Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (39 of 60)
| Basepair (1820:2029)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
54.3* |
5.1 |
6.2 |
6.5* |
4.0 |
0.5* |
5.8 |
0.2 |
0.5 |
10.5* |
0.1 |
3.2 |
0.2 |
0.1 |
0.4 |
1.7 |
0.5 | 810 |
| 3 |
76.9* |
8.3* |
4.8* |
3.5* |
6.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 433 |
| B |
73.8* |
15.2* |
8.9* |
1.3* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
78.0* |
-- |
-- |
12.2* |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
85.1* |
-- |
-- |
11.9* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 101 |
| E |
80.6* |
0.6* |
-- |
4.5* |
13.5 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
7.6* |
1.8 |
10.5 |
9.4* |
1.8 |
1.4* |
17.0 |
-- |
1.4 |
30.8* |
0.4 |
9.4 |
0.7 |
0.4 |
1.1 |
5.1 |
1.2 | 276 |
| |
| Basepair (1821:2028)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
34.9* |
26.7* |
11.0* |
19.5* |
0.9 |
0.1 |
0.6 |
1.2 |
0.1 |
-- |
0.5 |
1.2 |
-- |
-- |
1.6 |
1.4 |
0.2 | 810 |
| 3 |
54.0* |
27.7* |
14.5* |
1.8* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 | 433 |
| B |
19.8* |
50.6* |
26.2* |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 | 237 |
| A |
82.9* |
-- |
2.4* |
14.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
88.1* |
10.9* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
98.1* |
-- |
0.6* |
1.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
17.8* |
2.5* |
5.4* |
54.0* |
1.1 |
0.4 |
1.8 |
3.6 |
0.4 |
-- |
0.7 |
3.6 |
-- |
-- |
4.7 |
3.6 |
0.4 | 276 |
| |
| Basepair (1822:2027)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
40.2* |
25.4* |
6.4* |
24.1* |
0.2 |
0.5 |
0.1 |
0.7 |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
1.1 |
0.1 | 810 |
| 3 |
62.8* |
27.9* |
2.1* |
6.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 433 |
| B |
36.7* |
49.4* |
2.5* |
10.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
80.5* |
9.8* |
-- |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
1.0* |
80.2* |
17.8* |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
98.1* |
-- |
1.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
19.2* |
1.4* |
9.1* |
60.5* |
0.7 |
1.1 |
0.4 |
2.2 |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.7 |
0.7 |
-- |
-- |
3.3 |
-- | 276 |
| |
| Basepair (1823:2026)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
33.0* |
26.5* |
5.1* |
31.5* |
1.2 |
0.7 |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 810 |
| 3 |
34.4* |
27.0* |
-- |
36.3* |
0.2 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 433 |
| B |
46.0* |
49.4* |
-- |
0.8* |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
97.6* |
-- |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
95.0* |
2.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
| E |
0.6* |
-- |
-- |
98.7* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
42.8* |
0.7* |
14.1* |
34.8* |
3.3 |
0.4 |
-- |
3.3 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- | 276 |
| |
| Basepair (1824:2025)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.0* |
25.2* |
6.1* |
46.4* |
7.9 |
3.7 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.9 |
0.1 |
5.9 |
0.1 | 809 |
| 3 |
2.5* |
15.0* |
0.7* |
64.4* |
4.9 |
2.3 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
9.0 |
0.2 | 432 |
| B |
2.1* |
24.1* |
-- |
49.4* |
3.4 |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
16.0 |
0.4 | 237 |
| A |
15.0 |
20.0* |
-- |
25.0 |
32.5* |
5.0 |
-- |
2.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 40 |
| C |
-- |
1.0* |
9.9* |
78.2* |
10.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
0.6* |
1.9* |
96.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
| M |
4.7 |
50.0* |
13.0* |
6.5 |
11.6* |
7.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
2.5 |
0.4 |
3.3 |
-- | 276 |
| |
| Basepair (1825:2024)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
19.3* |
25.2* |
26.3* |
15.9* |
1.7 |
8.0 |
-- |
0.1 |
0.1 |
2.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.6 |
0.3 | 809 |
| 3 |
18.5* |
6.7* |
37.4* |
17.1* |
2.8 |
13.9 |
-- |
-- |
0.2 |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.4 | 433 |
| B |
33.8* |
-- |
-- |
30.4* |
5.1 |
24.5* |
-- |
-- |
0.4 |
4.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.4 | 237 |
| A |
-- |
61.0* |
31.7* |
4.9* |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
69.3* |
-- |
1.0* |
28.7* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
2.6* |
95.5* |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
2.2* |
63.6* |
18.2* |
9.5* |
0.7 |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
1.1 |
0.4 | 275 |
| |
| Basepair (1826:2023)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
10.7 |
41.4* |
2.8* |
4.3 |
30.9* |
8.0 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.9 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 810 |
| 3 |
13.6 |
47.1* |
0.2* |
1.4 |
35.6* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 433 |
| B |
24.1 |
5.5* |
-- |
2.5 |
65.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
4.9* |
90.2* |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
3.0 |
-- |
-- |
1.0 |
93.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 101 |
| E |
-- |
98.7* |
0.6* |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
9.1* |
47.5* |
8.0* |
10.1* |
0.7 |
22.8 |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 276 |
| |
| Basepair (1827:2021)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.7* |
90.1* |
0.4* |
1.0* |
-- |
6.0 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.1 | 816 |
| 3 |
2.5* |
86.8* |
-- |
-- |
-- |
9.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5* |
0.2 | 433 |
| B |
3.4* |
95.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
