Identified Basepairs and Their Conformations and Conformational Parameters

PDB Id: 1J5A BPC Identified: 1256 Ambiguities: 14
RNA PDB Position bp bpC; LG [LW][Sanger] dCC <X ; <Y |<X - <Y| Torsion Z-Diff Buckle
rRNA 1J5A 1!L:2876!L G:C WC [cWW][XIX] 10.84 52.76; 52.77 0.01 4.75 0.46 1.59
rRNA 1J5A 2!L:2875!L G:C WC [cWW][XIX] 10.7 54.11; 54.58 0.47 -3.9 0.35 13.93
rRNA 1J5A 3!L:2874!L U:A WC [cWW][XX] 10.69 54.09; 54.46 0.37 -1.75 0.13 5.37
rRNA 1J5A 4!L:2873!L C:G WC [cWW][XIX] 10.75 54.27; 53.86 0.41 -5.37 0.18 15.5
rRNA 1J5A 5!L:2872!L A:U WC [cWW][XX] 10.61 55.25; 54.96 0.29 -5.67 0.17 15.55
rRNA 1J5A 6!L:2871!L A:U WC [cWW][XX] 10.66 54.23; 54.29 0.06 0.46 0.08 10.02
rRNA 1J5A 7!L:2870!L G:C WC [cWW][XIX] 10.73 54.76; 54.66 0.09 -5.66 0.04 10.46
rRNA 1J5A 8!L:2869!L A:U WC [cWW][XX] 10.8 53.14; 52.42 0.73 -9.41 0.42 17.75
rRNA 1J5A 9!L:2608!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 10.37 38.72; 7.12 31.6 174.99 0.28 18.27
rRNA 1J5A 14!L:2603!L A:G fS [tSW][X] 10.0 42.76; 113.66 70.9 -13.83 2.31 75.04
rRNA 1J5A 15!L:535!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 11.17 33.23; 66.01 32.78 21.29 1.33 4.73
rRNA 1J5A 16!L:534!L G:U sWb [---][-] 10.63 41.49; 84.65 43.16 -8.67 0.08 9.56
rRNA 1J5A 17!L:533!L G:C WC [cWW][XIX] 10.54 55.58; 56.15 0.57 -4.15 0.59 14.78
rRNA 1J5A 18!L:532!L U:A WC [cWW][XX] 10.62 54.25; 54.27 0.02 -6.37 0.47 20.18
rRNA 1J5A 19!L:531!L C:G WC [cWW][XIX] 10.75 54.6; 54.11 0.48 0.25 0.23 8.84
rRNA 1J5A 20!L:530!L C:G WC [cWW][XIX] 10.82 53.33; 53.48 0.16 -3.04 0.27 10.47
rRNA 1J5A 21!L:529!L A:U WC [cWW][XX] 10.73 53.84; 53.58 0.26 -3.58 0.25 10.67
rRNA 1J5A 22!L:528!L C:G WC [cWW][XIX] 10.48 57.41; 56.56 0.85 -5.75 0.65 19.03
rRNA 1J5A 23!L:527!L G:C WC [cWW][XIX] 10.77 53.5; 53.6 0.09 3.41 0.16 3.7
rRNA 1J5A 24!L:526!L G:C WC [cWW][XIX] 10.26 55.91; 57.34 1.43 -2.41 0.45 30.1
rRNA 1J5A 25!L:525!L U:A sWC [---][-] 10.84 71.26; 22.93 48.33 14.73 1.44 38.97
rRNA 1J5A 26!L:525!L G:A S_Mo [tSH][XI] 9.57 117.99; 28.93 89.05 -18.0 1.9 11.95
rRNA 1J5A 26!L:524!L G:A S [tSH][XI] 9.57 97.37; 11.89 85.48 12.3 0.11 15.7
rRNA 1J5A 27!L:523!L G:A S [tSH][XI] 8.71 97.26; 4.99 92.27 -87.55 0.08 20.16
rRNA 1J5A 28!L:591!L A:G rS(ss:O2*-O2*)_2 [---][-] 5.5 149.8; 155.42 5.62 -110.11 0.97 26.84
rRNA 1J5A 28!L:522!L A:G S(sb:O2*-N6)_3 [---][-] 8.89 15.29; 149.8 134.52 -87.01 0.57 30.13
rRNA 1J5A 30!L:1227!L G:A rpS(sb:O2*-N3) [---][-] 5.42 157.68; 90.48 67.2 -48.69 0.58 56.97
rRNA 1J5A 30!L:520!L G:C WC [cWW][XIX] 10.38 54.86; 57.55 2.69 3.47 1.23 35.72
rRNA 1J5A 31!L:485!L C:G WC [cWW][XIX] 10.8 52.81; 50.63 2.18 -22.1 0.02 25.32
rRNA 1J5A 32!L:484!L C:G WC [cWW][XIX] 10.95 47.9; 47.57 0.33 -30.82 0.63 27.07
rRNA 1J5A 34!L:484!L U:G S*_1 [tHS][-] 10.21 14.25; 104.88 90.63 62.51 0.27 50.26
rRNA 1J5A 35!L:457!L G:C WC [cWW][XIX] 10.28 56.84; 59.1 2.25 -1.68 0.74 21.16
rRNA 1J5A 36!L:462!L G:G rS(sb:O2*-N3) [---][-] 5.52 110.09; 105.29 4.81 -140.7 0.85 40.23
rRNA 1J5A 36!L:456!L G:C WC [cWW][XIX] 10.02 57.37; 59.4 2.04 -2.55 0.87 21.02
rRNA 1J5A 37!L:454!L C:G WC [cWW][XIX] 10.74 54.26; 54.44 0.18 -11.1 0.53 21.6
rRNA 1J5A 38!L:453!L G:U WC [---][-] 10.6 57.75; 57.36 0.39 -24.84 0.41 32.83
rRNA 1J5A 39!L:452!L C:G WC [cWW][XIX] 10.77 52.72; 53.19 0.48 -12.95 0.09 20.2
rRNA 1J5A 40!L:451!L U:A WC [cWW][XX] 10.62 54.44; 55.11 0.67 -6.79 0.42 14.37
rRNA 1J5A 41!L:450!L G:C WC [cWW][XIX] 10.73 54.15; 54.65 0.49 -3.31 0.26 8.82
rRNA 1J5A 42!L:449!L G:C WC [cWW][XIX] 10.54 55.61; 54.83 0.78 -12.16 0.46 35.66
rRNA 1J5A 43!L:447!L A:U WC [cWW][XX] 10.49 54.53; 51.07 3.47 -23.79 0.33 25.8
rRNA 1J5A 44!L:446!L G:C WC [cWW][XIX] 10.81 52.91; 53.37 0.47 -13.45 0.29 13.57
rRNA 1J5A 45!L:156!L C:G WC [cWW][XIX] 10.56 55.8; 56.07 0.27 -0.46 0.79 20.89
rRNA 1J5A 46!L:155!L C:G WC [cWW][XIX] 10.45 55.47; 53.24 2.23 12.45 0.49 24.9
rRNA 1J5A 48!L:118!L A:U Wb* [---][-] 8.75 86.86; 62.08 24.79 -20.08 1.15 29.06
rRNA 1J5A 51!L:155!L A:G rS [tSS][-] 7.49 58.31; 90.55 32.24 -174.28 0.44 64.42
rRNA 1J5A 51!L:115!L A:G S(bp:N1-O2P)_1 [---][-] 9.38 14.98; 73.11 58.13 127.05 1.45 26.99
rRNA 1J5A 52!L:115!L A:G S [tSH][XI] 9.59 13.96; 100.85 86.89 -34.53 0.57 17.23
rRNA 1J5A 53!L:114!L G:C WC [cWW][XIX] 10.81 53.83; 54.79 0.96 -1.13 0.19 4.74
rRNA 1J5A 54!L:125!L G:A rS [tSS][-] 8.41 85.37; 60.55 24.82 168.34 0.37 20.57
rRNA 1J5A 54!L:113!L G:C WC [cWW][XIX] 10.69 54.54; 55.53 1.0 -7.08 0.13 12.11
rRNA 1J5A 55!L:112!L A:U WC [cWW][XX] 11.03 50.33; 48.52 1.81 -12.98 0.54 26.06
rRNA 1J5A 56!L:69!L C:G WC [cWW][XIX] 10.77 46.95; 52.54 5.59 -33.2 0.18 34.11
rRNA 1J5A 57!L:68!L G:C WC [cWW][XIX] 10.59 53.03; 56.51 3.48 -19.84 0.14 26.41
rRNA 1J5A 58!L:67!L C:G WC [cWW][XIX] 10.64 53.69; 50.49 3.2 -14.8 0.3 29.8
rRNA 1J5A 60!L:92!L A:U WC [cWW][XX] 10.33 56.72; 57.42 0.71 5.39 0.26 14.54
rRNA 1J5A 61!L:91!L U:A WC [cWW][XX] 9.75 62.34; 60.95 1.39 2.88 1.45 19.2
rRNA 1J5A 63!L:89!L A:A rWb* [tWW][I] 13.75 18.66; 39.63 20.97 -166.86 1.78 1.68
rRNA 1J5A 64!L:88!L C:G WC [cWW][XIX] 10.76 53.34; 53.64 0.3 -2.69 0.16 19.11
rRNA 1J5A 65!L:87!L C:G WC [cWW][XIX] 10.86 52.02; 51.64 0.38 -11.7 0.39 19.89
rRNA 1J5A 66!L:72!L U:A WC [cWW][XX] 10.6 52.04; 54.6 2.56 -29.55 0.38 65.81
rRNA 1J5A 75!L:108!L C:G WC [cWW][XIX] 10.73 53.84; 53.51 0.33 -8.36 0.02 19.97
rRNA 1J5A 76!L:107!L C:G WC [cWW][XIX] 10.83 53.02; 53.1 0.08 -10.47 0.13 13.27
rRNA 1J5A 77!L:106!L C:G WC [cWW][XIX] 10.8 53.26; 53.77 0.5 -1.13 0.68 18.68
rRNA 1J5A 78!L:105!L C:G WC [cWW][XIX] 10.45 56.36; 53.82 2.55 3.29 0.57 35.38
rRNA 1J5A 79!L:305!L G:A rS [tSS][-] 7.81 89.0; 76.62 12.38 166.99 0.57 24.19
rRNA 1J5A 79!L:104!L G:C WC [cWW][XIX] 10.7 54.69; 54.12 0.57 -9.75 0.41 22.36
rRNA 1J5A 80!L:103!L A:U WC [cWW][XX] 10.66 55.13; 52.79 2.34 -10.2 0.88 26.69
rRNA 1J5A 81!L:102!L C:C sWb [---][-] 10.48 74.07; 23.98 50.09 -3.78 0.11 16.71
rRNA 1J5A 83!L:100!L A:G S [tSH][XI] 8.75 16.06; 103.67 87.61 -65.26 0.08 24.95
rRNA 1J5A 84!L:101!L G:A rS [tSS][-] 7.46 90.63; 51.6 39.03 -150.42 1.54 60.37
rRNA 1J5A 84!L:96!L G:C WC [cWW][XIX] 10.67 54.09; 54.51 0.42 3.61 0.46 13.47
rRNA 1J5A 85!L:95!L C:G WC [cWW][XIX] 10.76 54.24; 53.47 0.77 -8.13 0.16 14.79
rRNA 1J5A 113!L:125!L C:A rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.53 106.21; 155.23 49.02 -36.04 1.12 8.58
rRNA 1J5A 114!L:124!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 4.9 149.35; 104.81 44.54 -43.47 0.29 26.41
rRNA 1J5A 118!L:154!L U:U rWb* [tWW][XII] 10.97 26.96; 32.07 5.12 85.24 1.37 29.72
rRNA 1J5A 119!L:128!L G:C WC [cWW][XIX] 10.95 49.4; 51.39 1.99 -11.08 0.12 11.5
rRNA 1J5A 120!L:127!L G:C WC [cWW][XIX] 10.31 56.39; 57.42 1.03 2.19 0.5 25.15
rRNA 1J5A 121!L:126!L G:C WC [cWW][XIX] 10.59 55.01; 55.03 0.02 0.39 0.42 27.33
rRNA 1J5A 122!L:1389!L G:C rS(sp:O2*-O1P) [---][-] 8.25 108.26; 172.95 64.69 170.83 0.04 69.36
rRNA 1J5A 129!L:142!L A:U WC [cWW][XX] 10.25 57.06; 58.0 0.94 0.98 0.76 7.48
rRNA 1J5A 130!L:141!L C:G WC [cWW][XIX] 10.68 54.82; 54.35 0.47 2.37 0.13 16.17
rRNA 1J5A 131!L:140!L C:G WC [cWW][XIX] 10.76 53.86; 53.77 0.08 6.26 0.51 2.76
rRNA 1J5A 132!L:139!L U:A WC [cWW][XX] 10.55 55.26; 55.78 0.52 4.36 0.44 2.58
rRNA 1J5A 133!L:138!L C:G WC [cWW][XIX] 10.71 54.53; 54.34 0.19 6.95 0.61 2.54
rRNA 1J5A 134!L:137!L G:A S [tSH][XI] 9.73 101.21; 3.02 98.19 -39.55 0.47 17.06
rRNA 1J5A 143!L:154!L A:U WC [cWW][XX] 11.37 56.61; 49.49 7.12 -25.97 0.21 25.41
rRNA 1J5A 144!L:153!L U:A WC [cWW][XX] 10.48 55.11; 56.9 1.78 -12.08 0.56 22.26
rRNA 1J5A 145!L:152!L C:G WC [cWW][XIX] 10.64 55.57; 55.0 0.57 2.41 0.03 18.94
rRNA 1J5A 146!L:151!L C:G WC [cWW][XIX] 10.69 54.67; 52.78 1.89 15.87 0.58 24.83
rRNA 1J5A 147!L:150!L G:A S [tSH][XI] 9.65 90.36; 9.68 80.68 -119.08 1.66 40.26
rRNA 1J5A 159!L:446!L A:C rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.17 101.19; 146.72 45.53 -53.58 1.16 37.91
rRNA 1J5A 159!L:192!L A:G WC [cWW][VIII] 12.42 47.77; 53.03 5.26 -34.18 1.48 26.94
rRNA 1J5A 160!L:445!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.72 154.34; 91.94 62.4 -53.79 0.82 36.99
rRNA 1J5A 160!L:191!L C:G WC [cWW][XIX] 10.64 53.92; 55.18 1.26 -8.17 0.19 17.37
rRNA 1J5A 161!L:194!L U:G rS(ss:O2*-O2*)_1 [---][-] 4.77 133.28; 123.91 9.37 -158.61 1.21 51.73
rRNA 1J5A 161!L:189!L U:A WC [cWW][XX] 10.67 54.12; 54.56 0.44 2.6 0.09 6.61
rRNA 1J5A 162!L:188!L C:G WC [cWW][XIX] 10.7 54.36; 54.16 0.2 -1.56 0.34 23.28
rRNA 1J5A 163!L:187!L A:U WC [cWW][XX] 10.53 55.76; 56.27 0.52 -6.19 0.21 13.41
rRNA 1J5A 164!L:186!L G:C WC [cWW][XIX] 10.71 53.39; 54.23 0.84 6.24 0.13 14.45
rRNA 1J5A 165!L:185!L G:C WC [cWW][XIX] 10.73 54.3; 54.66 0.36 4.59 0.19 15.52
rRNA 1J5A 166!L:184!L G:A S [tSH][XI] 10.24 95.5; 7.16 88.33 10.77 0.04 3.97
rRNA 1J5A 167!L:812!L A:G fS(sb:O2*-N6) [---][-] 9.16 32.21; 107.96 75.76 154.26 1.79 38.58
rRNA 1J5A 167!L:692!L A:C rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.72 89.82; 148.95 59.13 -52.51 1.06 41.05
rRNA 1J5A 167!L:183!L A:U rH_1 [tWH][XXIV] 9.78 26.09; 22.96 3.13 -160.6 1.26 55.84
rRNA 1J5A 167!L:182!L A:G S(bp:N2-O2P)_3 [---][-] 10.38 61.04; 98.82 37.78 177.91 2.59 30.39
rRNA 1J5A 168!L:812!L A:G rS [tSS][-] 8.34 60.89; 85.06 24.18 162.27 1.77 22.92
rRNA 1J5A 168!L:691!L A:C rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.63 150.07; 103.17 46.9 -52.36 0.27 27.4
rRNA 1J5A 168!L:181!L A:A rS* [tHH][-] 11.19 16.19; 16.41 0.22 -101.97 0.22 31.06
rRNA 1J5A 169!L:180!L C:C S [---][-] 9.27 9.31; 97.8 88.49 89.17 0.02 26.64
rRNA 1J5A 170!L:180!L U:C pfS*_1 [cWS][-] 6.34 64.75; 114.48 49.73 -13.3 1.99 20.76
rRNA 1J5A 170!L:179!L U:U WC [---][-] 9.13 50.19; 63.42 13.23 -15.47 0.35 35.56
rRNA 1J5A 171!L:816!L G:U rS(sp:O2*-O1P) [---][-] 10.04 85.5; 155.33 69.84 113.89 1.5 49.95
rRNA 1J5A 171!L:228!L G:A rpS [cSS][-] 6.88 106.0; 116.59 10.59 -66.98 0.33 60.44
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rRNA 1J5A 203!L:205!L G:A S(sb:O2*-N6)_3 [---][-] 9.83 127.65; 14.68 112.97 -104.15 2.18 53.73
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rRNA 1J5A 214!L:237!L C:G WC [cWW][XIX] 10.4 57.17; 55.77 1.41 3.48 0.93 14.75
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rRNA 1J5A 298!L:364!L C:G WC [cWW][XIX] 10.79 52.85; 51.37 1.48 12.07 0.4 12.92
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rRNA 1J5A 309!L:351!L G:A S [tSH][XI] 9.57 99.35; 5.35 94.0 -17.08 0.6 11.61
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rRNA 1J5A 311!L:329!L A:C rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.63 154.48; 104.87 49.6 -41.05 1.01 15.67
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rRNA 1J5A 312!L:326!L G:A WC [cWW][VIII] 13.03 52.44; 46.34 6.1 13.63 1.06 12.88
rRNA 1J5A 313!L:326!L U:A WC [cWW][XX] 10.52 54.5; 55.58 1.08 -10.11 0.73 5.68
rRNA 1J5A 314!L:325!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.46 47.22; 76.69 29.47 -12.85 0.07 26.31
rRNA 1J5A 315!L:324!L G:C WC [cWW][XIX] 10.53 55.48; 56.34 0.86 -8.75 0.78 19.78
rRNA 1J5A 316!L:323!L C:G WC [cWW][XIX] 10.65 54.81; 54.64 0.17 -11.44 0.24 20.38
rRNA 1J5A 317!L:321!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 10.52 31.11; 12.03 19.08 -155.47 0.25 10.31
rRNA 1J5A 318!L:341!L G:A S_Mo [tSH][XI] 9.92 116.97; 31.38 85.59 16.67 0.17 32.87
rRNA 1J5A 318!L:321!L G:A S(bp:N1-O2P)_1 [---][-] 7.93 73.55; 44.36 29.19 -101.68 2.61 33.17
rRNA 1J5A 328!L:345!L A:U WC [cWW][XX] 10.25 58.54; 58.91 0.37 -8.44 0.03 14.21
rRNA 1J5A 329!L:344!L C:G WC [cWW][XIX] 10.76 54.59; 53.99 0.6 -8.69 0.4 14.37
rRNA 1J5A 330!L:334!L C:G WC [cWW][XIX] 10.45 53.5; 55.87 2.36 16.79 0.99 11.56
rRNA 1J5A 335!L:349!L A:G S [tSH][XI] 10.09 5.84; 95.57 89.73 -2.24 0.5 14.04
rRNA 1J5A 336!L:348!L A:U WC [cWW][XX] 10.6 55.42; 54.88 0.54 -0.59 0.5 6.93
rRNA 1J5A 337!L:347!L G:C WC [cWW][XIX] 10.67 54.41; 55.33 0.92 -1.26 0.64 10.72
rRNA 1J5A 338!L:346!L G:C WC [cWW][XIX] 10.98 54.63; 55.63 1.0 -9.61 0.23 10.21
