Filename: a.16.c.M.yamamotoi.bpseq Organism: Mitrastema yamamotoi Accession Number: U67742 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 U 0 2 C 0 3 U 0 4 C 0 5 A 0 6 U 0 7 G 0 8 G 0 9 A 0 10 G 26 11 A 25 12 G 24 13 U 23 14 U 22 15 C 0 16 G 0 17 A 0 18 U 860 19 C 859 20 C 858 21 U 0 22 G 14 23 G 13 24 C 12 25 U 11 26 C 10 27 A 0 28 G 493 29 G 492 30 A 491 31 U 490 32 G 489 33 A 488 34 C 487 35 U 0 36 G 0 37 G 486 38 C 485 39 G 0 40 G 366 41 C 365 42 U 364 43 G 363 44 U 362 45 A 361 46 U 359 47 G 358 48 C 0 49 U 0 50 U 0 51 A 0 52 A 0 53 C 323 54 A 322 55 C 321 56 A 0 57 U 320 58 G 319 59 C 318 60 A 0 61 A 0 62 G 85 63 U 84 64 C 83 65 U 0 66 U 0 67 A 82 68 C 81 69 U 80 70 A 79 71 U 0 72 A 0 73 A 0 74 A 0 75 A 0 76 C 0 77 U 0 78 U 0 79 U 70 80 A 69 81 G 68 82 U 67 83 G 64 84 G 63 85 C 62 86 G 0 87 A 0 88 A 0 89 C 0 90 G 0 91 G 0 92 G 278 93 U 277 94 G 276 95 A 0 96 G 0 97 U 0 98 G 0 99 A 0 100 C 0 101 G 203 102 C 202 103 G 201 104 U 200 105 A 199 106 A 198 107 G 197 108 A 196 109 A 0 110 U 195 111 C 194 112 U 0 113 G 0 114 C 0 115 C 191 116 C 190 117 C 189 118 U 188 119 U 187 120 U 186 121 A 185 122 G 152 123 A 151 124 A 150 125 G 0 126 U 0 127 A 0 128 A 145 129 C 144 130 G 143 131 A 142 132 U 141 133 G 140 134 G 139 135 G 0 136 A 0 137 A 0 138 A 0 139 C 134 140 U 133 141 A 132 142 U 131 143 U 130 144 G 129 145 C 128 146 U 0 147 A 0 148 A 0 149 U 0 150 A 124 151 U 123 152 C 122 153 C 0 154 C 0 155 A 0 156 U 0 157 A 0 158 G 0 159 G 168 160 C 167 161 U 166 162 G 0 163 A 0 164 A 0 165 G 0 166 A 161 167 G 160 168 U 159 169 U 0 170 A 0 171 A 0 172 A 0 173 A 183 174 G 182 175 A 181 176 A 180 177 G 0 178 A 0 179 A 0 180 U 176 181 U 175 182 C 174 183 U 173 184 C 0 185 U 121 186 A 120 187 C 119 188 A 118 189 G 117 190 G 116 191 G 115 192 A 0 193 A 0 194 G 111 195 A 110 196 G 108 197 C 107 198 U 106 199 U 105 200 A 104 201 C 103 202 G 102 203 U 101 204 C 250 205 U 249 206 G 248 207 A 0 208 U 0 209 U 247 210 A 0 211 G 241 212 C 240 213 U 239 214 A 0 215 G 0 216 U 238 217 U 237 218 G 236 219 G 235 220 U 234 221 A 233 222 C 232 223 G 231 224 A 0 225 U 0 226 A 0 227 A 0 228 U 0 229 A 0 230 G 0 231 C 223 232 U 222 233 U 221 234 A 220 235 C 219 236 C 218 237 A 217 238 A 216 239 G 213 240 G 212 241 C 211 242 U 0 243 G 0 244 U 0 245 G 0 246 A 0 247 U 209 248 C 206 249 A 205 250 G 204 251 G 0 252 A 0 253 G 275 254 C 274 255 U 273 256 