Filename: d.16.b.Cristispira.CP1.bpseq Organism: Cristispira CP1 Accession Number: U42638 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 0 9 N 25 10 N 24 11 N 23 12 N 22 13 N 21 14 N 0 15 N 0 16 N 0 17 N 906 18 N 905 19 N 904 20 N 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 545 28 A 544 29 A 543 30 C 542 31 G 0 32 A 541 33 A 540 34 C 539 35 A 538 36 C 537 37 U 536 38 A 0 39 G 395 40 C 394 41 G 393 42 A 392 43 U 391 44 G 390 45 C 388 46 G 387 47 U 353 48 C 0 49 U 0 50 U 0 51 A 0 52 G 351 53 A 350 54 U 349 55 A 0 56 U 348 57 G 347 58 C 346 59 A 0 60 A 0 61 G 88 62 U 87 63 C 86 64 G 0 65 A 0 66 A 85 67 C 84 68 G 83 69 A 82 70 U 81 71 A 80 72 U 79 73 A 78 74 U 0 75 U 0 76 U 0 77 A 0 78 U 73 79 A 72 80 U 71 81 A 70 82 U 69 83 A 68 84 G 67 85 U 66 86 G 63 87 G 62 88 C 61 89 G 0 90 A 0 91 A 0 92 C 0 93 G 0 94 G 0 95 G 306 96 U 305 97 G 304 98 A 0 99 G 0 100 U 0 101 A 0 102 A 0 103 C 0 104 A 231 105 U 230 106 G 229 107 U 228 108 A 227 109 G 226 110 G 225 111 U 224 112 A 0 113 A 0 114 U 223 115 C 222 116 U 0 117 A 0 118 C 0 119 C 219 120 A 218 121 U 217 122 G 216 123 A 215 124 A 214 125 G 213 126 U 159 127 G 158 128 G 157 129 G 156 130 G 0 131 A 0 132 U 0 133 A 0 134 G 150 135 C 149 136 U 148 137 U 147 138 A 146 139 G 145 140 G 144 141 A 0 142 A 0 143 A 0 144 C 140 145 C 139 146 U 138 147 A 137 148 A 136 149 G 135 150 G 134 151 U 0 152 A 0 153 A 0 154 U 0 155 A 0 156 C 129 157 C 128 158 G 127 159 C 126 160 A 0 161 U 0 162 A 0 163 U 0 164 C 0 165 U 186 166 U 185 167 U 184 168 A 183 169 U 182 170 A 181 171 G 180 172 A 179 173 U 178 174 G 0 175 U 0 176 U 0 177 G 0 178 A 173 179 U 172 180 C 171 181 U 170 182 A 169 183 U 168 184 A 167 185 A 166 186 A 165 187 G 0 188 A 0 189 A 0 190 A 0 191 G 0 192 G 211 193 A 210 194 A 209 195 C 207 196 U 206 197 C 205 198 G 204 199 A 0 200 A 0 201 U 0 202 U 0 203 A 0 204 U 198 205 G 197 206 G 196 207 G 195 208 U 0 209 U 194 210 U 193 211 C 192 212 G 0 213 C 125 214 U 124 215 U 123 216 U 122 217 A 121 218 U 120 219 G 119 220 A 0 221 U 0 222 G 115 223 A 114 224 G 111 225 C 110 226 U 109 227 U 108 228 G 107 229 C 106 230 A 105 231 C 104 232 C 278 233 U 277 234 G 276 235 A 0 236 U 0 237 U 275 238 A 0 239 G 269 240 C 268 241 U 267 242 U 0 243 G 0 244 U 266 245 U 265 246 G 264 247 G 263 248 U 262 249 A 261 250 G 260 251 G 259 252 G 0 253 U 0 254 A 0 255 A 0 256 A 0 257 A 0 258 G 0 259 C 251 260 C 250 261 U 249 262 A 248 263 C 247 264 C 246 265 A 245 266 A 244 267 G 241 268 G 240 269 C 239 270 G 0 271 A 0 272 