Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (57 of 60)
| Basepair (2713:2767)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
14.2* |
57.3* |
6.1* |
14.2* |
5.0 |
1.8 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
0.5 | 726 |
| 3 |
6.7* |
85.9* |
0.5* |
1.0* |
5.5 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 417 |
| B |
4.2* |
94.9* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
43.9 |
-- |
-- |
-- |
56.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
77.6* |
20.7* |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
95.7* |
-- |
2.9* |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
29.9* |
5.2* |
12.0* |
39.4* |
5.2 |
4.4 |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
1.2 |
1.6 | 251 |
| |
| Basepair (2714:2766)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
48.1* |
5.0* |
3.9* |
36.9* |
2.1 |
2.8 |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 726 |
| 3 |
58.8* |
5.8* |
1.9* |
28.1* |
1.0 |
3.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 417 |
| B |
69.6* |
4.2 |
-- |
19.4* |
0.8 |
5.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 237 |
| A |
43.9* |
31.7* |
17.1* |
-- |
4.9 |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
37.9* |
-- |
-- |
56.9* |
5.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
45.3* |
0.7 |
0.7 |
50.4* |
-- |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 139 |
| M |
32.7* |
4.8* |
8.0* |
47.0* |
3.2 |
1.6 |
-- |
0.8 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 | 251 |
| |
| Basepair (2715:2765)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
39.9* |
21.5* |
13.8* |
22.1* |
0.3 |
1.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 725 |
| 3 |
30.8* |
31.2* |
15.4* |
20.2* |
0.2 |
1.7 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 416 |
| B |
5.5* |
34.7* |
23.3* |
33.1* |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
68.3* |
24.4* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
41.4* |
32.8* |
17.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
6.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 | 58 |
| E |
61.9* |
28.1* |
4.3* |
4.3* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 139 |
| M |
64.1* |
0.8* |
6.8* |
26.3* |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 251 |
| |
| Basepair (2716:2764)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
34.1* |
0.4* |
2.3* |
61.2* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 727 |
| 3 |
13.9* |
0.2* |
1.4* |
83.7* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 417 |
| B |
3.8* |
0.4* |
2.1* |
93.2* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
97.6* |
-- |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
31.0* |
-- |
-- |
69.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
6.5* |
-- |
0.7* |
91.4* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
68.3* |
0.8* |
4.4* |
22.2* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.6 | 252 |
| |
| Basepair (2717:2763)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.0* |
75.8* |
14.3* |
0.7* |
-- |
0.7 |
0.1 |
0.1 |
-- |
4.0 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
3.0 | 727 |
| 3 |
0.7* |
71.9* |
20.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 417 |
| B |
0.8* |
85.2* |
13.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
0.7* |
41.0* |
37.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
20.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
1.6* |
76.6* |
7.5* |
2.0* |
-- |
2.0 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
8.7 | 252 |
| |
| Basepair (2721:2761)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
10.6* |
83.5* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.3* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 | 727 |
| 3 |
-- |
1.7* |
98.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 417 |
| B |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
-- |
9.8* |
90.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
2.2* |
97.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
0.4 |
27.8* |
55.6* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.8* |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
13.9 | 252 |
| |
| Basepair (2722:2760)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
10.3 |
0.6* |
8.5* |
3.4 |
57.8* |
0.4 |
0.1 |
11.4* |
-- |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
5.4 | 727 |
| 3 |
7.0 |
-- |
1.0* |
2.2 |
84.2* |
-- |
-- |
4.1* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
1.0 | 417 |
| B |
7.2 |
-- |
1.7* |
3.8 |
86.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
19.5 |
-- |
-- |
-- |
46.3* |
-- |
-- |
34.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
36.2* |
-- |
-- |
5.2 |
34.5 |
-- |
-- |
13.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.3* |
-- | 58 |
| E |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
91.4* |
-- |
-- |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
2.2 | 139 |
| M |
9.9 |
1.6* |
23.0* |
5.2 |
19.4* |
1.2 |
0.4 |
23.0* |
-- |
