Filename: d.16.b.F.tularensis.bpseq Organism: Francisella tularensis Accession Number: Z21931 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 U 0 5 U 0 6 G 0 7 A 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 909 18 C 908 19 A 907 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 544 28 A 543 29 U 542 30 U 541 31 G 0 32 A 540 33 A 539 34 C 538 35 G 537 36 C 536 37 U 535 38 G 0 39 G 391 40 U 390 41 G 389 42 G 388 43 C 387 44 A 386 45 U 384 46 G 383 47 C 349 48 U 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 347 53 A 346 54 C 345 55 A 0 56 U 344 57 G 343 58 C 342 59 A 0 60 A 0 61 G 98 62 U 97 63 C 96 64 G 0 65 A 0 66 A 95 67 C 94 68 G 93 69 G 91 70 U 90 71 A 0 72 A 0 73 C 89 74 A 88 75 G 87 76 G 85 77 U 84 78 C 83 79 U 0 80 U 0 81 A 0 82 G 0 83 G 78 84 A 77 85 U 76 86 G 0 87 C 75 88 U 74 89 G 73 90 A 70 91 C 69 92 G 0 93 A 68 94 G 67 95 U 66 96 G 63 97 G 62 98 C 61 99 G 0 100 G 0 101 A 0 102 C 0 103 G 0 104 G 0 105 G 302 106 U 301 107 G 300 108 A 0 109 G 0 110 U 0 111 A 0 112 A 0 113 C 0 114 G 227 115 C 226 116 G 225 117 U 224 118 A 223 119 G 222 120 G 221 121 A 220 122 A 0 123 U 219 124 C 218 125 U 0 126 G 0 127 C 0 128 C 215 129 C 214 130 A 213 131 U 212 132 U 211 133 U 210 134 G 209 135 A 0 136 G 170 137 G 169 138 G 168 139 G 167 140 G 0 141 A 0 142 U 0 143 A 0 144 C 161 145 C 160 146 A 159 147 G 158 148 U 157 149 U 156 150 G 155 151 G 0 152 A 0 153 A 0 154 A 0 155 C 150 156 G 149 157 A 148 158 C 147 159 U 146 160 G 145 161 U 144 162 U 0 163 A 0 164 A 0 165 U 0 166 A 0 167 C 139 168 C 138 169 G 137 170 C 136 171 A 0 172 U 0 173 A 0 174 A 0 175 U 0 176 A 185 177 U 184 178 C 183 179 U 0 180 G 0 181 U 0 182 G 0 183 G 178 184 A 177 185 U 176 186 U 0 187 A 0 188 A 0 189 A 0 190 G 207 191 G 206 192 U 205 193 G 204 194 G 202 195 C 201 196 U 200 197 U 0 198 U 0 199 C 0 200 G 196 201 G 195 202 C 194 203 G 0 204 U 193 205 G 192 206 U 191 207 C 190 208 G 0 209 C 134 210 A 133 211 G 132 212 A 131 213 U 130 214 G 129 215 G 128 216 A 0 217 U 0 218 G 124 219 A 123 220 G 121 221 C 120 222 C 119 223 U 118 224 G 117 225 C 116 226 G 115 227 U 114 228 U 274 229 G 273 230 G 272 231 A 0 232 U 0 233 U 271 234 A 0 235 G 265 236 C 264 237 U 263 238 A 0 239 G 0 240 U 262 241 U 261 242 G 260 243 G 259 244 U 258 245 G 257 246 G 256 247 G 255 248 G 0 249 U 0 250 A 0 251 A 0 252 G 0 253 G 0 254 G 0 255 C 247 256 C 246 257 C 245 258 A 244 259 C 243 260 C 242 261 A 241 262 A 240 263 G 237 264 G 236 265 C 235 266 U 0 267 A 0 268 C 0 269 G 0 