rRNA 1J5A 388!L:412!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.32 38.52; 73.78 35.27 -5.69 0.89 21.73
rRNA 1J5A 389!L:411!L G:C WC [cWW][XIX] 10.7 53.66; 54.63 0.97 -13.1 0.09 18.41
rRNA 1J5A 390!L:410!L U:A WC [cWW][XX] 10.4 55.58; 57.1 1.52 -12.44 0.53 28.66
rRNA 1J5A 391!L:409!L C:G WC [cWW][XIX] 10.34 56.91; 57.02 0.11 -1.32 1.03 9.73
rRNA 1J5A 392!L:408!L G:U WC_mo [---][-] 11.36 48.13; 52.65 4.52 -1.96 0.8 40.0
rRNA 1J5A 393!L:407!L U:A WC [cWW][XX] 10.08 58.0; 59.38 1.37 0.47 0.95 14.66
rRNA 1J5A 394!L:406!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.56 66.95; 43.28 23.67 -9.19 0.24 11.52
rRNA 1J5A 395!L:405!L G:C WC [cWW][XIX] 10.75 53.42; 51.6 1.82 -17.36 0.74 29.52
rRNA 1J5A 396!L:404!L U:A WC [cWW][XX] 11.16 47.71; 46.75 0.96 -19.66 0.16 26.16
rRNA 1J5A 398!L:424!L C:G Wb [---][-] 10.52 49.12; 30.75 18.37 -73.95 0.9 58.04
rRNA 1J5A 414!L:435!L A:A rWb* [tWW][I] 14.23 22.45; 34.11 11.65 82.64 0.57 71.52
rRNA 1J5A 415!L:436!L A:A rWC [---][-] 12.99 31.84; 50.93 19.1 96.93 0.44 49.44
rRNA 1J5A 419!L:434!L G:C WC [cWW][XIX] 10.77 43.58; 44.28 0.7 -43.96 1.21 30.57
rRNA 1J5A 420!L:433!L C:G WC [cWW][XIX] 10.79 52.16; 53.51 1.34 -14.24 0.48 22.28
rRNA 1J5A 421!L:432!L G:C WC [cWW][XIX] 10.78 52.84; 53.3 0.45 5.54 0.72 2.89
rRNA 1J5A 422!L:431!L C:G WC [cWW][XIX] 10.76 53.31; 52.82 0.48 5.95 0.61 7.6
rRNA 1J5A 423!L:430!L G:C WC [cWW][XIX] 10.74 54.0; 53.34 0.66 -6.58 0.39 14.38
rRNA 1J5A 425!L:2390!L A:A S [tSH][-] 9.7 2.15; 82.99 80.84 13.98 0.13 9.27
rRNA 1J5A 426!L:2389!L C:G WC [cWW][XIX] 10.71 53.36; 53.84 0.48 5.45 0.73 3.48
rRNA 1J5A 426!L:1862!L C:C rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 6.3 158.11; 138.78 19.33 -110.14 0.18 26.68
rRNA 1J5A 427!L:2388!L C:G WC [cWW][XIX] 10.56 56.98; 55.73 1.26 -0.97 0.08 19.99
rRNA 1J5A 427!L:1856!L C:U rS(sb:O2*-O2) [---][-] 3.91 120.96; 131.84 10.88 -162.51 1.2 32.69
rRNA 1J5A 428!L:2387!L A:U WC [cWW][XX] 10.71 52.52; 53.31 0.79 -5.85 0.14 13.72
rRNA 1J5A 429!L:2386!L C:G WC [cWW][XIX] 10.9 51.5; 51.86 0.36 -13.35 0.13 17.22
rRNA 1J5A 455!L:1258!L A:G rS [tSS][-] 8.2 58.04; 88.25 30.21 -173.41 0.65 20.98
rRNA 1J5A 455!L:1214!L A:C rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 5.97 152.63; 103.1 49.53 -31.52 0.82 38.01
rRNA 1J5A 457!L:461!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.72 136.52; 100.25 36.27 -27.25 0.33 23.09
rRNA 1J5A 458!L:466!L G:A fS [tSW][X] 9.75 117.5; 11.0 106.5 150.22 1.19 12.93
rRNA 1J5A 460!L:592!L U:G fS*_1 [tWS][-] 6.5 26.29; 114.68 88.39 -123.57 1.67 13.89
rRNA 1J5A 461!L:466!L A:A rH [tWH][V] 12.56 20.6; 20.78 0.18 -103.8 2.05 43.59
rRNA 1J5A 464!L:468!L G:A rS [tSS][-] 9.39 83.13; 54.85 28.28 143.37 1.77 55.25
rRNA 1J5A 467!L:483!L U:A pfS(sb:O2*-N6) [---][-] 9.84 167.78; 22.17 145.62 164.68 0.29 40.09
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rRNA 1J5A 595!L:822!L A:G rS [tSS][-] 8.21 63.28; 89.57 26.29 148.23 0.89 39.48
rRNA 1J5A 595!L:684!L A:C rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 6.66 139.97; 98.54 41.43 -60.79 0.93 25.81
rRNA 1J5A 598!L:681!L U:A WC [cWW][XX] 10.2 58.73; 56.3 2.43 -18.0 1.4 38.92
rRNA 1J5A 599!L:680!L A:U WC [cWW][XX] 10.21 57.86; 57.37 0.49 -12.46 0.87 8.49
rRNA 1J5A 600!L:679!L G:C WC [cWW][XIX] 10.75 53.47; 52.97 0.5 -17.87 0.42 25.35
rRNA 1J5A 602!L:678!L C:G WC [cWW][XIX] 10.74 53.97; 54.54 0.57 -2.27 0.2 18.11
rRNA 1J5A 603!L:677!L C:G WC [cWW][XIX] 10.67 55.39; 55.58 0.19 3.63 0.66 2.98
rRNA 1J5A 604!L:676!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.58 72.24; 44.9 27.34 1.91 0.18 5.2
rRNA 1J5A 605!L:675!L G:C WC [cWW][XIX] 10.57 55.8; 56.6 0.79 -5.83 0.26 22.71
rRNA 1J5A 606!L:674!L A:U WC [cWW][XX] 10.92 51.84; 51.54 0.3 1.02 0.24 11.06
rRNA 1J5A 607!L:673!L C:G WC [cWW][XIX] 10.84 53.59; 53.36 0.23 -1.62 0.21 6.24
rRNA 1J5A 608!L:672!L G:C WC [cWW][XIX] 10.74 54.42; 54.37 0.05 -4.07 0.32 16.13
rRNA 1J5A 609!L:671!L U:A WC [cWW][XX] 10.56 55.47; 55.21 0.26 -9.33 0.18 16.13
rRNA 1J5A 610!L:670!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.8 40.83; 70.81 29.98 -20.48 0.16 22.01
rRNA 1J5A 610!L:614!L G:G rpS(sb:O2*-N2)_3 [---][-] 9.98 61.95; 154.51 92.57 -179.36 1.19 62.21
rRNA 1J5A 611!L:669!L C:G WC [cWW][XIX] 10.91 48.94; 50.81 1.86 -23.47 0.29 24.09
rRNA 1J5A 612!L:613!L G:A rS(ss:O2*-O2*)_2 [---][-] 5.82 156.32; 171.6 15.28 -164.26 0.76 29.12
rRNA 1J5A 613!L:635!L A:C WC [---][-] 10.66 52.87; 55.81 2.93 17.12 0.25 16.67
rRNA 1J5A 615!L:633!L C:G WC [cWW][XIX] 10.8 53.66; 53.12 0.54 9.68 0.01 10.82
rRNA 1J5A 616!L:632!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 10.5 42.03; 4.08 37.95 -159.36 1.09 46.27
rRNA 1J5A 618!L:630!L A:G S [tSH][XI] 10.19 7.91; 89.44 81.53 -22.79 1.31 29.52
rRNA 1J5A 619!L:629!L A:C WC [---][-] 10.38 52.08; 63.79 11.7 -16.17 0.23 28.48
rRNA 1J5A 621!L:628!L U:A WC [cWW][XX] 9.4 62.35; 60.77 1.58 -8.38 0.8 46.13
rRNA 1J5A 622!L:627!L U:A WC [cWW][XX] 9.34 62.33; 61.62 0.72 -3.26 0.02 38.41
rRNA 1J5A 635!L:670!L C:U rpS(ps:O1P-O2*)_1 [---][-] 7.37 94.58; 129.5 34.91 165.55 0.35 42.87
rRNA 1J5A 636!L:669!L G:G rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 5.58 140.08; 152.86 12.78 -69.87 0.71 65.31
rRNA 1J5A 639!L:646!L G:C WC [cWW][XIX] 10.69 53.6; 54.21 0.61 -1.6 0.2 20.68
rRNA 1J5A 640!L:645!L C:G WC [cWW][XIX] 10.75 54.72; 53.54 1.18 2.45 0.5 4.39
rRNA 1J5A 641!L:644!L G:A S_mo [tSH][XI] 9.79 85.1; 23.68 61.43 -124.5 0.83 22.97
rRNA 1J5A 641!L:643!L G:A S(sb:O2*-N7) [---][-] 7.45 82.02; 32.08 49.94 -156.81 1.58 35.09
rRNA 1J5A 642!L:2394!L A:G pfS(sb:O2*-N3) [---][-] 6.34 93.0; 147.97 54.97 -8.28 0.52 22.7
rRNA 1J5A 643!L:2382!L A:C rS(sb:O2*-N3)_1 [---][-] 5.35 90.73; 132.97 42.24 -129.75 2.53 47.03
rRNA 1J5A 647!L:649!L G:G rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 5.64 168.76; 161.39 7.37 -63.74 0.78 38.85
rRNA 1J5A 650!L:659!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 11.38 54.06; 39.62 14.44 -2.8 0.59 15.04
rRNA 1J5A 651!L:658!L C:G Wb* [---][-] 12.1 33.24; 55.01 21.77 1.16 1.06 14.73
rRNA 1J5A 653!L:2328!L G:G rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 5.86 173.51; 150.18 23.33 -173.99 0.22 7.36
rRNA 1J5A 676!L:950!L G:G rS(sb:O2*-N2) [---][-] 6.97 99.9; 130.98 31.08 176.77 1.73 8.52
rRNA 1J5A 677!L:951!L G:G rS(ps:O1P-O2*)_1 [---][-] 6.8 141.48; 125.76 15.73 120.14 1.31 23.82
rRNA 1J5A 684!L:822!L C:G WC [cWW][XIX] 10.91 50.59; 52.07 1.48 -8.62 0.07 13.71
rRNA 1J5A 685!L:821!L U:A WC [cWW][XX] 10.57 54.6; 55.12 0.52 -6.86 0.14 18.78
rRNA 1J5A 687!L:819!L G:C WC [cWW][XIX] 10.8 53.69; 53.28 0.41 4.68 0.05 4.68
rRNA 1J5A 688!L:816!L A:U rH_1 [tWH][XXIV] 10.34 10.35; 38.24 27.9 107.47 0.61 23.13
rRNA 1J5A 689!L:2421!L A:C pS(bs:O2-O2*) [---][-] 4.97 143.72; 102.28 41.44 -8.69 1.44 11.66
rRNA 1J5A 689!L:815!L A:A rWb* [tWW][I] 13.87 39.01; 13.87 25.14 115.25 0.15 42.49
rRNA 1J5A 690!L:2054!L A:A rS(sp:O2*-O1P) [---][-] 7.44 156.81; 114.22 42.59 150.7 1.64 35.38
rRNA 1J5A 690!L:813!L A:A rWb* [tWW][I] 13.46 29.51; 37.76 8.25 122.91 1.0 41.36
rRNA 1J5A 691!L:812!L C:G WC [cWW][XIX] 10.75 53.66; 54.08 0.42 -3.15 0.59 11.65
rRNA 1J5A 692!L:811!L C:G WC [cWW][XIX] 10.73 55.02; 54.77 0.25 -2.92 0.3 7.42
rRNA 1J5A 693!L:810!L A:U WC [cWW][XX] 10.55 55.24; 55.42 0.18 -8.85 0.14 17.2
rRNA 1J5A 694!L:809!L G:C WC [cWW][XIX] 10.77 53.54; 53.77 0.23 -9.13 0.0 15.66
rRNA 1J5A 695!L:808!L G:C WC [cWW][XIX] 10.79 52.58; 52.73 0.15 -17.89 0.53 16.79
rRNA 1J5A 696!L:807!L U:A WC [cWW][XX] 10.96 48.2; 50.8 2.6 -24.19 0.81 20.88
rRNA 1J5A 700!L:788!L C:G WC [cWW][XIX] 10.61 45.92; 54.68 8.75 -16.0 0.82 39.05
rRNA 1J5A 701!L:799!L U:C rpS(ss:O2*-O2*)_1 [---][-] 5.11 116.98; 146.37 29.38 -22.73 1.55 12.94
rRNA 1J5A 702!L:792!L A:U rS(sb:O2*-N3) [---][-] 4.87 92.58; 119.94 27.35 -148.94 1.03 28.92
rRNA 1J5A 702!L:786!L A:U WC [cWW][XX] 11.01 51.84; 50.93 0.92 -3.63 0.12 8.99
rRNA 1J5A 703!L:785!L A:U WC [cWW][XX] 10.69 54.09; 53.4 0.69 -9.86 0.18 16.56
rRNA 1J5A 704!L:784!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.52 46.48; 71.93 25.45 -8.65 0.33 14.1
rRNA 1J5A 705!L:1367!L C:A rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.63 101.35; 162.42 61.07 -33.42 0.31 20.51
rRNA 1J5A 705!L:783!L C:G WC [cWW][XIX] 10.73 54.53; 54.73 0.2 -7.95 0.13 17.13
rRNA 1J5A 706!L:1366!L A:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.94 158.32; 96.84 61.47 -52.75 0.35 25.64
rRNA 1J5A 706!L:782!L A:U WC [cWW][XX] 10.71 54.32; 52.97 1.35 -10.18 0.58 19.28
rRNA 1J5A 707!L:781!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.67 63.71; 49.02 14.69 -12.9 0.1 17.48
rRNA 1J5A 708!L:780!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.31 48.27; 71.81 23.55 -1.92 0.47 8.11
rRNA 1J5A 709!L:779!L A:U WC [cWW][XX] 10.38 57.16; 56.72 0.44 -6.59 0.19 20.06
rRNA 1J5A 710!L:778!L C:G WC [cWW][XIX] 10.79 53.61; 51.94 1.67 -7.98 0.37 14.43
rRNA 1J5A 712!L:746!L A:G S [tSH][XI] 9.25 1.82; 97.59 95.78 -64.85 0.68 7.31
rRNA 1J5A 713!L:1649!L G:A rpS(sb:O2*-N3) [---][-] 6.03 149.86; 88.79 61.06 -86.46 1.1 30.25
rRNA 1J5A 713!L:745!L G:C WC [cWW][XIX] 10.62 55.22; 54.72 0.5 9.6 1.07 1.06
rRNA 1J5A 714!L:744!L G:C WC [cWW][XIX] 10.59 55.77; 56.05 0.28 -4.77 0.26 21.95
rRNA 1J5A 715!L:743!L U:A WC [cWW][XX] 10.53 56.23; 55.45 0.78 -11.22 0.35 16.48
rRNA 1J5A 716!L:741!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.37 67.19; 51.89 15.3 -8.71 0.7 16.1
rRNA 1J5A 718!L:739!L A:G S(sb:O2*-N6)_2 [---][-] 7.89 9.79; 125.22 115.42 -132.3 0.51 7.1
rRNA 1J5A 719!L:738!L A:G S [tSH][XI] 9.93 5.19; 91.17 85.98 30.75 0.29 21.11
rRNA 1J5A 720!L:738!L A:G S_Mo [tSH][XI] 8.88 37.55; 115.91 78.36 -24.86 1.69 10.79
rRNA 1J5A 720!L:737!L A:C sWb [---][-] 11.11 26.98; 91.18 64.2 -2.63 0.18 25.82
rRNA 1J5A 721!L:736!L C:G WC [cWW][XIX] 10.72 53.19; 54.25 1.06 -10.91 0.5 27.22
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rRNA 1J5A 740!L:1445!L A:A rS(sp:O2*-O1P) [---][-] 9.5 99.83; 136.65 36.82 125.81 0.02 81.06
rRNA 1J5A 742!L:1765!L G:C WC [cWW][XIX] 10.38 56.29; 56.18 0.11 -0.63 0.03 42.4
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rRNA 1J5A 754!L:1693!L G:A S(sp:O2*-O1P)_1 [---][-] 9.98 115.62; 106.53 9.09 -140.63 0.97 40.0
rRNA 1J5A 754!L:769!L G:C WC [cWW][XIX] 10.76 51.9; 53.95 2.05 11.2 0.05 17.2
rRNA 1J5A 755!L:768!L C:U WC_mo [cWW][XVIII] 11.94 44.19; 42.73 1.46 12.02 1.22 5.57
rRNA 1J5A 756!L:767!L C:G WC [cWW][XIX] 10.84 53.48; 53.25 0.23 -4.2 0.01 9.13
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rRNA 1J5A 758!L:763!L G:A fS [tSW][X] 9.51 109.88; 7.46 102.42 100.09 0.88 34.78
rRNA 1J5A 760!L:1997!L U:A pfS* [cWS][-] 5.8 67.37; 136.61 69.24 20.98 0.07 15.29
rRNA 1J5A 762!L:1633!L A:C rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 5.93 157.37; 145.86 11.51 13.96 0.28 57.92
rRNA 1J5A 771!L:1964!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.74 148.65; 100.05 48.6 18.86 1.0 25.33
rRNA 1J5A 777!L:1766!L A:U H_1 [cWH][XXIII] 9.79 29.1; 57.51 28.41 20.27 1.01 10.03
rRNA 1J5A 783!L:1367!L G:A rS [tSS][-] 8.1 85.59; 62.62 22.97 177.16 0.49 6.69
rRNA 1J5A 784!L:1368!L U:G rS(ss:O2*-O2*)_2 [---][-] 5.2 171.63; 145.45 26.18 -111.04 1.7 32.38
rRNA 1J5A 786!L:791!L U:G rpS(bs:O2-O2*) [---][-] 6.36 96.45; 163.61 67.16 -54.82 0.85 29.97
rRNA 1J5A 790!L:800!L A:U WC [cWW][XX] 10.62 56.68; 55.57 1.11 -1.4 0.15 9.52
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rRNA 1J5A 794!L:1767!L A:G rS [tSS][-] 9.08 57.19; 85.99 28.8 161.81 1.12 24.66
rRNA 1J5A 797!L:2055!L A:G S(sb:O2*-N6)_3 [---][-] 9.59 7.97; 146.06 138.09 114.53 0.5 6.67
rRNA 1J5A 819!L:2423!L C:G rS(bs:O2-O2*) [---][-] 6.11 103.28; 115.53 12.25 -178.45 1.98 15.18
rRNA 1J5A 821!L:1267!L A:A rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 5.22 117.83; 153.26 35.44 -11.36 1.48 30.27
rRNA 1J5A 825!L:1264!L C:C rS(ps:O1P-O2*) [---][-] 9.66 119.11; 122.41 3.3 37.75 0.87 73.81
rRNA 1J5A 825!L:1239!L C:A rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.78 106.15; 149.88 43.73 -52.84 1.3 26.11
