Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (41 of 60)
| Basepair (1885:2017)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.5 |
58.3* |
2.0 |
1.6* |
4.4 |
8.8 |
2.9 |
15.8* |
2.0 |
1.9 |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
1.3 | 837 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
77.6 |
-- |
-- |
-- |
16.9 |
5.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 433 |
| B |
-- |
-- |
-- |
84.8 |
-- |
-- |
-- |
15.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
29.3 |
-- |
-- |
-- |
58.5 |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
79.4 |
-- |
-- |
-- |
8.4 |
12.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
1.3 |
16.8* |
5.6 |
4.3* |
12.2 |
0.3 |
0.3 |
43.6* |
5.6 |
5.3 |
0.3 |
-- |
-- |
1.0 |
3.2 | 303 |
| |
| Basepair (1886:2016)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
42.3* |
5.5 |
9.9 |
2.7 |
0.7 |
0.8* |
0.4 |
1.8 |
1.8 |
0.1 |
3.0 |
0.1 |
0.4 |
7.9 |
22.3* |
0.2 | 837 |
| 3 |
-- |
52.2* |
2.1 |
5.8 |
1.4 |
0.7 |
0.5 |
0.5* |
1.8 |
0.5 |
-- |
0.9 |
0.2* |
-- |
0.5 |
33.0* |
-- | 433 |
| B |
-- |
92.8* |
3.0* |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
0.8* |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
14.6* |
2.4* |
56.1* |
14.6 |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
96.0* |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
0.6 |
0.6 |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.9* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.3 |
91.6* |
-- | 155 |
| M |
-- |
10.2* |
12.2 |
19.1* |
4.6 |
1.0 |
1.7 |
0.3 |
2.3 |
4.3 |
0.3 |
6.6 |
-- |
1.0 |
21.1* |
14.5 |
0.6 | 303 |
| |
| Basepair (1887:2015)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
59.2* |
1.0* |
25.8* |
10.2* |
3.0 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 836 |
| 3 |
44.6* |
0.9* |
43.2* |
8.8* |
2.1 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 433 |
| B |
78.9* |
-- |
2.1* |
14.3* |
3.8 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
14.6* |
9.8* |
65.9* |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
90.1* |
-- |
-- |
6.9* |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
0.6* |
-- |
99.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
69.9* |
1.3* |
9.6* |
13.2* |
4.3 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- | 302 |
| |
| Basepair (1888:2014)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
76.9* |
3.5* |
0.1* |
-- |
18.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.6 | 837 |
| 3 |
-- |
64.9 |
-- |
-- |
-- |
34.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 433 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
96.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
86.8* |
9.2* |
0.3* |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
1.3 | 303 |
| |
| Basepair (1889:2013)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2* |
97.3* |
2.0* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 845 |
| 3 |
0.2* |
99.1* |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 433 |
| B |
0.4* |
98.3* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
0.3* |
94.2* |
4.5* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 311 |
| |
| Basepair (1890:2011)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
1.4 | 845 |
| 3 |
-- |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 433 |
| B |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
| E |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4 | 311 |
| |
| Basepair (1891:1946)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
98.1* |
-- |
0.1* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 852 |
| 3 |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 440 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 244 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
95.2* |
-- |
0.3* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 311 |
| |
| Basepair (1892:1945)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.7* |
95.5* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 | 853 |
| 3 |
5.2* |
94.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 441 |
| B |
0.8* |
99.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 245 |
| A |
51.2* |
48.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
95.5* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.5 | 311 |
| |
| Basepair (1893:1944)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
92.8* |
4.6* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.2 | 853 |
| 3 |
-- |
96.4* |
3.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 441 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 245 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
97.0* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
89.7* |
10.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
86.5* |
6.4* |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
3.2 | 311 |
| |
| Basepair (1896:1943)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
87.3* |
3.5* |
0.2* |
6.3* |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.4 | 853 |
| 3 |
92.5* |
4.3* |
-- |
2.5* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 441 |
| B |
95.5* |
-- |
-- |
4.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 245 |
| A |
53.7* |
46.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
97.0* |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 101 |
| E |
98.1 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
76.8* |
3.5* |
0.6* |
13.5* |
0.3 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 311 |
| |
