Filename: d.16.b.A.vinosum.bpseq Organism: Allochromatium vinosum Accession Number: M26629 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 A 0 4 C 0 5 U 0 6 G 0 7 A 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 904 18 C 903 19 C 902 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 541 28 A 540 29 U 539 30 U 538 31 G 0 32 A 537 33 A 536 34 C 535 35 G 534 36 C 533 37 U 532 38 G 0 39 G 388 40 C 387 41 G 386 42 G 385 43 C 384 44 A 383 45 U 381 46 G 380 47 C 346 48 C 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 344 53 A 343 54 C 342 55 A 0 56 U 341 57 G 340 58 C 339 59 A 0 60 A 0 61 G 97 62 U 96 63 C 95 64 G 0 65 A 0 66 A 94 67 C 93 68 G 92 69 C 91 70 G 0 71 A 0 72 A 0 73 A 0 74 G 85 75 G 84 76 G 83 77 C 82 78 U 0 79 U 0 80 C 0 81 G 0 82 G 77 83 C 76 84 C 75 85 U 74 86 G 0 87 A 0 88 G 0 89 U 0 90 A 0 91 G 69 92 A 68 93 G 67 94 U 66 95 G 63 96 G 62 97 C 61 98 G 0 99 G 0 100 A 0 101 C 0 102 G 0 103 G 0 104 G 299 105 U 298 106 G 297 107 A 0 108 G 0 109 U 0 110 A 0 111 A 0 112 C 0 113 G 224 114 C 223 115 A 222 116 U 221 117 G 220 118 G 219 119 G 218 120 A 217 121 A 0 122 U 216 123 C 215 124 U 0 125 G 0 126 C 0 127 C 212 128 U 211 129 G 210 130 G 209 131 C 208 132 A 207 133 G 206 134 A 0 135 G 169 136 G 168 137 G 167 138 G 166 139 G 0 140 A 0 141 U 0 142 A 0 143 A 160 144 C 159 145 C 158 146 C 157 147 G 156 148 G 155 149 G 154 150 G 0 151 A 0 152 A 0 153 A 0 154 C 149 155 U 148 156 C 147 157 G 146 158 G 145 159 G 144 160 C 143 161 U 0 162 A 0 163 A 0 164 U 0 165 A 0 166 C 138 167 C 137 168 G 136 169 C 135 170 A 0 171 U 0 172 A 0 173 C 0 174 G 0 175 C 184 176 C 183 177 C 182 178 U 0 179 A 0 180 C 0 181 G 0 182 G 177 183 G 176 184 G 175 185 G 0 186 A 0 187 A 0 188 A 0 189 G 204 190 G 203 191 G 202 192 G 201 193 G 200 194 C 199 195 U 0 196 U 0 197 C 0 198 G 0 199 G 194 200 C 193 201 U 192 202 C 191 203 U 190 204 C 189 205 G 0 206 U 133 207 U 132 208 G 131 209 C 130 210 C 129 211 A 128 212 G 127 213 A 0 214 U 0 215 G 123 216 A 122 217 G 120 218 C 119 219 C 118 220 C 117 221 A 116 222 U 115 223 G 114 224 U 113 225 C 271 226 C 270 227 G 269 228 A 0 229 U 0 230 U 268 231 A 0 232 G 262 233 C 261 234 U 260 235 A 0 236 G 0 237 U 259 238 U 258 239 G 257 240 G 256 241 C 255 242 G 254 243 G 253 244 G 252 245 G 0 246 U 0 247 A 0 248 A 0 249 A 0 250 G 0 251 G 0 252 C 244 253 C 243 254 C 242 255 A 241 256 C 240 257 C 239 258 A 238 259 A 237 260 G 234 261 G 233 262 C 232 263 G 0 264 A 0 265 C 0 266 G 0 267 A 0 268 U 230 269 C 227 270 G 226 