270 A 0 271 U 233 272 C 230 273 C 229 274 A 228 275 U 0 276 A 0 277 G 299 278 C 298 279 U 297 280 G 296 281 A 292 282 U 291 283 U 290 284 U 289 285 G 0 286 A 0 287 G 0 288 A 0 289 G 284 290 G 283 291 A 282 292 U 281 293 G 0 294 A 0 295 U 0 296 C 280 297 A 279 298 G 278 299 C 277 300 C 107 301 A 106 302 C 105 303 A 0 304 U 325 305 U 324 306 G 323 307 G 322 308 G 321 309 A 320 310 C 0 311 U 0 312 G 0 313 A 0 314 G 0 315 A 0 316 C 0 317 A 0 318 C 0 319 G 0 320 G 309 321 C 308 322 C 307 323 C 306 324 A 305 325 A 304 326 A 0 327 C 338 328 U 337 329 C 336 330 C 335 331 U 0 332 A 0 333 C 0 334 G 0 335 G 330 336 G 329 337 A 328 338 G 327 339 G 0 340 C 0 341 A 0 342 G 58 343 C 57 344 A 56 345 G 54 346 U 53 347 G 52 348 G 0 349 G 47 350 G 0 351 A 0 352 A 0 353 U 0 354 A 0 355 U 381 356 U 0 357 G 380 358 G 379 359 A 378 360 C 0 361 A 0 362 A 0 363 U 376 364 G 375 365 G 374 366 G 373 367 G 372 368 G 0 369 C 0 370 A 0 371 A 0 372 C 367 373 C 366 374 C 365 375 U 364 376 G 363 377 A 0 378 U 359 379 C 358 380 C 357 381 A 355 382 G 0 383 C 46 384 A 45 385 A 0 386 U 44 387 G 43 388 C 42 389 C 41 390 A 40 391 U 39 392 G 0 393 U 0 394 G 424 395 U 423 396 G 422 397 U 421 398 G 0 399 A 0 400 A 0 401 G 0 402 A 0 403 A 0 404 G 415 405 G 414 406 C 413 407 C 412 408 C 0 409 U 0 410 A 0 411 G 0 412 G 407 413 G 406 414 U 405 415 U 404 416 G 0 417 U 0 418 A 0 419 A 0 420 A 0 421 G 397 422 C 396 423 A 395 424 C 394 425 U 0 426 U 484 427 U 0 428 A 485 429 G 481 430 U 480 431 U 479 432 G 478 433 G 477 434 G 476 435 G 0 436 A 0 437 G 0 438 G 471 439 A 0 440 A 0 441 A 0 442 G 0 443 C 465 444 C 464 445 U 463 446 C 462 447 A 461 448 A 460 449 G 459 450 G 458 451 U 0 452 U 0 453 A 0 454 A 0 455 U 0 456 A 0 457 G 0 458 C 450 459 C 449 460 U 448 461 U 447 462 G 446 463 G 445 464 G 444 465 G 443 466 G 0 467 A 0 468 G 0 469 G 0 470 A 0 471 C 438 472 G 0 473 U 0 474 U 0 475 A 0 476 C 434 477 C 433 478 C 432 479 A 431 480 A 430 481 A 429 482 G 0 483 A 0 484 A 426 485 U 428 486 A 0 487 A 0 488 G 533 489 C 532 490 A 531 491 C 530 492 C 529 493 G 514 494 G 513 495 C 512 496 U 0 497 A 0 498 A 0 499 C 528 500 U 527 501 C 526 502 C 525 503 G 524 504 U 0 505 G 0 506 C 0 507 C 0 508 A 0 509 G 516 510 C 515 511 A 0 512 G 495 513 C 494 514 C 493 515 G 510 516 C 509 517 G 0 518 G 0 519 U 0 520 A 0 521 A 0 522 U 0 523 A 0 524 C 503 525 G 502 526 G 501 527 G 500 528 G 499 529 G 492 530 G 491 531 U 490 532 G 489 533 C 488 534 A 0 535 A 37 536 G 36 537 C 35 538 G 34 539 U 33 540 U 32 541 A 30 