Last modified on 15 July 2002.
| 125:129 (131:148 in E. coli) | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | 41.6* | 1.4* | 0.5* | 44.7* | 2.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 9.2 | 425 |
| B | 32.8* | 1.1* | 0.7* | 63.1* | 0.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.9 | 268 |
| A | 65.7* | -- | 2.9* | 8.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 22.9 | 35 |
| C | -- | -- | 1.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.0 | 100 |
| E | 53.7* | 2.4* | -- | 15.4* | 8.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 20.3 | 123 |
| M | 0.4* | -- | 0.4* | 0.4* | 0.4 | -- | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.9 | 234 |
| 313:317 (306:310 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | 0.6* | 69.2* | -- | 0.2 | 0.4 | 4.9 | 0.2 | -- | 9.7 | -- | 0.4* | 2.8 | 2.2* | -- | 7.9 | 1.7 | 535 |
| B | -- | -- | 94.6 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | 3.6 | -- | -- | -- | 0.4 | 279 |
| A | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 36 |
| C | -- | -- | 78.0* | -- | -- | 9.0 | 1.0 | -- | -- | 4.0 | -- | -- | 3.0 | 1.0* | -- | 2.0 | 2.0 | 100 |
| E | -- | 1.4 | 31.8* | -- | 0.5 | 0.9 | 10.0 | 0.5* | -- | 23.6 | -- | 0.9* | 2.3 | 5.5* | -- | 19.1 | 3.8 | 220 |
| M | -- | -- | 6.3* | -- | -- | -- | 0.8 | 0.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 92.6 | 254 |
| 326:330 (319:323 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | 16.3* | 77.4* | 0.7 | 0.2 | 0.2 | 3.2 | 0.2 | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 0.6 | 0.4 | -- | -- | 0.7 | 539 |
| B | 27.7* | 68.4* | -- | -- | 0.4 | 1.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.1 | 0.7 | -- | -- | -- | 282 |
| A | 19.4* | 77.8* | -- | -- | -- | 2.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 36 |
| C | 3.0* | 94.0* | -- | -- | -- | 1.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.0 | 100 |
| E | 1.8* | 88.2* | 1.8* | 0.5* | -- | 5.0 | 0.5 | -- | 0.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.9 | 221 |
| M | -- | 7.9* | 0.4* | 1.2* | -- | 2.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | 88.2 | 254 |
| 335:339 (328:332 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | 0.4* | 98.1* | 0.2 | 0.2 | 0.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | -- | 0.4 | 538 |
| B | -- | -- | 99.6 | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 282 |
| A | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 36 |
| C | -- | -- | 89.0 | -- | -- | -- | 1.0 | -- | -- | 8.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.0 | 100 |
| E | -- | 0.9* | 95.9* | 0.5 | 0.5* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | 0.9 | 220 |
| M | 0.4* | -- | 9.8* | -- | -- | -- | 1.2 | -- | 0.4* | 0.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 87.8 | 254 |
| 481:485 (475:479 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | -- | 82.0 | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 13.5 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 4.1 | 539 |
| B | -- | -- | 73.5 | -- | -- | -- | 0.4 | -- | -- | 25.8 | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | -- | 283 |
| A | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 37 |
| C | -- | -- | 97.0 | -- | -- | -- | 2.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.0 | -- | 100 |
| E | -- | -- | 89.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 10.0 | 219 |
| M | -- | -- | 9.8 | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | -- | 89.1 | 256 |
| 482:486 (476:480 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | -- | 3.7 | -- | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | -- | -- | 88.5 | -- | -- | -- | 7.4 | 539 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 99.3 | -- | -- | -- | -- | 283 |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | 37 |
| C | 2.0 | -- | 1.0 | -- | 5.0 | -- | 5.0 | -- | -- | -- | -- | -- | 83.0 | 2.0 | -- | 2.0 | -- | 100 |
| E | -- | -- | 9.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 72.6 | -- | -- | -- | 18.3 | 219 |
| M | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 9.8 | -- | -- | -- | 89.4 | 256 |
| 505:509 (499:503 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | 0.2 | 92.9 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 1.5 | 0.4 | -- | 0.2 | -- | -- | 0.4 | 4.3 | 539 |
| B | -- | -- | 99.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | 283 |
| A | -- | -- | 89.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 8.1 | -- | -- | 2.7 | -- | -- | -- | -- | 37 |
| C | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100 |
| E | -- | 0.5 | 85.4* | -- | -- | 0.5 | -- | -- | -- | 1.8 | 0.9* | -- | -- | -- | -- | 0.9 | 10.0 | 219 |
| M | -- | -- | 7.8* | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4* | -- | -- | 91.1 | 256 |
| 624:628 (567:571 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | 0.2 | 8.6 | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | 43.2* | 0.6 | -- | 1.0 | -- | 14.1* | 31.7* | -- | 523 |
| B | -- | -- | 10.4 | -- | -- | -- | 1.1 | -- | -- | -- | 1.1* | -- | 1.4* | -- | 26.5 | 59.5* | -- | 279 |
