Filename: a.16.c.C.coccineum.bpseq Organism: Cynomorium coccineum Accession Number: U67743 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 U 0 2 C 0 3 U 0 4 C 0 5 A 0 6 U 0 7 G 0 8 G 0 9 A 0 10 G 26 11 A 25 12 G 24 13 U 23 14 U 22 15 C 0 16 G 0 17 A 0 18 U 860 19 C 859 20 C 858 21 U 0 22 G 14 23 G 13 24 C 12 25 U 11 26 C 10 27 A 0 28 G 500 29 G 499 30 A 498 31 U 497 32 G 0 33 A 496 34 A 495 35 C 494 36 G 493 37 C 492 38 U 491 39 G 0 40 G 371 41 C 370 42 G 369 43 G 368 44 C 367 45 A 366 46 U 364 47 G 363 48 C 0 49 U 0 50 U 0 51 A 0 52 A 0 53 C 328 54 A 327 55 C 326 56 A 0 57 U 325 58 G 324 59 C 323 60 A 0 61 A 0 62 G 88 63 U 87 64 U 86 65 G 0 66 U 0 67 A 85 68 C 84 69 U 83 70 G 82 71 U 81 72 A 80 73 U 79 74 A 78 75 U 0 76 A 0 77 A 0 78 U 74 79 A 73 80 U 72 81 A 71 82 U 70 83 A 69 84 G 68 85 U 67 86 G 64 87 G 63 88 C 62 89 G 0 90 C 0 91 A 0 92 C 0 93 G 0 94 G 0 95 G 283 96 U 282 97 G 281 98 C 0 99 A 0 100 U 0 101 A 0 102 A 0 103 C 0 104 A 208 105 C 207 106 G 206 107 U 205 108 A 204 109 A 203 110 G 202 111 A 201 112 A 0 113 C 200 114 C 199 115 U 0 116 A 0 117 C 0 118 C 196 119 C 195 120 U 194 121 U 193 122 G 192 123 G 191 124 G 190 125 A 0 126 G 160 127 G 159 128 G 158 129 G 157 130 A 156 131 A 0 132 C 0 133 A 0 134 A 151 135 C 150 136 G 149 137 U 148 138 C 147 139 U 146 140 G 145 141 G 0 142 A 0 143 A 0 144 A 0 145 U 140 146 G 139 147 G 138 148 C 137 149 C 136 150 G 135 151 A 134 152 A 0 153 A 0 154 A 0 155 U 0 156 A 130 157 C 129 158 C 128 159 C 127 160 C 126 161 G 0 162 U 0 163 U 0 164 A 0 165 G 174 166 C 173 167 U 172 168 G 0 169 A 0 170 G 0 171 G 0 172 A 167 173 G 166 174 C 165 175 A 0 176 A 0 177 U 0 178 A 0 179 G 188 180 G 187 181 A 186 182 G 0 183 G 0 184 A 0 185 A 0 186 U 181 187 U 180 188 C 179 189 G 0 190 C 124 191 C 123 192 C 122 193 A 121 194 A 120 195 G 119 196 G 118 197 A 0 198 G 0 199 G 114 200 G 113 201 G 111 202 C 110 203 U 109 204 C 108 205 G 107 206 C 106 207 G 105 208 U 104 209 C 255 210 U 254 211 G 253 212 A 0 213 U 0 214 U 252 215 A 0 216 G 246 217 C 245 218 U 244 219 A 0 220 G 0 221 U 243 222 U 242 223 G 241 224 G 240 225 U 239 226 G 238 227 A 237 228 G 236 229 G 0 230 C 0 231 A 0 232 A 0 233 U 0 234 A 0 235 G 0 236 C 228 237 U 227 238 U 226 239 A 225 240 C 224 241 C 223 242 A 222 243 A 221 244 G 218 245 G 217 246 C 216 247 G 0 248 A 0 249 U 0 250 G 0 251 A 0 252 U 214 253 C 211 254 A 210 255 G 209 256 U 0 257 A 0 258 G 280 