| Triple (481:485)509 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | AAA | CAA | UAA | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | ||||||
| T | 0.3 | 8.2 | 61.9 | 28.3 | 1.3 | 10 | -- | -- | 1.03/ 0.54/ 0.50 | 895 | ||||||
| 3 | 0.2 | 13.5 | 80.7 | 4.1 | 1.5 | 7 | -- | -- | 1.07/ 1.67/ 1.55 | 539 | ||||||
| B | 0.4 | 25.8 | 73.1 | -- | 0.7 | 5 | -- | -- | 1.11/ 2.00/ 1.97 | 283 | ||||||
| A | -- | -- | 100.0 | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 37 | ||||||
| C | 2.0 | -- | 97.0 | -- | 1.0 | 3 | -- | -- | 1.86/ 1.92/ 2.00 | 100 | ||||||
| E | -- | 0.5 | 86.8 | 10.0 | 2.7 | 5 | -- | -- | 1.29/ 1.33/ 1.11 | 219 | ||||||
| M | -- | -- | 8.6 | 90.2 | 1.2 | 3 | -- | -- | 0.91/-0.34/-0.30 | 256 | ||||||
| Triple (482:486)511 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | AAA | GAA | GAG | GCA | GUA | UAA | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | |||
| T | 0.8 | 64.7 | 0.3 | 0.4 | 0.6 | 2.3 | 30.2 | 0.7 | 9 | -- | -- | 1.08/ 0.46/ 0.54 | 895 | |||
| 3 | 0.4 | 88.1 | 0.2 | -- | -- | 3.7 | 7.4 | 0.2 | 5 | -- | -- | 1.21/ 1.66/ 1.63 | 539 | |||
| B | 0.7 | 98.9 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | 3 | -- | -- | 1.94/ 2.00/ 1.97 | 283 | |||
| A | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 37 | |||
| C | 5.0 | 81.0 | 2.0 | 2.0 | 5.0 | 1.0 | -- | 4.0 | 8 | -- | -- | 1.52/ 1.36/ 1.86 | 100 | |||
| E | -- | 72.1 | 0.5 | -- | -- | 9.1 | 18.3 | -- | 3 | -- | -- | 0.54/ 1.30/ 1.29 | 219 | |||
| M | -- | 9.0 | -- | 0.8 | -- | -- | 89.8 | 0.4 | 3 | -- | -- | 0.74/-0.31/-0.31 | 256 | |||
| Triple (505:509)485 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | CAA | GAA | UAA | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | ||||||
| T | 0.9 | 0.1 | 68.7 | 28.9 | 1.3 | 11 | -- | -- | 0.44/ 0.50/ 0.54 | 895 | ||||||
| 3 | 1.5 | 0.2 | 92.9 | 4.3 | 1.1 | 7 | -- | -- | 1.50/ 1.55/ 1.67 | 539 | ||||||
| B | 0.4 | -- | 99.3 | 0.4 | -- | 2 | -- | -- | 1.92/ 1.97/ 2.00 | 283 | ||||||
| A | 8.1 | 2.7 | 89.2 | -- | -- | 3 | -- | -- | 1.42/ 2.00/ 2.00 | 37 | ||||||
| C | -- | -- | 99.0 | -- | 1.0 | 2 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 1.92 | 100 | ||||||
| E | 1.8 | -- | 85.4 | 10.0 | 2.7 | 6 | -- | -- | 1.13/ 1.11/ 1.33 | 219 | ||||||
| M | -- | -- | 5.9 | 92.2 | 2.0 | 4 | -- | -- | -0.33/-0.30/-0.34 | 256 | ||||||
| Triple (1159:1208)1189 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | AUA | CAA | GCA | UAA | UCA | UGA | UGU | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | ||
| T | 0.7 | 0.7 | *69.3 | 0.6 | 0.6 | 1.2 | *2.7 | 19.7 | 4.7 | 23 | 0.90 | -- | 0.34/ 0.38/ 1.32 | 859 | ||
| 3 | -- | -- | 98.1 | -- | 0.2 | -- | -- | 0.6 | 1.0 | 5 | -- | -- | 1.89/ 1.98/ 1.90 | 483 | ||
| B | -- | -- | 99.6 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | 2 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 1.96 | 242 | ||
| A | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 36 | ||
| C | 3.0 | -- | 94.0 | -- | 2.0 | -- | -- | -- | 1.0 | 4 | -- | -- | 1.66/ 1.81/ 1.92 | 100 | ||
| E | -- | -- | 96.1 | -- | 0.5 | -- | -- | 1.5 | 2.0 | 5 | -- | -- | 1.77/ 1.95/ 1.83 | 205 | ||
| M | 1.1 | 2.2 | 9.8 | 2.2 | 0.7 | *14.5 | 0.4 | 60.1 | 9.1 | 20 | 0.40 | -- | -0.81/-0.94/ 0.88 | 276 | ||
| Triple (1725:2050)1393 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | AAA | AAC | AAG | AAU | CGA | CGU | GCA | UAA | UAG | UAU | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq |
| T | 4.9 | 3.3 | *4.7 | 2.6 | *31.2 | 1.0 | 1.8 | 23.5 | 3.8 | 3.8 | 15.1 | 4.3 | 26 | 0.43 | -- | 0.00/ 0.41/ 0.13 | 814 |