C 0 273 G 0 274 A 0 275 U 237 276 C 234 277 A 233 278 G 232 279 U 0 280 A 0 281 G 303 282 C 302 283 C 301 284 G 300 285 G 296 286 C 295 287 C 294 288 U 293 289 G 0 290 A 0 291 G 0 292 A 0 293 G 288 294 G 287 295 G 286 296 C 285 297 G 0 298 A 0 299 U 0 300 C 284 301 G 283 302 G 282 303 U 281 304 C 97 305 A 96 306 C 95 307 A 0 308 U 329 309 U 328 310 G 327 311 G 326 312 A 325 313 A 324 314 C 0 315 U 0 316 G 0 317 A 0 318 G 0 319 A 0 320 U 0 321 A 0 322 C 0 323 G 0 324 G 313 325 U 312 326 C 311 327 C 310 328 A 309 329 G 308 330 A 0 331 C 342 332 C 341 333 A 340 334 C 339 335 U 0 336 A 0 337 C 0 338 G 0 339 G 334 340 U 333 341 G 332 342 G 331 343 G 0 344 C 0 345 A 0 346 G 58 347 C 57 348 A 56 349 G 54 350 U 53 351 C 52 352 A 0 353 A 47 354 G 0 355 A 0 356 A 0 357 U 0 358 C 0 359 U 385 360 U 0 361 C 384 362 C 383 363 G 382 364 C 0 365 A 0 366 A 0 367 U 380 368 G 379 369 G 378 370 G 377 371 C 376 372 G 0 373 A 0 374 A 0 375 A 0 376 G 371 377 C 370 378 C 369 379 U 368 380 G 367 381 A 0 382 C 363 383 G 362 384 G 361 385 A 359 386 G 0 387 C 46 388 G 45 389 A 0 390 C 44 391 A 43 392 U 42 393 C 41 394 G 40 395 C 39 396 G 0 397 U 0 398 G 428 399 G 427 400 G 426 401 U 425 402 G 0 403 A 0 404 U 0 405 G 0 406 A 0 407 A 0 408 G 419 409 G 418 410 U 417 411 G 416 412 G 0 413 A 0 414 A 0 415 A 0 416 C 411 417 A 410 418 U 409 419 C 408 420 G 0 421 U 0 422 A 0 423 A 0 424 A 0 425 A 401 426 C 400 427 C 399 428 C 398 429 U 0 430 U 486 431 U 0 432 U 487 433 A 483 434 U 482 435 A 481 436 G 480 437 A 479 438 U 478 439 G 0 440 A 0 441 A 0 442 G 473 443 A 0 444 A 0 445 U 0 446 A 0 447 A 0 448 G 467 449 C 466 450 U 465 451 U 464 452 U 463 453 A 462 454 A 461 455 G 460 456 G 0 457 A 0 458 A 0 459 A 0 460 U 455 461 G 454 462 U 453 463 A 452 464 A 451 465 A 450 466 G 449 467 U 448 468 G 0 469 A 0 470 U 0 471 G 0 472 A 0 473 C 442 474 A 0 475 U 0 476 U 0 477 A 0 478 G 438 479 U 437 480 C 436 481 U 435 482 A 434 483 U 433 484 G 0 485 A 0 486 C 430 487 U 432 488 A 0 489 A 0 490 G 0 491 U 534 492 C 533 493 C 532 494 C 531 495 G 516 496 G 515 497 C 514 498 U 0 499 A 0 500 A 0 501 U 530 502 U 529 503 A 528 504 C 527 505 G 526 506 U 0 507 G 0 508 C 0 509 C 0 510 A 0 511 G 518 512 C 517 513 A 0 514 G 497 515 C 496 516 C 495 517 G 512 518 C 511 519 G 0 520 G 0 521 U 0 522 A 0 523 A 0 524 U 0 525 A 0 526 C 505 527 G 504 528 U 503 529 A 502 530 A 501 531 G 494 532 G 493 533 G 492 534 G 491 535 A 0 536 A 37 537 G 36 538 U 35 539 G 34 540 U 33 541 U 32 542 G 30 543 U 29 544 U 28 