Triple (68:94)64 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | AUG | AUU | GAA | GAG | GCA | GCG | GCU | UAA | UAC | UAU | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq |
T | 0.1 | *0.5 | 1.5 | *65.7 | 0.5 | 2.2 | 0.3 | 0.3 | 0.8 | 12.1 | 14.0 | 1.8 | 39 | 0.77 | -- | 0.52/ 0.90/ 0.38 | 6650 |
3 | 0.1 | *0.6 | 1.8 | *75.0 | 0.6 | 2.4 | 0.4 | 0.4 | 0.9 | 14.4 | 1.6 | 1.9 | 36 | 0.77 | -- | 1.18/ 1.55/ 0.99 | 5555 |
B | -- | -- | 1.9 | *94.9 | 0.2 | 0.5 | 0.1 | -- | -- | -- | 0.8 | 1.7 | 24 | -- | -- | 1.86/ 1.76/ 1.76 | 4386 |
A | 2.0 | *4.0 | 8.6 | 2.0 | 13.1 | *57.1 | 9.1 | -- | -- | -- | 1.5 | 2.5 | 12 | 0.62 | -- | 1.45/ 0.91/ 0.65 | 198 |
C | -- | -- | -- | *92.7 | 0.6 | 1.2 | -- | 0.6 | -- | 1.2 | -- | 3.6 | 9 | 0.93 | -- | 1.78/ 1.65/ 1.77 | 165 |
E | -- | 2.6 | 0.1 | 0.1 | -- | -- | -- | 2.1 | 5.1 | *82.3 | 5.4 | 2.4 | 16 | -- | -- | 1.62/ 1.61/ 1.06 | 971 |
M | 0.3 | *0.1 | 0.2 | *6.0 | 0.1 | 0.9 | 0.1 | -- | -- | 0.3 | 90.6 | 1.4 | 13 | 0.65 | -- | -0.34/-0.43/-0.39 | 932 |
Triple (912:1362)1365 | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | AAC | AUC | AUU | CGA | CGC | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | ||||
T | 0.4 | *77.0 | 7.5 | *5.3 | 8.2 | 0.6 | 1.0 | 29 | 0.83 | -- | 1.31/ 1.34/ 1.27 | 6171 | ||||
3 | -- | 91.0 | 8.4 | -- | -- | 0.2 | 0.4 | 12 | -- | -- | 1.93/ 1.97/ 1.56 | 5050 | ||||
B | 0.1 | 88.5 | 10.9 | -- | -- | 0.2 | 0.3 | 11 | -- | -- | 1.94/ 1.97/ 1.48 | 3888 | ||||
A | -- | 98.9 | -- | -- | -- | -- | 1.1 | 2 | -- | -- | 1.77/ 1.92/ 2.00 | 189 | ||||
C | -- | 79.2 | 15.7 | -- | -- | 1.9 | 3.1 | 6 | -- | -- | 1.83/ 1.83/ 1.27 | 159 | ||||
E | -- | 99.4 | -- | -- | -- | 0.2 | 0.4 | 4 | -- | -- | 1.97/ 1.96/ 1.98 | 973 | ||||
M | 2.4 | 3.0 | *1.1 | 34.2 | *52.8 | 2.4 | 4.2 | 26 | 0.55 | -- | 1.45/ 1.25/ 0.80 | 963 |
Triple (961:1202)936 | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | CGA | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | ||||||||
T | 83.7 | 15.8 | 0.5 | 9 | -- | -- | 1.97/ 1.96/ 1.04 | 6711 | ||||||||
3 | 99.2 | 0.2 | 0.5 | 9 | -- | -- | 1.98/ 1.97/ 1.95 | 5402 | ||||||||
B | 99.4 | 0.1 | 0.5 | 7 | -- | -- | 1.99/ 1.99/ 1.94 | 4216 | ||||||||
A | 100.0 | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 185 | ||||||||
C | 97.6 | 1.2 | 1.2 | 3 | -- | -- | 1.83/ 1.88/ 1.83 | 166 | ||||||||
E | 99.0 | 0.3 | 0.7 | 4 | -- | -- | 1.94/ 1.95/ 1.97 | 995 | ||||||||
M | 8.7 | 91.3 | 0.1 | 2 | -- | -- | 1.95/ 1.92/-0.25 | 1144 |
Triple (1037:1186)1181 | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | ACC | AUC | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | |||||||
T | 2.7 | 96.5 | 0.3 | 0.6 | 11 | -- | -- | 1.96/ 1.79/ 1.94 | 6904 | |||||||
3 | 3.1 | 96.3 | 0.2 | 0.3 | 8 | -- | -- | 1.98/ 1.77/ 1.96 | 5593 | |||||||
