Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (36 of 60)
| Basepair (1725:2050)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.9* |
33.0* |
33.9* |
1.1* |
0.2 |
0.4 |
18.5 |
0.6 |
0.5 |
0.6 |
-- |
-- |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
1.5 |
6.0 | 806 |
| 3 |
4.9* |
37.5* |
55.5* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
0.4 | 429 |
| B |
-- |
59.5* |
40.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
39.0* |
46.3* |
7.3* |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
3.3* |
0.7* |
92.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.3 |
0.7 | 151 |
| M |
0.7* |
1.8* |
12.3 |
3.3 |
0.7 |
0.4 |
53.6* |
1.8 |
1.4 |
1.8 |
-- |
-- |
1.1 |
0.4 |
0.4 |
2.5* |
17.7 | 276 |
| |
| Basepair (1726:2049)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
77.3* |
0.2* |
0.7* |
15.2* |
1.4 |
0.4 |
0.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.7 |
3.0 | 805 |
| 3 |
72.0* |
-- |
-- |
24.9* |
2.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 | 429 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
82.9* |
-- |
-- |
7.3* |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
97.0* |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
26.5* |
-- |
-- |
68.2* |
3.3 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.7 | 151 |
| M |
77.8* |
0.7* |
2.2* |
4.4* |
0.7 |
1.1 |
0.7 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.7 |
1.8 |
8.7 | 275 |
| |
| Basepair (1727:2048)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
30.3* |
-- |
1.4* |
62.2* |
0.7 |
-- |
0.4 |
0.7 |
0.2 |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
2.1 | 806 |
| 3 |
51.0* |
-- |
0.2* |
48.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 429 |
| B |
15.6* |
-- |
-- |
84.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
98.0 |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
92.7* |
-- |
0.7* |
6.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 151 |
| M |
9.1* |
-- |
3.6* |
69.9* |
1.4 |
-- |
1.1 |
2.2 |
0.4 |
0.7 |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
1.8 |
6.6 | 276 |
| |
| Basepair (1728:2047)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
49.0* |
6.2* |
16.0* |
22.6* |
0.7 |
-- |
1.7 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.6 |
2.0 | 804 |
| 3 |
59.8* |
-- |
-- |
39.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- | 428 |
| B |
90.3* |
-- |
-- |
9.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
92.5* |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 40 |
| C |
98.0* |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
4.0* |
-- |
-- |
94.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- | 151 |
| M |
14.5* |
18.1* |
46.7* |
4.7* |
2.2 |
-- |
5.1 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
1.1 |
6.2 | 276 |
| |
| Basepair (1733:2046)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.2 |
0.9 |
4.5 |
0.1 |
0.1 |
72.5* |
1.2 |
13.8 |
1.0 |
0.4* |
0.1 |
-- |
0.4* |
-- |
0.2* |
4.3 | 804 |
| 3 |
-- |
0.2 |
0.5 |
1.2 |
0.2* |
0.2* |
78.5* |
0.7 |
13.1 |
0.7 |
0.7* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
3.7 | 428 |
| B |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
0.4* |
86.5* |
0.4 |
10.5 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
2.5 |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
20.0 |
-- |
65.0* |
5.0 |
2.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 40 |
| C |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
58.0* |
-- |
39.0 |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
0.7* |
-- |
81.5* |
1.3 |
3.3 |
-- |
1.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.6 | 151 |
| M |
-- |
0.4 |
1.8 |
10.9 |
-- |
-- |
68.5* |
2.5 |
5.8 |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
0.7* |
-- |
0.7* |
7.0 | 276 |
| |
| Basepair (1734:2045)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.1 |
44.8* |
6.8 |
11.8 |
2.1 |
0.2 |
4.4 |
10.5* |
0.1 |
0.9 |
0.6 |
0.4 |
1.2* |
-- |
0.1 |
13.8* |
0.9 | 803 |
| 3 |
1.9* |
56.7* |
7.5 |
3.5 |
2.8 |
0.2 |
0.5* |
0.2 |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
25.1* |
0.2 | 427 |
| B |
-- |
88.1* |
11.0* |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
5.0* |
77.5* |
15.0* |
2.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 40 |
| C |
-- |
94.0* |
4.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
4.0* |
2.6 |
-- |
9.3 |
7.3 |
0.7 |
1.3 |
-- |
-- |
3.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
70.2* |
0.7 | 151 |
| M |
0.4 |
8.7* |
6.9* |
28.3 |
1.8* |
0.4 |
12.0 |
30.1* |
0.4 |
0.7 |
1.8 |
1.1 |
3.6 |
-- |
-- |
1.4 |
2.7 | 276 |
| |
| Basepair (1735:2044)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
32.5* |
11.3* |
42.5* |
6.6* |
1.4 |
2.9 |
0.5 |
0.2 |
0.6 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.5 |
0.3 | 804 |
| 3 |
36.0* |
15.7* |
40.4* |
0.7* |
0.5 |
5.1 |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
0.2 |
-- | 428 |
| B |
3.4* |
14.0* |
72.0* |
0.4* |
-- |
8.1 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.4 |
-- | 236 |
| A |
2.4* |
82.9* |
7.3* |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
1.0* |
99.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
95.4* |
-- |
0.7* |
1.3* |
1.3 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- | 151 |
| M |
38.8* |
8.3* |
25.4* |
18.1* |
3.3 |
0.4 |
1.1 |
0.4 |
1.8 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
1.2 | 276 |
| |
| Basepair (1736:2043)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
7.0* |
40.8* |
19.7* |
26.9* |
1.0 |
2.1 |
0.9 |
0.4 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 |
0.1 | 804 |
| 3 |
4.9* |
47.2* |
31.5* |
11.7* |
1.2 |
2.3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 428 |
| B |
8.1* |
66.1* |
5.1* |
19.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- | 236 |
| A |
2.4* |
63.4* |
9.8* |
12.2* |
12.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
97.0* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
0.7* |
13.9* |
78.1* |
-- |
-- |
6.6 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 151 |
| M |
12.7* |
10.5* |
7.2* |
60.1* |
1.1 |
2.5 |
2.5 |
1.1 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.7 |
0.4 | 276 |
| |
| Basepair (1737:2042)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
11.6* |
3.1* |
45.7* |
33.7* |
0.4 |
0.7 |
0.7 |
2.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.5 |
0.4 | 805 |
| 3 |
17.5* |
4.4* |
34.7* |
40.8* |
0.2 |
0.9 |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 429 |
| B |
22.4* |
7.6* |
62.4* |
5.1* |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
41.5* |
-- |
2.4* |
51.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 | 41 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
4.0* |
0.7* |
-- |
93.4* |
0.7 |
-- |
0.7 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 151 |
| M |
6.5* |
2.2* |
43.1* |
34.8* |
0.7 |
0.7 |
1.8 |
6.5 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.7 |
1.4 |
0.4 | 276 |
| |
