Identified Basepairs and Their Conformations and Conformational Parameters

PDB Id: 1KOG BPC Identified: 125 Ambiguities: 0
RNA PDB Position bp bpC; LG [LW][Sanger] dCC <X ; <Y |<X - <Y| Torsion Z-Diff Buckle
Misc_RNA 1KOG 69!I:105!I G:C WC [cWW][XIX] 10.78 53.53; 55.6 2.07 0.6 0.35 3.81
Misc_RNA 1KOG 70!I:104!I G:C WC [cWW][XIX] 10.53 54.47; 57.63 3.16 -7.16 0.01 10.92
Misc_RNA 1KOG 71!I:103!I C:G WC [cWW][XIX] 10.82 53.01; 50.52 2.49 -12.98 0.66 10.94
Misc_RNA 1KOG 72!I:102!I G:C WC [cWW][XIX] 10.59 56.92; 55.18 1.74 -3.42 0.23 7.07
Misc_RNA 1KOG 73!I:101!I U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.54 65.51; 45.29 20.22 -10.2 0.1 18.45
Misc_RNA 1KOG 74!I:100!I A:U WC [cWW][XX] 10.43 57.94; 53.82 4.11 -27.76 0.19 26.56
Misc_RNA 1KOG 74!I:97!I A:C rH_1 [rWH][XXV] 10.7 6.15; 32.49 26.34 -115.42 0.04 2.2
Misc_RNA 1KOG 76!I:99!I G:C pfS*_1 [cWS][-] 7.57 134.87; 34.5 100.36 -36.61 0.25 37.27
Misc_RNA 1KOG 76!I:96!I G:C WC [cWW][XIX] 10.65 53.6; 58.56 4.95 -16.66 0.01 17.31
Misc_RNA 1KOG 77!I:95!I U:A WC [cWW][XX] 10.09 58.37; 60.61 2.24 -15.38 0.32 26.96
Misc_RNA 1KOG 78!I:94!I G:C WC [cWW][XIX] 10.44 58.11; 59.2 1.1 -3.36 0.22 5.77
Misc_RNA 1KOG 79!I:93!I A:U WC [cWW][XX] 10.57 54.94; 56.13 1.19 -10.56 0.03 15.91
Misc_RNA 1KOG 80!I:92!I U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.36 71.57; 46.79 24.78 -1.38 0.04 7.57
Misc_RNA 1KOG 81!I:91!I C:G WC [cWW][XIX] 10.46 57.36; 56.39 0.96 2.01 0.13 4.03
Misc_RNA 1KOG 82!I:90!I U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.3 71.42; 45.64 25.79 1.03 0.1 5.85
Misc_RNA 1KOG 97!I:99!I C:C pS [cSH][-] 8.77 115.64; 29.2 86.44 0.58 0.63 36.52
Misc_RNA 1KOG 69!J:105!J G:C WC [cWW][XIX] 10.75 53.12; 55.7 2.58 0.98 0.45 2.73
Misc_RNA 1KOG 70!J:104!J G:C WC [cWW][XIX] 10.51 54.76; 56.96 2.2 -7.02 0.0 9.49
Misc_RNA 1KOG 71!J:103!J C:G WC [cWW][XIX] 10.85 52.97; 49.48 3.48 -11.5 0.63 12.63
Misc_RNA 1KOG 72!J:102!J G:C WC [cWW][XIX] 10.55 56.48; 55.67 0.81 -2.24 0.25 7.42
Misc_RNA 1KOG 73!J:101!J U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.54 65.58; 44.81 20.77 -10.17 0.06 19.9
Misc_RNA 1KOG 74!J:100!J A:U WC [cWW][XX] 10.45 57.62; 53.26 4.36 -28.47 0.21 26.99
Misc_RNA 1KOG 74!J:97!J A:C rH_1 [rWH][XXV] 10.67 6.09; 31.58 25.49 -122.91 0.02 1.06
