Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (30 of 60)
| Basepair (1366:2058)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
21.7* |
0.9* |
13.2* |
61.4* |
0.5 |
0.4 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
1.1 | 803 |
| 3 |
40.4* |
1.6* |
0.9* |
54.4* |
0.7 |
0.7 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- | 428 |
| B |
5.1* |
-- |
1.3* |
92.4* |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
63.4* |
17.1* |
-- |
17.1* |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
89.3* |
-- |
0.7 |
5.3* |
-- |
2.0* |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- | 150 |
| M |
0.4* |
-- |
0.7* |
94.5* |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
3.2 | 275 |
| |
| Basepair (1367:2057)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
21.4* |
-- |
0.4 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
1.6 |
-- |
0.4 |
1.0 |
-- |
72.9* |
1.2 | 803 |
| 3 |
40.2* |
-- |
0.5 |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
1.9 |
-- |
55.1* |
-- | 428 |
| B |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- | 237 |
| A |
53.7* |
-- |
2.4* |
17.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
19.5 |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- | 100 |
| E |
99.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7* |
-- | 150 |
| M |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
4.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
90.5* |
3.7 | 275 |
| |
| Basepair (1368:2056)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
0.4* |
17.2 |
0.5* |
0.4 |
1.4 |
13.7 |
0.1 |
-- |
0.9 |
1.2 |
0.2 |
53.1* |
2.5 |
4.5* |
2.4 |
1.5 | 803 |
| 3 |
-- |
0.7* |
26.4 |
-- |
-- |
1.6 |
14.0 |
0.2 |
-- |
1.2 |
2.3 |
0.5 |
39.7* |
4.7 |
7.9* |
-- |
0.7 | 428 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7* |
21.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
68.4* |
8.4 |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
17.1 |
4.9 |
7.3* |
-- |
48.8* |
-- |
4.9 | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
74.7* |
-- |
-- |
-- |
6.0 |
0.7 |
-- |
3.3 |
2.0* |
-- |
3.3 |
-- |
9.3 |
-- |
0.7 | 150 |
| M |
0.4 |
-- |
9.1 |
1.5 |
1.1 |
1.5 |
15.3 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
59.6* |
-- |
0.7 |
6.9* |
3.3 | 275 |
| |
| Basepair (1369:2055)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
97.9 |
-- |
0.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 803 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.8 |
-- |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 428 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.7 |
-- |
0.7 |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 150 |
| M |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
95.6 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.3 | 275 |
| |
| Basepair (1371:2054)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
98.4 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.2 | 803 |
| 3 |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 428 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 150 |
| M |
-- |
-- |
95.3 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
3.7 | 275 |
| |
| Basepair (1372:2053)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
96.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 | 803 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 428 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 150 |
| M |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
90.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.8 | 275 |
| |
| Basepair (1373:2052)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
29.0* |
0.1* |
2.5* |
52.3* |
13.3 |
-- |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
1.4 | 803 |
| 3 |
50.7* |
-- |
-- |
26.2* |
22.2 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 428 |
| B |
28.7* |
-- |
-- |
36.7* |
33.8 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
22.0* |
-- |
-- |
48.8* |
29.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
8.0* |
-- |
-- |
91.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
92.7* |
-- |
-- |
4.0* |
2.0 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 150 |
| M |
2.9* |
0.4* |
7.3* |
78.9* |
4.0 |
-- |
0.7 |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
4.0 | 275 |
| |
| Basepair (1374:2051)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.6* |
86.3* |
5.9* |
2.7* |
-- |
1.6 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.6 |
1.4 | 803 |
| 3 |
0.2 |
98.1* |
-- |
0.2 |
-- |
0.9 |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 428 |
| B |
-- |
99.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
2.4* |
92.7* |
-- |
2.4* |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 150 |
| M |
1.5* |
63.3* |
16.7* |
7.6* |
-- |
3.3 |
-- |
-- |
0.7 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
1.8 |
4.4 | 275 |
| |
| Basepair (1377:1683)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
4.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
95.1 | 842 |
| 3 |
-- |
8.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.2 | 466 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 265 |
| A |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 160 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.1 | 276 |
| |
| Basepair (1382:1400)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
22.4* |
13.9* |
24.3* |
20.0* |
0.6 |
-- |
0.2 |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
1.7 |
15.5 | 863 |
| 3 |
26.9* |
4.9* |
40.7* |
21.1* |
0.8 |
-- |
0.4 |
0.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.1 |
1.4 | 487 |
| B |
35.6* |
4.9* |
19.7* |
38.6* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 264 |
| A |
87.8* |
-- |
-- |
2.4* |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
95.0* |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
0.5 |
6.0* |
79.7* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5* |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.2 |
3.2 | 182 |
| M |
22.5* |
0.4* |
2.5* |
25.4* |
0.4 |
-- |
-- |
1.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
46.3 | 276 |
| |
| Basepair (1383:1399)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
14.9* |
4.4* |
27.0* |
31.4* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
21.2 | 864 |
| 3 |
21.9* |
6.6* |
43.4* |