545 C 27 546 G 0 547 G 0 548 A 0 549 A 0 550 U 0 551 U 0 552 A 0 553 U 0 554 U 0 555 G 0 556 G 871 557 G 870 558 U 869 559 G 854 560 U 853 561 A 0 562 A 0 563 A 0 564 G 868 565 G 0 566 G 753 567 C 752 568 A 751 569 U 750 570 G 0 571 U 747 572 A 0 573 G 746 574 G 745 575 C 744 576 G 0 577 G 640 578 U 639 579 U 638 580 U 637 581 A 636 582 A 635 583 U 634 584 A 0 585 A 633 586 G 632 587 U 629 588 C 628 589 U 627 590 A 626 591 A 625 592 U 624 593 A 623 594 U 622 595 U 621 596 A 0 597 A 0 598 A 0 599 G 0 600 A 618 601 C 617 602 U 616 603 C 615 604 A 614 605 A 613 606 G 612 607 C 0 608 U 0 609 C 0 610 A 0 611 A 0 612 C 606 613 U 605 614 U 604 615 G 603 616 A 602 617 G 601 618 G 600 619 A 0 620 A 0 621 U 595 622 G 594 623 U 593 624 G 592 625 U 591 626 U 590 627 A 589 628 G 588 629 A 587 630 A 0 631 A 0 632 C 586 633 U 585 634 A 583 635 U 582 636 C 581 637 A 580 638 A 579 639 A 578 640 C 577 641 U 0 642 A 0 643 G 0 644 A 740 645 G 739 646 U 738 647 U 737 648 U 735 649 A 734 650 G 733 651 A 732 652 A 731 653 G 0 654 A 0 655 G 729 656 G 728 657 A 727 658 A 726 659 A 725 660 A 724 661 U 723 662 A 706 663 G 705 664 A 0 665 A 0 666 U 702 667 U 701 668 U 700 669 C 699 670 U 698 671 A 697 672 G 696 673 U 695 674 G 0 675 U 0 676 A 0 677 G 688 678 U 687 679 G 686 680 G 0 681 U 0 682 G 0 683 A 0 684 U 0 685 A 0 686 U 679 687 C 678 688 U 677 689 U 0 690 C 0 691 A 0 692 G 0 693 A 0 694 U 0 695 A 673 696 U 672 697 U 671 698 A 670 699 G 669 700 G 668 701 A 667 702 G 666 703 G 0 704 A 0 705 A 663 706 U 662 707 G 0 708 C 0 709 C 0 710 A 0 711 G 722 712 A 0 713 G 0 714 G 721 715 U 720 716 G 0 717 A 0 718 A 0 719 G 0 720 G 715 721 C 714 722 G 711 723 A 661 724 U 660 725 U 659 726 U 658 727 U 657 728 C 656 729 U 655 730 A 0 731 G 652 732 U 651 733 C 650 734 U 649 735 A 648 736 A 0 737 A 647 738 A 646 739 C 645 740 U 644 741 G 0 742 A 0 743 C 0 744 G 575 745 C 574 746 U 573 747 G 571 748 A 0 749 U 0 750 A 569 751 U 568 752 G 567 753 C 566 754 G 0 755 A 0 756 A 0 757 A 0 758 G 799 759 C 798 760 A 797 761 U 796 762 G 795 763 G 794 764 G 0 765 U 0 766 A 0 767 G 793 768 C 792 769 A 0 770 A 0 771 A 0 772 C 788 773 U 787 774 G 786 775 A 785 776 A 0 777 U 0 778 U 0 779 A 0 780 G 0 781 A 0 782 U 0 783 A 0 784 C 0 785 U 775 786 C 774 787 A 773 788 G 772 789 G 0 790 U 0 791 A 0 792 G 768 793 U 767 794 C 763 795 C 762 796 A 761 797 U 760 798 G 759 799 C 758 800 U 0 801 G 0 802 U 0 803 A 0 804 A 0 805 A 0 806 C 0 807 G 0 808 A 0 809 U 0 810 G 867 811 U 866 812 A 865 813 U 864 814 