Filename: d.16.b.B.fragilis.bpseq
Organism: Bacteroides fragilis
Accession Number: M61006
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 A 0
2 C 0
3 U 0
4 U 0
5 U 0
6 U 0
7 A 0
8 C 0
9 A 0
10 A 0
11 U 0
12 G 0
13 A 0
14 A 0
15 G 31
16 A 30
17 G 29
18 U 28
19 U 27
20 U 0
21 G 0
22 A 0
23 U 920
24 C 919
25 C 918
26 U 0
27 G 19
28 G 18
29 C 17
30 U 16
31 C 15
32 A 0
33 G 561
34 G 560
35 A 559
36 U 558
37 G 0
38 A 557
39 A 556
40 C 555
41 G 554
42 C 553
43 U 552
44 A 0
45 G 413
46 C 412
47 U 411
48 A 410
49 C 409
50 A 408
51 G 406
52 G 405
53 C 371
54 U 0
55 U 0
56 A 0
57 A 0
58 C 369
59 A 368
60 C 367
61 A 0
62 U 366
63 G 365
64 C 364
65 A 0
66 A 0
67 G 114
68 U 113
69 C 112
70 G 0
71 A 0
72 G 111
73 G 110
74 G 109
75 G 107
76 C 106
77 A 0
78 U 0
79 C 105
80 A 104
81 G 103
82 G 0
83 A 100
84 A 99
85 G 98
86 A 97
87 A 96
88 A 95
89 G 94
90 C 0
91 U 0
92 U 0
93 G 0
94 C 89
95 U 88
96 U 87
97 U 86
98 C 85
99 U 84
100 U 83
101 U 0
102 G 0
103 C 81
104 U 80
105 G 79
106 G 76
107 C 75
108 G 0
109 A 74
110 C 73
111 C 72
112 G 69
113 G 68
114 C 67
115 G 0
116 C 0
117 A 0
118 C 0
119 G 0
120 G 0
121 G 324
122 U 323
123 G 322
124 A 0
125 G 0
126 U 0
127 A 0
128 A 0
129 C 0
130 A 249
131 C 248
132 G 247
133 U 246
134 A 245
135 U 244
136 C 243
137 C 242
138 A 0
139 A 0
140 C 241
141 C 240
142 U 0
143 G 0
144 C 0
145 C 237
146 C 236
147 U 235
148 U 234
149 U 233
150 A 232
151 C 231
152 U 0
153 C 187
154 G 186
155 G 185
156 G 184
157 G 0
158 A 0
159 U 0
160 A 0
161 G 178
162 C 177
163 C 176
164 U 175
165 U 174
166 U 173
167 C 172
168 G 0
169 A 0
170 A 0
171 A 0
172 G 167
173 A 166
174 A 165
175 A 164
176 G 163
177 A 162
178 U 161
179 U 0
180 A 0
181 A 0
182 U 0
183 A 0
184 C 156
185 C 155
186 C 154
187 G 153
188 A 0
189 U 0
190 A 0
191 G 0
192 C 0
193 A 218
194 U 217
195 A 216
196 A 215
197 U 214
198 G 213
199 A 212
200 U 211
201 U 210
202 C 209
203 C 208
204 G 0
205 C 0
206 A 0
207 U 0
208 G 203
209 G 202
210 U 201
211 U 200
212 U 199
213 C 198
214 A 197
215 U 196
216 U 195
217 A 194
218 U 193
219 U 0
220 A 0
221 A 0
222 A 0
223 G 229
224 G 228
225 A 0
226 U 0
227 U 0
228 C 224
229 C 223
230 G 0
231 G 151
232 U 150
233 A 149
234 A 148
235 A 147
236 G 146
237 G 145
238 A 0
239 U 0
240 G 141
241 G 140
242 G 137
243 G 136
244 A 135
245 U 134
246 G 133
247 C 132
248 G 131
249 U 130
250 U 296
251 C 295
252 C 294
253 A 0
254 U 0
255 U 293
256 A 0
257 G 287
258 G 286
259 U 285
260 N 0
261 G 0
262 U 284
263 U 283
264 G 282
265 G 281
266 U 280
267 G 279
268 A 278
269 G 277
