Filename: d.16.b.C.innocuum.bpseq
Organism: Clostridium innocuum
Accession Number: M23732
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 C 0
2 A 0
3 N 0
4 N 0
5 A 0
6 U 0
7 G 0
8 G 0
9 A 0
10 G 26
11 A 25
12 G 24
13 U 23
14 U 22
15 U 0
16 G 0
17 A 0
18 U 922
19 C 921
20 C 920
21 U 0
22 G 14
23 G 13
24 C 12
25 U 11
26 C 10
27 A 0
28 G 568
29 G 567
30 A 566
31 U 565
32 G 0
33 A 564
34 A 563
35 C 562
36 G 561
37 C 560
38 U 559
39 G 0
40 G 415
41 C 414
42 G 413
43 G 412
44 C 411
45 A 410
46 U 408
47 G 407
48 C 373
49 C 0
50 U 0
51 A 0
52 A 0
53 U 371
54 A 370
55 C 369
56 A 0
57 U 368
58 G 367
59 C 366
60 A 0
61 A 0
62 G 108
63 U 107
64 C 106
65 G 0
66 A 0
67 A 105
68 C 104
69 G 103
70 A 102
71 A 101
72 G 100
73 U 99
74 C 98
75 U 97
76 U 96
77 C 0
78 A 0
79 G 92
80 G 91
81 A 90
82 A 89
83 G 88
84 C 0
85 U 0
86 U 0
87 G 0
88 C 83
89 U 82
90 U 81
91 C 80
92 C 79
93 A 0
94 A 0
95 A 0
96 A 76
97 A 75
98 G 74
99 A 73
100 C 72
101 U 71
102 U 70
103 A 69
104 G 68
105 U 67
106 G 64
107 G 63
108 C 62
109 G 0
110 A 0
111 A 0
112 C 0
113 G 0
114 G 0
115 G 326
116 U 325
117 G 324
118 A 0
119 G 0
120 U 0
121 A 0
122 A 0
123 C 0
124 A 251
125 C 250
126 G 249
127 U 248
128 A 247
129 G 246
130 G 245
131 U 244
132 A 0
133 A 0
134 C 243
135 C 242
136 U 0
137 G 0
138 C 0
139 C 239
140 C 238
141 A 237
142 U 236
143 G 235
144 U 234
145 G 233
146 U 0
147 C 181
148 C 180
149 G 179
150 G 178
151 G 0
152 A 0
153 U 0
154 A 0
155 A 172
156 C 171
157 U 170
158 G 169
159 C 168
160 U 167
161 G 166
162 G 0
163 A 0
164 A 0
165 A 0
166 C 161
167 G 160
168 G 159
169 U 158
170 A 157
171 G 156
172 C 155
173 U 0
174 A 0
175 A 0
176 A 0
177 A 0
178 C 150
179 C 149
180 G 148
181 G 147
182 A 0
183 U 0
184 A 0
185 G 0
186 G 211
187 U 210
188 A 209
189 U 208
190 A 207
191 C 206
192 G 205
193 G 204
194 A 203
195 G 202
196 C 201
197 G 0
198 C 0
199 A 0
200 U 0
201 G 196
202 C 195
203 U 194
204 C 193
205 U 192
206 G 191
207 U 190
208 A 189
209 U 188
210 A 187
211 U 186
212 U 0
213 A 0
214 A 0
215 A 0
216 G 231
217 C 230
218 G 229
219 C 228
220 C 227
221 C 0
222 U 0
223 U 0
224 C 0
225 A 0
226 A 0
227 G 220
228 G 219
229 C 218
230 G 217
231 U 216
232 G 0
233 A 145
234 A 144
235 C 143
236 A 142
237 U 141
238 G 140
239 G 139
240 A 0
241 U 0
242 G 135
243 G 134
244 A 131
245 C 130
246 C 129
247 U 128
248 G 127
249 C 126
250 G 125
251 A 124
252 C 298
253 G 297
254 C 296
255 A 0
256 U 0
257 U 295
258 A 0
259 G 289
260 C 288
261 U 287
262 A 0
263 G 0
264 U 286
265 U 285
266 G 284
267 G 283
268 U 282
269 G 281
270 A 280