271 G 225 272 U 0 273 A 0 274 G 296 275 C 295 276 U 294 277 N 293 278 G 289 279 U 288 280 C 287 281 U 286 282 G 0 283 A 0 284 G 0 285 A 0 286 G 281 287 G 280 288 A 279 289 U 278 290 G 0 291 A 0 292 C 0 293 C 277 294 A 276 295 G 275 296 C 274 297 C 106 298 A 105 299 C 104 300 A 0 301 C 322 302 U 321 303 G 320 304 G 319 305 G 318 306 A 317 307 C 0 308 U 0 309 G 0 310 A 0 311 G 0 312 A 0 313 C 0 314 A 0 315 C 0 316 G 0 317 G 306 318 C 305 319 C 304 320 C 303 321 A 302 322 G 301 323 A 0 324 C 335 325 U 334 326 C 333 327 C 332 328 U 0 329 A 0 330 C 0 331 G 0 332 G 327 333 G 326 334 A 325 335 G 324 336 G 0 337 C 0 338 A 0 339 G 58 340 C 57 341 A 56 342 G 54 343 U 53 344 G 52 345 G 0 346 G 47 347 G 0 348 A 0 349 A 0 350 U 0 351 A 0 352 U 378 353 U 0 354 G 377 355 G 376 356 A 375 357 C 0 358 A 0 359 A 0 360 U 373 361 G 372 362 G 371 363 G 370 364 G 369 365 G 0 366 A 0 367 A 0 368 A 0 369 C 364 370 C 363 371 C 362 372 U 361 373 G 360 374 A 0 375 U 356 376 C 355 377 C 354 378 A 352 379 G 0 380 C 46 381 A 45 382 A 0 383 U 44 384 G 43 385 C 42 386 C 41 387 G 40 388 C 39 389 G 0 390 U 0 391 G 421 392 G 420 393 G 419 394 U 418 395 G 0 396 A 0 397 A 0 398 G 0 399 A 0 400 C 0 401 G 412 402 G 411 403 C 410 404 C 409 405 U 0 406 G 0 407 C 0 408 G 0 409 G 404 410 G 403 411 U 402 412 U 401 413 G 0 414 U 0 415 A 0 416 A 0 417 A 0 418 G 394 419 C 393 420 C 392 421 C 391 422 U 0 423 U 481 424 U 0 425 C 482 426 G 478 427 G 477 428 U 476 429 G 475 430 G 474 431 G 473 432 A 0 433 A 0 434 A 0 435 G 468 436 A 0 437 A 0 438 A 0 439 A 0 440 G 462 441 C 461 442 A 460 443 C 459 444 G 458 445 G 457 446 G 456 447 G 455 448 C 0 449 U 0 450 A 0 451 A 0 452 U 0 453 A 0 454 C 0 455 C 447 456 U 446 457 C 445 458 C 444 459 G 443 460 U 442 461 G 441 462 U 440 463 A 0 464 U 0 465 U 0 466 G 0 467 A 0 468 C 435 469 G 0 470 U 0 471 U 0 472 A 0 473 C 431 474 C 430 475 C 429 476 A 428 477 C 427 478 A 426 479 G 0 480 A 0 481 A 423 482 G 425 483 A 0 484 A 0 485 G 530 486 C 529 487 A 528 488 C 527 489 C 526 490 G 511 491 G 510 492 C 509 493 U 0 494 A 0 495 A 0 496 C 525 497 U 524 498 C 523 499 C 522 500 G 521 501 U 0 502 G 0 503 C 0 504 C 0 505 A 0 506 G 513 507 C 512 508 A 0 509 G 492 510 C 491 511 C 490 512 G 507 513 C 506 514 G 0 515 G 0 516 U 0 517 A 0 518 A 0 519 U 0 520 A 0 521 C 500 522 G 499 523 G 498 524 A 497 525 G 496 526 N 489 527 G 488 528 U 487 529 G 486 530 C 485 531 A 0 532 A 37 533 G 36 534 C 35 535 G 34 536 U 33 537 U 32 538 A 30 539 A 29 540 U 28 541 C 27 542 G 0 543 G 0 