25.8* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.4 | 488 |
| B |
38.5* |
6.4* |
11.3* |
43.0* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 265 |
| A |
12.2* |
12.2* |
46.3* |
29.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
2.0* |
-- |
-- |
98.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
0.5* |
5.5* |
89.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
3.2 | 182 |
| M |
7.2* |
2.2* |
7.6* |
17.0* |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
64.1 | 276 |
| |
| Basepair (1384:1398)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
13.5* |
31.8* |
14.9* |
11.3* |
0.5 |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
26.1 | 864 |
| 3 |
21.7* |
53.5* |
6.4* |
14.1* |
0.6 |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 488 |
| B |
31.3* |
31.7* |
11.3* |
24.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 265 |
| A |
56.1* |
29.3* |
2.4* |
4.9* |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
3.0* |
2.0* |
91.0* |
1.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
| E |
-- |
90.7* |
-- |
0.5* |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 182 |
| M |
2.9* |
4.3* |
2.5* |
10.1* |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
79.4 | 276 |
| |
| Basepair (1385:1397)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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2.5* |
11.3* |
31.7* |
1.0 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.2 |
-- |
1.8 |
-- |
0.2 |
27.3 | 865 |
| 3 |
39.7* |
2.9* |
1.0* |
49.5* |
1.8 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
3.1 |
-- |
0.2 |
1.0 | 489 |
| B |
60.2* |
2.3* |
1.1* |
33.1* |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 266 |
| A |
82.9* |
7.3* |
2.4* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
1.0* |
4.0* |
90.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
1.0 |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
| E |
0.5 |
2.7 |
0.5* |
82.4* |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
8.2* |
-- |
0.5 |
2.7 | 182 |
| M |
1.1* |
1.4* |
1.1* |
10.9* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.7 | 276 |
| |
| Basepair (1386:1396)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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1.0* |
7.2* |
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0.6 |
0.3 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
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1.4* |
8.0* |
42.4* |
-- |
0.6 |
0.2 |
0.4 |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 |
0.2 |
1.2 | 488 |
| B |
65.3* |
2.3* |
14.7* |
16.6* |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 265 |
| A |
95.1* |
2.4* |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
94.0* |
-- |
-- |
4.0* |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
3.8* |
-- |
-- |
88.5* |
-- |
-- |
0.5 |
1.1 |
-- |
0.5* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
1.1 |
0.5 |
3.3 | 182 |
| M |
4.0* |
0.7* |
8.3* |
1.4* |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.4 | 276 |
| |
| Basepair (1387:1395)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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1.3* |
0.9* |
16.3* |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
28.9 | 865 |
| 3 |
65.8* |
2.2* |
-- |
28.6* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 | 489 |
| B |
97.7* |
-- |
-- |
1.1* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 266 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
12.1* |
6.0* |
-- |
74.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
6.6 | 182 |
| M |
10.5* |
-- |
2.9* |
0.4* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.5 | 276 |
| |
| Basepair (1388:1392)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
0.1* |
61.0* |
0.2* |
0.1 |
0.6 |
0.2 |
-- |
0.1 |
5.7 |
-- |
0.1 |
1.3 |
-- |
0.1 |
0.2 |
30.1 | 865 |
| 3 |
0.2* |
-- |
83.8* |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2* |
10.0 |
-- |
0.2* |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 489 |
| B |
-- |
-- |
98.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 266 |
| A |
-- |
-- |
92.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 | 41 |
| C |
-- |
-- |
97.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
0.5* |
-- |
60.4* |
0.5 |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
0.5* |
24.7 |
-- |
0.5* |
4.4 |
-- |
-- |
-- |
6.9 | 182 |
| M |
-- |
0.4* |
7.6* |
0.4 |
0.4* |
1.1 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.7 |
88.5 | 276 |
| |
| Basepair (1389:1435)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2 |
-- |
0.8 |
1.7 |
66.2* |
0.2 |
1.6* |
0.5 |
0.3 |
0.9 |
1.0 |
0.6 |
0.3 |
-- |
1.3* |
1.3 |
23.0 | 863 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
96.1* |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
0.4* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
1.0 |
1.4 | 487 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 265 |
| A |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
90.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
93.0* |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
91.7* |
-- |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
1.1* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.7 |
4.0 | 181 |
| M |
0.7 |
-- |
2.5 |
2.9 |
3.6* |
0.7 |
4.3* |
1.4 |
0.7 |
2.9 |
2.5 |
1.8 |
0.7 |
-- |
4.0* |
1.8 |
69.1 | 276 |
| |
| Basepair (1394:1432)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3 |
-- |
0.6 |
9.3 |
4.5 |
-- |
0.1* |
0.7 |
-- |
0.2 |
15.9* |
4.3 |
0.1 |
0.1* |
0.8 |
33.0* |
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| 3 |
0.6 |
-- |
0.2 |
15.2 |
8.0 |
-- |
0.2* |
0.2 |
-- |
0.2 |
28.1* |
7.6 |
0.2 |
-- |
0.6 |
36.5* |
2.4 | 488 |
| B |
-- |
-- |
0.4 |
26.3 |
14.7 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
3.4* |
0.4 |
0.4* |
-- |
0.8 |
53.0* |
0.4 | 266 |
| A |
4.9* |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
82.9* |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- | 100 |
| E |
0.6 |
-- |
-- |
1.1 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
70.7* |
18.2 |
-- |
-- |
0.6 |
1.7* |
6.1 | 181 |
| M |
-- |
-- |
1.4 |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
1.8* |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
1.4 |
2.5* |
90.0 | 276 |
| |
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