rRNA 1J5A 825!L:1209!L C:G WC [cWW][XIX] 10.6 55.68; 54.93 0.75 -1.98 0.88 19.82
rRNA 1J5A 826!L:1238!L U:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.27 149.91; 94.18 55.73 -57.43 0.58 51.56
rRNA 1J5A 826!L:1208!L U:A WC [cWW][XX] 10.54 56.33; 55.6 0.73 -5.51 0.25 9.76
rRNA 1J5A 827!L:1207!L C:G WC [cWW][XIX] 10.67 55.63; 54.37 1.26 1.61 0.52 20.45
rRNA 1J5A 828!L:1206!L C:G WC [cWW][XIX] 10.61 55.74; 54.19 1.55 5.73 0.36 16.59
rRNA 1J5A 829!L:1205!L C:G WC [cWW][XIX] 10.65 52.51; 54.19 1.68 10.81 0.74 8.44
rRNA 1J5A 830!L:1204!L C:G WC [cWW][XIX] 10.57 55.73; 55.09 0.64 1.12 0.71 10.18
rRNA 1J5A 830!L:852!L C:U rpS(ps:O1P-O2*)_1 [---][-] 6.85 100.88; 130.79 29.91 152.38 0.04 52.61
rRNA 1J5A 831!L:1203!L G:A S [tSH][XI] 10.33 88.25; 7.22 81.03 79.95 0.68 29.68
rRNA 1J5A 832!L:1202!L A:U rH_1 [tWH][XXIV] 9.16 35.5; 23.42 12.08 -150.04 2.42 58.02
rRNA 1J5A 832!L:953!L A:G rS [tSS][-] 7.53 65.7; 100.21 34.51 140.06 0.83 48.37
rRNA 1J5A 832!L:850!L A:C rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 6.07 135.59; 106.07 29.52 -68.74 1.78 38.26
rRNA 1J5A 833!L:954!L A:U rS(sb:O2*-N3) [---][-] 4.95 108.5; 139.33 30.82 -169.22 0.28 44.86
rRNA 1J5A 834!L:983!L A:G S [tSH][XI] 9.85 9.91; 95.04 85.13 57.01 0.67 12.3
rRNA 1J5A 835!L:848!L U:A WC [cWW][XX] 10.89 53.77; 61.79 8.02 -5.3 0.25 22.48
rRNA 1J5A 836!L:847!L G:C WC [cWW][XIX] 10.88 61.46; 52.7 8.75 4.1 0.42 14.32
rRNA 1J5A 837!L:846!L U:A WC [cWW][XX] 10.61 63.16; 48.17 15.0 -0.09 0.51 7.61
rRNA 1J5A 838!L:845!L A:U WC [cWW][XX] 10.26 63.12; 55.01 8.11 0.82 0.4 12.48
rRNA 1J5A 839!L:844!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.34 69.32; 39.7 29.62 -0.6 0.2 12.34
rRNA 1J5A 843!L:2424!L G:G pfS_1 [cSW][-] 9.58 49.18; 129.1 79.92 -19.13 0.2 15.04
rRNA 1J5A 849!L:954!L G:U sWb [---][-] 10.89 29.87; 74.34 44.47 -16.47 0.41 29.61
rRNA 1J5A 850!L:953!L C:G WC [cWW][XIX] 9.97 57.94; 62.79 4.84 -10.77 1.24 10.4
rRNA 1J5A 850!L:952!L C:A WC [---][-] 11.04 47.29; 38.8 8.49 19.72 0.87 18.87
rRNA 1J5A 851!L:951!L C:G WC [cWW][XIX] 10.84 52.3; 52.94 0.64 11.52 0.75 6.33
rRNA 1J5A 852!L:950!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.73 64.35; 38.3 26.05 4.84 0.9 7.05
rRNA 1J5A 853!L:949!L C:G WC [cWW][XIX] 10.73 54.81; 54.87 0.06 0.52 0.0 5.43
rRNA 1J5A 854!L:948!L G:C WC [cWW][XIX] 10.67 55.14; 55.25 0.11 -1.88 0.57 9.85
rRNA 1J5A 855!L:947!L G:C WC [cWW][XIX] 10.73 54.25; 54.66 0.4 -1.77 0.45 7.87
rRNA 1J5A 856!L:946!L A:U WC [cWW][XX] 10.58 55.39; 54.76 0.63 -3.61 0.16 12.58
rRNA 1J5A 857!L:945!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.61 66.32; 45.52 20.8 -5.3 0.03 10.01
rRNA 1J5A 859!L:860!L U:U pS [cSH][-] 5.64 156.28; 42.36 113.92 -70.9 0.94 87.56
rRNA 1J5A 862!L:941!L A:U sWC [---][-] 10.32 35.42; 101.76 66.33 -16.78 0.34 24.36
rRNA 1J5A 864!L:938!L C:G WC [cWW][XIX] 10.89 50.74; 49.46 1.28 -29.55 0.09 30.31
rRNA 1J5A 865!L:937!L A:C WC [---][-] 10.25 58.48; 61.3 2.82 -21.97 0.88 19.72
rRNA 1J5A 866!L:936!L U:A WC [cWW][XX] 10.49 54.89; 56.59 1.69 -12.26 0.32 18.76
rRNA 1J5A 867!L:935!L G:C WC [cWW][XIX] 10.71 54.51; 54.76 0.26 1.17 0.53 8.13
rRNA 1J5A 868!L:934!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.98 69.02; 39.67 29.34 3.8 0.22 7.76
rRNA 1J5A 869!L:933!L C:G WC [cWW][XIX] 10.52 55.85; 54.95 0.9 -1.3 0.55 18.38
rRNA 1J5A 870!L:932!L C:G WC [cWW][XIX] 10.75 54.0; 53.88 0.12 -11.22 0.06 17.68
rRNA 1J5A 873!L:930!L U:A Wb*_PSU [---][-] 10.19 37.9; 50.77 12.87 -129.14 0.47 38.47
rRNA 1J5A 874!L:928!L A:G S [tSH][XI] 10.28 11.49; 88.65 77.16 -86.41 0.51 24.0
rRNA 1J5A 875!L:927!L G:C WC [cWW][XIX] 10.88 53.4; 52.92 0.48 -10.36 0.09 15.0
rRNA 1J5A 876!L:925!L A:U WC [cWW][XX] 10.01 58.7; 60.19 1.49 -13.6 0.63 11.45
rRNA 1J5A 877!L:924!L G:C WC [cWW][XIX] 10.81 52.57; 50.88 1.69 -19.9 0.43 27.82
rRNA 1J5A 878!L:921!L C:A rH_1 [rWH][XXV] 11.72 29.01; 3.4 25.61 128.78 0.02 8.03
rRNA 1J5A 878!L:920!L C:G rH_1 [tWH][-] 10.77 16.59; 21.4 4.81 -134.64 2.12 6.26
rRNA 1J5A 878!L:880!L C:C pS [cSH][-] 8.73 112.5; 24.26 88.24 -20.18 0.6 48.44
rRNA 1J5A 880!L:924!L C:C pfS [cSW][-] 7.7 41.92; 136.51 94.59 -21.73 0.81 29.77
rRNA 1J5A 881!L:921!L U:A WC [cWW][XX] 10.58 55.05; 56.09 1.03 -4.44 0.23 12.52
rRNA 1J5A 882!L:920!L C:G WC [cWW][XIX] 10.85 52.48; 52.34 0.14 -4.93 0.43 11.85
rRNA 1J5A 883!L:919!L A:U WC [cWW][XX] 10.44 56.29; 56.17 0.11 -4.4 0.33 12.27
rRNA 1J5A 885!L:917!L A:U WC [cWW][XX] 9.75 60.67; 62.9 2.23 5.8 0.84 20.85
rRNA 1J5A 886!L:916!L A:U WC [cWW][XX] 10.47 55.73; 55.84 0.11 14.25 0.01 17.72
rRNA 1J5A 887!L:915!L G:C WC [cWW][XIX] 10.11 58.39; 59.72 1.33 -0.31 0.47 31.78
rRNA 1J5A 888!L:914!L G:C WC [cWW][XIX] 10.27 57.35; 55.57 1.78 -5.97 1.29 38.52
rRNA 1J5A 890!L:911!L U:A S [tSH][-] 9.03 107.21; 7.89 99.32 -32.8 0.6 16.91
rRNA 1J5A 922!L:2243!L A:C rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.29 100.14; 152.22 52.08 -75.22 1.22 24.69
rRNA 1J5A 923!L:2256!L A:G rS [tSS][-] 8.38 53.95; 86.47 32.52 -177.97 1.07 13.86
rRNA 1J5A 957!L:982!L G:C WC [cWW][XIX] 10.53 54.49; 55.04 0.55 1.82 1.03 8.77
rRNA 1J5A 958!L:981!L G:C WC [cWW][XIX] 10.36 55.73; 58.37 2.64 -4.71 0.02 30.31
rRNA 1J5A 959!L:980!L C:G WC [cWW][XIX] 10.75 53.53; 53.29 0.24 0.26 0.64 7.14
rRNA 1J5A 960!L:979!L U:A WC [cWW][XX] 10.6 54.74; 55.13 0.38 2.08 0.05 8.88
rRNA 1J5A 961!L:978!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.59 42.84; 76.8 33.96 -5.06 0.06 10.21
rRNA 1J5A 962!L:977!L C:G WC [cWW][XIX] 10.65 55.52; 54.9 0.62 -5.66 0.05 20.08
rRNA 1J5A 963!L:976!L G:C WC [cWW][XIX] 10.63 55.55; 56.48 0.93 -0.09 0.78 22.44
rRNA 1J5A 964!L:975!L A:C Wb [cWW][-] 10.71 41.47; 65.66 24.18 6.1 0.09 4.24
rRNA 1J5A 965!L:2253!L G:A rS [tSS][-] 8.31 91.59; 50.95 40.64 -150.53 0.92 42.39
rRNA 1J5A 965!L:974!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.68 44.25; 63.92 19.67 -3.36 0.72 18.33
rRNA 1J5A 966!L:973!L A:U WC [cWW][XX] 10.49 56.26; 56.37 0.1 3.04 0.02 7.1
rRNA 1J5A 967!L:970!L G:A S(sb:O2*-N7) [---][-] 7.49 91.47; 24.52 66.95 -153.05 1.4 39.39
rRNA 1J5A 970!L:2436!L A:U rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.61 96.96; 159.32 62.36 -90.34 0.25 39.55
rRNA 1J5A 971!L:2474!L A:G rS [tSS][-] 8.89 63.24; 78.85 15.62 166.47 1.81 20.96
rRNA 1J5A 971!L:2435!L A:C rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 5.59 154.7; 106.78 47.93 -38.98 1.61 37.96
rRNA 1J5A 973!L:2475!L U:C rS(ss:O2*-O2*) [---][-] 5.12 153.04; 172.33 19.29 -46.64 2.13 33.02
rRNA 1J5A 975!L:2252!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.91 144.54; 95.32 49.22 -62.75 1.04 41.96
rRNA 1J5A 976!L:2251!L C:U rpS(bs:O2-O2*) [---][-] 6.24 149.73; 107.24 42.48 -66.3 2.54 7.77
rRNA 1J5A 982!L:994!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.64 165.7; 83.86 81.84 -47.62 0.72 53.4
rRNA 1J5A 983!L:985!L G:G H_1_Mo [cWH][VI] 10.87 52.45; 79.82 27.38 5.56 1.44 36.16
rRNA 1J5A 987!L:998!L G:C WC [cWW][XIX] 10.8 52.69; 53.69 1.0 0.03 0.1 8.5
rRNA 1J5A 988!L:1012!L G:A rS [tSS][-] 8.17 85.78; 61.3 24.49 -178.07 0.05 23.78
rRNA 1J5A 988!L:997!L G:C WC [cWW][XIX] 10.71 53.67; 54.5 0.83 3.1 0.36 9.96
rRNA 1J5A 989!L:996!L G:C WC [cWW][XIX] 10.78 53.33; 53.09 0.24 7.39 0.02 14.56
rRNA 1J5A 991!L:2020!L A:G pfS_1 [---][-] 5.79 81.68; 150.14 68.46 -26.85 0.65 47.99
rRNA 1J5A 992!L:2019!L A:C rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.73 167.03; 89.52 77.5 -27.37 0.87 6.87
rRNA 1J5A 992!L:2010!L A:G rS [tSS][-] 8.06 64.82; 89.76 24.94 165.45 0.69 15.0
rRNA 1J5A 997!L:1012!L C:A rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 5.85 103.02; 158.25 55.24 -27.04 0.92 25.62
rRNA 1J5A 998!L:1011!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.64 150.3; 93.5 56.8 -67.75 0.17 34.39
rRNA 1J5A 1002!L:1175!L C:A WC [---][-] 10.08 55.77; 67.58 11.8 -10.97 0.45 23.7
rRNA 1J5A 1003!L:1174!L* C:G WC [cWW][XIX]; Wb* [---][-] 10.68 53.41; 65.94 12.53 9.04 0.72 9.19
rRNA 1J5A 1005!L:1171!L U:A WC [cWW][XX] 10.65 53.86; 53.34 0.52 -17.8 0.32 17.24
rRNA 1J5A 1007!L:1170!L A:U WC [cWW][XX] 10.23 59.57; 58.52 1.05 -7.76 0.05 11.6
rRNA 1J5A 1008!L:1169!L G:C WC [cWW][XIX] 10.73 54.12; 51.9 2.22 -10.03 0.86 25.93
rRNA 1J5A 1009!L:1168!L C:G WC [cWW][XIX] 10.76 52.95; 52.23 0.71 -7.47 0.84 20.66
rRNA 1J5A 1011!L:1165!L A:G S(bp:N1-O2P)_1 [---][-] 9.19 15.0; 64.73 49.73 106.12 0.49 50.27
rRNA 1J5A 1012!L:1165!L A:G S [tSH][XI] 9.84 10.82; 96.27 85.45 -21.34 1.16 30.75
rRNA 1J5A 1013!L:1164!L G:C WC [cWW][XIX] 10.76 53.93; 54.23 0.3 -7.76 0.04 13.32
rRNA 1J5A 1014!L:1163!L G:C WC [cWW][XIX] 10.57 56.04; 56.67 0.63 -5.75 0.17 23.55
rRNA 1J5A 1014!L:1021!L G:A rS [tSS][-] 7.69 86.95; 55.77 31.18 162.63 0.08 40.54
rRNA 1J5A 1015!L:1162!L U:A WC [cWW][XX] 10.77 53.2; 53.54 0.34 -7.78 0.37 16.62
rRNA 1J5A 1016!L:1148!L C:G Wb [---][-] 10.28 63.17; 50.56 12.61 -3.14 0.28 11.99
rRNA 1J5A 1017!L:1147!L C:G WC [cWW][XIX] 10.46 53.29; 58.11 4.81 -2.33 1.33 16.25
rRNA 1J5A 1018!L:1146!L C:G Wb [---][-] 10.49 61.92; 46.2 15.73 10.39 0.07 12.74
rRNA 1J5A 1020!L:1164!L A:C rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 6.32 82.89; 142.65 59.76 -46.88 1.08 55.35
rRNA 1J5A 1022!L:1161!L A:U WC [cWW][XX] 10.37 57.48; 56.22 1.26 7.19 0.19 14.53
rRNA 1J5A 1024!L:1160!L G:C WC [cWW][XIX] 10.78 54.24; 54.23 0.01 -2.63 0.15 5.94
rRNA 1J5A 1025!L:1159!L A:U WC [cWW][XX] 10.3 57.67; 58.25 0.58 3.64 0.58 6.63
rRNA 1J5A 1026!L:1158!L U:A WC [cWW][XX] 10.27 58.36; 58.23 0.12 10.89 0.11 13.69
rRNA 1J5A 1027!L:1157!L C:G WC [cWW][XIX] 10.68 54.51; 54.3 0.21 7.34 0.87 2.76
rRNA 1J5A 1028!L:1156!L G:U WC_Mo [---][-] 10.69 59.4; 72.28 12.88 -16.03 0.62 14.95
rRNA 1J5A 1029!L:1153!L C:A WC [---][-] 11.3 37.04; 50.42 13.39 19.79 1.4 8.93
rRNA 1J5A 1029!L:1131!L C:G rpS(sb:O2*-N2)_2 [---][-] 8.13 169.74; 98.77 70.98 148.99 0.11 77.69
rRNA 1J5A 1030!L:1153!L U:A WC [cWW][XX] 9.65 50.03; 66.94 16.92 -11.57 2.68 14.96
rRNA 1J5A 1030!L:1131!L U:G fS(pb:O1P-N2)_2 [---][-] 10.26 120.71; 80.29 40.42 -111.27 1.44 84.13
rRNA 1J5A 1033!L:1034!L G:U pS* [cHS][-] 5.73 152.61; 57.64 94.97 -22.14 0.37 10.54
rRNA 1J5A 1035!L:1155!L* G:G rS(sb:O2*-N3) [---][-]; rpS(sb:O2*-N3) [---][-] 6.09 97.99; 139.97 41.97 -125.18 2.58 61.23
rRNA 1J5A 1035!L:1150!L G:C WC [cWW][XIX] 10.81 51.26; 49.53 1.74 16.58 1.24 10.1
rRNA 1J5A 1039!L:2465!L A:G pfS(sb:O2*-N3) [---][-] 6.03 97.91; 131.71 33.8 -62.84 1.01 32.31
rRNA 1J5A 1039!L:1137!L A:A rS* [tHH][-] 9.83 23.9; 36.69 12.8 -50.45 1.37 60.41
rRNA 1J5A 1040!L:2444!L A:C fS(sb:O2*-N1)_1 [tSS][-] 9.11 45.42; 96.85 51.43 -164.5 0.2 21.98
rRNA 1J5A 1040!L:1136!L A:G S [tSH][XI] 10.17 1.6; 89.76 88.15 -123.92 0.01 6.79
rRNA 1J5A 1041!L:1135!L G:C WC [cWW][XIX] 10.77 54.19; 54.09 0.1 2.22 0.25 6.62
rRNA 1J5A 1042!L:1134!L G:C WC [cWW][XIX] 10.75 52.26; 54.21 1.95 -1.09 0.08 17.99
rRNA 1J5A 1043!L:1133!L A:G Wb [---][-] 12.94 51.71; 60.47 8.76 3.78 1.2 6.07
rRNA 1J5A 1045!L:1132!L G:C WC [cWW][XIX] 10.61 54.75; 55.87 1.12 1.11 0.87 8.24
rRNA 1J5A 1046!L:1131!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.51 72.08; 39.0 33.09 -3.1 0.53 19.14
rRNA 1J5A 1047!L:1130!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.69 43.12; 54.03 10.91 10.27 0.8 23.35
rRNA 1J5A 1048!L:1130!L U:U Wb [cWW][XVI] 7.98 56.56; 72.52 15.95 -12.08 0.62 16.44
rRNA 1J5A 1048!L:1129!L U:A WC [cWW][XX] 10.3 56.67; 56.37 0.29 6.04 1.11 9.12
rRNA 1J5A 1050!L:1127!L G:C WC [cWW][XIX] 10.5 53.28; 54.64 1.36 -6.34 0.69 38.44
rRNA 1J5A 1051!L:1126!L U:A WC [cWW][XX] 10.34 56.6; 56.9 0.3 -3.02 0.91 15.65
rRNA 1J5A 1054!L:1123!L C:G WC [cWW][XIX] 10.26 58.29; 56.78 1.51 6.65 1.12 17.07
rRNA 1J5A 1063!L:1118!L C:G WC [cWW][XIX] 10.01 60.71; 58.22 2.49 -1.17 0.99 25.86
rRNA 1J5A 1064!L:1117!L C:G WC [cWW][XIX] 10.14 58.26; 55.0 3.25 -11.72 0.78 28.27
rRNA 1J5A 1065!L:1116!L A:U WC [cWW][XX] 10.43 55.86; 56.52 0.66 -5.68 0.55 12.53