544 A 0 545 A 0 546 U 0 547 C 0 548 A 0 549 C 0 550 U 0 551 G 0 552 G 869 553 G 868 554 C 867 555 G 852 556 U 851 557 A 0 558 A 0 559 A 0 560 G 866 561 C 0 562 G 749 563 C 748 564 A 747 565 C 746 566 G 0 567 U 743 568 A 0 569 G 742 570 G 741 571 C 740 572 G 0 573 G 636 574 C 635 575 A 634 576 C 633 577 G 632 578 G 631 579 U 630 580 C 0 581 A 629 582 G 628 583 U 625 584 C 624 585 U 623 586 G 622 587 C 621 588 U 620 589 G 619 590 U 618 591 G 617 592 A 0 593 A 0 594 A 0 595 G 0 596 C 614 597 C 613 598 C 612 599 C 611 600 G 610 601 G 609 602 G 608 603 C 0 604 U 0 605 C 0 606 A 0 607 A 0 608 C 602 609 C 601 610 U 600 611 G 599 612 G 598 613 G 597 614 A 596 615 A 0 616 C 0 617 U 591 618 G 590 619 C 589 620 A 588 621 G 587 622 U 586 623 G 585 624 G 584 625 A 583 626 U 0 627 A 0 628 C 582 629 U 581 630 G 579 631 C 578 632 C 577 633 G 576 634 C 575 635 G 574 636 C 573 637 U 0 638 A 0 639 G 0 640 A 736 641 G 735 642 U 734 643 G 733 644 U 731 645 G 730 646 A 729 647 A 728 648 A 727 649 G 0 650 A 0 651 G 725 652 G 724 653 G 723 654 G 722 655 G 721 656 G 720 657 U 719 658 G 702 659 G 701 660 A 0 661 A 0 662 U 698 663 U 697 664 C 696 665 C 695 666 A 694 667 G 693 668 G 692 669 U 691 670 G 0 671 U 0 672 A 0 673 G 684 674 C 683 675 G 682 676 G 0 677 U 0 678 G 0 679 A 0 680 A 0 681 A 0 682 U 675 683 G 674 684 C 673 685 G 0 686 U 0 687 A 0 688 G 0 689 A 0 690 G 0 691 A 669 692 U 668 693 C 667 694 U 666 695 G 665 696 G 664 697 A 663 698 G 662 699 G 0 700 A 0 701 A 659 702 C 658 703 A 0 704 C 0 705 C 0 706 A 0 707 G 718 708 U 0 709 G 0 710 G 717 711 C 716 712 G 0 713 A 0 714 A 0 715 G 0 716 G 711 717 C 710 718 G 707 719 G 657 720 C 656 721 C 655 722 C 654 723 C 653 724 C 652 725 U 651 726 G 0 727 G 648 728 U 647 729 U 646 730 C 645 731 A 644 732 A 0 733 C 643 734 A 642 735 C 641 736 U 640 737 G 0 738 A 0 739 C 0 740 G 571 741 C 570 742 U 569 743 G 567 744 A 0 745 G 0 746 G 565 747 U 564 748 G 563 749 C 562 750 N 0 751 A 0 752 A 0 753 A 0 754 G 795 755 C 794 756 G 793 757 U 792 758 G 791 759 G 790 760 G 0 761 G 0 762 A 0 763 G 789 764 C 788 765 A 0 766 A 0 767 A 0 768 C 784 769 A 783 770 G 782 771 G 781 772 A 0 773 U 0 774 U 0 775 A 0 776 G 0 777 A 0 778 U 0 779 A 0 780 C 0 781 C 771 782 C 770 783 U 769 784 G 768 785 G 0 786 U 0 787 A 0 788 G 764 789 U 763 790 C 759 791 C 758 792 A 757 793 C 756 794 G 755 795 C 754 796 U 0 797 G 0 798 U 0 799 A 0 800 A 0 801 A 0 802 C 0 803 G 0 804 C 0 805 U 0 806 G 865 807 U 864 808 C 863 809 G 862 810 A 861 811 C 860 812 U 0 