RNA | PDB | Position | bp | bpC; LG [LW][Sanger] | dCC | <X ; <Y | |<X - <Y| | Torsion | Z-Diff | Buckle |
Riboswitch | 2HO6 | 2!A:64!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.56 | 56.87; 56.18 | 0.7 | 0.1 | 0.02 | 5.66 |
Riboswitch | 2HO6 | 3!A:63!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.38 | 53.37; 56.87 | 3.51 | -1.08 | 0.34 | 14.32 |
Riboswitch | 2HO6 | 4!A:62!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.63 | 56.42; 53.41 | 3.01 | -3.86 | 0.11 | 7.7 |
Riboswitch | 2HO6 | 5!A:61!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.6 | 59.56; 54.01 | 5.55 | 8.58 | 0.31 | 4.6 |
Riboswitch | 2HO6 | 7!A:60!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.58 | 55.44; 58.09 | 2.65 | 4.49 | 0.25 | 7.42 |
Riboswitch | 2HO6 | 7!A:34!B | G:G | S_1 [tSH][-] | 11.53 | 8.59; 83.86 | 75.27 | 36.47 | 0.1 | 7.17 |
Riboswitch | 2HO6 | 8!A:58!B | G:A | rS [tSS][-] | 8.12 | 88.36; 60.1 | 28.26 | 126.19 | 1.36 | 64.72 |
Riboswitch | 2HO6 | 8!A:33!B | G:U | Wb [cWW][XXVIII] | 11.22 | 33.7; 59.55 | 25.86 | -3.77 | 0.73 | 26.84 |
Riboswitch | 2HO6 | 9!A:32!B | A:U | WC [cWW][XX] | 10.54 | 52.48; 55.55 | 3.07 | -11.27 | 0.54 | 20.89 |
Riboswitch | 2HO6 | 10!A:117!B | C:A | rpS(ss:O2*-O2*)_1 [cSS][-] | 5.97 | 106.66; 149.36 | 42.7 | -39.3 | 2.02 | 1.94 |
Riboswitch | 2HO6 | 10!A:31!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.52 | 55.56; 54.34 | 1.22 | -13.59 | 0.22 | 23.05 |
Riboswitch | 2HO6 | 11!A:116!B | U:G | rpS [cSS][-] | 5.59 | 150.98; 98.74 | 52.24 | -62.67 | 0.04 | 27.57 |
Riboswitch | 2HO6 | 11!A:30!B | U:A | WC [cWW][XX] | 10.39 | 56.2; 54.19 | 2.01 | -10.01 | 0.04 | 16.24 |
Riboswitch | 2HO6 | 12!A:115!B | U:C | fS(sb:O2*-N3) [---][-] | 7.61 | 163.5; 37.18 | 126.32 | 151.3 | 0.7 | 42.98 |
Riboswitch | 2HO6 | 12!A:29!B | U:A | WC [cWW][XX] | 10.24 | 58.56; 53.44 | 5.12 | -7.89 | 0.03 | 10.18 |
Riboswitch | 2HO6 | 13!A:28!B | A:U | H_1 [cWH][XXIII] | 10.31 | 29.41; 59.59 | 30.18 | 0.92 | 0.3 | 15.3 |
Riboswitch | 2HO6 | 14!A:27!B | A:U | WC [cWW][XX] | 10.23 | 59.13; 56.22 | 2.91 | -9.67 | 0.34 | 15.17 |
Riboswitch | 2HO6 | 15!A:26!B | A:U | WC [cWW][XX] | 10.34 | 55.22; 55.57 | 0.35 | -6.33 | 0.34 | 14.77 |
Riboswitch | 2HO6 | 16!A:25!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.28 | 56.72; 61.29 | 4.57 | -2.96 | 0.14 | 6.98 |
Riboswitch | 2HO6 | 17!A:24!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.77 | 57.99; 56.03 | 1.97 | -2.15 | 0.09 | 11.28 |
Riboswitch | 2HO6 | 18!A:23!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.65 | 57.42; 55.81 | 1.61 | 0.61 | 0.07 | 4.52 |
Riboswitch | 2HO6 | 31!B:117!B | G:A | rS [tSS][-] | 8.26 | 88.78; 60.52 | 28.26 | 158.61 | 1.03 | 24.59 |
Riboswitch | 2HO6 | 34!B:60!B | G:C | pS*(bs:N4-O2*) [---][-] | 9.19 | 143.55; 13.06 | 130.49 | -0.6 | 0.27 | 10.93 |
Riboswitch | 2HO6 | 35!B:36!B | A:C | pS* [cHS][-] | 6.8 | 142.23; 40.59 | 101.63 | 33.51 | 0.32 | 32.74 |
Riboswitch | 2HO6 | 36!B:105!B | C:A | rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] | 5.4 | 131.57; 93.98 | 37.59 | -84.42 | 0.66 | 59.27 |
