Filename: b.16.m.R.salina.bpseq Organism: Rhodomonas salina Accession Number: UNP00180 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 U 0 2 U 0 3 A 0 4 U 0 5 C 0 6 U 0 7 U 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 826 18 U 825 19 C 824 20 U 0 21 A 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 A 475 28 A 474 29 A 473 30 U 472 31 A 0 32 A 471 33 A 470 34 C 469 35 G 468 36 C 467 37 U 466 38 A 0 39 U 348 40 U 347 41 U 346 42 A 345 43 C 344 44 C 343 45 U 341 46 G 340 47 C 0 48 U 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 304 53 A 303 54 C 302 55 A 0 56 U 301 57 G 300 58 C 299 59 A 0 60 A 0 61 G 90 62 U 89 63 U 88 64 A 0 65 U 87 66 A 86 67 U 85 68 U 84 69 U 83 70 U 82 71 U 81 72 U 80 73 U 79 74 U 0 75 A 0 76 U 0 77 U 0 78 U 0 79 A 73 80 A 72 81 A 71 82 A 70 83 A 69 84 A 68 85 A 67 86 U 66 87 A 65 88 A 63 89 G 62 90 C 61 91 G 0 92 A 0 93 A 0 94 C 0 95 G 0 96 G 0 97 G 260 98 U 259 99 G 258 100 A 0 101 G 0 102 U 0 103 A 0 104 A 0 105 U 0 106 A 195 107 A 194 108 A 193 109 A 192 110 A 191 111 A 190 112 G 189 113 A 188 114 A 0 115 U 0 116 G 187 117 A 186 118 U 0 119 G 0 120 C 0 121 C 183 122 U 182 123 U 181 124 A 180 125 U 179 126 A 178 127 G 177 128 U 0 129 U 161 130 U 160 131 A 159 132 A 158 133 C 157 134 U 0 135 A 0 136 A 0 137 G 153 138 U 152 139 A 0 140 A 151 141 U 150 142 U 149 143 U 148 144 G 0 145 C 0 146 U 0 147 U 0 148 A 143 149 A 142 150 A 141 151 U 140 152 A 138 153 U 137 154 A 0 155 A 0 156 U 0 157 G 133 158 U 132 159 U 131 160 A 130 161 U 129 162 A 0 163 U 0 164 A 0 165 A 0 166 A 175 167 A 174 168 G 0 169 A 0 170 U 0 171 U 0 172 U 0 173 A 0 174 U 167 175 U 166 176 G 0 177 C 127 178 U 126 179 A 125 180 U 124 181 A 123 182 A 122 183 G 121 184 A 0 185 U 0 186 U 117 187 C 116 188 A 113 189 C 112 190 U 111 191 U 110 192 U 109 193 U 108 194 U 107 195 U 106 196 A 232 197 A 231 198 G 230 199 A 0 200 U 0 201 U 229 202 A 0 203 G 223 204 G 222 205 U 221 206 U 0 207 U 0 208 U 220 209 U 219 210 G 218 211 A 217 212 U 216 213 A 0 214 A 0 215 A 0 216 A 212 217 U 211 218 C 210 219 A 209 220 A 208 221 G 205 222 C 204 223 C 203 224 G 0 225 A 0 226 U 0 227 G 0 228 A 0 229 U 201 230 C 198 231 U 197 232 U 196 233 U 0 234 A 0 235 A 257 236 U 256 237 U 255 238 G 254 239 G 250 240 U 249 241 C 248 242 U 247 243 G 0 244 U 0 245 A 0 246 A 0 247 G 242 248 G 241 249 A 240 250 U 239 251 G 0 252 U 0 253 U 0 254 C 238 255 A 237 256 A 236 257 U 235 