Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (49 of 60)
| Basepair (2321:2378)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.1* |
68.1* |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
0.1* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
30.6 | 849 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 438 |
| B |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
98.1 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
0.3* |
13.3* |
-- |
-- |
0.3 |
0.6 |
-- |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
83.8 | 309 |
| |
| Basepair (2323:2377)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
10.5 |
-- |
0.1* |
1.9 |
56.7* |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
30.5 | 849 |
| 3 |
17.4 |
-- |
-- |
0.7 |
81.5* |
-- |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 438 |
| B |
17.4 |
-- |
-- |
0.4 |
82.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
75.6 |
-- |
-- |
-- |
24.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
1.9 |
-- |
-- |
1.3 |
95.5* |
-- |
-- |
1.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
4.2 |
-- |
0.3* |
3.6 |
7.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.0 | 309 |
| |
| Basepair (2324:2376)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
58.0* |
2.0* |
0.8* |
7.9* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
31.0 | 849 |
| 3 |
80.1* |
3.9* |
1.1* |
13.7* |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 438 |
| B |
95.0* |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
78.0* |
9.8* |
4.9* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
99.0* |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
57.4* |
0.6* |
1.9* |
36.8* |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 155 |
| M |
12.9* |
-- |
0.3* |
2.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
84.1 | 309 |
| |
| Basepair (2325:2375)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.7* |
6.9 |
3.5 |
0.2* |
-- |
54.8* |
-- |
-- |
0.1 |
0.2* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
31.0 | 849 |
| 3 |
5.0* |
12.6 |
5.3 |
0.2* |
-- |
75.6* |
-- |
-- |
0.2 |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 | 438 |
| B |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
97.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.8 | 242 |
| A |
-- |
7.3 |
4.9 |
-- |
-- |
87.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
97.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
13.5* |
33.5 |
12.3 |
0.6* |
-- |
38.1* |
-- |
-- |
0.6 |
1.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
0.3* |
1.3 |
1.9 |
0.3* |
-- |
11.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.7 | 309 |
| |
| Basepair (2326:2374)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
12.3* |
7.8* |
33.7* |
13.1* |
0.7 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
31.3 | 848 |
| 3 |
23.1* |
14.0* |
42.8* |
17.4* |
1.4 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.2 |
-- |
0.5 | 437 |
| B |
6.2* |
6.2* |
71.8* |
14.5* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 241 |
| A |
-- |
80.5* |
17.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
2.9* |
91.2* |
2.0* |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 102 |
| E |
54.8* |
8.4* |
5.2* |
26.5* |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- | 155 |
| M |
1.0* |
0.6* |
1.9* |
10.7* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.4 | 309 |
| |
| Basepair (2327:2373)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
14.1* |
26.4* |
4.6* |
21.6* |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
31.5 | 849 |
| 3 |
25.3* |
32.2* |
4.1* |
37.2* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 | 438 |
| B |
24.0* |
56.6* |
6.6* |
11.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 242 |
| A |
73.2* |
-- |
4.9* |
22.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
77.5* |
8.8* |
-- |
-- |
13.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
14.8* |
2.6* |
-- |
81.3* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
| M |
2.9* |
1.3* |
3.9* |
6.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.4 | 309 |
| |
| Basepair (2328:2372)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
33.1* |
25.6* |
4.6* |
4.6* |
0.7 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.2 | 847 |
| 3 |
58.7* |
31.0* |
2.8* |
6.9* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 436 |
| B |
40.4* |
55.0* |
2.9* |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 240 |
| A |
80.5* |
7.3* |
9.8* |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
76.5* |
21.6* |
1.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
81.9* |
-- |
0.6* |
15.5* |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
7.8* |
1.3* |
1.6* |
2.6* |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.4 | 309 |
| |
| Basepair (2329:2371)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.1* |
63.0* |
2.1* |
0.6* |
-- |
1.4 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
31.3 | 847 |
| 3 |
-- |
96.3* |
2.1* |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 436 |
| B |
-- |
96.2* |
1.2* |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 240 |
| A |
-- |
95.1* |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
89.2* |
4.9* |
-- |
-- |
5.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
96.8* |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
2.9* |
7.4* |
1.3* |
1.6* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
85.7 | 309 |
| |
| Basepair (2330:2369)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
66.2* |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.4* |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
32.2 | 849 |
| 3 |
-- |
-- |
97.9* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 438 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 102 |
| E |
-- |
-- |
94.2* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 155 |
| M |
-- |
-- |
10.4* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
87.0 | 309 |
| |
| Basepair (2331:2355)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
57.7* |
3.3* |
6.2* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
31.7 | 849 |
| 3 |
-- |
85.6* |
2.7* |
11.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 438 |
| B |
-- |
76.0* |
5.0* |
19.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
97.1* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 102 |
| E |
-- |
96.1* |
-- |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
0.3* |
5.2* |
4.5* |
1.0* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
86.7 | 309 |
| |
| Basepair (2332:2352)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.1* |
