Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (50 of 60)
| Basepair (2360:2426)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4 |
22.7 |
2.9 |
13.1* |
0.1 |
26.4* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7* |
0.1 |
-- |
-- |
31.3 | 849 |
| 3 |
0.7 |
34.5* |
2.5 |
24.9* |
0.2 |
31.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.3* |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 438 |
| B |
-- |
46.7 |
-- |
-- |
-- |
53.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
82.9* |
4.9* |
-- |
-- |
12.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
31.4 |
2.9 |
-- |
-- |
65.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
1.9 |
3.2 |
5.8 |
69.7* |
0.6 |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.8* |
0.6 |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
3.2 |
3.6 |
0.6* |
-- |
5.8* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
86.1 | 309 |
| |
| Basepair (2362:2424)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.1* |
68.4* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.0 | 849 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
99.1 |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 438 |
| B |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
97.4 |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
0.3* |
14.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.1 | 309 |
| |
| Basepair (2363:2423)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
25.8* |
0.1* |
15.0* |
27.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
31.0 | 849 |
| 3 |
49.8* |
-- |
19.2* |
30.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
-- | 438 |
| B |
13.2* |
-- |
34.7* |
52.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
92.7* |
-- |
-- |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
2.0* |
98.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
94.8* |
-- |
0.6* |
1.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
1.3 |
-- |
-- | 155 |
| M |
0.3* |
0.3* |
13.3* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.1 | 309 |
| |
| Basepair (2364:2422)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
62.0* |
0.5* |
3.3* |
2.8* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.2 | 849 |
| 3 |
90.0* |
0.7* |
5.7* |
2.7* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 438 |
| B |
88.8* |
-- |
10.3* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
78.0* |
-- |
-- |
22.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
94.1* |
-- |
-- |
5.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
94.8* |
1.9* |
-- |
1.3* |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
11.7* |
0.3* |
1.0* |
1.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.1 | 309 |
| |
| Basepair (2379:2408)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.3 |
0.1 |
1.9 |
-- |
0.2 |
-- |
3.7* |
0.5 |
3.8 |
-- |
-- |
-- |
11.3 |
30.9* |
-- |
1.3* |
31.1 | 849 |
| 3 |
29.7 |
0.2 |
3.7 |
-- |
0.2 |
-- |
4.6* |
0.7 |
6.8 |
-- |
-- |
-- |
15.1 |
37.7* |
-- |
0.9* |
0.4 | 438 |
| B |
0.8 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.3* |
-- |
10.7 |
-- |
-- |
-- |
14.9 |
64.5* |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
26.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
58.5 |
14.6 |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.7 |
82.4* |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
74.8* |
-- |
10.3* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.9 |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
3.9 |
2.6 |
-- |
2.6 |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
2.6 |
0.3 |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
4.9* |
4.2 |
-- |
2.3* |
84.7 | 309 |
| |
| Basepair (2381:2407)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
50.2* |
17.9* |
0.5 |
0.6* |
0.9 |
1.4 |
0.9* |
0.2 |
0.5 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
26.2 | 850 |
| 3 |
-- |
66.1* |
31.2* |
0.5* |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 439 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
95.1* |
-- |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
94.1* |
3.9* |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
6.5* |
87.7* |
-- |
0.6* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 155 |
| M |
0.3 |
13.3* |
3.6 |
0.6 |
1.3* |
1.6 |
3.9* |
0.3 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
73.6 | 309 |
| |
| Basepair (2382:2406)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
10.7* |
4.1* |
62.7* |
12.2* |
0.2 |
0.9 |
0.9 |
0.7 |
0.2 |
0.6 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.5 |
5.9 | 850 |
| 3 |
2.5* |
8.0* |
85.4* |
1.8* |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 | 439 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
26.8* |
19.5* |
36.6* |
17.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
17.4* |
75.5* |
0.6* |
-- |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 | 155 |
| M |
25.9* |
-- |
18.4* |
31.1* |
0.6 |
0.6 |
2.6 |
1.9 |
0.6 |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
1.0 |
15.6 | 309 |
| |
| Basepair (2383:2405)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
48.4* |
20.8* |
16.5* |
4.0* |
-- |
2.2 |
0.9 |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.5 |
5.5 | 849 |
| 3 |
61.6* |
9.1* |
23.7* |
1.8* |
-- |
1.6 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.9 |
0.2 | 438 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
65.9* |
2.4* |
19.5* |
12.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
1.9* |
25.2* |
61.3* |
1.9* |
-- |
4.5 |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
0.6 | 155 |
| M |
12.6* |
44.3* |
11.7* |
8.4* |
-- |
3.9 |
1.6 |
0.3 |
1.0 |
0.3 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
14.8 | 309 |
| |
| Basepair (2384:2404)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.6* |
32.9* |
15.3* |
1.5* |
1.1 |
9.5 |
1.9 |
-- |
-- |
11.3 |
1.1 |
-- |
0.1 |
-- |
12.9 |
2.8 |
5.8 | 850 |
| 3 |
6.4 |
46.0* |
3.9 |
0.7 |
1.6* |
14.8 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
24.1* |
2.1 |
-- | 439 |
| B |
-- |
76.5* |
6.6* |
-- |
0.4* |
14.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
-- | 243 |
| A |
61.0* |
4.9 |
-- |
-- |
4.9 |
29.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
71.6* |
15.7* |
-- |
-- |
9.8 |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
1.9 |
9.7* |
0.6 |
1.9 |
2.6* |
11.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
67.7* |
3.2 |
-- | 155 |
| M |
1.0 |
1.6 |
31.4* |
3.2* |
0.6 |
1.9 |