| Basepair (1897:1942)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
98.5 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 853 |
| 3 |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 441 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 245 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
95.8 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 311 |
| |
| Basepair (1898:1939)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
97.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
1.3 | 853 |
| 3 |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
98.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 441 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 245 |
| A |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
90.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
94.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
3.5 | 311 |
| |
| Basepair (1899:1938)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.5* |
65.3* |
1.3* |
28.3* |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
1.6 | 852 |
| 3 |
4.3* |
95.2* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 441 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 245 |
| A |
46.3* |
53.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
0.6* |
11.3* |
3.5* |
77.7* |
1.3 |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
4.2 | 310 |
| |
| Basepair (1900:1937)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.3* |
46.8* |
25.2* |
3.6* |
-- |
17.8 |
-- |
-- |
0.1 |
0.6 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.1 | 853 |
| 3 |
1.6* |
25.9* |
37.9* |
1.8* |
-- |
32.4 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 441 |
| B |
-- |
35.1* |
64.1* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 245 |
| A |
17.1* |
58.5* |
17.1* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
91.1* |
5.9* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
3.2 |
1.9 |
3.2* |
-- |
91.0* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
1.3* |
62.1* |
13.5* |
6.4* |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
11.2 | 311 |
| |
| Basepair (1901:1936)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
43.0* |
19.9* |
2.3* |
4.5* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
29.9 | 861 |
| 3 |
56.1* |
37.2* |
2.2* |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 449 |
| B |
83.8* |
10.7* |
0.4* |
4.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 253 |
| A |
97.6* |
-- |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
92.1* |
-- |
-- |
7.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
0.6* |
89.7* |
5.8* |
3.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
8.0* |
1.3* |
3.2* |
4.2* |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
82.9 | 311 |
| |
| Basepair (1902:1935)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
64.7* |
0.1* |
1.0* |
0.6* |
0.2 |
0.3 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.9 |
0.1 |
30.2 | 865 |
| 3 |
96.0* |
-- |
1.1* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 453 |
| B |
95.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 258 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
99.0* |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
95.5* |
-- |
3.2* |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
8.0* |
0.3 |
1.0 |
1.6* |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
2.6 |
0.3 |
83.9 | 311 |
| |
| Basepair (1905:1934)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
43.1* |
3.5 |
2.5 |
1.8* |
0.2 |
16.4* |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
30.7 | 865 |
| 3 |
55.8* |
6.6 |
3.8 |
-- |
-- |
31.1* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
0.4 | 453 |
| B |
95.3* |
3.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 257 |
| A |
19.5* |
48.8* |
31.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
95.0* |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
1.0 | 101 |
| E |
0.6 |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
90.3* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
1.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.9 |
-- | 155 |
| M |
7.7* |
-- |
1.6* |
4.2* |
0.6 |
0.3 |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.5 | 311 |
| |
| Basepair (1906:1933)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
63.6* |
1.8* |
0.8* |
2.2* |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
30.8 | 866 |
| 3 |
93.4* |
2.9* |
-- |
2.9* |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 454 |
| B |
94.2* |
-- |
-- |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 258 |
| A |
68.3* |
31.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
97.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
| E |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
9.3* |
1.0* |
2.3* |
1.9* |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
84.8 | 311 |
| |
| Basepair (1907:1932)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.3 |
1.3 |
-- |
-- |
65.6* |
0.7* |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1* |
-- |
0.3 |
0.2 |
0.6 |
0.1 |
30.4 | 868 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 456 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 260 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
1.0 |
3.5 |
-- |
-- |
3.9* |
1.9* |
-- |
0.3 |
0.6 |
0.3* |
-- |
1.0 |
0.6 |
1.6 |
0.3 |
84.9 | 311 |
| |
| Basepair (1908:1931)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
40.7* |
-- |
0.1* |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
18.3 |
0.6* |
0.1 |
7.9 |
-- |
0.3 |
-- |