A 863 815 C 862 816 U 0 817 A 0 818 G 845 819 A 844 820 U 843 821 C 842 822 U 841 823 U 840 824 G 839 825 G 838 826 A 837 827 U 836 828 U 835 829 U 834 830 U 0 831 U 0 832 U 0 833 U 0 834 G 829 835 G 828 836 A 827 837 U 826 838 U 825 839 U 824 840 G 823 841 G 822 842 G 821 843 A 820 844 U 819 845 C 818 846 G 0 847 A 0 848 A 0 849 G 856 850 C 855 851 U 0 852 A 0 853 A 560 854 C 559 855 G 850 856 C 849 857 G 0 858 U 0 859 U 0 860 A 0 861 A 0 862 G 815 863 U 814 864 A 813 865 U 812 866 A 811 867 C 810 868 C 564 869 A 558 870 C 557 871 C 556 872 U 0 873 G 900 874 G 899 875 G 898 876 G 0 877 A 0 878 G 0 879 U 0 880 A 0 881 U 0 882 G 893 883 C 892 884 U 891 885 C 890 886 G 0 887 C 0 888 A 0 889 A 0 890 G 885 891 A 884 892 G 883 893 U 882 894 G 0 895 A 0 896 A 0 897 A 0 898 C 875 899 U 874 900 C 873 901 A 0 902 A 0 903 A 0 904 G 19 905 G 18 906 A 17 907 A 0 908 U 0 909 U 1380 910 G 1379 911 A 1377 912 C 1376 913 G 1375 914 G 0 915 G 1374 916 G 1373 917 G 1372 918 C 1371 919 C 1370 920 C 1369 921 G 1368 922 C 0 923 A 1364 924 C 1363 925 A 0 926 A 0 927 G 1328 928 C 1327 929 G 1326 930 G 1325 931 U 1324 932 G 1222 933 G 1221 934 A 1220 935 G 1219 936 C 1218 937 A 1217 938 U 1216 939 G 1215 940 U 1214 941 G 1213 942 G 1211 943 U 1210 944 U 0 945 U 0 946 A 0 947 A 0 948 U 963 949 U 962 950 C 961 951 G 960 952 A 0 953 U 0 954 G 0 955 A 0 956 U 0 957 A 0 958 C 0 959 G 0 960 C 951 961 G 950 962 A 949 963 G 948 964 A 0 965 A 0 966 A 0 967 U 0 968 C 0 969 U 0 970 U 0 971 A 0 972 C 1206 973 C 1205 974 A 1204 975 G 1203 976 G 1202 977 G 1201 978 C 1200 979 U 0 980 U 0 981 G 0 982 A 0 983 C 0 984 A 1032 985 U 1031 986 A 1030 987 U 1029 988 A 1028 989 G 1027 990 U 1026 991 A 1025 992 G 1024 993 A 0 994 A 0 995 A 1012 996 A 1011 997 G 1010 998 U 1009 999 G 1008 1000 U 1007 1001 A 1006 1002 G 0 1003 A 0 1004 G 0 1005 A 0 1006 U 1001 1007 A 1000 1008 C 999 1009 A 998 1010 C 997 1011 U 996 1012 C 995 1013 C 0 1014 U 1023 1015 A 1022 1016 G 1021 1017 C 0 1018 U 0 1019 U 0 1020 G 0 1021 C 1016 1022 U 1015 1023 A 1014 1024 C 992 1025 U 991 1026 G 990 1027 C 989 1028 U 988 1029 A 987 1030 U 986 1031 A 985 1032 C 984 1033 A 0 1034 G 1195 1035 G 1194 1036 U 0 1037 G 1193 1038 U 1192 1039 U 1191 1040 G 1190 1041 C 0 1042 A 0 1043 U 1189 1044 G 1188 1045 G 1184 1046 C 1183 1047 U 1182 1048 G 1180 1049 U 1179 1050 C 1178 1051 G 1177 1052 U 0 1053 C 0 1054 A 0 1055 G 1094 1056 C 1093 1057 U 1092 1058 C 1091 1059 G 1090 1060 U 1089 1061 G 1070 1062 C 1069 1063 C 1068 1064 