A 272 257 G 268 258 U 267 259 U 266 260 C 265 261 G 0 262 A 0 263 G 0 264 A 0 265 G 260 266 G 259 267 A 258 268 U 257 269 G 0 270 A 0 271 U 0 272 C 256 273 A 255 274 G 254 275 C 253 276 C 94 277 A 93 278 C 92 279 A 0 280 C 301 281 U 300 282 G 299 283 G 298 284 A 297 285 A 296 286 C 0 287 U 0 288 G 0 289 A 0 290 G 0 291 A 0 292 C 0 293 A 0 294 A 0 295 G 0 296 G 285 297 U 284 298 C 283 299 C 282 300 A 281 301 G 280 302 A 0 303 C 314 304 U 313 305 C 312 306 C 311 307 U 0 308 A 0 309 U 0 310 G 0 311 G 306 312 G 305 313 A 304 314 G 303 315 G 0 316 C 0 317 A 0 318 G 59 319 C 58 320 A 57 321 G 55 322 U 54 323 G 53 324 G 0 325 G 0 326 G 0 327 A 0 328 A 0 329 U 0 330 U 0 331 U 356 332 U 0 333 C 355 334 C 354 335 G 353 336 C 0 337 A 0 338 A 0 339 U 351 340 G 350 341 G 349 342 G 0 343 C 348 344 G 0 345 A 0 346 A 0 347 A 0 348 G 343 349 C 341 350 U 340 351 G 339 352 A 0 353 C 335 354 G 334 355 G 333 356 G 331 357 G 0 358 C 47 359 A 46 360 A 0 361 U 45 362 A 44 363 C 43 364 C 42 365 G 41 366 C 40 367 G 0 368 U 0 369 G 399 370 A 398 371 A 397 372 G 396 373 G 0 374 U 0 375 A 0 376 G 0 377 A 0 378 A 0 379 G 390 380 G 389 381 C 388 382 C 387 383 U 0 384 A 0 385 C 0 386 G 0 387 G 382 388 G 381 389 U 380 390 C 379 391 G 0 392 U 0 393 A 0 394 A 0 395 A 0 396 C 372 397 U 371 398 U 370 399 C 369 400 U 0 401 U 433 402 U 0 403 U 0 404 A 430 405 C 429 406 C 428 407 A 427 408 A 426 409 A 425 410 A 0 411 A 0 412 A 0 413 G 420 414 A 0 415 A 0 416 C 0 417 U 0 418 A 0 419 A 0 420 C 413 421 A 0 422 G 0 423 U 0 424 A 0 425 U 409 426 U 408 427 U 407 428 G 406 429 G 405 430 G 404 431 G 0 432 A 0 433 A 401 434 U 0 435 A 0 436 A 0 437 G 482 438 C 481 439 A 480 440 U 479 441 C 478 442 G 0 443 G 0 444 C 0 445 U 0 446 A 0 447 A 0 448 C 477 449 U 476 450 U 475 451 U 474 452 G 473 453 U 0 454 G 0 455 C 0 456 C 0 457 A 0 458 G 0 459 C 0 460 A 0 461 G 0 462 C 0 463 C 0 464 G 0 465 C 0 466 G 0 467 G 0 468 U 0 469 A 0 470 A 0 471 U 0 472 A 0 473 C 452 474 A 451 475 G 450 476 A 449 477 G 448 478 G 441 479 A 440 480 U 439 481 G 438 482 C 437 483 A 0 484 A 0 485 G 38 486 C 37 487 G 34 488 U 33 489 U 32 490 A 31 491 U 30 492 C 29 493 C 28 494 G 0 495 G 0 496 A 0 497 A 0 498 U 0 499 G 0 500 A 0 501 U 0 502 U 0 503 G 0 504 G 825 505 G 824 506 C 823 507 G 0 508 U 0 509 A 0 510 A 0 511 A 0 512 G 0 513 A 0 514 G 702 515 U 701 516 C 700 517 U 699 518 G 0 519 U 0 520 A 0 521 