Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (52 of 60)
| Basepair (2471:2633)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
96.3* |
0.3* |
-- |
-- |
0.4 | 733 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
-- | 414 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 238 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
95.1 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
94.8 |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 58 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.3 |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
4.6 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
93.5* |
0.8* |
-- |
-- |
-- | 261 |
| |
| Basepair (2482:2486)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.2 |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 833 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.4 |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 423 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.7 |
-- |
-- |
-- |
3.3 | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 140 |
| M |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 309 |
| |
| Basepair (2485:2536)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
99.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 830 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
92.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- | 306 |
| |
| Basepair (2487:2535)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 830 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
92.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 306 |
| |
| Basepair (2488:2534)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
2.3 |
79.0* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
17.1* |
-- | 830 |
| 3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.3 |
62.1* |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
33.6* |
-- | 422 |
| B |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
34.1 |
48.8* |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8* |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3* |
-- | 138 |
| M |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
1.6 |
95.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 306 |
| |
| Basepair (2489:2533)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
98.8* |
-- |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 830 |
| 3 |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 422 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 138 |
| M |
97.1* |
-- |
-- |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 306 |
| |
| Basepair (2490:2531)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
45.7* |
29.9* |
-- |
3.7* |
20.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 829 |
| 3 |
56.8* |
-- |
-- |
5.9* |
37.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 421 |
| B |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
61.0 |
39.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
12.4* |
81.0* |
-- |
2.0* |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- | 306 |
| |
| Basepair (2491:2530)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
32.7* |
47.7* |
0.6* |
2.3* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
16.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 830 |
| 3 |
8.5* |
58.8* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
32.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
87.8* |
12.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
0.7 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
76.8* |
15.0* |
1.3* |
6.2* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- | 306 |
| |
| Basepair (2492:2529)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.2 |
1.0 |
1.6* |
-- |
73.1* |
0.1 |
-- |
0.4 |
23.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 830 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
-- |
0.7 |
2.6 |
4.2* |
-- |
28.1* |
0.3 |
-- |
-- |
64.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 306 |
| |
| Basepair (2494:2528)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7* |
-- |
1.0* |
76.1* |
21.4 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.4 | 830 |
| 3 |
0.5* |
-- |
-- |
57.1* |
42.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 422 |
| B |
0.8* |
-- |
-- |
99.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
1.3* |
-- |
2.6* |
94.4* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
1.0 | 306 |
| |
| Basepair (2495:2525)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
1.2* |
-- |
81.3* |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
16.5 |
0.3 | 829 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
67.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
32.5 |
0.2 | 421 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.6 |
0.7 | 138 |
| M |
-- |
-- |
-- |
3.3* |
-- |
94.4* |
0.7 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.6 | 306 |
| |
| Basepair (2496:2524)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.3 |
62.1* |
4.8* |
10.3 |
16.7* |
0.6 |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
1.3 | 828 |
| 3 |
3.1 |
46.7* |
1.4* |
15.7 |
32.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 420 |
| B |
5.4* |
64.3* |
2.5* |
25.3* |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 241 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
4.3 |
95.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
4.6* |
70.9* |
10.8* |
6.2* |
0.3 |
1.6 |
1.0 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.7 |
2.9 | 306 |
| |
| Basepair (2497:2523)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
23.2* |
29.7* |
34.4* |
7.2* |
0.1 |
1.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
1.2 | 829 |