270 G 0
271 U 0
272 A 0
273 A 0
274 C 0
275 G 0
276 G 0
277 C 269
278 U 268
279 C 267
280 A 266
281 C 265
282 C 264
283 A 263
284 A 262
285 G 259
286 C 258
287 C 257
288 U 0
289 U 0
290 C 0
291 G 0
292 A 0
293 U 255
294 G 252
295 G 251
296 A 250
297 U 0
298 A 0
299 G 321
300 G 320
301 G 319
302 G 318
303 U 314
304 U 313
305 C 312
306 U 311
307 G 0
308 A 0
309 G 0
310 A 0
311 G 306
312 G 305
313 A 304
314 A 303
315 G 0
316 G 0
317 U 0
318 C 302
319 C 301
320 C 300
321 C 299
322 C 123
323 A 122
324 C 121
325 A 0
326 U 347
327 U 346
328 G 345
329 G 344
330 A 343
331 A 342
332 C 0
333 U 0
334 G 0
335 A 0
336 G 0
337 A 0
338 C 0
339 A 0
340 C 0
341 G 0
342 G 331
343 U 330
344 C 329
345 C 328
346 A 327
347 A 326
348 A 0
349 C 360
350 U 359
351 C 358
352 C 357
353 U 0
354 A 0
355 C 0
356 G 0
357 G 352
358 G 351
359 A 350
360 G 349
361 G 0
362 C 0
363 A 0
364 G 64
365 C 63
366 A 62
367 G 60
368 U 59
369 G 58
370 A 0
371 G 53
372 G 0
373 A 0
374 A 0
375 U 0
376 A 0
377 U 403
378 U 0
379 G 402
380 G 401
381 U 400
382 C 0
383 A 0
384 A 0
385 U 398
386 G 397
387 G 396
388 G 395
389 C 394
390 G 0
391 C 0
392 U 0
393 A 0
394 G 389
395 C 388
396 C 387
397 U 386
398 G 385
399 A 0
400 A 381
401 C 380
402 C 379
403 A 377
404 G 0
405 C 52
406 C 51
407 A 0
408 A 50
409 G 49
410 U 48
411 A 47
412 G 46
413 C 45
414 G 0
415 U 0
416 G 447
417 A 446
418 A 445
419 G 444
420 G 0
421 A 0
422 U 0
423 G 0
424 A 0
425 A 0
426 G 438
427 G 437
428 C 436
429 U 435
430 C 0
431 U 0
432 A 0
433 U 0
434 G 0
435 G 429
436 G 428
437 U 427
438 C 426
439 G 0
440 U 0
441 A 0
442 A 0
443 A 0
444 C 419
445 U 418
446 U 417
447 C 416
448 U 0
449 U 501
450 U 0
451 U 502
452 A 498
453 U 497
454 A 496
455 U 495
456 A 494
457 A 493
458 G 0
459 A 0
460 A 0
461 U 488
462 A 0
463 A 0
464 A 0
465 G 0
466 U 0
467 G 482
468 C 481
469 A 480
470 G 479
471 U 478
472 A 477
473 U 0
474 G 0
475 U 0
476 A 0
477 U 472
478 A 471
479 C 470
480 U 469
481 G 468
482 U 467
483 U 0
484 U 0
485 U 0
486 G 0
487 U 0
488 A 461
489 U 0
490 G 0
491 U 0
492 A 0
493 U 457
494 U 456
495 A 455
496 U 454
497 A 453
498 U 452
499 G 0
500 A 0
501 A 449
502 U 451
503 A 0
504 A 0
505 G 550
506 G 549
507 A 548
508 U 547
509 C 546
510 G 531
511 G 530
512 C 529
513 U 0
514 A 0
515 A 0
516 C 545
517 U 544
518 C 543
519 C 542
520 G 541
521 U 0
522 G 0
523 C 0
524 C 0
525 A 0
526 G 533
527 C 532
528 A 0
529 G 512
530 C 511
531 C 510
532 G 527
533 C 526
534 G 0
535 G 0
536 U 0
537 A 0
538 A 0
539 U 0
540 A 0
541 C 520
542 G 519
543 G 518
544 A 517
545 G 516