| 3 | -- | -- | -- | -- | 35.2 | *1.9 | 3.3 | *40.8 | 7.0 | 6.3 | 2.3 | 3.3 | 13 | 0.44 | -- | 0.78/ 0.69/ 0.85 | 429 |
| B | -- | -- | -- | -- | *55.9 | 3.4 | -- | 29.8 | *10.1 | 0.4 | 0.4 | -- | 5 | 0.66 | -- | 0.97/ 1.03/ 1.34 | 238 |
| A | -- | -- | -- | -- | *43.9 | -- | 34.1 | 7.3 | -- | -- | 2.4 | 12.2 | 7 | 0.47 | -- | 0.55/ 0.52/ 1.55 | 41 |
| C | -- | -- | -- | -- | 99.0 | -- | -- | 1.0 | -- | -- | -- | -- | 2 | -- | -- | 1.92/ 1.92/ 2.00 | 100 |
| E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | *66.9 | 4.0 | 17.2 | 6.0 | 6.0 | 7 | 0.73 | -- | 1.62/ 1.49/ 0.29 | 151 |
| M | *14.0 | 9.5 | 13.0 | 7.4 | 1.4 | -- | 0.4 | 5.3 | 0.4 | 1.4 | 40.0 | 7.4 | 19 | 0.24 | -- | 0.08/ 0.52/-0.87 | 285 |
| Triple (1892:1945)1969 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | CGA | GCA | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | |||||||
| T | 95.4 | 2.7 | 1.4 | 0.5 | 5 | -- | -- | 1.68/ 1.66/ 1.92 | 845 | |||||||
| 3 | 94.2 | 5.3 | 0.2 | 0.2 | 3 | -- | -- | 1.69/ 1.71/ 1.98 | 433 | |||||||
| B | 98.3 | 0.8 | 0.4 | 0.4 | 3 | -- | -- | 1.94/ 1.93/ 1.91 | 238 | |||||||
| A | 48.8 | 51.2 | -- | -- | 2 | -- | -- | 1.00/ 1.00/ 2.00 | 41 | |||||||
| C | 100.0 | -- | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 101 | |||||||
| E | 99.4 | -- | 0.6 | -- | 1 | -- | -- | 1.93/ 2.00/ 2.00 | 155 | |||||||
| M | 95.5 | -- | 3.5 | 1.0 | 3 | -- | -- | 1.67/ 1.63/ 1.83 | 311 | |||||||
| Triple (2105:2481)2484 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | CGU | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | ||||||||
| T | 98.9 | 0.2 | 0.8 | 3 | -- | -- | 1.92/ 1.93/ 2.00 | 832 | ||||||||
| 3 | 99.3 | 0.2 | 0.5 | 2 | -- | -- | 1.96/ 1.97/ 2.00 | 423 | ||||||||
| B | 98.8 | 0.4 | 0.8 | 2 | -- | -- | 1.93/ 1.95/ 2.00 | 240 | ||||||||
| A | 100.0 | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 41 | ||||||||
| C | 100.0 | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 99 | ||||||||
| E | 100.0 | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 142 | ||||||||
| M | 98.1 | 0.3 | 1.6 | 2 | -- | -- | 1.84/ 1.88/ 2.00 | 310 | ||||||||
| Triple (2106:2480)2484 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | CGU | UAU | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | |||||||
| T | 97.8 | 1.1 | 0.5 | 0.6 | 3 | -- | -- | 1.85/ 1.87/ 2.00 | 833 | |||||||
| 3 | 99.3 | -- | 0.7 | -- | 1 | -- | -- | 1.97/ 1.92/ 2.00 | 424 | |||||||
| B | 99.6 | -- | 0.4 | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 1.95/ 2.00 | 240 | |||||||
| A | 100.0 | -- | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 41 | |||||||
| C | 100.0 | -- | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 99 | |||||||
| E | 98.6 | -- | 1.4 | -- | 1 | -- | -- | 1.93/ 1.87/ 2.00 | 143 | |||||||
| M | 95.2 | 2.9 | 0.3 | 1.6 | 3 | -- | -- | 1.70/ 1.81/ 2.00 | 310 | |||||||
| Triple (2482:2486)2102 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | AAG | GAG | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | |||||||
| T | 0.4 | 98.1 | 1.4 | 0.1 | 3 | -- | -- | 1.83/ 2.00/ 1.99 | 830 | |||||||
| 3 | 0.7 | 97.2 | 2.1 | -- | 2 | -- | -- | 1.77/ 2.00/ 1.97 | 422 | |||||||
| B | -- | 96.3 | 3.7 | -- | 1 | -- | -- | 1.70/ 2.00/ 2.00 | 242 | |||||||
| A | 7.5 | 92.5 | -- | -- | 2 | -- | -- | 1.62/ 2.00/ 2.00 | 40 | |||||||
| C | -- | 100.0 | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 99 | |||||||
| E | -- | 99.3 | 0.7 | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 1.93 | 141 | |||||||
