Identified Basepairs and Their Conformations and Conformational Parameters

PDB Id: 3IQP BPC Identified: 47 Ambiguities: 0
RNA PDB Position bp bpC; LG [LW][Sanger] dCC <X ; <Y |<X - <Y| Torsion Z-Diff Buckle
Riboswitch 3IQP 1!A:93!A G:C WC [cWW][XIX] 10.75 51.09; 55.76 4.66 -0.23 0.22 8.6
Riboswitch 3IQP 2!A:92!A G:C WC [cWW][XIX] 10.54 53.81; 54.43 0.62 -11.79 0.12 17.09
Riboswitch 3IQP 3!A:91!A C:G WC [cWW][XIX] 10.49 56.75; 55.6 1.15 -3.14 0.46 15.21
Riboswitch 3IQP 4!A:90!A U:A WC [cWW][XX] 10.15 58.69; 59.02 0.33 -4.77 0.5 12.49
Riboswitch 3IQP 5!A:89!A U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.14 70.62; 48.74 21.89 -3.88 0.03 7.82
Riboswitch 3IQP 6!A:88!A A:U WC [cWW][XX] 10.28 58.43; 58.33 0.11 -10.18 0.24 17.04
Riboswitch 3IQP 7!A:87!A U:A WC [cWW][XX] 10.8 51.9; 56.89 4.99 -11.96 0.3 12.95
Riboswitch 3IQP 8!A:86!A C:G WC [cWW][XIX] 10.71 52.1; 51.03 1.07 -8.33 0.15 14.49
Riboswitch 3IQP 11!A:44!A G:C rpS [cSS][-] 5.47 99.07; 150.79 51.72 -68.72 0.24 30.6
Riboswitch 3IQP 12!A:59!A A:C fS(sb:O2*-N1)_1 [tSS][-] 8.3 56.43; 84.74 28.31 162.14 2.05 35.91
Riboswitch 3IQP 12!A:43!A A:G rpS [cSS][-] 5.3 153.02; 106.93 46.1 -25.83 0.97 8.46
Riboswitch 3IQP 13!A:41!A G:C WC [cWW][XIX] 10.29 61.18; 60.14 1.04 -11.41 0.59 5.43
Riboswitch 3IQP 14!A:42!A A:G S_Mo [tSH][XI] 7.91 24.75; 136.19 111.45 56.07 0.82 33.89
Riboswitch 3IQP 15!A:40!A G:C WC [cWW][XIX] 10.59 54.42; 56.3 1.87 11.47 0.11 15.66
Riboswitch 3IQP 16!A:39!A G:C WC [cWW][XIX] 10.46 57.54; 59.44 1.9 11.58 0.11 14.47
Riboswitch 3IQP 17!A:38!A U:A WC [cWW][XX] 9.94 63.13; 57.9 5.23 4.02 0.71 15.09
Riboswitch 3IQP 18!A:37!A G:A S [tSH][XI] 9.54 96.12; 9.84 86.27 22.28 0.05 10.75
Riboswitch 3IQP 19!A:36!A G:A S [tSH][XI] 8.63 95.78; 7.39 88.39 -61.26 0.15 22.49
Riboswitch 3IQP 20!A:35!A A:G S [tSH][XI] 9.39 15.85; 99.41 83.56 -18.2 0.48 15.26
Riboswitch 3IQP 20!A:32!A A:G rS [tSS][-] 8.66 56.04; 100.38 44.34 127.96 1.28 58.7
Riboswitch 3IQP 21!A:31!A G:C WC [cWW][XIX] 10.5 54.91; 57.67 2.76 3.45 0.03 1.98
Riboswitch 3IQP 22!A:30!A G:C WC [cWW][XIX] 10.63 55.86; 52.96 2.9 2.5 0.24 4.75