258 C 99 259 A 98 260 C 97 261 A 0 262 C 283 263 U 282 264 G 281 265 G 280 266 A 279 267 A 278 268 C 0 269 U 0 270 G 0 271 A 0 272 G 0 273 A 0 274 C 0 275 A 0 276 A 0 277 G 0 278 G 267 279 U 266 280 C 265 281 C 264 282 A 263 283 G 262 284 A 0 285 C 295 286 U 294 287 U 293 288 U 292 289 U 0 290 A 0 291 A 0 292 G 288 293 A 287 294 A 286 295 G 285 296 G 0 297 C 0 298 U 0 299 G 58 300 C 57 301 A 56 302 G 54 303 U 53 304 G 52 305 A 0 306 G 0 307 G 0 308 A 0 309 A 0 310 U 0 311 U 0 312 U 338 313 U 0 314 A 337 315 A 336 316 A 335 317 C 0 318 A 0 319 A 0 320 U 333 321 G 332 322 A 331 323 G 330 324 C 329 325 G 0 326 A 0 327 A 0 328 A 0 329 G 324 330 C 323 331 U 322 332 U 321 333 G 320 334 A 0 335 U 316 336 U 315 337 U 314 338 A 312 339 G 0 340 C 46 341 A 45 342 A 0 343 G 44 344 G 43 345 U 42 346 A 41 347 A 40 348 A 39 349 G 0 350 U 0 351 G 381 352 A 380 353 A 379 354 U 378 355 G 0 356 A 0 357 U 0 358 U 0 359 G 0 360 A 0 361 A 0 362 A 372 363 A 371 364 C 370 365 A 0 366 A 0 367 A 0 368 A 0 369 A 0 370 G 364 371 U 363 372 U 362 373 G 0 374 U 0 375 A 0 376 A 0 377 A 0 378 G 354 379 U 353 380 U 352 381 C 351 382 U 0 383 U 415 384 U 0 385 U 0 386 G 412 387 U 411 388 A 410 389 A 409 390 A 408 391 U 407 392 A 0 393 U 0 394 A 0 395 A 403 396 A 0 397 U 0 398 U 0 399 A 0 400 U 0 401 G 0 402 A 0 403 U 395 404 U 0 405 U 0 406 U 0 407 A 391 408 U 390 409 U 389 410 U 388 411 A 387 412 A 386 413 G 0 414 A 0 415 A 383 416 A 0 417 A 0 418 A 0 419 G 464 420 U 463 421 C 462 422 C 461 423 C 460 424 G 0 425 G 0 426 C 0 427 C 0 428 A 0 429 A 0 430 C 459 431 U 458 432 U 457 433 U 456 434 G 455 435 U 0 436 G 0 437 C 0 438 C 0 439 A 0 440 G 0 441 C 0 442 A 0 443 G 0 444 C 0 445 C 0 446 G 0 447 C 0 448 G 0 449 G 0 450 U 0 451 U 0 452 A 0 453 A 0 454 A 0 455 C 434 456 G 433 457 A 432 458 A 431 459 G 430 460 G 423 461 G 422 462 G 421 463 G 420 464 C 419 465 A 0 466 A 37 467 G 36 468 C 35 469 G 34 470 U 33 471 U 32 472 A 30 473 U 29 474 U 28 475 U 27 476 G 0 477 G 0 478 U 0 479 U 0 480 U 0 481 G 0 482 A 0 483 U 0 484 U 0 485 U 0 486 C 791 487 G 790 488 U 789 489 G 0 490 U 0 491 A 0 492 A 0 493 A 0 494 A 0 495 A 0 496 G 681 497 U 680 498 G 679 499 U 678 500 G 0 501 U 0 502 A 0 503 G 674 504 A 673 505 C 672 506 U 0 507 G 569 508 U 568 509 U 567 510 U 566 511 U 565 512 U 564 513 G 563 514 A 0 515 A 562 516 A 561 517 A 559 518 C 558 519 U 557 520 U 556 521 A 555 522 A 554 523 A 553 524 A 552 