| Base Pair (66:96) | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 30.3* | 0.1* | 0.7* | 53.9* | 0.7 | 0.3 | -- | 2.0 | 0.1 | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | 0.1 | 11.3 | 6563 |
| 3 | 35.7* | 0.1* | 0.8* | 58.9* | 0.9 | 0.3 | 0.1 | 2.4 | 0.1 | -- | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.2 | -- | 0.1 | 0.2 | 5579 |
| B | 43.8* | -- | 0.4* | 53.9* | 0.9 | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | 4409 |
| A | 30.7* | -- | 4.5* | 61.8* | 0.5 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.5 | -- | 0.5 | -- | -- | -- | 1.5 | 199 |
| C | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 165 |
| E | -- | 0.7 | 1.8 | 81.2* | 0.8 | 1.8* | 0.1 | 11.9 | 0.6 | -- | 0.1* | 0.1 | 0.1* | 0.5 | -- | 0.2 | 0.1 | 971 |
| M | 0.1* | 0.2* | 0.7* | 10.5* | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 87.7 | 821 |
| Base Pair (67:95) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 16.6* | 68.6* | 1.5* | 0.7* | 0.2 | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.3 | 0.2 | 0.1 | -- | 0.2 | -- | -- | 11.1 | 6597 |
| 3 | 19.5* | 76.6* | 1.4* | 0.7* | 0.2 | -- | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.4 | 0.1 | 0.1 | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | 5613 |
| B | 3.4* | 94.5* | 0.3* | 0.1* | 0.1 | -- | -- | -- | 0.1 | 0.5 | 0.2 | 0.1 | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | 4438 |
| A | 11.4* | 50.7* | 25.4* | 11.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.5 | 201 |
| C | -- | 95.8* | 1.8* | 0.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 0.6 | -- | 165 |
| E | 94.5* | 0.3* | 1.4* | 1.0* | 0.5 | -- | 0.4 | 0.4 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | 0.1 | 974 |
| M | 0.2* | 8.8* | 1.9* | 0.6* | -- | 0.2 | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 87.8 | 821 |
| Base Pair (102:319) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 0.1 | -- | 0.4 | -- | -- | 0.2 | 0.1 | 88.4 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 10.6 | 6839 |
| 3 | -- | 0.1 | -- | 0.3 | -- | -- | 0.2 | 0.1 | 99.1 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 5852 |
| B | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 99.4 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 4639 |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.5 | -- | 97.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 202 |
| C | -- | -- | -- | 1.8 | 0.6* | -- | -- | -- | 97.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 166 |
| E | -- | 0.1 | -- | 1.7 | -- | -- | 0.2 | -- | 97.7 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | 1011 |
| M | -- | 0.4 | 0.2* | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 11.1* | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 87.8 | 823 |
| Base Pair (104:326) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 0.1 | 0.1 | -- | 0.2 | 1.0 | 1.9 | 0.5* | 0.1 | 0.9 | -- | -- | -- | 0.6 | 83.2* | -- | 0.1* | 11.3 | 6896 |
| 3 | 0.1 | 0.1 | -- | -- | 1.1 | 2.2 | -- | -- | 0.9 | -- | -- | -- | 0.7 | 93.8* | -- | 0.1* | 1.0 | 5909 |
| B | -- | 0.1 | -- | -- | 1.3 | 1.8 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 96.3 | -- | -- | 0.2 | 4694 |
| A | -- | 1.5 | 0.5 | -- | 1.5 | 21.2 | -- | 0.5* | 20.2 | -- | -- | 0.5 | -- | 52.7* | -- | 1.5* | -- | 203 |
| C | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | 1.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.0* | -- | -- | 0.6 | 166 |
| E | 0.3 | 0.2 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 0.1* | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 3.9 | 90.4* | -- | -- | 4.7 | 1012 |
| M | -- | -- | -- | 1.3 | -- | 0.7 | 3.8* | 0.5 | 1.0 | -- | 0.1* | -- | 0.1 | 4.4* | -- | 0.1* | 87.9 | 823 |