B | 3.9 | 95.5 | 0.1 | 0.4 | 8 | -- | -- | 1.98/ 1.75/ 1.97 | 4392 | |||||||
A | 1.0 | 99.0 | -- | -- | 2 | -- | -- | 2.00/ 1.92/ 2.00 | 198 | |||||||
C | 0.6 | 97.6 | 1.2 | 0.6 | 3 | -- | -- | 1.88/ 1.88/ 1.88 | 168 | |||||||
E | -- | 99.6 | 0.3 | 0.1 | 2 | -- | -- | 1.98/ 1.98/ 1.99 | 999 | |||||||
M | 0.8 | 97.1 | 0.3 | 1.8 | 9 | -- | -- | 1.92/ 1.90/ 1.85 | 1144 |
Triple (1039:1184)1035 | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | CGA | GAG | GCG | GUG | UAA | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | ||||
T | *14.9 | 2.5 | *66.2 | 14.9 | 0.4 | 0.4 | 0.7 | 22 | 0.81 | 0.81 | 1.32/ 0.64/ 1.35 | 6780 | ||||
3 | -- | 3.1 | 78.1 | 17.8 | -- | 0.3 | 0.6 | 13 | -- | -- | 1.97/ 1.10/ 1.95 | 5470 | ||||
B | -- | 0.1 | 98.2 | 0.8 | -- | 0.3 | 0.7 | 10 | -- | -- | 1.98/ 1.88/ 1.95 | 4270 | ||||
A | -- | -- | 38.1 | *61.4 | -- | -- | 0.5 | 3 | 0.62 | -- | 1.96/ 1.05/ 1.96 | 197 | ||||
C | -- | -- | 92.3 | 6.5 | -- | 1.2 | -- | 2 | -- | -- | 1.88/ 1.59/ 1.88 | 168 | ||||
E | -- | 16.9 | 0.3 | 82.2 | -- | 0.4 | 0.2 | 5 | -- | -- | 1.95/ 1.25/ 1.99 | 999 | ||||
M | *88.4 | -- | *5.9 | 2.1 | 2.4 | 0.2 | 1.1 | 12 | 0.94 | 0.94 | 1.37/ 1.30/ 1.55 | 1143 |
Triple (1158:1162)1140 | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | AGC | GGC | GGU | CUU | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | |||||
T | 1.5 | *80.7 | 0.1 | *0.3 | 15.6 | 1.8 | 29 | -- | -- | 0.97/ 0.91/ 1.00 | 7127 | |||||
3 | 1.8 | *95.8 | 0.1 | -- | 0.4 | 2.0 | 19 | -- | -- | 1.91/ 1.87/ 1.71 | 5813 | |||||
B | 0.1 | 99.5 | -- | -- | 0.2 | 0.1 | 4 | -- | -- | 1.98/ 1.98/ 1.97 | 4599 | |||||
A | -- | *99.0 | -- | -- | -- | 1.0 | 3 | 1.00 | 1.00 | 1.95/ 1.95/ 1.92 | 194 | |||||
C | 0.6 | *89.5 | 2.9 | -- | 5.2 | 1.7 | 6 | 0.95 | -- | 1.32/ 1.65/ 1.64 | 172 | |||||
E | 9.7 | *78.8 | 0.1 | -- | 0.7 | 10.7 | 19 | 0.81 | -- | 1.71/ 1.56/ 1.00 | 1015 | |||||
M | 0.1 | *2.6 | -- | *2.0 | 94.2 | 1.0 | 13 | 0.80 | 0.80 | -0.33/-0.58/-0.01 | 1144 |
Triple (1296:1300)1342 | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | UAA | UAC | UAG | UAU | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | |||||
T | 2.3 | 1.9 | *78.1 | 16.6 | 0.4 | 0.7 | 20 | -- | -- | 1.95/ 1.94/ 1.03 | 7033 | |||||
3 | 2.1 | 1.6 | 78.8 | 17.0 | 0.1 | 0.3 | 10 | -- | -- | 1.99/ 1.97/ 1.07 | 5800 | |||||
B | 0.1 | 0.2 | 98.9 | 0.3 | 0.1 | 0.3 | 8 | -- | -- | 1.99/ 1.97/ 1.92 | 4573 | |||||
A | 40.3 | 19.9 | 13.6 | 25.7 | -- | 0.5 | 5 | -- | -- | 2.00/ 1.96/ 0.11 | 206 | |||||
C | 0.6 | -- | 95.9 | 1.7 | 1.2 | 0.6 | 4 | -- | -- | 1.88/ 1.94/ 1.76 | 172 | |||||
E | 3.3 | 4.0 | 2.2 | 90.1 | 0.2 | 0.2 | 6 | -- | -- | 1.98/ 1.99/ 1.38 | 1020 | |||||
M | 3.9 | 3.9 | *71.5 | 16.5 | 1.7 | 2.6 | 18 | -- | -- | 1.80/ 1.83/ 0.78 | 1063 |
Last modified on 18 September 2002.