4.2 |
-- |
-- |
30.7 |
2.6* |
-- |
0.3 |
-- |
1.3 |
4.9 |
16.2 | 309 |
| |
| Basepair (2385:2403)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.9 |
0.8* |
10.5 |
4.6* |
1.1 |
0.2 |
26.8 |
0.8 |
0.1 |
1.6 |
-- |
0.1 |
40.8* |
0.1 |
0.6* |
0.4 |
6.4 | 850 |
| 3 |
9.6 |
1.4* |
1.8 |
5.5* |
2.1 |
0.5 |
7.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
71.5* |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 439 |
| B |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
12.8 |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
84.4* |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 | 243 |
| A |
36.6* |
-- |
4.9* |
48.8* |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
16.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
16.1 |
3.9* |
3.9 |
2.6* |
1.9 |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
70.3* |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
0.3 |
26.2 |
4.9 |
-- |
-- |
36.2* |
2.3 |
-- |
4.5 |
-- |
0.3* |
5.2 |
-- |
1.6* |
1.0 |
17.4 | 309 |
| |
| Basepair (2386:2402)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7* |
2.9 |
2.9* |
22.8 |
0.4 |
0.2 |
14.8 |
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0.1 |
-- |
0.1 |
0.8 |
13.0 | 850 |
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1.4* |
5.7 |
4.6* |
32.8 |
-- |
-- |
4.8 |
-- |
50.3* |
-- |
-- |
0.2* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- | 439 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.6 |
-- |
90.9* |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
61.0* |
31.7* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
12.7 |
-- |
87.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
3.9* |
-- |
4.5* |
90.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
1.6 |
16.2 |
1.0 |
0.6 |
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1.6 |
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1.0 |
0.3* |
1.0 |
-- |
-- |
0.3 |
2.3* |
35.9 | 309 |
| |
| Basepair (2387:2401)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
61.3* |
5.9* |
18.5* |
2.7* |
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-- |
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-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
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-- |
0.1 |
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0.7 |
5.2 |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
0.2 |
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| B |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.8 | 243 |
| A |
-- |
70.7* |
22.0* |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- | 41 |
| C |
97.1* |
-- |
-- |
1.0* |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
0.6 |
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1.9 |
1.9* |
13.5 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
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1.0 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
18.0 | 309 |
| |
| Basepair (2388:2400)
|
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| GC
| CG
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| GU
| UG
| AA
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| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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0.4 |
0.1 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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13.4* |
32.8* |
49.0* |
0.2 |
0.7 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 439 |
| B |
2.9* |
7.0* |
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87.7* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
9.8* |
80.5* |
2.4* |
2.4* |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
13.2 | 309 |
| |
| Basepair (2389:2399)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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4.9* |
5.2* |
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-- |
-- |
-- |
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11.8* |
47.2* |
4.1* |
1.6* |
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32.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.7 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
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| B |
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1.2* |
0.8* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 243 |
| A |
14.6* |
36.6 |
2.4 |
-- |
-- |
41.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
2.0* |
97.1* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
1.3* |
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-- |
79.4* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 |
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-- |
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0.3 |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
12.3 | 309 |
| |
| Basepair (2390:2398)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
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-- |
-- |
0.9 |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
0.8 |
-- |
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0.1 |
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-- |
-- |
2.5* |
-- |
-- |
1.8 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
1.6* |
-- |
1.6 |
-- |
1.1 |
0.2 |
90.7 | 439 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.9 | 243 |
| A |
-- |
-- |
26.8* |
-- |
-- |
19.5 |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
17.1* |
-- |
17.1 |
-- |
12.2 |
2.4 |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 155 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 309 |
| |
| Basepair (2391:2397)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.7 |
0.9 |
-- |
0.1* |
-- |
1.2 |
-- |
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2.0* |
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1.1 |
-- |
0.8* |
0.2 |
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| 3 |
-- |
1.4 |
0.2 |
-- |
0.2* |
-- |
1.6 |
-- |
1.4* |
2.5* |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
90.7 | 439 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 243 |
| A |
-- |
14.6 |
2.4 |
-- |
2.4* |
-- |
17.1 |
-- |
14.6* |
26.8* |
-- |
-- |
22.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.1 | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 155 |
| M |
-- |
-- |
2.3* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
0.3* |
1.9 |
2.3* |
0.3 |
-- |
-- |
2.3 |
0.6 |
89.1 | 309 |
| |
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