Riboswitch | 2HO6 | 36!B:53!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.54 | 55.94; 53.15 | 2.79 | 0.69 | 0.33 | 12.74 |
Riboswitch | 2HO6 | 37!B:127!B | G:A | fS [tSW][X] | 10.01 | 99.97; 46.4 | 53.56 | 112.51 | 1.03 | 63.02 |
Riboswitch | 2HO6 | 37!B:104!B | G:A | rpS(sb:O2*-N3) [---][-] | 5.51 | 142.62; 90.08 | 52.53 | -69.55 | 1.14 | 62.63 |
Riboswitch | 2HO6 | 37!B:52!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.59 | 54.0; 56.7 | 2.7 | -2.43 | 0.33 | 7.3 |
Riboswitch | 2HO6 | 38!B:51!B | A:U | WC [cWW][XX] | 10.2 | 59.05; 55.3 | 3.75 | -5.36 | 0.06 | 7.4 |
Riboswitch | 2HO6 | 42!B:73!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.56 | 56.04; 54.67 | 1.37 | -8.21 | 0.04 | 12.73 |
Riboswitch | 2HO6 | 43!B:72!B | A:U | WC [cWW][XX] | 10.17 | 61.54; 56.03 | 5.51 | -8.72 | 0.3 | 17.73 |
Riboswitch | 2HO6 | 44!B:71!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.51 | 56.57; 53.29 | 3.28 | -5.41 | 0.01 | 11.18 |
Riboswitch | 2HO6 | 45!B:70!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.53 | 54.39; 54.3 | 0.09 | -6.2 | 0.18 | 15.04 |
Riboswitch | 2HO6 | 46!B:69!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.64 | 56.18; 51.54 | 4.64 | -13.63 | 0.65 | 31.94 |
Riboswitch | 2HO6 | 47!B:68!B | U:G | Wb [cWW][XXVIII] | 10.75 | 65.69; 37.71 | 27.98 | -10.33 | 0.42 | 22.24 |
Riboswitch | 2HO6 | 48!B:50!B | U:A | H_1 [cWH][XXIII] | 7.96 | 70.0; 55.18 | 14.83 | 6.77 | 0.03 | 8.87 |
Riboswitch | 2HO6 | 52!B:128!B | C:G | rpS [cSS][-] | 5.54 | 131.73; 97.12 | 34.61 | -88.65 | 0.19 | 56.47 |
Riboswitch | 2HO6 | 53!B:127!B | G:A | rpS(sb:O2*-N3) [---][-] | 5.64 | 142.25; 86.43 | 55.82 | -71.34 | 1.94 | 64.07 |
Riboswitch | 2HO6 | 53!B:104!B | G:A | fS [tSW][X] | 9.99 | 98.84; 45.81 | 53.02 | 119.02 | 0.92 | 63.25 |
Riboswitch | 2HO6 | 54!B:106!B | A:A | rS(sb:O2*-N1)_1 [tSS][-] | 7.78 | 94.89; 55.38 | 39.51 | 169.55 | 0.15 | 40.51 |
Riboswitch | 2HO6 | 54!B:59!B | A:U | rWC [tWW][XXI] | 11.34 | 30.0; 38.65 | 8.64 | -161.53 | 0.22 | 11.04 |
Riboswitch | 2HO6 | 74!B:90!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.75 | 51.98; 53.93 | 1.95 | -8.36 | 0.3 | 14.53 |
Riboswitch | 2HO6 | 75!B:93!B | G:A | rS [tSS][-] | 8.13 | 86.49; 56.61 | 29.89 | 148.1 | 1.49 | 46.04 |
Riboswitch | 2HO6 | 75!B:89!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.66 | 54.49; 53.33 | 1.15 | -17.43 | 0.34 | 28.84 |
Riboswitch | 2HO6 | 76!B:88!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.72 | 55.99; 53.73 | 2.27 | -8.96 | 0.38 | 9.7 |
Riboswitch | 2HO6 | 77!B:87!B | U:A | WC [cWW][XX] | 10.54 | 53.84; 55.07 | 1.23 | -11.99 | 0.02 | 19.01 |
Riboswitch | 2HO6 | 78!B:86!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.58 | 52.48; 52.94 | 0.46 | -5.45 | 0.19 | 6.95 |
Riboswitch | 2HO6 | 79!B:81!B | U:C | H_2 [---][-] | 9.33 | 89.12; 28.97 | 60.15 | -44.72 | 2.45 | 61.02 |
Riboswitch | 2HO6 | 80!B:144!B | U:A | WC [cWW][XX] | 10.56 | 52.78; 54.58 | 1.8 | -17.14 | 0.42 | 19.57 |