546 G 509
547 A 508
548 U 507
549 C 506
550 C 505
551 G 0
552 A 43
553 G 42
554 C 41
555 G 40
556 U 39
557 U 38
558 A 36
559 U 35
560 C 34
561 C 33
562 G 0
563 G 0
564 A 0
565 U 0
566 U 0
567 U 0
568 A 0
569 U 0
570 U 0
571 G 0
572 G 885
573 G 884
574 U 883
575 U 868
576 U 867
577 A 0
578 A 0
579 A 0
580 G 882
581 G 0
582 G 769
583 A 768
584 G 767
585 C 766
586 G 0
587 U 763
588 A 0
589 G 762
590 G 761
591 U 760
592 G 0
593 G 656
594 A 655
595 C 654
596 U 653
597 G 652
598 G 651
599 U 650
600 A 0
601 A 649
602 G 648
603 U 645
604 C 644
605 A 643
606 G 642
607 U 641
608 U 640
609 G 639
610 U 638
611 G 637
612 A 0
613 A 0
614 A 0
615 G 0
616 U 634
617 U 633
618 U 632
619 G 631
620 C 630
621 G 629
622 G 628
623 C 0
624 U 0
625 C 0
626 A 0
627 A 0
628 C 622
629 C 621
630 G 620
631 U 619
632 A 618
633 A 617
634 A 616
635 A 0
636 U 0
637 U 611
638 G 610
639 C 609
640 A 608
641 G 607
642 C 606
643 U 605
644 G 604
645 A 603
646 U 0
647 A 0
648 C 602
649 U 601
650 G 599
651 U 598
652 C 597
653 A 596
654 G 595
655 U 594
656 C 593
657 U 0
658 U 0
659 G 0
660 A 756
661 G 755
662 U 754
663 A 753
664 C 751
665 A 750
666 G 749
667 U 748
668 A 747
669 G 0
670 A 0
671 G 745
672 G 744
673 U 743
674 G 742
675 G 741
676 G 740
677 C 739
678 G 722
679 G 721
680 A 0
681 A 0
682 U 718
683 U 717
684 C 716
685 G 715
686 U 714
687 G 713
688 G 712
689 U 711
690 G 0
691 U 0
692 A 0
693 G 704
694 C 703
695 G 702
696 G 0
697 U 0
698 G 0
699 A 0
700 A 0
701 A 0
702 U 695
703 G 694
704 C 693
705 U 0
706 U 0
707 A 0
708 G 0
709 A 0
710 U 0
711 A 689
712 U 688
713 C 687
714 A 686
715 C 685
716 G 684
717 A 683
718 A 682
719 G 0
720 A 0
721 A 679
722 C 678
723 U 0
724 C 0
725 C 0
726 G 0
727 A 738
728 U 0
729 U 0
730 G 737
731 C 736
732 G 0
733 A 0
734 A 0
735 G 0
736 G 731
737 C 730
738 A 727
739 G 677
740 C 676
741 U 675
742 C 674
743 A 673
744 C 672
745 U 671
746 G 0
747 G 668
748 A 667
749 C 666
750 U 665
751 G 664
752 C 0
753 A 663
754 A 662
755 C 661
756 U 660
757 G 0
758 A 0
759 C 0
760 A 591
761 C 590
762 U 589
763 G 587
764 A 0
765 U 0
766 G 585
767 C 584
768 U 583
769 C 582
770 G 0
771 A 0
772 A 0
773 A 0
774 G 815
775 U 814
776 G 813
777 U 812
778 G 811
779 G 810
780 G 0
781 U 0
782 A 0
783 U 809
784 C 808
785 A 0
786 A 0
787 A 0
788 C 804
789 A 803
790 G 802
791 G 801
792 A 0
793 U 0
794 U 0
795 A 0
796 G 0
797 A 0
798 U 0
799 A 0
800 C 0
801 C 791
802 C 790
803 U 789
804 G 788
805 G 0
806 U 0
807 A 0
808 G 784
809 U 783
810 C 779
811 C 778
812 A 777
813 C 776
814 A 775
815 C 774