813 A 0 814 G 843 815 C 842 816 C 841 817 G 840 818 U 839 819 U 838 820 U 837 821 G 836 822 G 835 823 U 834 824 C 833 825 C 832 826 A 0 827 U 0 828 U 0 829 U 0 830 A 0 831 A 0 832 G 825 833 G 824 834 G 823 835 C 822 836 U 821 837 G 820 838 A 819 839 G 818 840 U 817 841 G 816 842 G 815 843 C 814 844 G 0 845 C 0 846 A 0 847 G 854 848 C 853 849 U 0 850 A 0 851 A 556 852 C 555 853 G 848 854 C 847 855 G 0 856 C 0 857 U 0 858 A 0 859 A 0 860 G 811 861 U 810 862 C 809 863 G 808 864 A 807 865 C 806 866 C 560 867 G 554 868 C 553 869 C 552 870 U 0 871 G 898 872 G 897 873 G 896 874 G 0 875 A 0 876 G 0 877 U 0 878 A 0 879 C 0 880 G 891 881 G 890 882 C 889 883 C 888 884 G 0 885 C 0 886 A 0 887 A 0 888 G 883 889 G 882 890 U 881 891 U 880 892 A 0 893 A 0 894 A 0 895 A 0 896 C 873 897 U 872 898 C 871 899 A 0 900 A 0 901 A 0 902 G 19 903 G 18 904 A 17 905 A 0 906 U 0 907 U 1382 908 G 1381 909 A 1379 910 C 1378 911 G 1377 912 G 0 913 G 1376 914 G 1375 915 N 1374 916 N 1373 917 N 1372 918 N 1371 919 G 1370 920 C 0 921 A 1366 922 C 1365 923 A 0 924 A 0 925 G 1330 926 C 1329 927 G 1328 928 G 1327 929 U 1326 930 G 1223 931 G 1222 932 A 1221 933 G 1220 934 C 1219 935 A 1218 936 U 1217 937 G 1216 938 U 1215 939 G 1214 940 G 1212 941 U 1211 942 U 0 943 U 0 944 A 0 945 A 0 946 U 961 947 U 960 948 C 959 949 G 958 950 A 0 951 U 0 952 G 0 953 C 0 954 A 0 955 A 0 956 C 0 957 G 0 958 C 949 959 G 948 960 A 947 961 A 946 962 G 0 963 A 0 964 A 0 965 C 0 966 C 0 967 U 0 968 U 0 969 A 0 970 C 1207 971 C 1206 972 A 1205 973 G 1204 974 C 1203 975 C 1202 976 C 1201 977 U 0 978 U 0 979 G 0 980 A 0 981 C 0 982 A 1031 983 U 1030 984 C 1029 985 C 1027 986 U 1026 987 C 1025 988 G 1024 989 G 1023 990 A 0 991 A 0 992 C 1009 993 U 1008 994 U 1007 995 G 1006 996 G 1005 997 C 1004 998 A 1003 999 G 0 1000 A 0 1001 G 0 1002 A 0 1003 U 998 1004 G 997 1005 C 996 1006 C 995 1007 U 994 1008 U 993 1009 G 992 1010 G 0 1011 U 1022 1012 G 1021 1013 C 1020 1014 C 1019 1015 U 0 1016 U 0 1017 C 0 1018 G 0 1019 G 1014 1020 G 1013 1021 A 1012 1022 G 1011 1023 C 989 1024 C 988 1025 G 987 1026 A 986 1027 G 985 1028 A 0 1029 G 984 1030 A 983 1031 C 982 1032 A 0 1033 G 1196 1034 G 1195 1035 U 0 1036 G 1194 1037 C 1193 1038 U 1192 1039 G 1191 1040 C 0 1041 A 0 1042 U 1190 1043 G 1189 1044 G 1185 1045 C 1184 1046 U 1183 1047 G 1181 1048 U 1180 1049 C 1179 1050 G 1178 1051 U 0 1052 C 0 1053 A 0 1054 G 1093 1055 C 1092 1056 U 1091 1057 C 1090 1058 G 1089 1059 U 1088 1060 G 1069 1061 U 1068 1062 C 1067 1063 G 0 1064 