Filename: b.16.m.P.infestans.bpseq Organism: Phytophthora infestans Accession Number: UNP00263 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 A 0 2 U 0 3 U 0 4 A 0 5 A 0 6 A 0 7 U 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 845 18 C 844 19 C 843 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 489 28 A 488 29 A 487 30 U 486 31 A 0 32 A 485 33 A 484 34 U 483 35 G 482 36 C 481 37 U 480 38 A 0 39 U 359 40 C 358 41 G 357 42 G 356 43 U 355 44 A 354 45 U 352 46 G 351 47 C 0 48 U 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 315 53 A 314 54 C 313 55 A 0 56 U 312 57 G 311 58 C 310 59 A 0 60 A 0 61 G 83 62 U 82 63 U 81 64 G 0 65 A 0 66 A 80 67 U 79 68 G 78 69 U 77 70 U 76 71 U 75 72 U 0 73 U 0 74 A 0 75 A 71 76 A 70 77 A 69 78 C 68 79 A 67 80 U 66 81 A 63 82 G 62 83 C 61 84 G 0 85 A 0 86 A 0 87 C 0 88 G 0 89 G 0 90 G 271 91 U 270 92 G 269 93 A 0 94 G 0 95 U 0 96 A 0 97 A 0 98 C 0 99 A 195 100 C 194 101 G 193 102 U 192 103 G 191 104 A 190 105 A 189 106 U 188 107 U 0 108 A 0 109 U 187 110 C 186 111 U 0 112 A 0 113 C 0 114 C 183 115 U 182 116 U 181 117 U 180 118 U 179 119 A 178 120 A 177 121 U 0 122 U 150 123 C 149 124 G 148 125 G 147 126 A 146 127 A 0 128 U 0 129 A 0 130 A 0 131 U 142 132 U 141 133 A 140 134 G 139 135 U 0 136 U 0 137 U 0 138 U 0 139 C 134 140 U 133 141 A 132 142 A 131 143 A 0 144 A 0 145 A 0 146 U 126 147 U 125 148 C 124 149 G 123 150 G 122 151 A 0 152 A 0 153 U 163 154 A 162 155 A 161 156 A 0 157 U 0 158 A 0 159 A 0 160 A 0 161 U 155 162 U 154 163 A 153 164 A 0 165 A 0 166 G 175 167 U 174 168 U 173 169 U 0 170 U 0 171 U 0 172 U 0 173 A 168 174 A 167 175 C 166 176 G 0 177 U 120 178 U 119 179 A 118 180 A 117 181 A 116 182 A 115 183 G 114 184 A 0 185 U 0 186 G 110 187 A 109 188 G 106 189 U 105 190 U 104 191 U 103 192 G 102 193 C 101 194 G 100 195 C 99 196 A 243 197 A 242 198 G 241 199 A 0 200 U 0 201 U 240 202 A 0 203 U 0 204 G 234 205 G 233 206 U 232 207 A 0 208 G 0 209 U 231 210 U 230 211 G 229 212 G 228 213 U 227 214 A 226 215 G 225 216 U 224 217 U 0 218 U 0 219 A 0 220 A 0 221 A 0 222 A 0 223 G 0 224 A 216 225 C 215 226 U 214 227 A 213 228 C 212 229 A 211 230 A 210 231 A 209 232 G 206 233 C 205 234 C 204 235 U 0 236 A 0 237 U 0 238 U 0 239 A 0 240 U 201 241 C 198 242 U 197 243 U 196 244 U 0 245 A 0 246 G 268 247 C 267 248 U 266 249 G 265 250 G 261 251 U 260 252 U 259 253 U 258 254 G 0 255 A 0 256 A 0 257 A 0 258 G 253 259 A 252 260 A 251 261 U 250 262 G 0 263 