Misc_RNA 1KOG 76!J:99!J G:C pfS*_1 [cWS][-] 7.61 133.29; 34.13 99.16 -36.63 0.4 37.38
Misc_RNA 1KOG 76!J:96!J G:C WC [cWW][XIX] 10.62 53.26; 58.99 5.73 -15.44 0.04 16.55
Misc_RNA 1KOG 77!J:95!J U:A WC [cWW][XX] 10.11 58.45; 60.7 2.25 -16.61 0.29 27.41
Misc_RNA 1KOG 78!J:94!J G:C WC [cWW][XIX] 10.52 57.43; 59.55 2.12 -7.69 0.39 11.27
Misc_RNA 1KOG 79!J:93!J A:U WC [cWW][XX] 10.52 55.35; 55.98 0.63 -11.8 0.01 15.67
Misc_RNA 1KOG 80!J:92!J U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.32 71.37; 47.92 23.45 -1.08 0.0 4.77
Misc_RNA 1KOG 81!J:91!J C:G WC [cWW][XIX] 10.51 57.87; 56.04 1.83 1.2 0.44 3.42
Misc_RNA 1KOG 82!J:90!J U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.3 71.28; 45.55 25.73 -2.16 0.05 7.48
Misc_RNA 1KOG 69!K:105!K G:C WC [cWW][XIX] 10.08 45.42; 62.24 16.82 -34.92 0.19 49.95
Misc_RNA 1KOG 70!K:104!K G:C WC [cWW][XIX] 10.55 53.94; 56.25 2.31 1.58 0.35 16.86
Misc_RNA 1KOG 71!K:103!K C:G WC [cWW][XIX] 10.94 49.42; 45.75 3.66 -0.05 0.71 14.76
Misc_RNA 1KOG 72!K:102!K G:C WC [cWW][XIX] 10.86 50.2; 50.76 0.56 4.71 0.06 5.17
Misc_RNA 1KOG 73!K:101!K U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.69 61.66; 46.82 14.84 -5.47 0.15 18.55
Misc_RNA 1KOG 74!K:100!K A:U WC [cWW][XX] 11.05 49.66; 47.02 2.64 -3.97 0.41 22.64
Misc_RNA 1KOG 76!K:99!K G:C pfS*_1 [cWS][-] 7.67 140.49; 33.68 106.81 -23.04 1.55 71.8
Misc_RNA 1KOG 76!K:96!K G:C WC [cWW][XIX] 10.55 56.84; 58.38 1.55 -21.02 0.21 31.2
Misc_RNA 1KOG 77!K:95!K U:A WC [cWW][XX] 10.08 58.73; 57.46 1.27 -0.8 0.52 17.89
Misc_RNA 1KOG 78!K:94!K G:C WC [cWW][XIX] 10.55 53.85; 51.19 2.66 6.48 0.9 7.76
Misc_RNA 1KOG 79!K:93!K A:U WC [cWW][XX] 10.96 45.27; 57.23 11.96 -4.49 0.64 30.89
Misc_RNA 1KOG 80!K:92!K U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.72 68.77; 44.8 23.98 -11.62 0.38 30.76
Misc_RNA 1KOG 81!K:91!K C:G WC [cWW][XIX] 10.62 52.6; 52.98 0.38 18.41 1.28 5.33
Misc_RNA 1KOG 82!K:90!K U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.3 65.81; 39.22 26.59 21.7 1.14 21.91
Misc_RNA 1KOG 83!K:90!K U:G pS [---][-] 7.04 117.94; 32.43 85.5 -14.98 2.19 15.52
Misc_RNA 1KOG 69!L:105!L G:C WC [cWW][XIX] 10.73 53.69; 56.17 2.48 -1.16 0.37 3.54
Misc_RNA 1KOG 70!L:104!L G:C WC [cWW][XIX] 10.53 55.02; 57.04 2.02 -6.56 0.11 11.49
Misc_RNA 1KOG 71!L:103!L C:G WC [cWW][XIX] 10.83 52.97; 49.74 3.23 -11.97 0.63 11.7
