Filename: d.16.b.A.caulinodans.bpseq Organism: Azorhizobium caulinodans Accession Number: D11342 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 0 9 N 25 10 N 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 857 18 C 856 19 C 855 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 496 28 A 495 29 G 494 30 C 493 31 G 0 32 A 492 33 A 491 34 C 490 35 G 489 36 C 488 37 U 487 38 G 0 39 G 368 40 C 367 41 G 366 42 G 365 43 C 364 44 A 363 45 G 361 46 G 360 47 C 326 48 C 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 324 53 A 323 54 C 322 55 A 0 56 U 321 57 G 320 58 C 319 59 A 0 60 A 0 61 G 86 62 U 85 63 C 84 64 G 0 65 A 0 66 G 83 67 C 82 68 G 81 69 C 80 70 C 79 71 C 78 72 A 77 73 G 0 74 C 0 75 A 0 76 A 0 77 U 72 78 G 71 79 G 70 80 G 69 81 A 68 82 G 67 83 C 66 84 G 63 85 G 62 86 C 61 87 A 0 88 G 0 89 A 0 90 C 0 91 G 0 92 G 0 93 G 279 94 U 278 95 G 277 96 A 0 97 G 0 98 U 0 99 A 0 100 A 0 101 C 0 102 G 204 103 C 203 104 G 202 105 U 201 106 G 200 107 G 199 108 G 198 109 G 197 110 A 0 111 U 196 112 G 195 113 U 0 114 G 0 115 C 0 116 C 192 117 C 191 118 A 190 119 A 189 120 U 188 121 G 187 122 G 186 123 U 0 124 G 158 125 C 157 126 G 156 127 G 155 128 A 0 129 A 0 130 U 0 131 A 0 132 A 149 133 C 148 134 C 147 135 C 146 136 A 145 137 G 144 138 G 143 139 G 0 140 A 0 141 A 0 142 A 0 143 C 138 144 U 137 145 U 136 146 G 135 147 G 134 148 A 133 149 U 132 150 U 0 151 A 0 152 A 0 153 U 0 154 A 0 155 C 127 156 C 126 157 G 125 158 C 124 159 A 0 160 U 0 161 U 0 162 G 0 163 C 172 164 C 171 165 C 170 166 U 0 167 U 0 168 C 0 169 G 0 170 G 165 171 G 164 172 G 163 173 G 0 174 A 0 175 A 0 176 A 0 177 G 184 178 A 183 179 U 0 180 U 0 181 U 0 182 A 0 183 U 178 184 C 177 185 G 0 186 C 122 187 C 121 188 A 120 189 U 119 190 U 118 191 G 117 192 G 116 193 A 0 194 U 0 195 C 112 196 A 111 197 A 109 198 C 108 199 C 107 200 C 106 201 G 105 202 C 104 203 G 103 204 U 102 205 C 251 206 U 250 207 G 249 208 A 0 209 U 0 210 U 248 211 A 0 212 G 242 213 C 241 214 U 240 215 A 0 216 G 0 217 U 239 218 U 238 219 G 237 220 G 236 221 U 235 222 G 234 223 A 233 224 G 232 225 G 0 226 U 0 227 A 0 228 A 0 229 A 0 230 G 0 231 G 0 232 C 224 233 U 223 234 C 222 235 A 221 236 C 220 237 C 219 238 A 218 239 A 217 240 G 214 241 G 213 242 C 212 243 G 0 244 A 0 245 C 0 246 G 0 247 A 0 248 U 210 249 C 207 250 A 206 251 G 205 252 U 0 253 A 0 254 G 276 255 C 275 256 U 274 257 G 273 258 G 269 259 U 268 260 C 267 261 