1.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
13.9 | 252 |
| |
| Basepair (2723:2759)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
69.5* |
11.1* |
9.5* |
1.5* |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.3 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
1.0 |
0.1 |
-- |
5.6 | 727 |
| 3 |
97.1* |
-- |
-- |
0.7* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
0.2 | 417 |
| B |
98.7* |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
94.8* |
-- |
-- |
5.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
93.5* |
-- |
-- |
0.7* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
17.9* |
32.1* |
27.4* |
2.0* |
-- |
0.4 |
0.8 |
0.8 |
-- |
1.2 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
15.9 | 252 |
| |
| Basepair (2724:2758)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
1.5 |
-- |
0.3* |
-- |
68.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.0 |
0.1 |
28.7 | 727 |
| 3 |
-- |
2.4 |
-- |
0.2* |
-- |
95.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
0.2 |
-- | 417 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
96.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
7.2 |
-- |
0.7* |
-- |
87.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- | 139 |
| M |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
16.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.0 | 252 |
| |
| Basepair (2725:2757)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4 |
-- |
7.3 |
0.6 |
0.1 |
0.7* |
7.0 |
1.4* |
0.1 |
6.1 |
-- |
-- |
42.6* |
2.3 |
1.1 |
0.3 |
30.0 | 727 |
| 3 |
0.7 |
-- |
10.1 |
1.0 |
-- |
1.0* |
7.7 |
2.4* |
0.2 |
10.3 |
-- |
-- |
59.0* |
4.1 |
1.4 |
-- |
2.1 | 417 |
| B |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
88.6 |
7.2 |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
29.3 |
-- |
-- |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
24.4 |
-- |
-- |
39.0* |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
24.1 |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
70.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
2.2 |
-- |
19.4 |
2.9 |
-- |
0.7* |
17.3 |
7.2* |
0.7 |
23.7* |
-- |
-- |
15.1 |
-- |
4.3 |
-- |
6.4 | 139 |
| M |
-- |
-- |
3.6 |
-- |
0.4 |
0.4 |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.1* |
-- |
0.8* |
0.8 |
82.9 | 252 |
| |
| Basepair (2727:2755)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.4 |
7.3* |
0.3 |
3.9* |
7.2 |
12.0 |
-- |
36.2* |
1.5 |
0.1* |
0.1 |
0.3 |
1.1 |
0.3 |
0.3 |
29.2 | 727 |
| 3 |
-- |
0.7 |
12.7* |
-- |
5.5* |
11.5 |
18.2 |
-- |
45.1* |
2.6 |
0.2* |
0.2 |
0.5 |
1.7 |
0.5 |
-- |
0.5 | 417 |
| B |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
8.0* |
19.8 |
5.9 |
-- |
62.0* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
94.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
-- |
37.4 |
-- |
2.9* |
1.4* |
44.6* |
-- |
-- |
7.2 |
0.7* |
0.7 |
1.4 |
0.7 |
1.4 |
-- |
1.4 | 139 |
| M |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
2.0* |
0.8 |
4.4 |
-- |
7.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
83.3 | 252 |
| |
| Basepair (2728:2754)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.9* |
47.5* |
6.6* |
0.8* |
-- |
11.3 |
-- |
0.1 |
0.8 |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.6 |
29.7 | 727 |
| 3 |
2.6* |
67.9* |
4.6* |
0.7* |
-- |
19.7 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.2 |
0.2 |
1.0 |
1.2 | 417 |
| B |
4.6* |
88.2* |
6.3* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
95.1* |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
77.6* |
22.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
25.9 |
1.4 |
2.2* |
-- |
56.8* |
-- |
-- |
4.3 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
0.7 |
0.7 |
2.9 |
3.6 | 139 |
| M |
1.2* |
6.7* |
6.3* |
1.2* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.7 | 252 |
| |
| Basepair (2729:2753)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
20.4* |
46.9* |
1.2* |
1.8* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
29.0 | 727 |
| 3 |
35.3* |
61.2* |
0.7* |
2.6* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 417 |
| B |
10.1* |
89.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
88.5* |
0.7* |
2.2* |
7.9* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
0.4* |
11.1* |
2.4* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
83.7 | 252 |
| |
| Basepair (2730:2752)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
19.5* |
13.6* |
6.5* |
27.4* |
0.3 |
3.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
29.3 | 727 |
| 3 |
29.0* |
23.5* |
7.7* |
33.1* |
0.5 |
5.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 417 |
| B |
30.4* |
-- |
11.0* |
58.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
12.1* |
-- |
6.9* |
81.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
6.5* |
69.8* |
4.3* |
-- |
1.4 |
16.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 | 139 |
| M |
5.6* |
0.4* |
4.4* |
5.6* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.7 | 252 |
| |
