Identified Basepairs and Their Conformations and Conformational Parameters

PDB Id: 1YYW BPC Identified: 48 Ambiguities: 0
RNA PDB Position bp bpC; LG [LW][Sanger] dCC <X ; <Y |<X - <Y| Torsion Z-Diff Buckle
dsRNA 1YYW 1!E:24!F A:U WC [cWW][XX] 10.88 46.93; 54.9 7.97 -5.71 0.41 1.93
dsRNA 1YYW 2!E:23!F A:U WC [cWW][XX] 10.15 59.46; 59.37 0.09 -6.18 0.07 7.41
dsRNA 1YYW 3!E:22!F A:U WC [cWW][XX] 10.04 61.55; 63.65 2.1 -13.37 0.02 18.44
dsRNA 1YYW 4!E:21!F U:A WC [cWW][XX] 10.83 49.99; 53.15 3.16 -5.6 0.08 13.31
dsRNA 1YYW 5!E:20!F A:U WC [cWW][XX] 10.5 54.59; 58.13 3.54 -4.1 0.42 4.57
dsRNA 1YYW 6!E:19!F U:A WC [cWW][XX] 10.4 59.21; 53.28 5.93 -8.59 0.34 7.5
dsRNA 1YYW 7!E:18!F A:U WC [cWW][XX] 10.49 57.02; 56.11 0.91 -7.97 0.01 12.98
dsRNA 1YYW 8!E:17!F U:A WC [cWW][XX] 10.23 60.87; 57.33 3.55 -3.82 0.11 13.52
dsRNA 1YYW 9!E:16!F A:U WC [cWW][XX] 10.32 60.1; 57.44 2.66 -8.25 0.12 14.84
dsRNA 1YYW 10!E:15!F U:A WC [cWW][XX] 10.48 52.85; 57.13 4.27 -9.56 0.01 18.42
dsRNA 1YYW 11!E:14!F U:A WC [cWW][XX] 10.24 60.99; 55.92 5.08 -9.78 0.4 10.19
dsRNA 1YYW 12!E:13!F U:A WC [cWW][XX] 10.5 57.78; 52.85 4.93 -5.73 0.15 6.47
dsRNA 1YYW 1!G:24!H A:U WC [cWW][XX] 10.74 52.24; 56.41 4.17 -13.16 0.08 19.6
dsRNA 1YYW 2!G:23!H A:U WC [cWW][XX] 10.61 55.78; 52.37 3.41 -10.89 0.68 20.45
dsRNA 1YYW 3!G:22!H A:U WC [cWW][XX] 10.64 48.82; 56.9 8.07 -13.74 0.22 21.17
dsRNA 1YYW 4!G:21!H U:A WC [cWW][XX] 10.38 55.74; 52.34 3.41 -13.25 0.48 22.04
dsRNA 1YYW 5!G:20!H A:U WC [cWW][XX] 10.5 56.43; 54.64 1.8 -9.45 0.02 12.97
dsRNA 1YYW 6!G:19!H U:A WC [cWW][XX] 10.41 58.06; 52.3 5.76 -2.55 0.13 6.99
dsRNA 1YYW 7!G:18!H A:U WC [cWW][XX] 10.64 54.25; 50.85 3.41 -4.46 0.01 10.11
dsRNA 1YYW 8!G:17!H U:A WC [cWW][XX] 10.72 54.37; 50.86 3.51 0.59 0.45 9.62
dsRNA 1YYW 9!G:16!H A:U WC [cWW][XX] 10.54 60.11; 55.83 4.28 -8.0 0.04 11.3
dsRNA 1YYW 10!G:15!H U:A WC [cWW][XX] 10.64 56.98; 54.05 2.93 -5.34 0.39 11.08
dsRNA 1YYW 11!G:14!H U:A WC [cWW][XX] 10.61 53.05; 54.66 1.6 -8.92 0.02 10.42