542 A 29 543 U 28 544 C 27 545 G 0 546 G 0 547 A 0 548 A 0 549 U 0 550 U 0 551 A 0 552 C 0 553 U 0 554 G 0 555 G 874 556 G 873 557 C 872 558 G 857 559 U 856 560 A 0 561 A 0 562 A 0 563 G 871 564 G 0 565 G 752 566 U 751 567 C 750 568 U 749 569 G 0 570 U 746 571 A 0 572 G 745 573 G 744 574 U 743 575 G 0 576 G 639 577 U 638 578 U 637 579 U 636 580 G 635 581 U 634 582 U 633 583 A 0 584 A 632 585 G 631 586 U 628 587 C 627 588 A 626 589 G 625 590 A 624 591 U 623 592 G 622 593 U 621 594 G 620 595 A 0 596 A 0 597 A 0 598 G 0 599 C 617 600 C 616 601 C 615 602 A 614 603 G 613 604 G 612 605 G 611 606 C 0 607 U 0 608 C 0 609 A 0 610 A 0 611 C 605 612 C 604 613 U 603 614 U 602 615 G 601 616 G 600 617 A 599 618 A 0 619 C 0 620 U 594 621 G 593 622 C 592 623 A 591 624 U 590 625 U 589 626 U 588 627 G 587 628 A 586 629 U 0 630 A 0 631 C 585 632 U 584 633 G 582 634 G 581 635 C 580 636 A 579 637 A 578 638 A 577 639 C 576 640 U 0 641 A 0 642 G 0 643 A 739 644 G 738 645 U 737 646 A 736 647 C 734 648 G 733 649 G 732 650 U 731 651 A 730 652 G 0 653 A 0 654 G 728 655 G 727 656 A 726 657 A 725 658 U 724 659 G 723 660 G 722 661 G 705 662 G 704 663 A 0 664 A 0 665 U 701 666 U 700 667 U 699 668 C 698 669 U 697 670 G 696 671 G 695 672 U 694 673 G 0 674 U 0 675 A 0 676 G 687 677 C 686 678 G 685 679 G 0 680 U 0 681 G 0 682 A 0 683 A 0 684 A 0 685 U 678 686 G 677 687 C 676 688 G 0 689 U 0 690 A 0 691 G 0 692 A 0 693 G 0 694 A 672 695 U 671 696 C 670 697 A 669 698 G 668 699 A 667 700 A 666 701 G 665 702 G 0 703 A 0 704 A 662 705 C 661 706 A 0 707 C 0 708 C 0 709 A 0 710 A 721 711 U 0 712 G 0 713 G 720 714 C 719 715 G 0 716 A 0 717 A 0 718 G 0 719 G 714 720 C 713 721 A 710 722 A 660 723 C 659 724 A 658 725 U 657 726 U 656 727 C 655 728 U 654 729 G 0 730 G 651 731 A 650 732 C 649 733 C 648 734 G 647 735 A 0 736 U 646 737 A 645 738 C 644 739 U 643 740 G 0 741 A 0 742 C 0 743 A 574 744 C 573 745 U 572 746 G 570 747 A 0 748 G 0 749 G 568 750 G 567 751 A 566 752 C 565 753 G 0 754 A 0 755 A 0 756 A 0 757 G 798 758 C 797 759 G 796 760 U 795 761 G 794 762 G 793 763 G 0 764 G 0 765 A 0 766 U 792 767 C 791 768 A 0 769 A 0 770 A 0 771 C 787 772 A 786 773 G 785 774 G 784 775 A 0 776 U 0 777 U 0 778 A 0 779 G 0 780 A 0 781 U 0 782 A 0 783 C 0 784 C 774 785 C 773 786 U 772 787 G 771 788 G 0 789 U 0 790 A 0 791 G 767 792 U 766 793 C 762 794 C 761 795 A 760 796 C 759 797 G 758 798 C 757 799 U 0 800 G 0 801 U 0 802 A 0 803 A 0 804 A 0 805 C 0 806 G 0 807 A 0 808 U 0 809 G 870 810 A 869 