Misc_RNA 1KOG 72!L:102!L G:C WC [cWW][XIX] 10.61 55.98; 54.57 1.41 -0.95 0.2 5.9
Misc_RNA 1KOG 73!L:101!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.51 65.21; 45.3 19.92 -10.58 0.02 19.05
Misc_RNA 1KOG 74!L:100!L A:U WC [cWW][XX] 10.47 57.41; 53.98 3.44 -28.39 0.11 26.7
Misc_RNA 1KOG 74!L:97!L A:C rH_1 [rWH][XXV] 10.67 6.44; 31.7 25.26 -118.69 0.02 2.18
Misc_RNA 1KOG 76!L:99!L G:C pfS*_1 [cWS][-] 7.55 134.32; 35.03 99.29 -36.83 0.34 36.47
Misc_RNA 1KOG 76!L:96!L G:C WC [cWW][XIX] 10.67 53.24; 57.78 4.55 -13.93 0.01 18.23
Misc_RNA 1KOG 77!L:95!L U:A WC [cWW][XX] 10.09 58.52; 59.94 1.42 -14.71 0.36 23.19
Misc_RNA 1KOG 78!L:94!L G:C WC [cWW][XIX] 10.5 56.47; 59.97 3.5 -5.49 0.31 7.59
Misc_RNA 1KOG 79!L:93!L A:U WC [cWW][XX] 10.55 54.74; 55.52 0.77 -11.97 0.07 15.13
Misc_RNA 1KOG 80!L:92!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.38 71.28; 46.94 24.34 -2.11 0.06 7.33
Misc_RNA 1KOG 81!L:91!L C:G WC [cWW][XIX] 10.51 57.54; 55.94 1.6 0.62 0.28 3.39
Misc_RNA 1KOG 82!L:90!L U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.31 71.18; 45.19 25.99 0.05 0.09 7.56
Misc_RNA 1KOG 97!L:99!L C:C pS [cSH][-] 8.75 114.71; 29.05 85.66 3.64 0.76 36.72
Misc_RNA 1KOG 69!M:105!M G:C WC [cWW][XIX] 10.71 53.28; 56.31 3.03 -2.12 0.59 0.28
Misc_RNA 1KOG 70!M:104!M G:C WC [cWW][XIX] 10.52 55.99; 57.35 1.36 -8.88 0.03 11.27
Misc_RNA 1KOG 71!M:103!M C:G WC [cWW][XIX] 10.85 52.7; 49.58 3.12 -13.21 0.48 13.4
Misc_RNA 1KOG 72!M:102!M G:C WC [cWW][XIX] 10.63 55.98; 54.3 1.68 0.91 0.1 8.35
Misc_RNA 1KOG 73!M:101!M U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.54 65.56; 44.35 21.21 -12.06 0.17 18.88
Misc_RNA 1KOG 74!M:100!M A:U WC [cWW][XX] 10.48 57.43; 53.72 3.71 -24.14 0.15 26.08
Misc_RNA 1KOG 74!M:97!M A:C rH_1 [rWH][XXV] 10.67 4.03; 31.61 27.59 -155.22 0.4 0.81
Misc_RNA 1KOG 76!M:99!M G:C pfS*_1 [cWS][-] 7.6 133.62; 34.66 98.95 -37.56 0.52 34.92
Misc_RNA 1KOG 76!M:96!M G:C WC [cWW][XIX] 10.66 53.2; 58.54 5.35 -19.0 0.21 19.98
Misc_RNA 1KOG 77!M:95!M U:A WC [cWW][XX] 10.1 58.55; 59.83 1.27 -18.75 0.58 25.74
Misc_RNA 1KOG 78!M:94!M G:C WC [cWW][XIX] 10.5 56.17; 58.54 2.37 -6.95 0.46 7.87
Misc_RNA 1KOG 79!M:93!M A:U WC [cWW][XX] 10.52 54.89; 57.1 2.21 -12.6 0.05 13.35
