Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (55 of 60)
| Basepair (2661:2812)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
42.2* |
10.1* |
0.6 |
0.2* |
2.0 |
1.1 |
0.8* |
3.5 |
0.3 |
-- |
0.5 |
0.6 |
0.5 |
-- |
0.8 |
37.4 | 664 |
| 3 |
-- |
58.8* |
16.0* |
-- |
-- |
3.1 |
1.3 |
0.3* |
6.0 |
0.5 |
-- |
0.8 |
1.0 |
0.8 |
-- |
-- |
11.2 | 381 |
| B |
-- |
89.3* |
8.9* |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 | 214 |
| A |
-- |
12.2* |
85.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
98.2* |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
-- |
24.6* |
4.8* |
-- |
-- |
8.7 |
4.0 |
0.8* |
19.0 |
-- |
0.8 |
2.4 |
4.0 |
2.4 |
-- |
-- |
28.7 | 126 |
| M |
-- |
0.4* |
2.2* |
1.8 |
0.4* |
0.4 |
0.9 |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
89.9 | 227 |
| |
| Basepair (2662:2816)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.6 |
0.2 |
0.6 |
0.3 |
-- |
0.3 |
2.4 |
0.5 |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
46.9* |
0.5 |
0.2 |
0.6* |
46.7 | 663 |
| 3 |
1.1 |
0.3 |
0.5 |
-- |
-- |
0.5* |
0.8 |
0.8* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
66.3* |
0.8 |
0.3 |
0.3 |
27.9 | 380 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.1 |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 214 |
| A |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
3.2* |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- |
2.4* |
0.8* |
2.4 |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
1.6 |
-- |
0.8 |
84.8 | 125 |
| M |
-- |
-- |
0.9 |
0.9 |
-- |
-- |
5.7* |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
1.3* |
89.0 | 227 |
| |
| Basepair (2667:2822)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
55.8* |
0.8* |
6.5* |
5.3* |
1.2 |
0.6 |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.3 |
28.5 | 660 |
| 3 |
77.8* |
1.1* |
10.0* |
5.3* |
2.1 |
1.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 |
1.4 | 379 |
| B |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 213 |
| A |
82.9* |
-- |
-- |
14.6* |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
38.4* |
3.2* |
36.8* |
11.2* |
2.4 |
0.8 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
4.0 | 125 |
| M |
7.6* |
0.4* |
2.2* |
6.7* |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
80.9 | 225 |
| |
| Basepair (2667:2827)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.9 |
0.2 |
5.6 |
0.3* |
0.5 |
1.4* |
3.9 |
-- |
0.6 |
0.3 |
-- |
0.2 |
48.5* |
6.8 |
0.3 |
-- |
30.7 | 646 |
| 3 |
1.6 |
0.3 |
8.7 |
-- |
0.5 |
2.4* |
4.2 |
-- |
1.1 |
0.5 |
-- |
0.3* |
66.4* |
11.4 |
0.3 |
-- |
2.3 | 378 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 213 |
| A |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
7.5* |
-- |
-- |
-- |
72.5* |
10.0 |
-- |
-- |
-- | 40 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
90.6 |
-- |
-- |
-- |
9.4 | 53 |
| E |
3.2 |
0.8 |
29.6* |
-- |
1.6 |
7.2 |
11.2 |
-- |
0.8 |
1.6 |
-- |
0.8* |
4.0 |
31.2* |
0.8 |
-- |
7.2 | 125 |
| M |
-- |
-- |
1.4 |
0.9* |
0.5 |
-- |
4.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
6.5* |
0.5 |
0.5* |
-- |
85.7 | 215 |
| |
| Basepair (2668:2821)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.9* |
8.8 |
3.6 |
45.2* |
0.6 |
10.3* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.2 |
27.7 | 661 |
| 3 |
3.4* |
15.3 |
4.7 |
56.3* |
0.5 |
17.9* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.3 |
0.3 | 380 |
| B |
-- |
-- |
1.4* |
97.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 214 |
| A |
22.0* |
61.0* |
-- |
9.8* |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
3.2* |
28.0 |
8.0 |
1.6* |
1.6 |
56.0* |
-- |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- | 125 |
| M |
2.7* |
-- |
2.7* |
12.9* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
80.9 | 225 |
| |
| Basepair (2669:2820)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
23.5* |
4.1* |
8.6* |
30.5* |
2.6 |
1.4 |
0.6 |
0.3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.2 |
0.2 |
-- |
27.6 | 660 |
| 3 |
26.4* |
6.9* |