271 G 279
272 G 0
273 U 0
274 A 0
275 A 0
276 C 0
277 G 0
278 G 0
279 C 271
280 C 270
281 C 269
282 A 268
283 C 267
284 C 266
285 A 265
286 A 264
287 G 261
288 G 260
289 C 259
290 G 0
291 A 0
292 U 0
293 G 0
294 A 0
295 U 257
296 G 254
297 C 253
298 G 252
299 U 0
300 A 0
301 G 323
302 C 322
303 C 321
304 G 320
305 G 316
306 C 315
307 C 314
308 U 313
309 G 0
310 A 0
311 G 0
312 A 0
313 G 308
314 G 307
315 G 306
316 U 305
317 A 0
318 A 0
319 A 0
320 C 304
321 G 303
322 G 302
323 C 301
324 C 117
325 A 116
326 C 115
327 A 0
328 U 349
329 U 348
330 G 347
331 G 346
332 G 345
333 A 344
334 C 0
335 U 0
336 G 0
337 A 0
338 G 0
339 A 0
340 C 0
341 A 0
342 C 0
343 G 0
344 G 333
345 C 332
346 C 331
347 C 330
348 A 329
349 A 328
350 A 0
351 C 362
352 U 361
353 C 360
354 C 359
355 U 0
356 A 0
357 C 0
358 G 0
359 G 354
360 G 353
361 A 352
362 G 351
363 G 0
364 C 0
365 A 0
366 G 59
367 C 58
368 A 57
369 G 55
370 U 54
371 A 53
372 G 0
373 G 48
374 G 0
375 A 0
376 A 0
377 U 0
378 U 0
379 U 405
380 U 0
381 C 404
382 G 403
383 U 402
384 C 0
385 A 0
386 A 0
387 U 400
388 G 399
389 G 398
390 G 397
391 G 396
392 G 0
393 A 0
394 A 0
395 A 0
396 C 391
397 C 390
398 C 389
399 U 388
400 G 387
401 A 0
402 A 383
403 C 382
404 G 381
405 A 379
406 G 0
407 C 47
408 A 46
409 A 0
410 U 45
411 G 44
412 C 43
413 C 42
414 G 41
415 C 40
416 G 0
417 U 0
418 G 448
419 A 447
420 G 446
421 U 445
422 G 0
423 A 0
424 A 0
425 G 0
426 A 0
427 A 0
428 G 439
429 G 438
430 U 437
431 C 436
432 U 0
433 U 0
434 C 0
435 G 0
436 G 431
437 A 430
438 U 429
439 C 428
440 G 0
441 U 0
442 A 0
443 A 0
444 A 0
445 G 421
446 C 420
447 U 419
448 C 418
449 U 0
450 G 508
451 U 0
452 U 509
453 G 505
454 U 504
455 A 503
456 A 502
457 G 501
458 U 500
459 G 0
460 A 0
461 A 0
462 G 495
463 A 0
464 A 0
465 C 0
466 G 0
467 G 0
468 C 489
469 U 488
470 C 487
471 A 486
472 U 485
473 A 484
474 G 483
475 A 482
476 G 481
477 G 0
478 A 0
479 A 0
480 A 0
481 U 476
482 G 475
483 C 474
484 U 473
485 A 472
486 U 471
487 G 470
488 G 469
489 G 468
490 A 0
491 G 0
492 U 0
493 G 0
494 A 0
495 C 462
496 G 0
497 G 0
498 U 0
499 A 0
500 G 458
501 C 457
502 U 456
503 U 455
504 A 454
505 C 453
506 C 0
507 A 0
508 G 450
509 A 452
510 A 0
511 A 0
512 G 557
513 C 556
514 C 555
515 A 554
516 C 553
517 G 538
518 G 537
519 C 536
520 U 0
521 A 0
522 A 0
523 C 552
524 U 551
525 A 550
526 C 549
527 G 548
528 U 0
529 G 0
530 C 0
531 C 0
532 A 0
533 G 540
534 Y 539
535 A 0
536 G 519
537 C 518
538 C 517
539 G 534
540 C 533
541 G 0
542 G 0
543 U 0
544 A 0
545 A 0
546 U 0