U 0 1065 G 0 1066 A 0 1067 G 1062 1068 A 1061 1069 U 1060 1070 G 0 1071 U 0 1072 U 1085 1073 G 1084 1074 G 1083 1075 G 1082 1076 U 0 1077 U 0 1078 A 0 1079 A 0 1080 G 0 1081 U 0 1082 C 1075 1083 C 1074 1084 C 1073 1085 G 1072 1086 U 0 1087 A 0 1088 A 1059 1089 C 1058 1090 G 1057 1091 A 1056 1092 G 1055 1093 C 1054 1094 G 0 1095 C 0 1096 A 0 1097 A 0 1098 C 0 1099 C 1173 1100 C 1172 1101 U 1171 1102 U 1170 1103 G 0 1104 U 1141 1105 C 1140 1106 C 1139 1107 C 1138 1108 U 1137 1109 A 1136 1110 G 1135 1111 U 0 1112 U 0 1113 G 0 1114 C 1130 1115 C 1129 1116 A 0 1117 G 0 1118 C 1128 1119 A 1127 1120 C 1126 1121 U 0 1122 U 0 1123 C 0 1124 G 0 1125 G 0 1126 G 1120 1127 U 1119 1128 G 1118 1129 G 1115 1130 G 1114 1131 A 0 1132 A 0 1133 C 0 1134 U 0 1135 C 1110 1136 U 1109 1137 A 1108 1138 G 1107 1139 G 1106 1140 G 1105 1141 A 1104 1142 G 0 1143 A 0 1144 C 1164 1145 U 1163 1146 G 1162 1147 C 1161 1148 C 1160 1149 G 1159 1150 G 1158 1151 U 1157 1152 G 0 1153 A 0 1154 U 0 1155 A 0 1156 A 0 1157 A 1151 1158 C 1150 1159 C 1149 1160 G 1148 1161 G 1147 1162 A 1146 1163 G 1145 1164 G 1144 1165 A 0 1166 A 0 1167 G 0 1168 G 0 1169 U 0 1170 G 1102 1171 G 1101 1172 G 1100 1173 G 1099 1174 A 0 1175 U 0 1176 G 0 1177 A 0 1178 C 1050 1179 G 1049 1180 U 1048 1181 C 1047 1182 A 0 1183 A 1046 1184 G 1045 1185 U 1044 1186 C 0 1187 A 0 1188 U 0 1189 C 1043 1190 A 1042 1191 U 1039 1192 G 1038 1193 G 1037 1194 C 1036 1195 C 1034 1196 C 1033 1197 U 0 1198 U 0 1199 A 0 1200 U 0 1201 G 976 1202 G 975 1203 G 974 1204 C 973 1205 U 972 1206 G 971 1207 G 970 1208 G 0 1209 C 0 1210 U 0 1211 A 941 1212 C 940 1213 A 0 1214 C 939 1215 A 938 1216 C 937 1217 G 936 1218 U 935 1219 G 934 1220 C 933 1221 U 932 1222 A 931 1223 C 930 1224 A 0 1225 A 0 1226 U 0 1227 G 1282 1228 G 1281 1229 U 1280 1230 C 1279 1231 G 1278 1232 G 1277 1233 U 1276 1234 A 0 1235 C 0 1236 A 0 1237 G 0 1238 A 0 1239 G 1270 1240 C 1269 1241 G 1268 1242 U 0 1243 C 0 1244 G 1263 1245 C 1262 1246 G 0 1247 A 0 1248 A 0 1249 G 1258 1250 C 1257 1251 C 1256 1252 G 0 1253 C 0 1254 G 0 1255 A 0 1256 G 1251 1257 G 1250 1258 U 1249 1259 G 0 1260 G 0 1261 A 0 1262 G 1245 1263 C 1244 1264 C 0 1265 A 0 1266 A 0 1267 U 0 1268 C 1241 1269 G 1240 1270 C 1239 1271 A 0 1272 C 0 1273 A 0 1274 A 0 1275 A 0 1276 A 1233 1277 C 1232 1278 C 1231 1279 G 1230 1280 A 1229 1281 U 1228 1282 C 1227 1283 G 0 1284 U 0 1285 A 0 1286 G 0 1287 U 0 1288 C 0 1289 C 1320 1290 G 0 1291 G 0 1292 A 0 1293 U 1316 1294 C 1315 1295 G 1314 1296 C 1313 1297 A 