Filename: d.16.b.Beggiatoa.sp.bpseq
Organism: Beggiatoa sp. 1401-13
Accession Number: L40997
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 N 0
2 N 0
3 N 0
4 N 0
5 N 0
6 N 0
7 N 0
8 N 0
9 N 25
10 N 24
11 N 23
12 U 22
13 U 21
14 U 0
15 G 0
16 A 0
17 U 897
18 C 896
19 N 895
20 U 0
21 G 13
22 G 12
23 C 11
24 U 10
25 C 9
26 A 0
27 G 534
28 A 533
29 U 532
30 U 531
31 G 0
32 A 530
33 A 529
34 C 528
35 G 527
36 C 526
37 U 525
38 G 0
39 G 381
40 C 380
41 G 379
42 G 378
43 U 377
44 A 376
45 U 374
46 G 373
47 C 339
48 U 0
49 U 0
50 A 0
51 A 0
52 C 337
53 A 336
54 C 335
55 A 0
56 U 334
57 G 333
58 C 332
59 A 0
60 A 0
61 G 90
62 U 89
63 C 88
64 G 0
65 A 0
66 A 87
67 C 86
68 G 85
69 G 84
70 G 83
71 G 82
72 G 81
73 U 80
74 A 79
75 G 0
76 C 0
77 A 0
78 A 0
79 U 74
80 A 73
81 C 72
82 C 71
83 U 70
84 U 69
85 A 68
86 G 67
87 U 66
88 G 63
89 G 62
90 C 61
91 G 0
92 G 0
93 A 0
94 C 0
95 G 0
96 G 0
97 G 292
98 U 291
99 G 290
100 A 0
101 G 0
102 U 0
103 A 0
104 A 0
105 U 0
106 A 217
107 C 216
108 A 215
109 U 214
110 A 213
111 G 212
112 G 211
113 A 210
114 A 0
115 U 209
116 C 208
117 U 0
118 G 0
119 C 0
120 C 205
121 U 204
122 U 203
123 G 202
124 U 201
125 A 200
126 G 199
127 U 0
128 G 162
129 G 161
130 G 160
131 G 159
132 G 0
133 A 0
134 C 0
135 A 0
136 A 153
137 C 152
138 U 151
139 U 150
140 G 149
141 G 148
142 G 147
143 G 0
144 A 0
145 A 0
146 A 0
147 C 142
148 U 141
149 C 140
150 A 139
151 A 138
152 G 137
153 C 136
154 U 0
155 A 0
156 A 0
157 U 0
158 A 0
159 C 131
160 C 130
161 G 129
162 C 128
163 A 0
164 U 0
165 A 0
166 C 0
167 G 0
168 A 177
169 C 176
170 C 175
171 U 0
172 A 0
173 C 0
174 G 0
175 G 170
176 G 169
177 U 168
178 G 0
179 A 0
180 A 0
181 A 0
182 G 197
183 G 196
184 G 195
185 G 194
186 G 193
187 C 192
188 U 0
189 U 0
190 C 0
191 G 0
192 G 187
193 C 186
194 U 185
195 C 184
196 U 183
197 C 182
198 G 0
199 C 126
200 U 125
201 A 124
202 U 123
203 A 122
204 A 121
205 G 120
206 A 0
207 U 0
208 G 116
209 A 115
210 G 113
211 C 112
212 C 111
213 U 110
214 A 109
215 U 108
216 G 107
217 U 106
218 C 264
219 U 263
220 G 262
221 A 0
222 U 0
223 U 261
224 A 0
225 G 255
226 C 254
227 U 253
228 A 0
229 G 0
230 U 252
231 U 251
232 G 250
233 G 249
234 U 248
235 G 247
236 G 246
237 G 245
238 G 0
239 U 0
240 A 0
241 A 0
242 A 0
243 G 0
244 G 0
245 C 237
246 C 236
247 U 235
248 A 234
249 C 233
250 C 232
251 A 231
252 A 230
253 G 227
254 G 226
255 C 225
256 G 0
257 A 0
258 C 0
259 G 0
260 A 0
261 U 223
262 C 220
263 A 219
264 G 218
265 U 0
266 A 0
267 G 289
