Filename: a.16.c.G.wittrockiana.bpseq Organism: Gloeochaete wittrockiana Accession Number: X82495 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 G 0 2 U 0 3 G 0 4 C 0 5 U 0 6 G 0 7 C 0 8 A 0 9 G 0 10 A 0 11 G 27 12 A 26 13 G 25 14 U 24 15 U 23 16 U 0 17 G 0 18 A 0 19 U 896 20 C 895 21 C 894 22 U 0 23 G 15 24 G 14 25 C 13 26 U 12 27 C 11 28 A 0 29 G 533 30 G 532 31 A 531 32 U 530 33 G 0 34 A 529 35 A 528 36 C 527 37 G 526 38 C 525 39 U 524 40 G 0 41 G 402 42 C 401 43 G 400 44 G 399 45 U 398 46 A 397 47 U 395 48 G 394 49 C 0 50 U 0 51 U 0 52 A 0 53 A 0 54 C 359 55 A 358 56 C 357 57 A 0 58 U 356 59 G 355 60 C 354 61 A 0 62 A 0 63 G 92 64 U 91 65 C 90 66 G 0 67 A 0 68 A 89 69 C 88 70 G 87 71 A 86 72 A 85 73 A 84 74 A 83 75 U 82 76 U 81 77 G 0 78 A 0 79 A 0 80 A 0 81 A 76 82 A 75 83 U 74 84 U 73 85 U 72 86 U 71 87 A 70 88 G 69 89 U 68 90 G 65 91 G 64 92 C 63 93 G 0 94 A 0 95 A 0 96 C 0 97 G 0 98 G 0 99 G 314 100 U 313 101 G 312 102 A 0 103 G 0 104 U 0 105 A 0 106 A 0 107 C 0 108 G 239 109 C 238 110 G 237 111 U 236 112 G 235 113 A 234 114 G 233 115 A 232 116 A 0 117 U 231 118 C 230 119 U 0 120 G 0 121 C 0 122 C 227 123 U 226 124 C 225 125 A 224 126 A 223 127 G 222 128 G 221 129 A 0 130 G 184 131 G 183 132 A 182 133 G 181 134 G 180 135 A 0 136 U 0 137 A 0 138 A 175 139 C 174 140 A 173 141 G 172 142 U 0 143 A 158 144 G 157 145 G 156 146 A 155 147 A 154 148 U 153 149 G 0 150 C 0 151 A 0 152 A 0 153 G 148 154 U 147 155 U 146 156 C 145 157 C 144 158 U 143 159 U 0 160 G 0 161 U 0 162 G 171 163 U 170 164 C 169 165 G 0 166 A 0 167 A 0 168 A 0 169 G 164 170 A 163 171 U 162 172 C 141 173 U 140 174 G 139 175 C 138 176 U 0 177 A 0 178 A 0 179 U 0 180 A 134 181 C 133 182 U 132 183 C 131 184 C 130 185 G 0 186 U 0 187 A 0 188 U 0 189 G 198 190 C 197 191 C 196 192 G 0 193 A 0 194 A 0 195 A 0 196 G 191 197 G 190 198 U 189 199 G 0 200 A 0 201 A 0 202 A 0 203 G 219 204 G 218 205 A 217 206 U 216 207 U 215 208 G 214 209 A 213 210 U 0 211 U 0 212 U 0 213 U 209 214 C 208 215 A 207 216 A 206 217 U 205 218 C 204 219 U 203 220 G 0 221 C 128 222 C 127 223 U 126 224 A 125 225 G 124 226 A 123 227 G 122 228 A 0 229 A 0 230 G 118 231 A 117 232 G 115 233 C 114 234 U 113 235 C 112 236 G 111 237 C 110 238 G 109 239 U 108 240 C 286 241 U 285 242 G 284 243 A 0 244 U 0 245 U 283 246 A 0 247 G 277 248 C 276 249 U 275 250 A 0 251 G 0 252 U 274 253 U 273 254 G 272 255 G 271 256 U 270 257 A 269 258 A 268 259 G 267 260 G 0 261 U 0 262 A 0 263 A 0 264 U 0 265 G 0 266 