14.2* |
42.5* |
4.5 |
2.4 |
1.1 |
0.5 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- | 379 |
| B |
21.6* |
-- |
16.9* |
59.6* |
0.5 |
-- |
0.9 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 213 |
| A |
-- |
58.5* |
24.4* |
4.9* |
-- |
12.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
82.1* |
-- |
-- |
17.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
52.0* |
0.8* |
6.4* |
24.8* |
11.2 |
-- |
1.6 |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- | 125 |
| M |
4.0* |
0.4* |
1.3* |
13.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
80.9 | 225 |
| |
| Basepair (2670:2819)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
13.4* |
9.5* |
20.5* |
26.6* |
0.2 |
0.9 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
28.2 | 662 |
| 3 |
21.4* |
7.1* |
29.6* |
38.3* |
0.3 |
1.6 |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.8 | 379 |
| B |
18.8* |
0.9* |
13.6* |
63.8* |
-- |
1.9 |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 213 |
| A |
85.4* |
-- |
2.4* |
9.8* |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
62.5* |
37.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
2.4* |
23.2* |
68.0* |
4.8* |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 125 |
| M |
3.5* |
0.4* |
1.3* |
13.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
81.1 | 227 |
| |
| Basepair (2671:2818)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.3* |
25.8* |
21.9* |
19.8* |
0.2 |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
28.3 | 663 |
| 3 |
3.9* |
43.2* |
35.5* |
13.2* |
0.3 |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 380 |
| B |
3.7* |
28.0* |
44.9* |
22.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 214 |
| A |
4.9* |
75.6* |
19.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
3.6* |
96.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
3.2* |
59.2* |
26.4* |
1.6* |
0.8 |
8.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 125 |
| M |
-- |
3.1* |
3.5* |
11.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
81.4 | 227 |
| |
| Basepair (2672:2817)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.1* |
9.5 |
5.4 |
2.1* |
1.4 |
36.7* |
0.5 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
28.2 | 662 |
| 3 |
25.1* |
14.8 |
5.5 |
0.3* |
2.4 |
50.1* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
-- | 379 |
| B |
0.9* |
6.1 |
8.0 |
-- |
-- |
85.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 213 |
| A |
-- |
87.8* |
4.9* |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
10.7 |
-- |
-- |
89.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
76.8* |
4.8* |
0.8* |
1.6* |
6.4 |
4.8 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
0.8 |
0.8 |
0.8 |
-- | 125 |
| M |
2.2* |
3.1* |
4.0* |
5.7* |
-- |
1.3 |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
81.9 | 227 |
| |
| Basepair (2673:2811)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.5* |
49.8* |
0.3* |
-- |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
48.3 | 663 |
| 3 |
-- |
0.8* |
68.4* |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
29.8 | 380 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 214 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
-- |
2.4* |
4.8* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.2 | 125 |
| M |
-- |
-- |
6.2* |
0.9* |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
91.0 | 227 |
| |
| Basepair (2674:2813)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.8 |
0.2* |
-- |
0.9* |
2.0 |
-- |
3.5 |
-- |
0.6 |
0.2 |
-- |
-- |
51.4* |
1.2 |
-- |
0.2 |
39.3 | 663 |
| 3 |
1.1 |
0.3 |
-- |
0.3 |
3.4 |
-- |
5.0 |
-- |
1.1* |
0.3 |
-- |
-- |
70.8* |
1.8 |
-- |
-- |
15.9 | 380 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 215 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
3.2 |
-- |
-- |
0.8 |
10.4* |
-- |
15.2* |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
13.6 |
5.6 |
-- |
-- |
49.6 | 125 |
| M |
0.4 |
-- |
-- |
2.2* |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.0* |
0.4 |
-- |
