Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (46 of 60)
| Basepair (2134:2241)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
66.0* |
-- |
-- |
1.8* |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
31.6 | 848 |
| 3 |
98.6* |
-- |
-- |
1.1* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 438 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
96.8* |
-- |
-- |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
8.7* |
-- |
-- |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
86.7 | 309 |
| |
| Basepair (2135:2240)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
8.0* |
3.7* |
18.9* |
19.9* |
14.9 |
1.5 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 |
31.6 | 848 |
| 3 |
5.9* |
6.4* |
32.0* |
31.5* |
19.9 |
2.7 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- | 438 |
| B |
4.5* |
4.5* |
-- |
55.0* |
34.3 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- | 242 |
| A |
34.1* |
24.4* |
17.1* |
12.2* |
9.8 |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
40.6* |
1.0* |
-- |
17.8* |
38.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 101 |
| E |
0.6* |
4.5* |
85.2* |
0.6* |
-- |
7.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
0.3* |
0.6* |
6.5* |
4.2* |
-- |
0.3 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
86.7 | 309 |
| |
| Basepair (2136:2239)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
7.3 |
5.1* |
7.0* |
19.5 |
24.1* |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
0.8 |
0.9 |
31.6 | 848 |
| 3 |
13.5 |
8.2* |
9.6* |
30.8 |
31.1* |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
1.4 |
0.7 |
-- | 438 |
| B |
5.8* |
10.3* |
14.9* |
50.8* |
8.3 |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
2.5 |
0.8 |
-- | 242 |
| A |
43.9* |
26.8* |
14.6* |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
2.0* |
4.0* |
13.9 |
64.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.9 |
-- |
-- |
1.0 |
4.0 |
-- | 101 |
| E |
17.4 |
-- |
-- |
8.4 |
72.9* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
| M |
1.0* |
1.6* |
4.2* |
5.2* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
86.7 | 309 |
| |
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