U 266 262 G 0 263 A 0 264 G 0 265 A 0 266 G 261 267 G 260 268 A 259 269 U 258 270 G 0 271 A 0 272 U 0 273 C 257 274 A 256 275 G 255 276 C 254 277 C 95 278 A 94 279 C 93 280 A 0 281 C 302 282 U 301 283 G 300 284 G 299 285 G 298 286 A 297 287 C 0 288 U 0 289 G 0 290 A 0 291 G 0 292 A 0 293 C 0 294 A 0 295 C 0 296 G 0 297 G 286 298 C 285 299 C 284 300 C 283 301 A 282 302 G 281 303 A 0 304 C 315 305 U 314 306 C 313 307 C 312 308 U 0 309 A 0 310 C 0 311 G 0 312 G 307 313 G 306 314 A 305 315 G 304 316 G 0 317 C 0 318 A 0 319 G 58 320 C 57 321 A 56 322 G 54 323 U 53 324 G 52 325 G 0 326 G 47 327 G 0 328 A 0 329 A 0 330 U 0 331 A 0 332 U 358 333 U 0 334 G 357 335 G 356 336 A 355 337 C 0 338 A 0 339 A 0 340 U 353 341 G 352 342 G 351 343 G 350 344 C 349 345 G 0 346 C 0 347 A 0 348 A 0 349 G 344 350 C 343 351 C 342 352 U 341 353 G 340 354 A 0 355 U 336 356 C 335 357 C 334 358 A 332 359 G 0 360 C 46 361 C 45 362 A 0 363 U 44 364 G 43 365 C 42 366 C 41 367 G 40 368 C 39 369 G 0 370 U 0 371 G 401 372 A 400 373 G 399 374 U 398 375 G 0 376 A 0 377 U 0 378 G 0 379 A 0 380 A 0 381 G 392 382 G 391 383 C 390 384 C 389 385 U 0 386 U 0 387 A 0 388 G 0 389 G 384 390 G 383 391 U 382 392 U 381 393 G 0 394 U 0 395 A 0 396 A 0 397 A 0 398 G 374 399 C 373 400 U 372 401 C 371 402 U 0 403 U 436 404 U 0 405 C 437 406 G 433 407 C 432 408 C 431 409 G 430 410 G 429 411 U 428 412 G 0 413 A 0 414 A 0 415 G 423 416 A 0 417 U 0 418 A 0 419 A 0 420 U 0 421 G 0 422 A 0 423 C 415 424 G 0 425 G 0 426 U 0 427 A 0 428 A 411 429 C 410 430 C 409 431 G 408 432 G 407 433 A 406 434 G 0 435 A 0 436 A 403 437 G 405 438 A 0 439 A 0 440 G 485 441 C 484 442 C 483 443 C 482 444 C 481 445 G 466 446 G 465 447 C 464 448 U 0 449 A 0 450 A 0 451 C 480 452 U 479 453 U 478 454 C 477 455 G 476 456 U 0 457 G 0 458 C 0 459 C 0 460 A 0 461 G 468 462 C 467 463 A 0 464 G 447 465 C 446 466 C 445 467 G 462 468 C 461 469 G 0 470 G 0 471 U 0 472 A 0 473 A 0 474 U 0 475 A 0 476 C 455 477 G 454 478 A 453 479 A 452 480 G 451 481 G 444 482 G 443 483 G 442 484 G 441 485 C 440 486 A 0 487 A 37 488 G 36 489 C 35 490 G 34 491 U 33 492 U 32 493 G 30 494 C 29 495 U 28 496 C 27 497 G 0 498 G 0 499 A 0 500 A 0 501 U 0 502 C 0 503 A 0 504 C 0 505 U 0 506 G 0 507 G 822 508 G 821 509 C 820 510 G 805 511 U 804 512 A 0 513 A 0 514 A 0 515 G 819 516 C 0 517 G 704 518 C 703 519 A 702 520 C 701 521 G 0 522 U 698 523 A 0 524 G 697 525 G 696 526 C 