547 A 0
548 C 527
549 G 526
550 U 525
551 A 524
552 G 523
553 G 516
554 U 515
555 G 514
556 G 513
557 C 512
558 A 0
559 A 38
560 G 37
561 C 36
562 G 35
563 U 34
564 U 33
565 A 31
566 U 30
567 C 29
568 C 28
569 G 0
570 G 0
571 A 0
572 A 0
573 U 0
574 C 0
575 A 0
576 U 0
577 U 0
578 G 0
579 G 887
580 G 886
581 C 885
582 G 870
583 U 869
584 A 0
585 A 0
586 A 0
587 G 884
588 G 0
589 G 775
590 U 774
591 G 773
592 C 772
593 G 0
594 U 769
595 A 0
596 G 768
597 G 767
598 U 766
599 G 0
600 G 662
601 C 661
602 G 660
603 U 659
604 A 658
605 C 657
606 U 656
607 A 0
608 A 655
609 G 654
610 U 651
611 C 650
612 U 649
613 G 648
614 U 647
615 A 646
616 G 645
617 U 644
618 A 643
619 A 0
620 A 0
621 A 0
622 G 0
623 G 0
624 C 640
625 A 639
626 A 638
627 U 637
628 G 636
629 G 635
630 C 0
631 U 0
632 C 0
633 A 0
634 A 0
635 C 629
636 C 628
637 A 627
638 U 626
639 U 625
640 G 624
641 U 0
642 A 0
643 A 618
644 G 617
645 C 616
646 U 615
647 A 614
648 U 613
649 G 612
650 G 611
651 A 610
652 A 0
653 A 0
654 C 609
655 U 608
656 G 606
657 G 605
658 U 604
659 A 603
660 U 602
661 G 601
662 C 600
663 U 0
664 G 0
665 G 0
666 A 762
667 G 761
668 U 760
669 G 758
670 C 757
671 A 756
672 G 755
673 A 754
674 A 753
675 G 0
676 A 0
677 G 751
678 G 750
679 G 749
680 C 748
681 G 747
682 A 746
683 U 745
684 G 728
685 G 727
686 A 0
687 A 0
688 U 724
689 U 723
690 C 722
691 C 721
692 A 720
693 U 719
694 G 718
695 U 717
696 G 0
697 U 0
698 A 0
699 G 710
700 C 709
701 G 708
702 G 0
703 U 0
704 A 0
705 A 0
706 A 0
707 A 0
708 U 701
709 G 700
710 C 699
711 G 0
712 U 0
713 A 0
714 G 0
715 A 0
716 U 0
717 A 695
718 U 694
719 A 693
720 U 692
721 G 691
722 G 690
723 A 689
724 G 688
725 G 0
726 A 0
727 A 685
728 C 684
729 A 0
730 C 0
731 C 0
732 A 0
733 G 744
734 U 0
735 G 0
736 G 743
737 C 742
738 G 0
739 A 0
740 A 0
741 G 0
742 G 737
743 C 736
744 G 733
745 G 683
746 U 682
747 C 681
748 G 680
749 C 679
750 C 678
751 U 677
752 G 0
753 G 674
754 U 673
755 C 672
756 U 671
757 G 670
758 U 669
759 A 0
760 A 668
761 C 667
762 U 666
763 G 0
764 A 0
765 C 0
766 A 598
767 C 597
768 U 596
769 G 594
770 A 0
771 G 0
772 G 592
773 C 591
774 A 590
775 C 589
776 G 0
777 A 0
778 A 0
779 A 0
780 G 821
781 C 820
782 G 819
783 U 818
784 G 817
785 G 816
786 G 0
787 G 0
788 A 0
789 G 815
790 C 814
791 A 0
792 A 0
793 A 0
794 U 810
795 A 809
796 G 808
797 G 807
798 A 0
799 U 0
800 U 0
801 A 0
802 G 0
803 A 0
804 U 0
805 A 0
806 C 0
807 C 797
808 C 796
809 U 795
810 A 794
811 G 0
812 U 0
813 A 0
814 G 790
815 U 789
816 C 785
817 C 784
818 A 783
