Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (43 of 60)
| Basepair (2060:2076)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
23.6 |
2.7* |
2.6 |
-- |
9.8 |
1.3 |
0.5 |
53.4* |
0.6 |
0.1 |
1.9* |
1.5 |
0.1 |
-- |
1.5 |
0.3 | 848 |
| 3 |
-- |
44.3* |
0.2 |
3.2* |
-- |
18.6 |
1.1 |
0.5 |
24.3 |
0.7 |
0.2 |
3.0 |
0.9* |
-- |
-- |
2.5 |
0.4 | 436 |
| B |
-- |
12.5 |
-- |
-- |
-- |
33.8 |
2.1 |
0.8 |
44.2* |
-- |
-- |
-- |
1.7* |
-- |
-- |
4.6* |
0.4 | 240 |
| A |
-- |
31.7* |
2.4* |
34.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
2.0 |
94.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
| E |
-- |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.9 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
2.3 |
7.1* |
2.6 |
-- |
0.6 |
1.0 |
-- |
81.0* |
0.6 |
-- |
1.0* |
2.9 |
0.3 |
-- |
0.6 |
-- | 311 |
| |
| Basepair (2061:2075)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.8* |
14.2* |
15.6* |
35.2* |
-- |
1.5 |
0.1 |
-- |
18.2 |
0.1 |
-- |
10.5 |
0.1 |
0.9 |
-- |
1.5 |
1.1 | 847 |
| 3 |
1.4* |
2.8 |
1.6 |
52.6* |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
35.4 |
0.2* |
-- |
0.2 |
-- |
1.8 |
-- |
0.7 |
0.2 | 435 |
| B |
2.5* |
-- |
1.2* |
95.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 240 |
| A |
-- |
30.0* |
10.0* |
-- |
-- |
27.5 |
-- |
-- |
12.5 |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
10.0 |
-- |
7.5 |
-- | 40 |
| C |
-- |
-- |
-- |
12.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
87.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
95.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
0.3* |
34.7* |
40.2* |
18.0* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
3.2 |
2.9 | 311 |
| |
| Basepair (2063:2083)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.8 |
-- |
39.3* |
1.8* |
0.6 |
0.7 |
2.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.8 |
12.0 |
4.6* |
1.9 |
33.9 |
1.1 | 849 |
| 3 |
1.6 |
-- |
50.1* |
2.5* |
1.1 |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
23.1 |
8.9* |
2.5 |
6.4 |
1.1 | 437 |
| B |
-- |
-- |
83.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
4.6 |
11.2 |
0.4 | 241 |
| A |
-- |
-- |
43.9* |
24.4* |
-- |
-- |
19.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
9.8 | 41 |
| C |
-- |
-- |
89.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
9.9 |
-- | 101 |
| E |
4.5 |
-- |
0.6 |
0.6* |
3.2 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
63.9* |
25.2 |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
8.0 |
1.3 |
-- |
1.9 |
2.9* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
2.3 |
0.3 |
-- |
1.3 |
80.4* |
1.3 | 311 |
| |
| Basepair (2064:2081)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
22.7* |
32.5* |
15.0* |
24.9* |
0.5 |
0.5 |
0.1 |
0.5 |
-- |
1.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
1.2 |
0.6 | 847 |
| 3 |
16.3* |
48.0* |
4.1* |
30.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 435 |
| B |
22.2* |
24.7* |
0.4* |
51.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 239 |
| A |
43.9* |
19.5* |
31.7* |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
94.1* |
-- |
-- |
5.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
91.6* |
2.6* |
5.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
8.4* |
21.2* |
35.0* |
22.8* |
1.3 |
1.3 |
0.3 |
1.3 |
-- |
3.2 |
0.3 |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
3.2 |
0.9 | 311 |
| |
| Basepair (2065:2080)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.9 |
54.4* |
24.9* |
1.7 |
7.1* |
4.2 |
-- |
0.1* |
-- |
0.8 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
2.0 |
0.4 | 848 |
| 3 |
4.4 |
71.8* |
6.9* |
0.2 |
11.9* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.7 |
0.2 | 436 |
| B |
7.5 |
53.3* |
11.2* |
-- |
20.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
6.7 |
0.4 | 240 |
| A |
-- |
85.4* |
-- |
-- |
4.9* |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
1.0* |
96.0* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
0.6* |
96.1* |
1.9* |
0.6* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
4.5* |
47.3* |
27.0* |
3.2* |
2.6 |
10.3 |
-- |
0.3 |
-- |
2.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
1.0 |
0.3 |
0.9 | 311 |
| |
| Basepair (2066:2079)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
7.9* |
59.0* |
9.2* |
21.5* |
0.4 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 848 |
| 3 |
14.0* |
43.2* |
7.6* |
35.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 437 |
| B |
17.0* |
67.6* |
8.3* |
6.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 241 |
| A |
9.8* |
58.5* |
22.0* |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
94.1* |
2.0* |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
10.3* |
1.9* |
2.6* |
85.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
1.9* |
69.7* |
13.9* |
9.4* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 310 |
| |
| Basepair (2067:2078)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
8.6* |
33.8* |
19.8* |
30.9* |
-- |
5.9 |
-- |
0.1 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.3 | 850 |
| 3 |
15.3* |
10.5* |
25.3* |
47.7* |
-- |
0.7 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 438 |
| B |
14.5* |
16.9* |
45.9* |