G 0 267 C 259 268 U 258 269 U 257 270 A 256 271 C 255 272 C 254 273 A 253 274 A 252 275 G 249 276 G 248 277 C 247 278 G 0 279 A 0 280 U 0 281 G 0 282 A 0 283 U 245 284 C 242 285 A 241 286 G 240 287 U 0 288 A 0 289 G 311 290 C 310 291 U 309 292 G 308 293 G 304 294 U 303 295 C 302 296 U 301 297 G 0 298 A 0 299 G 0 300 A 0 301 G 296 302 G 295 303 A 294 304 U 293 305 G 0 306 A 0 307 U 0 308 C 292 309 A 291 310 G 290 311 C 289 312 C 101 313 A 100 314 C 99 315 A 0 316 C 337 317 U 336 318 G 335 319 G 334 320 G 333 321 A 332 322 C 0 323 U 0 324 G 0 325 A 0 326 G 0 327 A 0 328 U 0 329 A 0 330 C 0 331 G 0 332 G 321 333 C 320 334 C 319 335 C 318 336 A 317 337 G 316 338 A 0 339 C 350 340 U 349 341 C 348 342 C 347 343 U 0 344 A 0 345 C 0 346 G 0 347 G 342 348 G 341 349 A 340 350 G 339 351 G 0 352 C 0 353 A 0 354 G 60 355 C 59 356 A 58 357 G 56 358 U 55 359 G 54 360 G 0 361 G 0 362 G 0 363 A 0 364 A 0 365 U 0 366 U 0 367 U 392 368 U 0 369 C 391 370 C 390 371 G 389 372 C 0 373 A 0 374 A 0 375 U 387 376 G 386 377 G 385 378 G 0 379 C 384 380 G 0 381 A 0 382 A 0 383 A 0 384 G 379 385 C 377 386 U 376 387 G 375 388 A 0 389 C 371 390 G 370 391 G 369 392 A 367 393 G 0 394 C 48 395 A 47 396 A 0 397 U 46 398 A 45 399 C 44 400 C 43 401 G 42 402 C 41 403 G 0 404 U 0 405 G 435 406 A 434 407 G 433 408 G 432 409 G 0 410 A 0 411 U 0 412 G 0 413 A 0 414 A 0 415 G 426 416 G 425 417 C 424 418 C 423 419 U 0 420 U 0 421 U 0 422 G 0 423 G 418 424 G 417 425 U 416 426 U 415 427 G 0 428 U 0 429 A 0 430 A 0 431 A 0 432 C 408 433 C 407 434 U 406 435 C 405 436 U 0 437 U 473 438 U 0 439 U 0 440 C 470 441 U 469 442 C 468 443 A 467 444 A 466 445 G 465 446 G 0 447 A 0 448 A 0 449 G 460 450 A 0 451 A 0 452 A 0 453 U 0 454 A 0 455 A 0 456 A 0 457 U 0 458 G 0 459 A 0 460 C 449 461 G 0 462 G 0 463 U 0 464 A 0 465 C 445 466 U 444 467 U 443 468 G 442 469 A 441 470 G 440 471 G 0 472 A 0 473 A 437 474 U 0 475 A 0 476 A 0 477 G 522 478 C 521 479 A 520 480 U 519 481 C 518 482 G 0 483 G 0 484 C 0 485 U 0 486 A 0 487 A 0 488 C 517 489 U 516 490 C 515 491 C 514 492 G 513 493 U 0 494 G 0 495 C 0 496 C 0 497 A 0 498 G 0 499 C 0 500 A 0 501 G 0 502 C 0 503 C 0 504 G 0 505 C 0 506 G 0 507 G 0 508 U 0 509 A 0 510 A 0 511 U 0 512 A 0 513 C 492 514 G 491 515 G 490 516 G 489 517 G 488 518 G 481 519 A 480 520 U 479 521 G 478 522 C 477 523 A 0 524 A 39 525 G 38 526 C 37 527 G 36 528 U 35 529 U 34 530 A 32 531 U 31 532 C 30 533 C 29 534 G 0 535 G 0 536 A 0 537 A 0 538 U 0 539 U 0 540 A 0 541 