Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (40 of 60)
| Basepair (1841:2623)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
1.0 |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
14.5 |
0.3 |
83.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 770 |
| 3 |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
10.2 |
0.2 |
86.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 413 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
16.9 |
-- |
82.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
-- |
14.6 |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
4.9 |
2.4 |
73.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
30.5 |
-- |
69.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 95 |
| E |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 135 |
| M |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
15.6 |
0.4 |
92.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 262 |
| |
| Basepair (1847:1884)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.2* |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
-- |
0.1 |
1.2 |
0.1 |
75.6* |
10.0* |
7.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1* |
1.5 | 843 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
1.3 |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 460 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.6 |
-- |
85.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 156 |
| M |
9.5* |
0.4 |
1.1 |
0.4 |
-- |
-- |
1.4 |
0.4 |
30.4* |
29.7* |
21.6 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4* |
4.3 | 283 |
| |
| Basepair (1848:1883)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.0 |
-- |
0.4* |
2.7 |
81.0* |
-- |
-- |
9.1* |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.1 |
3.1 |
0.8 | 843 |
| 3 |
2.6 |
-- |
-- |
0.7 |
95.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- | 459 |
| B |
0.8 |
-- |
-- |
0.8 |
97.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- | 263 |
| A |
24.4 |
-- |
-- |
-- |
75.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
2.0 |
-- |
-- |
3.0 |
95.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
98.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
1.1 |
-- |
1.1* |
6.0 |
52.3* |
-- |
-- |
27.2* |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
0.4 |
8.5 |
2.5 | 283 |
| |
| Basepair (1849:1882)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
35.1* |
61.4* |
0.2* |
1.4* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- | 843 |
| 3 |
35.9* |
62.3* |
-- |
1.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 459 |
| B |
49.0* |
48.7* |
-- |
1.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
78.0* |
19.5* |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
99.0* |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
2.6* |
96.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6* |
-- | 155 |
| M |
11.0* |
82.0* |
0.7* |
1.8* |
3.5 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 283 |
| |
| Basepair (1850:1881)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.9* |
22.7 |
12.2 |
33.8* |
2.4 |
25.9* |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.9 | 843 |
| 3 |
3.1* |
1.1 |
12.0 |
54.0* |
4.4 |
25.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 459 |
| B |
1.9* |
1.1 |
14.4 |
42.6* |
7.2 |
32.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 263 |
| A |
4.9* |
4.9 |
17.1 |
2.4* |
-- |
70.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
97.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
4.5* |
-- |
6.5* |
87.1* |
0.6 |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
0.7* |
65.7* |
15.9* |
13.1* |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
2.5 | 283 |
| |
| Basepair (1851:1880)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.7* |
51.5* |
41.2* |
2.3* |
0.4 |
2.0 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.7 | 843 |
| 3 |
2.8* |
59.7* |
31.6* |
2.2* |
0.2 |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 459 |
| B |
-- |
93.2* |
-- |
1.1* |
0.4 |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
29.3* |
70.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
95.0* |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 | 101 |
| E |
0.6* |
0.6* |
92.9* |
4.5* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
0.4* |
22.6* |
71.4* |
2.5* |
0.7 |
1.1 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.7 | 283 |
| |
| Basepair (1852:1879)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.5* |
27.1 |
25.3 |
3.2* |
0.5 |
42.0* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.5 |
0.6 | 842 |
| 3 |
0.9* |
16.2 |
28.2 |
3.1* |
-- |
51.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 | 458 |
| B |
-- |
9.9 |
1.9 |
0.8* |
-- |
87.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 262 |
| A |
7.3* |
61.0* |
7.3* |
24.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
94.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
-- | 101 |
| E |
0.6* |
14.8* |
77.4* |
1.3* |
-- |
4.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
54.4* |
28.6* |
4.6* |
1.4 |
8.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
1.5 | 283 |
| |
| Basepair (1853:1878)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
23.0* |
51.8* |
15.0* |
3.9* |
0.2 |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
2.9 | 842 |
| 3 |
40.6* |
46.5* |
5.2* |
4.4* |
0.4 |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.6 | 458 |
| B |
18.3* |
67.2* |
4.2* |
7.6* |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 262 |
| A |
-- |
82.9* |
7.3* |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
98.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
| E |
89.0* |
1.9* |
6.5* |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
2.8* |
43.8* |
35.7* |
4.6* |
-- |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
7.1 | 283 |
| |
| Basepair (1854:1877)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4* |
28.9* |
47.8* |
16.4* |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
2.9 | 843 |
| 3 |
0.7* |
31.4* |
63.6* |
1.7* |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 459 |
| B |
-- |
1.9* |
98.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
4.9* |
63.4* |
14.6* |
17.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
95.0* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
| E |
0.6* |
72.3* |
18.7* |
0.6* |
-- |
6.5 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
1.4* |
38.2* |
45.9* |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
0.4 |
0.7 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
8.1 | 283 |
| |
| Basepair (1855:1874)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