0.1 |
0.1* |
2.7 |
1.6 |
0.1 |
6.7 |
1.3 |
50.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
34.8 | 849 |
| 3 |
1.6 |
0.2 |
-- |
3.0 |
3.2* |
0.2 |
3.7 |
0.9 |
86.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 438 |
| B |
2.9 |
-- |
-- |
5.4 |
5.8* |
-- |
4.5 |
1.7 |
79.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
95.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
10.8* |
-- |
-- |
7.8 |
-- |
-- |
38.2* |
2.9 |
38.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
1.0 | 102 |
| E |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.9 |
-- |
95.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 155 |
| M |
-- |
-- |
0.3* |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
1.3 |
2.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
94.4 | 309 |
| |
| Basepair (2333:2351)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
38.5* |
0.5* |
8.7* |
12.2* |
5.3 |
-- |
0.6 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
33.7 | 849 |
| 3 |
55.5* |
0.9* |
14.8* |
18.7* |
8.0 |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 | 438 |
| B |
61.2* |
0.8* |
17.8* |
4.5* |
13.2 |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
75.6* |
4.9* |
2.4* |
9.8* |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
82.4* |
-- |
2.0* |
3.9* |
8.8 |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 102 |
| E |
41.3* |
-- |
14.2* |
42.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 155 |
| M |
-- |
-- |
2.3* |
5.8* |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.6 | 309 |
| |
| Basepair (2334:2350)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.4* |
18.0* |
13.0* |
15.3* |
2.6 |
1.6 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
33.6 | 849 |
| 3 |
20.5* |
31.5* |
16.9* |
26.5* |
0.7 |
2.7 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 438 |
| B |
8.7* |
35.5* |
7.0* |
44.6* |
-- |
4.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
82.9* |
14.6* |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
30.4* |
11.8* |
32.4* |
4.9* |
18.6 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 102 |
| E |
22.6* |
29.7* |
36.8* |
5.2* |
1.3 |
1.3 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 155 |
| M |
3.2* |
1.0* |
1.0* |
2.9* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.3 | 309 |
| |
| Basepair (2335:2349)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
19.9* |
26.6* |
3.3* |
15.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.4 |
-- |
0.1 |
-- |
33.7 | 849 |
| 3 |
38.4* |
28.5* |
2.7* |
29.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.7 | 438 |
| B |
11.2* |
34.3* |
5.0* |
49.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
-- |
97.6* |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
91.2* |
4.9* |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 102 |
| E |
90.3* |
1.9* |
-- |
5.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
1.3 | 155 |
| M |
0.3* |
2.6* |
3.6* |
1.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
91.3 | 309 |
| |
| Basepair (2336:2348)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.8* |
12.5* |
29.4* |
16.8* |
0.9 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
-- |
33.5 | 849 |
| 3 |
11.0* |
21.2* |
34.0* |
31.7* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- | 438 |
| B |
2.9* |
38.4* |
58.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
12.7* |
86.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 102 |
| E |
-- |
-- |
5.2* |
89.0* |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.3 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
0.3* |
-- |
4.2* |
1.3* |
1.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
91.6 | 309 |
| |
| Basepair (2337:2347)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
60.9* |
0.9* |
0.4* |
2.5* |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.1 |
-- |
33.9 | 849 |
| 3 |
97.3* |
1.4* |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- | 438 |
| B |
99.6* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
92.7* |
2.4* |
-- |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
83.3* |
-- |
-- |
10.8* |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 102 |
| E |
94.8* |
2.6* |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
0.6 |
-- |
-- | 155 |
| M |
1.9* |
0.6* |
1.0* |
2.3* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
92.9 | 309 |
| |
| Basepair (2338:2346)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
7.1 |
0.2 |
0.2 |
13.8 |
41.8* |
0.9* |
0.1 |
0.7* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
34.4 | 849 |
| 3 |
13.5 |
-- |
-- |
24.9 |
58.4* |
1.8* |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 438 |
| B |
2.9 |
-- |
-- |
2.1 |
93.0* |
-- |
-- |
1.2* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
19.5 |
-- |
-- |
-- |
61.0* |
19.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
94.1* |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
1.0 | 102 |
| E |
28.4* |
-- |
-- |
66.5* |
4.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
| M |
0.3* |
0.6* |
0.6* |
1.9* |
1.0 |
-- |
0.3 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
94.2 | 309 |
| |
| Basepair (2357:2366)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
46.3* |
3.1* |
1.2* |
8.6* |
9.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
31.2 | 849 |
| 3 |
63.9* |
5.5* |
0.9* |
15.3* |
13.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 438 |
| B |
82.2 |
-- |
-- |
-- |
17.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
89.2* |
-- |
-- |
2.9* |
7.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
26.5* |
15.5* |
2.6* |
42.6* |
11.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 155 |
| M |
7.1* |
0.6* |
1.9* |
1.0* |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
85.1 | 309 |
| |
| Basepair (2358:2365)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.6* |
20.7 |
1.2 |
0.1* |
-- |
45.9* |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.2 | 849 |
| 3 |
1.1* |
35.2 |
0.2 |
-- |
-- |
62.6* |
-- |
-- |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 438 |
| B |
-- |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
92.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
7.3* |
14.6 |
-- |
-- |
-- |
78.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
2.0 |
2.0 |
-- |
-- |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
1.3* |
84.5* |
0.6* |
-- |
-- |
11.6 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
6.5* |
2.3* |
0.3* |
-- |
5.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.1 | 309 |
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