Riboswitch 3IQP 23!A:62!A G:A fS [tSW][X] 9.53 114.14; 6.84 107.3 136.48 0.73 17.99
Riboswitch 3IQP 23!A:29!A G:C WC [cWW][XIX] 10.87 52.76; 53.14 0.38 2.02 0.23 6.97
Riboswitch 3IQP 24!A:85!A A:A pfS [cSW][-] 9.54 31.58; 110.59 79.0 -63.84 2.65 53.69
Riboswitch 3IQP 25!A:68!A C:G WC [cWW][XIX] 10.35 57.05; 56.16 0.89 -21.09 0.08 38.58
Riboswitch 3IQP 25!A:67!A C:U WC_mo [cWW][XVIII] 11.92 33.01; 43.94 10.94 -5.91 1.4 58.78
Riboswitch 3IQP 26!A:67!A U:U Wb [cWW][XVI] 8.57 41.24; 77.48 36.24 -18.03 0.23 18.85
Riboswitch 3IQP 26!A:66!A U:C WC_mo [cWW][XVIII] 12.18 29.94; 39.88 9.94 21.01 2.47 23.56
Riboswitch 3IQP 27!A:66!A G:C WC [cWW][XIX] 10.49 55.01; 57.13 2.13 -9.49 0.01 13.03
Riboswitch 3IQP 28!A:65!A G:C WC [cWW][XIX] 10.71 51.18; 53.49 2.31 -14.35 0.06 18.23
Riboswitch 3IQP 30!A:61!A C:A pfS [cSW][-] 9.67 119.83; 31.82 88.01 -26.25 0.13 19.53
Riboswitch 3IQP 42!A:60!A G:C WC [cWW][XIX] 10.55 53.92; 56.49 2.57 -5.03 0.08 7.18
Riboswitch 3IQP 43!A:59!A G:C WC [cWW][XIX] 10.47 55.65; 54.98 0.67 -18.06 0.17 27.47
Riboswitch 3IQP 44!A:58!A C:G WC [cWW][XIX] 10.94 52.69; 48.33 4.36 -17.61 0.12 20.87
Riboswitch 3IQP 46!A:57!A A:U WC [cWW][XX] 11.11 41.27; 53.0 11.72 -4.08 0.33 12.4
Riboswitch 3IQP 47!A:56!A C:G WC [cWW][XIX] 11.0 53.75; 47.19 6.56 -2.55 0.52 23.67
Riboswitch 3IQP 48!A:55!A C:G WC [cWW][XIX] 10.87 53.68; 52.12 1.57 1.4 0.01 5.71
Riboswitch 3IQP 49!A:54!A A:U WC [cWW][XX] 10.55 53.64; 56.38 2.74 5.41 0.55 12.34
Riboswitch 3IQP 50!A:53!A G:A S [tSH][XI] 9.6 91.43; 9.03 82.4 -115.85 0.58 20.89
Riboswitch 3IQP 56!A:90!A G:A rpS*(bp:N2-O1P) [---][-] 12.25 84.97; 106.4 21.42 96.6 0.37 84.11
Riboswitch 3IQP 64!A:85!A U:A WC [cWW][XX] 10.27 59.67; 57.29 2.38 -14.33 0.67 24.24
Riboswitch 3IQP 69!A:82!A C:G WC [cWW][XIX] 10.57 56.01; 55.77 0.24 4.15 0.11 20.77
Riboswitch 3IQP 70!A:81!A A:U WC [cWW][XX] 10.6 50.99; 55.28 4.29 -5.47 0.05 11.14
Riboswitch 3IQP 71!A:80!A G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.08 48.27; 68.29 20.02 -4.76 0.21 3.27
Riboswitch 3IQP 72!A:79!A C:G WC [cWW][XIX] 10.55 57.08; 57.61 0.54 -3.37 0.07 10.15
Riboswitch 3IQP 73!A:78!A G:C WC [cWW][XIX] 10.83 51.78; 52.02 0.24 11.18 0.19 6.79