816 A 0
817 G 0
818 U 0
819 A 0
820 A 0
821 A 0
822 C 0
823 G 0
824 A 0
825 U 0
826 G 881
827 A 880
828 A 879
829 U 878
830 A 877
831 C 876
832 U 0
833 C 0
834 G 859
835 C 858
836 U 857
837 G 856
838 U 855
839 U 854
840 U 853
841 G 852
842 C 851
843 G 850
844 A 0
845 U 0
846 A 0
847 U 0
848 A 0
849 C 0
850 A 843
851 G 842
852 U 841
853 A 840
854 A 839
855 G 838
856 C 837
857 G 836
858 G 835
859 C 834
860 C 0
861 A 0
862 A 0
863 G 870
864 C 869
865 G 0
866 A 0
867 A 576
868 A 575
869 G 864
870 C 863
871 A 0
872 U 0
873 U 0
874 A 0
875 A 0
876 G 831
877 U 830
878 A 829
879 U 828
880 U 827
881 C 826
882 C 580
883 A 574
884 C 573
885 C 572
886 U 0
887 G 914
888 G 913
889 G 912
890 G 0
891 A 0
892 G 0
893 U 0
894 A 0
895 C 0
896 G 907
897 C 906
898 C 905
899 G 904
900 G 0
901 C 0
902 A 0
903 A 0
904 C 899
905 G 898
906 G 897
907 U 896
908 G 0
909 A 0
910 A 0
911 A 0
912 C 889
913 U 888
914 C 887
915 A 0
916 A 0
917 A 0
918 G 25
919 G 24
920 A 23
921 A 0
922 U 0
923 U 1398
924 G 1397
925 A 1395
926 C 1394
927 G 1393
928 G 0
929 G 1392
930 G 1391
931 G 1390
932 C 1389
933 C 1388
934 C 1387
935 G 1386
936 C 0
937 A 1382
938 C 1381
939 A 0
940 A 0
941 G 1345
942 C 1344
943 G 1343
944 G 1342
945 A 1341
946 G 1239
947 G 1238
948 A 1237
949 A 1236
950 C 1235
951 A 1234
952 U 1233
953 G 1232
954 U 1231
955 G 1230
956 G 1228
957 U 1227
958 U 0
959 U 0
960 A 0
961 A 0
962 U 977
963 U 976
964 C 975
965 G 974
966 A 0
967 U 0
968 G 0
969 A 0
970 U 0
971 A 0
972 C 0
973 G 0
974 C 965
975 G 964
976 A 963
977 G 962
978 G 0
979 A 0
980 A 0
981 C 0
982 C 0
983 U 0
984 U 0
985 A 0
986 C 1223
987 C 1222
988 C 1221
989 G 1220
990 G 1219
991 G 1218
992 C 1217
993 U 0
994 U 0
995 A 0
996 A 0
997 A 0
998 U 1046
999 U 1045
1000 G 1044
1001 C 1043
1002 A 1042
1003 G 1041
1004 U 1040
1005 G 1039
1006 G 1038
1007 A 0
1008 A 0
1009 U 1026
1010 G 1025
1011 A 1024
1012 U 1023
1013 G 1022
1014 U 1021
1015 G 1020
1016 G 0
1017 A 0
1018 A 0
1019 A 0
1020 C 1015
1021 A 1014
1022 U 1013
1023 G 1012
1024 U 1011
1025 C 1010
1026 A 1009
1027 G 0
1028 U 1037
1029 G 1036
1030 A 1035
1031 G 0
1032 C 0
1033 A 0
1034 A 0
1035 U 1030
1036 C 1029
1037 A 1028
1038 C 1006
1039 C 1005
1040 G 1004
1041 C 1003
1042 U 1002
1043 G 1001
1044 U 1000
1045 G 999
1046 A 998
1047 A 0
1048 G 1212
1049 G 1211
1050 U 0
1051 G 1210
1052 C 1209
1053 U 1208
1054 G 1207
1055 C 0
1056 A 0
1057 U 1206
1058 G 1205
1059 G 1201
1060 U 1200
1061 U 1199
1062 G 1197
1063 U 1196
1064 C 1195
1065 G 1194
1066 U 0
1067 C 0
1068 A 0
1069 G 1108