811 G 868 812 U 867 813 A 866 814 C 865 815 U 0 816 A 0 817 G 848 818 C 847 819 U 846 820 G 845 821 U 844 822 U 843 823 G 842 824 G 841 825 A 840 826 G 839 827 U 838 828 C 837 829 G 0 830 G 0 831 U 0 832 G 0 833 U 0 834 A 0 835 A 0 836 A 0 837 G 828 838 G 827 839 C 826 840 U 825 841 C 824 842 U 823 843 A 822 844 G 821 845 U 820 846 G 819 847 G 818 848 C 817 849 G 0 850 C 0 851 A 0 852 C 859 853 G 858 854 U 0 855 A 0 856 A 559 857 C 558 858 G 853 859 C 852 860 G 0 861 A 0 862 U 0 863 A 0 864 A 0 865 G 814 866 U 813 867 A 812 868 C 811 869 U 810 870 C 809 871 C 563 872 G 557 873 C 556 874 C 555 875 U 0 876 G 903 877 G 902 878 G 901 879 G 0 880 A 0 881 C 0 882 U 0 883 A 0 884 C 0 885 G 896 886 G 895 887 C 894 888 C 893 889 G 0 890 C 0 891 A 0 892 A 0 893 G 888 894 G 887 895 C 886 896 U 885 897 A 0 898 A 0 899 A 0 900 A 0 901 C 878 902 U 877 903 C 876 904 A 0 905 A 0 906 A 0 907 G 19 908 G 18 909 A 17 910 A 0 911 U 0 912 U 1383 913 G 1382 914 A 1380 915 C 1379 916 G 1378 917 G 0 918 G 1377 919 G 1376 920 A 1375 921 C 1374 922 C 1373 923 C 1372 924 G 1371 925 C 0 926 A 1367 927 C 1366 928 A 0 929 A 0 930 G 1331 931 C 1330 932 G 1329 933 G 1328 934 U 1327 935 G 1224 936 G 1223 937 A 1222 938 G 1221 939 C 1220 940 A 1219 941 U 1218 942 G 1217 943 U 1216 944 G 1215 945 G 1213 946 U 1212 947 U 0 948 U 0 949 A 0 950 A 0 951 U 966 952 U 965 953 C 964 954 G 963 955 A 0 956 U 0 957 G 0 958 C 0 959 A 0 960 A 0 961 C 0 962 G 0 963 C 954 964 G 953 965 A 952 966 A 951 967 G 0 968 A 0 969 A 0 970 C 0 971 C 0 972 U 0 973 U 0 974 A 0 975 C 1208 976 C 1207 977 U 1206 978 G 1205 979 G 1204 980 U 1203 981 C 1202 982 U 0 983 U 0 984 G 0 985 A 0 986 C 0 987 A 1034 988 U 1033 989 C 1032 990 C 1030 991 U 1029 992 G 1028 993 C 1027 994 G 1026 995 A 0 996 A 0 997 C 1014 998 U 1013 999 U 1012 1000 U 1011 1001 C 1010 1002 U 1009 1003 A 1008 1004 G 0 1005 A 0 1006 G 0 1007 A 0 1008 U 1003 1009 A 1002 1010 G 1001 1011 A 1000 1012 U 999 1013 U 998 1014 G 997 1015 G 0 1016 U 1025 1017 G 1024 1018 C 1023 1019 U 0 1020 U 0 1021 C 0 1022 G 0 1023 G 1018 1024 A 1017 1025 A 1016 1026 C 994 1027 G 993 1028 C 992 1029 A 991 1030 G 990 1031 U 0 1032 G 989 1033 A 988 1034 C 987 1035 A 0 1036 G 1197 1037 U 0 1038 G 1195 1039 C 1194 1040 U 1193 1041 G 1192 1042 C 0 1043 A 0 1044 C 1191 1045 G 1190 1046 G 1186 1047 C 1185 1048 U 1184 1049 G 1182 1050 U 1181 1051 C 1180 1052 G 1179 1053 U 0 1054 C 0 1055 A 0 1056 G 1095 1057 C 1094 1058 U 1093 1059 C 1092 1060 G 1091 1061 U 1090 