Lonepair Triloop: 5S rRNA Base Pair Frequencies for Tertiary Interactions


Base Pair (3:25)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.5* -- 0.7* -- 0.3 -- 0.2* -- -- 0.2 0.7 -- 0.5 0.2 96.8609
B -- -- 10.0* -- 4.0* -- 4.0 -- -- 2.0 -- -- -- -- 6.0 2.0 72.050
A -- -- -- -- 4.4 -- -- -- 2.2* -- -- -- 8.9* -- 2.2* 2.2 80.045
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0296
 

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