Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (42 of 60)
| Basepair (1931:2267)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.7 |
0.1 |
0.6 |
-- |
0.1 |
3.3 |
0.1 |
63.5* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.3 | 842 |
| 3 |
-- |
1.2 |
-- |
1.2 |
-- |
0.2 |
0.9 |
-- |
96.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 433 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.0 |
-- |
93.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
3.2 |
-- |
3.2 |
-- |
0.6 |
1.9 |
-- |
91.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
5.5 |
0.3 |
7.8* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.1 | 309 |
| |
| Basepair (1947:1965)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
65.7* |
27.8* |
2.1* |
1.7* |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
1.5 | 846 |
| 3 |
97.0* |
1.6* |
-- |
0.2* |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 434 |
| B |
96.2* |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 238 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
96.0* |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
97.4* |
-- |
-- |
0.6* |
1.3 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
12.2* |
73.3* |
5.8* |
3.5* |
0.3 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.8 | 311 |
| |
| Basepair (1948:1964)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7 |
0.2* |
-- |
0.1 |
97.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 851 |
| 3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- | 439 |
| B |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
1.6 |
0.6* |
-- |
0.3 |
94.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 311 |
| |
| Basepair (1966:1970)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
74.6* |
1.2* |
0.5* |
-- |
23.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 | 849 |
| 3 |
-- |
54.9 |
-- |
-- |
-- |
44.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 437 |
| B |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
93.9* |
3.2* |
1.3* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 311 |
| |
| Basepair (1972:2010)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
99.3* |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 848 |
| 3 |
-- |
-- |
99.3* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 436 |
| B |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- | 240 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 311 |
| |
| Basepair (1973:2009)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 849 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 437 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.1 |
94.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 311 |
| |
| Basepair (1974:2008)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
40.0 |
-- |
0.1* |
0.1 |
59.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 848 |
| 3 |
50.3* |
-- |
-- |
-- |
49.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 437 |
| B |
91.3 |
-- |
-- |
-- |
8.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
6.1 |
-- |
0.3* |
0.3 |
92.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 310 |
| |
| Basepair (1975:2005)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
99.2* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 845 |
| 3 |
-- |
99.3* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 437 |
| B |
-- |
99.2* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
98.7* |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 | 307 |
| |
| Basepair (1977:1984)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
68.0* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
9.0 |
-- |
-- |
0.2* |
22.2 |
0.1 | 848 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
96.8 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- | 437 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
-- |
-- |
73.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
26.8 |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
-- |
17.1 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
24.5 |
-- |
-- |
0.6 |
56.8* |
0.3 | 310 |
| |
| Basepair (1981:1983)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
21.4 |
0.2 |
4.6 |
2.6 |
-- |
-- |
1.4* |
1.9 |
-- |
4.6 |
16.4 |
6.7* |
-- |
-- |
39.2* |
0.8 |
0.1 | 849 |
| 3 |
40.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
56.2* |
-- |
0.2 | 438 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6* |
-- |
-- | 241 |
| A |
58.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
26.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.6 |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
36.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
58.4 |
5.0 |
-- | 101 |
| E |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 | 156 |
| M |
1.0 |
0.6 |
0.6* |
7.1* |
-- |
-- |
3.5 |
1.6 |
-- |
12.6 |
44.8* |
18.4 |
-- |
-- |
9.0 |
0.6 |
-- | 310 |
| |
| Basepair (1986:2002)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
97.3* |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1* |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 849 |
| 3 |
99.1* |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 437 |
| B |
98.8* |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
93.9* |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
0.3* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.5 |
-- |
-- |
-- |
-- | 311 |
| |
| Basepair (1987:2001)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
7.3* |
85.3* |
1.3 |
2.6* |
1.5 |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
1.3 |
0.1 | 848 |
| 3 |
-- |
7.8* |
90.8* |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- | 436 |
| B |
-- |
0.8* |
96.7* |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- | 240 |
| A |
-- |
78.0* |
22.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
12.9* |
83.2* |
3.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
4.8* |
78.1* |
2.6 |
6.8* |
3.9 |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
2.3 |
0.3 | 311 |
| |
| Basepair (1988:2000)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
84.5* |
2.6* |
0.1 |
0.2* |
11.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.2 | 849 |
| 3 |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 437 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 241 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
1.0* |
99.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
58.5* |
7.1* |
0.3 |
0.6* |
32.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 311 |
| |
| Basepair (1989:1999)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
44.8* |
14.7* |
14.3* |
22.4* |
-- |
1.6 |
-- |
0.1 |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 849 |
| 3 |
63.6* |
0.5* |
0.7* |
34.8* |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 437 |
| B |
97.1* |
-- |
-- |
2.5* |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
74.3* |
-- |
4.0* |
21.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
2.6* |
1.3* |
1.9* |
93.5* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
8.7* |
39.5* |
36.7* |
5.1* |
-- |
4.2 |
-- |
-- |
-- |
5.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- | 311 |
| |
| Basepair (1990:1998)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
42.5* |
13.5 |
13.7 |
7.8* |
-- |
22.1* |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 849 |
| 3 |
62.0* |
2.5 |
0.2 |
1.1* |
-- |
33.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- | 437 |
| B |
98.8* |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- | 241 |
| A |
73.2* |
26.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
64.4* |
-- |
-- |
35.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
2.6* |
-- |
0.6 |
1.9* |
-- |
94.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
| M |
8.0* |
33.4* |
37.0* |
8.0* |
-- |
13.2 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 311 |
| |
| Basepair (1991:1997)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.2 |
13.0 |
0.4 |
44.3* |
9.8* |
2.0 |
2.9* |
0.8 |
25.3* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
1.1 |
-- | 849 |
| 3 |
-- |
-- |
3.4 |
0.2 |
58.6* |
2.7* |
1.4 |
-- |
-- |
32.0* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
1.1 |
-- | 437 |
| B |
-- |
-- |
4.6* |
-- |
94.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
58.5* |
17.1* |
14.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.0* |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
3.9* |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
88.4* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
3.2 |
-- | 155 |
| M |
-- |
0.6* |
30.5* |
0.6 |
6.8* |
22.8 |
3.5 |
7.4* |
2.3 |
24.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- | 311 |
| |
| Basepair (2010:2013)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
0.2 |
97.3* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 849 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.2 |
98.6* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 437 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.4 |
97.9* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.5 |
0.3 |
95.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 311 |
| |
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