1070 C 1107
1071 U 1106
1072 C 1105
1073 G 1104
1074 U 1103
1075 G 1084
1076 C 1083
1077 C 1082
1078 G 0
1079 U 0
1080 G 0
1081 A 0
1082 G 1077
1083 G 1076
1084 U 1075
1085 G 0
1086 U 0
1087 C 1100
1088 G 1099
1089 G 1098
1090 C 1097
1091 U 0
1092 U 0
1093 A 0
1094 A 0
1095 G 0
1096 U 0
1097 G 1090
1098 C 1089
1099 C 1088
1100 A 1087
1101 U 0
1102 A 0
1103 A 1074
1104 C 1073
1105 G 1072
1106 A 1071
1107 G 1070
1108 C 1069
1109 G 0
1110 C 0
1111 A 0
1112 A 0
1113 C 0
1114 C 1189
1115 C 1188
1116 U 1187
1117 U 1186
1118 A 0
1119 U 1157
1120 C 1156
1121 U 1155
1122 U 1154
1123 U 1153
1124 A 1152
1125 G 1151
1126 U 0
1127 U 0
1128 A 0
1129 C 1146
1130 U 1145
1131 A 0
1132 A 0
1133 C 1144
1134 A 1143
1135 G 1142
1136 G 0
1137 U 0
1138 U 0
1139 A 0
1140 U 0
1141 G 0
1142 C 1135
1143 U 1134
1144 G 1133
1145 A 1130
1146 G 1129
1147 G 0
1148 A 0
1149 C 0
1150 U 0
1151 C 1125
1152 U 1124
1153 A 1123
1154 G 1122
1155 A 1121
1156 G 1120
1157 A 1119
1158 G 0
1159 A 0
1160 C 1180
1161 U 1179
1162 G 1178
1163 C 1177
1164 C 1175
1165 G 1174
1166 U 1173
1167 C 1172
1168 G 0
1169 U 0
1170 A 0
1171 A 0
1172 G 1167
1173 A 1166
1174 U 1165
1175 G 1164
1176 U 0
1177 G 1163
1178 A 1162
1179 G 1161
1180 G 1160
1181 A 0
1182 A 0
1183 G 0
1184 G 0
1185 U 0
1186 G 1117
1187 G 1116
1188 G 1115
1189 G 1114
1190 A 0
1191 U 0
1192 G 0
1193 A 0
1194 C 1065
1195 G 1064
1196 U 1063
1197 C 1062
1198 A 0
1199 A 1061
1200 A 1060
1201 U 1059
1202 C 0
1203 A 0
1204 G 0
1205 C 1058
1206 A 1057
1207 C 1054
1208 G 1053
1209 G 1052
1210 C 1051
1211 C 1049
1212 C 1048
1213 U 0
1214 U 0
1215 A 0
1216 C 0
1217 G 992
1218 U 991
1219 C 990
1220 C 989
1221 G 988
1222 G 987
1223 G 986
1224 G 0
1225 C 0
1226 U 0
1227 A 957
1228 C 956
1229 A 0
1230 C 955
1231 A 954
1232 C 953
1233 G 952
1234 U 951
1235 G 950
1236 U 949
1237 U 948
1238 A 947
1239 C 946
1240 A 0
1241 A 0
1242 U 0
1243 G 1297
1244 G 1296
1245 G 1295
1246 G 1294
1247 G 1293
1248 G 1292
1249 U 1291
1250 A 0
1251 C 0
1252 A 0
1253 G 0
1254 A 0
1255 A 1286
1256 G 1285
1257 G 1284
1258 C 0
1259 A 0
1260 G 1279
1261 C 1278
1262 U 0
1263 A 0
1264 G 0
1265 C 1274
1266 G 1273
1267 G 1272
1268 G 0
1269 U 0
1270 G 0
1271 A 0
1272 C 1267
1273 C 1266
1274 G 1265
1275 U 0
1276 A 0
1277 U 0
1278 G 1261
1279 C 1260
1280 U 0
1281 A 0
1282 A 0
1283 U 0
1284 C 1257
1285 C 1256
1286 C 1255
1287 A 0
1288 A 0
1289 A 0
1290 A 0
1291 U 1249
1292 C 1248
1293 C 1247
1294 U 1246
1295 C 1245
1296 U 1244
1297 C 1243
1298 U 0
1299 C 0
1300 A 0
1301 G 0
1302 U 0
1303 U 0