0.4 |
87.6 | 227 |
| |
| Basepair (2675:2810)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2* |
-- |
0.6 |
1.1 |
-- |
-- |
33.6* |
-- |
14.6 |
0.2 |
0.3 |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
48.6 | 663 |
| 3 |
0.3 |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
43.2* |
-- |
24.5 |
-- |
0.5* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
30.1 | 380 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
75.2 |
-- |
24.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 214 |
| A |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
82.9* |
-- |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
3.6 |
-- |
-- |
-- |
96.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
4.8* |
-- |
1.6* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.2 | 125 |
| M |
-- |
-- |
0.9 |
1.3 |
-- |
-- |
2.2* |
-- |
1.8 |
0.4 |
-- |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.1 | 227 |
| |
| Basepair (2676:2809)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
38.8* |
9.8* |
14.3* |
6.6* |
1.4 |
-- |
0.3 |
-- |
0.2 |
0.3 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
28.0 | 663 |
| 3 |
53.2* |
15.8* |
21.8* |
5.8* |
1.3 |
-- |
0.5 |
-- |
0.3 |
0.5 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 | 380 |
| B |
76.6* |
8.4* |
3.7* |
9.3* |
0.5 |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 214 |
| A |
70.7* |
17.1* |
-- |
2.4* |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
82.1* |
-- |
-- |
14.3* |
3.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
8.0* |
28.0* |
60.8* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 125 |
| M |
4.0* |
2.2* |
5.3* |
6.2* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
81.1 | 227 |
| |
| Basepair (2677:2808)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
19.1* |
-- |
1.5* |
46.0* |
3.0 |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
28.5 | 665 |
| 3 |
31.1* |
-- |
1.8* |
60.9* |
5.0 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 379 |
| B |
26.3* |
-- |
3.3* |
62.4* |
7.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 213 |
| A |
87.8* |
-- |
-- |
9.8* |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
5.4* |
-- |
-- |
75.0* |
-- |
-- |
-- |
19.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 56 |
| E |
21.6* |
-- |
-- |
75.2* |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 | 125 |
| M |
2.6* |
-- |
1.3* |
14.3* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
81.3 | 230 |
| |
| Basepair (2678:2807)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
58.8* |
0.1* |
0.4* |
11.0* |
0.7 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
28.5 | 672 |
| 3 |
85.0* |
-- |
0.3* |
13.9* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 380 |
| B |
76.2* |
-- |
-- |
23.4* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 214 |
| A |
90.2* |
-- |
2.4* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
93.1* |
-- |
-- |
5.2* |
-- |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 125 |
| M |
7.7* |
0.4* |
0.9* |
7.7* |
1.3 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
81.6 | 234 |
| |
| Basepair (2679:2806)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
43.4* |
0.7 |
2.2 |
5.3* |
1.5 |
12.7* |
0.4 |
0.9 |
-- |
0.3* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
0.3 |
29.0 | 675 |
| 3 |
61.1* |
1.1 |
1.3 |
3.2* |
1.6 |
22.6* |
0.5 |
1.6 |
-- |
0.5* |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
4.5 |
0.5 |
0.6 | 380 |
| B |
91.6* |
-- |
-- |
3.7* |
1.9 |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 214 |
| A |
87.8* |
2.4* |
-- |
2.4* |
4.9 |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
82.8* |
-- |
12.1* |
5.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
0.8 |
2.4 |
4.0 |
2.4* |
-- |
68.0* |
1.6 |
-- |
-- |
1.6 |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
13.6 |
1.6 |
0.8 | 125 |
| M |
5.5* |
0.4* |
1.3* |
8.9* |
1.7 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
81.8 | 237 |
| |
Last generated : Mon Jul 1 2002 (8 : 31)