525 C 551 526 G 0 527 A 0 528 A 0 529 A 0 530 A 0 531 A 0 532 U 0 533 U 547 534 A 546 535 A 545 536 C 544 537 A 543 538 U 542 539 U 0 540 U 0 541 U 0 542 A 538 543 U 537 544 G 536 545 A 535 546 U 534 547 A 533 548 U 0 549 G 0 550 A 0 551 A 525 552 G 524 553 U 523 554 U 522 555 U 521 556 A 520 557 A 519 558 G 518 559 U 517 560 U 0 561 U 516 562 A 515 563 A 513 564 A 512 565 A 511 566 A 510 567 A 509 568 A 508 569 C 507 570 U 0 571 U 0 572 G 0 573 A 668 574 G 667 575 U 666 576 U 665 577 A 663 578 A 662 579 A 661 580 A 660 581 A 659 582 G 0 583 A 0 584 A 658 585 G 657 586 A 656 587 U 655 588 U 654 589 A 653 590 U 652 591 A 635 592 G 634 593 A 633 594 A 0 595 U 631 596 U 630 597 U 629 598 U 628 599 A 627 600 A 626 601 A 625 602 U 624 603 G 0 604 G 0 605 A 0 606 A 617 607 G 616 608 A 615 609 A 0 610 U 0 611 A 0 612 A 0 613 A 0 614 A 0 615 U 608 616 C 607 617 U 606 618 A 0 619 U 0 620 U 0 621 G 0 622 A 0 623 U 0 624 A 602 625 U 601 626 U 600 627 U 599 628 G 598 629 A 597 630 A 596 631 G 595 632 G 0 633 A 593 634 A 592 635 U 591 636 U 0 637 U 0 638 C 0 639 G 0 640 A 651 641 A 0 642 A 0 643 G 650 644 C 649 645 G 0 646 A 0 647 A 0 648 A 0 649 G 644 650 C 643 651 A 640 652 A 590 653 U 589 654 A 588 655 G 587 656 U 586 657 C 585 658 U 584 659 A 581 660 U 580 661 U 579 662 A 578 663 A 577 664 A 0 665 A 576 666 A 575 667 C 574 668 U 573 669 G 0 670 A 0 671 C 0 672 G 505 673 U 504 674 U 503 675 U 0 676 G 0 677 U 0 678 G 499 679 C 498 680 A 497 681 C 496 682 G 0 683 U 0 684 A 0 685 A 0 686 U 727 687 U 726 688 U 725 689 U 724 690 A 723 691 G 722 692 G 721 693 U 0 694 A 0 695 G 0 696 C 720 697 A 0 698 A 0 699 C 0 700 U 716 701 A 715 702 G 714 703 G 713 704 A 0 705 U 0 706 U 0 707 A 0 708 G 0 709 A 0 710 A 0 711 A 0 712 C 0 713 C 703 714 C 702 715 U 701 716 A 700 717 U 0 718 U 0 719 A 0 720 G 696 721 U 692 722 C 691 723 U 690 724 A 689 725 A 688 726 A 687 727 A 686 728 C 0 729 G 0 730 U 0 731 A 0 732 A 0 733 A 0 734 C 0 735 A 0 736 A 0 737 U 0 738 G 787 739 A 786 740 A 785 741 U 784 742 A 783 743 U 782 744 U 0 745 U 0 746 A 765 747 U 764 748 C 763 749 U 762 750 U 761 751 U 760 752 A 759 753 A 758 754 A 0 755 U 0 756 U 0 757 U 0 758 U 753 759 U 752 760 A 751 761 G 750 762 A 749 763 G 748 764 A 747 765 U 746 766 U 0 767 U 0 768 A 0 769 G 776 770 C 775 771 U 0 772 A 0 773 A 0 774 C 0 775 G 770 776 C 769 777 G 0 778 U 0 779 U 0 780 A 0 781 A 0 782 A 743 783 U 742 784 A 741 