U 0 542 U 0 543 G 0 544 G 861 545 G 860 546 C 859 547 G 0 548 U 0 549 A 0 550 A 0 551 A 0 552 G 0 553 G 0 554 G 741 555 U 740 556 U 739 557 C 738 558 G 0 559 U 0 560 A 0 561 G 734 562 G 733 563 U 732 564 G 731 565 G 628 566 U 627 567 U 626 568 U 625 569 A 624 570 A 623 571 C 622 572 A 0 573 A 621 574 G 620 575 U 617 576 C 616 577 U 615 578 G 614 579 U 613 580 U 612 581 G 611 582 U 610 583 U 609 584 A 0 585 A 0 586 A 0 587 G 0 588 G 0 589 C 605 590 U 604 591 A 603 592 G 602 593 G 601 594 G 600 595 C 0 596 U 0 597 U 0 598 A 0 599 A 0 600 C 594 601 C 593 602 U 592 603 U 591 604 A 590 605 G 589 606 A 0 607 A 0 608 A 0 609 A 583 610 G 582 611 C 581 612 A 580 613 A 579 614 U 578 615 G 577 616 G 576 617 A 575 618 A 0 619 A 0 620 C 574 621 U 573 622 G 571 623 U 570 624 U 569 625 A 568 626 G 567 627 A 566 628 C 565 629 U 0 630 A 0 631 G 0 632 A 728 633 G 727 634 U 726 635 A 724 636 U 723 637 G 722 638 G 721 639 U 720 640 A 719 641 G 0 642 G 718 643 G 717 644 G 716 645 C 715 646 A 714 647 A 713 648 A 712 649 G 711 650 G 694 651 G 693 652 A 692 653 A 691 654 U 690 655 U 689 656 C 688 657 U 687 658 C 686 659 A 685 660 G 684 661 U 683 662 G 0 663 U 0 664 A 0 665 G 676 666 C 675 667 G 674 668 G 0 669 U 0 670 G 0 671 A 0 672 A 0 673 A 0 674 U 667 675 G 666 676 C 665 677 G 0 678 U 0 679 A 0 680 G 0 681 A 0 682 U 0 683 A 661 684 U 660 685 U 659 686 G 658 687 G 657 688 G 656 689 A 655 690 A 654 691 G 653 692 A 652 693 A 651 694 C 650 695 A 0 696 C 0 697 C 0 698 A 0 699 A 710 700 A 0 701 A 0 702 G 709 703 C 708 704 G 0 705 A 0 706 A 0 707 A 0 708 G 703 709 C 702 710 A 699 711 C 649 712 U 648 713 U 647 714 U 646 715 G 645 716 C 644 717 U 643 718 G 642 719 G 640 720 G 639 721 C 638 722 C 637 723 A 636 724 U 635 725 A 0 726 A 634 727 C 633 728 U 632 729 G 0 730 A 0 731 C 564 732 A 563 733 C 562 734 U 561 735 G 0 736 A 0 737 G 0 738 G 557 739 A 556 740 A 555 741 C 554 742 G 0 743 A 0 744 A 0 745 A 0 746 G 787 747 C 786 748 U 785 749 A 784 750 G 783 751 G 782 752 G 781 753 G 0 754 A 0 755 G 0 756 C 780 757 A 0 758 A 0 759 A 0 760 U 776 761 G 775 762 G 774 763 G 773 764 A 0 765 U 0 766 U 0 767 A 0 768 G 0 769 A 0 770 U 0 771 A 0 772 C 0 773 C 763 774 C 762 775 C 761 776 A 760 777 G 0 778 U 0 779 A 0 780 G 756 781 U 752 782 C 751 783 C 750 784 U 749 785 A 748 786 G 747 787 C 746 788 C 0 789 G 0 790 U 0 791 A 0 792 A 0 793 A 0 794 C 0 795 G 0 796 A 0 797 U 0 798 G 857 799 G 856 800 A 855 801 U 854 802 A 853 803 C 852 804 U 851 805 A 0 806 G 835 807 G 