7.3* |
48.8* |
-- |
-- |
-- |
39.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9* |
-- | 41 |
| C |
1.0* |
98.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
83.9 |
-- |
-- |
-- |
15.5 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
0.7* |
92.2* |
1.1* |
2.8* |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- | 282 |
| |
| Basepair (1828:2020)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
82.6* |
-- |
-- |
14.1* |
2.0 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.1* |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 | 816 |
| 3 |
80.6* |
-- |
-- |
14.8* |
3.5 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 433 |
| B |
75.1* |
-- |
-- |
22.8* |
0.4 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
95.1* |
-- |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
85.1* |
-- |
-- |
14.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
84.5* |
-- |
-- |
6.5* |
9.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
84.8* |
-- |
-- |
12.8* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
0.7 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.7 |
-- | 282 |
| |
| Basepair (1829:2018)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
7.6 |
0.4 |
0.5 |
-- |
0.1 |
75.9* |
0.9 |
0.2 |
4.8 |
9.2* |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2* |
-- | 816 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 433 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
22.0 |
1.1 |
1.4 |
-- |
0.4 |
31.2* |
2.1 |
0.7 |
13.5 |
26.6* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.7* |
-- | 282 |
| |
| Basepair (1830:1846)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.5 |
0.4 |
-- |
0.7* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
12.7 |
48.5* |
36.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.3 | 844 |
| 3 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
22.8 |
58.7 |
17.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 460 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.0 |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 263 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
26.8 |
73.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.0 |
2.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
67.3 |
3.2 |
28.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 156 |
| M |
1.4* |
0.4 |
-- |
2.1 |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
14.5 |
78.1* |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.8 | 283 |
| |
| Basepair (1832:1844)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
99.6* |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 844 |
| 3 |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 460 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 156 |
| M |
98.9* |
-- |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 283 |
| |
| Basepair (1833:1843)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
0.5* |
97.6* |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 843 |
| 3 |
-- |
0.2* |
98.9* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 460 |
| B |
-- |
0.4* |
98.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 263 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
3.0* |
96.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
98.7 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 156 |
| M |
0.4* |
-- |
96.1* |
-- |
-- |
3.2 |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 282 |
| |
| Basepair (1834:1841)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
93.8* |
-- |
-- |
0.1 |
1.3 |
-- |
-- |
3.4 |
0.9* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 844 |
| 3 |
-- |
-- |
89.3* |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
6.3 |
1.7* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 460 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
-- |
-- |
80.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.6* |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
74.4* |
-- |
-- |
-- |
5.8 |
-- |
-- |
17.9 |
1.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 156 |
| M |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 283 |
| |
| Basepair (1838:2621)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1 |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
60.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
37.0* |
0.5 | 771 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
37.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
62.0* |
0.2 | 413 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
62.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
37.1* |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
17.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
82.9* |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 95 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
0.7 | 135 |
| M |
-- |
0.4 |
6.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
81.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
11.0* |
1.2 | 263 |
| |
| Basepair (1839:2642)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
16.2* |
1.7 |
0.1* |
2.5 |
12.6 |
0.1 |
66.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 | 723 |
| 3 |
-- |
-- |
28.7* |
0.5 |
-- |
2.9 |
3.2 |
0.2 |
64.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 408 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
3.4 |
-- |
0.4 |
95.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 232 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 53 |
| E |
-- |
-- |
85.9* |
-- |
-- |
3.0 |
9.6 |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 135 |
| M |
-- |
-- |
-- |
3.8 |
0.4 |
2.3 |
29.8 |
-- |
63.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8* |
-- | 262 |
| |
Last generated : Mon Jul 1 2002 (8 : 31)