Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (58 of 60)
| Basepair (2756:2896)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
8.0* |
65.3* |
1.4* |
-- |
-- |
0.9 |
0.9 |
0.2 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
22.0 | 427 |
| 3 |
-- |
10.2* |
63.3* |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
25.8 | 332 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 206 |
| A |
-- |
89.5* |
10.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
-- |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
96.6 | 88 |
| M |
-- |
-- |
42.2* |
13.3* |
-- |
-- |
6.7 |
8.9 |
2.2 |
-- |
-- |
8.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
17.7 | 45 |
| |
| Basepair (2769:2805)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.9 |
0.1 |
1.9 |
3.3 |
1.6 |
1.8 |
7.2 |
3.1 |
11.8* |
3.1 |
7.2* |
1.0 |
4.7* |
-- |
-- |
3.0* |
49.1 | 676 |
| 3 |
1.6 |
0.3 |
1.8* |
3.9 |
2.9* |
2.6 |
7.4 |
5.0 |
20.3* |
4.5 |
12.6* |
1.3 |
1.1 |
-- |
-- |
1.6 |
33.2 | 380 |
| B |
-- |
0.5 |
2.3* |
2.8 |
-- |
4.2 |
11.7 |
8.9 |
36.0* |
4.7 |
22.4* |
2.3 |
1.9 |
-- |
-- |
1.4 |
0.9 | 214 |
| A |
14.6 |
-- |
4.9 |
22.0 |
26.8* |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
17.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
94.7 | 58 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.4 | 125 |
| M |
-- |
-- |
2.5 |
2.9 |
-- |
0.8 |
5.5* |
0.8 |
1.3 |
1.7 |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.9* |
78.1 | 238 |
| |
| Basepair (2770:2804)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
24.9* |
10.7* |
12.3* |
8.6* |
7.2 |
4.9 |
3.7 |
2.4 |
0.4 |
1.9 |
1.8 |
0.1 |
1.0 |
0.1 |
2.2 |
1.3 |
16.1 | 676 |
| 3 |
39.5* |
4.7* |
13.7* |
8.9* |
12.4 |
7.6 |
3.4 |
2.4 |
0.5 |
2.4 |
0.3 |
-- |
1.1 |
0.3 |
1.1 |
1.1 |
0.8 | 380 |
| B |
47.2* |
1.4* |
5.6* |
13.1* |
20.6 |
1.4 |
2.3 |
3.7 |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
1.4 |
0.5 |
1.4 |
-- |
0.5 | 214 |
| A |
73.2* |
14.6* |
-- |
12.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
58.6* |
1.7* |
13.8* |
1.7* |
3.4 |
1.7 |
13.8 |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
1.7 | 58 |
| E |
15.2* |
7.2* |
31.2* |
0.8* |
3.2 |
20.8 |
6.4 |
0.8 |
0.8 |
6.4 |
0.8 |
-- |
0.8 |
-- |
0.8 |
3.2 |
1.6 | 125 |
| M |
4.2* |
22.7* |
10.1* |
9.7* |
0.8 |
1.3 |
1.7 |
0.4 |
0.4 |
1.7 |
-- |
0.4 |
1.3 |
-- |
-- |
0.8 |
44.5 | 238 |
| |
| Basepair (2771:2803)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
50.0* |
8.7* |
4.7* |
17.3* |
0.7 |
0.1 |
0.9 |
0.3 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.7 |
15.4 | 676 |
| 3 |
74.7* |
3.4* |
0.8* |
18.2* |
0.8 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.8 |
0.3 | 380 |
| B |
64.5* |
2.8* |
1.4* |
29.0* |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- | 214 |
| A |
78.0* |
7.3* |
-- |
4.9 |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3* |
-- | 41 |
| C |
67.2* |
-- |
1.7 |
24.1* |
-- |
1.7* |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- | 58 |
| E |
90.4* |
3.2* |
-- |
4.8* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 125 |
| M |
6.3* |
19.7* |
12.2* |
14.3* |
0.8 |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
43.3 | 238 |
| |
| Basepair (2772:2802)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
64.5* |
5.5* |
4.1* |
3.7* |
0.1 |
0.3 |
3.7 |
0.4 |
-- |
0.7 |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.9 |
15.3 | 676 |
| 3 |
97.1* |
-- |
0.5 |
0.5 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.3 |
0.8* |
-- | 380 |
| B |
99.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- | 214 |
| A |
90.2* |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3* |
-- | 41 |
| C |
91.4* |
-- |
1.7* |
3.4* |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
96.0* |
-- |
1.6* |
1.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- | 125 |
| M |
5.9* |
15.5* |
10.5* |
8.8* |
-- |
1.3 |
9.7 |
0.8 |
-- |
2.5 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
43.4 | 238 |
| |
| Basepair (2773:2801)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.6* |
0.1 |
1.5* |
14.9 |
0.3 |
0.4 |
19.4 |
0.7 |
28.2* |
0.1 |
0.3 |
0.7* |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
28.9 | 680 |
| 3 |
4.4* |
0.3 |
0.8* |
25.5 |
0.5 |
0.8 |
