Identified Basepairs and Their Conformations and Conformational Parameters

PDB Id: 3MOJ BPC Identified: 31 Ambiguities: 0
RNA PDB Position bp bpC; LG [LW][Sanger] dCC <X ; <Y |<X - <Y| Torsion Z-Diff Buckle
rRNA 3MOJ 2508!A:2581!A G:A S [tSH][XI] 9.96 96.88; 12.42 84.46 43.29 0.02 42.16
rRNA 3MOJ 2508!A:2580!A G:U WC [---][-] 10.74 61.53; 55.47 6.06 -20.21 0.09 27.22
rRNA 3MOJ 2509!A:2579!A G:C WC [cWW][XIX] 10.48 60.65; 48.27 12.38 -7.94 0.81 32.55
rRNA 3MOJ 2510!A:2578!A C:G WC [cWW][XIX] 10.36 47.1; 64.06 16.96 16.47 1.87 5.75
rRNA 3MOJ 2514!A:2570!A U:G Wb* [---][-] 11.05 43.08; 61.86 18.77 17.85 0.18 17.39
rRNA 3MOJ 2515!A:2569!A C:G WC [cWW][XIX] 10.68 51.19; 63.01 11.82 0.03 0.08 20.7
rRNA 3MOJ 2516!A:2568!A A:U WC [cWW][XX] 10.33 64.82; 57.79 7.03 -5.05 0.59 37.15
rRNA 3MOJ 2517!A:2567!A C:G Wb* [---][-] 10.87 48.36; 66.47 18.11 -0.23 0.69 10.81
rRNA 3MOJ 2518!A:2546!A A:U WC [cWW][XX] 11.05 52.47; 46.82 5.65 -4.56 0.2 20.05
rRNA 3MOJ 2519!A:2545!A U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.3 62.22; 43.49 18.73 -11.8 0.4 18.16
rRNA 3MOJ 2520!A:2565!A C:A rpS(bs:O2-O2*) [cSS][-] 5.32 109.28; 151.45 42.18 -50.77 1.88 17.78
rRNA 3MOJ 2520!A:2544!A C:G WC [cWW][XIX] 10.34 56.7; 55.69 1.01 -10.39 0.25 21.62
rRNA 3MOJ 2521!A:2564!A C:A rpS(sb:O2*-N3) [cSS][-] 5.39 154.35; 92.23 62.12 -35.57 0.37 24.76
rRNA 3MOJ 2521!A:2543!A C:G WC [cWW][XIX] 10.91 51.82; 55.76 3.95 -3.99 0.17 12.42
rRNA 3MOJ 2522!A:2542!A U:A WC [cWW][XX] 10.16 63.17; 56.19 6.98 3.3 0.88 25.82
rRNA 3MOJ 2523!A:2540!A G:C WC [cWW][XIX] 10.84 51.76; 51.28 0.48 -8.96 0.15 9.97
rRNA 3MOJ 2524!A:2539!A G:C WC [cWW][XIX] 10.84 55.68; 55.28 0.4 -4.68 0.26 5.78
rRNA 3MOJ 2525!A:2538!A G:C WC [cWW][XIX] 10.63 58.39; 54.35 4.04 -6.16 0.32 13.76
rRNA 3MOJ 2526!A:2537!A G:U Wb [cWW][XXVIII] 10.91 41.65; 55.84 14.19 -3.78 0.25 17.23
rRNA 3MOJ 2527!A:2536!A C:G WC [cWW][XIX] 10.7 58.27; 51.43 6.84 -9.06 0.08 21.94
rRNA 3MOJ 2528!A:2535!A U:G Wb [cWW][XXVIII] 10.44 64.56; 41.54 23.02 -2.49 0.07 15.43
rRNA 3MOJ 2529!A:2534!A G:C WC [cWW][XIX] 10.55 51.79; 52.25 0.46 5.35 0.22 11.6
rRNA 3MOJ 2530!A:2533!A G:A S [tSH][XI] 9.26 97.59; 11.22 86.36 -80.92 0.09 25.26
rRNA 3MOJ 2530!A:2532!A G:A S(sb:O2*-N7) [---][-] 7.65 88.26; 35.25 53.01 -169.99 2.15 32.47
rRNA 3MOJ 2544!A:2565!A G:A rS [tSS][-] 8.29 86.37; 64.46 21.92 154.05 0.97 34.22
rRNA 3MOJ 2547!A:2561!A A:U WC [cWW][XX] 11.43 51.72; 52.49 0.77 -5.85 0.9 20.84
rRNA 3MOJ 2548!A:2560!A U:A WC [cWW][XX] 10.54 55.71; 60.0 4.29 -12.27 0.32 16.5
rRNA 3MOJ 2549!A:2559!A G:C WC [cWW][XIX] 10.71 53.74; 58.02 4.28 -9.53 0.08 9.65
rRNA 3MOJ 2550!A:2558!A G:C WC [cWW][XIX] 10.82 55.02; 48.09 6.93 -6.35 0.26 5.97
rRNA 3MOJ 2551!A:2557!A C:G WC [cWW][XIX] 11.61 48.16; 48.31 0.15 0.84 0.03 3.29
rRNA 3MOJ 2563!A:2565!A U:A S(sb:O2*-N7) [---][-] 6.65 78.21; 40.37 37.84 178.24 0.23 24.86