dsRNA 1YYW 12!G:13!H U:A WC [cWW][XX] 10.46 57.59; 53.71 3.89 1.43 0.06 0.78
dsRNA 1YYW 1!I:24!J A:U WC [cWW][XX] 10.21 54.61; 58.32 3.71 -8.98 0.2 8.38
dsRNA 1YYW 2!I:23!J A:U WC [cWW][XX] 10.32 54.77; 56.34 1.56 -4.15 0.08 6.81
dsRNA 1YYW 3!I:22!J A:U WC [cWW][XX] 10.4 61.66; 55.02 6.64 -12.33 0.2 20.37
dsRNA 1YYW 4!I:21!J U:A WC [cWW][XX] 10.79 54.54; 54.53 0.01 -3.31 0.19 8.46
dsRNA 1YYW 5!I:20!J A:U WC [cWW][XX] 10.52 56.73; 55.69 1.04 -5.56 0.32 6.6
dsRNA 1YYW 6!I:19!J U:A WC [cWW][XX] 10.34 61.07; 54.38 6.68 -9.45 0.32 10.7
dsRNA 1YYW 7!I:18!J A:U WC [cWW][XX] 10.45 54.65; 55.98 1.33 -3.95 0.17 13.68
dsRNA 1YYW 8!I:17!J U:A WC [cWW][XX] 10.63 54.51; 54.9 0.39 -1.85 0.13 4.69
dsRNA 1YYW 9!I:16!J A:U WC [cWW][XX] 10.77 53.8; 51.33 2.47 -6.37 0.26 13.34
dsRNA 1YYW 10!I:15!J U:A WC [cWW][XX] 10.45 53.64; 54.92 1.28 -9.1 0.04 14.83
dsRNA 1YYW 11!I:14!J U:A WC [cWW][XX] 10.54 54.06; 57.36 3.3 -8.65 0.44 7.47
dsRNA 1YYW 12!I:13!J U:A WC [cWW][XX] 10.67 57.12; 50.48 6.64 -8.62 0.04 8.34
dsRNA 1YYW 1!K:24!L A:U WC [cWW][XX] 10.73 53.7; 52.09 1.6 -5.56 0.36 10.55
dsRNA 1YYW 2!K:23!L A:U WC [cWW][XX] 10.64 52.82; 54.56 1.75 -11.95 0.29 14.32
dsRNA 1YYW 3!K:22!L A:U WC [cWW][XX] 10.44 52.12; 57.98 5.86 -11.91 0.24 13.87
dsRNA 1YYW 4!K:21!L U:A WC [cWW][XX] 10.45 57.67; 56.26 1.41 -8.77 0.0 19.51
dsRNA 1YYW 5!K:20!L A:U WC [cWW][XX] 10.58 56.72; 55.35 1.36 -1.79 1.02 20.65
dsRNA 1YYW 6!K:19!L U:A WC [cWW][XX] 10.48 55.82; 56.1 0.27 -2.55 0.23 10.22
dsRNA 1YYW 7!K:18!L A:U WC [cWW][XX] 10.76 52.97; 53.01 0.04 -6.02 0.59 17.3
dsRNA 1YYW 8!K:17!L U:A WC [cWW][XX] 10.9 51.11; 57.2 6.09 -8.04 0.03 8.83
dsRNA 1YYW 9!K:16!L A:U WC [cWW][XX] 10.66 52.36; 56.68 4.32 -6.77 0.01 10.72
dsRNA 1YYW 10!K:15!L U:A WC [cWW][XX] 10.6 52.22; 57.86 5.65 -14.46 0.42 14.26
dsRNA 1YYW 11!K:14!L U:A WC [cWW][XX] 10.52 52.46; 55.77 3.3 -12.22 0.32 12.73
dsRNA 1YYW 12!K:13!L U:A WC [cWW][XX] 10.62 51.31; 54.93 3.62 -5.07 0.19 4.66