Filename: d.16.b.B.hyodysenteriae.bpseq
Organism: Brachyspira hyodysenteriae
Accession Number: U23035
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 N 0
2 N 0
3 N 0
4 N 0
5 N 0
6 N 0
7 N 0
8 N 0
9 N 25
10 N 24
11 N 23
12 N 22
13 N 21
14 N 0
15 N 0
16 N 0
17 N 888
18 N 887
19 N 886
20 N 0
21 N 13
22 N 12
23 N 11
24 N 10
25 N 9
26 N 0
27 N 529
28 N 528
29 N 527
30 N 526
31 N 0
32 N 525
33 N 524
34 C 523
35 G 522
36 U 521
37 U 520
38 G 0
39 G 401
40 C 400
41 G 399
42 A 398
43 U 397
44 G 396
45 C 394
46 G 393
47 U 359
48 C 0
49 U 0
50 U 0
51 A 0
52 A 357
53 G 356
54 C 355
55 A 0
56 U 354
57 G 353
58 C 352
59 A 0
60 A 0
61 G 100
62 U 99
63 C 98
64 G 0
65 A 0
66 G 97
67 C 96
68 G 95
69 G 94
70 G 93
71 C 92
72 U 91
73 U 90
74 A 89
75 U 88
76 U 87
77 C 86
78 G 85
79 G 84
80 G 0
81 C 0
82 A 0
83 A 0
84 C 79
85 U 78
86 G 77
87 G 76
88 A 75
89 U 74
90 A 73
91 A 72
92 G 71
93 U 70
94 U 69
95 A 68
96 G 67
97 C 66
98 G 63
99 G 62
100 C 61
101 G 0
102 A 0
103 A 0
104 C 0
105 U 0
106 G 0
107 G 312
108 U 311
109 G 310
110 A 0
111 G 0
112 U 0
113 A 0
114 A 0
115 C 0
116 A 237
117 C 236
118 G 235
119 U 234
120 A 233
121 G 232
122 G 231
123 U 230
124 A 0
125 A 0
126 U 229
127 C 228
128 U 0
129 G 0
130 C 0
131 C 225
132 G 224
133 U 223
134 A 222
135 G 221
136 A 220
137 G 219
138 U 0
139 G 173
140 G 172
141 G 171
142 G 170
143 G 0
144 A 0
145 U 0
146 A 0
147 A 164
148 C 163
149 C 162
150 C 161
151 A 160
152 U 159
153 G 158
154 G 0
155 A 0
156 A 0
157 A 0
158 C 153
159 A 152
160 U 151
161 G 150
162 G 149
163 A 148
164 C 147
165 U 0
166 A 0
167 A 0
168 U 0
169 A 0
170 C 142
171 C 141
172 G 140
173 C 139
174 A 0
175 U 0
176 A 0
177 U 0
178 A 0
179 C 203
180 U 202
181 C 201
182 U 200
183 U 198
184 G 197
185 C 196
186 U 195
187 A 194
188 C 193
189 A 0
190 U 0
191 A 0
192 A 0
193 G 188
194 U 187
195 A 186
196 G 185
197 A 184
198 G 183
199 U 0
200 A 182
201 G 181
202 A 180
203 G 179
204 G 0
205 A 0
206 A 0
207 A 0
208 G 217
209 G 216
210 A 215
211 G 0
212 C 0
213 A 0
214 A 0
215 U 210
216 C 209
217 C 208
218 G 0
219 C 137
220 U 136
221 U 135
222 U 134
223 A 133
224 C 132
225 G 131
226 A 0
227 U 0
228 G 127
229 A 126
230 G 123
231 C 122
232 C 121
233 U 120
234 G 119
235 C 118
236 G 117
237 G 116
238 C 284
239 C 283
240 U 282
241 A 0
242 U 0
243 U 281
244 A 0
245 G 275
246 C 274
247 C 273
248 U 0
249 G 0
250 U 272
251 U 271
252 G 270
253 G 269
254 U 268
255 G 267
256 G 266
257 G 265
258 G 0
259 U 0
260 A 0
261 A 0
262 C 0
263 G 0
264 G 0
265 C 257