259 C 279 260 U 278 261 G 277 262 G 273 263 U 272 264 C 271 265 U 270 266 G 0 267 A 0 268 G 0 269 A 0 270 G 265 271 G 264 272 A 263 273 U 262 274 G 0 275 A 0 276 U 0 277 C 261 278 A 260 279 G 259 280 C 258 281 C 97 282 A 96 283 C 95 284 A 0 285 C 306 286 U 305 287 G 304 288 G 303 289 G 302 290 A 301 291 C 0 292 U 0 293 G 0 294 A 0 295 G 0 296 A 0 297 C 0 298 A 0 299 C 0 300 G 0 301 G 290 302 C 289 303 C 288 304 C 287 305 A 286 306 G 285 307 A 0 308 C 319 309 U 318 310 C 317 311 C 316 312 U 0 313 A 0 314 C 0 315 G 0 316 G 311 317 G 310 318 A 309 319 G 308 320 G 0 321 C 0 322 A 0 323 G 59 324 C 58 325 A 57 326 G 55 327 U 54 328 G 53 329 G 0 330 G 0 331 G 0 332 A 0 333 A 0 334 U 0 335 U 0 336 U 361 337 U 0 338 C 360 339 C 359 340 G 358 341 C 0 342 A 0 343 A 0 344 U 356 345 G 355 346 G 354 347 G 0 348 C 353 349 G 0 350 A 0 351 A 0 352 A 0 353 G 348 354 C 346 355 U 345 356 G 344 357 A 0 358 C 340 359 G 339 360 G 338 361 A 336 362 G 0 363 C 47 364 A 46 365 A 0 366 U 45 367 G 44 368 C 43 369 C 42 370 G 41 371 C 40 372 G 0 373 U 0 374 G 404 375 G 403 376 A 402 377 G 401 378 G 0 379 U 0 380 A 0 381 A 0 382 A 0 383 A 0 384 G 395 385 G 394 386 C 393 387 U 392 388 U 0 389 A 0 390 U 0 391 G 0 392 G 387 393 G 386 394 U 385 395 C 384 396 A 0 397 U 0 398 G 0 399 A 0 400 A 0 401 C 377 402 U 376 403 U 375 404 C 374 405 U 0 406 U 440 407 U 0 408 U 0 409 C 437 410 C 436 411 C 435 412 A 434 413 G 433 414 C 432 415 G 0 416 A 0 417 A 0 418 U 427 419 A 0 420 A 0 421 A 0 422 A 0 423 A 0 424 U 0 425 G 0 426 A 0 427 C 418 428 G 0 429 G 0 430 U 0 431 A 0 432 U 414 433 C 413 434 U 412 435 G 411 436 G 410 437 A 409 438 G 0 439 A 0 440 A 406 441 U 0 442 A 0 443 A 0 444 G 489 445 C 488 446 A 487 447 U 486 448 C 485 449 G 0 450 G 0 451 C 0 452 U 0 453 A 0 454 A 0 455 C 484 456 U 483 457 C 482 458 U 481 459 G 480 460 U 0 461 G 0 462 C 0 463 C 0 464 A 0 465 G 0 466 C 0 467 A 0 468 G 0 469 C 0 470 C 0 471 G 0 472 C 0 473 G 0 474 G 0 475 U 0 476 A 0 477 A 0 478 U 0 479 A 0 480 C 459 481 A 458 482 G 457 483 A 456 484 G 455 485 G 448 486 A 447 487 U 446 488 G 445 489 C 444 490 A 0 491 A 38 492 G 37 493 C 36 494 G 35 495 U 34 496 U 33 497 A 31 498 U 30 499 C 29 500 C 28 501 G 0 502 G 0 503 A 0 504 A 0 505 U 0 506 G 0 507 A 0 508 U 0 509 U 0 510 G 0 511 G 825 512 G 824 513 C 823 514 G 0 515 U 0 516 A 0 517 A 0 518 A 0 519 G 0 520 A 0 521 G 707 522 U 706 523 C 705 524 U 704 525 G 0 526 U 0 527 