695 527 G 0 528 G 591 529 A 590 530 U 589 531 C 588 532 G 587 533 U 586 534 U 585 535 A 0 536 A 584 537 G 583 538 U 580 539 C 579 540 A 578 541 A 577 542 G 0 543 G 576 544 G 575 545 G 574 546 U 573 547 G 572 548 A 0 549 A 0 550 A 0 551 G 0 552 C 569 553 C 568 554 U 567 555 G 566 556 A 564 557 G 563 558 C 0 559 U 0 560 C 0 561 A 0 562 A 0 563 C 557 564 U 556 565 C 0 566 C 555 567 A 554 568 G 553 569 A 552 570 A 0 571 C 0 572 U 547 573 G 546 574 C 545 575 C 544 576 C 543 577 U 541 578 U 540 579 G 539 580 A 538 581 U 0 582 A 0 583 C 537 584 U 536 585 G 534 586 G 533 587 C 532 588 G 531 589 A 530 590 U 529 591 C 528 592 U 0 593 U 0 594 G 0 595 A 691 596 G 690 597 U 689 598 U 687 599 C 686 600 G 685 601 A 684 602 G 683 603 A 682 604 G 0 605 A 0 606 G 680 607 G 679 608 U 678 609 U 677 610 G 676 611 G 675 612 U 674 613 G 657 614 G 656 615 A 0 616 A 0 617 C 653 618 U 652 619 C 651 620 C 650 621 G 649 622 A 648 623 G 647 624 U 646 625 G 0 626 U 0 627 A 0 628 G 639 629 A 638 630 G 637 631 G 0 632 U 0 633 G 0 634 A 0 635 A 0 636 A 0 637 U 630 638 U 629 639 C 628 640 G 0 641 U 0 642 A 0 643 G 0 644 A 0 645 U 0 646 A 624 647 U 623 648 U 622 649 C 621 650 G 620 651 G 619 652 A 618 653 A 617 654 G 0 655 A 0 656 A 614 657 C 613 658 A 0 659 C 0 660 C 0 661 A 0 662 G 673 663 U 0 664 G 0 665 G 672 666 C 671 667 G 0 668 A 0 669 A 0 670 G 0 671 G 666 672 C 665 673 G 662 674 G 612 675 C 611 676 C 610 677 A 609 678 A 608 679 C 607 680 U 606 681 G 0 682 G 603 683 C 602 684 U 601 685 C 600 686 G 599 687 A 598 688 U 0 689 A 597 690 C 596 691 U 595 692 G 0 693 A 0 694 C 0 695 G 526 696 C 525 697 U 524 698 G 522 699 A 0 700 G 0 701 G 520 702 U 519 703 G 518 704 C 517 705 G 0 706 A 0 707 A 0 708 A 0 709 G 750 710 C 749 711 G 748 712 U 747 713 G 746 714 G 745 715 G 0 716 G 0 717 A 0 718 G 744 719 C 743 720 A 0 721 A 0 722 A 0 723 C 739 724 A 738 725 G 737 726 G 736 727 A 0 728 U 0 729 U 0 730 A 0 731 G 0 732 A 0 733 U 0 734 A 0 735 C 0 736 C 726 737 C 725 738 U 724 739 G 723 740 G 0 741 U 0 742 A 0 743 G 719 744 U 718 745 C 714 746 C 713 747 A 712 748 C 711 749 G 710 750 C 709 751 C 0 752 G 0 753 U 0 754 A 0 755 A 0 756 A 0 757 C 0 758 G 0 759 A 0 760 U 0 761 G 818 762 G 817 763 A 816 764 U 815 765 G 814 766 C 813 767 U 0 768 A 0 769 G 796 770 C 795 771 C 794 772 G 793 773 U 792 774 U 791 775 G 790 776 G 789 777 G 788 778 G 787 779 A 786 780 G 785 781 C 0 782 U 0 783 U 0 784 G 0 785 C 