A 0 264 U 0 265 C 249 266 A 248 267 G 247 268 C 246 269 C 92 270 A 91 271 C 90 272 A 0 273 U 294 274 U 293 275 G 292 276 G 291 277 G 290 278 A 289 279 C 0 280 U 0 281 G 0 282 A 0 283 G 0 284 A 0 285 C 0 286 A 0 287 C 0 288 G 0 289 G 278 290 C 277 291 C 276 292 C 275 293 A 274 294 A 273 295 A 0 296 C 306 297 U 305 298 U 304 299 U 303 300 U 0 301 U 0 302 U 0 303 A 299 304 A 298 305 A 297 306 G 296 307 G 0 308 C 0 309 A 0 310 G 58 311 C 57 312 A 56 313 G 54 314 U 53 315 G 52 316 G 0 317 G 0 318 G 0 319 A 0 320 A 0 321 U 0 322 U 0 323 U 349 324 U 0 325 G 348 326 G 347 327 A 346 328 C 0 329 A 0 330 A 0 331 U 344 332 G 343 333 A 342 334 G 341 335 C 340 336 G 0 337 A 0 338 A 0 339 A 0 340 G 335 341 C 334 342 U 333 343 U 332 344 G 331 345 A 0 346 U 327 347 C 326 348 C 325 349 A 323 350 G 0 351 C 46 352 A 45 353 A 0 354 U 44 355 A 43 356 C 42 357 C 41 358 G 40 359 A 39 360 G 0 361 U 0 362 G 393 363 A 392 364 G 391 365 U 390 366 G 0 367 A 0 368 U 0 369 G 0 370 A 0 371 A 0 372 G 384 373 G 383 374 C 382 375 U 381 376 A 0 377 A 0 378 U 0 379 U 0 380 A 0 381 G 375 382 G 374 383 U 373 384 U 372 385 G 0 386 U 0 387 A 0 388 A 0 389 A 0 390 G 365 391 C 364 392 U 363 393 C 362 394 U 0 395 U 428 396 U 0 397 C 0 398 A 425 399 U 424 400 U 423 401 A 422 402 A 421 403 G 420 404 G 0 405 A 0 406 G 0 407 G 415 408 A 0 409 A 0 410 A 0 411 A 0 412 U 0 413 G 0 414 A 0 415 C 407 416 A 0 417 G 0 418 U 0 419 A 0 420 C 403 421 U 402 422 U 401 423 A 400 424 A 399 425 A 398 426 A 0 427 A 0 428 A 395 429 G 0 430 A 0 431 A 0 432 G 478 433 U 477 434 U 476 435 C 475 436 C 474 437 G 0 438 G 0 439 C 0 440 U 0 441 A 0 442 A 0 443 U 473 444 A 0 445 C 472 446 C 471 447 C 470 448 G 469 449 U 0 450 G 0 451 C 0 452 C 0 453 A 0 454 G 0 455 C 0 456 A 0 457 G 0 458 C 0 459 C 0 460 G 0 461 C 0 462 G 0 463 G 0 464 U 0 465 A 0 466 A 0 467 U 0 468 A 0 469 C 448 470 G 447 471 G 446 472 G 445 473 A 443 474 G 436 475 G 435 476 A 434 477 G 433 478 C 432 479 G 0 480 A 37 481 G 36 482 C 35 483 A 34 484 U 33 485 U 32 486 A 30 487 U 29 488 U 28 489 C 27 490 G 0 491 G 0 492 A 0 493 A 0 494 U 0 495 G 0 496 A 0 497 U 0 498 U 0 499 A 0 500 G 810 501 G 809 502 C 808 503 G 0 504 U 0 505 A 0 506 A 0 507 A 0 508 G 0 509 G 0 510 G 698 511 U 697 512 U 696 513 U 695 514 G 0 515 U 0 516 A 0 517 G 691 518 G 690 519 U 689 520 G 0 521 G 584 522 U 583 523 U 582 524 U 581 525 U 580 526 U 579 527 U 578 528 A 0 529 A 577 530 G 576 531 U 573 532 U 572 533 G 571 534 A 570 535 A 