Last modified on 16 September 2002
| 64:68 (64:68 in E. coli) | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | 0.3 | 0.2 | 0.6 | 0.4 | 0.2 | 0.4 | 0.0 | 0.1* | 2.5 | -- | 0.1 | 0.9 | 0.2 | 78.1* | 0.1 | 14.6* | 1.3 | 5587 |
| B | 0.3 | 0.2 | 0.0 | 0.1 | 0.2 | 0.2 | 0.0 | 0.1* | 2.1 | -- | -- | 0.0 | 0.2 | 96.0* | -- | 0.1* | 0.5 | 4418 |
| A | -- | 0.5 | 4.0* | -- | 0.5 | 9.0 | -- | -- | 22.6 | -- | -- | -- | 2.0 | 59.3* | -- | 0.5 | 1.5 | 199 |
| C | -- | -- | -- | 0.6 | 0.6 | -- | 0.6* | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | 96.4* | -- | 1.2* | -- | 165 |
| E | 0.3 | -- | 2.7 | 2.1 | 0.5 | -- | -- | 0.1 | 0.1* | -- | 0.4* | 5.2 | -- | 0.1 | 0.5 | 83.1* | 4.9 | 970 |
| M | -- | 0.1 | 0.1 | 0.2 | -- | 0.2 | -- | -- | 1.3 | -- | -- | -- | 0.4 | 7.0* | -- | 0.3* | 90.4 | 931 |
| 318:322 (323:327 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | -- | 99.6 | -- | -- | 0.2 | 0.0 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.1 | 6344 |
| B | -- | -- | 99.7 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5089 |
| A | -- | -- | 97.8 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 229 |
| C | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 169 |
| E | -- | -- | 99.2 | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 1026 |
| M | -- | -- | 9.6 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 90.0 | 985 |
| 911:915 (934:938 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | 0.0 | 0.0 | -- | -- | 3.2 | 0.0 | 0.0 | 0.1* | 96.0* | 0.1 | 0.1 | 0.0 | -- | -- | -- | 0.4 | 5551 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1* | 99.4* | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 4351 |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 216 |
| C | -- | 0.6 | 6.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 91.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 167 |
| E | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 18.0* | -- | -- | -- | 80.1* | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | 0.9 | 983 |
| M | 13.6 | 0.1 | 1.6 | 1.9 | 4.0 | 0.1 | 2.7 | 22.7* | -- | 5.8* | 9.4 | 7.5 | 1.4 | -- | 12.1 | 13.1* | 4.2 | 1143 |
| 933:937 (956:960 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | -- | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.0 | 99.6 | 0.2 | 5526 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 99.6 | 0.1 | 4324 |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | 212 |
| C | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.8 | 1.2 | 168 |
| E | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 99.4 | 0.3 | 989 |
| M | -- | -- | 2.4 | -- | -- | -- | 71.8* | 0.2 | -- | 0.3 | -- | -- | 16.3 | -- | 0.2 | 8.9* | 0.1 | 1144 |
| 1035:1039 (1053:1057 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | 0.0 | 0.2 | -- | -- | 0.1 | 0.0 | -- | 0.0 | 0.1 | -- | -- | -- | 0.1 | 99.4 | -- | -- | 0.1 | 5630 |
| B | 0.0 | 0.2 | -- | -- | 0.0 | 0.0 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 0.1 | 99.4 | -- | -- | 0.1 | 4412 |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.5* | -- | -- | -- | -- | -- | 99.5* | -- | -- | -- | 201 |
| C | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.8 | -- | -- | 1.2 | 169 |
| E | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 99.6 | -- | -- | 0.2 | 1012 |
| M | -- | -- | -- | 2.5 | 0.5 | -- | 0.2 | 88.5* | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 8.0* | 0.1 | -- | 0.1 | 1144 |
| 1158:1162 (1177:1181 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| B | 0.1 | 0.2 | 0.3 | -- | -- | 0.2 | 0.4* | -- | 2.0 | 0.2 | -- | -- | 0.1 | 95.9* | -- | -- | 0.3 | 5840 |
| B | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 99.6 | -- | -- | 0.1 | 4621 |
| A | -- | -- | 0.5 | -- | -- | 0.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.0* | -- | -- | -- | 198 |
| C | -- | -- | 2.3* | -- | -- | -- | 0.6 | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | 94.8* | -- | -- | 1.8 | 172 |
| E | 0.3 | 1.3 | 1.9 | -- | 0.8 | 1.0 | 2.5* | 0.1 | 10.9 | 1.3 | 0.1 | -- | 0.4 | 78.9* | -- | -- | 0.6 | 1016 |
| M | 0.1 | -- | 0.7 | 1.6 | 0.2 | 0.3 | 0.5* | 1.8 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 2.1* | 0.3 | 3.0* | 0.9 | 0.7 | 82.2 | 1143 |
| 1296:1300 (1315:1319 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | -- | 99.7 | -- | -- | 0.0 | 0.0 | -- | -- | 0.0 | -- | -- | 0.0 | -- | 0.2 | 0.1 | 0.0 | 5869 |
| B | -- | -- | 99.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 0.1 | -- | 4635 |
| A | -- | -- | 99.5 | -- | -- | 0.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 207 |
| C | -- | -- | 98.8 | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | 172 |
| E | -- | -- | 99.7 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1026 |
| M | 0.2* | -- | 96.7* | -- | 0.1 | 0.2 | 0.3 | -- | -- | 0.6 | -- | 0.1* | 0.1 | -- | 0.1 | 0.9 | 0.9 | 1125 |