Filename: d.16.b.A.hydrophila.bpseq Organism: Aeromonas hydrophila Accession Number: X60407 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 919 18 C 918 19 A 917 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 557 28 A 556 29 U 555 30 U 554 31 G 0 32 A 553 33 A 552 34 C 551 35 G 550 36 C 549 37 U 548 38 G 0 39 G 404 40 C 403 41 G 402 42 G 401 43 C 400 44 A 399 45 G 397 46 G 396 47 C 362 48 C 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 360 53 A 359 54 C 358 55 A 0 56 U 357 57 G 356 58 C 355 59 A 0 60 A 0 61 G 108 62 U 107 63 C 106 64 G 0 65 A 0 66 G 105 67 C 104 68 G 103 69 G 101 70 C 100 71 A 0 72 G 0 73 C 99 74 G 98 75 G 97 76 G 95 77 A 94 78 A 93 79 A 92 80 G 91 81 U 90 82 A 89 83 G 88 84 C 0 85 U 0 86 U 0 87 G 0 88 C 83 89 U 82 90 A 81 91 C 80 92 U 79 93 U 78 94 U 77 95 U 76 96 G 0 97 C 75 98 C 74 99 G 73 100 G 70 101 C 69 102 G 0 103 A 68 104 G 67 105 C 66 106 G 63 107 G 62 108 C 61 109 G 0 110 G 0 111 A 0 112 C 0 113 G 0 114 G 0 115 G 315 116 U 314 117 G 313 118 A 0 119 G 0 120 U 0 121 A 0 122 A 0 123 U 0 124 G 240 125 C 239 126 C 238 127 U 237 128 G 236 129 G 235 130 G 234 131 G 233 132 A 0 133 U 232 134 C 231 135 U 0 136 G 0 137 C 0 138 C 228 139 C 227 140 A 226 141 G 225 142 U 224 143 C 223 144 G 222 145 A 0 146 G 180 147 G 179 148 G 178 149 G 177 150 G 0 151 A 0 152 U 0 153 A 0 154 A 171 155 C 170 156 A 169 157 G 168 158 U 167 159 U 166 160 G 165 161 G 0 162 A 0 163 A 0 164 A 0 165 C 160 166 G 159 167 A 158 168 C 157 169 U 156 170 G 155 171 C 154 172 U 0 173 A 0 174 A 0 175 U 0 176 A 0 177 C 149 178 C 148 179 G 147 180 C 146 181 A 0 182 U 0 183 A 0 184 C 0 185 G 0 186 C 194 187 C 193 188 U 0 189 A 0 190 C 0 191 G 0 192 G 0 193 G 187 194 G 186 195 G 0 196 A 0 197 A 0 198 A 0 199 G 220 200 G 219 201 A 218 202 G 217 203 G 216 204 G 215 205 G 0 206 A 0 207 C 214 208 C 213 209 U 0 210 U 0 211 C 0 212 G 0 213 G 208 214 G 207 215 C 204 216 C 203 217 U 202 218 U 201 219 U 200 220 C 199 221 G 0 222 C 144 223 G 143 224 A 142 225 U 141 226 U 140 227 G 139 228 G 138 229 A 0 230 U 0 231 G 134 232 A 133 233 A 131 234 C 130 235 C 129 236 C 128 237 A 127 238 G 126 239 G 125 240 U 124 241 G 287 242 G 286 243 G 285 244 A 0 245 U 0 246 U 284 247 A 0 248 G 278 249 C 277 250 U 276 251 A 0 252 G 0 253 U 275 254 U 274 255 G 273 256 G 272 257 U 271 258 G 270 259 G 269 260 G 268 261 G 0 262 U 0 263 A 0 264 A 0 265 U 0 266 G 0 267 G 0 268 C 260 269 U 259 270 C 258 271 A 257 272 C 256 273 C 255 274 A 254 275 A 253 276 G 250 277 G 249 278 C 248 279 G 0 280 