569 536 A 568 537 G 567 538 A 566 539 A 565 540 A 0 541 C 0 542 A 0 543 A 0 544 A 0 545 U 561 546 U 560 547 A 559 548 A 558 549 A 557 550 G 556 551 C 0 552 U 0 553 C 0 554 A 0 555 A 0 556 C 550 557 U 549 558 U 548 559 U 547 560 A 546 561 U 545 562 A 0 563 C 0 564 A 0 565 U 539 566 U 538 567 U 537 568 U 536 569 U 535 570 U 534 571 C 533 572 A 532 573 A 531 574 A 0 575 A 0 576 C 530 577 U 529 578 G 527 579 A 526 580 U 525 581 A 524 582 A 523 583 A 522 584 C 521 585 U 0 586 G 0 587 G 0 588 A 685 589 G 684 590 U 683 591 A 682 592 U 681 593 A 680 594 A 678 595 A 0 596 U 677 597 A 676 598 G 0 599 A 675 600 G 674 601 G 673 602 A 672 603 U 671 604 A 670 605 A 669 606 U 668 607 G 651 608 G 0 609 A 0 610 A 0 611 U 647 612 U 646 613 U 645 614 C 644 615 U 643 616 A 642 617 U 641 618 U 640 619 G 0 620 G 0 621 A 0 622 G 633 623 U 632 624 G 631 625 A 0 626 U 0 627 A 0 628 A 0 629 A 0 630 A 0 631 U 624 632 A 623 633 C 622 634 G 0 635 U 0 636 U 0 637 G 0 638 A 0 639 U 0 640 A 618 641 A 617 642 U 616 643 A 615 644 G 614 645 A 613 646 A 612 647 G 611 648 G 0 649 A 0 650 A 0 651 G 607 652 A 0 653 C 0 654 C 0 655 A 0 656 A 667 657 U 0 658 G 0 659 G 666 660 C 665 661 G 0 662 A 0 663 A 0 664 G 0 665 G 660 666 C 659 667 A 656 668 A 606 669 U 605 670 U 604 671 A 603 672 U 602 673 C 601 674 U 600 675 G 599 676 G 597 677 G 596 678 U 594 679 A 0 680 U 593 681 A 592 682 U 591 683 A 590 684 C 589 685 U 588 686 G 0 687 A 0 688 C 0 689 A 519 690 C 518 691 U 517 692 G 0 693 A 0 694 G 0 695 A 513 696 A 512 697 A 511 698 C 510 699 G 0 700 A 0 701 A 0 702 A 0 703 G 744 704 C 743 705 U 742 706 U 741 707 G 740 708 G 739 709 G 738 710 U 0 711 A 0 712 G 0 713 C 737 714 G 0 715 A 0 716 A 0 717 C 733 718 G 732 719 G 731 720 G 730 721 A 0 722 U 0 723 U 0 724 A 0 725 G 0 726 A 0 727 U 0 728 A 0 729 C 0 730 C 720 731 C 719 732 C 718 733 G 717 734 G 0 735 U 0 736 A 0 737 G 713 738 U 709 739 C 708 740 C 707 741 A 706 742 U 705 743 G 704 744 C 703 745 U 0 746 G 0 747 U 0 748 A 0 749 A 0 750 A 0 751 C 0 752 G 0 753 A 0 754 U 0 755 G 806 756 A 805 757 G 804 758 U 803 759 G 802 760 C 801 761 U 800 762 A 0 763 A 783 764 U 782 765 A 781 766 U 780 767 U 779 768 U 778 769 A 777 770 G 776 771 A 775 772 A 0 773 U 0 774 U 0 775 U 771 776 U 770 777 U 769 778 A 768 779 G 767 780 A 766 781 U 765 782 A 764 783 U 763 784 A 0 785 A 0 786 U 0 787 A 0 788 G 795 789 C 794 790 U 0 791 A 0 792 A 0 793 C 0 794 G 789 795 C 788 796 G 0 797 U 0 798 U 0 799 A 0 800 A 