rRNA 1J5A 1066!L:1115!L G:C WC [cWW][XIX] 10.64 54.75; 55.21 0.46 0.46 0.51 11.61
rRNA 1J5A 1066!L:1096!L G:A rS [tSS][-] 8.0 83.25; 63.9 19.35 -177.44 0.17 11.59
rRNA 1J5A 1067!L:1113!L G:C S*(pb:O2P-N1) [---][-] 10.95 52.01; 27.49 24.52 97.69 1.84 65.55
rRNA 1J5A 1068!L:1092!L A:U WC [cWW][XX] 9.99 58.47; 59.49 1.02 -11.68 0.6 31.27
rRNA 1J5A 1069!L:1091!L G:C WC [cWW][XIX] 10.67 53.99; 54.96 0.97 8.29 0.03 18.33
rRNA 1J5A 1070!L:1090!L G:C WC [cWW][XIX] 10.8 53.39; 53.01 0.37 12.55 0.66 7.7
rRNA 1J5A 1073!L:1087!L G:C WC [cWW][XIX] 10.89 51.33; 52.51 1.18 -1.09 0.58 14.76
rRNA 1J5A 1074!L:1086!L G:C WC [cWW][XIX] 10.43 56.1; 56.16 0.06 -0.82 1.03 13.46
rRNA 1J5A 1075!L:1085!L C:G WC [cWW][XIX] 10.73 52.81; 54.43 1.62 11.41 0.17 12.64
rRNA 1J5A 1076!L:1084!L U:A sWC [---][-] 11.7 69.91; 22.3 47.61 8.83 0.37 11.08
rRNA 1J5A 1079!L:1081!L G:A S(sb:O2*-N6)_3 [---][-] 9.56 114.7; 19.7 95.0 -150.51 1.94 76.7
rRNA 1J5A 1082!L:1103!L G:C srWC* [---][-] 12.37 45.02; 24.4 20.62 -23.59 1.2 65.77
rRNA 1J5A 1082!L:1101!L G:U rH*_2 [tHW][-] 11.17 92.59; 44.95 47.65 -32.09 2.51 41.58
rRNA 1J5A 1094!L:1096!L C:A S(sb:O2*-N7) [---][-] 6.88 76.67; 34.47 42.2 -164.87 2.17 30.42
rRNA 1J5A 1096!L:1115!L A:C rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.28 168.21; 101.6 66.61 -19.92 0.2 13.03
rRNA 1J5A 1098!L:1113!L G:C WC [cWW][XIX] 10.21 56.73; 55.11 1.62 -8.59 1.95 53.08
rRNA 1J5A 1102!L:1111!L G:C WC [cWW][XIX] 9.91 58.51; 58.52 0.01 7.84 1.31 14.9
rRNA 1J5A 1103!L:1110!L C:G WC [cWW][XIX] 10.65 53.0; 54.52 1.52 17.33 0.76 32.58
rRNA 1J5A 1104!L:1109!L G:A S(bp:N2-O2P)_2 [---][-] 10.34 101.9; 14.62 87.28 -176.0 0.11 10.66
rRNA 1J5A 1138!L:2467!L A:A pS [cSH][-] 8.11 22.56; 138.07 115.51 -17.17 0.66 46.82
rRNA 1J5A 1140!L:2494!L A:C rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.5 152.11; 105.67 46.44 -42.09 2.05 21.21
rRNA 1J5A 1145!L:1148!L C:G rH_1 [tWH][-] 10.75 8.98; 37.31 28.34 -158.79 0.88 7.36
rRNA 1J5A 1177!L:1198!L U:C pfS*_1 [cWS][-] 6.18 64.39; 125.35 60.96 -35.59 2.4 42.21
rRNA 1J5A 1177!L:1197!L U:U Wb [cWW][XVI] 9.15 48.5; 68.68 20.17 -31.17 0.25 50.21
rRNA 1J5A 1178!L:1196!L C:G WC [cWW][XIX] 10.53 55.79; 55.82 0.03 -9.03 0.57 19.57
rRNA 1J5A 1179!L:1195!L A:U WC [cWW][XX] 10.52 56.21; 55.51 0.71 0.5 0.66 17.83
rRNA 1J5A 1180!L:1194!L A:U WC [cWW][XX] 10.57 55.43; 55.55 0.11 -3.78 0.29 9.09
rRNA 1J5A 1181!L:1193!L C:G WC [cWW][XIX] 10.49 56.55; 56.51 0.04 -8.58 0.11 29.09
rRNA 1J5A 1183!L:1191!L C:G WC [cWW][XIX] 11.12 47.02; 37.41 9.61 24.94 0.29 26.31
rRNA 1J5A 1184!L:1190!L G:C WC [cWW][XIX] 10.79 52.42; 52.61 0.19 -18.4 0.65 14.49
rRNA 1J5A 1185!L:1189!L C:G WC [cWW][XIX] 10.28 49.83; 55.55 5.72 -17.99 1.22 47.91
rRNA 1J5A 1209!L:1239!L G:A rS [tSS][-] 8.36 87.17; 62.46 24.72 168.52 0.59 22.12
rRNA 1J5A 1210!L:1263!L C:G WC [cWW][XIX] 10.65 54.19; 54.61 0.42 -8.44 0.73 29.33
rRNA 1J5A 1212!L:1260!L U:A WC [cWW][XX] 10.49 54.45; 56.65 2.2 -14.54 0.69 36.45
rRNA 1J5A 1213!L:1259!L U:A Wb* [---][-] 10.72 47.04; 64.78 17.74 -5.98 0.55 20.83
rRNA 1J5A 1214!L:1258!L C:G WC [cWW][XIX] 10.59 55.36; 55.22 0.14 -5.28 0.02 24.52
rRNA 1J5A 1215!L:1257!L A:U WC [cWW][XX] 10.58 60.19; 60.94 0.75 -7.16 0.36 15.43
rRNA 1J5A 1216!L:1256!L G:C WC [cWW][XIX] 10.85 52.46; 52.7 0.24 9.43 0.48 7.09
rRNA 1J5A 1217!L:1255!L U:A WC [cWW][XX] 11.36 55.93; 50.81 5.12 5.53 0.87 10.32
rRNA 1J5A 1218!L:1254!L C:G WC [cWW][XIX] 10.89 52.72; 51.72 1.0 -7.37 0.03 10.62
rRNA 1J5A 1220!L:1252!L G:C WC [cWW][XIX] 10.67 54.07; 55.43 1.35 8.81 0.9 1.54
rRNA 1J5A 1221!L:1251!L C:G WC [cWW][XIX] 10.42 55.12; 54.43 0.69 10.52 1.01 14.44
rRNA 1J5A 1222!L:1225!L G:G rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 5.43 152.32; 169.35 17.03 52.14 2.12 30.31
rRNA 1J5A 1222!L:1223!L G:G pS_1 [cSH][-] 7.49 113.76; 55.83 57.93 -37.56 2.15 34.4
rRNA 1J5A 1223!L:1225!L G:G rpS [cSS][-] 4.7 93.69; 77.6 16.08 154.88 1.47 33.31
rRNA 1J5A 1226!L:1252!L A:C rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 5.29 142.15; 120.95 21.2 -108.88 1.64 51.57
rRNA 1J5A 1226!L:1251!L A:G rS(sb:O2*-N3) [---][-] 4.57 101.04; 113.84 12.79 -142.14 1.7 49.39
rRNA 1J5A 1226!L:1249!L A:G S [tSH][XI] 8.62 8.36; 99.63 91.28 -113.29 0.68 19.88
rRNA 1J5A 1227!L:1248!L A:G S [tSH][XI] 9.6 6.65; 99.11 92.46 -18.6 0.52 13.23
rRNA 1J5A 1228!L:1247!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.48 43.97; 72.08 28.11 -0.47 0.7 14.34
rRNA 1J5A 1229!L:1246!L C:G WC [cWW][XIX] 10.6 55.47; 55.08 0.38 -1.34 0.37 18.71
rRNA 1J5A 1230!L:1245!L C:G WC [cWW][XIX] 10.61 55.21; 55.4 0.19 -0.13 0.09 12.62
rRNA 1J5A 1231!L:1244!L A:U WC [cWW][XX] 10.52 56.58; 55.98 0.6 3.47 0.42 9.66
rRNA 1J5A 1232!L:1243!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.46 74.96; 35.17 39.79 2.03 0.34 9.46
rRNA 1J5A 1234!L:1241!L C:G WC [cWW][XIX] 10.78 54.3; 53.53 0.77 -8.43 0.19 12.02
rRNA 1J5A 1235!L:1240!L C:G WC [cWW][XIX] 10.69 55.04; 54.42 0.63 -3.04 0.23 10.15
rRNA 1J5A 1236!L:1239!L G:A S [tSH][XI] 10.56 77.11; 22.24 54.88 -154.15 1.12 27.95
rRNA 1J5A 1275!L:2001!L A:G fS [tSW][X] 10.05 15.17; 99.39 84.22 -165.79 0.69 17.91
rRNA 1J5A 1276!L:1999!L U:U Wb [cWW][XVI] 8.93 40.28; 63.67 23.39 9.39 1.62 12.82
rRNA 1J5A 1277!L:1998!L G:A S [tSH][XI] 9.33 94.68; 4.63 90.06 -11.84 1.7 43.87
rRNA 1J5A 1278!L:1997!L A:A rS* [tHH][-] 10.99 18.32; 15.61 2.71 -95.32 2.05 38.36
rRNA 1J5A 1279!L:1996!L G:A S(bp:N2-O2P)_3 [---][-] 11.34 99.79; 39.32 60.47 -155.87 1.61 9.52
rRNA 1J5A 1279!L:1280!L G:U pS* [cHS][-] 5.4 159.72; 53.62 106.11 23.84 0.78 14.87
rRNA 1J5A 1280!L:1996!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 9.91 37.23; 14.48 22.75 -136.59 0.52 13.16
rRNA 1J5A 1281!L:1995!L A:G S [tSH][XI] 9.37 8.68; 99.28 90.6 -30.04 0.71 13.87
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rRNA 1J5A 1283!L:1993!L C:G WC [cWW][XIX] 10.47 56.78; 55.91 0.87 -3.43 0.83 16.57
rRNA 1J5A 1284!L:1634!L G:A S(sp:O2*-O1P)_1 [---][-] 8.16 134.6; 47.84 86.76 -160.4 1.66 79.71
rRNA 1J5A 1284!L:1631!L G:C rWb [tWW][XXII] 10.7 32.15; 54.19 22.04 -157.24 1.17 27.42
rRNA 1J5A 1287!L:1661!L A:C fS(sb:O2*-N1)_1 [tSS][-] 8.77 50.13; 98.07 47.94 176.15 0.64 4.05
rRNA 1J5A 1287!L:1309!L A:G rpS [cSS][-] 7.4 130.37; 107.05 23.32 -29.79 0.03 21.67
rRNA 1J5A 1289!L:1307!L A:U WC [cWW][XX] 10.35 55.38; 57.48 2.1 5.43 0.1 21.77
rRNA 1J5A 1290!L:1306!L A:U WC [cWW][XX] 10.49 54.12; 55.8 1.69 13.07 0.3 13.62
rRNA 1J5A 1291!L:1305!L G:C WC [cWW][XIX] 10.84 52.83; 53.12 0.29 9.41 0.48 6.47
rRNA 1J5A 1292!L:1304!L A:U WC [cWW][XX] 10.48 56.65; 56.45 0.2 -2.25 0.52 8.81
rRNA 1J5A 1293!L:1303!L A:U WC [cWW][XX] 10.55 55.27; 54.81 0.46 -11.3 0.02 29.42
rRNA 1J5A 1294!L:1302!L* G:C Wb* [---][-]; Wb* [---][-] 11.04 66.66; 52.1 14.56 -14.54 0.29 25.51
rRNA 1J5A 1296!L:1342!L G:U pfS*_1 [cWS][-] 5.47 147.62; 55.61 92.01 32.93 0.78 9.05
rRNA 1J5A 1300!L:1339!L A:U rWC [tWW][XXI] 10.86 22.79; 54.8 32.01 179.33 0.39 24.12
rRNA 1J5A 1308!L:1662!L C:G WC [cWW][XIX] 10.95 53.43; 59.66 6.23 -21.92 0.86 37.51
rRNA 1J5A 1309!L:1661!L G:C WC [cWW][XIX] 10.65 54.53; 55.34 0.81 -6.76 0.56 17.73
rRNA 1J5A 1310!L:1660!L C:G WC [cWW][XIX] 10.44 56.06; 55.94 0.11 2.79 1.21 9.0
rRNA 1J5A 1310!L:1315!L C:A fS(sb:O2*-N1)_1 [tSS][-] 9.16 101.14; 52.69 48.45 139.13 2.7 45.18
rRNA 1J5A 1311!L:1659!L C:G WC [cWW][XIX] 10.78 53.89; 53.77 0.12 8.11 0.11 8.63
rRNA 1J5A 1312!L:1658!L G:A S [tSH][XI] 9.75 98.36; 10.57 87.79 -90.47 0.53 13.2
rRNA 1J5A 1316!L:1641!L G:C WC [cWW][XIX] 10.76 52.24; 53.71 1.47 4.58 0.14 11.4
rRNA 1J5A 1317!L:1640!L G:C WC [cWW][XIX] 10.41 56.58; 58.27 1.69 1.55 0.55 16.46
rRNA 1J5A 1318!L:1639!L A:U WC [cWW][XX] 10.16 59.19; 59.54 0.34 9.36 0.01 16.47
rRNA 1J5A 1319!L:1638!L C:G WC [cWW][XIX] 10.57 56.1; 54.81 1.29 5.0 1.02 5.61
rRNA 1J5A 1320!L:1622!L* A:G S [tSH][XI]; S(bp:N1-O2P)_1 [---][-] 8.96 12.38; 79.76 67.38 156.29 2.33 25.1
rRNA 1J5A 1321!L:1622!L A:G S [tSH][XI] 9.37 13.41; 101.91 88.51 -47.67 0.51 22.71
rRNA 1J5A 1322!L:1621!L G:C WC [cWW][XIX] 10.76 53.58; 53.57 0.02 3.7 0.64 13.93
rRNA 1J5A 1323!L:1620!L G:C WC [cWW][XIX] 10.88 52.59; 51.83 0.76 -13.02 0.13 13.79
rRNA 1J5A 1327!L:1406!L C:A rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 6.26 101.44; 150.14 48.7 -16.34 0.61 28.25
rRNA 1J5A 1327!L:1351!L C:G WC [cWW][XIX] 10.81 49.73; 52.93 3.2 -19.55 0.74 31.72
rRNA 1J5A 1328!L:1405!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 6.17 144.27; 96.98 47.3 -76.11 2.03 15.51
rRNA 1J5A 1328!L:1350!L C:G WC [cWW][XIX] 10.74 53.98; 53.65 0.33 -8.0 0.07 14.92
rRNA 1J5A 1329!L:1349!L U:A WC [cWW][XX] 10.58 55.35; 55.5 0.15 -4.37 0.18 11.29
rRNA 1J5A 1330!L:1348!L G:C WC [cWW][XIX] 10.76 53.89; 55.01 1.12 -1.68 0.06 3.22
rRNA 1J5A 1331!L:1347!L G:C WC [cWW][XIX] 10.72 53.28; 55.25 1.97 -4.01 0.35 10.37
rRNA 1J5A 1332!L:1346!L G:C WC [cWW][XIX] 10.83 53.05; 49.78 3.27 -14.09 0.66 28.57
rRNA 1J5A 1335!L:1346!L A:C pfS [cSW][-] 9.08 41.92; 128.72 86.8 -17.64 0.02 44.75
rRNA 1J5A 1336!L:1344!L G:C WC [cWW][XIX] 10.94 51.1; 48.46 2.65 -20.16 0.6 16.56
rRNA 1J5A 1337!L:1343!L G:C WC [cWW][XIX] 10.53 56.45; 56.99 0.55 -17.58 0.32 22.96
rRNA 1J5A 1351!L:1406!L G:A rS [tSS][-] 8.59 88.11; 58.31 29.8 171.16 0.2 9.43
rRNA 1J5A 1356!L:1417!L G:C WC [cWW][XIX] 10.88 49.51; 47.75 1.76 -27.55 0.79 22.76
rRNA 1J5A 1356!L:1397!L G:A rS [tSS][-] 8.78 78.99; 73.68 5.31 155.82 1.52 29.33
rRNA 1J5A 1357!L:1416!L U:A WC [cWW][XX] 10.62 50.71; 56.0 5.29 -22.58 0.12 25.71
rRNA 1J5A 1358!L:1617!L C:G WC [cWW][XIX] 10.48 51.73; 56.82 5.09 -22.17 1.47 46.3
rRNA 1J5A 1359!L:1616!L G:C WC [cWW][XIX] 10.31 54.53; 59.03 4.5 10.8 0.43 25.61
rRNA 1J5A 1360!L:1615!L G:C WC [cWW][XIX] 10.44 55.59; 57.25 1.66 4.54 0.07 27.55
rRNA 1J5A 1361!L:1614!L G:C WC [cWW][XIX] 10.61 54.73; 55.75 1.02 1.54 0.66 27.26
rRNA 1J5A 1363!L:1588!L C:A rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 6.69 106.35; 134.72 28.37 -45.93 1.39 40.65
rRNA 1J5A 1363!L:1394!L C:G WC [cWW][XIX] 10.55 55.51; 54.74 0.77 5.56 0.67 16.81
rRNA 1J5A 1364!L:1587!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.41 145.26; 104.92 40.34 -74.16 0.71 51.88
rRNA 1J5A 1364!L:1393!L C:G Wb [---][-] 10.41 65.2; 50.28 14.92 7.01 0.12 8.2
rRNA 1J5A 1365!L:1586!L U:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.54 169.87; 83.32 86.56 -70.07 1.62 39.16
rRNA 1J5A 1365!L:1391!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 9.38 50.69; 11.63 39.06 -166.5 0.27 23.24
rRNA 1J5A 1366!L:1392!L A:U Wb* [---][-] 11.08 56.26; 45.46 10.8 41.66 2.2 61.08
rRNA 1J5A 1366!L:1390!L A:G S(bp:N1-O2P)_1 [---][-] 9.42 17.2; 63.76 46.55 104.0 2.11 20.7
rRNA 1J5A 1367!L:1390!L A:G S [tSH][XI] 9.98 5.29; 93.41 88.12 -6.98 0.97 22.04
rRNA 1J5A 1368!L:1389!L G:C WC [cWW][XIX] 10.48 55.94; 56.3 0.35 -6.97 0.11 19.73
rRNA 1J5A 1369!L:1388!L G:C WC [cWW][XIX] 10.56 55.53; 55.32 0.21 -6.59 0.18 28.08
rRNA 1J5A 1370!L:1387!L U:G sWb [---][-] 10.37 84.22; 40.84 43.39 -5.12 0.53 18.95
rRNA 1J5A 1371!L:1386!L G:A S [tSH][XI] 9.43 98.32; 6.16 92.16 20.53 0.07 9.75
rRNA 1J5A 1373!L:2192!L G:U srWb [---][-] 10.33 45.05; 59.46 14.41 -142.78 1.54 51.94
rRNA 1J5A 1373!L:1384!L G:G S_1 [tSH][-] 11.66 10.14; 85.01 74.87 36.47 0.14 9.14
rRNA 1J5A 1374!L:1383!L G:C WC [cWW][XIX] 10.68 54.78; 55.33 0.56 -5.27 0.52 13.11
rRNA 1J5A 1375!L:1802!L C:A rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 5.64 102.31; 161.74 59.44 -53.17 1.93 48.67
rRNA 1J5A 1375!L:1382!L C:G WC [cWW][XIX] 10.71 54.71; 54.3 0.4 -1.94 0.27 14.15
rRNA 1J5A 1376!L:1800!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.37 142.16; 106.36 35.8 -43.38 0.13 34.86
rRNA 1J5A 1376!L:1381!L C:G WC [cWW][XIX] 10.68 54.17; 54.4 0.23 -2.74 0.29 12.19
rRNA 1J5A 1377!L:1799!L G:A rpS(sb:O2*-N3) [---][-] 6.33 164.84; 58.85 105.99 -147.93 0.66 89.69
rRNA 1J5A 1381!L:1799!L G:A fS [tSW][X] 9.92 106.64; 36.23 70.4 90.02 1.49 81.94
rRNA 1J5A 1382!L:1802!L G:A rS [tSS][-] 8.34 84.19; 67.07 17.12 -174.41 0.07 42.46