819 C 782
820 G 781
821 C 780
822 C 0
823 G 0
824 U 0
825 A 0
826 A 0
827 A 0
828 C 0
829 G 0
830 A 0
831 U 0
832 G 883
833 A 882
834 G 881
835 A 880
836 A 879
837 C 878
838 U 0
839 A 0
840 A 861
841 G 860
842 U 859
843 G 858
844 U 857
845 U 856
846 G 855
847 G 854
848 A 853
849 G 0
850 A 0
851 A 0
852 A 0
853 U 848
854 U 847
855 C 846
856 A 845
857 G 844
858 U 843
859 G 842
860 C 841
861 U 840
862 G 0
863 C 0
864 A 0
865 G 872
866 U 871
867 U 0
868 A 0
869 A 583
870 C 582
871 G 866
872 C 865
873 A 0
874 A 0
875 U 0
876 A 0
877 A 0
878 G 837
879 U 836
880 U 835
881 C 834
882 U 833
883 C 832
884 C 587
885 G 581
886 C 580
887 C 579
888 U 0
889 G 916
890 G 915
891 G 914
892 G 0
893 A 0
894 G 0
895 U 0
896 A 0
897 U 0
898 G 909
899 C 908
900 A 907
901 C 906
902 G 0
903 C 0
904 A 0
905 A 0
906 G 901
907 U 900
908 U 899
909 N 898
910 G 0
911 A 0
912 A 0
913 A 0
914 C 891
915 U 890
916 C 889
917 A 0
918 A 0
919 A 0
920 G 20
921 G 19
922 A 18
923 A 0
924 U 0
925 U 1395
926 G 1394
927 A 1392
928 C 1391
929 G 1390
930 G 0
931 G 1389
932 G 1388
933 G 1387
934 C 1386
935 C 1385
936 C 1384
937 G 1383
938 C 0
939 A 1379
940 C 1378
941 A 0
942 A 0
943 G 1343
944 C 1342
945 G 1341
946 N 1340
947 U 1339
948 G 1236
949 G 1235
950 A 1234
951 G 1233
952 U 1232
953 A 1231
954 U 1230
955 G 1229
956 U 1228
957 G 1227
958 G 1225
959 U 1224
960 U 0
961 U 0
962 A 0
963 A 0
964 U 979
965 U 978
966 C 977
967 G 976
968 A 0
969 A 0
970 G 0
971 C 0
972 A 0
973 A 0
974 C 0
975 G 0
976 C 967
977 G 966
978 A 965
979 A 964
980 G 0
981 A 0
982 A 0
983 C 0
984 C 0
985 U 0
986 U 0
987 A 0
988 C 1220
989 C 1219
990 A 1218
991 G 1217
992 G 1216
993 C 1215
994 C 1214
995 U 0
996 U 0
997 G 0
998 A 0
999 C 0
1000 A 1045
1001 U 1044
1002 G 1043
1003 G 1041
1004 A 1040
1005 A 1039
1006 A 1038
1007 C 1037
1008 A 0
1009 A 0
1010 A 0
1011 U 1028
1012 A 1027
1013 C 1026
1014 C 1025
1015 C 1024
1016 U 1023
1017 A 1022
1018 G 0
1019 A 0
1020 G 0
1021 A 0
1022 U 1017
1023 A 1016
1024 G 1015
1025 G 1014
1026 G 1013
1027 G 1012
1028 G 1011
1029 A 0
1030 U 0
1031 A 0
1032 A 0
1033 U 0
1034 U 0
1035 A 0
1036 U 0
1037 G 1007
1038 G 1006
1039 A 1005
1040 U 1004
1041 C 1003
1042 A 0
1043 C 1002
1044 A 1001
1045 C 1000
1046 A 0
1047 G 1209
1048 G 1208
1049 U 0
1050 G 1207
1051 G 1206
1052 U 1205
1053 G 1204
1054 C 0
1055 A 0
1056 U 1203
1057 G 1202
1058 G 1198
1059 U 1197
1060 U 1196
1061 G 1194
1062 U 1193
1063 C 1192
1064 G 1191
1065 U 0
1066 C 0
1067 A 0
1068 G 1107
1069 C 1106
1070 U 1105
1071 C 1104
1072 G 1103
1073 U 1102