266 C 256
267 U 255
268 A 254
269 C 253
270 C 252
271 A 251
272 A 250
273 A 247
274 G 246
275 C 245
276 U 0
277 A 0
278 C 0
279 G 0
280 A 0
281 U 243
282 A 240
283 G 239
284 G 238
285 U 0
286 A 0
287 G 309
288 C 308
289 C 307
290 G 306
291 A 302
292 C 301
293 C 300
294 U 299
295 G 0
296 A 0
297 G 0
298 A 0
299 G 294
300 G 293
301 G 292
302 U 291
303 G 0
304 A 0
305 C 0
306 C 290
307 G 289
308 G 288
309 C 287
310 C 109
311 A 108
312 C 107
313 A 0
314 U 335
315 U 334
316 G 333
317 G 332
318 G 331
319 A 330
320 C 0
321 U 0
322 G 0
323 A 0
324 G 0
325 A 0
326 U 0
327 A 0
328 C 0
329 G 0
330 G 319
331 C 318
332 C 317
333 C 316
334 A 315
335 G 314
336 A 0
337 C 348
338 U 347
339 C 346
340 C 345
341 U 0
342 A 0
343 C 0
344 G 0
345 G 340
346 G 339
347 A 338
348 G 337
349 G 0
350 C 0
351 A 0
352 G 58
353 C 57
354 A 56
355 G 54
356 C 53
357 U 52
358 G 0
359 A 47
360 G 0
361 A 0
362 A 0
363 U 0
364 C 0
365 U 391
366 U 0
367 C 390
368 C 389
369 A 388
370 C 0
371 A 0
372 A 0
373 U 386
374 G 385
375 G 384
376 A 383
377 C 382
378 G 0
379 A 0
380 A 0
381 A 0
382 G 377
383 U 376
384 C 375
385 U 374
386 G 373
387 A 0
388 U 369
389 G 368
390 G 367
391 A 365
392 G 0
393 C 46
394 G 45
395 A 0
396 C 44
397 A 43
398 U 42
399 C 41
400 G 40
401 C 39
402 G 0
403 U 0
404 G 434
405 A 433
406 G 432
407 G 431
408 G 0
409 A 0
410 U 0
411 G 0
412 A 0
413 A 0
414 G 425
415 G 424
416 C 423
417 C 422
418 U 0
419 U 0
420 C 0
421 G 0
422 G 417
423 G 416
424 U 415
425 U 414
426 G 0
427 U 0
428 A 0
429 A 0
430 A 0
431 C 407
432 C 406
433 U 405
434 C 404
435 G 0
436 G 471
437 A 0
438 A 0
439 A 468
440 U 467
441 U 466
442 A 465
443 U 464
444 C 463
445 G 0
446 A 0
447 A 0
448 G 458
449 A 0
450 A 0
451 U 0
452 G 0
453 A 0
454 G 0
455 U 0
456 G 0
457 A 0
458 C 448
459 A 0
460 G 0
461 U 0
462 A 0
463 G 444
464 A 443
465 U 442
466 A 441
467 A 440
468 U 439
469 G 0
470 U 0
471 A 436
472 A 0
473 G 518
474 C 517
475 C 516
476 U 515
477 C 514
478 G 499
479 G 498
480 C 497
481 U 0
482 A 0
483 A 0
484 C 513
485 U 512
486 A 511
487 C 510
488 G 509
489 U 0
490 G 0
491 C 0
492 C 0
493 A 0
494 G 501
495 C 500
496 A 0
497 G 480
498 C 479
499 C 478
500 G 495
501 C 494
502 G 0
503 G 0
504 U 0
505 A 0
506 A 0
507 U 0
508 A 0
509 C 488
510 G 487
511 U 486
512 A 485
513 G 484
514 G 477
515 A 476
516 G 475
517 G 474
518 C 473
519 A 0
520 A 37
521 A 36
522 C 35
523 G 34
524 U 33
525 U 32
526 G 30
527 C 29
528 U 28
529 C 27
530 G 0
531 G 0
532 A 0
533 U 0
534 U 0
535 U 0
536 A 0
537 C 0