834 808 U 833 809 G 832 810 U 831 811 U 830 812 G 829 813 U 828 814 A 827 815 C 826 816 G 825 817 U 0 818 A 0 819 U 0 820 U 0 821 G 0 822 A 0 823 C 0 824 C 0 825 C 816 826 G 815 827 U 814 828 A 813 829 C 812 830 A 811 831 G 810 832 U 809 833 A 808 834 C 807 835 U 806 836 G 0 837 U 0 838 A 0 839 G 846 840 C 845 841 U 0 842 A 0 843 A 0 844 C 0 845 G 840 846 C 839 847 G 0 848 U 0 849 U 0 850 A 0 851 A 804 852 G 803 853 U 802 854 A 801 855 U 800 856 C 799 857 C 798 858 C 0 859 G 546 860 C 545 861 C 544 862 U 0 863 G 890 864 G 889 865 G 888 866 A 0 867 A 0 868 G 0 869 U 0 870 A 0 871 C 0 872 G 883 873 C 882 874 U 881 875 C 880 876 G 0 877 C 0 878 A 0 879 A 0 880 G 875 881 A 874 882 G 873 883 U 872 884 G 0 885 A 0 886 A 0 887 A 0 888 C 865 889 U 864 890 C 863 891 A 0 892 A 0 893 A 0 894 G 21 895 G 20 896 A 19 897 A 0 898 U 0 899 U 1373 900 G 1372 901 A 1370 902 C 1369 903 G 1368 904 G 0 905 G 1367 906 G 1366 907 G 1365 908 C 1364 909 C 1363 910 C 1362 911 G 1361 912 C 0 913 A 0 914 C 0 915 A 0 916 A 1321 917 G 1320 918 C 1319 919 G 1317 920 U 1316 921 G 0 922 G 1212 923 A 1211 924 G 1210 925 C 1209 926 A 1208 927 U 1207 928 G 1206 929 U 1205 930 G 1204 931 G 1202 932 U 1201 933 U 0 934 U 0 935 A 0 936 A 0 937 U 952 938 U 951 939 C 950 940 G 949 941 A 0 942 U 0 943 G 0 944 C 0 945 A 0 946 A 0 947 C 0 948 G 0 949 C 940 950 G 939 951 A 938 952 A 937 953 G 0 954 A 0 955 A 0 956 C 0 957 C 0 958 U 0 959 U 0 960 A 0 961 C 1197 962 C 1196 963 A 1195 964 G 1194 965 G 1193 966 G 1192 967 U 1191 968 U 0 969 U 0 970 G 0 971 A 0 972 C 0 973 A 1022 974 U 1021 975 G 1020 976 U 1018 977 C 1017 978 G 1016 979 C 1015 980 G 1014 981 A 0 982 A 0 983 U 1000 984 U 999 985 U 998 986 U 997 987 C 996 988 U 995 989 U 994 990 G 0 991 A 0 992 A 0 993 A 0 994 A 989 995 A 988 996 G 987 997 A 986 998 A 985 999 A 984 1000 A 983 1001 G 0 1002 U 1013 1003 G 1012 1004 C 1011 1005 C 1010 1006 U 0 1007 U 0 1008 C 0 1009 G 0 1010 G 1005 1011 G 1004 1012 A 1003 1013 G 1002 1014 C 980 1015 G 979 1016 C 978 1017 G 977 1018 A 976 1019 A 0 1020 C 975 1021 A 974 1022 C 973 1023 A 0 1024 G 1186 1025 G 1185 1026 U 0 1027 G 1184 1028 G 1183 1029 U 1182 1030 G 1181 1031 C 0 1032 A 0 1033 U 1180 1034 G 1179 1035 G 1175 1036 C 1174 1037 U 1173 1038 G 1171 1039 U 1170 1040 C 1169 1041 G 1168 1042 U 1167 1043 C 0 1044 A 0 1045 G 1084 1046 C 1083 1047 U 1082 1048 C 1081 1049 G 1080 1050 U 1079 1051 G 1060 1052 U 1059 1053 C 1058 1054 G 0 1055 U 0 1056 G 0 1057 A 0 1058 G 1053 1059 A 