A 0 528 G 700 529 G 699 530 U 698 531 G 697 532 G 594 533 C 593 534 U 592 535 U 591 536 U 590 537 U 589 538 U 588 539 A 0 540 A 587 541 G 586 542 U 583 543 C 582 544 C 581 545 G 580 546 U 579 547 C 578 548 G 577 549 U 576 550 C 575 551 A 0 552 A 0 553 A 0 554 U 0 555 C 0 556 C 572 557 C 571 558 A 570 559 G 569 560 G 568 561 G 567 562 C 566 563 U 0 564 C 0 565 A 0 566 A 562 567 C 561 568 C 560 569 C 559 570 U 558 571 G 557 572 U 556 573 A 0 574 A 0 575 U 550 576 A 549 577 C 548 578 G 547 579 G 546 580 U 545 581 G 544 582 G 543 583 A 542 584 A 0 585 A 0 586 C 541 587 U 540 588 A 538 589 U 537 590 C 536 591 A 535 592 A 534 593 G 533 594 C 532 595 U 0 596 U 0 597 G 0 598 A 694 599 G 693 600 U 692 601 A 691 602 C 689 603 G 688 604 U 687 605 U 686 606 A 685 607 G 0 608 G 684 609 G 683 610 G 682 611 C 681 612 A 680 613 G 679 614 A 678 615 G 677 616 G 660 617 G 659 618 A 658 619 A 657 620 U 656 621 U 655 622 U 654 623 A 653 624 U 652 625 G 651 626 G 650 627 U 649 628 G 0 629 G 0 630 A 0 631 G 642 632 C 641 633 G 640 634 G 0 635 U 0 636 U 0 637 A 0 638 U 0 639 A 0 640 U 633 641 G 632 642 U 631 643 G 0 644 U 0 645 A 0 646 G 0 647 A 0 648 G 0 649 A 627 650 U 626 651 C 625 652 A 624 653 G 623 654 A 622 655 A 621 656 A 620 657 G 619 658 A 618 659 A 617 660 C 616 661 A 0 662 C 0 663 C 0 664 A 0 665 A 676 666 C 0 667 G 0 668 G 675 669 C 674 670 G 0 671 A 0 672 A 0 673 A 0 674 G 669 675 C 668 676 A 665 677 C 615 678 U 614 679 C 613 680 U 612 681 G 611 682 C 610 683 U 609 684 G 608 685 G 606 686 G 605 687 A 604 688 C 603 689 G 602 690 A 0 691 U 601 692 A 600 693 C 599 694 U 598 695 G 0 696 A 0 697 C 531 698 A 530 699 C 529 700 U 528 701 G 0 702 A 0 703 G 0 704 A 524 705 G 523 706 A 522 707 C 521 708 G 0 709 A 0 710 A 0 711 A 0 712 G 753 713 C 752 714 U 751 715 A 750 716 G 749 717 G 748 718 G 747 719 G 0 720 A 0 721 G 0 722 C 746 723 A 0 724 A 0 725 A 0 726 U 742 727 G 741 728 G 740 729 G 739 730 A 0 731 U 0 732 U 0 733 A 0 734 G 0 735 A 0 736 U 0 737 A 0 738 C 0 739 C 729 740 C 728 741 C 727 742 G 726 743 G 0 744 U 0 745 A 0 746 G 722 747 U 718 748 C 717 749 C 716 750 U 715 751 A 714 752 G 713 753 C 712 754 C 0 755 G 0 756 U 0 757 A 0 758 A 0 759 A 0 760 C 0 761 G 0 762 A 0 763 U 0 764 G 821 765 G 820 766 A 819 767 U 818 768 A 817 769 C 816 770 U 0 771 A 0 772 A 799 773 G 798 774 C 797 775 G 796 776 C 795 777 U 794 778 G 793 779 U 792 780 G 791 781 U 790 782 A 0 783 