761 801 G 760 802 C 759 803 A 758 804 C 757 805 U 756 806 C 755 807 C 0 808 G 502 809 C 501 810 C 500 811 U 0 812 G 839 813 A 838 814 A 837 815 A 0 816 A 0 817 G 0 818 U 0 819 A 0 820 U 0 821 A 832 822 A 831 823 U 830 824 C 829 825 G 0 826 C 0 827 A 0 828 A 0 829 G 824 830 A 823 831 U 822 832 U 821 833 G 0 834 A 0 835 A 0 836 A 0 837 U 814 838 U 813 839 C 812 840 A 0 841 A 0 842 A 0 843 G 19 844 G 18 845 A 17 846 A 0 847 U 0 848 U 1312 849 G 1311 850 A 1309 851 C 1308 852 G 1307 853 G 0 854 G 1306 855 A 1305 856 G 1304 857 U 1303 858 C 1302 859 U 1301 860 A 1300 861 C 0 862 A 0 863 C 0 864 A 0 865 A 1261 866 G 1260 867 C 1259 868 G 1258 869 G 1257 870 U 1256 871 G 0 872 G 1150 873 A 1149 874 G 1148 875 C 1147 876 A 1146 877 U 1145 878 G 1144 879 U 1143 880 G 1142 881 G 1140 882 U 1139 883 U 0 884 U 0 885 A 0 886 A 0 887 U 902 888 C 901 889 C 900 890 G 899 891 A 0 892 U 0 893 A 0 894 A 0 895 U 0 896 A 0 897 C 0 898 G 0 899 C 890 900 G 889 901 C 888 902 A 887 903 G 0 904 A 0 905 A 0 906 C 0 907 C 0 908 U 0 909 U 0 910 A 0 911 C 1135 912 C 1134 913 A 1133 914 A 1132 915 C 1131 916 U 1130 917 C 1129 918 U 0 919 U 0 920 G 0 921 C 0 922 U 0 923 A 952 924 A 951 925 U 950 926 U 949 927 U 948 928 U 947 929 U 946 930 A 945 931 U 944 932 A 943 933 U 942 934 A 941 935 A 940 936 A 0 937 A 0 938 U 0 939 A 0 940 U 935 941 U 934 942 A 933 943 U 932 944 A 931 945 U 930 946 A 929 947 A 928 948 A 927 949 A 926 950 A 925 951 A 924 952 C 923 953 A 0 954 G 1124 955 G 1123 956 C 0 957 G 1122 958 U 1121 959 U 1120 960 G 1119 961 C 0 962 A 0 963 U 1118 964 G 1117 965 G 1113 966 C 1112 967 U 1111 968 G 1109 969 U 1108 970 C 1107 971 G 1106 972 U 0 973 C 0 974 A 0 975 G 1014 976 C 1013 977 U 1012 978 C 1011 979 G 1010 980 U 1009 981 G 990 982 U 989 983 U 988 984 G 0 985 U 0 986 G 0 987 A 0 988 A 983 989 A 982 990 U 981 991 G 0 992 U 0 993 U 1006 994 U 1005 995 G 1004 996 G 1003 997 U 0 998 U 0 999 A 0 1000 A 0 1001 A 0 1002 U 0 1003 C 996 1004 C 995 1005 U 994 1006 U 993 1007 U 0 1008 A 0 1009 A 980 1010 C 979 1011 G 978 1012 A 977 1013 G 976 1014 C 975 1015 G 0 1016 C 0 1017 A 0 1018 A 0 1019 C 0 1020 C 1101 1021 C 1100 1022 C 1099 1023 U 1098 1024 A 1097 1025 U 1069 1026 U 1068 1027 G 1067 1028 U 1066 1029 U 1065 1030 A 1064 1031 G 1063 1032 U 0 1033 U 1060 1034 G 1059 1035 C 1058 1036 U 1057 1037 A 0 1038 U 0 1039 U 1056 1040 U 1055 1041 U 1054 1042 A 1053 1043 U 1052 1044 U 1051 1045 A 0 1046 A 0 1047 A 0 1048 A 0 1049 A 