A 0 281 C 0 282 G 0 283 A 0 284 U 246 285 C 243 286 C 242 287 C 241 288 U 0 289 A 0 290 G 312 291 C 311 292 U 310 293 G 309 294 G 305 295 U 304 296 C 303 297 U 302 298 G 0 299 A 0 300 G 0 301 A 0 302 G 297 303 G 296 304 A 295 305 U 294 306 G 0 307 A 0 308 U 0 309 C 293 310 A 292 311 G 291 312 C 290 313 C 117 314 A 116 315 C 115 316 A 0 317 C 338 318 U 337 319 G 336 320 G 335 321 A 334 322 A 333 323 C 0 324 U 0 325 G 0 326 A 0 327 G 0 328 A 0 329 C 0 330 A 0 331 C 0 332 G 0 333 G 322 334 U 321 335 C 320 336 C 319 337 A 318 338 G 317 339 A 0 340 C 351 341 U 350 342 C 349 343 C 348 344 U 0 345 A 0 346 C 0 347 G 0 348 G 343 349 G 342 350 A 341 351 G 340 352 G 0 353 C 0 354 A 0 355 G 58 356 C 57 357 A 56 358 G 54 359 U 53 360 G 52 361 G 0 362 G 47 363 G 0 364 A 0 365 A 0 366 U 0 367 A 0 368 U 394 369 U 0 370 G 393 371 C 392 372 A 391 373 C 0 374 A 0 375 A 0 376 U 389 377 G 388 378 G 387 379 G 386 380 G 385 381 G 0 382 A 0 383 A 0 384 A 0 385 C 380 386 C 379 387 C 378 388 U 377 389 G 376 390 A 0 391 U 372 392 G 371 393 C 370 394 A 368 395 G 0 396 C 46 397 C 45 398 A 0 399 U 44 400 G 43 401 C 42 402 C 41 403 G 40 404 C 39 405 G 0 406 U 0 407 G 437 408 U 436 409 G 435 410 U 434 411 G 0 412 A 0 413 A 0 414 G 0 415 A 0 416 A 0 417 G 428 418 G 427 419 C 426 420 C 425 421 U 0 422 U 0 423 C 0 424 G 0 425 G 420 426 G 419 427 U 418 428 U 417 429 G 0 430 U 0 431 A 0 432 A 0 433 A 0 434 G 410 435 C 409 436 A 408 437 C 407 438 U 0 439 U 497 440 U 0 441 C 498 442 A 494 443 G 493 444 C 492 445 G 491 446 A 490 447 G 489 448 G 0 449 A 0 450 G 0 451 G 484 452 A 0 453 A 0 454 A 0 455 G 0 456 G 478 457 U 477 458 U 476 459 G 475 460 G 474 461 C 473 462 G 472 463 C 471 464 C 0 465 U 0 466 A 0 467 A 0 468 U 0 469 A 0 470 C 0 471 G 463 472 U 462 473 G 461 474 U 460 475 C 459 476 A 458 477 A 457 478 C 456 479 U 0 480 G 0 481 U 0 482 G 0 483 A 0 484 C 451 485 G 0 486 U 0 487 U 0 488 A 0 489 C 447 490 U 446 491 C 445 492 G 444 493 C 443 494 A 442 495 G 0 496 A 0 497 A 439 498 G 441 499 A 0 500 A 0 501 G 546 502 C 545 503 A 544 504 C 543 505 C 542 506 G 527 507 G 526 508 C 525 509 U 0 510 A 0 511 A 0 512 C 541 513 U 540 514 C 539 515 C 538 516 G 537 517 U 0 518 G 0 519 C 0 520 C 0 521 A 0 522 G 529 523 C 528 524 A 0 525 G 508 526 C 507 527 C 506 528 G 523 529 C 522 530 G 0 531 G 0 532 U 0 533 A 0 534 A 0 535 U 0 536 A 0 537 C 516 538 G 515 539 G 514 540 A 513 541 G 512 542 G 505 543 G 504 544 U 503 545 G 502 546 C 501 547 A 0 548 A 37 549 G 36 550 C 35 551 G 34 552 U 33 553 U 32 554 A 30 