1074 G 1083
1075 U 1082
1076 C 1081
1077 G 0
1078 U 0
1079 G 0
1080 A 0
1081 G 1076
1082 A 1075
1083 U 1074
1084 G 0
1085 U 0
1086 U 1099
1087 G 1098
1088 G 1097
1089 G 1096
1090 U 0
1091 U 0
1092 A 0
1093 A 0
1094 G 0
1095 U 0
1096 C 1089
1097 C 1088
1098 C 1087
1099 G 1086
1100 C 0
1101 A 0
1102 A 1073
1103 C 1072
1104 G 1071
1105 A 1070
1106 G 1069
1107 C 1068
1108 G 0
1109 C 0
1110 A 0
1111 A 0
1112 C 0
1113 C 1186
1114 C 1185
1115 U 1184
1116 U 1183
1117 G 0
1118 U 1154
1119 C 1153
1120 G 1152
1121 C 1151
1122 A 1150
1123 U 1149
1124 G 1148
1125 U 0
1126 U 0
1127 A 0
1128 C 1143
1129 C 1142
1130 A 0
1131 G 0
1132 C 1141
1133 A 1140
1134 U 0
1135 C 0
1136 A 0
1137 A 0
1138 G 0
1139 U 0
1140 U 1133
1141 G 1132
1142 G 1129
1143 G 1128
1144 G 0
1145 A 0
1146 C 0
1147 U 0
1148 C 1124
1149 A 1123
1150 U 1122
1151 G 1121
1152 C 1120
1153 G 1119
1154 A 1118
1155 G 0
1156 A 0
1157 C 1177
1158 U 1176
1159 G 1175
1160 C 1174
1161 C 1173
1162 G 1172
1163 G 1171
1164 U 1170
1165 G 0
1166 A 0
1167 C 0
1168 A 0
1169 A 0
1170 A 1164
1171 C 1163
1172 C 1162
1173 G 1161
1174 G 1160
1175 A 1159
1176 G 1158
1177 G 1157
1178 A 0
1179 A 0
1180 G 0
1181 G 0
1182 U 0
1183 G 1116
1184 G 1115
1185 G 1114
1186 G 1113
1187 A 0
1188 U 0
1189 G 0
1190 A 0
1191 C 1064
1192 G 1063
1193 U 1062
1194 C 1061
1195 A 0
1196 A 1060
1197 A 1059
1198 U 1058
1199 C 0
1200 A 0
1201 U 0
1202 C 1057
1203 A 1056
1204 U 1053
1205 G 1052
1206 C 1051
1207 C 1050
1208 C 1048
1209 C 1047
1210 U 0
1211 U 0
1212 A 0
1213 U 0
1214 G 994
1215 G 993
1216 C 992
1217 C 991
1218 U 990
1219 G 989
1220 G 988
1221 G 0
1222 C 0
1223 U 0
1224 A 959
1225 C 958
1226 A 0
1227 C 957
1228 A 956
1229 C 955
1230 G 954
1231 U 953
1232 A 952
1233 C 951
1234 U 950
1235 A 949
1236 C 948
1237 A 0
1238 A 0
1239 U 0
1240 G 1295
1241 G 1294
1242 C 1293
1243 G 1292
1244 A 1291
1245 C 1290
1246 C 1289
1247 A 0
1248 C 0
1249 A 0
1250 A 0
1251 A 0
1252 G 1283
1253 A 1282
1254 G 1281
1255 C 0
1256 A 0
1257 G 1276
1258 C 1275
1259 G 0
1260 A 0
1261 C 0
1262 U 1271
1263 U 1270
1264 G 1269
1265 G 0
1266 U 0
1267 G 0
1268 A 0
1269 C 1264
1270 A 1263
1271 A 1262
1272 G 0
1273 A 0
1274 A 0
1275 G 1258
1276 C 1257
1277 G 0
1278 A 0
1279 A 0
1280 U 0
1281 C 1254
1282 U 1253
1283 C 1252
1284 A 0
1285 U 0
1286 A 0
1287 A 0
1288 A 0
1289 G 1246
1290 A 1245
1291 U 1244
1292 C 1243
1293 G 1242
1294 U 1241
1295 C 1240
1296 U 0
1297 C 0
1298 A 0
1299 G 0
1300 U 0
1301 U 0
1302 C 1333
1303 G 0
1304 G 0
1305 A 0
1306 U 1329
1307 U 1328
1308 G 1327
1309 A 1326