785 U 740 786 U 739 787 C 738 788 U 0 789 A 488 790 C 487 791 G 486 792 A 0 793 G 820 794 A 819 795 G 818 796 G 0 797 A 0 798 G 0 799 U 0 800 A 0 801 C 0 802 A 813 803 U 812 804 U 811 805 A 810 806 G 0 807 C 0 808 A 0 809 A 0 810 U 805 811 A 804 812 A 803 813 U 802 814 A 0 815 A 0 816 A 0 817 A 0 818 C 795 819 U 794 820 C 793 821 A 0 822 A 0 823 A 0 824 G 19 825 A 18 826 A 17 827 A 0 828 U 0 829 U 1290 830 G 1289 831 C 1287 832 C 1286 833 G 1285 834 G 0 835 G 1284 836 A 1283 837 G 1282 838 U 1281 839 U 1280 840 U 1279 841 A 1278 842 U 0 843 A 0 844 U 0 845 A 0 846 A 1239 847 U 1238 848 U 1237 849 G 1236 850 G 1235 851 U 1234 852 G 0 853 G 1131 854 A 1130 855 A 1129 856 C 1128 857 A 1127 858 U 1126 859 A 1125 860 U 1124 861 A 1123 862 G 1120 863 C 1119 864 U 0 865 U 0 866 A 0 867 A 0 868 U 883 869 U 882 870 C 881 871 G 880 872 U 0 873 C 0 874 G 0 875 G 0 876 U 0 877 A 0 878 C 0 879 G 0 880 C 871 881 G 870 882 C 869 883 A 868 884 A 0 885 A 0 886 A 0 887 C 0 888 C 0 889 U 0 890 U 0 891 A 0 892 C 1115 893 C 1114 894 A 1113 895 U 1112 896 U 1111 897 U 1110 898 U 1109 899 U 0 900 U 0 901 G 0 902 A 0 903 A 0 904 U 0 905 U 0 906 C 0 907 U 0 908 U 0 909 A 0 910 G 0 911 A 0 912 C 0 913 A 0 914 A 1104 915 G 1103 916 U 0 917 G 1102 918 U 1101 919 U 1100 920 G 1099 921 C 0 922 A 0 923 U 1098 924 G 1097 925 G 1094 926 C 1093 927 U 1092 928 G 1090 929 U 1089 930 C 1088 931 G 1087 932 U 0 933 C 0 934 A 0 935 G 974 936 C 973 937 U 972 938 C 971 939 G 970 940 U 969 941 G 950 942 U 949 943 U 948 944 U 0 945 U 0 946 G 0 947 A 0 948 A 943 949 A 942 950 U 941 951 G 0 952 U 0 953 U 966 954 U 965 955 G 964 956 G 963 957 U 0 958 U 0 959 A 0 960 A 0 961 G 0 962 U 0 963 C 956 964 C 955 965 C 954 966 U 953 967 U 0 968 A 0 969 A 940 970 C 939 971 G 938 972 A 937 973 G 936 974 C 935 975 G 0 976 A 0 977 A 0 978 A 0 979 C 0 980 C 1082 981 C 1081 982 U 1080 983 U 1079 984 G 1078 985 U 1050 986 U 1049 987 U 1048 988 U 1047 989 U 1046 990 U 1045 991 A 0 992 U 0 993 U 0 994 U 0 995 U 0 996 A 1039 997 A 1038 998 A 1037 999 U 1036 1000 A 1035 1001 A 1034 1002 A 1033 1003 A 1032 1004 C 0 1005 G 0 1006 A 0 1007 G 0 1008 A 0 1009 U 0 1010 U 1026 1011 A 1025 1012 A 1024 1013 A 1023 1014 A 1022 1015 C 1021 1016 A 0 1017 A 0 1018 A 0 1019 U 0 1020 A 0 1021 G 1015 1022 U 1014 1023 U 1013 1024 U 1012 1025 U 1011 1026 A 1010 1027 U 0 1028 A 0 1029 U 0 1030 U 0 1031 U 0 1032 U 1003 1033 U 1002 1034 U 