555 A 29 556 U 28 557 C 27 558 G 0 559 G 0 560 A 0 561 A 0 562 U 0 563 U 0 564 A 0 565 C 0 566 U 0 567 G 0 568 G 884 569 G 883 570 C 882 571 G 867 572 U 866 573 A 0 574 A 0 575 A 0 576 G 881 577 C 0 578 G 765 579 C 764 580 A 763 581 C 762 582 G 0 583 C 759 584 A 0 585 G 758 586 G 757 587 C 756 588 G 0 589 G 652 590 U 651 591 U 650 592 G 649 593 G 648 594 A 647 595 U 646 596 A 0 597 A 645 598 G 644 599 U 641 600 U 640 601 A 639 602 G 638 603 A 637 604 U 636 605 G 635 606 U 634 607 G 633 608 A 0 609 A 0 610 A 0 611 G 0 612 C 630 613 C 629 614 C 628 615 C 627 616 G 626 617 G 625 618 G 624 619 C 0 620 U 0 621 C 0 622 A 0 623 A 0 624 C 618 625 C 617 626 U 616 627 G 615 628 G 614 629 G 613 630 A 612 631 A 0 632 U 0 633 U 607 634 G 606 635 C 605 636 A 604 637 U 603 638 U 602 639 U 601 640 A 600 641 A 599 642 A 0 643 A 0 644 C 598 645 U 597 646 G 595 647 U 594 648 C 593 649 C 592 650 A 591 651 G 590 652 C 589 653 U 0 654 A 0 655 G 0 656 A 752 657 G 751 658 U 750 659 C 749 660 U 747 661 U 746 662 G 745 663 U 744 664 A 743 665 G 0 666 A 0 667 G 741 668 G 740 669 G 739 670 G 738 671 G 737 672 G 736 673 U 735 674 A 718 675 G 717 676 A 0 677 A 0 678 U 714 679 U 713 680 C 712 681 C 711 682 A 710 683 G 709 684 G 708 685 U 707 686 G 0 687 U 0 688 A 0 689 G 700 690 C 699 691 G 698 692 G 0 693 U 0 694 G 0 695 A 0 696 A 0 697 A 0 698 U 691 699 G 690 700 C 689 701 G 0 702 U 0 703 A 0 704 G 0 705 A 0 706 G 0 707 A 685 708 U 684 709 C 683 710 U 682 711 G 681 712 G 680 713 A 679 714 G 678 715 G 0 716 A 0 717 A 675 718 U 674 719 A 0 720 C 0 721 C 0 722 G 0 723 G 734 724 U 0 725 G 0 726 G 733 727 C 732 728 G 0 729 A 0 730 A 0 731 G 0 732 G 727 733 C 726 734 G 723 735 G 673 736 C 672 737 C 671 738 C 670 739 C 669 740 C 668 741 U 667 742 G 0 743 G 664 744 A 663 745 C 662 746 A 661 747 A 660 748 A 0 749 G 659 750 A 658 751 C 657 752 U 656 753 G 0 754 A 0 755 C 0 756 G 587 757 C 586 758 U 585 759 C 583 760 A 0 761 G 0 762 G 581 763 U 580 764 G 579 765 C 578 766 G 0 767 A 0 768 A 0 769 A 0 770 G 811 771 C 810 772 G 809 773 U 808 774 G 807 775 G 806 776 G 0 777 G 0 778 A 0 779 G 805 780 C 804 781 A 0 782 A 0 783 A 0 784 C 800 785 A 799 786 G 798 787 G 797 788 A 0 789 U 0 790 U 0 791 A 0 792 G 0 793 A 0 794 U 0 795 A 0 796 C 0 797 C 787 798 C 786 799 U 785 800 G 784 801 G 0 802 U 0 803 A 0 804 G 780 805 U 779 806 C 775 807 C 774 808 A 773 809 C 772 810 G 771 811 C 770 812 C 0 813 G 0 814 U 0 815 A 0 816 A 0 817 A 0 818 C 0 819 G 0 820 A 0 821 U 0 822 G 880 823 U 879 824 C 878 825 G 877 826 A 