1052 1060 U 1051 1061 G 0 1062 U 0 1063 U 1076 1064 G 1075 1065 G 1074 1066 G 1073 1067 U 0 1068 U 0 1069 A 0 1070 A 0 1071 G 0 1072 U 0 1073 C 1066 1074 C 1065 1075 C 1064 1076 G 1063 1077 C 0 1078 A 0 1079 A 1050 1080 C 1049 1081 G 1048 1082 A 1047 1083 G 1046 1084 C 1045 1085 G 0 1086 C 0 1087 A 0 1088 A 0 1089 C 0 1090 C 1163 1091 C 1162 1092 U 1161 1093 U 1160 1094 G 1159 1095 U 1131 1096 U 1130 1097 U 1129 1098 U 1128 1099 U 1127 1100 A 1126 1101 G 1125 1102 U 0 1103 U 1122 1104 G 1121 1105 C 1120 1106 C 1119 1107 A 1117 1108 U 1116 1109 C 1115 1110 A 0 1111 U 0 1112 U 0 1113 A 0 1114 A 0 1115 G 1109 1116 U 1108 1117 U 1107 1118 G 0 1119 G 1106 1120 G 1105 1121 C 1104 1122 A 1103 1123 C 0 1124 U 0 1125 C 1101 1126 U 1100 1127 A 1099 1128 A 1098 1129 A 1097 1130 G 1096 1131 A 1095 1132 G 0 1133 A 0 1134 C 0 1135 U 0 1136 G 0 1137 C 1151 1138 C 1150 1139 G 1149 1140 G 1148 1141 U 1147 1142 G 0 1143 A 0 1144 U 0 1145 A 0 1146 A 0 1147 G 1141 1148 C 1140 1149 C 1139 1150 G 1138 1151 G 1137 1152 A 0 1153 G 0 1154 G 0 1155 A 0 1156 A 0 1157 G 0 1158 G 0 1159 U 1094 1160 A 1093 1161 A 1092 1162 G 1091 1163 G 1090 1164 A 0 1165 U 0 1166 G 0 1167 A 1042 1168 C 1041 1169 G 1040 1170 U 1039 1171 C 1038 1172 A 0 1173 A 1037 1174 G 1036 1175 U 1035 1176 C 0 1177 A 0 1178 G 0 1179 C 1034 1180 A 1033 1181 U 1030 1182 G 1029 1183 C 1028 1184 C 1027 1185 C 1025 1186 C 1024 1187 U 0 1188 U 0 1189 A 0 1190 U 0 1191 A 967 1192 U 966 1193 C 965 1194 C 964 1195 U 963 1196 G 962 1197 G 961 1198 G 0 1199 C 0 1200 U 0 1201 A 932 1202 C 931 1203 A 0 1204 C 930 1205 A 929 1206 C 928 1207 G 927 1208 U 926 1209 G 925 1210 C 924 1211 U 923 1212 A 922 1213 C 0 1214 A 0 1215 A 0 1216 U 0 1217 G 1272 1218 G 1271 1219 U 1270 1220 U 1269 1221 A 1268 1222 A 1267 1223 G 1266 1224 A 0 1225 C 0 1226 A 0 1227 A 0 1228 U 0 1229 A 1260 1230 G 1259 1231 G 1258 1232 U 0 1233 U 0 1234 G 1253 1235 C 1252 1236 A 0 1237 A 0 1238 G 0 1239 C 1248 1240 U 1247 1241 U 1246 1242 G 0 1243 U 0 1244 A 0 1245 A 0 1246 A 1241 1247 A 1240 1248 G 1239 1249 U 0 1250 A 0 1251 A 0 1252 G 1235 1253 C 1234 1254 U 0 1255 A 0 1256 A 0 1257 U 0 1258 C 1231 1259 C 1230 1260 U 1229 1261 U 0 1262 U 0 1263 A 0 1264 A 0 1265 A 0 1266 C 1223 1267 U 1222 1268 U 1221 1269 A 1220 1270 A 1219 1271 U 1218 1272 C 1217 1273 U 0 1274 C 0 1275 A 0 1276 G 0 1277 U 0 1278 U 0 1279 C 1310 1280 A 0 1281 G 0 1282 A 0 1283 U 1306 1284 U 1305 1285 G 1304 1286 U 1303 1287 A 1302 1288 G 1301 1289 G 1300 1290 C 