U 0 784 C 0 785 G 0 786 A 0 787 C 0 788 C 0 789 C 0 790 G 781 791 U 780 792 G 779 793 C 778 794 A 777 795 G 776 796 U 775 797 A 774 798 C 773 799 U 772 800 G 0 801 U 0 802 A 0 803 G 810 804 C 809 805 U 0 806 A 0 807 A 0 808 C 0 809 G 804 810 C 803 811 A 0 812 U 0 813 U 0 814 A 0 815 A 0 816 G 769 817 U 768 818 A 767 819 U 766 820 C 765 821 C 764 822 C 0 823 G 513 824 C 512 825 C 511 826 U 0 827 G 854 828 G 853 829 G 852 830 G 0 831 A 0 832 G 0 833 U 0 834 A 0 835 U 0 836 G 847 837 U 846 838 U 845 839 C 844 840 G 0 841 C 0 842 A 0 843 A 0 844 G 839 845 A 838 846 A 837 847 U 836 848 G 0 849 A 0 850 A 0 851 A 0 852 C 829 853 U 828 854 C 827 855 A 0 856 A 0 857 A 0 858 G 20 859 G 19 860 A 18 861 A 0 862 U 0 863 U 1331 864 G 1330 865 G 1328 866 C 1327 867 G 1326 868 G 0 869 G 1325 870 G 1324 871 G 1323 872 C 1322 873 C 1321 874 C 1320 875 G 1319 876 C 0 877 A 0 878 C 0 879 A 0 880 A 1279 881 G 1278 882 C 1277 883 G 1276 884 G 1275 885 U 1274 886 G 0 887 G 1170 888 A 1169 889 G 1168 890 C 1167 891 A 1166 892 U 1165 893 G 1164 894 U 1163 895 G 1162 896 G 1160 897 U 1159 898 U 0 899 U 0 900 A 0 901 A 0 902 U 917 903 U 916 904 C 915 905 G 914 906 A 0 907 U 0 908 G 0 909 C 0 910 A 0 911 A 0 912 A 0 913 G 0 914 C 905 915 G 904 916 A 903 917 A 902 918 G 0 919 A 0 920 A 0 921 C 0 922 C 0 923 U 0 924 U 0 925 A 0 926 C 1155 927 C 1154 928 A 1153 929 G 1152 930 G 1151 931 G 1150 932 C 1149 933 U 0 934 U 0 935 G 0 936 A 0 937 C 0 938 A 987 939 U 986 940 G 985 941 C 983 942 C 982 943 G 981 944 C 980 945 G 979 946 A 0 947 A 0 948 U 965 949 C 964 950 C 963 951 U 962 952 A 961 953 U 960 954 C 959 955 G 0 956 A 0 957 A 0 958 A 0 959 G 954 960 A 953 961 U 952 962 A 951 963 G 950 964 G 949 965 G 948 966 G 0 967 U 978 968 G 977 969 C 976 970 C 975 971 C 0 972 U 0 973 C 0 974 G 0 975 G 970 976 G 969 977 A 968 978 A 967 979 C 945 980 G 944 981 U 943 982 G 942 983 G 941 984 A 0 985 C 940 986 A 939 987 C 938 988 A 0 989 G 1144 990 G 1143 991 U 0 992 G 1142 993 G 1141 994 U 1140 995 G 1139 996 C 0 997 A 0 998 U 1138 999 G 1137 1000 G 1133 1001 C 1132 1002 U 1131 1003 G 1129 1004 U 1128 1005 C 1127 1006 G 1126 1007 U 0 1008 C 0 1009 A 0 1010 G 1049 1011 C 1048 1012 U 1047 1013 C 1046 1014 G 1045 1015 U 1044 1016 G 1025 1017 C 1024 1018 C 1023 1019 G 0 1020 U 0 1021 A 0 1022 A 0 1023 G 1018 1024 G 1017 1025 U 1016 1026 G 0 1027 U 0 1028 U 1041 1029 G 1040 1030 G 1039 1031 G 1038 1032 