876 827 U 875 828 U 0 829 U 0 830 G 858 831 G 857 832 A 856 833 G 855 834 G 854 835 C 853 836 U 852 837 G 851 838 U 850 839 G 849 840 U 848 841 C 847 842 C 0 843 U 0 844 U 0 845 G 0 846 A 0 847 G 841 848 A 840 849 C 839 850 G 838 851 U 837 852 G 836 853 G 835 854 C 834 855 U 833 856 U 832 857 C 831 858 C 830 859 G 0 860 G 0 861 A 0 862 G 869 863 C 868 864 U 0 865 A 0 866 A 572 867 C 571 868 G 863 869 C 862 870 G 0 871 U 0 872 U 0 873 A 0 874 A 0 875 A 827 876 U 826 877 C 825 878 G 824 879 A 823 880 C 822 881 C 576 882 G 570 883 C 569 884 C 568 885 U 0 886 G 913 887 G 912 888 G 911 889 G 0 890 A 0 891 G 0 892 U 0 893 A 0 894 C 0 895 G 906 896 G 905 897 C 904 898 C 903 899 G 0 900 C 0 901 A 0 902 A 0 903 G 898 904 G 897 905 U 896 906 U 895 907 A 0 908 A 0 909 A 0 910 A 0 911 C 888 912 U 887 913 C 886 914 A 0 915 A 0 916 A 0 917 U 19 918 G 18 919 A 17 920 A 0 921 U 0 922 U 1398 923 G 1397 924 A 1395 925 C 1394 926 G 1393 927 G 0 928 G 1392 929 G 1391 930 G 1390 931 C 1389 932 C 1388 933 C 1387 934 G 1386 935 C 0 936 A 1382 937 C 1381 938 A 0 939 A 0 940 G 1346 941 C 1345 942 G 1344 943 G 1343 944 U 1342 945 G 1239 946 G 1238 947 A 1237 948 G 1236 949 C 1235 950 A 1234 951 U 1233 952 G 1232 953 U 1231 954 G 1230 955 G 1228 956 U 1227 957 U 0 958 U 0 959 A 0 960 A 0 961 U 976 962 U 975 963 C 974 964 G 973 965 A 0 966 U 0 967 G 0 968 C 0 969 A 0 970 A 0 971 C 0 972 G 0 973 C 964 974 G 963 975 A 962 976 A 961 977 G 0 978 A 0 979 A 0 980 C 0 981 C 0 982 U 0 983 U 0 984 A 0 985 C 1223 986 C 1222 987 U 1221 988 G 1220 989 G 1219 990 C 1218 991 C 1217 992 U 0 993 U 0 994 G 0 995 A 0 996 C 0 997 A 1046 998 U 1045 999 G 1044 1000 U 1042 1001 C 1041 1002 U 1040 1003 G 1039 1004 G 1038 1005 A 0 1006 A 0 1007 U 1024 1008 C 1023 1009 C 1022 1010 U 1021 1011 G 1020 1012 C 1019 1013 A 1018 1014 G 0 1015 A 0 1016 G 0 1017 A 0 1018 U 1013 1019 G 1012 1020 C 1011 1021 G 1010 1022 G 1009 1023 G 1008 1024 A 1007 1025 G 0 1026 U 1037 1027 G 1036 1028 C 1035 1029 C 1034 1030 U 0 1031 U 0 1032 C 0 1033 G 0 1034 G 1029 1035 G 1028 1036 A 1027 1037 A 1026 1038 U 1004 1039 C 1003 1040 A 1002 1041 G 1001 1042 A 1000 1043 A 0 1044 C 999 1045 A 998 1046 C 997 1047 A 0 1048 G 1212 1049 G 1211 1050 U 0 1051 G 1210 1052 C 1209 1053 U 1208 1054 G 1207 1055 C 0 1056 A 0 1057 U 1206 1058 G 1205 1059 G 1201 1060 C 1200 1061 U 1199 1062 G 1197 1063 U 1196 1064 C 1195 1065 G 1194 1066 U 0 1067 C 0 1068 A 0 1069 G 1108 1070 C 1107 1071 U 1106 1072 C 1105 1073 G 1104 1074 U 1103 1075 G 1084 1076 U 1083 