Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (51 of 60)
| Basepair (2409:2418)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
31.1* |
17.6* |
18.1* |
2.4* |
-- |
0.7 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.1 |
29.5 | 849 |
| 3 |
32.4* |
32.2* |
31.5* |
2.3* |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 438 |
| B |
54.5* |
1.2* |
41.3* |
0.8* |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
19.5* |
68.3* |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
93.1* |
-- |
2.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
1.3* |
70.3* |
22.6* |
5.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
8.7* |
2.6* |
4.5* |
2.6* |
-- |
1.0 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
79.9 | 309 |
| |
| Basepair (2410:2417)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
33.9* |
0.7* |
1.4* |
33.7* |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
29.4 | 849 |
| 3 |
50.0* |
1.1* |
2.1* |
45.9* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 438 |
| B |
24.0* |
-- |
3.7* |
72.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
78.0* |
9.8* |
-- |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 | 41 |
| C |
58.8* |
-- |
-- |
41.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
83.9* |
0.6* |
-- |
14.2* |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
2.9* |
0.3* |
1.0* |
13.9* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.6 |
80.2 | 309 |
| |
| Basepair (2411:2416)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.4* |
49.9* |
0.5* |
1.2* |
0.1 |
13.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
30.7 | 849 |
| 3 |
5.7* |
67.1* |
0.2* |
1.8* |
-- |
23.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
1.1 | 438 |
| B |
2.5* |
93.8* |
-- |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.1 | 242 |
| A |
29.3* |
70.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
93.1 |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 | 102 |
| E |
4.5* |
25.2 |
0.6 |
2.6* |
-- |
65.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- | 155 |
| M |
1.3* |
11.3* |
1.0* |
0.6* |
0.3 |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
82.1 | 309 |
| |
| Basepair (2412:2415)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
1.4 |
0.9* |
-- |
-- |
0.7 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
66.1* |
0.1 |
0.2* |
0.6 |
29.5 | 850 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.9* |
0.2 |
-- |
0.2* |
1.1 | 439 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
1.7 | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.6 |
2.4 |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
2.9 |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.1* |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.4* |
-- |
-- |
0.6* |
0.6 | 156 |
| M |
-- |
-- |
2.9 |
2.3* |
-- |
-- |
1.3 |
0.3 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
11.0* |
-- |
0.6* |
1.3 |
79.6 | 309 |
| |
| Basepair (2427:2462)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
22.0* |
66.4* |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
5.4 |
0.5 |
0.4 |
0.7 |
0.1 |
0.4 |
0.7 |
-- |
-- |
0.6 |
2.2 | 849 |
| 3 |
-- |
42.6* |
55.4* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.7 |
0.7 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 439 |
| B |
-- |
-- |
100 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
85.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
7.3 |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
100 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
97.4* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
1.3* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
71.2* |
0.6 |
0.6 |
0.3 |
14.2 |
1.3* |
-- |
1.0 |
0.3 |
0.6* |
1.9 |
-- |
-- |
1.6 |
6.0 | 309 |
| |
| Basepair (2428:2466)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.2 |
0.6* |
0.1* |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
13.7 |
82.6* |
-- |
0.1 |
2.0 | 849 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.3 |
97.7 |
-- |
-- |
-- | 439 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.3 |
96.7 |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
95.1 |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
96.0 |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
0.6 |
1.6* |
0.3* |
0.3 |
-- |
0.6 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
33.0 |
56.6* |
-- |
0.3 |
5.4 | 309 |
| |
| Basepair (2429:2461)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.7* |
31.8 |
0.1* |
-- |
1.8 |
62.4* |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
2.3 | 849 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
46.9 |
-- |
-- |
1.1 |
51.0 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 439 |
| B |
-- |
-- |
-- |
7.4 |
-- |
-- |
2.1 |
90.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
80.5* |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
5.0 |
90.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
1.9* |
19.1 |
0.3* |
-- |
1.6 |
69.6* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
6.1 | 309 |
| |
| Basepair (2430:2460)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.6 |
0.9 |
1.4 |
0.4 |
18.6 |
4.8* |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.9* |
10.0 |
-- |
-- |
1.4 |
57.8* |
2.5 | 849 |
| 3 |
-- |
0.2* |
-- |
0.5 |
-- |
35.8 |
8.4* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
53.8* |
-- | 439 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
97.1 |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9* |
90.2* |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
97.0 |
2.0 | 101 |
| E |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
| M |
-- |
1.3 |
2.6 |
3.2 |
1.0 |
0.3 |
1.3* |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
2.6* |
25.9 |
-- |
-- |
3.9 |
50.8* |
6.0 | 309 |
| |
| Basepair (2432:2459)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.2* |
90.0* |
2.6* |
0.8* |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
-- |
0.9 |
0.5 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.8 | 848 |
| 3 |
4.3* |
92.5* |
1.8* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 438 |
| B |
-- |
95.0* |
3.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
46.3* |
51.2* |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
98.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
83.8* |
3.9* |
2.3* |
-- |
1.0 |
0.3 |
-- |
2.3 |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
4.8 | 309 |
| |
| Basepair (2433:2458)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
49.4* |
5.3* |
19.6* |
22.6* |
0.4 |