U 0 1033 U 0 1034 A 0 1035 A 0 1036 G 0 1037 U 0 1038 C 1031 1039 C 1030 1040 C 1029 1041 C 1028 1042 U 0 1043 A 0 1044 A 1015 1045 C 1014 1046 G 1013 1047 A 1012 1048 G 1011 1049 C 1010 1050 G 0 1051 C 0 1052 A 0 1053 A 0 1054 C 0 1055 C 1121 1056 C 1120 1057 U 1119 1058 C 1118 1059 A 1117 1060 U 1089 1061 G 1088 1062 U 1087 1063 U 1086 1064 U 1085 1065 A 1084 1066 G 1083 1067 U 0 1068 U 0 1069 G 1079 1070 C 1078 1071 C 1077 1072 A 0 1073 U 0 1074 A 0 1075 U 0 1076 A 0 1077 G 1071 1078 G 1070 1079 A 1069 1080 A 0 1081 C 0 1082 U 0 1083 C 1066 1084 U 1065 1085 G 1064 1086 A 1063 1087 G 1062 1088 C 1061 1089 A 1060 1090 G 0 1091 A 0 1092 C 0 1093 U 0 1094 G 0 1095 C 1109 1096 C 1108 1097 G 1107 1098 G 1106 1099 U 1105 1100 U 0 1101 A 0 1102 U 0 1103 A 0 1104 A 0 1105 G 1099 1106 C 1098 1107 C 1097 1108 G 1096 1109 G 1095 1110 A 0 1111 G 0 1112 G 0 1113 A 0 1114 G 0 1115 G 0 1116 G 0 1117 U 1059 1118 G 1058 1119 A 1057 1120 G 1056 1121 G 1055 1122 A 0 1123 U 0 1124 G 0 1125 A 0 1126 C 1006 1127 G 1005 1128 U 1004 1129 C 1003 1130 A 0 1131 A 1002 1132 G 1001 1133 U 1000 1134 C 0 1135 A 0 1136 U 0 1137 C 999 1138 A 998 1139 U 995 1140 G 994 1141 C 993 1142 C 992 1143 C 990 1144 C 989 1145 U 0 1146 U 0 1147 A 0 1148 U 0 1149 G 932 1150 C 931 1151 C 930 1152 C 929 1153 U 928 1154 G 927 1155 G 926 1156 G 0 1157 C 0 1158 G 0 1159 A 897 1160 C 896 1161 A 0 1162 C 895 1163 A 894 1164 C 893 1165 G 892 1166 U 891 1167 G 890 1168 C 889 1169 U 888 1170 A 887 1171 C 0 1172 A 0 1173 A 0 1174 U 0 1175 G 1230 1176 G 1229 1177 U 1228 1178 C 1227 1179 G 1226 1180 G 1225 1181 G 1224 1182 A 0 1183 C 0 1184 A 0 1185 A 0 1186 A 0 1187 G 1218 1188 G 1217 1189 G 1216 1190 C 0 1191 C 0 1192 G 1211 1193 C 1210 1194 A 0 1195 A 0 1196 U 0 1197 A 1206 1198 C 1205 1199 C 1204 1200 G 0 1201 C 0 1202 G 0 1203 A 0 1204 G 1199 1205 G 1198 1206 G 1197 1207 C 0 1208 G 0 1209 A 0 1210 G 1193 1211 C 1192 1212 U 0 1213 A 0 1214 A 0 1215 C 0 1216 C 1189 1217 C 1188 1218 C 1187 1219 A 0 1220 A 0 1221 A 0 1222 A 0 1223 A 0 1224 C 1181 1225 C 1180 1226 C 1179 1227 U 1178 1228 U 1177 1229 C 1176 1230 C 1175 1231 U 0 1232 C 0 1233 A 0 1234 G 0 1235 U 0 1236 U 0 1237 C 1268 1238 G 1267 1239 G 1266 1240 A 1265 1241 U 1264 1242 U 1263 1243 G 1262 1244 A 1261 1245 A 1260 1246 G 1259 1247 G 1258 1248 C 1257 1249 U 0 1250 G 0 1251 C 0 1252 A 0 1253 A 0 1254 C 0 1255 U 0 1256 C 0 1257 G 1248 1258 C 1247 