538 U 0
539 G 0
540 G 853
541 G 852
542 C 851
543 G 836
544 U 835
545 A 0
546 A 0
547 A 0
548 G 850
549 G 0
550 G 737
551 U 736
552 G 735
553 A 734
554 G 0
555 U 731
556 A 0
557 G 730
558 G 729
559 C 728
560 G 0
561 G 624
562 A 623
563 C 622
564 U 621
565 U 620
566 A 619
567 U 618
568 A 0
569 A 617
570 G 616
571 U 613
572 C 612
573 U 611
574 A 610
575 A 609
576 G 608
577 G 607
578 U 606
579 G 605
580 A 0
581 A 0
582 A 0
583 G 0
584 A 602
585 C 601
586 C 600
587 G 599
588 A 598
589 A 597
590 G 596
591 C 0
592 U 0
593 C 0
594 A 0
595 A 0
596 C 590
597 U 589
598 U 588
599 C 587
600 G 586
601 G 585
602 A 584
603 A 0
604 A 0
605 C 579
606 G 578
607 C 577
608 C 576
609 U 575
610 C 574
611 G 573
612 G 572
613 A 571
614 U 0
615 A 0
616 C 570
617 U 569
618 G 567
619 U 566
620 A 565
621 A 564
622 G 563
623 U 562
624 C 561
625 U 0
626 U 0
627 G 0
628 G 724
629 A 723
630 U 722
631 A 721
632 U 719
633 U 718
634 G 717
635 U 716
636 A 715
637 G 0
638 G 0
639 G 713
640 G 712
641 A 711
642 U 710
643 G 709
644 A 708
645 U 707
646 G 690
647 G 689
648 A 0
649 A 0
650 U 686
651 U 685
652 C 684
653 U 683
654 C 682
655 G 681
656 G 680
657 U 679
658 G 0
659 U 0
660 A 0
661 G 672
662 C 671
663 G 670
664 G 0
665 U 0
666 G 0
667 G 0
668 A 0
669 A 0
670 U 663
671 G 662
672 C 661
673 G 0
674 C 0
675 A 0
676 G 0
677 A 0
678 U 0
679 A 657
680 U 656
681 C 655
682 G 654
683 A 653
684 G 652
685 A 651
686 G 650
687 G 0
688 A 0
689 A 647
690 C 646
691 A 0
692 C 0
693 C 0
694 U 0
695 A 706
696 U 0
697 A 0
698 G 705
699 C 704
700 G 0
701 A 0
702 A 0
703 G 0
704 G 699
705 C 698
706 A 695
707 G 645
708 N 644
709 C 643
710 A 642
711 U 641
712 C 640
713 U 639
714 G 0
715 G 636
716 G 635
717 C 634
718 A 633
719 U 632
720 U 0
721 U 631
722 A 630
723 U 629
724 C 628
725 G 0
726 A 0
727 C 0
728 G 559
729 C 558
730 U 557
731 G 555
732 A 0
733 A 0
734 U 553
735 C 552
736 A 551
737 C 550
738 G 0
739 A 0
740 A 0
741 A 0
742 G 783
743 C 782
744 U 781
745 A 780
746 G 779
747 G 778
748 G 0
749 G 0
750 A 0
751 G 777
752 C 776
753 A 0
754 A 0
755 A 0
756 C 772
757 A 771
758 G 770
759 G 769
760 C 0
761 U 0
762 U 0
763 A 0
764 G 0
765 A 0
766 U 0
767 A 0
768 C 0
769 C 759
770 C 758
771 U 757
772 G 756
773 G 0
774 U 0
775 A 0
776 G 752
777 U 751
778 C 747
779 C 746
780 U 745
781 A 744
782 G 743
783 C 742
784 C 0
785 G 0
786 U 0
787 A 0
788 A 0
789 A 0
790 C 0
791 G 0
792 U 0
793 U 0
794 G 849
795 U 848
796 A 847
797 C 846
798 A 845
799 C 844
800 U 0
801 A 0
802 G 827
803 G 826