| 3 |
42.8* |
17.3* |
27.8* |
6.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.5 |
0.2 | 421 |
| B |
5.8* |
28.9* |
47.1* |
8.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.5 |
0.4 | 242 |
| A |
68.3* |
7.3* |
7.3* |
17.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
99.3* |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
3.9* |
56.5* |
21.9* |
10.5* |
0.3 |
3.3 |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 | 306 |
| |
| Basepair (2498:2522)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7* |
58.4* |
33.4* |
2.2* |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 |
1.7 | 830 |
| 3 |
-- |
87.4* |
12.3* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
78.6* |
21.0* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
97.6* |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
27.5* |
71.6* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
2.0* |
28.8* |
49.7* |
5.2* |
-- |
8.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
1.3 |
4.6 | 306 |
| |
| Basepair (2499:2521)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
18.8* |
43.9* |
10.1* |
23.3* |
0.4 |
1.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
2.0 | 830 |
| 3 |
32.0* |
40.0* |
4.3* |
23.2* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 422 |
| B |
33.3* |
61.7* |
3.7* |
0.8* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
65.9* |
17.1* |
9.8* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
1.0* |
94.1* |
1.0* |
1.0* |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 102 |
| E |
20.3* |
8.7* |
3.6* |
66.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- | 138 |
| M |
6.5* |
32.4* |
21.2* |
30.7* |
1.0 |
2.0 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
5.2 | 306 |
| |
| Basepair (2500:2520)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
6.1 |
43.1* |
30.6* |
1.7 |
15.7* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
2.0 | 830 |
| 3 |
10.7 |
54.5* |
1.9* |
2.1 |
30.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
0.4* |
92.2* |
3.3* |
3.7* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
85.4* |
14.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
91.2* |
7.8* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
6.5 |
0.7* |
-- |
-- |
92.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
2.0* |
11.4* |
77.8* |
1.3* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
5.5 | 306 |
| |
| Basepair (2501:2519)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.4* |
66.7* |
21.4* |
1.0* |
0.6 |
1.8 |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 830 |
| 3 |
9.7* |
87.0* |
2.1* |
-- |
0.9 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
99.0* |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
90.6* |
6.5* |
-- |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
1.3* |
28.1* |
55.2* |
2.3* |
0.3 |
4.6 |
0.7 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
5.2 | 306 |
| |
| Basepair (2502:2518)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
1.3 |
0.8 |
0.7 |
-- |
0.7* |
0.6 |
0.6 |
0.5 |
83.3* |
-- |
-- |
0.1* |
6.3 |
3.1* |
1.9 | 830 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
95.1 |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
-- |
-- |
3.6 |
2.3 |
2.0 |
-- |
2.0* |
1.6 |
1.6 |
1.3 |
55.2* |
-- |
-- |
0.3* |
16.3 |
8.5* |
5.2 | 306 |
| |
| Basepair (2503:2517)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
7.6 |
0.5 |
0.2* |
0.5* |
69.6* |
0.1 |
-- |
7.0 |
-- |
-- |
11.7 |
0.5 |
-- |
0.4 |
1.9 | 829 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
90.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.8 |
0.7* |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
95.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.3 |
1.2* |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
39.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
61.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
-- |
-- |
20.7 |
1.0 |
0.7* |
1.3* |
31.8* |
0.3 |
-- |
19.0 |
-- |
-- |
18.7 |
0.3 |
-- |
1.0 |
5.2 | 305 |
| |
| Basepair (2504:2516)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1 |
0.4* |
0.2 |
0.1* |
-- |
4.0 |
-- |
92.7* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
2.0 | 830 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 422 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 138 |
| M |
-- |
0.3 |
1.0* |
0.7 |
0.3* |
-- |
10.8 |
-- |
80.4* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
5.2 | 306 |
| |
| Basepair (2505:2515)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
91.8* |
-- |
1.3* |
0.8* |
3.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.9 | 830 |
| 3 |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
97.1* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- | 102 |
| E |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
78.8* |
-- |
3.6* |
2.3* |
8.5 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
5.2 | 306 |
| |
| Basepair (2506:2514)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
17.2* |
0.4* |
80.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 830 |
| 3 |
-- |
33.9* |
-- |
66.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
3.3* |
-- |
96.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
97.1* |
-- |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
-- |
-- |
1.0* |
93.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.2 | 306 |
| |
| Basepair (2507:2513)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
97.8* |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 830 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
-- |
-- |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
94.1* |
-- |
-- |
-- |
5.2 | 306 |
| |
Last generated : Mon Jul 1 2002 (8 : 31)