G 0 1065 U 0 1066 G 0 1067 A 0 1068 G 1063 1069 G 1062 1070 U 1061 1071 G 0 1072 U 0 1073 U 1086 1074 G 1085 1075 G 1084 1076 G 1083 1077 U 0 1078 U 0 1079 A 0 1080 A 0 1081 G 0 1082 U 0 1083 C 1076 1084 C 1075 1085 C 1074 1086 G 1073 1087 C 0 1088 A 0 1089 A 1060 1090 C 1059 1091 G 1058 1092 A 1057 1093 G 1056 1094 C 1055 1095 G 0 1096 C 0 1097 A 0 1098 A 0 1099 C 0 1100 C 1172 1101 C 1171 1102 U 1170 1103 U 1169 1104 G 0 1105 U 1141 1106 C 1140 1107 G 1139 1108 U 1138 1109 C 1137 1110 U 1136 1111 G 1135 1112 U 0 1113 U 0 1114 A 0 1115 C 1130 1116 U 1129 1117 A 0 1118 A 0 1119 C 1128 1120 A 1127 1121 U 0 1122 U 0 1123 A 0 1124 A 0 1125 G 0 1126 U 0 1127 U 1120 1128 G 1119 1129 A 1116 1130 G 1115 1131 G 0 1132 A 0 1133 C 0 1134 U 0 1135 C 1111 1136 A 1110 1137 G 1109 1138 A 1108 1139 C 1107 1140 G 1106 1141 A 1105 1142 G 0 1143 A 0 1144 C 1163 1145 U 1162 1146 G 1161 1147 C 1160 1148 C 1159 1149 U 1158 1150 C 1157 1151 U 1156 1152 G 0 1153 U 0 1154 A 0 1155 A 0 1156 G 1151 1157 G 1150 1158 A 1149 1159 G 1148 1160 G 1147 1161 A 1146 1162 G 1145 1163 G 1144 1164 A 0 1165 A 0 1166 G 0 1167 G 0 1168 U 0 1169 G 1103 1170 A 1102 1171 G 1101 1172 G 1100 1173 A 0 1174 U 0 1175 G 0 1176 A 0 1177 C 1051 1178 G 1050 1179 U 1049 1180 C 1048 1181 A 0 1182 A 1047 1183 G 1046 1184 U 1045 1185 C 0 1186 A 0 1187 U 0 1188 C 1044 1189 A 1043 1190 U 1040 1191 G 1039 1192 G 1038 1193 C 1037 1194 C 1035 1195 C 1034 1196 U 0 1197 U 0 1198 A 0 1199 C 0 1200 G 978 1201 U 977 1202 C 976 1203 C 975 1204 U 974 1205 G 973 1206 G 972 1207 G 0 1208 C 0 1209 U 0 1210 A 943 1211 C 942 1212 A 0 1213 C 941 1214 A 940 1215 C 939 1216 G 938 1217 U 937 1218 G 936 1219 C 935 1220 U 934 1221 A 933 1222 C 932 1223 A 0 1224 A 0 1225 U 0 1226 G 1280 1227 G 1279 1228 U 1278 1229 A 1277 1230 U 1276 1231 A 1275 1232 U 1274 1233 A 0 1234 C 0 1235 G 0 1236 A 0 1237 C 0 1238 C 1267 1239 G 1266 1240 A 0 1241 A 0 1242 G 1261 1243 C 1260 1244 G 0 1245 A 0 1246 A 0 1247 A 1256 1248 C 1255 1249 C 1254 1250 G 0 1251 A 0 1252 G 0 1253 A 0 1254 G 1249 1255 G 1248 1256 U 1247 1257 C 0 1258 A 0 1259 A 0 1260 G 1243 1261 C 1242 1262 G 0 1263 A 0 1264 A 0 1265 U 0 1266 C 1239 1267 G 1238 1268 U 0 1269 A 0 1270 C 0 1271 A 0 1272 A 0 1273 A 0 1274 G 1232 1275 U 1231 1276 A 1230 1277 U 1229 1278 A 1228 1279 C 1227 1280 C 1226 1281 G 0 1282 A 0 1283 A 0 1284 G 0 1285 U 0 1286 U 0 1287 C 1318 1288 G 0 1289 G 0 1290 A 0 1291 U 1314 1292 U 1313 1293 G 1312 1294 A 1311 1295 A 1310 1296 G 1309 1297 U 1308 