780 786 U 779 787 C 778 788 U 777 789 U 776 790 C 775 791 A 774 792 G 773 793 U 772 794 G 771 795 G 770 796 C 769 797 G 0 798 C 0 799 A 0 800 C 807 801 G 806 802 U 0 803 A 0 804 A 511 805 C 510 806 G 801 807 C 800 808 C 0 809 U 0 810 U 0 811 A 0 812 A 0 813 G 766 814 C 765 815 A 764 816 U 763 817 C 762 818 C 761 819 C 515 820 G 509 821 C 508 822 C 507 823 U 0 824 G 851 825 G 850 826 G 849 827 G 0 828 A 0 829 G 0 830 U 0 831 A 0 832 C 0 833 G 844 834 G 843 835 U 842 836 C 841 837 G 0 838 C 0 839 A 0 840 A 0 841 G 836 842 A 835 843 U 834 844 U 833 845 A 0 846 A 0 847 A 0 848 A 0 849 C 826 850 U 825 851 C 824 852 A 0 853 A 0 854 A 0 855 G 19 856 G 18 857 A 17 858 A 0 859 U 0 860 U 1336 861 G 1335 862 A 1333 863 C 1332 864 G 1331 865 G 0 866 G 1330 867 G 1329 868 G 1328 869 C 1327 870 C 1326 871 C 1325 872 G 1324 873 C 0 874 A 1320 875 C 1319 876 A 0 877 A 0 878 G 1284 879 C 1283 880 G 1282 881 G 1281 882 U 1280 883 G 1178 884 G 1177 885 A 1176 886 G 1175 887 C 1174 888 A 1173 889 U 1172 890 G 1171 891 U 1170 892 G 1169 893 G 1167 894 U 1166 895 U 0 896 U 0 897 A 0 898 A 0 899 U 914 900 U 913 901 C 912 902 G 911 903 A 0 904 A 0 905 G 0 906 C 0 907 A 0 908 A 0 909 C 0 910 G 0 911 C 902 912 G 901 913 C 900 914 A 899 915 G 0 916 A 0 917 A 0 918 C 0 919 C 0 920 U 0 921 U 0 922 A 0 923 C 1162 924 C 1161 925 A 1160 926 G 1159 927 C 1158 928 C 1157 929 U 1156 930 U 0 931 U 0 932 G 0 933 A 0 934 C 0 935 A 986 936 U 985 937 G 984 938 G 982 939 C 981 940 A 980 941 G 979 942 G 978 943 A 0 944 C 0 945 G 0 946 A 963 947 C 962 948 U 961 949 U 960 950 C 959 951 C 958 952 G 957 953 G 0 954 A 0 955 G 0 956 A 0 957 C 952 958 G 951 959 G 950 960 A 949 961 U 948 962 U 947 963 U 946 964 C 0 965 U 0 966 U 977 967 C 976 968 C 975 969 A 974 970 G 0 971 C 0 972 A 0 973 A 0 974 U 969 975 G 968 976 G 967 977 A 966 978 C 942 979 C 941 980 U 940 981 G 939 982 C 938 983 A 0 984 C 937 985 A 936 986 C 935 987 A 0 988 G 1151 989 G 1150 990 U 0 991 G 1149 992 C 1148 993 U 1147 994 G 1146 995 C 0 996 A 0 997 U 1145 998 G 1144 999 G 1140 1000 C 1139 1001 U 1138 1002 G 1136 1003 U 1135 1004 C 1134 1005 G 1133 1006 U 0 1007 C 0 1008 A 0 1009 G 1048 1010 C 1047 1011 U 1046 1012 C 1045 1013 G 1044 1014 U 1043 1015 G 1024 1016 U 1023 1017 C 1022 1018 G 0 1019 U 0 1020 G 0 1021 A 0 1022 G 1017 1023 A 1016 1024 U 1015 1025 G 0 1026 U 0 1027 U 1040 1028 G 1039 1029 G 1038 1030 G 1037 1031 U 0 1032 U 0 1033 