Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (54 of 60)
| Basepair (2574:2776)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
18.8 |
-- |
0.1* |
0.6 |
0.8 |
-- |
-- |
65.2* |
0.4 |
0.6 |
4.4 |
-- |
0.7* |
0.7 |
7.5 | 709 |
| 3 |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
90.5* |
-- |
0.7 |
7.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 411 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 233 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
82.9 |
-- |
-- |
17.1 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
8.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
77.4* |
-- |
2.2 |
15.3 |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 137 |
| M |
-- |
-- |
53.3* |
-- |
-- |
1.7 |
0.8 |
-- |
-- |
15.4 |
1.2* |
0.4 |
0.8 |
-- |
2.1 |
2.1 |
22.0 | 240 |
| |
| Basepair (2576:2800)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.4 |
1.6 |
-- |
0.1* |
81.3* |
1.2 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.6 | 685 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.7 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 389 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 223 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.7 |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 125 |
| M |
-- |
-- |
1.3 |
4.6 |
-- |
0.4* |
48.3* |
3.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
41.7 | 238 |
| |
| Basepair (2582:2596)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4* |
5.0* |
73.1* |
13.5* |
0.3 |
0.6 |
1.4 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
4.3 |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 799 |
| 3 |
-- |
7.6* |
59.6* |
20.6* |
-- |
0.9 |
1.2 |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
7.8 |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 423 |
| B |
-- |
0.4* |
65.4* |
34.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
19.5* |
-- |
-- |
-- |
80.5* |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
2.0* |
97.0* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 99 |
| E |
-- |
22.3* |
66.2* |
3.6* |
-- |
2.9 |
3.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 | 139 |
| M |
1.1* |
2.2* |
85.2* |
7.6* |
0.7 |
0.4 |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 277 |
| |
| Basepair (2583:2595)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
49.9* |
26.1* |
17.3* |
4.9* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.4 | 798 |
| 3 |
65.0* |
4.5* |
25.8* |
3.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
1.4 | 423 |
| B |
44.4* |
7.8* |
44.4* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
2.4 | 243 |
| A |
70.7* |
-- |
-- |
29.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
92.9* |
-- |
2.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 | 99 |
| E |
98.6* |
-- |
1.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
11.2* |
68.5* |
9.8* |
8.7* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 276 |
| |
| Basepair (2584:2594)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
97.5* |
0.4* |
0.3* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 796 |
| 3 |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 420 |
| B |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 240 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
97.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 | 99 |
| E |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
94.9* |
1.1* |
0.7* |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 277 |
| |
| Basepair (2585:2593)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
50.3* |
0.1* |
27.0* |
3.3* |
-- |
0.1 |
-- |
17.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.1 |
1.0 | 796 |
| 3 |
65.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
32.6 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 420 |
| B |
96.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.3 | 240 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
96.0* |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- | 99 |
| E |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.8 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
11.2* |
0.4* |
77.6* |
9.0* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
0.4 |
-- | 277 |
| |
| Basepair (2586:2592)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
54.4* |
40.9* |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.8 |
0.5 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- | 799 |
| 3 |
-- |
63.0* |
32.9* |
-- |
-- |
3.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
61.0* |
-- |
-- |
-- |
31.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
0.7* |
99.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
-- |
24.9* |
67.9* |
-- |
-- |
3.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
2.2 |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- | 277 |
| |
| Basepair (2587:2591)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
99.8 |
-- |
0.1 | 801 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 |
-- |
0.2 | 422 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- | 139 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- | 277 |
| |
| Basepair (2597:2601)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
79.3* |
0.3 |
0.6 |
-- |
0.5 |
0.3* |
-- |
0.1 |
1.9 |
13.4* |
0.1 |
0.1* |
0.3 |
1.0 |
1.9 | 799 |
| 3 |
-- |
-- |
68.8* |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.5 |
25.3* |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.9 | 423 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
96.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- | 99 |
| E |
-- |
-- |
5.8* |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.8 |
76.3* |
-- |
-- |
0.7 |
0.7 |
2.9 | 139 |
| M |
0.4 |
-- |
89.5* |
0.7 |
0.4* |
-- |
1.4 |
0.7* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
1.1 |
4.4 | 277 |
| |
| Basepair (2622:2643)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 735 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 418 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 238 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 262 |
| |
| Basepair (2623:2641)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
63.7* |
0.3* |
0.1* |
12.9* |
22.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 735 |
| 3 |
54.3* |
0.2* |
-- |
8.9* |
36.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 418 |
| B |
81.1* |
-- |
-- |
14.7* |
3.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 238 |
| A |
82.9* |
2.4* |
-- |
4.9* |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
67.3* |
-- |
-- |
29.1* |
3.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
77.9* |
0.4* |
0.4* |
16.0* |
4.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 262 |
| |
| Basepair (2624:2640)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
1.9* |
97.0* |
0.1 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 | 735 |
| 3 |
-- |
-- |
0.2* |
99.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 418 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 238 |
| A |
-- |
-- |
2.4* |
97.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
-- |
-- |
5.0* |
92.4* |
0.4 |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.8 | 262 |
| |
| Basepair (2625:2639)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* |
52.8* |
2.2* |
44.5* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 735 |
| 3 |
-- |
44.5* |
-- |
55.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 418 |
| B |
-- |
2.9* |
-- |
97.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 238 |
| A |
-- |
97.6* |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
-- |
99.3* |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
0.8* |
77.1* |
6.1* |
15.3* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 262 |
| |
| Basepair (2626:2638)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 735 |
| 3 |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 418 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 238 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
-- |
98.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 | 139 |
| M |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 262 |
| |
| Basepair (2627:2636)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
97.3* |
-- |
-- |
0.4* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.5 | 735 |
| 3 |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 418 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 238 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
94.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.5 |
-- |
-- |
-- |
-- | 55 |
| E |
98.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 | 139 |
| M |
94.7* |
-- |
-- |
1.1* |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.8 | 262 |
| |
| Basepair (2628:2635)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
26.3* |
0.3* |
69.8* |
1.0* |
-- |
1.4 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.6 | 735 |
| 3 |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 418 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 238 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
92.7 |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.5 |
-- |
-- | 55 |
| E |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
73.7* |
0.8* |
16.8* |
2.7* |
-- |
3.4 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 262 |
| |
| Basepair (2629:2634)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.8* |
72.5* |
2.2* |
22.3* |
0.1 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.6 | 735 |
| 3 |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 418 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 238 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
98.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 55 |
| E |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
2.3* |
23.7* |
6.1* |
62.6* |
0.4 |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
1.2 | 262 |
| |
| Basepair (2630:2633)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3* |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 736 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 418 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 238 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.5 |
-- |
-- |
-- |
3.5 | 57 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.9* |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 261 |
| |
Last generated : Mon Jul 1 2002 (8 : 31)