0.6 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.7 | 848 |
| 3 |
54.3* |
7.8* |
34.5* |
2.5* |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 438 |
| B |
98.3* |
-- |
0.4* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
68.3* |
7.3* |
22.0* |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
0.6* |
3.9* |
94.2* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
25.9* |
3.6* |
4.9* |
58.6* |
0.6 |
1.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
4.5 | 309 |
| |
| Basepair (2434:2457)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.5* |
3.1 |
1.9 |
33.6* |
30.9 |
21.4* |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
2.8 | 849 |
| 3 |
-- |
3.6 |
0.2 |
4.1 |
53.1* |
38.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 439 |
| B |
-- |
1.2* |
-- |
2.1 |
95.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 243 |
| A |
-- |
29.3 |
-- |
19.5* |
-- |
51.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
93.1 |
6.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
0.6 |
0.6 |
3.2* |
0.6 |
94.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
15.2* |
3.2* |
4.9* |
56.0* |
7.1 |
4.2 |
0.3 |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
7.1 | 309 |
| |
| Basepair (2435:2456)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.6* |
29.8* |
45.7* |
6.1* |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
15.1 | 849 |
| 3 |
0.2* |
23.0* |
73.1* |
2.7* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 439 |
| B |
-- |
23.0* |
76.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 243 |
| A |
-- |
61.0* |
31.7* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
98.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
0.6* |
12.9* |
78.7* |
5.8* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
4.2* |
17.2* |
21.0* |
12.9* |
0.6 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
41.4 | 309 |
| |
| Basepair (2436:2455)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
44.9* |
4.0* |
7.7* |
16.4* |
0.6 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
25.2 | 847 |
| 3 |
60.4* |
4.8* |
8.9* |
24.0* |
1.1 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 437 |
| B |
91.7* |
0.8* |
-- |
6.2* |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
73.2* |
7.3* |
12.2* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
96.0* |
-- |
-- |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
9.0* |
10.3* |
21.9* |
55.5* |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
6.1* |
4.2* |
8.4* |
9.7* |
-- |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
69.2 | 309 |
| |
| Basepair (2438:2454)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
56.2* |
1.8* |
1.6* |
3.7* |
-- |
0.2 |
-- |
2.1 |
-- |
0.6 |
0.5 |
-- |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.2 |
32.6 | 849 |
| 3 |
84.1* |
3.2* |
1.1* |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
4.1 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
5.2 | 439 |
| B |
93.8* |
4.5* |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
92.1* |
-- |
-- |
6.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
64.5* |
1.9* |
3.2* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
11.0 |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
14.8 | 155 |
| M |
4.9* |
0.3* |
2.9* |
6.8* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
82.2 | 309 |
| |
| Basepair (2439:2453)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.3* |
15.7 |
2.4 |
1.4* |
-- |
45.0* |
-- |
-- |
2.1 |
0.4* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.6 |
30.5 | 848 |
| 3 |
2.3* |
29.5 |
1.6 |
1.6* |
-- |
59.4* |
-- |
-- |
4.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
1.1 |
-- | 438 |
| B |
-- |
6.6 |
-- |
-- |
-- |
93.0 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
12.2* |
70.7* |
-- |
-- |
-- |
12.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
93.1* |
-- |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
1.0 |
-- |
-- | 101 |
| E |
3.2* |
54.2* |
4.5* |
4.5* |
-- |
19.4 |
-- |
-- |
11.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 |
-- | 155 |
| M |
0.3* |
1.3 |
3.6 |
1.6* |
-- |
9.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
83.8 | 309 |
| |
| Basepair (2440:2452)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.5* |
46.8* |
16.1* |
1.1* |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
30.8 | 849 |
| 3 |
8.7* |
63.1* |
26.4* |
0.7* |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 439 |
| B |
14.0* |
85.2* |
0.4* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
90.2* |
2.4* |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
97.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
2.6* |
21.3* |
73.5* |
1.9* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
7.1* |
6.1* |
1.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.8 | 309 |
| |
| Basepair (2441:2451)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.1* |
31.6* |
17.2* |
4.4* |
-- |
11.1 |
0.7 |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
31.1 | 849 |
| 3 |
5.9* |
39.2* |
26.2* |
5.9* |
-- |
20.7 |
0.2 |
-- |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 439 |
| B |
0.8* |
58.8* |
0.4* |
6.6* |
-- |
32.1 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 243 |
| A |
-- |
68.3 |
-- |
-- |
-- |
31.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
86.1* |
11.9* |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
15.5* |
0.6* |
72.9* |
6.5* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
2.9* |
6.1* |
3.6* |
-- |
0.3 |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.1 | 309 |
| |
| Basepair (2442:2450)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.8 |
13.1* |
6.6 |
2.9 |
0.6 |
0.5 |
4.5 |
0.1* |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
34.9* |
-- |
0.1 |
3.1* |
31.4 | 849 |
| 3 |
3.4 |
25.3* |
9.8 |
5.5* |
1.1 |
0.9 |
5.0 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
43.3* |
-- |
-- |
5.0 |
0.4 | 439 |
| B |
-- |
-- |
11.1 |
-- |
1.6 |
-- |
8.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
78.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 243 |
| A |
14.6* |
70.7* |
7.3* |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
8.9 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
88.1 |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
| E |
5.8* |
52.3* |
8.4* |
15.5* |
0.6 |
0.6 |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
14.2 |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
-- |
3.9 |
0.3 |
-- |
-- |
2.3 |
0.3 |
0.3* |
-- |
0.3* |
-- |
5.5* |
-- |
0.3 |
1.3* |
85.3 | 309 |
| |
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