rRNA 1J5A 1383!L:1803!L C:G rS(ss:O2*-O2*) [---][-] 5.13 156.88; 129.4 27.48 -116.84 1.89 46.93
rRNA 1J5A 1391!L:1585!L A:A rWb* [tWW][I] 13.21 36.07; 38.2 2.13 80.92 0.86 65.72
rRNA 1J5A 1393!L:1586!L G:A fS [tSW][X] 9.97 94.05; 35.22 58.83 128.85 2.03 64.45
rRNA 1J5A 1394!L:1588!L G:A rS [tSS][-] 8.27 92.81; 55.87 36.94 162.94 1.18 41.03
rRNA 1J5A 1394!L:1440!L G:G rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 6.46 157.17; 142.23 14.94 -130.66 0.66 41.72
rRNA 1J5A 1397!L:1417!L A:C rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.9 167.21; 101.35 65.86 -2.3 0.15 7.94
rRNA 1J5A 1398!L:1415!L G:C WC [cWW][XIX] 9.62 60.35; 65.3 4.95 0.03 0.26 50.44
rRNA 1J5A 1399!L:1414!L C:G WC [cWW][XIX] 10.58 55.38; 55.3 0.08 4.6 0.17 14.3
rRNA 1J5A 1400!L:1413!L A:U WC [cWW][XX] 10.72 54.76; 53.04 1.72 -9.17 0.36 15.95
rRNA 1J5A 1401!L:1540!L G:C rS(ss:O2*-O2*) [---][-] 5.61 147.12; 152.06 4.94 -120.44 0.81 31.22
rRNA 1J5A 1401!L:1412!L G:C WC [cWW][XIX] 10.8 52.56; 51.65 0.91 -13.96 0.68 10.99
rRNA 1J5A 1402!L:1411!L G:C WC [cWW][XIX] 10.78 53.42; 51.56 1.86 -18.31 0.63 27.45
rRNA 1J5A 1418!L:1613!L C:G WC [cWW][XIX] 10.59 56.04; 55.74 0.3 -6.52 0.45 24.19
rRNA 1J5A 1420!L:1611!L A:U WC [cWW][XX] 10.53 55.76; 55.92 0.16 -10.69 0.18 21.17
rRNA 1J5A 1421!L:1610!L U:A WC [cWW][XX] 10.57 54.88; 55.31 0.43 -4.98 0.16 18.29
rRNA 1J5A 1422!L:1609!L C:G WC [cWW][XIX] 10.7 54.37; 54.51 0.14 0.09 0.66 9.15
rRNA 1J5A 1423!L:1608!L A:U WC [cWW][XX] 10.7 53.93; 53.96 0.03 1.99 0.2 3.45
rRNA 1J5A 1424!L:1607!L U:A WC [cWW][XX] 10.43 56.8; 56.66 0.13 0.49 0.14 10.67
rRNA 1J5A 1425!L:1606!L G:C WC [cWW][XIX] 10.66 54.63; 55.14 0.5 -3.74 0.37 15.19
rRNA 1J5A 1426!L:1605!L U:A WC [cWW][XX] 10.55 55.27; 54.65 0.62 -12.17 0.46 24.63
rRNA 1J5A 1427!L:1604!L G:A S [tSH][XI] 10.48 92.62; 10.44 82.18 -14.82 0.99 23.93
rRNA 1J5A 1430!L:1603!L G:A rS(sb:O2*-N3) [---][-] 5.17 122.43; 92.92 29.51 -142.65 2.02 39.45
rRNA 1J5A 1430!L:1599!L G:G pfS_1 [cSW][-] 9.2 39.26; 119.26 80.0 9.74 1.01 15.0
rRNA 1J5A 1430!L:1598!L G:C WC [cWW][XIX] 10.68 52.29; 47.7 4.59 21.5 0.65 20.75
rRNA 1J5A 1431!L:1597!L U:A WC [cWW][XX] 9.63 59.13; 60.2 1.06 4.45 1.32 16.88
rRNA 1J5A 1432!L:1596!L G:A S [tSH][XI] 10.19 103.87; 18.36 85.51 -4.94 0.36 14.07
rRNA 1J5A 1433!L:1594!L A:U rH_1 [tWH][XXIV] 9.62 26.86; 28.99 2.13 -154.03 0.03 12.95
rRNA 1J5A 1435!L:1593!L G:C sWC [---][-] 10.25 32.66; 92.18 59.52 -11.47 0.68 9.44
rRNA 1J5A 1436!L:1592!L G:U Wb_Mo [cWW][XXVIII] 9.49 55.49; 96.36 40.87 -9.75 1.12 34.31
rRNA 1J5A 1438!L:1590!L G:C WC [cWW][XIX] 9.82 60.06; 61.24 1.19 1.25 1.63 18.76
rRNA 1J5A 1440!L:1588!L G:A S [tSH][XI] 9.05 101.9; 12.48 89.43 -27.54 1.0 5.06
rRNA 1J5A 1443!L:1580!L G:C WC [cWW][XIX] 10.83 52.82; 51.85 0.97 -15.16 0.32 14.59
rRNA 1J5A 1444!L:1579!L C:G WC [cWW][XIX] 10.8 53.57; 53.62 0.04 -10.75 0.29 11.21
rRNA 1J5A 1445!L:1578!L A:U WC [cWW][XX] 10.79 53.15; 53.19 0.03 -7.37 0.17 11.37
rRNA 1J5A 1446!L:1577!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.85 67.49; 42.67 24.82 -17.68 0.21 25.75
rRNA 1J5A 1447!L:1576!L U:G sWb [---][-] 10.58 79.27; 35.69 43.58 -15.5 0.25 20.46
rRNA 1J5A 1449!L:1573!L C:G WC [cWW][XIX] 10.55 53.28; 54.79 1.52 -11.01 1.44 35.99
rRNA 1J5A 1449!L:1493!L C:A rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 6.32 95.86; 150.68 54.82 -63.03 1.14 24.78
rRNA 1J5A 1450!L:1572!L G:C WC [cWW][XIX] 10.65 55.04; 55.8 0.75 -10.65 0.05 17.95
rRNA 1J5A 1450!L:1531!L G:C rS [tSS][-] 8.86 90.19; 50.03 40.16 -172.02 0.77 14.22
rRNA 1J5A 1451!L:1571!L C:G WC [cWW][XIX] 10.76 54.16; 54.18 0.02 -3.47 0.02 12.9
rRNA 1J5A 1451!L:1532!L C:A rS(ss:O2*-O2*)_2 [---][-] 5.22 161.76; 153.84 7.92 -69.43 2.57 33.86
rRNA 1J5A 1452!L:1569!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 9.68 41.23; 13.76 27.47 -174.34 0.19 13.23
rRNA 1J5A 1453!L:1568!L A:A S [tSH][-] 9.64 3.41; 89.7 86.29 -89.54 0.18 3.65
rRNA 1J5A 1454!L:1568!L U:A Wb* [---][-] 8.02 61.54; 94.8 33.26 3.11 2.24 15.27
rRNA 1J5A 1454!L:1567!L U:A WC [cWW][XX] 10.43 56.32; 56.65 0.33 4.74 0.6 7.69
rRNA 1J5A 1455!L:1566!L C:G WC [cWW][XIX] 10.72 55.51; 54.54 0.97 0.75 0.37 4.3
rRNA 1J5A 1456!L:1565!L C:G WC [cWW][XIX] 10.8 54.33; 54.11 0.22 -0.4 0.25 3.37
rRNA 1J5A 1457!L:1564!L A:U WC [cWW][XX] 10.55 56.1; 55.84 0.27 -8.28 0.15 13.3
rRNA 1J5A 1458!L:1563!L A:U WC [cWW][XX] 11.17 50.77; 45.41 5.36 -22.26 0.58 34.78
rRNA 1J5A 1460!L:1481!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.81 43.58; 76.24 32.67 -15.15 0.05 19.95
rRNA 1J5A 1460!L:1475!L G:U S(sp:O2*-O2P)_2 [---][-] 9.66 82.35; 140.12 57.77 142.21 2.49 71.04
rRNA 1J5A 1461!L:1561!L C:A rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.76 101.6; 159.07 57.47 -63.75 0.18 28.6
rRNA 1J5A 1461!L:1480!L C:G WC [cWW][XIX] 10.72 53.37; 54.34 0.97 -11.6 0.24 24.17
rRNA 1J5A 1462!L:1560!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 4.95 159.65; 98.52 61.13 -35.55 1.08 43.55
rRNA 1J5A 1462!L:1543!L C:G rS [tSS][-] 9.35 89.51; 66.72 22.79 163.07 0.68 30.36
rRNA 1J5A 1462!L:1479!L C:G WC [cWW][XIX] 10.55 56.26; 55.64 0.61 -2.66 0.65 10.3
rRNA 1J5A 1463!L:1478!L A:U WC [cWW][XX] 10.6 55.02; 54.84 0.18 -8.26 0.25 15.88
rRNA 1J5A 1464!L:1477!L A:C WC [---][-] 11.23 44.47; 57.67 13.2 -3.41 0.84 15.39
rRNA 1J5A 1466!L:1476!L C:G WC [cWW][XIX] 11.23 28.93; 48.18 19.24 -51.18 0.75 50.24
rRNA 1J5A 1470!L:2683!L G:C WC [cWW][XIX] 10.9 49.43; 54.23 4.8 -4.34 0.49 18.11
rRNA 1J5A 1471!L:2682!L G:C WC [cWW][XIX] 10.71 58.28; 50.33 7.95 -12.82 1.29 38.31
rRNA 1J5A 1472!L:2681!L C:A Wb_mo [cWW][-] 11.9 52.15; 29.15 22.99 -5.34 0.68 27.82
rRNA 1J5A 1479!L:1543!L G:G rpS [cSS][-] 5.81 117.41; 146.19 28.78 -36.33 0.34 21.97
rRNA 1J5A 1480!L:1561!L G:A rS [tSS][-] 8.24 86.43; 69.08 17.35 165.69 1.29 21.88
rRNA 1J5A 1483!L:1539!L G:U WC [---][-] 10.88 52.03; 55.13 3.1 1.46 0.08 7.87
rRNA 1J5A 1487!L:1536!L C:G pfS*_2 [---][-] 9.87 56.64; 94.91 38.27 -4.74 0.99 16.43
rRNA 1J5A 1488!L:1534!L G:A WC [cWW][VIII] 12.8 49.98; 45.29 4.69 11.15 0.36 23.05
rRNA 1J5A 1491!L:1532!L C:A WC [---][-] 10.4 54.8; 66.67 11.87 -1.11 0.38 10.98
rRNA 1J5A 1493!L:1573!L A:G rS [tSS][-] 7.42 62.56; 90.86 28.29 159.22 0.03 34.22
rRNA 1J5A 1493!L:1530!L A:U S [tSH][-] 9.99 12.06; 90.17 78.11 -26.63 0.71 13.76
rRNA 1J5A 1495!L:1528!L G:C WC [cWW][XIX] 10.7 48.85; 45.49 3.36 -33.14 1.72 19.46
rRNA 1J5A 1498!L:1522!L G:C WC [cWW][XIX] 10.76 49.35; 46.33 3.03 31.97 1.58 19.57
rRNA 1J5A 1499!L:1521!L A:U WC [cWW][XX] 10.4 57.18; 55.62 1.55 -8.95 0.68 20.87
rRNA 1J5A 1500!L:1520!L U:G WC [---][-] 11.11 56.91; 57.95 1.03 -1.91 0.24 11.86
rRNA 1J5A 1501!L:1519!L C:G WC [cWW][XIX] 10.69 55.34; 55.16 0.19 7.02 0.56 3.73
rRNA 1J5A 1502!L:1518!L G:C WC [cWW][XIX] 10.73 54.85; 54.44 0.41 -1.69 0.17 8.78
rRNA 1J5A 1503!L:1517!L G:C WC [cWW][XIX] 10.86 53.14; 52.11 1.03 3.19 0.31 3.69
rRNA 1J5A 1508!L:1514!L G:C Wb* [---][-] 12.37 67.08; 41.96 25.12 23.37 1.3 31.85
rRNA 1J5A 1542!L:1561!L G:A S [tSH][XI] 10.03 96.42; 18.6 77.82 -52.4 0.39 18.46
rRNA 1J5A 1542!L:1560!L G:A S(bp:N1-O2P)_1 [---][-] 9.24 75.89; 12.61 63.28 159.24 1.71 19.68
rRNA 1J5A 1545!L:1558!L G:C Wb [---][-] 10.34 51.63; 68.58 16.95 -8.43 0.29 19.87
rRNA 1J5A 1546!L:1557!L C:G Wb [---][-] 10.42 72.43; 55.03 17.41 -10.24 1.04 6.1
rRNA 1J5A 1547!L:1556!L U:A sWC [---][-] 10.36 80.08; 38.58 41.5 -14.77 1.36 12.01
rRNA 1J5A 1547!L:1555!L U:A WC [cWW][XX] 10.71 54.06; 54.61 0.55 -7.01 0.49 15.4
rRNA 1J5A 1548!L:1554!L U:G WC [---][-] 10.63 54.09; 57.21 3.11 0.67 0.47 21.56
rRNA 1J5A 1549!L:1553!L C:G WC [cWW][XIX] 10.52 53.63; 49.82 3.8 22.35 0.9 41.73
rRNA 1J5A 1575!L:1576!L C:G rS(sp:O2*-O1P) [---][-] 9.27 120.94; 95.63 25.31 141.59 1.46 67.35
rRNA 1J5A 1581!L:1584!L C:G WC [cWW][XIX] 10.44 55.45; 56.55 1.1 -9.16 1.54 37.67
rRNA 1J5A 1620!L:1626!L C:A fS(sb:O2*-N1)_1 [tSS][-] 8.98 94.54; 50.49 44.05 129.48 1.88 62.88
rRNA 1J5A 1624!L:1637!L A:U rH_1 [tWH][XXIV] 10.7 13.51; 35.36 21.86 -127.84 0.79 12.05
rRNA 1J5A 1627!L:1636!L C:G WC [cWW][XIX] 10.87 50.77; 53.07 2.3 -5.53 0.47 16.05
rRNA 1J5A 1628!L:1635!L C:G WC [cWW][XIX] 10.79 54.16; 52.97 1.19 2.55 0.44 8.2
rRNA 1J5A 1643!L:1656!L A:U WC [cWW][XX] 10.8 52.47; 52.76 0.29 0.39 0.03 11.57
rRNA 1J5A 1644!L:1655!L G:C WC [cWW][XIX] 10.75 53.36; 54.14 0.78 -2.71 0.29 16.34
rRNA 1J5A 1645!L:2677!L U:U rpS(ps:O1P-O2*) [---][-] 7.11 96.21; 128.31 32.11 151.08 0.17 52.25
rRNA 1J5A 1645!L:1654!L U:A WC [cWW][XX] 10.7 54.25; 53.96 0.29 -1.26 0.05 2.53
rRNA 1J5A 1646!L:1653!L G:C WC [cWW][XIX] 10.66 55.23; 55.75 0.51 -8.04 0.18 13.99
rRNA 1J5A 1647!L:1652!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.4 73.92; 36.62 37.3 -12.97 0.65 8.89
rRNA 1J5A 1652!L:1752!L G:U rpS [cSS][-] 6.96 95.57; 126.39 30.82 -57.53 0.87 54.72
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rRNA 1J5A 1655!L:2677!L C:U rS(sb:O2*-O2) [---][-] 4.23 122.21; 132.95 10.74 -161.47 1.67 45.5
rRNA 1J5A 1665!L:1992!L C:G WC [cWW][XIX] 10.75 53.82; 55.03 1.21 12.74 0.63 6.81
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rRNA 1J5A 1686!L:1976!L A:U WC [cWW][XX] 10.92 49.58; 59.6 10.02 7.81 0.74 5.67
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rRNA 1J5A 1702!L:1720!L C:G WC [cWW][XIX] 10.77 61.62; 58.54 3.08 5.44 0.14 12.85
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rRNA 1J5A 1727!L:1739!L C:G WC [cWW][XIX] 11.3 52.67; 50.81 1.86 4.86 0.49 1.97
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rRNA 1J5A 1743!L:1747!L C:G WC [cWW][XIX] 10.66 55.06; 58.51 3.45 -3.05 0.77 21.39
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rRNA 1J5A 1746!L:2673!L A:G fS [tSW][X] 9.79 10.69; 111.81 101.12 148.18 0.56 19.51
rRNA 1J5A 1748!L:1753!L U:A S* [tHS][-] 9.54 14.91; 94.22 79.31 40.38 1.68 48.16
rRNA 1J5A 1755!L:1971!L G:C WC [cWW][XIX] 10.82 55.47; 53.27 2.19 8.09 0.97 7.62
rRNA 1J5A 1756!L:1970!L C:G WC [cWW][XIX] 10.77 60.04; 56.27 3.77 10.89 1.39 4.33
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rRNA 1J5A 1758!L:1968!L C:G WC [cWW][XIX] 10.57 64.24; 57.06 7.18 -0.04 0.5 8.13
rRNA 1J5A 1760!L:1966!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.6 66.89; 58.15 8.75 -0.79 0.74 8.13
rRNA 1J5A 1761!L:1965!L G:U WC [---][-] 10.89 51.22; 54.21 2.99 -3.87 0.44 32.57
rRNA 1J5A 1762!L:1963!L C:G WC [cWW][XIX] 10.68 58.47; 55.9 2.57 -8.82 0.17 16.39
rRNA 1J5A 1763!L:1962!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.64 60.92; 63.4 2.48 -15.8 0.42 22.3
rRNA 1J5A 1764!L:1961!L A:A rS(sb:O2*-N1)_1 [tSS][-] 8.83 87.05; 48.29 38.76 -160.68 0.66 29.36
rRNA 1J5A 1764!L:1960!L A:A fS [tSW][-] 10.47 91.53; 11.77 79.75 -144.35 0.64 20.14
rRNA 1J5A 1766!L:1780!L U:A S* [---][-] 11.83 16.98; 73.04 56.06 66.85 1.38 30.2
rRNA 1J5A 1767!L:1779!L G:C WC [cWW][XIX] 10.92 51.5; 51.84 0.34 -12.03 0.16 21.06
rRNA 1J5A 1768!L:1778!L* U:U Wb [cWW][XVI]; Wb_mo [cWW][XVI] 9.67 59.94; 39.06 20.88 -10.06 0.27 34.51
rRNA 1J5A 1769!L:1776!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 10.42 36.63; 13.25 23.37 -162.82 0.38 8.98
rRNA 1J5A 1773!L:2565!L C:C rWb* [tWW][XIV] 10.27 34.53; 20.81 13.72 -140.34 0.75 22.64
rRNA 1J5A 1774!L:2586!L A:G rpS [cSS][-] 5.11 167.47; 104.27 63.2 6.6 1.19 15.43
rRNA 1J5A 1776!L:2567!L A:G rS [tSS][-] 8.67 50.05; 86.66 36.61 174.35 1.87 18.84
rRNA 1J5A 1783!L:1819!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.53 41.04; 72.37 31.33 -2.96 0.15 11.02
rRNA 1J5A 1784!L:1818!L C:G WC_Mo [cWW][XIX] 10.67 65.07; 57.41 7.65 0.22 0.32 12.95
rRNA 1J5A 1785!L:1817!L A:U WC [cWW][XX] 10.14 57.17; 65.32 8.14 -1.28 0.27 9.73
rRNA 1J5A 1786!L:1816!L C:G WC [cWW][XIX] 10.85 58.23; 50.75 7.48 3.0 0.47 10.2
rRNA 1J5A 1787!L:1815!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.33 78.26; 46.9 31.37 -1.15 0.06 7.91
rRNA 1J5A 1788!L:1814!L C:G WC [cWW][XIX] 10.12 68.23; 54.1 14.13 -10.1 0.33 18.86
rRNA 1J5A 1788!L:1794!L C:A rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 6.49 120.43; 126.85 6.41 -45.61 2.1 41.41