1062 G 1071 1063 U 1070 1064 U 1069 1065 G 0 1066 U 0 1067 G 0 1068 A 0 1069 A 1064 1070 A 1063 1071 U 1062 1072 G 0 1073 U 0 1074 U 1087 1075 G 1086 1076 G 1085 1077 G 1084 1078 U 0 1079 U 0 1080 A 0 1081 A 0 1082 G 0 1083 U 0 1084 C 1077 1085 C 1076 1086 C 1075 1087 G 1074 1088 C 0 1089 A 0 1090 A 1061 1091 C 1060 1092 G 1059 1093 A 1058 1094 G 1057 1095 C 1056 1096 G 0 1097 C 0 1098 A 0 1099 A 0 1100 C 0 1101 C 1174 1102 C 1173 1103 C 1172 1104 U 1171 1105 A 0 1106 U 1142 1107 U 1141 1108 G 1140 1109 A 1139 1110 U 1138 1111 A 1137 1112 G 1136 1113 U 0 1114 U 0 1115 A 0 1116 C 1131 1117 C 1130 1118 A 0 1119 U 0 1120 C 1129 1121 A 1128 1122 U 0 1123 U 0 1124 A 0 1125 A 0 1126 G 0 1127 U 0 1128 U 1121 1129 G 1120 1130 G 1117 1131 G 1116 1132 U 0 1133 A 0 1134 C 0 1135 U 0 1136 C 1112 1137 U 1111 1138 A 1110 1139 U 1109 1140 U 1108 1141 A 1107 1142 A 1106 1143 G 0 1144 A 0 1145 C 1165 1146 U 1164 1147 G 1163 1148 C 1162 1149 C 1161 1150 G 1160 1151 C 1159 1152 U 1158 1153 G 0 1154 A 0 1155 C 0 1156 A 0 1157 A 0 1158 G 1152 1159 G 1151 1160 C 1150 1161 G 1149 1162 G 1148 1163 A 1147 1164 G 1146 1165 G 1145 1166 A 0 1167 A 0 1168 G 0 1169 G 0 1170 U 0 1171 G 1104 1172 G 1103 1173 G 1102 1174 G 1101 1175 A 0 1176 C 0 1177 G 0 1178 A 0 1179 C 1052 1180 G 1051 1181 U 1050 1182 C 1049 1183 A 0 1184 A 1048 1185 G 1047 1186 U 1046 1187 C 0 1188 A 0 1189 U 0 1190 C 1045 1191 A 1044 1192 U 1041 1193 G 1040 1194 G 1039 1195 C 1038 1196 C 0 1197 C 1036 1198 U 0 1199 U 0 1200 A 0 1201 C 0 1202 G 981 1203 A 980 1204 C 979 1205 C 978 1206 A 977 1207 G 976 1208 G 975 1209 G 0 1210 C 0 1211 U 0 1212 A 946 1213 C 945 1214 A 0 1215 C 944 1216 A 943 1217 C 942 1218 G 941 1219 U 940 1220 G 939 1221 C 938 1222 U 937 1223 A 936 1224 C 935 1225 A 0 1226 A 0 1227 U 0 1228 G 1283 1229 G 1282 1230 G 1281 1231 U 1280 1232 A 1279 1233 U 1278 1234 U 1277 1235 A 0 1236 C 0 1237 A 0 1238 G 0 1239 A 0 1240 G 1271 1241 G 1270 1242 G 1269 1243 C 0 1244 U 0 1245 G 1264 1246 C 1263 1247 G 0 1248 A 0 1249 A 0 1250 G 1259 1251 G 1258 1252 U 1257 1253 G 0 1254 C 0 1255 G 0 1256 A 0 1257 G 1252 1258 C 1251 1259 U 1250 1260 G 0 1261 G 0 1262 A 0 1263 G 1246 1264 C 1245 1265 G 0 1266 A 0 1267 A 0 1268 A 0 1269 C 1242 1270 U 1241 1271 C 1240 1272 A 0 1273 A 0 1274 A 0 1275 A 0 1276 A 0 1277 G 1234 1278 G 1233 1279 U 1232 1280 A 1231 1281 C 1230 1282 U 1229 1283 C 1228 1284 U 0 1285 U 0 1286 A 0 1287 G 0 1288 U 0 1289 C 0 1290 C 1321 1291 G 0 1292 G 0 1293 A 0 1294 U 1317 1295 U 