26.3 |
1.3 |
36.5* |
-- |
0.5 |
0.8* |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 384 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
41.7 |
1.4 |
56.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 218 |
| A |
39.0* |
-- |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
12.2 |
-- |
19.5* |
-- |
-- |
4.9* |
19.5 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
20.7 |
-- |
74.1* |
-- |
-- |
3.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
0.8 |
0.8 |
0.8 |
77.6* |
1.6 |
2.4* |
4.8 |
1.6 |
7.2 |
-- |
1.6* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 125 |
| M |
0.4* |
-- |
2.5 |
1.3 |
-- |
-- |
8.0* |
-- |
3.8 |
0.4 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
82.8 | 238 |
| |
| Basepair (2774:2799)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
70.5* |
0.1* |
-- |
0.7 |
0.6 |
-- |
-- |
1.0 |
0.4* |
-- |
1.8 |
0.1* |
0.7 |
1.3 |
22.7 | 685 |
| 3 |
-- |
-- |
96.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
0.3 |
0.3* |
-- |
1.5 |
0.3 | 389 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 223 |
| A |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
-- |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
-- |
91.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4* |
-- |
0.8 |
0.8* |
-- |
4.8 |
-- | 125 |
| M |
-- |
-- |
20.6* |
0.4* |
-- |
2.1 |
2.1 |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
4.2 |
-- |
1.7 |
0.8 |
65.5 | 238 |
| |
| Basepair (2776:2798)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
0.1 |
0.4 |
3.5 |
-- |
0.7 |
3.2 |
3.8 |
71.3* |
0.9* |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
15.2 | 686 |
| 3 |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
1.0 |
0.3 |
2.6 |
94.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 390 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
4.0 |
94.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 224 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
20.7 |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
77.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
0.8 |
-- |
0.8 |
-- |
3.2 |
-- |
0.8 |
94.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 125 |
| M |
0.4* |
-- |
1.3 |
4.2 |
-- |
0.4 |
8.8 |
6.7 |
31.5* |
2.5* |
0.8 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
42.3 | 238 |
| |
| Basepair (2777:2797)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
13.0* |
28.9* |
34.4* |
8.9* |
5.7 |
0.1 |
0.6 |
0.9 |
0.1 |
2.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
1.3 |
1.5 |
1.9 | 686 |
| 3 |
16.5* |
30.8* |
26.5* |
11.8* |
9.3 |
-- |
-- |
1.0 |
0.3 |
1.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
1.8 |
0.5 |
-- | 389 |
| B |
20.6* |
44.4* |
1.3* |
16.1* |
15.7 |
-- |
-- |
0.9 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 223 |
| A |
39.0* |
41.5* |
4.9* |
14.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
12.1* |
86.2* |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
2.4* |
3.2* |
77.6* |
3.2* |
0.8 |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.6 |
1.6 |
-- | 125 |
| M |
7.9* |
11.7* |
55.2* |
6.3* |
1.3 |
0.4 |
1.7 |
0.8 |
-- |
4.2 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.8 |
3.3 |
5.8 | 239 |
| |
| Basepair (2778:2796)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
18.4* |
30.6* |
32.3* |
9.7* |
1.0 |
2.2 |
0.6 |
0.1 |
-- |
1.3 |
0.1 |
0.4 |
0.3 |
0.1 |
0.3 |
0.9 |
1.6 | 690 |
| 3 |
31.0* |
45.5* |
16.5* |
3.3* |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- | 393 |
| B |
-- |
69.5* |
27.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 226 |
| A |
24.4* |
46.3* |
4.9* |
24.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
27.6* |
65.5* |
6.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
88.1* |
2.4* |
0.8* |
2.4* |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- |
-- | 126 |
| M |
2.1* |
6.7* |
50.6* |
20.5* |
0.8 |
6.3 |
1.7 |
0.4 |
-- |
1.3 |
0.4 |
0.8 |
0.4 |
-- |
0.8 |
2.5 |
4.6 | 239 |
| |
| Basepair (2779:2795)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
42.6* |
1.7* |
3.5* |
31.5* |
16.3 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
1.9 | 695 |
| 3 |
61.1* |
2.3* |
-- |
23.1* |
12.8 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 398 |