| Basepair (2731:2751)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
60.8* |
0.3* |
0.6* |
4.3* |
2.9 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
0.1 |
-- |
29.4 | 727 |
| 3 |
86.6* |
0.2* |
0.2* |
4.6* |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
0.2 |
-- |
0.5 | 417 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
98.3* |
-- |
-- |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
59.7* |
0.7* |
0.7* |
13.7* |
15.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
7.2 |
0.7 |
-- |
1.4 | 139 |
| M |
9.5* |
0.4* |
1.2* |
4.4* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.1 | 252 |
| |
| Basepair (2732:2750)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
7.3* |
11.0 |
1.0 |
1.5* |
0.1 |
49.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
29.2 | 726 |
| 3 |
12.7* |
18.3 |
1.0 |
2.4* |
0.2 |
65.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 416 |
| B |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
97.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 236 |
| A |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
96.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
37.4* |
50.4* |
2.9* |
7.2* |
0.7 |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
-- |
1.6 |
0.4 |
0.4* |
-- |
13.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
83.7 | 252 |
| |
| Basepair (2733:2746)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
2.6* |
55.5* |
0.1* |
-- |
8.5 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
0.1 |
1.5 |
29.2 | 728 |
| 3 |
-- |
4.5* |
74.4* |
-- |
-- |
14.8 |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- | 418 |
| B |
-- |
0.8* |
99.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 238 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
96.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4 |
-- | 58 |
| E |
-- |
12.2 |
25.2 |
-- |
-- |
44.6* |
-- |
-- |
-- |
6.5* |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
6.5 |
-- | 139 |
| M |
-- |
-- |
14.7* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
84.5 | 252 |
| |
| Basepair (2734:2745)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
40.5* |
2.6* |
17.9* |
8.9* |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
29.3 | 728 |
| 3 |
62.9* |
1.0* |
30.4* |
5.0* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 418 |
| B |
93.3* |
-- |
-- |
6.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 238 |
| A |
92.7* |
-- |
-- |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
3.4* |
24.1* |
5.2* |
62.1* |
1.7 |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
2.9* |
2.9* |
90.6* |
1.4* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.7 | 139 |
| M |
11.9* |
0.4* |
-- |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.5 | 252 |
| |
| Basepair (2735:2744)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
14.7* |
0.8 |
0.8 |
3.7* |
-- |
48.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
31.0 | 727 |
| 3 |
25.7* |
0.5 |
1.0 |
6.0* |
-- |
64.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 | 417 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
95.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.6 | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
94.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4 |
-- | 58 |
| E |
76.3* |
1.4* |
2.9* |
18.0* |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 139 |
| M |
-- |
1.2 |
0.8 |
0.8* |
-- |
12.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.5 | 252 |
| |
| Basepair (2736:2743)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.0* |
27.7* |
14.1* |
2.7* |
0.4 |
9.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
29.9 | 728 |
| 3 |
26.1* |
39.5* |
16.5* |
3.8* |
0.7 |
12.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 418 |
| B |
5.9* |
50.8* |
22.7* |
3.8* |
1.3 |
14.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 238 |
| A |
-- |
90.2* |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
60.3* |
22.4* |
1.7* |
-- |
10.3 |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
67.6* |
5.8 |
7.9 |
5.0* |
-- |
12.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 139 |
| M |
-- |
0.8* |
8.3* |
1.2* |
-- |
4.0 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.3 | 252 |
| |
| Basepair (2737:2742)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
8.5* |
31.3* |
8.9* |
11.3* |
0.4 |
8.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
30.0 | 728 |
| 3 |
7.9* |
53.1* |
10.3* |
12.9* |
0.5 |
14.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.2 |
0.4 | 418 |
| B |
13.9* |
46.2* |
12.6* |
22.7* |
0.8 |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 238 |
| A |
-- |
92.7* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
48.3* |
6.9* |
17.2* |
24.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
53.2* |
7.2* |
0.7* |
-- |
36.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
0.7 |
-- | 139 |
| M |
0.4* |
0.8* |
4.8* |
5.6* |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
86.1 | 252 |
| |
Last generated : Mon Jul 1 2002 (8 : 31)