1001 1035 U 1000 1036 A 999 1037 U 998 1038 U 997 1039 U 996 1040 U 0 1041 U 0 1042 C 0 1043 U 0 1044 A 0 1045 A 990 1046 A 989 1047 A 988 1048 A 987 1049 A 986 1050 A 985 1051 U 0 1052 A 0 1053 U 0 1054 U 0 1055 G 0 1056 C 1070 1057 C 1069 1058 U 1068 1059 G 1067 1060 U 1066 1061 A 0 1062 A 0 1063 A 0 1064 A 0 1065 A 0 1066 A 1060 1067 C 1059 1068 A 1058 1069 G 1057 1070 G 1056 1071 A 0 1072 U 0 1073 U 0 1074 A 0 1075 A 0 1076 A 0 1077 G 0 1078 U 984 1079 A 983 1080 A 982 1081 G 981 1082 G 980 1083 A 0 1084 U 0 1085 G 0 1086 A 0 1087 C 931 1088 G 930 1089 U 929 1090 C 928 1091 A 0 1092 A 927 1093 G 926 1094 U 925 1095 G 0 1096 U 0 1097 C 924 1098 A 923 1099 U 920 1100 G 919 1101 A 918 1102 C 917 1103 C 915 1104 U 914 1105 U 0 1106 U 0 1107 A 0 1108 U 0 1109 A 898 1110 A 897 1111 A 896 1112 A 895 1113 U 894 1114 G 893 1115 G 892 1116 G 0 1117 C 0 1118 U 0 1119 G 863 1120 C 862 1121 A 0 1122 U 0 1123 U 861 1124 A 860 1125 U 859 1126 G 858 1127 U 857 1128 G 856 1129 U 855 1130 U 854 1131 A 853 1132 C 0 1133 A 0 1134 A 0 1135 U 0 1136 A 1190 1137 A 1189 1138 C 1188 1139 A 1187 1140 A 1186 1141 A 1185 1142 A 1184 1143 A 0 1144 C 0 1145 A 0 1146 A 0 1147 U 0 1148 G 1179 1149 A 1178 1150 G 1177 1151 U 0 1152 U 0 1153 A 1172 1154 U 1171 1155 U 0 1156 U 0 1157 G 0 1158 A 1167 1159 A 1166 1160 U 1165 1161 G 0 1162 A 0 1163 A 0 1164 A 0 1165 A 1160 1166 U 1159 1167 U 1158 1168 G 0 1169 A 0 1170 A 0 1171 A 1154 1172 U 1153 1173 U 0 1174 A 0 1175 A 0 1176 U 0 1177 C 1150 1178 U 1149 1179 U 1148 1180 A 0 1181 A 0 1182 A 0 1183 A 0 1184 A 1142 1185 U 1141 1186 U 1140 1187 U 1139 1188 G 1138 1189 U 1137 1190 U 1136 1191 C 0 1192 U 0 1193 A 0 1194 G 0 1195 U 0 1196 U 0 1197 C 1228 1198 A 0 1199 G 0 1200 A 0 1201 U 1224 1202 U 1223 1203 A 1222 1204 U 1221 1205 U 1220 1206 U 1219 1207 U 1218 1208 C 1217 1209 U 0 1210 G 0 1211 C 0 1212 A 0 1213 A 0 1214 C 0 1215 U 0 1216 C 0 1217 G 1208 1218 A 1207 1219 A 1206 1220 A 1205 1221 A 1204 1222 U 1203 1223 A 1202 1224 U 1201 1225 G 0 1226 A 0 1227 A 0 1228 G 1197 1229 U 0 1230 U 0 1231 G 0 1232 A 0 1233 A 0 1234 A 851 1235 U 850 1236 C 849 1237 A 848 1238 A 847 1239 A 846 1240 A 0 1241 G 0 1242 U 0 1243 A 0 1244 A 1266 1245 U 1265 1246 C 1264 1247 G 1263 1248 U 1262 1249 U 1261 1250 U 1260 1251 A 1259 1252 U 0 1253 C 0 1254 A 0 1255 G 0 1256 C 0 1257 A 0 1258 C 0 1259 G 1251 1260 G 1250 1261 A 1249 1262 A 1248 1263 C 1247 1264 G 