Misc_RNA 1KOG 80!M:92!M U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.35 70.82; 47.6 23.22 -3.45 0.0 7.76
Misc_RNA 1KOG 81!M:91!M C:G WC [cWW][XIX] 10.58 56.74; 55.56 1.18 2.96 0.29 3.75
Misc_RNA 1KOG 82!M:90!M U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.37 69.66; 44.05 25.61 -2.09 0.12 6.33
Misc_RNA 1KOG 97!M:99!M C:C pS [cSH][-] 8.81 114.6; 29.34 85.26 0.74 0.58 34.83
Misc_RNA 1KOG 69!N:105!N G:C WC [cWW][XIX] 10.7 53.58; 56.19 2.61 -0.13 0.41 0.85
Misc_RNA 1KOG 70!N:104!N G:C WC [cWW][XIX] 10.55 55.5; 56.7 1.2 -7.36 0.25 14.22
Misc_RNA 1KOG 71!N:103!N C:G WC [cWW][XIX] 10.83 52.8; 49.52 3.27 -11.33 0.62 10.93
Misc_RNA 1KOG 72!N:102!N G:C WC [cWW][XIX] 10.57 56.88; 55.03 1.85 -2.29 0.26 7.21
Misc_RNA 1KOG 73!N:101!N U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.51 65.92; 44.72 21.19 -11.4 0.17 19.75
Misc_RNA 1KOG 74!N:100!N A:U WC [cWW][XX] 10.4 58.08; 54.15 3.93 -25.6 0.02 26.71
Misc_RNA 1KOG 74!N:97!N A:C rH_1 [rWH][XXV] 10.66 4.34; 33.13 28.8 -126.75 0.22 0.58
Misc_RNA 1KOG 76N:99!N G:C pfS*_1 [cWS][-] 7.54 135.82; 34.24 101.58 -38.26 0.34 35.77
Misc_RNA 1KOG 76!N:96!N G:C WC [cWW][XIX] 10.62 54.53; 58.5 3.97 -17.67 0.01 19.23
Misc_RNA 1KOG 77!N:95!N U:A WC [cWW][XX] 10.05 59.19; 60.14 0.95 -15.78 0.43 24.36
Misc_RNA 1KOG 78!N:94!N G:C WC [cWW][XIX] 10.52 55.9; 58.62 2.71 -5.16 0.28 6.44
Misc_RNA 1KOG 79!N:93!N A:U WC [cWW][XX] 10.55 53.98; 55.66 1.69 -10.09 0.07 14.73
Misc_RNA 1KOG 80!N:92!N U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.33 71.67; 47.47 24.19 -3.88 0.03 9.93
Misc_RNA 1KOG 81!N:91!N C:G WC [cWW][XIX] 10.5 57.21; 56.23 0.98 1.93 0.0 3.36
Misc_RNA 1KOG 82!N:90!N U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.28 71.35; 44.59 26.76 0.87 0.21 7.06
Misc_RNA 1KOG 97!N:99!N C:C pS [cSH][-] 8.74 116.71; 29.02 87.69 1.29 0.52 34.54
Misc_RNA 1KOG 69!O:105!O G:C WC [cWW][XIX] 10.7 53.86; 56.56 2.7 0.19 0.25 3.61
Misc_RNA 1KOG 70!O:104!O G:C WC [cWW][XIX] 10.51 54.96; 57.51 2.54 -7.97 0.03 11.1
Misc_RNA 1KOG 71!O:103!O C:G WC [cWW][XIX] 10.87 51.91; 49.34 2.57 -11.68 0.54 13.61
Misc_RNA 1KOG 72!O:102!O G:C WC [cWW][XIX] 10.59 55.8; 54.28 1.51 -1.99 0.23 6.63
Misc_RNA 1KOG 73!O:101!O U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.53 64.73; 44.36 20.37 -12.24 0.03 21.58
Misc_RNA 1KOG 74!O:100!O A:U WC [cWW][XX] 10.51 54.76; 53.6 1.16 -26.55 0.12 21.18