1077 C 1082 1078 G 0 1079 U 0 1080 G 0 1081 A 0 1082 G 1077 1083 A 1076 1084 U 1075 1085 G 0 1086 U 0 1087 U 1100 1088 G 1099 1089 G 1098 1090 G 1097 1091 U 0 1092 U 0 1093 A 0 1094 A 0 1095 G 0 1096 U 0 1097 C 1090 1098 C 1089 1099 C 1088 1100 G 1087 1101 C 0 1102 A 0 1103 A 1074 1104 C 1073 1105 G 1072 1106 A 1071 1107 G 1070 1108 C 1069 1109 G 0 1110 C 0 1111 A 0 1112 A 0 1113 C 0 1114 C 1189 1115 C 1188 1116 C 1187 1117 U 1186 1118 G 0 1119 U 1157 1120 C 1156 1121 C 1155 1122 U 1154 1123 U 1153 1124 U 1152 1125 G 1151 1126 U 0 1127 U 0 1128 G 0 1129 C 1146 1130 C 1145 1131 A 0 1132 G 0 1133 C 1144 1134 A 1143 1135 C 1142 1136 G 0 1137 U 0 1138 A 0 1139 A 0 1140 U 0 1141 G 0 1142 G 1135 1143 U 1134 1144 G 1133 1145 G 1130 1146 G 1129 1147 A 0 1148 A 0 1149 C 0 1150 U 0 1151 C 1125 1152 A 1124 1153 A 1123 1154 G 1122 1155 G 1121 1156 G 1120 1157 A 1119 1158 G 0 1159 A 0 1160 C 1180 1161 U 1179 1162 G 1178 1163 C 1177 1164 C 1176 1165 G 1175 1166 G 1174 1167 U 1173 1168 G 0 1169 A 0 1170 U 0 1171 A 0 1172 A 0 1173 A 1167 1174 C 1166 1175 C 1165 1176 G 1164 1177 G 1163 1178 A 1162 1179 G 1161 1180 G 1160 1181 A 0 1182 A 0 1183 G 0 1184 G 0 1185 U 0 1186 G 1117 1187 G 1116 1188 G 1115 1189 G 1114 1190 A 0 1191 U 0 1192 G 0 1193 A 0 1194 C 1065 1195 G 1064 1196 U 1063 1197 C 1062 1198 A 0 1199 A 1061 1200 G 1060 1201 U 1059 1202 C 0 1203 A 0 1204 U 0 1205 C 1058 1206 A 1057 1207 U 1054 1208 G 1053 1209 G 1052 1210 C 1051 1211 C 1049 1212 C 1048 1213 U 0 1214 U 0 1215 A 0 1216 C 0 1217 G 991 1218 G 990 1219 C 989 1220 C 988 1221 A 987 1222 G 986 1223 G 985 1224 G 0 1225 C 0 1226 U 0 1227 A 956 1228 C 955 1229 A 0 1230 C 954 1231 A 953 1232 C 952 1233 G 951 1234 U 950 1235 G 949 1236 C 948 1237 U 947 1238 A 946 1239 C 945 1240 A 0 1241 A 0 1242 U 0 1243 G 1298 1244 G 1297 1245 C 1296 1246 G 1295 1247 C 1294 1248 G 1293 1249 U 1292 1250 A 0 1251 C 0 1252 A 0 1253 G 0 1254 A 0 1255 G 1286 1256 G 1285 1257 G 1284 1258 C 0 1259 U 0 1260 G 1279 1261 C 1278 1262 A 0 1263 A 0 1264 G 0 1265 C 1274 1266 U 1273 1267 A 1272 1268 G 0 1269 C 0 1270 G 0 1271 A 0 1272 U 1267 1273 A 1266 1274 G 1265 1275 U 0 1276 G 0 1277 A 0 1278 G 1261 1279 C 1260 1280 G 0 1281 A 0 1282 A 0 1283 U 0 1284 C 1257 1285 C 1256 1286 C 1255 1287 A 0 1288 A 0 1289 A 0 1290 A 0 1291 A 0 1292 G 1249 1293 C 1248 1294 G 1247 1295 C 1246 1296 G 1245 1297 U 1244 1298 C 1243 1299 G 0 1300 U 0 1301 A 0 1302 G 0 1303 U 0 1304 C 0 1305 C 1336 1306 G 0 1307 G 0 1308 A 0 1309 U 1332 1310 C 1331 1311 G 1330 1312 