1259 C 1246 1260 U 1245 1261 A 1244 1262 C 1243 1263 A 1242 1264 U 1241 1265 G 1240 1266 A 1239 1267 A 1238 1268 G 1237 1269 U 0 1270 A 0 1271 G 0 1272 G 0 1273 A 0 1274 A 885 1275 U 884 1276 C 883 1277 G 882 1278 C 881 1279 U 880 1280 A 0 1281 G 0 1282 U 0 1283 A 0 1284 A 1307 1285 U 1306 1286 C 1305 1287 G 1304 1288 C 1303 1289 C 1302 1290 G 1301 1291 G 1300 1292 U 0 1293 C 0 1294 A 0 1295 G 0 1296 C 0 1297 C 0 1298 A 0 1299 U 0 1300 A 1291 1301 C 1290 1302 G 1289 1303 G 1288 1304 C 1287 1305 G 1286 1306 G 1285 1307 U 1284 1308 G 0 1309 A 0 1310 A 0 1311 U 0 1312 U 0 1313 U 0 1314 G 0 1315 U 0 1316 U 0 1317 C 0 1318 C 0 1319 C 875 1320 G 874 1321 G 873 1322 G 872 1323 C 871 1324 C 870 1325 U 869 1326 U 867 1327 G 866 1328 U 865 1329 A 0 1330 C 864 1331 A 863 1332 C 0 1333 A 0 1334 C 0 1335 U 0 1336 G 1439 1337 C 1438 1338 C 0 1339 C 1435 1340 G 1434 1341 U 0 1342 C 1432 1343 A 0 1344 C 1429 1345 A 1428 1346 C 1427 1347 U 1426 1348 A 1425 1349 U 1424 1350 G 1423 1351 G 1422 1352 G 1421 1353 A 1420 1354 G 1419 1355 C 1418 1356 U 1417 1357 G 1416 1358 G 1415 1359 G 1414 1360 C 1413 1361 A 1412 1362 U 1411 1363 A 1410 1364 C 1409 1365 C 1408 1366 C 0 1367 G 0 1368 A 0 1369 A 0 1370 A 1401 1371 U 1400 1372 U 1399 1373 A 0 1374 C 1398 1375 C 1397 1376 U 1396 1377 U 1395 1378 A 0 1379 A 1393 1380 C 1392 1381 U 1391 1382 A 0 1383 C 0 1384 A 0 1385 A 0 1386 U 0 1387 U 0 1388 U 0 1389 U 0 1390 A 0 1391 A 1381 1392 G 1380 1393 U 1379 1394 A 0 1395 G 1377 1396 G 1376 1397 G 1375 1398 G 1374 1399 G 1372 1400 A 1371 1401 U 1370 1402 G 0 1403 A 0 1404 C 0 1405 G 0 1406 A 0 1407 A 0 1408 G 1365 1409 G 1364 1410 U 1363 1411 A 1362 1412 G 1361 1413 G 1360 1414 A 1359 1415 C 1358 1416 U 1357 1417 A 1356 1418 G 1355 1419 U 1354 1420 G 1353 1421 A 1352 1422 C 1351 1423 U 1350 1424 A 1349 1425 G 1348 1426 A 1347 1427 G 1346 1428 U 1345 1429 G 1344 1430 A 0 1431 A 0 1432 G 1342 1433 U 0 1434 C 1340 1435 G 1339 1436 U 0 1437 A 0 1438 A 1337 1439 C 1336 1440 A 0 1441 A 0 1442 G 0 1443 G 0 1444 U 1467 1445 A 1466 1446 G 1465 1447 C 1464 1448 C 1463 1449 G 1462 1450 U 1461 1451 A 1460 1452 C 1459 1453 U 1458 1454 G 0 1455 G 0 1456 A 0 1457 A 0 1458 G 1453 1459 G 1452 1460 U 1451 1461 G 1450 1462 C 1449 1463 G 1448 1464 G 1447 1465 C 1446 1466 U 1445 1467 G 1444 1468 G 0 1469 A 0 1470 U 0 1471 C 0 1472 A 0 1473 C 0 1474 C 0 1475 U 0 1476 C 0 1477 C 0 1478 U 0 1479 U 0 1480 U 0