rRNA 1J5A 1789!L:1813!L U:A WC [cWW][XX] 9.94 67.39; 55.09 12.3 -5.29 0.49 14.49
rRNA 1J5A 1789!L:1793!L U:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.37 151.29; 99.91 51.38 -60.39 0.05 25.58
rRNA 1J5A 1791!L:1809!L C:G rWb [tWW][XXII] 11.25 45.07; 35.18 9.88 163.31 2.19 55.44
rRNA 1J5A 1794!L:1814!L A:G rS [tSS][-] 8.81 47.34; 91.77 44.43 -178.98 0.35 23.26
rRNA 1J5A 1794!L:1806!L A:G S [tSH][XI] 10.03 8.21; 95.35 87.14 23.95 0.17 17.14
rRNA 1J5A 1795!L:1805!L C:G WC [cWW][XIX] 10.33 62.62; 52.2 10.42 0.67 0.48 13.65
rRNA 1J5A 1796!L:1804!L A:U WC [cWW][XX] 10.38 64.89; 60.73 4.16 12.28 0.46 16.34
rRNA 1J5A 1797!L:1803!L C:G WC [cWW][XIX] 10.94 55.35; 50.1 5.24 20.12 0.7 17.06
rRNA 1J5A 1798!L:1802!L G:A S [tSH][XI] 10.07 97.82; 7.9 89.92 -27.54 0.46 27.49
rRNA 1J5A 1798!L:1800!L G:A S(sb:O2*-N7) [---][-] 7.18 93.78; 33.66 60.12 174.99 0.47 29.35
rRNA 1J5A 1806!L:1814!L G:G rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 7.15 129.72; 165.37 35.65 -109.79 1.43 40.39
rRNA 1J5A 1822!L:1958!L C:G Wb* [---][-] 11.14 48.02; 67.74 19.72 -12.65 0.95 34.4
rRNA 1J5A 1823!L:1957!L G:C WC [cWW][XIX] 10.89 57.96; 55.05 2.91 -1.77 0.75 14.31
rRNA 1J5A 1824!L:1956!L C:G WC [cWW][XIX] 11.35 49.76; 47.87 1.89 9.26 1.18 2.15
rRNA 1J5A 1827!L:1888!L G:C WC [cWW][XIX] 10.69 55.78; 59.95 4.17 -11.27 0.12 22.08
rRNA 1J5A 1828!L:1887!L C:G Wb [---][-] 10.65 64.44; 48.41 16.03 -3.8 0.48 21.55
rRNA 1J5A 1829!L:1910!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.1 151.62; 104.92 46.7 -54.12 0.29 20.67
rRNA 1J5A 1829!L:1886!L C:G WC_Mo [cWW][XIX] 10.84 59.31; 66.61 7.3 14.51 1.03 10.54
rRNA 1J5A 1832!L:1885!L G:C WC [cWW][XIX] 10.39 48.59; 59.21 10.62 -8.97 0.0 34.69
rRNA 1J5A 1833!L:1884!L U:A WC [cWW][XX] 10.65 62.32; 62.3 0.02 -9.64 0.4 21.04
rRNA 1J5A 1834!L:1881!L G:U WC [---][-] 11.03 56.97; 44.01 12.97 -14.52 0.24 20.49
rRNA 1J5A 1835!L:1880!L C:G WC [cWW][XIX] 11.27 52.95; 53.54 0.59 -4.43 0.16 23.72
rRNA 1J5A 1836!L:1879!L C:G Wb* [---][-] 11.08 45.62; 62.45 16.83 -2.52 0.23 12.92
rRNA 1J5A 1837!L:1878!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.73 57.07; 66.21 9.13 -5.87 0.02 11.54
rRNA 1J5A 1838!L:1877!L G:C WC [cWW][XIX] 11.05 55.18; 55.29 0.1 -17.41 0.65 37.78
rRNA 1J5A 1842!L:1875!L G:C WC [cWW][XIX] 10.76 62.96; 52.39 10.56 6.23 0.32 22.34
rRNA 1J5A 1844!L:1873!L C:A rH_2_Mo [---][-] 11.27 63.65; 11.31 52.33 -25.98 0.71 11.27
rRNA 1J5A 1844!L:1872!L C:A rH_2_Mo [---][-] 11.03 50.94; 10.68 40.26 146.2 2.34 11.8
rRNA 1J5A 1845!L:2212!L A:U rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.51 96.42; 141.82 45.4 -79.37 0.13 44.04
rRNA 1J5A 1846!L:2070!L A:G rS [tSS][-] 7.87 55.45; 89.59 34.15 -167.94 0.3 51.41
rRNA 1J5A 1848!L:1869!L* U:A WC [cWW][XX]; WC_mo [cWW][XX] 12.04 41.69; 47.9 6.21 17.58 2.26 7.94
rRNA 1J5A 1850!L:1867!L G:A S* [---][-] 9.27 21.15; 109.05 87.9 18.53 1.47 6.38
rRNA 1J5A 1851!L:1867!L A:A pfS [cSW][-] 9.4 21.04; 130.34 109.29 -9.81 1.14 6.69
rRNA 1J5A 1854!L:1862!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 11.27 55.13; 61.72 6.58 -4.7 0.26 21.44
rRNA 1J5A 1873!L:2213!L A:G rS [tSS][-] 7.87 62.96; 87.96 25.0 -172.1 0.06 49.8
rRNA 1J5A 1873!L:2068!L A:C rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 6.76 150.11; 107.42 42.69 -52.68 0.64 53.3
rRNA 1J5A 1887!L:1911!L G:A rS [tSS][-] 7.63 87.83; 63.88 23.95 -178.23 0.56 2.73
rRNA 1J5A 1888!L:1912!L C:G rS(ss:O2*-O2*) [---][-] 4.79 169.31; 121.3 48.01 158.37 0.31 38.32
rRNA 1J5A 1892!L:1904!L C:G Wb [---][-] 10.17 81.32; 52.29 29.03 8.04 0.48 10.9
rRNA 1J5A 1893!L:1903!L G:C Wb [---][-] 11.5 34.21; 47.5 13.29 19.53 0.51 11.5
rRNA 1J5A 1914!L:1952!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 10.52 17.57; 21.0 3.43 -148.84 1.27 51.19
rRNA 1J5A 1914!L:1951!L U:G rH*_2 [tHW][-] 11.51 29.58; 67.92 38.34 117.77 1.31 26.81
rRNA 1J5A 1915!L:1956!L A:G rS [tSS][-] 8.87 43.91; 100.69 56.79 -143.47 1.22 34.33
rRNA 1J5A 1915!L:1951!L A:G S [tSH][XI] 10.19 13.2; 90.03 76.83 41.92 1.03 31.15
rRNA 1J5A 1916!L:1950!L G:C WC [cWW][XIX] 10.34 50.62; 55.88 5.26 3.98 0.61 20.75
rRNA 1J5A 1917!L:1947!L C:G Wb*_Mo [---][-] 10.04 65.08; 75.8 10.72 -1.38 0.06 33.12
rRNA 1J5A 1919!L:1944!L A:C rH_1_mo [rWH][XXV] 11.24 26.19; 14.55 11.64 177.79 0.88 25.55
rRNA 1J5A 1921!L:2569!L A:A rS(sb:O2*-N1)_1 [tSS][-] 7.64 55.28; 97.36 42.07 163.32 0.67 31.61
rRNA 1J5A 1922!L:2570!L U:C rS(ss:O2*-O2*) [---][-] 4.89 140.51; 138.89 1.62 -177.69 1.58 88.67
rRNA 1J5A 1928!L:1944!L G:C WC [cWW][XIX] 10.3 50.36; 49.84 0.53 -46.07 2.26 29.07
rRNA 1J5A 1930!L:1942!L C:G WC [cWW][XIX] 10.95 45.51; 58.24 12.73 -11.91 0.02 30.67
rRNA 1J5A 1931!L:1941!L* G:C WC [cWW][XIX]; Wb* [---][-] 10.81 64.62; 51.76 12.86 -15.86 0.09 29.32
rRNA 1J5A 1932!L:1940!L G:C WC [cWW][XIX] 10.89 55.83; 57.05 1.22 -22.38 1.72 46.55
rRNA 1J5A 1934!L:1936!L U:A S(sb:O2*-N7) [---][-] 7.02 82.82; 42.5 40.32 177.82 0.23 25.98
rRNA 1J5A 1935!L:2539!L A:C rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.85 86.54; 152.6 66.06 -49.78 0.77 43.22
rRNA 1J5A 1936!L:2538!L A:C rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.24 155.83; 107.27 48.57 -43.41 1.27 13.41
rRNA 1J5A 1936!L:2528!L A:G rS [tSS][-] 8.61 62.83; 84.09 21.26 157.97 1.0 23.5
rRNA 1J5A 1938!L:2535!L U:C rH* [---][-] 12.81 22.41; 32.02 9.61 -7.92 0.11 57.25
rRNA 1J5A 1949!L:2571!L A:G rpS(ss:O2*-O2*)_1 [---][-] 6.28 112.45; 129.11 16.65 -55.97 0.05 24.38
rRNA 1J5A 1982!L:2703!L C:C rpS(ps:O1P-O2*)_1 [---][-] 7.05 135.28; 94.27 41.01 159.05 0.4 30.21
rRNA 1J5A 1982!L:2666!L C:U rS(sb:O2*-O2) [---][-] 4.17 120.44; 136.15 15.71 -167.33 1.08 34.14
rRNA 1J5A 1983!L:2668!L G:U pS* [cHS][-] 7.21 140.79; 44.32 96.47 -23.29 0.58 17.16
rRNA 1J5A 1988!L:2032!L A:G rpS(ps:O1P-O2*) [---][-] 11.07 121.53; 114.16 7.37 123.32 2.06 48.14
rRNA 1J5A 1989!L:2798!L C:A rS(sb:O2*-N3)_2 [---][-] 4.45 141.0; 121.29 19.71 -178.25 0.05 59.37
rRNA 1J5A 1996!L:2592!L* A:U Wb*_PSU [---][-]; srWC [---][-] 11.31 38.32; 46.22 7.9 156.71 0.64 15.36
rRNA 1J5A 2006!L:2023!L G:C WC [cWW][XIX] 10.69 57.6; 52.71 4.88 -5.26 0.28 15.32
rRNA 1J5A 2007!L:2022!L G:C WC [cWW][XIX] 10.53 55.58; 59.59 4.01 -7.08 0.75 27.12
rRNA 1J5A 2008!L:2021!L C:G Wb [---][-] 10.29 63.81; 46.55 17.27 -11.95 0.4 22.53
rRNA 1J5A 2009!L:2020!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.27 78.54; 46.75 31.79 -10.45 0.03 15.86
rRNA 1J5A 2010!L:2019!L G:C WC [cWW][XIX] 10.97 59.58; 44.11 15.48 -4.91 0.08 19.08
rRNA 1J5A 2011!L:2016!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 10.73 34.13; 12.18 21.95 -174.56 0.09 0.91
rRNA 1J5A 2014!L:2434!L A:G rpS(sb:O2*-N3) [---][-] 4.61 109.01; 154.94 45.93 8.65 1.13 57.06
rRNA 1J5A 2026!L:2604!L C:G WC [cWW][XIX] 10.97 56.42; 46.64 9.78 -3.67 0.35 32.41
rRNA 1J5A 2027!L:2603!L C:G WC [cWW][XIX] 10.86 53.03; 47.08 5.95 -6.14 0.06 13.34
rRNA 1J5A 2028!L:2602!L C:G WC [cWW][XIX] 10.73 57.47; 57.49 0.03 1.26 0.1 5.14
rRNA 1J5A 2029!L:2601!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.69 55.65; 69.42 13.77 -11.95 0.14 14.97
rRNA 1J5A 2030!L:2600!L* U:A WC [cWW][XX]; Wb* [---][-] 11.02 45.33; 56.99 11.67 -7.85 0.42 23.99
rRNA 1J5A 2031!L:2599!L A:U WC [cWW][XX] 10.84 51.65; 58.9 7.24 -9.78 0.36 17.06
rRNA 1J5A 2032!L:2598!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.34 61.56; 65.24 3.68 -11.36 0.4 24.13
rRNA 1J5A 2035!L:2596!L G:C Wb [---][-] 10.63 41.95; 56.15 14.19 8.33 0.32 12.76
rRNA 1J5A 2036!L:2595!L G:C WC [cWW][XIX] 10.89 54.46; 51.08 3.38 6.12 0.27 17.3
rRNA 1J5A 2037!L:2594!L A:U Wb* [---][-] 11.31 56.48; 41.22 15.26 16.91 0.43 12.97
rRNA 1J5A 2037!L:2556!L A:A rH [tWH][V] 12.4 15.11; 25.78 10.67 160.77 0.62 12.13
rRNA 1J5A 2038!L:2478!L C:C H_2 [---][-] 9.96 11.23; 86.83 75.6 34.38 1.17 87.73
rRNA 1J5A 2040!L:2590!L A:U Wb* [---][-] 11.14 60.35; 45.17 15.18 -26.92 0.19 36.66
rRNA 1J5A 2044!L:2430!L G:A WC [cWW][VIII] 12.65 54.35; 48.29 6.06 -2.15 1.24 37.16
rRNA 1J5A 2046!L:2429!L C:A WC [---][-] 10.75 56.61; 53.44 3.17 -13.37 1.31 47.09
rRNA 1J5A 2047!L:2425!L C:G WC [cWW][XIX] 11.02 41.63; 56.14 14.51 -19.09 1.08 43.46
rRNA 1J5A 2047!L:2230!L C:G rS(sb:O2*-N2) [---][-] 7.97 122.6; 94.3 28.3 -170.52 2.01 27.46
rRNA 1J5A 2048!L:2428!L C:U pfS*_1 [cWS][-] 5.52 147.46; 63.07 84.39 52.05 0.45 21.89
rRNA 1J5A 2048!L:2424!L C:G WC [cWW][XIX] 10.32 60.99; 54.24 6.75 -23.33 0.83 34.12
rRNA 1J5A 2049!L:2423!L C:G WC [cWW][XIX] 10.85 58.97; 52.96 6.02 -24.92 0.48 31.35
rRNA 1J5A 2050!L:2422!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.64 68.04; 58.73 9.31 -20.39 0.4 31.7
rRNA 1J5A 2051!L:2409!L U:A Wb*_PSU [---][-] 10.45 32.77; 51.82 19.06 169.74 0.63 19.65
rRNA 1J5A 2052!L:2421!L G:C WC [cWW][XIX] 10.65 62.92; 56.65 6.26 -6.02 0.44 19.11
rRNA 1J5A 2053!L:2420!L G:C WC [cWW][XIX] 10.4 56.05; 65.95 9.89 -7.02 0.89 33.39
rRNA 1J5A 2054!L:2417!L A:U WC [cWW][XX] 10.32 60.06; 59.35 0.72 0.46 0.02 8.32
rRNA 1J5A 2055!L:2416!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.18 38.0; 76.04 38.04 -0.91 0.81 14.9
rRNA 1J5A 2056!L:2577!L C:A rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 5.81 108.27; 157.11 48.84 -47.08 1.35 6.79
rRNA 1J5A 2056!L:2415!L C:G WC [cWW][XIX] 10.86 60.21; 54.45 5.76 -6.99 0.43 20.73
rRNA 1J5A 2057!L:2414!L U:A Wb [---][-] 10.42 69.7; 51.23 18.47 -23.6 0.12 29.96
rRNA 1J5A 2058!L:2060!L U:A H_1 [cWH][XXIII] 8.43 59.78; 57.38 2.4 -6.77 0.18 16.66
rRNA 1J5A 2060!L:2413!L A:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.56 95.61; 154.2 58.6 -41.6 1.25 27.96
rRNA 1J5A 2060!L:2222!L A:U WC [cWW][XX] 11.06 51.05; 57.68 6.64 -8.71 0.18 18.22
rRNA 1J5A 2061!L:2221!L C:G WC [cWW][XIX] 10.98 60.2; 51.99 8.21 -14.76 0.51 20.52
rRNA 1J5A 2061!L:2217!L C:G rS*_1 [tHH][-] 11.83 11.17; 18.91 7.74 78.89 0.02 23.53
rRNA 1J5A 2062!L:2220!L U:A WC [cWW][XX] 10.45 62.44; 57.64 4.8 -11.05 0.44 17.77
rRNA 1J5A 2063!L:2219!L A:U WC [cWW][XX] 10.66 43.41; 54.06 10.66 -1.51 0.46 13.45
rRNA 1J5A 2064!L:2218!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.09 77.31; 35.98 41.34 2.38 0.43 16.98
rRNA 1J5A 2065!L:2216!L A:G S [tSH][XI] 9.96 3.26; 95.35 92.09 -26.54 0.26 8.38
rRNA 1J5A 2066!L:2215!L G:C WC [cWW][XIX] 10.57 48.71; 59.44 10.72 -6.02 1.04 24.34
rRNA 1J5A 2067!L:2214!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.82 70.52; 43.23 27.28 3.52 1.16 8.46
rRNA 1J5A 2068!L:2213!L C:G WC [cWW][XIX] 10.5 62.67; 52.01 10.67 5.87 0.15 9.28
rRNA 1J5A 2069!L:2212!L U:U Wb [cWW][XVI] 8.99 73.84; 52.97 20.87 -11.62 0.3 15.21
rRNA 1J5A 2070!L:2211!L G:U sWb [---][-] 10.15 41.13; 86.6 45.47 -3.89 0.37 11.51
rRNA 1J5A 2071!L:2210!L G:C WC [cWW][XIX] 10.69 53.08; 56.91 3.83 5.22 0.97 3.58
rRNA 1J5A 2072!L:2209!L C:G Wb [---][-] 10.29 64.81; 50.51 14.3 -4.82 0.72 18.14
rRNA 1J5A 2073!L:2208!L A:U Wb [---][-] 10.42 41.3; 67.14 25.84 -13.26 0.64 29.29
rRNA 1J5A 2074!L:2207!L U:G WC_mo [---][-] 11.54 54.53; 50.89 3.63 0.2 0.06 6.43
rRNA 1J5A 2076!L:2180!L G:U rS [tSS][-] 10.04 82.23; 78.59 3.64 -20.45 0.88 26.9
rRNA 1J5A 2076!L:2179!L G:C Wb* [---][-] 11.58 71.4; 53.28 18.12 -14.61 0.24 16.35
rRNA 1J5A 2077!L:2178!L G:U sWb [---][-] 11.32 36.63; 72.44 35.81 2.16 0.97 11.44
rRNA 1J5A 2083!L:2172!L G:U Wb* [---][-] 10.89 61.06; 45.54 15.52 6.71 0.01 17.72
rRNA 1J5A 2084!L:2085!L G:G pS_2 [---][-] 6.55 107.77; 69.15 38.62 -32.53 1.98 26.55
rRNA 1J5A 2086!L:2170!L U:C Wb* [---][-] 7.65 55.51; 87.25 31.74 -10.06 1.45 5.75
rRNA 1J5A 2089!L:2166!L C:G Wb* [---][-] 11.34 44.75; 74.23 29.48 10.2 0.56 8.08
rRNA 1J5A 2091!L:2164!L* C:G Wb* [---][-]; Wb* [---][-] 11.93 42.22; 66.93 24.71 27.29 0.58 49.11
rRNA 1J5A 2103!L:2161!L G:C WC [cWW][XIX] 11.15 57.3; 40.63 16.67 -15.04 0.66 35.04
rRNA 1J5A 2105!L:2160!L U:C pfS*_1 [cWS][-] 7.2 76.47; 101.65 25.18 2.44 1.77 2.85
rRNA 1J5A 2105!L:2159!L U:A Wb [---][-] 9.88 73.85; 59.65 14.2 4.96 0.13 15.17