Riboswitch | 2HO6 | 81!B:143!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.52 | 56.08; 52.24 | 3.85 | -9.7 | 0.42 | 16.16 |
Riboswitch | 2HO6 | 82!B:142!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.29 | 57.31; 56.83 | 0.48 | -6.02 | 0.0 | 8.76 |
Riboswitch | 2HO6 | 83!B:141!B | U:A | WC [cWW][XX] | 10.41 | 55.24; 57.18 | 1.93 | -7.73 | 0.18 | 12.05 |
Riboswitch | 2HO6 | 84!B:140!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.51 | 54.34; 55.24 | 0.91 | -2.39 | 0.17 | 9.41 |
Riboswitch | 2HO6 | 85!B:139!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.36 | 57.31; 58.35 | 1.03 | -5.85 | 0.14 | 13.54 |
Riboswitch | 2HO6 | 89!B:93!B | C:A | rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] | 5.79 | 102.03; 147.33 | 45.3 | -42.77 | 1.77 | 18.61 |
Riboswitch | 2HO6 | 90!B:91!B | G:U | pS* [cHS][-] | 6.12 | 134.27; 52.78 | 81.48 | 49.41 | 0.75 | 38.67 |
Riboswitch | 2HO6 | 95!B:137!B | A:G | S [tSH][XI] | 9.46 | 11.53; 98.85 | 87.33 | -3.15 | 0.49 | 12.39 |
Riboswitch | 2HO6 | 96!B:136!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.42 | 56.47; 60.5 | 4.03 | -5.1 | 0.06 | 10.56 |
Riboswitch | 2HO6 | 97!B:135!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.4 | 55.18; 60.22 | 5.03 | -1.73 | 0.1 | 8.35 |
Riboswitch | 2HO6 | 98!B:134!B | A:U | WC [cWW][XX] | 10.53 | 52.99; 56.44 | 3.45 | -3.55 | 0.07 | 11.36 |
Riboswitch | 2HO6 | 99!B:133!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.43 | 54.13; 58.29 | 4.16 | -9.99 | 0.03 | 15.57 |
Riboswitch | 2HO6 | 100!B:132!B | U:A | WC [cWW][XX] | 10.32 | 54.89; 58.21 | 3.32 | -10.2 | 0.05 | 11.07 |
Riboswitch | 2HO6 | 101!B:131!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.72 | 56.83; 54.09 | 2.73 | -18.81 | 0.45 | 25.0 |
Riboswitch | 2HO6 | 102!B:129!B | G:A | S [tSH][XI] | 10.8 | 77.12; 24.03 | 53.09 | 176.22 | 0.24 | 5.88 |
Riboswitch | 2HO6 | 105!B:126!B | A:U | rH_1 [tWH][XXIV] | 10.16 | 13.87; 34.42 | 20.55 | 170.96 | 0.25 | 4.63 |
Riboswitch | 2HO6 | 106!B:125!B | A:A | rH [tWH][V] | 12.17 | 18.56; 24.93 | 6.37 | 137.68 | 0.31 | 18.16 |
Riboswitch | 2HO6 | 108!B:123!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.66 | 50.56; 55.77 | 5.21 | -10.34 | 0.2 | 22.81 |
Riboswitch | 2HO6 | 109!B:122!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.8 | 52.7; 53.89 | 1.19 | -8.57 | 0.19 | 12.99 |
Riboswitch | 2HO6 | 110!B:121!B | A:U | WC [cWW][XX] | 10.53 | 53.3; 55.19 | 1.89 | -10.28 | 0.0 | 14.16 |
Riboswitch | 2HO6 | 111!B:120!B | C:G | WC [cWW][XIX] | 10.47 | 55.16; 52.54 | 2.62 | -5.57 | 0.06 | 14.86 |
Riboswitch | 2HO6 | 112!B:119!B | A:U | WC [cWW][XX] | 10.38 | 58.58; 56.57 | 2.01 | -5.64 | 0.14 | 11.09 |
Riboswitch | 2HO6 | 113!B:118!B | G:C | WC [cWW][XIX] | 10.54 | 56.18; 57.84 | 1.67 | 6.09 | 0.22 | 2.58 |
Riboswitch | 2HO6 | 114!B:117!B | G:A | S_mo [tSH][XI] | 9.95 | 85.66; 20.58 | 65.08 | -151.24 | 0.82 | 23.68 |
Riboswitch | 2HO6 | 114!B:116!B | G:G | S(sb:O2*-N7)_1 [---][-] | 7.4 | 82.18; 35.66 | 46.53 | -173.46 | 2.66 | 30.1 |