G 695 522 G 694 523 U 693 524 G 692 525 G 588 526 C 587 527 U 586 528 U 585 529 U 584 530 U 583 531 U 582 532 A 0 533 A 581 534 G 580 535 U 577 536 C 576 537 U 575 538 G 574 539 C 573 540 U 572 541 G 571 542 U 570 543 C 569 544 A 0 545 A 0 546 A 0 547 U 0 548 A 0 549 C 565 550 C 564 551 U 563 552 A 562 553 G 561 554 G 560 555 C 559 556 U 0 557 C 0 558 A 0 559 A 555 560 C 554 561 C 553 562 C 552 563 G 551 564 G 550 565 G 549 566 G 0 567 A 0 568 A 0 569 G 543 570 G 542 571 C 541 572 A 540 573 A 539 574 C 538 575 A 537 576 G 536 577 U 535 578 G 0 579 A 0 580 C 534 581 U 533 582 A 531 583 A 530 584 A 529 585 A 528 586 A 527 587 G 526 588 C 525 589 U 0 590 U 0 591 G 0 592 A 689 593 G 688 594 U 687 595 A 686 596 U 685 597 G 682 598 A 681 599 U 680 600 A 679 601 A 0 602 G 678 603 G 677 604 G 676 605 A 675 606 A 674 607 G 673 608 A 672 609 G 671 610 G 654 611 G 653 612 A 652 613 A 651 614 U 650 615 U 649 616 U 648 617 C 647 618 U 646 619 G 645 620 A 644 621 A 643 622 G 0 623 G 0 624 A 0 625 G 636 626 C 635 627 G 634 628 A 0 629 U 0 630 G 0 631 A 0 632 A 0 633 A 0 634 U 627 635 G 626 636 C 625 637 A 0 638 U 0 639 A 0 640 G 0 641 A 0 642 U 0 643 A 621 644 U 620 645 C 619 646 A 618 647 G 617 648 A 616 649 A 615 650 A 614 651 G 613 652 A 612 653 A 611 654 C 610 655 G 0 656 C 0 657 C 0 658 G 0 659 A 670 660 A 0 661 G 0 662 G 669 663 U 668 664 G 0 665 A 0 666 A 0 667 A 0 668 A 663 669 C 662 670 G 659 671 C 609 672 U 608 673 C 607 674 U 606 675 U 605 676 C 604 677 U 603 678 G 602 679 U 600 680 A 599 681 U 598 682 U 597 683 U 0 684 G 0 685 A 596 686 U 595 687 A 594 688 C 593 689 U 592 690 G 0 691 A 0 692 C 524 693 A 523 694 U 522 695 U 521 696 G 0 697 A 0 698 G 0 699 A 517 700 G 516 701 A 515 702 C 514 703 G 0 704 A 0 705 A 0 706 A 0 707 G 748 708 C 747 709 U 746 710 A 745 711 G 744 712 G 743 713 G 742 714 G 0 715 A 0 716 G 0 717 C 741 718 G 0 719 A 0 720 A 0 721 U 737 722 G 736 723 G 735 724 G 734 725 A 0 726 U 0 727 U 0 728 A 0 729 G 0 730 A 0 731 G 0 732 A 0 733 C 0 734 C 724 735 C 723 736 C 722 737 A 721 738 G 0 739 U 0 740 A 0 741 G 717 742 U 713 743 C 712 744 C 711 745 U 710 746 A 709 747 G 708 748 C 707 749 U 0 750 G 0 751 U 0 752 A 0 753 A 0 754 A 0 755 C 0 756 G 0 757 A 0 758 U 0 759 G 821 760 G 820 761 A 819 762 U 818 763 G 0 764 G 0 765 A 0 766 U 0 767 A 817 768 C 816 769 U 0 770 A 0 771 A 799 772 G 798 773 U 797 774 A 796 775 