A 0 1034 A 0 1035 G 0 1036 U 0 1037 C 1030 1038 C 1029 1039 C 1028 1040 G 1027 1041 C 0 1042 A 0 1043 A 1014 1044 C 1013 1045 G 1012 1046 A 1011 1047 G 1010 1048 C 1009 1049 G 0 1050 C 0 1051 A 0 1052 A 0 1053 C 0 1054 C 1128 1055 C 1127 1056 U 1126 1057 C 1125 1058 G 0 1059 C 1095 1060 C 1094 1061 U 1093 1062 U 1092 1063 U 1091 1064 A 1090 1065 G 1089 1066 U 0 1067 U 0 1068 G 0 1069 C 1084 1070 C 1083 1071 A 0 1072 U 0 1073 C 1082 1074 A 1081 1075 U 0 1076 U 0 1077 C 0 1078 A 0 1079 G 0 1080 U 0 1081 U 1074 1082 G 1073 1083 G 1070 1084 G 1069 1085 C 0 1086 A 0 1087 C 0 1088 U 0 1089 C 1065 1090 U 1064 1091 A 1063 1092 A 1062 1093 A 1061 1094 G 1060 1095 G 1059 1096 G 0 1097 A 0 1098 C 1119 1099 U 1118 1100 G 1117 1101 C 1116 1102 C 1114 1103 G 1113 1104 G 1112 1105 U 1111 1106 G 0 1107 A 0 1108 U 0 1109 A 0 1110 A 0 1111 G 1105 1112 C 1104 1113 C 1103 1114 G 1102 1115 C 0 1116 G 1101 1117 A 1100 1118 G 1099 1119 G 1098 1120 A 0 1121 A 0 1122 G 0 1123 G 0 1124 U 0 1125 G 1057 1126 G 1056 1127 G 1055 1128 G 1054 1129 A 0 1130 U 0 1131 G 0 1132 A 0 1133 C 1005 1134 G 1004 1135 U 1003 1136 C 1002 1137 A 0 1138 A 1001 1139 G 1000 1140 U 999 1141 C 0 1142 C 0 1143 U 0 1144 C 998 1145 A 997 1146 U 994 1147 G 993 1148 G 992 1149 C 991 1150 C 989 1151 C 988 1152 U 0 1153 U 0 1154 A 0 1155 C 0 1156 G 929 1157 G 928 1158 G 927 1159 C 926 1160 U 925 1161 G 924 1162 G 923 1163 G 0 1164 C 0 1165 U 0 1166 A 894 1167 C 893 1168 A 0 1169 C 892 1170 A 891 1171 C 890 1172 G 889 1173 U 888 1174 G 887 1175 C 886 1176 U 885 1177 A 884 1178 C 883 1179 A 0 1180 A 0 1181 U 0 1182 G 1236 1183 G 1235 1184 C 1234 1185 G 1233 1186 G 1232 1187 U 1231 1188 G 1230 1189 A 0 1190 C 0 1191 A 0 1192 A 0 1193 U 0 1194 G 1225 1195 G 1224 1196 G 1223 1197 A 0 1198 U 0 1199 G 1218 1200 C 1217 1201 G 0 1202 A 0 1203 G 0 1204 C 1213 1205 C 1212 1206 U 1211 1207 G 0 1208 C 0 1209 G 0 1210 A 0 1211 G 1206 1212 G 1205 1213 G 1204 1214 U 0 1215 G 0 1216 A 0 1217 G 1200 1218 C 1199 1219 A 0 1220 A 0 1221 A 0 1222 U 0 1223 C 1196 1224 U 1195 1225 C 1194 1226 C 0 1227 A 0 1228 A 0 1229 A 0 1230 A 1188 1231 G 1187 1232 C 1186 1233 C 1185 1234 G 1184 1235 U 1183 1236 C 1182 1237 U 0 1238 C 0 1239 A 0 1240 G 0 1241 U 0 1242 U 0 1243 C 1274 1244 G 0 1245 G 0 1246 A 0 1247 U 1270 1248 U 1269 1249 G 1268 1250 C 1267 1251 A 1266 1252 C 1265 1253 U 1264 1254 C 1263 1255 U 0 1256 G 0 1257 C 0 1258 A 0 1259 A 0 