21.1* |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- | 242 |
| A |
73.2* |
-- |
-- |
24.4* |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
53.5* |
3.0* |
-- |
-- |
42.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
| E |
1.3* |
3.2* |
0.6* |
94.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
1.9* |
60.1* |
17.4* |
17.4* |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.6 | 311 |
| |
| Basepair (2068:2077)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
96.2* |
0.2* |
1.8* |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 | 849 |
| 3 |
98.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 | 437 |
| B |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
90.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
92.6* |
0.6* |
4.8* |
1.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 311 |
| |
| Basepair (2069:2074)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1 |
80.1* |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
18.1* |
-- |
-- |
0.2 | 850 |
| 3 |
-- |
0.2 |
62.6* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
35.2* |
-- |
-- |
0.4 | 438 |
| B |
-- |
0.4* |
99.2* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
82.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.7* |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
-- |
98.4 |
-- |
-- |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 311 |
| |
| Basepair (2084:2660)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.6 |
46.7* |
3.6 |
2.5* |
0.7 |
0.1 |
2.6 |
0.4 |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
8.8* |
1.0 |
-- |
0.1 |
30.3 | 730 |
| 3 |
3.9 |
63.9* |
3.9 |
0.5 |
1.2 |
-- |
3.9 |
0.7* |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- |
15.5* |
1.7 |
-- |
-- |
4.1 | 413 |
| B |
1.7* |
94.1* |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 | 236 |
| A |
2.4* |
97.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
92.7* |
5.5* |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
8.1 |
2.2* |
8.8 |
1.5 |
3.7 |
-- |
11.8 |
2.2* |
1.5 |
0.7 |
-- |
-- |
47.1* |
4.4 |
-- |
-- |
8.1 | 136 |
| M |
1.1* |
9.9* |
2.7* |
5.7* |
-- |
0.4 |
1.1 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
78.0 | 262 |
| |
| Basepair (2085:2659)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.3* |
40.0* |
6.6* |
2.3* |
0.4 |
0.4 |
0.8 |
-- |
15.3 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
28.0 | 730 |
| 3 |
9.2* |
55.0* |
5.3* |
1.2* |
0.7 |
-- |
0.7 |
-- |
27.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 | 413 |
| B |
13.1* |
84.0* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
58.5* |
31.7* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- | 41 |
| C |
-- |
76.4* |
20.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
5.2* |
3.7 |
1.5* |
1.5 |
2.2 |
-- |
2.2 |
-- |
82.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.5 | 135 |
| M |
0.4* |
8.8* |
5.7* |
4.6* |
-- |
1.1 |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.8 |
77.1 | 262 |
| |
| Basepair (2086:2658)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7* |
36.0* |
10.3* |
20.3* |
0.3 |
3.8 |
0.3 |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
27.7 | 730 |
| 3 |
1.2* |
62.2* |
4.4* |
29.1* |
-- |
2.2 |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 413 |
| B |
-- |
91.1* |
4.6* |
-- |
-- |
3.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
90.2* |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
67.3* |
5.5* |
-- |
27.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
3.7* |
3.7* |
2.2* |
88.1* |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
-- |
2.3* |
7.6* |
9.5* |
0.8 |
1.5 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
77.1 | 262 |
| |
| Basepair (2087:2657)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
14.1 |
7.7* |
18.4* |
9.9 |
24.2* |
0.3 |
0.4 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.4 |
0.3 |
23.9 | 730 |
| 3 |
23.2 |
10.9* |
28.3* |
2.9 |
33.4* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.2 |
-- | 413 |
| B |
40.5 |
-- |
-- |
1.3 |
58.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
9.1 |
-- |
-- |
38.2 |
50.9* |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
-- |
3.0* |
85.9* |
6.7* |
0.7 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
0.7 |
-- | 135 |
| M |
0.8* |
4.2* |
6.5* |
14.9* |
4.2 |
-- |
1.1 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
66.5 | 262 |
| |
| Basepair (2088:2656)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* |
63.4* |
9.3* |
1.5* |
0.1 |
0.8 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
23.8 | 729 |
| 3 |
-- |
93.0* |
4.4* |
0.7* |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 412 |
| B |
-- |
94.5* |
4.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
-- |
97.6* |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
94.5* |
5.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
-- |
88.9* |
4.4* |
2.2* |
-- |
4.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
0.8* |
10.3* |
17.9* |
3.1* |
0.4 |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
66.0 | 262 |
| |
| Basepair (2089:2655)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
29.2* |
9.9* |
13.0* |
46.4* |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.5 |