804 U 825
805 G 824
806 C 823
807 U 822
808 U 821
809 C 820
810 U 819
811 A 818
812 U 817
813 U 0
814 U 0
815 A 0
816 A 0
817 A 812
818 U 811
819 A 810
820 G 809
821 G 808
822 A 807
823 G 806
824 U 805
825 G 804
826 C 803
827 C 802
828 G 0
829 U 0
830 A 0
831 G 838
832 C 837
833 U 0
834 A 0
835 A 544
836 C 543
837 G 832
838 U 831
839 C 0
840 U 0
841 U 0
842 A 0
843 A 0
844 G 799
845 U 798
846 G 797
847 U 796
848 A 795
849 C 794
850 C 548
851 G 542
852 C 541
853 C 540
854 U 0
855 G 882
856 A 881
857 G 880
858 G 0
859 A 0
860 G 0
861 U 0
862 A 0
863 U 0
864 G 875
865 C 874
866 C 873
867 C 872
868 G 0
869 C 0
870 A 0
871 A 0
872 G 867
873 G 866
874 G 865
875 U 864
876 G 0
877 A 0
878 A 0
879 A 0
880 C 857
881 U 856
882 C 855
883 A 0
884 A 0
885 A 0
886 G 19
887 A 18
888 A 17
889 A 0
890 U 0
891 U 1369
892 G 1368
893 A 1366
894 C 1365
895 G 1364
896 G 0
897 G 1363
898 U 1362
899 C 1361
900 C 1360
901 C 1359
902 C 1358
903 G 1357
904 C 0
905 A 1353
906 C 1352
907 A 0
908 A 0
909 G 1317
910 U 1316
911 G 1315
912 G 1314
913 U 1313
914 G 1210
915 G 1209
916 A 1208
917 G 1207
918 C 1206
919 A 1205
920 U 1204
921 G 1203
922 U 1202
923 G 1201
924 G 1199
925 U 1198
926 U 0
927 U 0
928 A 0
929 A 0
930 U 945
931 U 944
932 C 943
933 G 942
934 A 0
935 U 0
936 G 0
937 A 0
938 U 0
939 A 0
940 C 0
941 G 0
942 C 933
943 G 932
944 A 931
945 A 930
946 A 0
947 A 0
948 A 0
949 C 0
950 C 0
951 U 0
952 U 0
953 A 0
954 C 1194
955 C 1193
956 U 1192
957 G 1191
958 G 1190
959 G 1189
960 U 1188
961 U 0
962 U 0
963 G 0
964 A 0
965 A 0
966 U 1016
967 U 1015
968 G 1014
969 U 1013
970 A 1012
971 A 1011
972 G 1010
973 A 1009
974 U 1008
975 G 0
976 A 0
977 A 0
978 U 995
979 G 994
980 A 993
981 U 992
982 U 991
983 U 990
984 A 989
985 G 0
986 A 0
987 G 0
988 A 0
989 U 984
990 A 983
991 A 982
992 G 981
993 U 980
994 C 979
995 A 978
996 G 1007
997 A 1006
998 C 1005
999 C 1004
1000 G 0
1001 C 0
1002 A 0
1003 A 0
1004 G 999
1005 G 998
1006 A 997
1007 C 996
1008 G 974
1009 U 973
1010 U 972
1011 U 971
1012 U 970
1013 A 969
1014 C 968
1015 A 967
1016 U 966
1017 A 0
1018 G 1183
1019 G 1182
1020 U 0
1021 G 1181
1022 C 1180
1023 U 1179
1024 G 1178
1025 C 0
1026 A 0
1027 U 1177
1028 G 1176
1029 G 1172
1030 C 1171
1031 U 1170
1032 G 1168
1033 U 1167
1034 C 1166
1035 G 1165
1036 U 0
1037 C 0
1038 A 0
1039 G 1078
1040 C 1077
1041 U 1076
1042 C 1075
1043 G 1074
1044 U 1073
1045 G 1054
1046 U 1053
1047 C 1052
1048 G 0
1049 U 0
1050 G 0
1051 A 0
1052 G 1047
1053 A 1046
1054 U 1045