1260 C 0 1261 U 0 1262 C 0 1263 G 1254 1264 A 1253 1265 G 1252 1266 U 1251 1267 G 1250 1268 C 1249 1269 A 1248 1270 U 1247 1271 G 0 1272 A 0 1273 A 0 1274 G 1243 1275 U 0 1276 U 0 1277 G 0 1278 G 0 1279 A 0 1280 A 882 1281 U 881 1282 C 880 1283 G 879 1284 C 878 1285 U 0 1286 A 0 1287 G 0 1288 U 0 1289 A 0 1290 A 1312 1291 U 1311 1292 C 1310 1293 G 1309 1294 U 1308 1295 G 1307 1296 G 1306 1297 A 1305 1298 U 0 1299 C 0 1300 A 0 1301 G 0 1302 C 0 1303 A 0 1304 U 0 1305 G 1297 1306 C 1296 1307 C 1295 1308 A 1294 1309 C 1293 1310 G 1292 1311 G 1291 1312 U 1290 1313 G 0 1314 A 0 1315 A 0 1316 U 0 1317 A 0 1318 C 0 1319 G 875 1320 U 874 1321 U 0 1322 C 0 1323 C 0 1324 C 872 1325 G 871 1326 G 870 1327 G 869 1328 C 868 1329 C 867 1330 U 866 1331 U 864 1332 G 863 1333 U 862 1334 A 0 1335 C 861 1336 A 860 1337 C 0 1338 A 0 1339 C 1444 1340 C 0 1341 G 1441 1342 C 1440 1343 C 0 1344 C 1437 1345 G 1436 1346 U 0 1347 C 0 1348 A 0 1349 C 1431 1350 A 1430 1351 C 1429 1352 C 1428 1353 A 1427 1354 U 1426 1355 G 1425 1356 G 1424 1357 G 0 1358 A 0 1359 G 1421 1360 U 1420 1361 U 1419 1362 G 1418 1363 G 1417 1364 C 1416 1365 U 1415 1366 U 1414 1367 U 1413 1368 A 1412 1369 C 1411 1370 C 1410 1371 C 0 1372 G 0 1373 A 0 1374 A 0 1375 G 1406 1376 G 1405 1377 C 1404 1378 G 1403 1379 U 1402 1380 U 1401 1381 G 0 1382 C 1400 1383 G 1399 1384 C 1398 1385 U 1397 1386 A 0 1387 A 0 1388 C 1395 1389 C 1394 1390 G 0 1391 C 0 1392 A 0 1393 A 0 1394 G 1389 1395 G 1388 1396 A 0 1397 G 1385 1398 G 1384 1399 C 1383 1400 A 1382 1401 G 1380 1402 G 1379 1403 C 1378 1404 G 1377 1405 A 1376 1406 C 1375 1407 C 0 1408 A 0 1409 C 0 1410 G 1370 1411 G 1369 1412 U 1368 1413 A 1367 1414 G 1366 1415 G 1365 1416 G 1364 1417 U 1363 1418 C 1362 1419 A 1361 1420 G 1360 1421 U 1359 1422 G 0 1423 A 0 1424 C 1356 1425 U 1355 1426 G 1354 1427 G 1353 1428 G 1352 1429 G 1351 1430 U 1350 1431 G 1349 1432 A 0 1433 A 0 1434 G 0 1435 U 0 1436 C 1345 1437 G 1344 1438 U 0 1439 A 0 1440 A 1342 1441 C 1341 1442 A 0 1443 A 0 1444 G 1339 1445 G 0 1446 U 1469 1447 A 1468 1448 G 1467 1449 C 1466 1450 C 1465 1451 G 1464 1452 U 1463 1453 A 1462 1454 G 1461 1455 G 1460 1456 G 0 1457 G 0 1458 A 0 1459 A 0 1460 C 1455 1461 C 1454 1462 U 1453 1463 G 1452 1464 C 1451 1465 G 1450 1466 G 1449 1467 C 1448 1468 U 1447 1469 G 1446 1470 G 0 1471 A 0 1472 U 0 1473 C 0 1474 A 0 1475 C 0 1476 C 0 1477 U 0 1478 N 0 1479 N 0 1480 N 0 1481 N 0 1482 N 0