1299 1291 U 0 1292 G 0 1293 C 0 1294 A 0 1295 A 0 1296 C 0 1297 U 0 1298 C 0 1299 G 1290 1300 C 1289 1301 C 1288 1302 U 1287 1303 A 1286 1304 C 1285 1305 A 1284 1306 U 1283 1307 G 0 1308 A 0 1309 A 0 1310 G 1279 1311 G 0 1312 U 0 1313 G 0 1314 G 0 1315 A 0 1316 A 920 1317 U 919 1318 C 0 1319 G 918 1320 C 917 1321 U 916 1322 A 0 1323 G 0 1324 U 0 1325 A 0 1326 A 1349 1327 U 1348 1328 C 1347 1329 G 1346 1330 C 1345 1331 C 1344 1332 G 1343 1333 G 1342 1334 U 0 1335 C 0 1336 A 0 1337 G 0 1338 C 0 1339 U 0 1340 A 0 1341 U 0 1342 A 1333 1343 C 1332 1344 G 1331 1345 G 1330 1346 C 1329 1347 G 1328 1348 G 1327 1349 U 1326 1350 G 0 1351 A 0 1352 A 0 1353 U 0 1354 U 0 1355 C 0 1356 G 0 1357 U 0 1358 U 0 1359 C 0 1360 C 0 1361 C 911 1362 G 910 1363 G 909 1364 G 908 1365 C 907 1366 C 906 1367 U 905 1368 U 903 1369 G 902 1370 U 901 1371 A 0 1372 C 900 1373 A 899 1374 C 0 1375 A 0 1376 C 0 1377 C 0 1378 G 1478 1379 C 1477 1380 C 0 1381 C 1474 1382 G 1473 1383 U 0 1384 C 1471 1385 A 0 1386 C 1468 1387 A 1467 1388 C 1466 1389 C 1465 1390 A 1464 1391 U 1463 1392 G 1462 1393 G 1461 1394 G 1460 1395 A 1459 1396 G 1458 1397 U 1457 1398 C 1456 1399 G 1455 1400 G 1454 1401 C 1453 1402 C 1452 1403 A 1451 1404 U 1450 1405 G 1449 1406 C 1448 1407 C 1447 1408 C 0 1409 A 0 1410 A 0 1411 G 1443 1412 U 1442 1413 C 1441 1414 G 1440 1415 U 1439 1416 U 1438 1417 A 0 1418 C 1437 1419 C 1436 1420 U 1435 1421 U 1434 1422 A 0 1423 A 0 1424 C 1432 1425 C 1431 1426 U 0 1427 A 0 1428 U 0 1429 U 0 1430 U 0 1431 G 1425 1432 G 1424 1433 A 0 1434 G 1421 1435 G 1420 1436 G 1419 1437 G 1418 1438 G 1416 1439 A 1415 1440 U 1414 1441 G 1413 1442 C 1412 1443 C 1411 1444 G 0 1445 A 0 1446 A 0 1447 N 1407 1448 N 1406 1449 N 1405 1450 N 1404 1451 N 1403 1452 N 1402 1453 N 1401 1454 U 1400 1455 C 1399 1456 G 1398 1457 G 1397 1458 U 1396 1459 G 1395 1460 A 1394 1461 C 1393 1462 U 1392 1463 G 1391 1464 G 1390 1465 G 1389 1466 G 1388 1467 U 1387 1468 G 1386 1469 A 0 1470 A 0 1471 G 1384 1472 U 0 1473 C 1382 1474 G 1381 1475 U 0 1476 A 0 1477 A 1379 1478 C 1378 1479 A 0 1480 A 0 1481 G 0 1482 G 0 1483 U 1506 1484 A 1505 1485 G 1504 1486 C 1503 1487 C 1502 1488 G 1501 1489 U 1500 1490 A 1499 1491 C 1498 1492 U 1497 1493 G 0 1494 G 0 1495 A 0 1496 A 0 1497 G 1492 1498 G 1491 1499 U 1490 1500 G 1489 1501 U 1488 1502 G 1487 1503 G 1486 1504 U 1485 1505 U 1484 1506 G 1483 1507 G 0 1508 A 0 1509 U 0 1510 C 0 1511 A 0 1512 C 0 1513 C 0 1514 U 0 1515 C 0 1516 C 0 1517 U 0 1518 U 0 1519 G 0