1316 1296 G 1315 1297 C 1314 1298 A 1313 1299 G 1312 1300 U 1311 1301 C 1310 1302 U 0 1303 G 0 1304 C 0 1305 A 0 1306 A 0 1307 C 0 1308 U 0 1309 C 0 1310 G 1301 1311 A 1300 1312 C 1299 1313 U 1298 1314 G 1297 1315 C 1296 1316 A 1295 1317 U 1294 1318 G 0 1319 A 0 1320 A 0 1321 G 1290 1322 U 0 1323 C 0 1324 G 0 1325 G 0 1326 A 0 1327 A 934 1328 U 933 1329 C 932 1330 G 931 1331 C 930 1332 U 0 1333 A 0 1334 G 0 1335 U 0 1336 A 0 1337 A 1359 1338 U 1358 1339 C 1357 1340 G 1356 1341 C 1355 1342 A 1354 1343 G 1353 1344 G 1352 1345 U 0 1346 C 0 1347 A 0 1348 G 0 1349 A 0 1350 A 0 1351 U 0 1352 A 1344 1353 C 1343 1354 U 1342 1355 G 1341 1356 C 1340 1357 G 1339 1358 G 1338 1359 U 1337 1360 G 0 1361 A 0 1362 A 0 1363 U 0 1364 A 0 1365 C 0 1366 G 927 1367 U 926 1368 U 0 1369 C 0 1370 C 0 1371 C 924 1372 G 923 1373 G 922 1374 G 921 1375 U 920 1376 C 919 1377 U 918 1378 U 916 1379 G 915 1380 U 914 1381 A 0 1382 C 913 1383 A 912 1384 C 0 1385 A 0 1386 C 1487 1387 C 0 1388 G 1484 1389 C 1483 1390 C 0 1391 C 1480 1392 G 1479 1393 U 0 1394 C 0 1395 A 0 1396 C 1474 1397 A 1473 1398 C 1472 1399 C 1471 1400 A 1470 1401 U 1469 1402 G 1468 1403 G 1467 1404 G 0 1405 A 0 1406 G 1464 1407 U 1463 1408 G 1462 1409 G 1461 1410 G 1460 1411 U 1459 1412 U 1458 1413 G 1457 1414 C 1456 1415 U 1455 1416 C 1454 1417 C 1453 1418 A 0 1419 G 0 1420 A 0 1421 A 0 1422 G 1449 1423 U 1448 1424 A 1447 1425 G 1446 1426 A 1445 1427 U 1444 1428 A 0 1429 G 1443 1430 C 1442 1431 U 1441 1432 U 1440 1433 A 1439 1434 A 0 1435 C 0 1436 G 0 1437 A 0 1438 A 0 1439 U 1433 1440 G 1432 1441 G 1431 1442 G 1430 1443 C 1429 1444 G 1427 1445 U 1426 1446 U 1425 1447 U 1424 1448 A 1423 1449 C 1422 1450 C 0 1451 A 0 1452 C 0 1453 G 1417 1454 G 1416 1455 A 1415 1456 G 1414 1457 U 1413 1458 G 1412 1459 A 1411 1460 U 1410 1461 U 1409 1462 C 1408 1463 A 1407 1464 U 1406 1465 G 0 1466 A 0 1467 C 1403 1468 U 1402 1469 G 1401 1470 G 1400 1471 G 1399 1472 G 1398 1473 U 1397 1474 G 1396 1475 A 0 1476 A 0 1477 G 0 1478 U 0 1479 C 1392 1480 G 1391 1481 U 0 1482 A 0 1483 A 1389 1484 C 1388 1485 A 0 1486 A 0 1487 U 1386 1488 G 0 1489 G 0 1490 U 1512 1491 A 1511 1492 G 1510 1493 C 1509 1494 C 1508 1495 G 1507 1496 U 1506 1497 A 1505 1498 G 1504 1499 G 1503 1500 G 0 1501 A 0 1502 A 0 1503 C 1499 1504 C 1498 1505 U 1497 1506 G 1496 1507 C 1495 1508 G 1494 1509 G 1493 1510 C 1492 1511 U 1491 1512 G 1490 1513 G 0 1514 A 0 1515 U 0 1516 C 0 1517 A 0 1518 C 0 1519 C 0 1520 U 0 1521 C 0 1522 C 0 1523 U 0 1524 U 0 1525 N 0