| Base Pair (912:1362) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 13.5* | 0.1* | 84.8* | 0.1 | 0.1 | 0.6 | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.2 | -- | -- | -- | 0.1 | 0.2 | 6264 |
| 3 | -- | -- | -- | 99.5 | 0.1 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 5140 |
| B | -- | -- | -- | 99.5 | 0.1 | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 3978 |
| A | 1.1* | -- | -- | 98.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 189 |
| C | -- | -- | -- | 96.2 | 0.6 | -- | 0.6 | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.9 | 159 |
| E | -- | -- | -- | 99.5 | -- | -- | -- | 0.1 | 0.1 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 973 |
| M | -- | 87.7* | 0.5* | 4.8* | 0.3 | 0.5 | 3.3 | 0.2 | -- | 0.4 | 0.4 | 0.2 | -- | -- | -- | 0.1 | 1.5 | 966 |
| Base Pair (913:1361) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 0.2* | 95.8* | 1.0* | 0.1* | -- | 0.3 | -- | -- | 0.2 | 0.7 | 0.1 | 0.6 | -- | 0.2 | -- | 0.3 | 0.6 | 6291 |
| 3 | -- | 99.0 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.5 | 5166 |
| B | -- | 99.4 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 4002 |
| A | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 188 |
| C | -- | 95.0* | -- | 0.6* | -- | -- | -- | -- | -- | 1.9 | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | 1.9 | 159 |
| E | -- | 96.9 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 2.5 | 976 |
| M | 1.0* | 78.9* | 6.2* | 0.8* | 0.1 | 1.2 | 0.3 | 0.2 | 0.2 | 4.0 | 0.4 | 3.5 | -- | 0.1 | -- | 2.2 | 0.7 | 967 |
| Base Pair (914:1360) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 1.2 | 1.1 | 4.7 | 0.1 | 0.1 | 2.2 | 70.2* | 0.7 | 1.8* | 15.0 | 1.1 | 0.4 | 0.1* | -- | 0.4* | 0.7 | 6280 |
| 3 | -- | 0.4 | -- | 2.3 | -- | -- | 0.3 | 79.9* | 0.1 | 0.5* | 15.7 | 0.4 | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 5157 |
| B | -- | -- | -- | 1.5 | -- | -- | 0.1 | 98.0 | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 3993 |
| A | -- | -- | -- | 13.3 | -- | -- | 0.5 | 85.6* | -- | -- | -- | 0.5* | -- | -- | -- | -- | -- | 188 |
| C | -- | -- | -- | 6.3 | -- | -- | 10.7 | 79.9 | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.6 | 159 |
| E | -- | 2.2 | -- | 3.4* | -- | -- | 1.0 | 4.7 | 0.5 | 2.6 | 82.9* | 2.2 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 976 |
| M | -- | 5.8 | 7.0* | 17.6* | 0.5 | 0.4 | 11.1 | 16.6 | 3.5 | 8.9 | 13.5* | 4.8 | 2.6 | 0.6* | -- | 2.8 | 3.4 | 965 |
| Base Pair (955:1297) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 0.1 | -- | 0.3 | -- | 0.1 | 0.2 | 0.1 | 98.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 6782 |
| 3 | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 99.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 5495 |
| B | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 99.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 4280 |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | 97.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.8 | 166 |
| E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.9 | 1017 |
| M | -- | -- | -- | 1.4 | 0.1 | 0.5 | 0.8 | 0.6 | 96.1* | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.2* | 0.2 | 1122 |
| Base Pair (956:1298) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 0.2 | 0.3 | 1.4* | 2.5* | -- | 0.1 | 0.2 | 9.6 | 0.5 | 19.2 | 63.2* | 0.9 | -- | -- | -- | 0.9 | 0.1 | 6801 |
| 3 | 0.2 | 0.2 | 1.2* | 3.0* | -- | 0.1 | 0.2 | 11.8 | 0.6 | 5.5 | 75.0* | 0.2 | -- | -- | -- | 1.0 | 0.1 | 5511 |
| B | -- | 0.1 | 0.1* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 7.0 | 92.3* | 0.2 | -- | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 4294 |