268 C 288
269 U 287
270 G 286
271 G 282
272 U 281
273 C 280
274 U 279
275 G 0
276 A 0
277 G 0
278 A 0
279 G 274
280 G 273
281 A 272
282 C 271
283 G 0
284 A 0
285 C 0
286 C 270
287 A 269
288 G 268
289 C 267
290 C 99
291 A 98
292 C 97
293 A 0
294 C 315
295 U 314
296 G 313
297 G 312
298 G 311
299 A 310
300 C 0
301 U 0
302 G 0
303 A 0
304 G 0
305 A 0
306 C 0
307 A 0
308 C 0
309 G 0
310 G 299
311 C 298
312 C 297
313 C 296
314 A 295
315 G 294
316 A 0
317 C 328
318 U 327
319 C 326
320 C 325
321 U 0
322 A 0
323 C 0
324 G 0
325 G 320
326 G 319
327 A 318
328 G 317
329 G 0
330 C 0
331 A 0
332 G 58
333 C 57
334 A 56
335 G 54
336 U 53
337 G 52
338 G 0
339 G 47
340 G 0
341 A 0
342 A 0
343 U 0
344 A 0
345 U 371
346 U 0
347 G 370
348 G 369
349 A 368
350 C 0
351 A 0
352 A 0
353 U 366
354 G 365
355 G 364
356 G 363
357 C 362
358 G 0
359 A 0
360 A 0
361 A 0
362 G 357
363 C 356
364 C 355
365 U 354
366 G 353
367 A 0
368 U 349
369 C 348
370 C 347
371 A 345
372 G 0
373 C 46
374 A 45
375 A 0
376 U 44
377 A 43
378 C 42
379 C 41
380 G 40
381 C 39
382 G 0
383 U 0
384 G 414
385 U 413
386 G 412
387 U 411
388 G 0
389 A 0
390 A 0
391 G 0
392 A 0
393 A 0
394 G 405
395 G 404
396 C 403
397 C 402
398 U 0
399 G 0
400 C 0
401 G 0
402 G 397
403 G 396
404 U 395
405 U 394
406 G 0
407 U 0
408 A 0
409 A 0
410 A 0
411 G 387
412 C 386
413 A 385
414 C 384
415 U 0
416 U 474
417 U 0
418 N 475
419 N 471
420 G 470
421 U 469
422 U 468
423 G 467
424 G 466
425 G 0
426 A 0
427 A 0
428 G 461
429 N 0
430 N 0
431 N 0
432 A 0
433 G 455
434 C 454
435 U 453
436 G 452
437 U 451
438 G 450
439 U 449
440 G 448
441 U 0
442 U 0
443 A 0
444 A 0
445 U 0
446 A 0
447 C 0
448 C 440
449 A 439
450 C 438
451 A 437
452 U 436
453 A 435
454 G 434
455 U 433
456 G 0
457 U 0
458 U 0
459 G 0
460 A 0
461 C 428
462 G 0
463 U 0
464 U 0
465 A 0
466 C 424
467 C 423
468 A 422
469 A 421
470 C 420
471 N 419
472 N 0
473 A 0
474 A 416
475 U 418
476 A 0
477 A 0
478 G 523
479 C 522
480 A 521
481 C 520
482 C 519
483 G 504
484 G 503
485 C 502
486 U 0
487 A 0
488 A 0
489 C 518
490 U 517
491 C 516
492 U 515
493 G 514
494 U 0
495 G 0
496 C 0
497 C 0
498 A 0
499 G 506
500 C 505
501 A 0
502 G 485
503 C 484
504 C 483
505 G 500
506 C 499
507 G 0
508 G 0
509 U 0
510 A 0
511 A 0
512 U 0
513 A 0
514 C 493
515 A 492
516 G 491
517 A 490
518 G 489
519 G 482
520 G 481
521 U 480
522 G 479
523 C 478
524 A 0
525 A 37
526 G 36
527 C 35
528 G 34
529 U 33
530 U 32
531 A 30
532 A 29
533 U 28
534 C 27
535 G 0
536 G 0
537 A 0
538 A 0
539 U 0
540 U 0