1304 C 1335
1305 G 0
1306 G 0
1307 A 0
1308 U 1331
1309 C 1330
1310 G 1329
1311 A 1328
1312 A 1327
1313 G 1326
1314 U 1325
1315 C 1324
1316 U 0
1317 G 0
1318 C 0
1319 A 0
1320 A 0
1321 C 0
1322 C 0
1323 C 0
1324 G 1315
1325 A 1314
1326 C 1313
1327 U 1312
1328 U 1311
1329 C 1310
1330 G 1309
1331 U 1308
1332 G 0
1333 A 0
1334 A 0
1335 G 1304
1336 C 0
1337 U 0
1338 G 0
1339 G 0
1340 A 0
1341 U 945
1342 U 944
1343 C 943
1344 G 942
1345 C 941
1346 U 0
1347 A 0
1348 G 0
1349 U 0
1350 A 0
1351 A 1374
1352 U 1373
1353 C 1372
1354 G 1371
1355 C 1370
1356 G 1369
1357 C 1368
1358 A 1367
1359 U 0
1360 C 0
1361 A 0
1362 G 0
1363 C 0
1364 C 0
1365 A 0
1366 C 0
1367 G 1358
1368 G 1357
1369 C 1356
1370 G 1355
1371 C 1354
1372 G 1353
1373 G 1352
1374 U 1351
1375 G 0
1376 A 0
1377 A 0
1378 U 0
1379 A 0
1380 C 0
1381 G 938
1382 U 937
1383 U 0
1384 C 0
1385 C 0
1386 C 935
1387 G 934
1388 G 933
1389 G 932
1390 C 931
1391 C 930
1392 U 929
1393 U 927
1394 G 926
1395 U 925
1396 A 0
1397 C 924
1398 A 923
1399 C 0
1400 A 0
1401 C 1497
1402 C 0
1403 G 1494
1404 C 1493
1405 C 0
1406 C 1490
1407 G 1489
1408 U 0
1409 C 0
1410 A 0
1411 A 1484
1412 G 1483
1413 C 1482
1414 C 1481
1415 A 1480
1416 U 1479
1417 G 1478
1418 G 1477
1419 G 0
1420 A 0
1421 G 1474
1422 C 1473
1423 C 1472
1424 G 1471
1425 G 1470
1426 G 1469
1427 G 1468
1428 G 1467
1429 U 1466
1430 A 1465
1431 C 1464
1432 C 1463
1433 U 0
1434 G 0
1435 A 0
1436 A 0
1437 G 1459
1438 U 1458
1439 A 1457
1440 C 1456
1441 G 1455
1442 U 1454
1443 A 0
1444 A 0
1445 C 1452
1446 C 1451
1447 G 0
1448 C 0
1449 A 0
1450 A 0
1451 G 1446
1452 G 1445
1453 A 0
1454 U 1442
1455 C 1441
1456 G 1440
1457 U 1439
1458 C 1438
1459 C 1437
1460 U 0
1461 A 0
1462 G 0
1463 G 1432
1464 G 1431
1465 U 1430
1466 A 1429
1467 A 1428
1468 A 1427
1469 A 1426
1470 C 1425
1471 U 1424
1472 G 1423
1473 G 1422
1474 U 1421
1475 G 0
1476 A 0
1477 C 1418
1478 U 1417
1479 G 1416
1480 G 1415
1481 G 1414
1482 G 1413
1483 C 1412
1484 U 1411
1485 A 0
1486 A 0
1487 G 0
1488 U 0
1489 C 1407
1490 G 1406
1491 U 0
1492 A 0
1493 A 1404
1494 C 1403
1495 A 0
1496 A 0
1497 G 1401
1498 G 0
1499 U 1522
1500 A 1521
1501 G 1520
1502 C 1519
1503 C 1518
1504 G 1517
1505 U 1516
1506 A 1515
1507 C 1514
1508 C 1513
1509 G 0
1510 G 0
1511 A 0
1512 A 0
1513 G 1508
1514 G 1507
1515 U 1506
1516 G 1505
1517 C 1504
1518 G 1503
1519 G 1502
1520 C 1501
1521 U 1500
1522 G 1499
1523 G 0
1524 A 0
1525 A 0
1526 C 0
1527 A 0
1528 C 0
1529 C 0
1530 U 0
1531 C 0
1532 C 0
1533 U 0
1534 U 0
1535 U 0
1536 C 0
1537 U 0