30.4 | 868 |
| 3 |
-- |
-- |
58.8* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
31.1 |
1.1* |
0.2 |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
-- | 456 |
| B |
-- |
-- |
97.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- | 260 |
| A |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
87.8 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
68.3 |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
11.9 |
-- |
-- |
17.8 |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
8.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
87.7 |
3.2 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
5.1* |
-- |
0.3* |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
4.2 |
-- |
1.0 |
-- |
84.9 | 311 |
| |
| Basepair (1912:1927)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
11.3 |
4.9* |
9.1* |
2.8 |
14.8* |
4.1 |
1.4 |
-- |
0.2 |
2.3 |
-- |
0.1 |
14.8 |
0.1 |
-- |
2.6 |
31.3 | 870 |
| 3 |
20.7 |
7.4* |
1.1 |
2.2 |
26.0 |
1.1 |
2.6 |
-- |
0.4 |
4.4 |
-- |
0.2 |
28.2* |
0.2 |
-- |
4.1* |
1.3 | 458 |
| B |
33.6 |
2.7 |
-- |
3.1 |
44.7* |
0.4* |
-- |
-- |
0.4 |
7.6* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
-- | 262 |
| A |
2.4* |
65.9* |
-- |
-- |
2.4 |
7.3 |
17.1* |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
5.9* |
60.4* |
2.0* |
-- |
30.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 101 |
| E |
3.9 |
-- |
3.2 |
1.3* |
1.3 |
0.6* |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
81.9* |
0.6 |
-- |
-- |
3.8 | 155 |
| M |
1.0* |
1.0* |
4.2* |
3.9* |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
85.8 | 311 |
| |
| Basepair (1913:1926)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
13.8* |
13.2* |
23.3* |
8.2* |
0.9 |
8.7 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
31.2 | 870 |
| 3 |
25.1* |
21.8* |
38.9* |
10.9* |
0.9 |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 | 458 |
| B |
43.9* |
22.1* |
12.2* |
19.1* |
1.5 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 262 |
| A |
-- |
95.1* |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
5.9 |
17.8 |
1.0 |
2.0* |
70.3* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 101 |
| E |
0.6* |
1.9* |
92.3* |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 155 |
| M |
1.6* |
2.9* |
2.3* |
6.4* |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.8 | 311 |
| |
| Basepair (1914:1925)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
19.9 |
6.1* |
5.4* |
4.6 |
30.3* |
1.0 |
-- |
0.1* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.7 |
31.1 | 870 |
| 3 |
35.2 |
10.0* |
9.0* |
3.9 |
37.8* |
1.1 |
-- |
0.2* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
0.7 |
1.3 | 458 |
| B |
3.1 |
5.7* |
15.6* |
6.5 |
66.0* |
1.1 |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
0.4 | 262 |
| A |
19.5* |
73.2* |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
10.9 |
-- |
-- |
-- |
83.2* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
3.0 |
1.0 | 101 |
| E |
92.9* |
0.6* |
-- |
0.6* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
3.2 | 155 |
| M |
0.3* |
2.3* |
1.9* |
7.1* |
2.3 |
1.0 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.9 | 311 |
| |
| Basepair (1915:1924)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
34.4* |
7.9* |
1.1* |
16.9* |
1.0 |
1.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
36.5 | 870 |
| 3 |
40.8* |
13.8* |
0.7* |
30.3* |
0.7 |
0.7 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
0.2 |
11.8 | 458 |
| B |
58.4* |
22.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
18.7 | 262 |
| A |
73.2* |
12.2* |
7.3* |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
97.0* |
-- |
2.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
3.2* |
-- |
-- |
89.0* |
1.9 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
3.2 | 155 |
| M |
4.5* |
1.9 |
1.6 |
2.3* |
1.9 |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.9 | 311 |
| |
| Basepair (1916:1923)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.8* |
0.8 |
1.3 |
13.8* |
0.6 |
37.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
0.2 |
2.9 |
36.9 | 870 |
| 3 |
7.4* |
1.3 |
0.4 |
24.9* |
-- |
45.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
0.4 |
5.5 |
12.1 | 458 |
| B |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
80.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
18.3 | 262 |
| A |
82.9* |
12.2* |
-- |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
97.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
0.6* |
-- |
71.6* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
6.5 |
-- |
-- |
-- |
16.1 |
4.5 | 155 |
| M |
2.6* |
0.3 |
1.9 |
1.9* |
1.6 |
6.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.5 | 311 |
| |
| Basepair (1917:1922)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7* |
-- |
27.0* |
0.2* |
0.3 |
1.3 |
0.3 |
-- |
-- |
6.4 |
-- |
-- |
6.3 |
-- |
0.5 |
0.3 |
56.5 | 869 |
| 3 |
-- |
-- |
34.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.7 |
-- |
-- |
10.5 |
-- |
-- |
8.5 |
-- |
0.4 |
-- |
45.0 | 457 |
| B |
-- |
-- |
59.0 |
-- |
-- |
0.4 |
1.1 |
-- |
-- |
18.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.8 |
-- |
19.9 | 261 |
| A |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
72.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.9 |
-- |
-- |
15.8 |
-- |
2.0 |
2.0 |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.6 | 155 |
| M |
1.9* |
-- |
1.6 |
0.6* |
1.0 |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
91.6 | 311 |
| |
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