0 1050 A 0 1051 A 1044 1052 A 1043 1053 U 1042 1054 A 1041 1055 A 1040 1056 A 1039 1057 A 1036 1058 G 1035 1059 C 1034 1060 A 1033 1061 C 0 1062 U 0 1063 C 1031 1064 U 1030 1065 A 1029 1066 A 1028 1067 C 1027 1068 A 1026 1069 A 1025 1070 A 0 1071 A 0 1072 A 0 1073 A 0 1074 A 0 1075 U 1089 1076 U 1088 1077 A 1087 1078 A 1086 1079 U 1085 1080 G 0 1081 A 0 1082 U 0 1083 A 0 1084 G 0 1085 G 1079 1086 U 1078 1087 U 1077 1088 A 1076 1089 A 1075 1090 U 0 1091 G 0 1092 G 0 1093 A 0 1094 A 0 1095 G 0 1096 G 0 1097 U 1024 1098 G 1023 1099 G 1022 1100 G 1021 1101 G 1020 1102 A 0 1103 U 0 1104 G 0 1105 A 0 1106 C 971 1107 G 970 1108 U 969 1109 C 968 1110 A 0 1111 A 967 1112 G 966 1113 U 965 1114 C 0 1115 U 0 1116 U 0 1117 C 964 1118 A 963 1119 U 960 1120 G 959 1121 G 958 1122 C 957 1123 C 955 1124 C 954 1125 U 0 1126 U 0 1127 A 0 1128 U 0 1129 G 917 1130 A 916 1131 G 915 1132 U 914 1133 U 913 1134 G 912 1135 G 911 1136 G 0 1137 C 0 1138 U 0 1139 A 882 1140 C 881 1141 A 0 1142 C 880 1143 A 879 1144 C 878 1145 G 877 1146 U 876 1147 G 875 1148 C 874 1149 U 873 1150 A 872 1151 C 0 1152 A 0 1153 A 0 1154 U 0 1155 G 1212 1156 A 1211 1157 U 1210 1158 A 1209 1159 A 1208 1160 U 1207 1161 U 1206 1162 A 0 1163 C 0 1164 A 0 1165 A 0 1166 U 0 1167 G 1201 1168 A 1200 1169 G 1199 1170 A 0 1171 A 0 1172 G 1194 1173 C 1193 1174 A 0 1175 A 0 1176 U 0 1177 A 1189 1178 A 1188 1179 U 1187 1180 G 0 1181 A 0 1182 U 0 1183 C 0 1184 A 0 1185 A 0 1186 A 0 1187 G 1179 1188 U 1178 1189 U 1177 1190 G 0 1191 G 0 1192 A 0 1193 G 1173 1194 C 1172 1195 A 0 1196 A 0 1197 A 0 1198 U 0 1199 C 1169 1200 U 1168 1201 U 1167 1202 U 0 1203 A 0 1204 A 0 1205 A 0 1206 A 1161 1207 A 1160 1208 U 1159 1209 U 1158 1210 A 1157 1211 U 1156 1212 C 1155 1213 C 0 1214 U 0 1215 A 0 1216 G 0 1217 U 0 1218 U 0 1219 C 1250 1220 G 0 1221 G 0 1222 A 0 1223 U 1246 1224 U 1245 1225 A 1244 1226 A 1243 1227 G 1242 1228 G 1241 1229 G 1240 1230 C 1239 1231 U 0 1232 G 0 1233 A 0 1234 A 0 1235 A 0 1236 C 0 1237 U 0 1238 C 0 1239 G 1230 1240 C 1229 1241 C 1228 1242 C 1227 1243 U 1226 1244 U 1225 1245 A 1224 1246 U 1223 1247 G 0 1248 A 0 1249 A 0 1250 G 1219 1251 U 0 1252 U 0 1253 G 0 1254 G 0 1255 A 0 1256 A 870 1257 U 869 1258 C 868 1259 G 867 1260 C 866 1261 U 865 1262 A 0 1263 G 0 1264 U 0 1265 A 0 1266 A 1288 1267 U 1287 1268 C 1286 1269 G 1285 1270 C 1284 1271 A 1283 1272 G 1282 1273 A 1281 1274 A 0 1275 C 0 1276 A 0 1277 G 0 1278 C 0 1279 A 0 1280 U 0 1281 G 1273 1282 