Identified Basepairs and Their Conformations and Conformational Parameters

PDB Id: 2HO6 BPC Identified: 75 Ambiguities: 0
RNA PDB Position bp bpC; LG [LW][Sanger] dCC <X ; <Y |<X - <Y| Torsion Z-Diff Buckle
Riboswitch 2HO6 2!A:64!B C:G WC [cWW][XIX] 10.56 56.87; 56.18 0.7 0.1 0.02 5.66
Riboswitch 2HO6 3!A:63!B G:C WC [cWW][XIX] 10.38 53.37; 56.87 3.51 -1.08 0.34 14.32
Riboswitch 2HO6 4!A:62!B C:G WC [cWW][XIX] 10.63 56.42; 53.41 3.01 -3.86 0.11 7.7
Riboswitch 2HO6 5!A:61!B C:G WC [cWW][XIX] 10.6 59.56; 54.01 5.55 8.58 0.31 4.6
Riboswitch 2HO6 7!A:60!B G:C WC [cWW][XIX] 10.58 55.44; 58.09 2.65 4.49 0.25 7.42
Riboswitch 2HO6 7!A:34!B G:G S_1 [tSH][-] 11.53 8.59; 83.86 75.27 36.47 0.1 7.17
Riboswitch 2HO6 8!A:58!B G:A rS [tSS][-] 8.12 88.36; 60.1 28.26 126.19 1.36 64.72
Riboswitch 2HO6 8!A:33!B G:U Wb [cWW][XXVIII] 11.22 33.7; 59.55 25.86 -3.77 0.73 26.84
Riboswitch 2HO6 9!A:32!B A:U WC [cWW][XX] 10.54 52.48; 55.55 3.07 -11.27 0.54 20.89
Riboswitch 2HO6 10!A:117!B C:A rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] 5.97 106.66; 149.36 42.7 -39.3 2.02 1.94
Riboswitch 2HO6 10!A:31!B C:G WC [cWW][XIX] 10.52 55.56; 54.34 1.22 -13.59 0.22 23.05
Riboswitch 2HO6 11!A:116!B U:G rpS [cSS][-] 5.59 150.98; 98.74 52.24 -62.67 0.04 27.57
Riboswitch 2HO6 11!A:30!B U:A WC [cWW][XX] 10.39 56.2; 54.19 2.01 -10.01 0.04 16.24
Riboswitch 2HO6 12!A:115!B U:C fS(sb:O2*-N3) [---][-] 7.61 163.5; 37.18 126.32 151.3 0.7 42.98
Riboswitch 2HO6 12!A:29!B U:A WC [cWW][XX] 10.24 58.56; 53.44 5.12 -7.89 0.03 10.18
Riboswitch 2HO6 13!A:28!B A:U H_1 [cWH][XXIII] 10.31 29.41; 59.59 30.18 0.92 0.3 15.3
Riboswitch 2HO6 14!A:27!B A:U WC [cWW][XX] 10.23 59.13; 56.22 2.91 -9.67 0.34 15.17
Riboswitch 2HO6 15!A:26!B A:U WC [cWW][XX] 10.34 55.22; 55.57 0.35 -6.33 0.34 14.77
Riboswitch 2HO6 16!A:25!B G:C WC [cWW][XIX] 10.28 56.72; 61.29 4.57 -2.96 0.14 6.98
Riboswitch 2HO6 17!A:24!B C:G WC [cWW][XIX] 10.77 57.99; 56.03 1.97 -2.15 0.09 11.28
Riboswitch 2HO6 18!A:23!B C:G WC [cWW][XIX] 10.65 57.42; 55.81 1.61 0.61 0.07 4.52
Riboswitch 2HO6 31!B:117!B G:A rS [tSS][-] 8.26 88.78; 60.52 28.26 158.61 1.03 24.59
Riboswitch 2HO6 34!B:60!B G:C pS*(bs:N4-O2*) [---][-] 9.19 143.55; 13.06 130.49 -0.6 0.27 10.93
Riboswitch 2HO6 35!B:36!B A:C pS* [cHS][-] 6.8 142.23; 40.59 101.63 33.51 0.32 32.74