74.3* |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
3.7 |
12.6 |
-- |
-- |
7.8 | 843 |
| 3 |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
67.1* |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
5.9 |
23.1 |
-- |
-- |
1.7 | 459 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
5.8 |
-- |
-- |
-- |
5.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
15.5 |
67.7 |
-- |
-- |
5.2 | 155 |
| M |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
77.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
20.5 | 283 |
| |
| Basepair (1855:1875)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.5 |
0.1 |
-- |
-- |
7.5 | 843 |
| 3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.7 |
0.2 |
-- |
-- |
1.5 | 459 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
3.2 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
90.3 |
0.6 |
-- |
-- |
4.5 | 155 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
79.9 |
-- |
-- |
-- |
20.2 | 283 |
| |
| Basepair (1856:1873)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
64.7* |
1.1* |
16.5* |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
0.2 |
0.1 |
8.2 |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.9 | 843 |
| 3 |
-- |
66.7* |
0.9* |
29.4* |
0.2 |
0.2 |
0.4 |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.5 | 459 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
39.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
60.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
1.9* |
5.8* |
86.5* |
0.6 |
0.6 |
1.3 |
1.3 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 155 |
| M |
-- |
70.3* |
1.8* |
1.4* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
2.8 |
1.1 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
21.6 | 283 |
| |
| Basepair (1858:1871)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4 |
-- |
-- |
3.1 |
1.1 |
0.1 |
47.9* |
0.2 |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
15.7* |
-- |
-- |
28.1 | 841 |
| 3 |
0.7 |
-- |
-- |
3.5 |
1.1 |
0.2 |
58.0* |
0.4 |
5.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
28.9* |
-- |
-- |
1.3 | 457 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.9 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 261 |
| A |
-- |
-- |
-- |
34.1 |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
61.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
| E |
1.9 |
-- |
-- |
1.3 |
3.2 |
0.6 |
3.9* |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.5* |
-- |
-- |
3.2 | 155 |
| M |
-- |
-- |
-- |
3.5 |
1.4* |
-- |
13.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
81.3 | 283 |
| |
| Basepair (1859:1870)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.5 |
0.4 |
0.6* |
1.5 |
20.2* |
0.1 |
7.6 |
2.6 |
37.6* |
0.2 |
0.1* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
28.1 | 841 |
| 3 |
0.9 |
0.7 |
0.2* |
0.9 |
37.2* |
-- |
0.2 |
2.0 |
56.0* |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
1.3 | 457 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
98.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 260 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
75.6* |
-- |
-- |
17.1* |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
-- |
53.5 |
11.9 |
29.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
| E |
2.6 |
1.9* |
0.6* |
1.9 |
88.5* |
-- |
-- |
0.6* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 156 |
| M |
-- |
-- |
1.4* |
1.8 |
-- |
0.4 |
3.2 |
0.4 |
10.6* |
0.7 |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
81.3 | 283 |
| |
| Basepair (1860:1869)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
22.7* |
27.8* |
9.6* |
10.0* |
0.1 |
0.6 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
28.4 | 841 |
| 3 |
18.8* |
49.2* |
15.3* |
13.8* |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 457 |
| B |
32.3* |
42.7* |
2.7* |
22.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 260 |
| A |
-- |
78.0* |
22.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
90.1* |
-- |
3.0* |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
1.3* |
52.6* |
34.6* |
3.2* |
-- |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.8 | 156 |
| M |
4.9* |
3.2* |
2.8* |
5.7* |
0.4 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
82.3 | 283 |
| |
| Basepair (1861:1868)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.6* |
29.4* |
25.7* |
10.8* |
0.2 |
1.8 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
27.8 | 841 |
| 3 |
6.1* |
53.4* |
20.1* |
16.0* |
0.4 |
3.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 457 |
| B |
6.2* |
30.0* |
35.0* |
28.1* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 260 |
| A |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
97.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- | 101 |
| E |
4.5* |
80.1* |
0.6* |
0.6* |
1.3 |
7.7 |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.8 | 156 |
| M |
0.7* |
1.1* |
9.2* |
6.4* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
82.3 | 283 |
| |
| Basepair (1862:1867)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.0* |
52.6* |
5.6* |
4.9* |
0.5 |
1.4 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 |
-- |
1.0 |
28.5 | 841 |
| 3 |
7.0* |
74.8* |
5.5* |
8.8* |
0.2 |
2.0 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
0.6 | 457 |
| B |
-- |
90.4* |
4.2* |
1.9* |
-- |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 260 |
| A |
4.9* |
92.7* |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
89.1* |
5.0* |
-- |
2.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
1.0 | 101 |
| E |
19.2* |
44.9* |
5.1* |
21.8* |
0.6 |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.9 |
-- |
-- |
4.4 | 156 |
| M |
3.5* |
3.5* |
6.0* |
0.4* |
0.4 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
83.4 | 283 |
| |
| Basepair (1863:1866)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4 |
1.1* |
4.0 |
3.9* |
0.8 |
0.1 |
4.1 |
1.2 |
2.0 |
4.4 |
6.0 |
0.9 |
50.9* |
0.4 |
12.4* |
3.2 |
4.0 | 844 |
| 3 |
0.7 |
0.4 |
2.0 |
2.6 |
1.1 |
-- |
1.3 |
1.3 |
3.7* |
3.3 |
9.6* |
0.7 |
64.3* |
0.7 |
8.0 |
0.2* |
0.2 | 460 |
| B |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
1.5 |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
92.4 |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 | 264 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.0* |
-- |
-- |
2.0* |
-- | 101 |
| E |
1.9 |
1.3 |
5.1 |
7.7 |
0.6 |
-- |
1.9 |
3.8 |
10.3* |
3.8 |
28.2* |
1.9 |
7.7* |
0.6 |
23.7 |
0.6* |
0.6 | 156 |
| M |
-- |
2.5* |
8.8 |
7.4* |
0.7 |
0.4 |
10.2 |
1.4 |
-- |
7.8 |
2.5 |
1.8 |
12.4* |
-- |
24.0* |
8.5 |
11.9 | 283 |
| |
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