1055 G 0
1056 U 0
1057 U 1070
1058 G 1069
1059 G 1068
1060 G 1067
1061 U 0
1062 U 0
1063 A 0
1064 A 0
1065 G 0
1066 U 0
1067 C 1060
1068 C 1059
1069 C 1058
1070 G 1057
1071 C 0
1072 A 0
1073 A 1044
1074 C 1043
1075 G 1042
1076 A 1041
1077 G 1040
1078 C 1039
1079 G 0
1080 C 0
1081 A 0
1082 A 0
1083 C 0
1084 C 1160
1085 C 1159
1086 U 1158
1087 C 1157
1088 A 0
1089 C 1127
1090 C 1126
1091 C 1125
1092 U 1124
1093 U 1123
1094 U 1122
1095 G 1121
1096 U 0
1097 U 0
1098 G 0
1099 C 1116
1100 U 1115
1101 A 0
1102 C 0
1103 C 1114
1104 G 1113
1105 A 1112
1106 G 0
1107 U 0
1108 A 0
1109 A 0
1110 U 0
1111 G 0
1112 U 1105
1113 C 1104
1114 G 1103
1115 G 1100
1116 G 1099
1117 C 0
1118 A 0
1119 C 0
1120 U 0
1121 C 1095
1122 U 1094
1123 U 1093
1124 A 1092
1125 G 1091
1126 G 1090
1127 G 1089
1128 G 0
1129 A 0
1130 C 1151
1131 U 1150
1132 G 1149
1133 C 1148
1134 C 1147
1135 U 1146
1136 A 1145
1137 C 1144
1138 G 0
1139 U 0
1140 U 0
1141 C 0
1142 A 0
1143 A 0
1144 G 1137
1145 U 1136
1146 A 1135
1147 G 1134
1148 G 1133
1149 A 1132
1150 G 1131
1151 G 1130
1152 A 0
1153 A 0
1154 G 0
1155 G 0
1156 U 0
1157 G 1087
1158 G 1086
1159 G 1085
1160 G 1084
1161 A 0
1162 U 0
1163 G 0
1164 A 0
1165 U 1035
1166 G 1034
1167 U 1033
1168 C 1032
1169 A 0
1170 A 1031
1171 G 1030
1172 U 1029
1173 C 0
1174 C 0
1175 U 0
1176 C 1028
1177 A 1027
1178 U 1024
1179 G 1023
1180 G 1022
1181 C 1021
1182 C 1019
1183 C 1018
1184 U 0
1185 U 0
1186 A 0
1187 U 0
1188 G 960
1189 U 959
1190 C 958
1191 C 957
1192 A 956
1193 G 955
1194 G 954
1195 G 0
1196 C 0
1197 U 0
1198 A 925
1199 C 924
1200 A 0
1201 C 923
1202 A 922
1203 C 921
1204 G 920
1205 U 919
1206 G 918
1207 C 917
1208 U 916
1209 A 915
1210 C 914
1211 A 0
1212 A 0
1213 U 0
1214 G 1269
1215 G 1268
1216 C 1267
1217 A 1266
1218 A 1265
1219 G 1264
1220 U 1263
1221 A 0
1222 C 0
1223 A 0
1224 A 0
1225 A 0
1226 G 1257
1227 A 1256
1228 G 1255
1229 A 0
1230 A 0
1231 G 1250
1232 C 1249
1233 A 0
1234 A 0
1235 G 0
1236 A 1245
1237 C 1244
1238 C 1243
1239 G 0
1240 C 0
1241 G 0
1242 A 0
1243 G 1238
1244 G 1237
1245 U 1236
1246 G 0
1247 G 0
1248 A 0
1249 G 1232
1250 C 1231
1251 A 0
1252 A 0
1253 A 0
1254 A 0
1255 C 1228
1256 U 1227
1257 C 1226
1258 A 0
1259 A 0
1260 A 0
1261 A 0
1262 A 0
1263 A 1220
1264 G 1219
1265 U 1218
1266 U 1217
1267 G 1216
1268 C 1215
1269 C 1214
1270 U 0
1271 C 0
1272 A 0
1273 G 0
1274 U 0
1275 U 0
1276 C 1307
1277 G 0
1278 G 0
1279 A 0
1280 U 1303
1281 U 1302
1282 G 1301
1283 G 1300
1284 A 1299
1285 G 1298