541 A 0
542 C 0
543 U 0
544 G 0
545 G 862
546 G 861
547 C 860
548 G 845
549 U 844
550 A 0
551 A 0
552 A 0
553 G 859
554 C 0
555 G 742
556 U 741
557 A 740
558 C 739
559 G 0
560 U 736
561 A 0
562 G 735
563 G 734
564 C 733
565 G 0
566 G 629
567 C 628
568 U 627
569 A 626
570 A 625
571 A 624
572 U 623
573 A 0
574 A 622
575 G 621
576 U 618
577 C 617
578 A 616
579 G 615
580 A 614
581 U 613
582 G 612
583 U 611
584 G 610
585 A 0
586 A 0
587 A 0
588 U 0
589 C 607
590 C 606
591 U 605
592 C 604
593 G 603
594 A 602
595 G 601
596 C 0
597 U 0
598 C 0
599 A 0
600 A 0
601 C 595
602 U 594
603 U 593
604 G 592
605 A 591
606 G 590
607 A 589
608 A 0
609 U 0
610 U 584
611 G 583
612 C 582
613 A 581
614 U 580
615 U 579
616 U 578
617 G 577
618 A 576
619 A 0
620 A 0
621 C 575
622 U 574
623 G 572
624 C 571
625 U 570
626 U 569
627 A 568
628 G 567
629 C 566
630 U 0
631 A 0
632 G 0
633 A 729
634 G 728
635 U 727
636 A 726
637 U 724
638 G 723
639 G 722
640 U 721
641 A 720
642 G 0
643 A 0
644 G 718
645 G 717
646 G 716
647 A 715
648 A 714
649 G 713
650 U 712
651 G 695
652 G 694
653 A 0
654 A 0
655 U 691
656 U 690
657 C 689
658 C 688
659 A 687
660 C 686
661 G 685
662 U 684
663 G 0
664 U 0
665 A 0
666 G 677
667 C 676
668 G 675
669 G 0
670 U 0
671 G 0
672 A 0
673 A 0
674 A 0
675 U 668
676 G 667
677 C 666
678 G 0
679 U 0
680 A 0
681 G 0
682 A 0
683 U 0
684 A 662
685 U 661
686 G 660
687 U 659
688 G 658
689 G 657
690 A 656
691 G 655
692 G 0
693 A 0
694 A 652
695 C 651
696 A 0
697 U 0
698 C 0
699 A 0
700 G 711
701 U 0
702 G 0
703 G 710
704 C 709
705 G 0
706 A 0
707 A 0
708 G 0
709 G 704
710 C 703
711 G 700
712 A 650
713 C 649
714 U 648
715 U 647
716 C 646
717 C 645
718 U 644
719 G 0
720 G 641
721 A 640
722 C 639
723 U 638
724 A 637
725 A 0
726 U 636
727 A 635
728 C 634
729 U 633
730 G 0
731 A 0
732 C 0
733 A 564
734 C 563
735 U 562
736 G 560
737 A 0
738 G 0
739 G 558
740 U 557
741 A 556
742 C 555
743 G 0
744 A 0
745 A 0
746 A 0
747 G 788
748 C 787
749 G 786
750 U 785
751 G 784
752 G 783
753 G 0
754 G 0
755 A 0
756 G 782
757 C 781
758 A 0
759 A 0
760 A 0
761 C 777
762 A 776
763 G 775
764 G 774
765 A 0
766 U 0
767 U 0
768 A 0
769 G 0
770 A 0
771 U 0
772 A 0
773 C 0
774 C 764
775 C 763
776 U 762
777 G 761
778 G 0
779 U 0
780 A 0
781 G 757
782 U 756
783 C 752
784 C 751
785 A 750
786 C 749
787 G 748
788 C 747
789 C 0
790 C 0
791 U 0
792 A 0
793 A 0
794 A 0
795 C 0
796 G 0
797 A 0
798 U 0
799 G 858
800 A 857
801 G 856
802 A 855
803 A 854
804 C 853
805 U 0
806 A 0
807 G 836
808 A 835