| B |
80.6* |
-- |
-- |
4.4* |
15.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 227 |
| A |
92.7* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
5.2 |
93.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
17.7* |
4.6* |
-- |
63.1* |
13.1 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 130 |
| M |
22.2* |
1.3* |
10.0* |
51.9* |
3.3 |
-- |
1.3 |
0.8 |
-- |
0.4 |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- |
1.3 |
1.3 |
4.6 | 239 |
| |
| Basepair (2780:2794)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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4.7* |
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0.3 |
-- |
1.0 |
2.4 |
0.3 |
0.3 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 | 697 |
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-- |
97.8* |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 400 |
| B |
-- |
96.1* |
3.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 228 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
98.3* |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 131 |
| M |
7.9* |
15.1* |
9.6* |
49.8* |
0.8 |
-- |
2.9 |
7.1 |
0.8 |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.6 | 239 |
| |
| Basepair (2781:2793)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
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| AG
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| CC
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| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.3* |
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1.1* |
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0.6 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
0.1 |
1.7 | 698 |
| 3 |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 400 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 228 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
96.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 131 |
| M |
-- |
0.8* |
85.0* |
2.9* |
0.8 |
1.7 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
0.4 |
5.0 | 240 |
| |
| Basepair (2782:2792)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.4* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
94.6* |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 698 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 400 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 228 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 131 |
| M |
1.7 |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
1.2* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
84.6* |
-- |
-- |
-- |
9.5 | 240 |
| |
| Basepair (2783:2789)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.6 |
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-- |
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0.4 |
0.7 |
0.1* |
-- |
0.9* |
0.1 |
-- |
-- |
3.7 | 699 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
98.8 |
0.7 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 401 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 229 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
-- |
-- |
96.9 |
2.3 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 131 |
| M |
-- |
-- |
1.7 |
46.2* |
-- |
-- |
32.9 |
1.7 |
1.2 |
2.1 |
0.4* |
-- |
2.5* |
0.4 |
-- |
-- |
10.8 | 240 |
| |
| Basepair (2784:2788)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1 |
4.9 |
1.9 |
-- |
1.0* |
65.2* |
17.9 |
-- |
3.0 |
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1.0* |
0.3 |
-- |
0.3 |
1.0 |
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| 3 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
67.6* |
30.7 |
-- |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 401 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
99.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 229 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7* |
89.7* |
-- |
-- |
8.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 58 |
| E |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
3.1 |
93.1 |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 131 |
| M |
-- |
0.4 |
14.2 |
4.2 |
-- |
2.5* |
55.4* |
0.8 |
-- |
6.7 |
-- |
2.9* |
0.8 |
-- |
0.8 |
2.9 |
8.3 | 240 |
| |
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