Riboswitch 2HO6 36!B:105!B C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.4 131.57; 93.98 37.59 -84.42 0.66 59.27
Riboswitch 2HO6 36!B:53!B C:G WC [cWW][XIX] 10.54 55.94; 53.15 2.79 0.69 0.33 12.74
Riboswitch 2HO6 37!B:127!B G:A fS [tSW][X] 10.01 99.97; 46.4 53.56 112.51 1.03 63.02
Riboswitch 2HO6 37!B:104!B G:A rpS(sb:O2*-N3) [---][-] 5.51 142.62; 90.08 52.53 -69.55 1.14 62.63
Riboswitch 2HO6 37!B:52!B G:C WC [cWW][XIX] 10.59 54.0; 56.7 2.7 -2.43 0.33 7.3
Riboswitch 2HO6 38!B:51!B A:U WC [cWW][XX] 10.2 59.05; 55.3 3.75 -5.36 0.06 7.4
Riboswitch 2HO6 42!B:73!B C:G WC [cWW][XIX] 10.56 56.04; 54.67 1.37 -8.21 0.04 12.73
Riboswitch 2HO6 43!B:72!B A:U WC [cWW][XX] 10.17 61.54; 56.03 5.51 -8.72 0.3 17.73
Riboswitch 2HO6 44!B:71!B G:C WC [cWW][XIX] 10.51 56.57; 53.29 3.28 -5.41 0.01 11.18
Riboswitch 2HO6 45!B:70!B G:C WC [cWW][XIX] 10.53 54.39; 54.3 0.09 -6.2 0.18 15.04
Riboswitch 2HO6 46!B:69!B G:C WC [cWW][XIX] 10.64 56.18; 51.54 4.64 -13.63 0.65 31.94
Riboswitch 2HO6 47!B:68!B U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.75 65.69; 37.71 27.98 -10.33 0.42 22.24
Riboswitch 2HO6 48!B:50!B U:A H_1 [cWH][XXIII] 7.96 70.0; 55.18 14.83 6.77 0.03 8.87
Riboswitch 2HO6 52!B:128!B C:G rpS [cSS][-] 5.54 131.73; 97.12 34.61 -88.65 0.19 56.47
Riboswitch 2HO6 53!B:127!B G:A rpS(sb:O2*-N3) [---][-] 5.64 142.25; 86.43 55.82 -71.34 1.94 64.07
Riboswitch 2HO6 53!B:104!B G:A fS [tSW][X] 9.99 98.84; 45.81 53.02 119.02 0.92 63.25
Riboswitch 2HO6 54!B:106!B A:A rS(sb:O2*-N1)_1 [tSS][-] 7.78 94.89; 55.38 39.51 169.55 0.15 40.51
Riboswitch 2HO6 54!B:59!B A:U rWC [tWW][XXI] 11.34 30.0; 38.65 8.64 -161.53 0.22 11.04
Riboswitch 2HO6 74!B:90!B C:G WC [cWW][XIX] 10.75 51.98; 53.93 1.95 -8.36 0.3 14.53
Riboswitch 2HO6 75!B:93!B G:A rS [tSS][-] 8.13 86.49; 56.61 29.89 148.1 1.49 46.04
Riboswitch 2HO6 75!B:89!B G:C WC [cWW][XIX] 10.66 54.49; 53.33 1.15 -17.43 0.34 28.84
Riboswitch 2HO6 76!B:88!B G:C WC [cWW][XIX] 10.72 55.99; 53.73 2.27 -8.96 0.38 9.7
Riboswitch 2HO6 77!B:87!B U:A WC [cWW][XX] 10.54 53.84; 55.07 1.23 -11.99 0.02 19.01
Riboswitch 2HO6 78!B:86!B C:G WC [cWW][XIX] 10.58 52.48; 52.94 0.46 -5.45 0.19 6.95
Riboswitch 2HO6 79!B:81!B U:C H_2 [---][-] 9.33 89.12; 28.97 60.15 -44.72 2.45 61.02