U 795 776 U 794 777 G 793 778 U 792 779 A 791 780 U 790 781 G 789 782 U 0 783 U 0 784 U 0 785 G 0 786 A 0 787 U 0 788 C 0 789 C 781 790 A 780 791 U 779 792 U 778 793 C 777 794 A 776 795 G 775 796 U 774 797 A 773 798 C 772 799 U 771 800 A 0 801 C 0 802 A 0 803 A 810 804 C 809 805 U 0 806 A 0 807 A 0 808 C 0 809 G 804 810 U 803 811 G 0 812 U 0 813 U 0 814 A 0 815 A 0 816 G 768 817 U 767 818 A 762 819 U 761 820 C 760 821 C 759 822 C 0 823 G 506 824 C 505 825 C 504 826 U 0 827 G 854 828 G 853 829 G 852 830 G 0 831 A 0 832 G 0 833 U 0 834 A 0 835 C 0 836 G 847 837 U 846 838 U 845 839 C 844 840 G 0 841 C 0 842 A 0 843 A 0 844 G 839 845 A 838 846 A 837 847 U 836 848 G 0 849 A 0 850 A 0 851 A 0 852 C 829 853 U 828 854 C 827 855 A 0 856 A 0 857 A 0 858 G 20 859 G 19 860 A 18 861 A 0 862 U 0 863 U 1338 864 G 1337 865 A 1335 866 C 1334 867 G 1333 868 G 0 869 G 1332 870 G 1331 871 G 1330 872 C 1329 873 U 1328 874 C 1327 875 G 1326 876 C 0 877 A 0 878 C 0 879 A 0 880 A 1286 881 G 1285 882 C 1284 883 G 1283 884 G 1282 885 U 1281 886 G 0 887 G 1174 888 A 1173 889 G 1172 890 C 1171 891 A 1170 892 U 1169 893 G 1168 894 U 1167 895 G 1166 896 G 1164 897 U 1163 898 U 0 899 U 0 900 A 0 901 A 0 902 U 917 903 U 916 904 C 915 905 G 914 906 A 0 907 U 0 908 G 0 909 C 0 910 A 0 911 A 0 912 A 0 913 G 0 914 C 905 915 G 904 916 A 903 917 A 902 918 G 0 919 A 0 920 A 0 921 C 0 922 C 0 923 U 0 924 U 0 925 A 0 926 C 1159 927 C 1158 928 A 1157 929 G 1156 930 G 1155 931 G 1154 932 C 1153 933 U 0 934 U 0 935 G 0 936 A 0 937 C 0 938 G 0 939 A 990 940 U 989 941 G 988 942 A 0 943 U 986 944 C 985 945 C 0 946 G 984 947 C 983 948 G 982 949 A 0 950 A 0 951 U 968 952 C 967 953 U 966 954 U 965 955 U 964 956 U 963 957 U 962 958 G 0 959 A 0 960 A 0 961 A 0 962 A 957 963 U 956 964 U 955 965 A 954 966 A 953 967 G 952 968 A 951 969 G 0 970 U 981 971 G 980 972 C 979 973 C 978 974 U 0 975 U 0 976 A 0 977 G 0 978 G 973 979 G 972 980 A 971 981 A 970 982 U 948 983 G 947 984 C 946 985 G 944 986 A 943 987 A 0 988 C 941 989 A 940 990 C 939 991 A 0 992 G 1148 993 G 1147 994 U 0 995 G 1146 996 G 1145 997 U 1144 998 G 1143 999 C 0 1000 A 0 1001 U 1142 1002 G 1141 1003 G 1137 1004 C 1136 1005 U 1135 1006 G 1133 1007 U 1132 1008 C 1131 1009 G 1130 1010 U 0 1011 C 0 1012 A 0 1013 G 1052 1014 C 1051 1015 U 1050 1016 C 1049 1017 G 1048 1018 U 1047 1019 G 1028 1020 C 1027 1021 C 1026 