809 U 834
810 G 833
811 U 832
812 U 831
813 G 830
814 G 829
815 G 828
816 G 827
817 G 826
818 A 825
819 G 0
820 U 0
821 U 0
822 A 0
823 A 0
824 G 0
825 U 818
826 C 817
827 C 816
828 C 815
829 U 814
830 U 813
831 A 812
832 G 811
833 U 810
834 A 809
835 U 808
836 C 807
837 G 0
838 C 0
839 N 0
840 N 847
841 N 846
842 N 0
843 A 0
844 A 549
845 C 548
846 G 841
847 C 840
848 G 0
849 U 0
850 U 0
851 A 0
852 A 0
853 G 804
854 U 803
855 U 802
856 C 801
857 U 800
858 C 799
859 C 553
860 G 547
861 C 546
862 C 545
863 U 0
864 G 891
865 G 890
866 G 889
867 G 0
868 A 0
869 G 0
870 U 0
871 A 0
872 C 0
873 G 884
874 G 883
875 C 882
876 C 881
877 G 0
878 C 0
879 A 0
880 A 0
881 G 876
882 G 875
883 U 874
884 U 873
885 A 0
886 A 0
887 A 0
888 A 0
889 C 866
890 U 865
891 C 864
892 A 0
893 A 0
894 A 0
895 U 19
896 G 18
897 A 17
898 A 0
899 U 0
900 U 1376
901 G 1375
902 A 1373
903 C 1372
904 G 1371
905 G 0
906 G 1370
907 G 1369
908 G 1368
909 C 1367
910 C 1366
911 C 1365
912 G 1364
913 C 0
914 A 1360
915 C 1359
916 A 0
917 A 0
918 G 1324
919 C 1323
920 G 1322
921 G 1321
922 U 1320
923 G 1217
924 G 1216
925 A 1215
926 G 1214
927 C 1213
928 A 1212
929 U 1211
930 G 1210
931 U 1209
932 G 1208
933 G 1206
934 U 1205
935 U 0
936 U 0
937 A 0
938 A 0
939 U 954
940 U 953
941 C 952
942 G 951
943 A 0
944 U 0
945 G 0
946 C 0
947 A 0
948 A 0
949 C 0
950 G 0
951 C 942
952 G 941
953 A 940
954 A 939
955 G 0
956 A 0
957 A 0
958 C 0
959 C 0
960 U 0
961 U 0
962 A 0
963 C 1201
964 C 1200
965 U 1199
966 G 1198
967 G 1197
968 C 1196
969 C 1195
970 U 0
971 U 0
972 G 0
973 A 0
974 C 0
975 A 1024
976 U 1023
977 G 1022
978 U 1020
979 C 1019
980 U 1018
981 G 1017
982 A 1016
983 A 0
984 A 0
985 U 1002
986 C 1001
987 U 1000
988 N 999
989 U 998
990 G 997
991 A 996
992 G 0
993 A 0
994 G 0
995 A 0
996 U 991
997 U 990
998 A 989
999 G 988
1000 A 987
1001 G 986
1002 A 985
1003 G 0
1004 U 1015
1005 G 1014
1006 C 1013
1007 C 1012
1008 U 0
1009 U 0
1010 C 0
1011 G 0
1012 G 1007
1013 G 1006
1014 A 1005
1015 A 1004
1016 U 982
1017 C 981
1018 A 980
1019 G 979
1020 A 978
1021 A 0
1022 C 977
1023 A 976
1024 C 975
1025 A 0
1026 G 1190
1027 G 1189
1028 U 0
1029 G 1188
1030 C 1187
1031 U 1186
1032 G 1185
1033 C 0
1034 A 0
1035 U 1184
1036 G 1183
1037 G 1179
1038 C 1178
1039 U 1177
1040 G 1175
1041 U 1174
1042 C 1173
1043 G 1172
1044 U 0
1045 C 0
1046 A 0
1047 G 1086
1048 C 1085
1049 U 1084
1050 C 1083
1051 G 1082
1052 U 1081
1053 G 1062
1054 U 1061
1055 C 1060
1056 G 0
1057 U 0
1058 G 0
1059 A 0