G 1329 1313 A 1328 1314 G 1327 1315 U 1326 1316 C 1325 1317 U 0 1318 G 0 1319 C 0 1320 A 0 1321 A 0 1322 C 0 1323 U 0 1324 C 0 1325 G 1316 1326 A 1315 1327 C 1314 1328 U 1313 1329 C 1312 1330 C 1311 1331 G 1310 1332 U 1309 1333 G 0 1334 A 0 1335 A 0 1336 G 1305 1337 U 0 1338 C 0 1339 G 0 1340 G 0 1341 A 0 1342 A 944 1343 U 943 1344 C 942 1345 G 941 1346 C 940 1347 U 0 1348 A 0 1349 G 0 1350 U 0 1351 A 0 1352 A 1374 1353 U 1373 1354 C 1372 1355 G 1371 1356 C 1370 1357 G 1369 1358 A 1368 1359 A 1367 1360 U 0 1361 C 0 1362 A 0 1363 G 0 1364 A 0 1365 A 0 1366 U 0 1367 G 1359 1368 U 1358 1369 C 1357 1370 G 1356 1371 C 1355 1372 G 1354 1373 G 1353 1374 U 1352 1375 G 0 1376 A 0 1377 A 0 1378 U 0 1379 A 0 1380 C 0 1381 G 937 1382 U 936 1383 U 0 1384 C 0 1385 C 0 1386 C 934 1387 G 933 1388 G 932 1389 G 931 1390 C 930 1391 C 929 1392 U 928 1393 U 926 1394 G 925 1395 U 924 1396 A 0 1397 C 923 1398 A 922 1399 C 0 1400 A 0 1401 C 1506 1402 C 0 1403 G 1503 1404 C 1502 1405 C 0 1406 C 1499 1407 G 1498 1408 U 0 1409 C 0 1410 A 0 1411 C 1493 1412 A 1492 1413 C 1491 1414 C 1490 1415 A 1489 1416 U 1488 1417 G 1487 1418 G 1486 1419 G 0 1420 A 0 1421 G 1483 1422 U 1482 1423 G 1481 1424 G 1480 1425 G 1479 1426 U 1478 1427 U 1477 1428 G 1476 1429 C 1475 1430 A 1474 1431 C 1473 1432 C 1472 1433 A 0 1434 G 0 1435 A 0 1436 A 0 1437 G 1468 1438 U 1467 1439 A 1466 1440 G 1465 1441 A 1464 1442 U 1463 1443 A 0 1444 G 1462 1445 C 1461 1446 U 1460 1447 U 1459 1448 A 0 1449 A 0 1450 C 1457 1451 C 1456 1452 U 0 1453 U 0 1454 C 0 1455 G 0 1456 G 1451 1457 G 1450 1458 A 0 1459 G 1447 1460 G 1446 1461 G 1445 1462 C 1444 1463 G 1442 1464 U 1441 1465 U 1440 1466 U 1439 1467 A 1438 1468 C 1437 1469 C 0 1470 A 0 1471 C 0 1472 G 1432 1473 G 1431 1474 U 1430 1475 G 1429 1476 U 1428 1477 G 1427 1478 A 1426 1479 U 1425 1480 U 1424 1481 C 1423 1482 A 1422 1483 U 1421 1484 G 0 1485 A 0 1486 C 1418 1487 U 1417 1488 G 1416 1489 G 1415 1490 G 1414 1491 G 1413 1492 U 1412 1493 G 1411 1494 A 0 1495 A 0 1496 G 0 1497 U 0 1498 C 1407 1499 G 1406 1500 U 0 1501 A 0 1502 A 1404 1503 C 1403 1504 A 0 1505 A 0 1506 G 1401 1507 G 0 1508 U 1531 1509 A 1530 1510 A 1529 1511 N 1528 1512 N 1527 1513 N 1526 1514 N 1525 1515 N 1524 1516 N 1523 1517 N 1522 1518 N 0 1519 N 0 1520 N 0 1521 N 0 1522 N 1517 1523 N 1516 1524 N 1515 1525 N 1514 1526 N 1513 1527 N 1512 1528 N 1511 1529 N 1510 1530 N 1509 1531 N 1508 1532 N 0 1533 N 0 1534 N 0 1535 N 0 1536 N 0 1537 N 0 1538 N 0 1539 N 0 1540 N 0 1541 N 0 1542 N 0 1543 N 0 1544 N 0