1022 G 0 1023 U 0 1024 C 0 1025 A 0 1026 G 1021 1027 G 1020 1028 U 1019 1029 G 0 1030 U 0 1031 U 1044 1032 G 1043 1033 U 1042 1034 G 1041 1035 U 0 1036 U 0 1037 A 0 1038 A 0 1039 G 0 1040 U 0 1041 C 1034 1042 C 1033 1043 C 1032 1044 G 1031 1045 C 0 1046 A 0 1047 A 1018 1048 C 1017 1049 G 1016 1050 A 1015 1051 G 1014 1052 C 1013 1053 G 0 1054 C 0 1055 A 0 1056 A 0 1057 C 0 1058 C 1125 1059 C 1124 1060 U 1123 1061 U 1122 1062 A 1121 1063 U 1093 1064 A 1092 1065 U 1091 1066 U 1090 1067 U 1089 1068 A 1088 1069 G 1087 1070 U 0 1071 U 0 1072 A 1083 1073 C 1082 1074 C 1081 1075 U 0 1076 U 0 1077 G 0 1078 U 0 1079 U 0 1080 U 0 1081 G 1074 1082 G 1073 1083 A 1072 1084 A 0 1085 C 0 1086 U 0 1087 C 1069 1088 U 1068 1089 A 1067 1090 A 1066 1091 A 1065 1092 U 1064 1093 A 1063 1094 A 0 1095 A 0 1096 C 0 1097 A 0 1098 G 0 1099 C 1113 1100 U 1112 1101 G 1111 1102 G 1110 1103 A 1109 1104 A 0 1105 A 0 1106 U 0 1107 A 0 1108 A 0 1109 U 1103 1110 C 1102 1111 U 1101 1112 A 1100 1113 G 1099 1114 A 0 1115 G 0 1116 G 0 1117 A 0 1118 A 0 1119 G 0 1120 G 0 1121 A 1062 1122 G 1061 1123 A 1060 1124 G 1059 1125 G 1058 1126 A 0 1127 U 0 1128 U 0 1129 A 0 1130 C 1009 1131 G 1008 1132 U 1007 1133 C 1006 1134 A 0 1135 A 1005 1136 G 1004 1137 U 1003 1138 C 0 1139 A 0 1140 U 0 1141 C 1002 1142 A 1001 1143 U 998 1144 G 997 1145 C 996 1146 C 995 1147 C 993 1148 C 992 1149 U 0 1150 U 0 1151 A 0 1152 U 0 1153 G 932 1154 C 931 1155 C 930 1156 C 929 1157 U 928 1158 G 927 1159 G 926 1160 G 0 1161 C 0 1162 A 0 1163 A 897 1164 C 896 1165 A 0 1166 C 895 1167 A 894 1168 C 893 1169 G 892 1170 U 891 1171 G 890 1172 C 889 1173 U 888 1174 A 887 1175 C 0 1176 A 0 1177 A 0 1178 U 0 1179 G 1237 1180 G 1236 1181 U 1235 1182 C 1234 1183 G 1233 1184 G 1232 1185 G 1231 1186 A 0 1187 C 0 1188 A 0 1189 A 0 1190 A 0 1191 G 1226 1192 A 1225 1193 A 1224 1194 U 0 1195 A 0 1196 A 0 1197 U 0 1198 U 0 1199 U 0 1200 G 1219 1201 U 1218 1202 G 0 1203 A 0 1204 A 0 1205 C 1214 1206 U 1213 1207 U 1212 1208 G 0 1209 C 0 1210 A 0 1211 A 0 1212 G 1207 1213 A 1206 1214 G 1205 1215 U 0 1216 G 0 1217 A 0 1218 A 1201 1219 C 1200 1220 U 0 1221 A 0 1222 A 0 1223 U 0 1224 U 1193 1225 U 1192 1226 C 1191 1227 A 0 1228 A 0 1229 A 0 1230 A 0 1231 C 1185 1232 C 1184 1233 C 1183 1234 G 1182 1235 A 1181 1236 U 1180 1237 C 1179 1238 A 0 1239 C 0 1240 A 0 1241 G 0 1242 U 0 1243 U 0 1244 C 1275 1245 G 1274 1246 A 