1060 G 1055
1061 A 1054
1062 U 1053
1063 G 0
1064 U 0
1065 U 1078
1066 G 1077
1067 G 1076
1068 G 1075
1069 U 0
1070 U 0
1071 A 0
1072 A 0
1073 G 0
1074 U 0
1075 C 1068
1076 C 1067
1077 C 1066
1078 G 1065
1079 C 0
1080 A 0
1081 A 1052
1082 C 1051
1083 G 1050
1084 A 1049
1085 G 1048
1086 C 1047
1087 G 0
1088 C 0
1089 A 0
1090 A 0
1091 C 0
1092 C 1167
1093 C 1166
1094 U 1165
1095 U 1164
1096 G 0
1097 U 1135
1098 C 1134
1099 C 1133
1100 U 1132
1101 U 1131
1102 A 1130
1103 G 1129
1104 U 0
1105 U 0
1106 G 0
1107 C 1124
1108 C 1123
1109 A 0
1110 G 0
1111 C 1122
1112 A 1121
1113 C 1120
1114 G 0
1115 U 0
1116 A 0
1117 A 0
1118 U 0
1119 G 0
1120 G 1113
1121 U 1112
1122 G 1111
1123 G 1108
1124 G 1107
1125 A 0
1126 A 0
1127 C 0
1128 U 0
1129 C 1103
1130 U 1102
1131 A 1101
1132 A 1100
1133 G 1099
1134 G 1098
1135 A 1097
1136 G 0
1137 A 0
1138 C 1158
1139 U 1157
1140 G 1156
1141 C 1155
1142 C 1154
1143 G 1153
1144 G 1152
1145 U 1151
1146 G 0
1147 A 0
1148 C 0
1149 A 0
1150 A 0
1151 A 1145
1152 C 1144
1153 C 1143
1154 G 1142
1155 G 1141
1156 A 1140
1157 G 1139
1158 G 1138
1159 A 0
1160 A 0
1161 G 0
1162 G 0
1163 U 0
1164 G 1095
1165 G 1094
1166 G 1093
1167 G 1092
1168 A 0
1169 U 0
1170 G 0
1171 A 0
1172 C 1043
1173 G 1042
1174 U 1041
1175 C 1040
1176 A 0
1177 A 1039
1178 G 1038
1179 U 1037
1180 C 0
1181 A 0
1182 U 0
1183 C 1036
1184 A 1035
1185 U 1032
1186 G 1031
1187 G 1030
1188 C 1029
1189 C 1027
1190 C 1026
1191 U 0
1192 U 0
1193 A 0
1194 U 0
1195 G 969
1196 G 968
1197 C 967
1198 C 966
1199 A 965
1200 G 964
1201 G 963
1202 G 0
1203 C 0
1204 U 0
1205 A 934
1206 C 933
1207 A 0
1208 C 932
1209 A 931
1210 C 930
1211 G 929
1212 U 928
1213 G 927
1214 C 926
1215 U 925
1216 A 924
1217 C 923
1218 A 0
1219 A 0
1220 U 0
1221 G 1276
1222 G 1275
1223 G 1274
1224 C 1273
1225 G 1272
1226 G 1271
1227 U 1270
1228 A 0
1229 C 0
1230 A 0
1231 G 0
1232 A 0
1233 G 1264
1234 G 1263
1235 G 1262
1236 U 0
1237 U 0
1238 G 1257
1239 C 1256
1240 C 0
1241 A 0
1242 A 0
1243 G 1252
1244 C 1251
1245 C 1250
1246 G 0
1247 C 0
1248 G 0
1249 A 0
1250 G 1245
1251 G 1244
1252 U 1243
1253 G 0
1254 G 0
1255 A 0
1256 G 1239
1257 C 1238
1258 U 0
1259 A 0
1260 A 0
1261 U 0
1262 C 1235
1263 C 1234
1264 C 1233
1265 A 0
1266 A 0
1267 A 0
1268 A 0
1269 A 0
1270 A 1227
1271 C 1226
1272 C 1225
1273 G 1224
1274 C 1223
1275 U 1222
1276 C 1221
1277 G 0
1278 U 0
1279 A 0
1280 G 0
1281 U 0
1282 C 0
1283 C 1314
1284 G 0
1285 G 0
1286 A 0
1287 U 1310
1288 U 1309
1289 G 1308
1290 G 1307
1291 A 1306