rRNA 1J5A 2119!L:2138!L A:U S [tSH][-] 8.98 13.9; 98.79 84.89 -85.5 0.04 38.17
rRNA 1J5A 2121!L:2137!L U:G pfS [cSW][-] 9.05 115.88; 51.36 64.53 8.57 0.58 11.69
rRNA 1J5A 2122!L:2136!L G:G S_2 [---][-] 7.87 101.75; 20.87 80.88 -62.51 0.5 53.0
rRNA 1J5A 2180!L:2204!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 10.63 30.65; 16.73 13.92 -159.36 1.78 45.86
rRNA 1J5A 2182!L:2203!L A:G S [tSH][XI] 9.93 8.64; 104.11 95.46 51.57 0.43 16.98
rRNA 1J5A 2183!L:2202!L C:G WC [cWW][XIX] 10.45 54.44; 58.99 4.54 9.49 0.08 27.65
rRNA 1J5A 2184!L:2201!L C:G WC_Mo [cWW][XIX] 10.3 67.89; 63.67 4.23 -6.91 0.8 17.78
rRNA 1J5A 2185!L:2200!L U:G Wb_Mo [cWW][XXVIII] 10.51 79.68; 49.67 30.01 2.7 0.89 18.78
rRNA 1J5A 2186!L:2199!L G:C WC [cWW][XIX] 10.77 57.1; 61.66 4.56 17.11 0.3 19.05
rRNA 1J5A 2222!L:2413!L U:A rS(sb:O2*-N1) [---][-] 8.12 86.47; 53.86 32.6 159.26 1.43 46.08
rRNA 1J5A 2223!L:2414!L U:A H_1 [cWH][XXIII] 8.59 60.03; 50.7 9.33 -7.42 0.29 21.86
rRNA 1J5A 2224!L:2415!L U:G H_1 [cWH][-] 7.95 70.59; 57.81 12.78 -16.42 0.09 22.72
rRNA 1J5A 2226!L:2236!L A:U WC [cWW][XX] 10.17 54.01; 65.11 11.1 -30.99 0.0 42.07
rRNA 1J5A 2227!L:2235!L C:G WC [cWW][XIX] 10.84 55.64; 53.6 2.04 -17.87 0.2 28.34
rRNA 1J5A 2228!L:2232!L U:G S(bp:N3-O2P)_2 [---][-] 10.27 74.87; 48.56 26.3 126.7 2.03 36.02
rRNA 1J5A 2230!L:2428!L G:U rpS(ss:O2*-O2*)_1 [---][-] 5.24 166.73; 145.03 21.7 95.22 1.55 20.92
rRNA 1J5A 2234!L:2254!L G:C WC [cWW][XIX] 10.42 62.54; 53.84 8.7 0.08 1.9 54.74
rRNA 1J5A 2238!L:2260!L G:C WC [cWW][XIX] 10.74 52.15; 52.67 0.52 -10.4 0.25 22.05
rRNA 1J5A 2239!L:2367!L C:A rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 6.27 109.19; 151.12 41.93 -44.25 1.31 15.37
rRNA 1J5A 2239!L:2259!L C:G WC [cWW][XIX] 10.6 57.48; 49.78 7.7 -6.25 0.44 24.24
rRNA 1J5A 2240!L:2258!L C:G WC_Mo [cWW][XIX] 11.07 57.23; 62.95 5.72 8.92 1.03 10.15
rRNA 1J5A 2241!L:2307!L U:A rS(sb:O2*-N3) [---][-] 4.2 121.59; 99.02 22.57 -137.88 2.46 44.87
rRNA 1J5A 2241!L:2257!L U:A Wb* [---][-] 10.52 46.49; 61.29 14.8 0.48 0.93 10.73
rRNA 1J5A 2242!L:2256!L C:G Wb* [---][-] 11.56 39.26; 57.34 18.08 15.6 0.5 32.32
rRNA 1J5A 2243!L:2255!L C:G WC [cWW][XIX] 10.04 66.83; 57.37 9.46 3.7 1.03 14.32
rRNA 1J5A 2244!L:2253!L C:A sWb [---][-] 11.14 89.08; 18.5 70.58 -18.4 0.52 12.44
rRNA 1J5A 2244!L:2252!L C:A rH_2_Mo [---][-] 10.57 70.25; 8.53 61.73 44.7 1.54 26.24
rRNA 1J5A 2246!L:2251!L A:U rWb*_e [---][-] 11.51 14.93; 43.08 28.15 163.77 0.36 29.56
rRNA 1J5A 2259!L:2367!L G:A rS [tSS][-] 8.48 85.77; 64.94 20.83 170.71 0.35 13.32
rRNA 1J5A 2262!L:2304!L C:G Wb [---][-] 10.24 73.1; 45.68 27.42 -16.76 0.54 31.55
rRNA 1J5A 2264!L:2362!L C:G WC_Mo [cWW][XIX] 10.74 57.96; 67.55 9.59 -4.84 0.11 16.45
rRNA 1J5A 2267!L:2316!L A:G rpS(ps:O1P-O2*) [---][-] 10.01 146.33; 100.61 45.72 -172.0 2.12 59.74
rRNA 1J5A 2268!L:2322!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.12 37.48; 80.14 42.66 -45.6 0.26 45.75
rRNA 1J5A 2269!L:2321!L G:C WC [cWW][XIX] 10.87 51.86; 55.81 3.95 -17.47 0.59 28.65
rRNA 1J5A 2270!L:2320!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.76 72.06; 35.98 36.08 -12.49 0.08 16.06
rRNA 1J5A 2271!L:2319!L C:G WC [cWW][XIX] 10.69 58.58; 59.86 1.28 -12.44 0.33 19.69
rRNA 1J5A 2272!L:2318!L A:U Wb [---][-] 10.51 42.39; 65.59 23.2 5.58 0.98 8.77
rRNA 1J5A 2273!L:2317!L C:G Wb [---][-] 9.75 78.16; 53.68 24.48 -6.53 0.06 23.02
rRNA 1J5A 2274!L:2316!L C:G Wb [---][-] 10.41 61.15; 45.32 15.82 -1.82 0.67 21.27
rRNA 1J5A 2276!L:2300!L C:G WC [cWW][XIX] 11.16 53.47; 48.22 5.25 15.93 0.44 26.9
rRNA 1J5A 2277!L:2297!L A:G S [tSH][XI] 9.47 6.56; 103.93 97.37 -41.5 0.26 16.61
rRNA 1J5A 2278!L:2296!L A:U WC [cWW][XX] 10.4 48.94; 60.24 11.3 10.19 1.12 1.33
rRNA 1J5A 2279!L:2295!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.59 58.2; 65.01 6.8 -10.91 0.14 22.12
rRNA 1J5A 2280!L:2294!L A:U Wb [---][-] 11.33 45.77; 66.6 20.83 -11.23 0.83 17.57
rRNA 1J5A 2281!L:2293!L C:G Wb* [---][-] 10.92 55.09; 69.25 14.16 -9.26 0.65 6.87
rRNA 1J5A 2282!L:2292!L G:C Wb* [---][-] 11.5 61.99; 38.63 23.36 0.11 0.87 14.49
rRNA 1J5A 2297!L:2300!L G:G pS(sb:O2*-O6) [---][-] 9.11 145.53; 16.34 129.19 54.7 2.03 13.21
rRNA 1J5A 2301!L:2314!L A:A rWC [---][-] 12.76 30.31; 43.55 13.24 -146.72 0.4 44.4
rRNA 1J5A 2302!L:2311!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.24 42.56; 74.3 31.75 -4.36 0.79 13.78
rRNA 1J5A 2303!L:2310!L C:G WC_Mo [cWW][XIX] 10.92 63.81; 54.15 9.66 -11.04 0.01 14.47
rRNA 1J5A 2305!L:2368!L C:G WC [cWW][XIX] 10.67 54.26; 64.89 10.64 -0.27 0.1 3.63
rRNA 1J5A 2305!L:2367!L C:A rH_1 [rWH][XXV] 11.5 48.23; 19.12 29.1 2.02 0.72 49.94
rRNA 1J5A 2307!L:2366!L* A:U WC [cWW][XX]; Wb* [---][-] 10.92 58.55; 47.23 11.33 -1.97 0.17 7.43
rRNA 1J5A 2308!L:2366!L A:U WC [cWW][XX] 9.75 62.84; 63.89 1.06 -16.03 2.44 9.52
rRNA 1J5A 2308!L:2365!L A:U Wb [---][-] 10.93 43.72; 67.13 23.4 -11.38 0.25 25.09
rRNA 1J5A 2309!L:2364!L G:C Wb [---][-] 10.32 52.84; 71.86 19.02 -14.5 0.42 24.96
rRNA 1J5A 2320!L:2353!L G:G rpS(sb:O2*-N2)_3 [---][-] 9.93 59.07; 157.41 98.33 172.52 0.63 64.53
rRNA 1J5A 2321!L:2353!L C:G rpS(sp:O2*-O1P) [---][-] 7.13 96.58; 138.61 42.03 142.3 1.2 51.54
rRNA 1J5A 2324!L:2350!L G:G H_1 [cWH][VI] 11.3 28.29; 61.37 33.08 9.16 0.6 29.79
rRNA 1J5A 2326!L:2349!L C:G WC [cWW][XIX] 10.94 57.56; 51.34 6.22 -14.77 0.82 25.28
rRNA 1J5A 2327!L:2361!L U:G pS* [cHS][-] 9.83 39.53; 111.49 71.96 -33.27 0.89 31.59
rRNA 1J5A 2327!L:2348!L* U:A WC [cWW][XX]; Wb* [---][-] 11.03 45.55; 58.5 12.95 -6.01 0.89 22.7
rRNA 1J5A 2328!L:2347!L G:C WC [cWW][XIX] 10.89 54.43; 60.54 6.11 8.17 0.74 24.72
rRNA 1J5A 2329!L:2346!L C:G WC [cWW][XIX] 10.56 62.84; 52.0 10.84 9.52 0.87 10.27
rRNA 1J5A 2330!L:2345!L G:A S(sb:O2*-N6)_3 [---][-] 10.12 123.31; 3.28 120.03 -136.97 0.55 24.29
rRNA 1J5A 2331!L:2344!L A:G S [tSH][XI] 9.77 7.7; 93.67 85.97 -133.41 0.23 11.32
rRNA 1J5A 2332!L:2343!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.41 57.87; 71.03 13.17 10.24 0.45 23.03
rRNA 1J5A 2338!L:2407!L C:G Wb [---][-] 10.62 60.63; 45.95 14.67 -16.56 0.05 22.57
rRNA 1J5A 2351!L:2360!L G:C WC [cWW][XIX] 11.07 59.08; 55.37 3.72 -10.4 0.03 13.84
rRNA 1J5A 2352!L:2359!L A:U WC [cWW][XX] 10.27 53.93; 65.35 11.42 -5.4 0.45 12.14
rRNA 1J5A 2353!L:2358!L G:C WC [cWW][XIX] 10.73 51.69; 59.33 7.64 7.75 0.04 9.1
rRNA 1J5A 2354!L:2357!L G:A S_mo [tSH][XI] 9.85 87.25; 22.68 64.57 -117.84 0.82 28.58
rRNA 1J5A 2354!L:2356!L G:A S(sb:O2*-N7) [---][-] 7.29 85.97; 25.67 60.3 -156.62 1.9 40.43
rRNA 1J5A 2370!L:2408!L G:G rS [tSS][IV] 8.3 84.84; 64.25 20.59 164.41 0.67 42.46
rRNA 1J5A 2371!L:2403!L A:C Wb_mo [cWW][-] 11.5 32.15; 29.07 3.08 -147.73 1.61 15.45
rRNA 1J5A 2372!L:2401!L A:A rH_Mo [tWH][V] 12.57 5.93; 34.5 28.57 -172.64 0.4 18.93
rRNA 1J5A 2374!L:2400!L C:G WC [cWW][XIX] 10.6 53.84; 61.12 7.28 9.96 0.98 3.47
rRNA 1J5A 2375!L:2399!L G:C WC [cWW][XIX] 10.24 68.57; 57.01 11.56 6.91 1.16 13.5
rRNA 1J5A 2376!L:2398!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.05 44.16; 80.08 35.92 -11.55 1.63 34.07
rRNA 1J5A 2378!L:2396!L* G:C WC [cWW][XIX]; Wb* [---][-] 10.46 67.25; 53.04 14.21 -5.52 0.92 16.97
rRNA 1J5A 2379!L:2395!L G:C WC [cWW][XIX] 10.62 62.64; 45.92 16.72 -9.32 0.7 35.98
rRNA 1J5A 2380!L:2394!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.41 79.83; 42.08 37.75 -12.88 0.18 24.56
rRNA 1J5A 2382!L:2393!L C:G WC [cWW][XIX] 10.88 49.15; 57.66 8.51 14.5 0.88 8.75
rRNA 1J5A 2383!L:2392!L C:G Wb [---][-] 10.63 58.89; 46.6 12.29 13.72 0.6 14.29
rRNA 1J5A 2384!L:2391!L G:A S [tSH][XI] 9.76 96.8; 3.36 93.44 27.41 0.6 14.31
rRNA 1J5A 2415!L:2577!L G:A rS [tSS][-] 8.25 86.27; 63.22 23.05 164.72 0.12 14.01
rRNA 1J5A 2417!L:2419!L U:C pS [cSH][-] 7.49 134.74; 37.67 97.06 -16.83 1.03 25.56
rRNA 1J5A 2420!L:2565!L C:C rpS(ps:O2P-O2*) [---][-] 11.2 110.37; 136.38 26.02 -163.67 1.29 16.7
rRNA 1J5A 2432!L:2551!L A:A rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 4.85 152.03; 121.68 30.35 -49.89 0.59 30.45
rRNA 1J5A 2432!L:2479!L A:U WC [cWW][XX] 10.57 53.83; 66.11 12.27 15.75 0.06 24.96
rRNA 1J5A 2433!L:2477!L G:C WC [cWW][XIX] 10.88 55.41; 45.59 9.82 6.18 0.24 11.86
rRNA 1J5A 2434!L:2475!L G:C WC [cWW][XIX] 10.66 55.65; 58.77 3.11 -22.58 0.09 27.6
rRNA 1J5A 2435!L:2474!L C:G WC [cWW][XIX] 10.86 53.36; 47.99 5.37 -16.36 0.26 28.89
rRNA 1J5A 2436!L:2473!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.69 64.75; 46.33 18.42 -5.76 0.03 9.55
rRNA 1J5A 2437!L:2471!L G:U S*_1 [tHS][-] 11.16 86.62; 4.11 82.51 24.84 0.48 20.07
rRNA 1J5A 2437!L:2439!L G:U fS*(bs:O4-O2*) [---][-] 8.54 136.52; 20.63 115.89 9.13 1.17 11.26
rRNA 1J5A 2438!L:2472!L A:U WC [cWW][XX] 10.98 51.25; 48.93 2.32 13.19 0.18 16.6
rRNA 1J5A 2439!L:2471!L U:U WC [---][-] 8.65 60.94; 52.73 8.22 -2.82 0.49 24.16
rRNA 1J5A 2439!L:2469!L U:G S*_1 [---][-] 12.39 18.1; 83.15 65.05 42.08 0.88 17.41
rRNA 1J5A 2440!L:2468!L C:G WC [cWW][XIX] 11.07 51.66; 51.36 0.29 -5.25 0.26 29.43
rRNA 1J5A 2441!L:2467!L U:A WC [cWW][XX] 10.6 58.18; 51.47 6.71 -13.42 0.2 19.7
rRNA 1J5A 2442!L:2466!L C:G Wb [---][-] 10.42 77.27; 48.51 28.76 -5.61 0.12 11.45
rRNA 1J5A 2443!L:2465!L C:G Wb [---][-] 10.92 62.43; 49.0 13.43 -0.99 0.72 14.9
rRNA 1J5A 2444!L:2464!L C:G WC [cWW][XIX] 10.61 57.37; 64.61 7.24 3.77 0.04 18.59
rRNA 1J5A 2445!L:2463!L C:G WC [cWW][XIX] 10.74 51.58; 61.03 9.45 12.04 1.12 4.94
rRNA 1J5A 2447!L:2461!L G:G S_2_mo [---][-] 9.84 95.49; 12.63 82.86 -135.25 0.45 20.4
rRNA 1J5A 2448!L:2460!L A:G S_Mo [tSH][XI] 9.9 13.73; 109.76 96.04 20.56 0.67 5.16
rRNA 1J5A 2450!L:2458!L A:U WC [cWW][XX] 11.01 49.75; 56.18 6.43 14.16 0.78 12.11
rRNA 1J5A 2451!L:2457!L G:A S [tSH][XI] 10.18 103.33; 8.05 95.28 30.57 0.17 9.1
rRNA 1J5A 2454!L:2508!L C:G rWb [tWW][XXII] 10.47 61.1; 49.76 11.34 116.07 0.61 51.27
rRNA 1J5A 2458!L:2516!L U:U rS(ps:O1P-O2*) [---][-] 7.33 128.19; 139.81 11.62 127.78 1.61 41.76
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rRNA 1J5A 2486!L:2561!L C:G WC [cWW][XIX] 11.06 49.19; 41.65 7.54 28.09 1.1 20.01
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rRNA 1J5A 2487!L:2559!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.75 37.19; 67.33 30.13 3.72 0.12 3.92
rRNA 1J5A 2487!L:2533!L G:U rS(ss:O2*-O2*)_2 [---][-] 5.72 147.72; 149.32 1.6 -113.56 0.02 27.43
rRNA 1J5A 2488!L:2558!L G:C WC [cWW][XIX] 10.68 48.06; 57.15 9.09 4.62 0.89 7.96
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rRNA 1J5A 2491!L:2553!L C:G WC [cWW][XIX] 10.8 54.75; 46.01 8.74 6.53 0.25 16.05
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rRNA 1J5A 2493!L:2549!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.59 71.88; 43.4 28.48 -12.59 0.06 12.17
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rRNA 1J5A 2496!L:2546!L C:G WC_mo [cWW][XIX] 11.76 50.68; 53.45 2.77 -8.66 0.26 34.68
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rRNA 1J5A 2499!L:2544!L C:A rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 6.28 96.3; 143.68 47.38 -56.45 2.1 13.25
rRNA 1J5A 2499!L:2524!L C:G WC [cWW][XIX] 11.34 46.66; 51.26 4.6 -5.25 0.99 26.94
rRNA 1J5A 2500!L:2543!L C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 6.02 142.1; 87.09 55.01 -69.03 0.55 49.44
rRNA 1J5A 2500!L:2523!L C:G WC [cWW][XIX] 10.92 49.05; 54.09 5.04 -15.36 0.34 21.93
rRNA 1J5A 2501!L:2626!L U:U rS(ps:O1P-O2*) [---][-] 7.57 145.46; 119.19 26.27 73.35 0.03 46.82
rRNA 1J5A 2501!L:2522!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.93 57.49; 40.97 16.52 -2.72 0.28 11.09
rRNA 1J5A 2502!L:2744!L G:A rpS [cSS][-] 6.41 106.46; 135.07 28.61 -66.55 1.04 47.75
rRNA 1J5A 2502!L:2519!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 11.13 58.49; 65.12 6.63 4.67 0.48 5.04
rRNA 1J5A 2503!L:2743!L G:G rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 7.28 164.13; 135.32 28.81 -86.22 1.36 32.61
rRNA 1J5A 2503!L:2721!L G:A rS [tSS][-] 8.0 85.43; 57.54 27.88 177.38 0.72 36.5
rRNA 1J5A 2503!L:2518!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 11.25 56.97; 63.67 6.7 -1.15 0.23 15.13