1273 1247 A 1272 1248 U 1271 1249 U 1270 1250 G 1269 1251 U 1268 1252 A 1267 1253 G 1266 1254 G 1265 1255 C 1264 1256 U 0 1257 G 0 1258 A 0 1259 A 0 1260 A 0 1261 C 0 1262 U 0 1263 C 0 1264 G 1255 1265 C 1254 1266 C 1253 1267 U 1252 1268 A 1251 1269 C 1250 1270 A 1249 1271 U 1248 1272 G 1247 1273 A 1246 1274 A 1245 1275 G 1244 1276 C 0 1277 C 0 1278 G 0 1279 A 0 1280 A 0 1281 A 885 1282 U 884 1283 C 883 1284 G 882 1285 C 881 1286 U 880 1287 A 0 1288 G 0 1289 U 0 1290 A 0 1291 A 1314 1292 U 1313 1293 C 1312 1294 G 1311 1295 C 1310 1296 C 1309 1297 G 1308 1298 G 1307 1299 U 0 1300 C 0 1301 A 0 1302 G 0 1303 C 0 1304 U 0 1305 A 0 1306 U 0 1307 A 1298 1308 C 1297 1309 G 1296 1310 G 1295 1311 C 1294 1312 G 1293 1313 G 1292 1314 U 1291 1315 G 0 1316 A 0 1317 A 0 1318 U 0 1319 A 0 1320 U 0 1321 G 0 1322 U 0 1323 U 0 1324 A 0 1325 C 0 1326 C 875 1327 G 874 1328 G 873 1329 G 872 1330 C 871 1331 C 870 1332 U 869 1333 U 867 1334 G 866 1335 U 865 1336 A 0 1337 C 864 1338 A 863 1339 C 0 1340 A 0 1341 C 0 1342 C 0 1343 G 1424 1344 C 1423 1345 C 0 1346 C 1420 1347 G 1419 1348 U 0 1349 C 1417 1350 A 0 1351 C 1414 1352 A 1413 1353 C 1412 1354 U 1411 1355 C 1410 1356 U 1409 1357 G 1408 1358 G 1407 1359 A 1406 1360 A 1405 1361 G 1404 1362 U 1403 1363 U 1402 1364 G 1401 1365 U 1400 1366 C 1399 1367 C 1398 1368 C 1397 1369 U 1396 1370 G 1395 1371 U 1394 1372 U 1393 1373 C 0 1374 U 0 1375 A 0 1376 A 0 1377 A 0 1378 U 1388 1379 C 1387 1380 A 1386 1381 A 0 1382 A 0 1383 A 0 1384 A 0 1385 A 0 1386 U 1380 1387 G 1379 1388 A 1378 1389 C 0 1390 U 0 1391 A 0 1392 A 0 1393 A 1372 1394 A 1371 1395 U 1370 1396 A 1369 1397 G 1368 1398 A 1367 1399 G 1366 1400 U 1365 1401 U 1364 1402 A 1363 1403 A 1362 1404 U 1361 1405 G 1360 1406 A 1359 1407 C 1358 1408 U 1357 1409 A 1356 1410 G 1355 1411 A 1354 1412 G 1353 1413 U 1352 1414 G 1351 1415 A 0 1416 A 0 1417 G 1349 1418 U 0 1419 C 1347 1420 G 1346 1421 U 0 1422 A 0 1423 A 1344 1424 C 1343 1425 A 0 1426 A 0 1427 G 0 1428 G 0 1429 U 1452 1430 A 1451 1431 G 1450 1432 C 1449 1433 C 1448 1434 G 1447 1435 U 1446 1436 A 1445 1437 C 1444 1438 U 1443 1439 G 0 1440 G 0 1441 A 0 1442 A 0 1443 G 1438 1444 G 1437 1445 U 1436 1446 G 1435 1447 C 1434 1448 G 1433 1449 G 1432 1450 C 1431 1451 U 1430 1452 G 1429 1453 G 0 1454 A 0 1455 U 0 1456 C 0 1457 A 0 1458 C 0 1459 C 0 1460 U 0 1461 C 0 1462 C 0 1463 U 0 1464 U 0 1465 U 0