1292 G 1305
1293 U 1304
1294 C 1303
1295 U 0
1296 G 0
1297 C 0
1298 A 0
1299 A 0
1300 C 0
1301 U 0
1302 C 0
1303 G 1294
1304 A 1293
1305 C 1292
1306 U 1291
1307 C 1290
1308 C 1289
1309 A 1288
1310 U 1287
1311 G 0
1312 A 0
1313 A 0
1314 G 1283
1315 U 0
1316 C 0
1317 G 0
1318 G 0
1319 A 0
1320 A 922
1321 U 921
1322 C 920
1323 G 919
1324 C 918
1325 U 0
1326 A 0
1327 G 0
1328 U 0
1329 A 0
1330 A 1352
1331 U 1351
1332 C 1350
1333 G 1349
1334 C 1348
1335 A 1347
1336 G 1346
1337 G 1345
1338 U 0
1339 C 0
1340 A 0
1341 G 0
1342 C 0
1343 A 0
1344 U 0
1345 A 1337
1346 C 1336
1347 U 1335
1348 G 1334
1349 C 1333
1350 G 1332
1351 G 1331
1352 U 1330
1353 G 0
1354 A 0
1355 A 0
1356 U 0
1357 A 0
1358 C 0
1359 G 915
1360 U 914
1361 U 0
1362 C 0
1363 C 0
1364 C 912
1365 G 911
1366 G 910
1367 G 909
1368 C 908
1369 C 907
1370 U 906
1371 U 904
1372 G 903
1373 U 902
1374 A 0
1375 C 901
1376 A 900
1377 C 0
1378 A 0
1379 C 1484
1380 C 0
1381 G 1481
1382 C 1480
1383 C 0
1384 C 1477
1385 G 1476
1386 U 0
1387 C 0
1388 A 0
1389 C 1471
1390 A 1470
1391 C 1469
1392 C 1468
1393 A 1467
1394 U 1466
1395 G 1465
1396 G 1464
1397 G 0
1398 A 0
1399 G 1461
1400 U 1460
1401 U 1459
1402 G 1458
1403 G 1457
1404 U 1456
1405 U 1455
1406 G 1454
1407 U 1453
1408 A 1452
1409 C 1451
1410 C 1450
1411 A 0
1412 G 0
1413 A 0
1414 A 0
1415 G 1446
1416 U 1445
1417 A 1444
1418 G 1443
1419 G 1442
1420 U 1441
1421 A 0
1422 G 1440
1423 U 1439
1424 C 1438
1425 U 1437
1426 A 0
1427 A 0
1428 C 1435
1429 C 1434
1430 G 0
1431 U 0
1432 A 0
1433 A 0
1434 N 1429
1435 G 1428
1436 A 0
1437 G 1425
1438 G 1424
1439 A 1423
1440 C 1422
1441 G 1420
1442 C 1419
1443 U 1418
1444 U 1417
1445 A 1416
1446 C 1415
1447 C 0
1448 A 0
1449 C 0
1450 G 1410
1451 G 1409
1452 U 1408
1453 A 1407
1454 U 1406
1455 G 1405
1456 G 1404
1457 U 1403
1458 C 1402
1459 A 1401
1460 A 1400
1461 U 1399
1462 G 0
1463 A 0
1464 C 1396
1465 U 1395
1466 G 1394
1467 G 1393
1468 G 1392
1469 G 1391
1470 U 1390
1471 G 1389
1472 A 0
1473 A 0
1474 G 0
1475 U 0
1476 C 1385
1477 G 1384
1478 U 0
1479 A 0
1480 A 1382
1481 C 1381
1482 A 0
1483 A 0
1484 G 1379
1485 N 0
1486 N 1509
1487 N 1508
1488 N 1507
1489 N 1506
1490 N 1505
1491 N 1504
1492 N 1503
1493 N 1502
1494 N 1501
1495 N 1500
1496 N 0
1497 N 0
1498 N 0
1499 N 0
1500 N 1495
1501 N 1494
1502 N 1493
1503 N 1492
1504 N 1491
1505 N 1490
1506 N 1489
1507 N 1488
1508 N 1487
1509 N 1486
1510 N 0
1511 N 0
1512 N 0
1513 N 0
1514 N 0
1515 N 0
1516 N 0
1517 N 0
1518 N 0
1519 N 0
1520 N 0
1521 N 0
1522 N 0