Misc_RNA 1KOG 74!O:97!O A:C rH_1 [rWH][XXV] 10.57 6.6; 31.0 24.4 -163.92 0.71 3.11
Misc_RNA 1KOG 76!O:96!O G:C WC [cWW][XIX] 10.68 53.59; 57.27 3.68 -16.93 0.09 16.03
Misc_RNA 1KOG 77!O:95!O U:A WC [cWW][XX] 10.05 59.5; 59.26 0.24 -18.7 0.36 25.26
Misc_RNA 1KOG 78!O:94!O G:C WC [cWW][XIX] 10.44 57.12; 59.22 2.11 -7.95 0.3 5.64
Misc_RNA 1KOG 79!O:93!O A:U WC [cWW][XX] 10.51 54.75; 56.64 1.9 -15.08 0.11 17.25
Misc_RNA 1KOG 80!O:92!O U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.28 71.89; 48.2 23.7 -3.09 0.11 6.08
Misc_RNA 1KOG 81!O:91!O C:G WC [cWW][XIX] 10.57 56.67; 55.95 0.72 0.35 0.35 5.48
Misc_RNA 1KOG 82!O:90!O U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.29 70.52; 44.57 25.95 -4.02 0.09 7.03
Misc_RNA 1KOG 97!O:99!O C:C pS [cSH][-] 8.77 114.58; 30.0 84.58 2.06 0.47 29.54
Misc_RNA 1KOG 69!P:105!P G:C WC [cWW][XIX] 10.78 53.81; 55.47 1.66 -2.78 0.5 0.51
Misc_RNA 1KOG 70!P:104!P G:C WC [cWW][XIX] 10.52 55.67; 57.24 1.57 -7.96 0.03 12.69
Misc_RNA 1KOG 71!P:103!P C:G WC [cWW][XIX] 10.85 52.61; 50.59 2.02 -12.21 0.55 11.45
Misc_RNA 1KOG 72!P:102!P G:C WC [cWW][XIX] 10.63 56.67; 54.67 2.0 -1.15 0.11 5.82
Misc_RNA 1KOG 73!P:101!P U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.58 64.97; 44.87 20.1 -11.01 0.06 19.58
Misc_RNA 1KOG 74!P:100!P A:U WC [cWW][XX] 10.45 57.29; 53.52 3.77 -26.78 0.08 26.82
Misc_RNA 1KOG 74!P:97!P A:C rH_1 [rWH][XXV] 10.68 5.63; 32.14 26.51 -129.1 0.11 0.55
Misc_RNA 1KOG 76!P:99!P G:C pfS*_1 [cWS][-] 7.57 134.64; 34.35 100.29 -38.2 0.21 37.09
Misc_RNA 1KOG 76!P:96!P G:C WC [cWW][XIX] 10.64 53.52; 57.79 4.27 -17.13 0.06 17.69
Misc_RNA 1KOG 77!P:95!P U:A WC [cWW][XX] 10.06 59.02; 59.96 0.93 -15.55 0.54 23.76
Misc_RNA 1KOG 78!P:94!P G:C WC [cWW][XIX] 10.46 57.2; 59.64 2.44 -7.4 0.47 7.02
Misc_RNA 1KOG 79!P:93!P A:U WC [cWW][XX] 10.58 53.85; 56.26 2.41 -9.28 0.11 13.74
Misc_RNA 1KOG 80!P:92!P U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.36 71.28; 47.12 24.16 -4.03 0.22 6.22
Misc_RNA 1KOG 81!P:91!P C:G WC [cWW][XIX] 10.51 57.28; 56.08 1.19 2.66 0.22 3.55
Misc_RNA 1KOG 82!P:90!P U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.28 70.52; 44.57 25.96 -1.22 0.01 8.39
Misc_RNA 1KOG 97!P:99!P C:C pS [cSH][-] 8.79 115.14; 29.64 85.51 2.79 0.61 36.6