1310 A 1325
1311 G 1324
1312 U 1323
1313 C 1322
1314 U 0
1315 G 0
1316 C 0
1317 A 0
1318 A 0
1319 C 0
1320 U 0
1321 C 0
1322 G 1313
1323 A 1312
1324 C 1311
1325 U 1310
1326 U 1309
1327 C 1308
1328 A 1307
1329 U 1306
1330 G 0
1331 A 0
1332 A 0
1333 G 1302
1334 U 0
1335 C 0
1336 G 0
1337 G 0
1338 A 0
1339 A 947
1340 U 946
1341 C 945
1342 G 944
1343 C 943
1344 U 0
1345 A 0
1346 G 0
1347 U 0
1348 A 0
1349 A 1371
1350 U 1370
1351 C 1369
1352 G 1368
1353 C 1367
1354 A 1366
1355 G 1365
1356 A 1364
1357 U 0
1358 C 0
1359 A 0
1360 G 0
1361 C 0
1362 A 0
1363 U 0
1364 G 1356
1365 C 1355
1366 U 1354
1367 G 1353
1368 C 1352
1369 G 1351
1370 G 1350
1371 U 1349
1372 G 0
1373 A 0
1374 A 0
1375 U 0
1376 A 0
1377 C 0
1378 G 940
1379 U 939
1380 U 0
1381 C 0
1382 U 0
1383 C 937
1384 G 936
1385 G 935
1386 G 934
1387 C 933
1388 C 932
1389 U 931
1390 U 929
1391 G 928
1392 U 927
1393 A 0
1394 C 926
1395 A 925
1396 C 0
1397 A 0
1398 C 1503
1399 C 0
1400 G 1500
1401 C 1499
1402 C 0
1403 C 1496
1404 G 1495
1405 U 0
1406 C 0
1407 A 0
1408 A 1490
1409 A 1489
1410 C 1488
1411 C 1487
1412 A 1486
1413 U 1485
1414 G 1484
1415 G 1483
1416 G 0
1417 A 0
1418 G 1480
1419 U 1479
1420 C 1478
1421 A 1477
1422 G 1476
1423 U 1475
1424 A 1474
1425 A 1473
1426 U 1472
1427 A 1471
1428 C 1470
1429 C 1469
1430 C 0
1431 G 0
1432 A 0
1433 A 0
1434 G 1465
1435 C 1464
1436 C 1463
1437 G 1462
1438 G 1461
1439 U 1460
1440 G 0
1441 G 1459
1442 C 1458
1443 A 1457
1444 U 1456
1445 A 0
1446 A 0
1447 C 1454
1448 C 1453
1449 G 0
1450 U 0
1451 A 0
1452 A 0
1453 G 1448
1454 G 1447
1455 A 0
1456 G 1444
1457 U 1443
1458 G 1442
1459 A 1441
1460 G 1439
1461 C 1438
1462 C 1437
1463 G 1436
1464 U 1435
1465 C 1434
1466 G 0
1467 A 0
1468 A 0
1469 G 1429
1470 G 1428
1471 U 1427
1472 A 1426
1473 G 1425
1474 G 1424
1475 A 1423
1476 C 1422
1477 C 1421
1478 G 1420
1479 A 1419
1480 U 1418
1481 G 0
1482 A 0
1483 C 1415
1484 U 1414
1485 G 1413
1486 G 1412
1487 G 1411
1488 G 1410
1489 U 1409
1490 U 1408
1491 A 0
1492 A 0
1493 G 0
1494 U 0
1495 C 1404
1496 G 1403
1497 U 0
1498 A 0
1499 A 1401
1500 C 1400
1501 A 0
1502 A 0
1503 G 1398
1504 G 0
1505 U 1528
1506 A 1527
1507 U 1526
1508 C 1525
1509 C 1524
1510 C 1523
1511 U 1522
1512 A 1521
1513 C 1520
1514 G 1519
1515 G 0
1516 G 0
1517 A 0
1518 A 0
1519 C 1514
1520 G 1513
1521 U 1512
1522 G 1511
1523 G 1510
1524 G 1509
1525 G 1508
1526 A 1507
1527 U 1506
1528 G 1505
1529 G 0
1530 A 0
1531 U 0
1532 C 0
1533 A 0
1534 C 0
1535 C 0
1536 U 0
1537 C 0
1538 C 0
1539 U 0
1540 U 0
1541 U 0
1542 C 0
1543 U 0