rRNA 1J5A 2504!L:2517!L G:C Wb [---][-] 10.46 46.72; 66.25 19.54 -0.1 0.42 6.42
rRNA 1J5A 2505!L:2516!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.52 44.34; 73.08 28.74 -0.11 0.71 11.17
rRNA 1J5A 2510!L:2641!L A:A rWb* [tWW][I] 13.79 21.72; 20.16 1.56 179.73 0.05 43.98
rRNA 1J5A 2510!L:2637!L A:C rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 6.62 94.39; 143.48 49.09 -12.34 1.43 36.47
rRNA 1J5A 2511!L:2642!L G:G rS [tSS][IV] 7.94 75.23; 80.36 5.13 -139.04 1.64 42.48
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rRNA 1J5A 2525!L:2545!L U:A rS(sb:O2*-N3) [---][-] 5.5 140.88; 108.43 32.45 141.38 2.06 42.43
rRNA 1J5A 2527!L:2539!L G:C WC [cWW][XIX] 11.01 58.77; 56.06 2.71 -1.49 0.73 8.33
rRNA 1J5A 2528!L:2538!L G:C WC [cWW][XIX] 10.91 56.03; 56.54 0.51 -0.74 0.08 16.1
rRNA 1J5A 2529!L:2537!L G:C WC [cWW][XIX] 10.85 53.36; 50.67 2.69 11.59 0.15 16.74
rRNA 1J5A 2530!L:2536!L C:G WC [cWW][XIX] 11.11 52.72; 54.48 1.76 12.58 0.34 12.09
rRNA 1J5A 2532!L:2561!L G:G rpS [cSS][-] 4.82 142.62; 93.23 49.4 104.2 0.98 14.71
rRNA 1J5A 2541!L:2545!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 9.69 40.45; 23.18 17.27 -144.51 2.4 49.81
rRNA 1J5A 2542!L:2544!L U:A S(sb:O2*-N7) [---][-] 6.89 84.06; 41.24 42.81 -178.13 2.03 21.55
rRNA 1J5A 2565!L:2587!L C:G S*(pb:O2P-N1) [---][-] 9.56 27.4; 79.64 52.24 128.46 1.83 20.91
rRNA 1J5A 2566!L:2587!L A:G S [tSH][XI] 9.57 6.46; 99.5 93.04 31.02 0.01 23.08
rRNA 1J5A 2567!L:2585!L G:C Wb [---][-] 10.45 45.95; 61.98 16.02 5.07 0.64 3.22
rRNA 1J5A 2569!L:2583!L A:U WC [cWW][XX] 10.75 59.85; 59.62 0.23 0.68 0.9 12.02
rRNA 1J5A 2570!L:2582!L C:G WC [cWW][XIX] 11.0 55.46; 47.0 8.45 4.99 0.52 4.31
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rRNA 1J5A 2572!L:2579!L U:A WC [cWW][XX] 10.64 52.76; 59.03 6.27 -15.47 1.2 33.92
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rRNA 1J5A 2574!L:2577!L G:A S [tSH][XI] 9.79 90.75; 15.8 74.94 -106.75 1.53 14.58
rRNA 1J5A 2574!L:2576!L G:G S(sb:O2*-N7)_1 [---][-] 7.2 94.1; 28.31 65.79 -149.47 0.86 41.03
rRNA 1J5A 2605!L:2757!L C:G WC [cWW][XIX] 10.5 54.57; 59.08 4.51 7.74 1.09 4.88
rRNA 1J5A 2606!L:2761!L G:A rS [tSS][-] 7.81 82.74; 54.99 27.75 162.19 0.88 56.13
rRNA 1J5A 2609!L:2866!L G:A rpS [cSS][-] 6.06 78.12; 152.44 74.32 -78.61 1.56 23.46
rRNA 1J5A 2609!L:2769!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.34 53.82; 57.17 3.35 -36.07 2.28 22.33
rRNA 1J5A 2610!L:2865!L G:G rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 7.45 156.74; 145.46 11.28 -94.21 0.31 25.14
rRNA 1J5A 2610!L:2785!L G:A rS [tSS][-] 8.88 89.26; 55.11 34.16 175.51 0.59 3.15
rRNA 1J5A 2610!L:2767!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 11.17 57.3; 57.56 0.27 -19.28 0.31 26.2
rRNA 1J5A 2611!L:2786!L A:G rS(ss:O2*-O2*)_2 [---][-] 5.42 163.09; 136.83 26.26 -126.46 1.65 34.93
rRNA 1J5A 2611!L:2766!L A:U WC [cWW][XX] 10.62 56.43; 59.32 2.9 -6.52 0.45 17.27
rRNA 1J5A 2612!L:2765!L G:C WC [cWW][XIX] 10.86 51.01; 58.7 7.69 6.91 0.69 4.78
rRNA 1J5A 2614!L:2763!L A:U WC [cWW][XX] 10.92 56.76; 52.54 4.22 -2.15 0.26 17.95
rRNA 1J5A 2615!L:2762!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.78 59.57; 37.76 21.8 2.03 0.39 16.53
rRNA 1J5A 2616!L:2756!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 9.77 45.9; 17.27 28.63 -145.69 0.54 17.42
rRNA 1J5A 2617!L:2758!L G:A S [tSH][XI] 9.65 102.2; 18.02 84.18 -25.8 0.41 28.81
rRNA 1J5A 2617!L:2756!L G:A S_mo [tSH][XI] 9.16 81.44; 36.97 44.47 -100.57 2.31 33.58
rRNA 1J5A 2618!L:2755!L A:A S [tSH][-] 9.51 8.91; 93.01 84.1 -84.73 0.56 13.63
rRNA 1J5A 2619!L:2754!L G:C WC [cWW][XIX] 10.58 51.43; 63.36 11.93 4.67 0.35 6.1
rRNA 1J5A 2620!L:2753!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.48 60.21; 67.13 6.93 3.21 0.33 12.15
rRNA 1J5A 2621!L:2752!L G:C WC [cWW][XIX] 10.61 64.52; 55.75 8.77 -0.68 0.43 16.97
rRNA 1J5A 2622!L:2751!L G:C WC [cWW][XIX] 10.63 51.63; 55.1 3.48 -12.6 0.95 37.86
rRNA 1J5A 2624!L:2713!L G:A pS(sp:O2*-O2P)_2 [---][-] 10.09 164.79; 68.59 96.2 -27.84 2.62 52.86
rRNA 1J5A 2625!L:2653!L U:A WC [cWW][XX] 10.86 49.35; 53.56 4.21 17.45 0.94 11.23
rRNA 1J5A 2626!L:2652!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.43 73.2; 50.48 22.72 13.44 0.54 14.6
rRNA 1J5A 2627!L:2651!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.83 33.51; 66.25 32.74 4.41 0.42 7.77
rRNA 1J5A 2628!L:2650!L C:G WC [cWW][XIX] 10.76 55.54; 52.89 2.66 -1.88 0.21 20.11
rRNA 1J5A 2629!L:2649!L U:A WC [cWW][XX] 10.84 53.56; 52.36 1.2 1.68 0.15 14.32
rRNA 1J5A 2630!L:2648!L C:G WC_Mo [cWW][XIX] 11.05 64.42; 53.22 11.21 -6.62 0.62 19.51
rRNA 1J5A 2631!L:2647!L C:G WC [cWW][XIX] 10.71 58.59; 52.43 6.17 6.62 0.92 0.78
rRNA 1J5A 2632!L:2646!L U:C sWC [---][-] 10.03 83.2; 32.96 50.25 1.0 0.65 12.94
rRNA 1J5A 2635!L:2644!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 10.11 18.68; 25.99 7.31 -156.01 1.78 57.12
rRNA 1J5A 2636!L:2643!L A:G S [tSH][XI] 10.25 10.26; 92.0 81.74 6.64 0.18 7.08
rRNA 1J5A 2637!L:2642!L C:G WC_Mo [cWW][XIX] 10.95 65.44; 52.7 12.74 16.62 0.05 20.89
rRNA 1J5A 2638!L:2641!L G:A S [tSH][XI] 9.23 98.64; 12.64 86.0 -92.74 0.25 29.49
rRNA 1J5A 2655!L:2711!L C:G WC [cWW][XIX] 11.28 51.84; 49.89 1.95 -18.85 0.4 27.26
rRNA 1J5A 2656!L:2710!L G:C WC [cWW][XIX] 10.95 58.85; 53.5 5.36 -5.76 0.14 13.59
rRNA 1J5A 2657!L:2709!L G:C Wb [---][-] 10.58 45.6; 63.36 17.75 -1.26 0.26 8.91
rRNA 1J5A 2658!L:2708!L A:U WC [cWW][XX] 10.46 52.51; 63.92 11.41 -9.86 0.0 20.27
rRNA 1J5A 2659!L:2707!L C:G WC [cWW][XIX] 11.41 47.95; 53.6 5.66 -17.96 0.25 27.44
rRNA 1J5A 2663!L:2705!L U:A WC [cWW][XX] 11.5 46.96; 31.7 15.26 -30.32 0.25 34.6
rRNA 1J5A 2664!L:2704!L G:U WC [---][-] 10.69 52.05; 59.58 7.53 3.5 0.85 4.85
rRNA 1J5A 2665!L:2703!L G:C WC [cWW][XIX] 10.72 52.82; 55.64 2.82 -6.92 0.32 27.3
rRNA 1J5A 2666!L:2702!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 11.2 70.62; 37.48 33.14 -3.21 0.56 13.08
rRNA 1J5A 2670!L:2698!L C:G WC [cWW][XIX] 11.66 47.21; 57.16 9.95 9.33 0.27 7.99
rRNA 1J5A 2671!L:2845!L C:C rpS(ps:O1P-O2*)_1 [---][-] 6.86 138.96; 94.88 44.08 151.66 0.9 44.75
rRNA 1J5A 2671!L:2844!L C:G pfS(sb:O2*-N2) [---][-] 10.11 151.57; 56.06 95.51 -176.32 1.75 56.17
rRNA 1J5A 2671!L:2697!L C:G WC [cWW][XIX] 11.14 54.05; 53.09 0.97 12.46 0.53 15.21
rRNA 1J5A 2672!L:2844!L U:G rpS(pb:O1P-N2)_1 [---][-] 11.44 113.44; 70.89 42.55 103.8 0.02 72.88
rRNA 1J5A 2672!L:2696!L U:A WC [cWW][XX] 10.62 62.54; 57.08 5.46 -4.58 0.03 14.95
rRNA 1J5A 2673!L:2695!L G:C Wb [---][-] 10.72 49.72; 62.31 12.59 -8.53 0.54 19.65
rRNA 1J5A 2674!L:2694!L C:G Wb [---][-] 10.4 60.47; 46.19 14.28 -8.21 0.02 13.2
rRNA 1J5A 2675!L:2690!L U:A WC [cWW][XX] 10.04 66.51; 59.89 6.62 -9.82 0.03 13.18
rRNA 1J5A 2676!L:2689!L G:C WC [cWW][XIX] 10.74 52.0; 66.0 14.0 -8.38 0.02 13.98
rRNA 1J5A 2677!L:2688!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.53 68.08; 49.11 18.97 -8.24 0.05 13.43
rRNA 1J5A 2678!L:2687!L C:G WC [cWW][XIX] 10.73 55.88; 51.75 4.14 -9.46 0.08 15.08
rRNA 1J5A 2679!L:2686!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.9 57.19; 66.85 9.65 -10.35 0.05 11.67
rRNA 1J5A 2680!L:2685!L U:A WC [cWW][XX] 10.94 48.83; 54.59 5.75 -1.93 0.22 18.76
rRNA 1J5A 2699!L:2821!L G:G rpS(ss:O2*-O2*) [---][-] 5.94 159.69; 164.68 4.99 -102.76 0.89 39.42
rRNA 1J5A 2700!L:2848!L U:A H_1 [cWH][XXIII] 9.83 61.49; 35.72 25.77 -9.88 1.62 44.18
rRNA 1J5A 2714!L:2750!L A:G S [tSH][XI] 9.79 10.55; 100.44 89.89 9.42 0.03 5.9
rRNA 1J5A 2715!L:2749!L C:A Wb* [cWW][-] 10.86 44.99; 75.16 30.17 5.75 0.17 18.12
rRNA 1J5A 2716!L:2748!L G:C WC_Mo [cWW][XIX] 10.79 64.2; 60.07 4.13 0.72 0.59 3.71
rRNA 1J5A 2717!L:2747!L G:C WC [cWW][XIX] 10.98 55.05; 51.04 4.01 -1.8 0.27 24.29
rRNA 1J5A 2718!L:2746!L A:G WC [cWW][VIII] 12.63 54.34; 43.0 11.34 5.06 0.4 18.96
rRNA 1J5A 2719!L:2746!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 9.58 74.69; 47.78 26.91 -19.32 2.41 2.13
rRNA 1J5A 2719!L:2744!L U:A rH_1 [tWH][XXIV] 8.97 39.84; 30.46 9.37 -161.09 0.47 16.98
rRNA 1J5A 2721!L:2743!L A:G S [tSH][XI] 9.9 11.71; 97.36 85.65 -15.79 0.19 9.68
rRNA 1J5A 2722!L:2742!L C:G WC_Mo [cWW][XIX] 10.67 61.88; 61.7 0.18 -0.72 0.11 15.44
rRNA 1J5A 2723!L:2741!L C:G WC_Mo [cWW][XIX] 10.82 67.17; 65.17 2.0 -4.07 0.3 8.02
rRNA 1J5A 2724!L:2740!L G:C Wb [---][-] 10.44 47.69; 69.65 21.97 -0.13 0.05 11.39
rRNA 1J5A 2725!L:2739!L C:G WC [cWW][XIX] 10.9 56.07; 56.75 0.68 2.45 0.47 6.93
rRNA 1J5A 2726!L:2736!L U:U rH_1 [tWH][-] 10.5 34.2; 13.39 20.81 -117.45 1.71 39.87
rRNA 1J5A 2729!L:2733!L A:A rH [tWH][V] 12.25 19.94; 22.93 2.99 127.08 1.13 27.46
rRNA 1J5A 2771!L:2781!L C:G Wb* [---][-] 11.3 48.4; 63.41 15.01 -27.74 0.38 32.87
rRNA 1J5A 2773!L:2779!L G:C WC [cWW][XIX] 11.32 54.51; 51.41 3.09 -3.44 1.67 22.81
rRNA 1J5A 2782!L:2867!L G:G rWC [---][-] 12.51 51.94; 29.43 22.52 -178.33 1.46 60.69
rRNA 1J5A 2785!L:2865!L A:G S [tSH][XI] 9.64 10.61; 97.63 87.03 16.27 0.55 26.73
rRNA 1J5A 2786!L:2864!L G:C Wb [---][-] 10.56 52.77; 68.77 16.0 0.2 0.66 12.94
rRNA 1J5A 2787!L:2863!L A:U WC [cWW][XX] 10.94 61.08; 49.99 11.09 0.83 0.55 11.67
rRNA 1J5A 2788!L:2862!L C:G WC [cWW][XIX] 10.78 59.97; 54.45 5.52 -4.88 0.39 14.6
rRNA 1J5A 2790!L:2806!L* C:G Wb* [---][-]; Wb* [---][-] 11.33 50.7; 64.17 13.47 -9.63 0.96 31.73
rRNA 1J5A 2791!L:2858!L C:A rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.48 115.77; 159.74 43.98 -12.66 1.71 20.52
rRNA 1J5A 2791!L:2805!L C:G WC_Mo [cWW][XIX] 10.57 64.59; 57.8 6.79 -21.2 0.05 35.69
rRNA 1J5A 2792!L:2804!L C:G WC [cWW][XIX] 10.8 59.51; 57.69 1.82 -4.65 0.68 15.01
rRNA 1J5A 2793!L:2803!L G:C WC [cWW][XIX] 10.95 54.51; 54.36 0.15 -8.85 0.51 16.0
rRNA 1J5A 2794!L:2802!L G:C WC [cWW][XIX] 11.18 50.82; 47.15 3.67 -6.06 0.31 29.8
rRNA 1J5A 2805!L:2858!L G:A rS [tSS][-] 8.32 86.69; 62.56 24.12 154.85 1.91 40.96
rRNA 1J5A 2806!L:2859!L G:U pS*(ps:O1P-O2*) [---][-] 9.9 122.61; 105.09 17.52 -25.96 2.1 11.13
rRNA 1J5A 2809!L:2858!L A:A S [tSH][-] 9.31 99.18; 18.84 80.34 43.82 0.22 47.6
rRNA 1J5A 2811!L:2857!L G:C WC [cWW][XIX] 11.26 49.16; 50.81 1.65 5.04 0.84 6.16
rRNA 1J5A 2812!L:2856!L A:U WC [cWW][XX] 10.99 53.54; 50.19 3.35 -0.08 0.22 15.74
rRNA 1J5A 2813!L:2855!L G:C WC [cWW][XIX] 11.08 54.18; 49.61 4.57 4.81 0.51 1.47
rRNA 1J5A 2814!L:2853!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.66 38.66; 67.28 28.62 -16.78 0.03 23.0
rRNA 1J5A 2815!L:2852!L C:G WC [cWW][XIX] 10.97 49.77; 51.48 1.72 -17.85 0.38 28.42
rRNA 1J5A 2816!L:2851!L C:G Wb [---][-] 10.67 62.64; 42.37 20.27 -12.75 0.05 19.89
rRNA 1J5A 2817!L:2850!L A:U WC [cWW][XX] 10.56 59.04; 54.68 4.36 -6.53 0.35 12.01
rRNA 1J5A 2818!L:2849!L G:C WC [cWW][XIX] 10.68 54.49; 60.41 5.92 -6.84 0.56 15.83
rRNA 1J5A 2819!L:2846!L G:G Wb [---][-] 13.07 26.44; 42.95 16.51 32.43 1.72 6.4
rRNA 1J5A 2820!L:2846!L C:G WC [cWW][XIX] 10.53 55.84; 56.81 0.97 -5.71 0.35 12.34
rRNA 1J5A 2821!L:2845!L G:C WC [cWW][XIX] 10.79 52.36; 59.89 7.53 -5.26 0.24 13.28
rRNA 1J5A 2822!L:2844!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.59 71.68; 38.82 32.86 -14.23 0.9 20.2
rRNA 1J5A 2823!L:2843!L G:A S [tSH][XI] 8.63 105.1; 13.39 91.71 -81.0 0.14 22.26
rRNA 1J5A 2823!L:2842!L G:C pfS(sb:O2*-N2) [---][-] 9.77 58.96; 154.79 95.83 -5.26 0.77 31.0
rRNA 1J5A 2827!L:2840!L G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.75 49.31; 62.26 12.96 -2.75 0.4 12.17
rRNA 1J5A 2828!L:2839!L C:G Wb [---][-] 10.89 64.37; 48.06 16.31 -5.21 0.42 9.77
rRNA 1J5A 2829!L:2838!L A:U WC [cWW][XX] 10.7 59.64; 56.32 3.32 -8.14 0.14 15.46
rRNA 1J5A 2830!L:2837!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.5 68.54; 44.81 23.73 -8.45 0.27 13.83
rRNA 1J5A 2831!L:2836!L A:U WC [cWW][XX] 10.75 52.05; 52.78 0.73 10.27 0.2 18.13
rRNA 1J5A 2832!L:2835!L G:A S(bp:N2-O2P)_2 [---][-] 10.16 100.64; 19.87 80.77 -123.77 1.28 14.65
rRNA 1J5A 2832!L:2834!L G:A S(sb:O2*-N7) [---][-] 7.82 95.58; 33.67 61.92 -167.38 1.5 32.78