1286 U 1297
1287 C 1296
1288 U 0
1289 G 0
1290 A 0
1291 A 0
1292 A 0
1293 C 0
1294 U 0
1295 C 0
1296 G 1287
1297 A 1286
1298 C 1285
1299 U 1284
1300 C 1283
1301 C 1282
1302 A 1281
1303 U 1280
1304 G 0
1305 A 0
1306 A 0
1307 G 1276
1308 U 0
1309 U 0
1310 G 0
1311 G 0
1312 A 0
1313 A 913
1314 U 912
1315 C 911
1316 A 910
1317 C 909
1318 U 0
1319 A 0
1320 G 0
1321 U 0
1322 A 0
1323 A 1345
1324 U 1344
1325 C 1343
1326 G 1342
1327 U 1341
1328 A 1340
1329 G 1339
1330 A 1338
1331 U 0
1332 C 0
1333 A 0
1334 G 0
1335 A 0
1336 A 0
1337 C 0
1338 G 1330
1339 C 1329
1340 U 1328
1341 A 1327
1342 C 1326
1343 G 1325
1344 G 1324
1345 U 1323
1346 G 0
1347 A 0
1348 A 0
1349 U 0
1350 A 0
1351 C 0
1352 G 906
1353 U 905
1354 U 0
1355 C 0
1356 C 0
1357 C 903
1358 G 902
1359 G 901
1360 G 900
1361 G 899
1362 A 898
1363 U 897
1364 U 895
1365 G 894
1366 U 893
1367 A 0
1368 C 892
1369 A 891
1370 C 0
1371 A 0
1372 C 1477
1373 C 0
1374 G 1474
1375 C 1473
1376 C 0
1377 C 1470
1378 G 1469
1379 U 0
1380 C 0
1381 A 0
1382 C 1464
1383 G 1463
1384 C 1462
1385 C 1461
1386 A 1460
1387 U 1459
1388 C 1458
1389 G 1457
1390 G 0
1391 A 0
1392 G 1454
1393 U 1453
1394 U 1452
1395 G 1451
1396 G 1450
1397 U 1449
1398 U 1448
1399 U 1447
1400 U 1446
1401 A 1445
1402 C 1444
1403 C 1443
1404 U 0
1405 G 0
1406 A 0
1407 A 0
1408 G 1439
1409 U 1438
1410 C 1437
1411 G 1436
1412 U 1435
1413 U 1434
1414 A 0
1415 G 1433
1416 C 1432
1417 C 1431
1418 U 1430
1419 A 0
1420 A 0
1421 C 1428
1422 C 1427
1423 G 0
1424 C 0
1425 A 0
1426 A 0
1427 G 1422
1428 G 1421
1429 G 0
1430 G 1418
1431 G 1417
1432 G 1416
1433 C 1415
1434 G 1413
1435 G 1412
1436 C 1411
1437 G 1410
1438 C 1409
1439 C 1408
1440 G 0
1441 A 0
1442 A 0
1443 G 1403
1444 G 1402
1445 U 1401
1446 G 1400
1447 G 1399
1448 G 1398
1449 A 1397
1450 C 1396
1451 U 1395
1452 G 1394
1453 A 1393
1454 U 1392
1455 G 0
1456 A 0
1457 U 1389
1458 G 1388
1459 A 1387
1460 G 1386
1461 G 1385
1462 G 1384
1463 U 1383
1464 G 1382
1465 A 0
1466 A 0
1467 G 0
1468 U 0
1469 C 1378
1470 G 1377
1471 U 0
1472 A 0
1473 A 1375
1474 C 1374
1475 A 0
1476 A 0
1477 G 1372
1478 G 0
1479 C 1502
1480 A 1501
1481 G 1500
1482 N 1499
1483 C 1498
1484 G 1497
1485 U 1496
1486 A 1495
1487 C 1494
1488 C 1493
1489 G 0
1490 G 0
1491 A 0
1492 A 0
1493 G 1488
1494 G 1487
1495 U 1486
1496 G 1485
1497 U 1484
1498 G 1483
1499 N 1482
1500 N 1481
1501 N 1480
1502 N 1479
1503 N 0
1504 N 0
1505 N 0
1506 N 0
1507 N 0
1508 N 0
1509 N 0
1510 N 0
1511 N 0
1512 N 0
1513 N 0
1514 N 0
1515 N 0