1246 1265 G 1245 1266 U 1244 1267 G 0 1268 A 0 1269 A 0 1270 A 0 1271 U 0 1272 U 0 1273 A 0 1274 U 0 1275 C 0 1276 U 0 1277 C 0 1278 U 841 1279 G 840 1280 G 839 1281 A 838 1282 C 837 1283 U 836 1284 U 835 1285 U 833 1286 G 832 1287 C 831 1288 A 0 1289 C 830 1290 A 829 1291 A 0 1292 A 0 1293 U 0 1294 C 0 1295 G 1442 1296 C 1441 1297 C 0 1298 C 1438 1299 G 1437 1300 U 0 1301 C 1435 1302 A 0 1303 C 1432 1304 A 1431 1305 G 1430 1306 C 1429 1307 A 1428 1308 U 1427 1309 G 1426 1310 A 1425 1311 A 1424 1312 A 1423 1313 G 1422 1314 U 1421 1315 U 1420 1316 U 1419 1317 U 1418 1318 U 1417 1319 U 1416 1320 A 1415 1321 A 1414 1322 U 1413 1323 U 1412 1324 U 1411 1325 G 0 1326 A 0 1327 A 0 1328 A 1407 1329 U 1406 1330 A 1405 1331 A 1404 1332 G 1403 1333 A 1402 1334 A 1401 1335 A 1400 1336 G 1399 1337 U 1398 1338 A 0 1339 A 0 1340 A 0 1341 U 1394 1342 U 1393 1343 U 1392 1344 U 1391 1345 A 1390 1346 U 0 1347 U 0 1348 U 0 1349 C 1387 1350 U 1386 1351 U 0 1352 G 1383 1353 U 1382 1354 A 1381 1355 A 1380 1356 G 1379 1357 A 0 1358 U 1378 1359 A 1377 1360 U 1376 1361 C 0 1362 U 1372 1363 U 1371 1364 U 1370 1365 U 1369 1366 U 0 1367 U 0 1368 U 0 1369 A 1365 1370 A 1364 1371 A 1363 1372 A 1362 1373 A 0 1374 C 0 1375 A 0 1376 A 1360 1377 U 1359 1378 A 1358 1379 C 1356 1380 U 1355 1381 U 1354 1382 A 1353 1383 U 1352 1384 U 0 1385 U 0 1386 A 1350 1387 G 1349 1388 U 0 1389 U 0 1390 U 1345 1391 A 1344 1392 A 1343 1393 A 1342 1394 A 1341 1395 C 0 1396 A 0 1397 A 0 1398 A 1337 1399 C 1336 1400 U 1335 1401 U 1334 1402 U 1333 1403 U 1332 1404 U 1331 1405 U 1330 1406 A 1329 1407 U 1328 1408 G 0 1409 A 0 1410 G 0 1411 A 1324 1412 A 1323 1413 C 1322 1414 A 1321 1415 G 1320 1416 A 1319 1417 A 1318 1418 A 1317 1419 A 1316 1420 A 1315 1421 A 1314 1422 U 1313 1423 U 1312 1424 A 1311 1425 U 1310 1426 U 1309 1427 G 1308 1428 U 1307 1429 G 1306 1430 C 1305 1431 U 1304 1432 G 1303 1433 A 0 1434 A 0 1435 G 1301 1436 U 0 1437 C 1299 1438 G 1298 1439 U 0 1440 A 0 1441 A 1296 1442 C 1295 1443 A 0 1444 A 0 1445 G 0 1446 G 0 1447 U 1470 1448 A 0 1449 A 1468 1450 C 1467 1451 U 1466 1452 G 1465 1453 U 1464 1454 A 1463 1455 G 1462 1456 G 1461 1457 G 0 1458 G 0 1459 A 0 1460 A 0 1461 C 1456 1462 C 1455 1463 U 1454 1464 G 1453 1465 U 1452 1466 A 1451 1467 G 1450 1468 U 1449 1469 U 0 1470 G 1447 1471 G 0 1472 A 0 1473 A 0 1474 A 0 1475 A 0 1476 U 0 1477 U 0 1478 U 0 1479 U 0 1480 C 0 1481 U 0 1482 U 0 1483 U 0