| M | -- | 98.7 | 1.0 | 0.3 | 2 | -- | -- | 1.87/ 2.00/ 2.00 | 309 | |||||||
| Triple (2485:2536)2104 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | AAC | ACC | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | |||||||
| T | 0.4 | 98.8 | 0.4 | 0.5 | 5 | -- | -- | 1.97/ 1.97/ 1.93 | 827 | |||||||
| 3 | 0.7 | 98.8 | 0.5 | -- | 2 | -- | -- | 2.00/ 1.94/ 1.95 | 420 | |||||||
| B | -- | 99.2 | 0.8 | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 1.91 | 241 | |||||||
| A | 7.3 | 92.7 | -- | -- | 2 | -- | -- | 2.00/ 1.62/ 2.00 | 41 | |||||||
| C | -- | 100.0 | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 100 | |||||||
| E | -- | 100.0 | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 138 | |||||||
| M | -- | 98.4 | 0.3 | 1.3 | 4 | -- | -- | 1.94/ 2.00/ 1.91 | 307 | |||||||
| Triple (2555:2580)2600 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | AUA | CGA | CGC | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | ||||||
| T | 2.4 | *93.5 | 0.8 | 2.0 | 1.4 | 10 | -- | -- | 1.63/ 1.62/ 1.71 | 796 | ||||||
| 3 | -- | 97.9 | 1.4 | 0.2 | 0.5 | 3 | -- | -- | 2.00/ 1.97/ 1.85 | 420 | ||||||
| B | -- | 100.0 | -- | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 243 | ||||||
| A | -- | 100.0 | -- | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 41 | ||||||
| C | -- | 100.0 | -- | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 99 | ||||||
| E | -- | 93.4 | 4.4 | 0.7 | 1.5 | 3 | -- | -- | 2.00/ 1.92/ 1.64 | 136 | ||||||
| M | 6.9 | *84.5 | -- | 5.4 | 3.2 | 8 | 0.90 | -- | 1.20/ 1.18/ 1.50 | 277 | ||||||
| Triple (2730:2752)1810 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | AUC | CGA | CGC | CGU | GCA | GCC | UAC | UGU | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | |
| T | *25.4 | 4.2 | 0.8 | *8.2 | *4.6 | 14.1 | 5.9 | 2.5 | 32.6 | 1.8 | 15 | 0.57 | -- | -0.80/-0.77/-0.27 | 733 | |
| 3 | *32.4 | 7.6 | 1.5 | *14.7 | *8.1 | 20.4 | 7.6 | 4.4 | 1.7 | 1.5 | 12 | 0.56 | -- | 0.07/ 0.10/ 0.57 | 407 | |
| B | *57.1 | -- | -- | -- | *13.4 | 17.7 | 10.8 | -- | 0.4 | 0.4 | 5 | 0.71 | -- | 0.68/ 0.64/ 1.43 | 231 | |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 41 | |
| C | 78.6 | -- | -- | -- | -- | 12.5 | 7.1 | -- | -- | 1.8 | 4 | -- | -- | 1.12/ 1.12/ 1.86 | 56 | |
| E | -- | 23.0 | 4.4 | *43.7 | *2.2 | 0.7 | *4.4 | 13.3 | 4.4 | 3.7 | 10 | 0.53 | -- | 0.89/ 1.16/ 0.43 | 135 | |
| M | 3.7 | -- | -- | -- | 0.4 | *4.8 | 3.0 | -- | 85.9 | 2.2 | 7 | 0.42 | -- | -0.59/-0.59/-0.46 | 270 | |
| Triple (2731:2751)1811 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | AUA | AUG | GCA | GCG | GGG | GUA | GUG | gap | Other | N | CovT1 | CovT2 | Conservation | Seq | ||
| T | 3.1 | *0.4 | *55.3 | 3.4 | 1.1 | 0.8 | 1.4 | 32.1 | 2.5 | 18 | 0.82 | -- | 0.22/ 0.03/ 0.17 | 733 | ||
| 3 | 3.4 | *0.7 | *80.1 | 6.1 | 2.0 | 1.5 | 2.5 | 0.7 | 2.9 | 16 | 0.81 | -- | 1.65/ 1.28/ 1.34 | 407 | ||
| B | -- | -- | 99.6 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | 2 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 1.96 | 231 | ||
| A | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1 | -- | -- | 2.00/ 2.00/ 2.00 | 41 | ||
| C | 1.8 | -- | 98.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2 | -- | -- | 1.87/ 1.87/ 2.00 | 56 | ||
| E | 10.4 | *2.2 | *40.7 | 18.5 | 5.9 | 4.4 | 7.4 | 2.2 | 8.1 | 16 | 0.44 | -- | 1.21/ 0.55/ 0.75 | 135 | ||
| M | 3.0 | -- | *8.9 | -- | -- | -- | -- | 85.9 | 2.2 | 4 | 0.79 | 0.79 | -0.54/-0.54/-0.45 | 270 | ||
Last modified on 26 June 2002.