1312 1298 G 1311 1299 U 1310 1300 C 1309 1301 U 0 1302 G 0 1303 C 0 1304 A 0 1305 A 0 1306 C 0 1307 U 0 1308 C 0 1309 G 1300 1310 A 1299 1311 C 1298 1312 U 1297 1313 G 1296 1314 C 1295 1315 G 1294 1316 U 1293 1317 G 0 1318 A 0 1319 A 0 1320 G 1289 1321 U 0 1322 C 0 1323 G 0 1324 G 0 1325 A 0 1326 A 929 1327 U 928 1328 C 927 1329 G 926 1330 C 925 1331 U 0 1332 A 0 1333 G 0 1334 U 0 1335 A 0 1336 A 1358 1337 U 1357 1338 C 1356 1339 G 1355 1340 C 1354 1341 G 1353 1342 G 1352 1343 A 1351 1344 U 0 1345 C 0 1346 A 0 1347 G 0 1348 C 0 1349 A 0 1350 U 0 1351 G 1343 1352 C 1342 1353 C 1341 1354 G 1340 1355 C 1339 1356 G 1338 1357 G 1337 1358 U 1336 1359 G 0 1360 A 0 1361 A 0 1362 U 0 1363 A 0 1364 C 0 1365 G 922 1366 U 921 1367 U 0 1368 C 0 1369 C 0 1370 C 919 1371 G 918 1372 G 917 1373 G 916 1374 C 915 1375 C 914 1376 U 913 1377 U 911 1378 G 910 1379 U 909 1380 A 0 1381 C 908 1382 A 907 1383 C 0 1384 A 0 1385 C 1490 1386 C 0 1387 G 1487 1388 C 1486 1389 C 0 1390 C 1483 1391 G 1482 1392 U 0 1393 C 0 1394 A 0 1395 C 1477 1396 A 1476 1397 C 1475 1398 C 1474 1399 A 1473 1400 U 1472 1401 G 1471 1402 G 1470 1403 G 0 1404 A 0 1405 G 1467 1406 U 1466 1407 U 1465 1408 G 1464 1409 G 1463 1410 U 1462 1411 U 1461 1412 G 1460 1413 C 1459 1414 A 1458 1415 C 1457 1416 C 1456 1417 A 0 1418 G 0 1419 A 0 1420 A 0 1421 G 1452 1422 U 1451 1423 A 1450 1424 G 1449 1425 A 1448 1426 U 1447 1427 A 0 1428 G 1446 1429 C 1445 1430 U 1444 1431 U 1443 1432 A 0 1433 A 0 1434 C 1441 1435 C 1440 1436 U 0 1437 U 0 1438 C 0 1439 G 0 1440 G 1435 1441 G 1434 1442 A 0 1443 G 1431 1444 G 1430 1445 G 1429 1446 C 1428 1447 G 1426 1448 U 1425 1449 U 1424 1450 U 1423 1451 A 1422 1452 C 1421 1453 C 0 1454 A 0 1455 C 0 1456 G 1416 1457 G 1415 1458 U 1414 1459 G 1413 1460 U 1412 1461 G 1411 1462 G 1410 1463 U 1409 1464 C 1408 1465 A 1407 1466 A 1406 1467 U 1405 1468 G 0 1469 A 0 1470 C 1402 1471 N 1401 1472 N 1400 1473 G 1399 1474 G 1398 1475 G 1397 1476 N 1396 1477 N 1395 1478 N 0 1479 N 0 1480 N 0 1481 N 0 1482 N 1391 1483 G 1390 1484 U 0 1485 A 0 1486 A 1388 1487 C 1387 1488 A 0 1489 A 0 1490 G 1385 1491 N 0 1492 N 1515 1493 N 1514 1494 N 1513 1495 N 1512 1496 N 1511 1497 N 1510 1498 N 1509 1499 N 1508 1500 N 1507 1501 N 1506 1502 N 0 1503 N 0 1504 N 0 1505 N 0 1506 N 1501 1507 N 1500 1508 N 1499 1509 N 1498 1510 N 1497 1511 N 1496 1512 N 1495 1513 N 1494 1514 N 1493 1515 N 1492 1516 G 0 1517 A 0 1518 U 0 1519 C 0 1520 A 0 1521 C 0 1522 C 0 1523 U 0 1524 C 0 1525 C 0 1526 U 0 1527 N 0 1528 N 0