-- | 730 |
| 3 |
49.2* |
2.4* |
2.2* |
45.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 413 |
| B |
81.0* |
-- |
0.8* |
17.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
19.5* |
24.4* |
17.1* |
39.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
3.0* |
-- |
-- |
97.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
3.8* |
23.7* |
32.8* |
36.3* |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
1.5 |
-- | 262 |
| |
| Basepair (2090:2654)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
46.6* |
7.9* |
1.6* |
42.3* |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
0.1 | 730 |
| 3 |
70.2* |
1.2* |
1.7* |
24.7* |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.7 |
0.2 |
-- |
0.2 | 413 |
| B |
58.6* |
1.7* |
1.3* |
36.7* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
51.2* |
2.4* |
9.8* |
36.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
94.5* |
5.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
96.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
0.7 |
-- |
-- | 135 |
| M |
19.1* |
0.4* |
0.8* |
79.0* |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 262 |
| |
| Basepair (2091:2653)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.5* |
41.2* |
17.8* |
6.7* |
0.5 |
7.9 |
0.1 |
-- |
0.1 |
22.3 |
0.4 |
0.1 |
1.0 |
0.3 |
-- |
0.7 |
0.1 | 730 |
| 3 |
0.2* |
46.5* |
3.4* |
2.4* |
-- |
10.9 |
-- |
-- |
0.2 |
33.2 |
0.7 |
-- |
1.7 |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 | 413 |
| B |
-- |
72.2* |
1.7* |
4.2* |
-- |
17.3 |
-- |
-- |
0.4 |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
2.4* |
48.8* |
22.0* |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
17.1 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
83.6* |
1.8* |
-- |
-- |
14.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
-- |
1.5 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
95.6 |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
1.1* |
24.0* |
43.9* |
14.9* |
1.5 |
1.9 |
0.4 |
-- |
-- |
9.9 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- | 262 |
| |
| Basepair (2093:2652)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
26.3* |
1.8* |
-- |
47.7* |
23.9 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 727 |
| 3 |
31.0 |
1.9* |
-- |
27.1 |
40.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 413 |
| B |
50.2* |
-- |
-- |
46.8* |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
22.0 |
19.5* |
-- |
-- |
58.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
96.2 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 52 |
| E |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
98.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
5.0* |
1.9* |
-- |
89.7* |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- | 262 |
| |
| Basepair (2094:2651)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
96.4* |
1.1* |
1.4* |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 727 |
| 3 |
97.6* |
1.9* |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 413 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
78.0* |
19.5* |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 52 |
| E |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- | 135 |
| M |
93.9* |
-- |
3.8* |
1.5* |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 262 |
| |
| Basepair (2095:2650)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
20.8* |
-- |
-- |
77.9* |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- | 727 |
| 3 |
35.8* |
-- |
-- |
62.0* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- | 413 |
| B |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
31.7* |
-- |
-- |
46.3* |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
19.5 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 52 |
| E |
99.3* |
-- |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
1.1* |
-- |
-- |
98.5* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 262 |
| |
| Basepair (2097:2647)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
70.7* |
-- |
-- |
18.7* |
-- |
-- |
7.6 |
0.7 |
0.3 |
-- |
0.1 |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- | 727 |
| 3 |
65.9* |
-- |
-- |
32.7* |
-- |
-- |
1.0 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 413 |
| B |
97.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.2 |
-- |
3.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 52 |
| E |
0.7* |
-- |
-- |
99.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
92.4* |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
0.4 |
1.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
5.3 |
-- |
-- |
-- |
-- | 262 |
| |
| Basepair (2098:2646)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
40.9* |
2.6* |
0.1* |
54.8* |
1.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- | 728 |
| 3 |
51.8* |
4.6* |
0.2* |
42.9* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 413 |
| B |
90.3* |
-- |
-- |
8.9* |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
46.3* |
2.4* |
51.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 53 |
| E |
0.7* |
-- |
-- |
99.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
11.8* |
-- |
-- |
84.7* |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 262 |
| |
Last generated : Mon Jul 1 2002 (8 : 31)