| Basepair (1738:2041)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
50.6* |
27.2* |
5.3* |
11.2* |
1.7 |
0.2 |
1.0 |
0.9 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.6 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.2 | 805 |
| 3 |
63.4* |
25.4* |
2.1* |
5.4* |
1.9 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 | 429 |
| B |
46.0* |
42.2* |
3.8* |
5.5* |
1.3 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
80.5* |
19.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
96.0* |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
86.1* |
0.7* |
-- |
6.6* |
3.3 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- | 151 |
| M |
48.9* |
5.1* |
10.9* |
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2.9 |
2.2 |
-- |
0.7 |
0.4 |
0.7 |
0.4 |
-- |
-- |
0.7 |
0.4 | 276 |
| |
| Basepair (1739:2040)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
0.5 |
-- |
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0.5 |
-- |
0.2 |
0.2 |
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11.0* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
68.3* |
24.4* |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
23.2 |
5.3* |
-- |
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-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.7 |
-- |
-- |
0.7 |
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| M |
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-- |
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1.8 |
-- |
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2.5 |
1.8 |
0.4 | 276 |
| |
| Basepair (1740:2039)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| B |
-- |
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0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
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26.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
95.0* |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| E |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| M |
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-- |
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-- |
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1.1 |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 276 |
| |
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|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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-- |
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-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
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34.5* |
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2.6 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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1.3* |
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4.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
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9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
2.0 |
17.0 |
-- |
-- |
78.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
2.0 |
-- | 100 |
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3.3* |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| M |
30.1* |
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-- |
2.2 |
0.7 |
7.2 |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
5.1 |
0.4 | 276 |
| |
| Basepair (1742:2037)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
1.0* |
2.9 |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
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-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
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| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
19.5 |
-- |
-- |
-- |
80.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
96.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7* |
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| M |
-- |
-- |
2.9* |
4.0 |
1.1* |
-- |
0.4 |
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-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
1.1 | 276 |
| |
| Basepair (1743:2036)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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-- |
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0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
55.0* |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 429 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
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-- |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 151 |
| M |
3.6* |
-- |
0.7* |
94.2* |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 | 276 |
| |
| Basepair (1744:2035)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
96.8* |
-- |
1.5* |
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-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
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99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- | 429 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 151 |
| M |
91.3* |
-- |
4.3* |
1.8* |
1.1 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.7 | 276 |
| |
| Basepair (1745:2034)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
1.2* |
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97.3* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
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-- |
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-- |
-- |
0.2 |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 431 |
| B |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 153 |
| M |
-- |
-- |
3.6* |
1.4 |
93.1* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.7 | 276 |
| |
| Basepair (1746:2032)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
97.5 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
1.7 | 808 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 431 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
98.7 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- | 153 |
| M |
-- |
-- |
-- |
93.8 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
5.1 | 276 |
| |
| Basepair (1747:2584)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.9 |
0.5 |
96.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 | 780 |
| 3 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 410 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 236 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 133 |
| M |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
2.6 |
1.1 |
90.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.6 | 270 |
| |
| Basepair (1752:2031)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
97.2* |
-- |
-- |
0.4* |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.9 | 808 |
| 3 |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 431 |
| B |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 153 |
| M |
93.5* |
-- |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.5 | 276 |
| |
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