1298 C 1307 1299 U 0 1300 G 0 1301 A 0 1302 A 0 1303 A 0 1304 C 0 1305 U 0 1306 C 0 1307 G 1298 1308 A 1297 1309 C 1296 1310 U 1295 1311 U 1294 1312 C 1293 1313 A 1292 1314 U 1291 1315 G 0 1316 A 0 1317 A 0 1318 G 1287 1319 U 0 1320 U 0 1321 G 0 1322 G 0 1323 A 0 1324 A 931 1325 U 930 1326 C 929 1327 G 928 1328 C 927 1329 U 0 1330 A 0 1331 G 0 1332 U 0 1333 A 0 1334 A 1356 1335 U 1355 1336 C 1354 1337 G 1353 1338 C 1352 1339 U 1351 1340 C 1350 1341 A 1349 1342 U 0 1343 C 0 1344 A 0 1345 C 0 1346 C 0 1347 A 0 1348 U 0 1349 G 1341 1350 G 1340 1351 A 1339 1352 G 1338 1353 C 1337 1354 G 1336 1355 G 1335 1356 U 1334 1357 G 0 1358 A 0 1359 A 0 1360 U 0 1361 A 0 1362 U 0 1363 G 924 1364 U 923 1365 U 0 1366 C 0 1367 C 0 1368 C 921 1369 G 920 1370 G 919 1371 G 918 1372 C 917 1373 C 916 1374 U 915 1375 U 913 1376 G 912 1377 U 911 1378 A 0 1379 C 910 1380 A 909 1381 C 0 1382 A 0 1383 C 1490 1384 C 0 1385 G 1487 1386 C 1486 1387 C 0 1388 C 1483 1389 G 1482 1390 U 0 1391 C 0 1392 A 0 1393 C 1477 1394 A 1476 1395 C 1475 1396 C 1474 1397 A 1473 1398 C 1472 1399 C 1471 1400 C 1470 1401 G 0 1402 A 0 1403 G 1467 1404 U 1466 1405 U 1465 1406 G 1464 1407 A 1463 1408 U 1462 1409 U 1461 1410 U 1460 1411 U 1459 1412 U 1458 1413 C 1457 1414 C 1456 1415 C 0 1416 G 0 1417 A 0 1418 A 0 1419 G 1452 1420 U 1451 1421 U 1450 1422 A 1449 1423 U 1448 1424 U 1447 1425 A 0 1426 G 1446 1427 U 1445 1428 C 1444 1429 U 1443 1430 A 0 1431 A 0 1432 C 1441 1433 A 1440 1434 G 1439 1435 C 0 1436 U 0 1437 U 0 1438 G 0 1439 C 1434 1440 U 1433 1441 G 1432 1442 A 0 1443 G 1429 1444 G 1428 1445 A 1427 1446 C 1426 1447 A 1424 1448 A 1423 1449 U 1422 1450 A 1421 1451 C 1420 1452 C 1419 1453 C 0 1454 A 0 1455 A 0 1456 G 1414 1457 G 1413 1458 A 1412 1459 A 1411 1460 G 1410 1461 A 1409 1462 A 1408 1463 U 1407 1464 U 1406 1465 G 1405 1466 G 1404 1467 U 1403 1468 A 0 1469 A 0 1470 G 1400 1471 G 1399 1472 G 1398 1473 G 1397 1474 G 1396 1475 G 1395 1476 U 1394 1477 G 1393 1478 A 0 1479 A 0 1480 G 0 1481 U 0 1482 C 1389 1483 G 1388 1484 U 0 1485 A 0 1486 A 1386 1487 C 1385 1488 A 0 1489 A 0 1490 G 1383 1491 G 0 1492 U 1515 1493 A 1514 1494 G 1513 1495 C 1512 1496 C 1511 1497 G 1510 1498 U 1509 1499 A 1508 1500 A 1507 1501 G 1506 1502 C 0 1503 U 0 1504 U 0 1505 G 0 1506 G 1501 1507 A 1500 1508 U 1499 1509 C 1498 1510 C 1497 1511 C 1496 1512 N 1495 1513 N 1494 1514 N 1493 1515 N 1492 1516 N 0 1517 N 0 1518 N 0 1519 N 0 1520 N 0 1521 N 0 1522 N 0 1523 N 0 1524 N 0 1525 N 0 1526 N 0 1527 N 0 1528 N 0