| A | 3.0 | -- | 29.3* | 8.6* | 0.5 | 1.0 | 1.5 | 1.0 | -- | 0.5 | 14.1* | 0.5 | 0.5 | -- | -- | 24.2 | -- | 198 |
| C | -- | -- | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 10.8 | 84.3* | 0.6 | -- | -- | -- | -- | 1.8 | 166 |
| E | 0.6 | 0.8* | 0.2* | 14.5 | 0.1* | 0.2 | 0.8 | 63.5* | 3.2 | 0.3 | 13.5 | 0.3 | -- | 0.1 | -- | 0.2 | 0.2 | 1019 |
| M | -- | 0.7 | 2.0 | 0.4 | -- | 0.4 | 0.4 | -- | -- | 87.7* | 2.8 | 4.2 | 0.2 | -- | -- | 0.9* | 0.1 | 1125 |
| Base Pair (1037:1186) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | -- | -- | 96.9 | 0.1 | -- | -- | 2.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 0.3 | 6908 |
| 3 | -- | -- | -- | 96.6 | -- | -- | -- | 3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 5598 |
| B | -- | -- | -- | 95.9 | -- | -- | -- | 3.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 4398 |
| A | -- | -- | -- | 99.0 | -- | -- | -- | 1.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | -- | -- | -- | 98.2 | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 168 |
| E | -- | -- | -- | 99.7 | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 998 |
| M | -- | -- | -- | 98.2 | 0.3 | -- | -- | 1.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | 0.1 | 1143 |
| Base Pair (1038:1185) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 15.0* | 82.0* | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 2.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 6897 |
| 3 | -- | 0.2* | 96.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 5588 |
| B | -- | 0.3* | 96.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 4386 |
| A | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | -- | -- | 97.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | 1.2 | 168 |
| E | -- | -- | 99.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 1000 |
| M | 0.1* | 89.4* | 6.7* | 0.1* | -- | 0.6 | -- | -- | -- | 2.8 | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 1142 |
| Base Pair (1138:1160) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | -- | 2.9 | -- | 0.1 | -- | 6.9 | -- | 0.1* | 0.3 | -- | -- | 71.5* | 2.6 | -- | 0.1* | 15.5 | 7068 |
| 3 | -- | -- | 3.0 | -- | 0.1 | -- | 8.1 | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 85.3 | 2.8 | -- | -- | 0.4 | 5754 |
| B | -- | -- | 3.7 | -- | -- | -- | 9.7 | -- | -- | 0.4 | -- | -- | 86.0 | -- | -- | -- | -- | 4554 |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | 98.9 | -- | -- | -- | 0.6 | 174 |
| C | -- | -- | 13.4 | -- | -- | -- | 5.2 | -- | -- | 0.6 | -- | -- | 77.3 | -- | -- | -- | 3.5 | 172 |
| E | -- | 0.1* | 0.7 | -- | 0.5 | -- | 2.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 80.0* | 15.7 | -- | -- | 0.8 | 1021 |
| M | 0.1 | 0.1 | 0.5 | 0.1 | 0.1 | -- | 0.7* | -- | 0.3 | 0.1 | -- | -- | 1.7 | 2.4* | -- | 0.4* | 93.4 | 1144 |
| Base Pair (1139:1159) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 0.1 | 0.3* | 0.2 | 0.1* | 0.2 | 0.2 | 2.0 | 81.5* | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | 15.2 | 7141 |
| 3 | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | 2.4 | 96.7 | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.2 | 5828 |
| B | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.5 | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 4604 |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | -- | -- | -- | 0.6 | -- | 5.2 | 0.6 | -- | 90.1* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6* | 2.9 | 172 |
| E | 0.1* | 0.1 | -- | 0.8 | -- | -- | 0.9 | 13.9 | 83.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.5 | 1021 |
| M | -- | -- | 2.1* | 0.4 | 0.4* | 0.1 | 0.3 | -- | 2.7* | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | 0.3 | 93.3 | 1143 |
Last modified on 18 September 2002.