| A | -- | 2.7 | 35.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 59.5 | -- | -- | 2.7 | -- | -- | -- | -- | 37 |
| C | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4.0 | -- | -- | -- | -- | -- | 96.0 | -- | -- | -- | -- | 100 |
| E | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.1* | -- | -- | -- | -- | -- | 0.5* | -- | 207 |
| M | -- | -- | 0.4 | 0.4* | -- | -- | -- | 1.5 | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | 77.9* | 14.5 | 5.0 | 262 |
| 1186:1190 (1082:1086 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | 46.8* | 52.4* | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 0.4 | 496 |
| B | -- | 0.8* | 98.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | -- | 248 |
| A | -- | 59.5* | 40.5* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 37 |
| C | -- | -- | 98.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.0 | -- | -- | 100 |
| E | -- | 98.1* | 0.5* | -- | -- | 0.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.0 | 211 |
| M | 0.4* | 0.7* | 13.1* | 3.3* | 0.4 | -- | 0.4 | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | 0.4 | 0.4 | 2.5 | 78.2 | 275 |
| 1388:1392 (1282:1286 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | 0.2 | -- | 83.8 | 0.2 | -- | 0.2 | 0.2 | -- | 0.2 | 10.0 | -- | 0.2 | 1.6 | -- | -- | -- | 3.5 | 489 |
| B | -- | -- | 98.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 266 |
| A | -- | -- | 92.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 7.3 | 41 |
| C | -- | -- | 97.0 | -- | -- | 1.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.0 | -- | -- | -- | -- | 100 |
| E | 0.5* | -- | 60.4* | 0.5 | -- | 0.5 | 0.5 | -- | 0.5* | 24.7 | -- | 0.5* | 4.4 | -- | -- | -- | 6.9 | 182 |
| M | -- | 0.4* | 7.6* | 0.4 | 0.4* | 1.1 | 0.4 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | -- | 0.4 | 0.7 | 88.5 | 276 |
| 1651:1655 (1565:1568 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | 94.6* | 0.4* | 0.2 | -- | 0.4 | 0.2 | -- | 0.2 | 0.4* | -- | 0.4 | -- | 0.2 | -- | 0.8 | 2.1 | 485 |
| B | -- | 98.5* | 0.4* | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | 265 |
| A | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 41 |
| C | -- | 97.0* | 1.0* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100 |
| E | -- | 87.8* | 0.6 | 0.6 | -- | -- | 0.6* | -- | 0.6 | 1.1 | -- | 1.1 | -- | -- | -- | 2.2* | 5.6 | 180 |
| M | -- | 7.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | -- | 0.7 | -- | -- | -- | 0.4* | 91.3 | 276 |
| 1808:1812 (1752:1756 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | 35.7* | 47.5* | 9.8* | 1.1* | 0.9 | 2.6 | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.9 | 0.9* | -- | 0.4 | 459 |
| B | 9.9* | 68.1* | 15.2* | 1.9* | -- | 3.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.1 | -- | -- | 0.4 | 263 |
| A | -- | 92.7 | -- | -- | -- | 7.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 41 |
| C | -- | 82.2* | 10.9* | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.0 | -- | -- | -- | 101 |
| E | 87.8* | 1.3* | 3.2* | -- | 2.6 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | 0.6 | 2.6 | -- | 1.2 | 156 |
| M | 7.6* | 1.4* | 0.7* | 4.0* | -- | -- | 1.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 84.4 | 277 |
| 1966:1970 (1925:1929 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | 54.9 | -- | -- | -- | 44.6 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 437 |
| B | -- | 99.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | -- | 0.4 | 242 |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 41 |
| C | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 101 |
| E | -- | 0.6 | -- | -- | -- | 98.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | 155 |
| M | -- | 93.9* | 3.2* | 1.3* | -- | 1.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | -- | 311 |
| 2482:2486 (2447:2451 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 97.4 | -- | -- | -- | 1.9 | 423 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.7 | -- | -- | -- | 3.3 | 242 |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 7.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 92.7 | -- | -- | -- | -- | 41 |
| C | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | 101 |
| E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | 140 |
| M | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.7 | -- | -- | -- | 1.0 | 309 |
| 2597:2601 (2562:2566 in E. coli) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| 3 | -- | -- | 68.8* | -- | 0.9 | -- | -- | -- | -- | -- | 3.5* | 25.3* | -- | -- | 0.2 | 0.2 | 0.9 | 423 |
| B | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 243 |
| A | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 41 |
| C | -- | -- | 96.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4.0 | -- | 99 |
| E | -- | -- | 5.8* | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | 10.8 | 76.3* | -- | -- | 0.7 | 0.7 | 2.9 | 139 |
| M | 0.4 | -- | 89.5* | 0.7 | 0.4* | -- | 1.4 | 0.7* | -- | 0.4 | -- | -- | 0.4 | 0.4 | 0.4 | 1.1 | 4.4 | 277 |