C 1272 1283 U 1271 1284 G 1270 1285 C 1269 1286 G 1268 1287 G 1267 1288 U 1266 1289 G 0 1290 A 0 1291 A 0 1292 U 0 1293 A 0 1294 U 0 1295 G 0 1296 U 0 1297 U 0 1298 A 0 1299 C 0 1300 U 860 1301 G 859 1302 G 858 1303 A 857 1304 C 856 1305 U 855 1306 U 854 1307 U 852 1308 G 851 1309 U 850 1310 A 0 1311 C 849 1312 A 848 1313 C 0 1314 A 0 1315 C 0 1316 C 0 1317 G 1466 1318 C 1465 1319 C 0 1320 C 1462 1321 G 1461 1322 U 0 1323 C 1459 1324 A 0 1325 C 1456 1326 A 1455 1327 U 1454 1328 C 1453 1329 A 1452 1330 G 1451 1331 G 1450 1332 G 1449 1333 A 1448 1334 A 1447 1335 G 1446 1336 U 1445 1337 U 1444 1338 G 1443 1339 A 1442 1340 U 1441 1341 U 1440 1342 A 1439 1343 U 1438 1344 U 1437 1345 U 1436 1346 U 1435 1347 U 1434 1348 A 0 1349 A 0 1350 A 0 1351 A 0 1352 U 0 1353 A 1429 1354 A 1428 1355 U 1427 1356 U 1426 1357 U 1425 1358 U 1424 1359 U 0 1360 A 0 1361 A 0 1362 U 1420 1363 U 1419 1364 A 1418 1365 U 1417 1366 U 1416 1367 U 1415 1368 A 1414 1369 A 1413 1370 U 1412 1371 A 1411 1372 U 1410 1373 U 0 1374 A 1407 1375 U 1406 1376 U 1405 1377 A 1404 1378 U 1403 1379 G 1402 1380 U 0 1381 A 1401 1382 A 1400 1383 U 1399 1384 U 1398 1385 U 0 1386 U 1396 1387 U 1395 1388 U 0 1389 A 0 1390 A 0 1391 U 0 1392 U 0 1393 A 0 1394 U 0 1395 A 1387 1396 A 1386 1397 U 0 1398 A 1384 1399 A 1383 1400 U 1382 1401 U 1381 1402 U 1379 1403 A 1378 1404 U 1377 1405 A 1376 1406 A 1375 1407 U 1374 1408 U 0 1409 U 0 1410 A 1372 1411 U 1371 1412 A 1370 1413 U 1369 1414 U 1368 1415 A 1367 1416 A 1366 1417 A 1365 1418 U 1364 1419 A 1363 1420 A 1362 1421 A 0 1422 U 0 1423 U 0 1424 A 1358 1425 A 1357 1426 A 1356 1427 A 1355 1428 U 1354 1429 U 1353 1430 C 0 1431 C 0 1432 U 0 1433 A 0 1434 A 1347 1435 A 1346 1436 A 1345 1437 A 1344 1438 G 1343 1439 U 1342 1440 A 1341 1441 A 1340 1442 U 1339 1443 U 1338 1444 A 1337 1445 G 1336 1446 U 1335 1447 A 1334 1448 A 1333 1449 C 1332 1450 U 1331 1451 U 1330 1452 U 1329 1453 G 1328 1454 A 1327 1455 U 1326 1456 G 1325 1457 A 0 1458 A 0 1459 G 1323 1460 U 0 1461 C 1321 1462 G 1320 1463 U 0 1464 A 0 1465 A 1318 1466 C 1317 1467 A 0 1468 A 0 1469 G 0 1470 G 0 1471 U 1494 1472 A 1493 1473 G 1492 1474 U 1491 1475 C 1490 1476 G 1489 1477 U 1488 1478 A 1487 1479 G 1486 1480 G 1485 1481 G 0 1482 G 0 1483 A 0 1484 A 0 1485 C 1480 1486 C 1479 1487 U 1478 1488 G 1477 1489 U 1476 1490 G 1475 1491 U 1474 1492 C 1473 1493 U 1472 1494 G 1471 1495 G 0 1496 A 0 1497 A 0 1498 G 0 1499 A 0 1500 G 0 1501 A 0 1502 U 0 1503 C 0