Riboswitch 2HO6 80!B:144!B U:A WC [cWW][XX] 10.56 52.78; 54.58 1.8 -17.14 0.42 19.57
Riboswitch 2HO6 81!B:143!B C:G WC [cWW][XIX] 10.52 56.08; 52.24 3.85 -9.7 0.42 16.16
Riboswitch 2HO6 82!B:142!B C:G WC [cWW][XIX] 10.29 57.31; 56.83 0.48 -6.02 0.0 8.76
Riboswitch 2HO6 83!B:141!B U:A WC [cWW][XX] 10.41 55.24; 57.18 1.93 -7.73 0.18 12.05
Riboswitch 2HO6 84!B:140!B G:C WC [cWW][XIX] 10.51 54.34; 55.24 0.91 -2.39 0.17 9.41
Riboswitch 2HO6 85!B:139!B C:G WC [cWW][XIX] 10.36 57.31; 58.35 1.03 -5.85 0.14 13.54
Riboswitch 2HO6 89!B:93!B C:A rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.79 102.03; 147.33 45.3 -42.77 1.77 18.61
Riboswitch 2HO6 90!B:91!B G:U pS* [cHS][-] 6.12 134.27; 52.78 81.48 49.41 0.75 38.67
Riboswitch 2HO6 95!B:137!B A:G S [tSH][XI] 9.46 11.53; 98.85 87.33 -3.15 0.49 12.39
Riboswitch 2HO6 96!B:136!B G:C WC [cWW][XIX] 10.42 56.47; 60.5 4.03 -5.1 0.06 10.56
Riboswitch 2HO6 97!B:135!B G:C WC [cWW][XIX] 10.4 55.18; 60.22 5.03 -1.73 0.1 8.35
Riboswitch 2HO6 98!B:134!B A:U WC [cWW][XX] 10.53 52.99; 56.44 3.45 -3.55 0.07 11.36
Riboswitch 2HO6 99!B:133!B C:G WC [cWW][XIX] 10.43 54.13; 58.29 4.16 -9.99 0.03 15.57
Riboswitch 2HO6 100!B:132!B U:A WC [cWW][XX] 10.32 54.89; 58.21 3.32 -10.2 0.05 11.07
Riboswitch 2HO6 101!B:131!B G:C WC [cWW][XIX] 10.72 56.83; 54.09 2.73 -18.81 0.45 25.0
Riboswitch 2HO6 102!B:129!B G:A S [tSH][XI] 10.8 77.12; 24.03 53.09 176.22 0.24 5.88
Riboswitch 2HO6 105!B:126!B A:U rH_1 [tWH][XXIV] 10.16 13.87; 34.42 20.55 170.96 0.25 4.63
Riboswitch 2HO6 106!B:125!B A:A rH [tWH][V] 12.17 18.56; 24.93 6.37 137.68 0.31 18.16
Riboswitch 2HO6 108!B:123!B C:G WC [cWW][XIX] 10.66 50.56; 55.77 5.21 -10.34 0.2 22.81
Riboswitch 2HO6 109!B:122!B C:G WC [cWW][XIX] 10.8 52.7; 53.89 1.19 -8.57 0.19 12.99
Riboswitch 2HO6 110!B:121!B A:U WC [cWW][XX] 10.53 53.3; 55.19 1.89 -10.28 0.0 14.16
Riboswitch 2HO6 111!B:120!B C:G WC [cWW][XIX] 10.47 55.16; 52.54 2.62 -5.57 0.06 14.86
Riboswitch 2HO6 112!B:119!B A:U WC [cWW][XX] 10.38 58.58; 56.57 2.01 -5.64 0.14 11.09
Riboswitch 2HO6 113!B:118!B G:C WC [cWW][XIX] 10.54 56.18; 57.84 1.67 6.09 0.22 2.58
Riboswitch 2HO6 114!B:117!B G:A S_mo [tSH][XI] 9.95 85.66; 20.58 65.08 -151.24 0.82 23.68
Riboswitch 2HO6 114!B:116!B G:G S(sb:O2*-N7)_1 [---][-] 7.4 82.18; 35.66 46.53 -173.46 2.66 30.1