Filename: d.16.b.H.chlorum.bpseq Organism: Heliobacterium chlorum Accession Number: M11212 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 0 9 N 25 10 N 24 11 N 23 12 N 22 13 N 21 14 N 0 15 G 0 16 A 0 17 U 897 18 C 896 19 C 895 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 534 28 G 533 29 A 532 30 C 531 31 G 0 32 A 530 33 A 529 34 C 528 35 G 527 36 C 526 37 U 525 38 G 0 39 G 404 40 C 403 41 G 402 42 G 401 43 C 400 44 A 399 45 U 397 46 G 396 47 C 362 48 C 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 360 53 A 359 54 C 358 55 A 0 56 U 357 57 G 356 58 C 355 59 A 0 60 A 0 61 G 102 62 U 101 63 C 100 64 G 0 65 A 0 66 A 99 67 C 98 68 G 97 69 G 96 70 A 95 71 G 94 72 A 93 73 G 92 74 C 91 75 G 90 76 G 89 77 A 88 78 A 87 79 G 86 80 U 85 81 U 0 82 U 0 83 C 0 84 G 0 85 A 80 86 U 79 87 G 78 88 G 77 89 A 76 90 A 75 91 G 74 92 C 73 93 U 72 94 C 71 95 U 70 96 U 69 97 A 68 98 G 67 99 U 66 100 G 63 101 G 62 102 C 61 103 G 0 104 G 0 105 A 0 106 C 0 107 G 0 108 G 0 109 G 315 110 U 314 111 G 313 112 A 0 113 G 0 114 U 0 115 A 0 116 A 0 117 C 0 118 G 240 119 C 239 120 G 238 121 U 237 122 G 236 123 G 235 124 A 234 125 C 233 126 A 0 127 A 0 128 C 232 129 C 231 130 U 0 131 A 0 132 C 0 133 C 228 134 G 227 135 G 226 136 A 225 137 G 224 138 A 223 139 G 222 140 U 0 141 G 175 142 G 174 143 G 173 144 G 172 145 G 0 146 A 0 147 U 0 148 A 0 149 A 166 150 C 165 151 A 164 152 G 163 153 U 162 154 C 161 155 C 160 156 G 0 157 A 0 158 A 0 159 A 0 160 G 155 161 G 154 162 G 153 163 C 152 164 U 151 165 G 150 166 C 149 167 U 0 168 A 0 169 A 0 170 U 0 171 A 0 172 C 144 173 C 143 174 G 142 175 C 141 176 A 0 177 U 0 178 A 0 179 A 0 180 C 0 181 G 206 182 U 205 183 U 204 184 C 203 185 C 202 186 U 201 187 G 200 188 A 199 189 A 198 190 G 197 191 G 196 192 A 0 193 C 0 194 A 0 195 U 0 196 C 191 197 C 190 198 U 189 199 U 188 200 C 187 201 A 186 202 G 185 203 G 184 204 A 183 205 A 182 206 C 181 207 C 0 208 A 0 209 A 0 210 A 0 211 G 220 212 G 219 213 A 218 214 G 0 215 C 0 216 A 0 217 A 0 218 U 213 219 C 212 220 C 211 221 G 0 222 C 139 223 U 138 224 U 137 225 U 136 226 C 135 227 C 134 228 G 133 229 A 0 230 U 0 231 G 129 232 G 128 233 G 125 234 U 124 235 C 123 236 C 122 237 A 121 238 C 120 239 G 119 240 U 118 241 C 287 242 C 286 243 G 285 244 A 0 245 U 0 246 U 284 247 A 0 248 G 278 249 C 277 250 U 276 251 A 0 252 G 0 253 U 275 254 U 274 255 G 273 256 G 272 257 U 271 258 A 270 259 G 269 260 G 268 261 G 0 262 U 0 263 A 0 264 A 0 265 A 0 266 G 0 267 G 0 268 C 260 269 C 259 270 U 258 271 A 257 272 C 256 273 C 255 274 A 254 275 A 253 276 G 250 277 G 249 278 C 248 279 G 0 280 A 0 281 C 0 282 G 0 283 A 0 284 U 246 285 C 243 286 G 242 287 G 241 288 U 0 289 A 0 290 G 312 291 C 311 292 C 310 293 G 309 294 G 305 295 C 304 296 C 303 297 U 302 298 G 0 299 A 0 300 G 0 301 A 0 302 G 297 303 G 296 304 G 295 305 U 294 306 G 0 307 A 0 308 A 0 309 C 293 310 G 292 311 G 291 312 C 290 313 C 111 314 A 110 315 C 109 316 A 0 317 C 338 318 U 337 319 G 336 320 G 335 321 G 334 322 A 333 323 C 0 324 U 0 325 G 0 326 A 0 327 G 0 328 A 0 329 C 0 330 A 0 331 C 0 332 G 0 333 G 322 334 C 321 335 C 320 336 C 319 337 A 318 338 G 317 339 A 0 340 C 351 341 U 350 342 C 349 343 C 348 344 U 0 345 A 0 346 C 0 347 G 0 348 G 343 349 G 342 350 A 341 351 G 340 352 G 0 353 C 0 354 A 0 355 G 58 356 C 57 357 A 56 358 G 54 359 U 53 360 G 52 361 G 0 362 G 47 363 G 0 364 A 0 365 A 0 366 U 0 367 C 0 368 U 394 369 U 0 370 C 393 371 C 392 372 G 391 373 C 0 374 A 0 375 A 0 376 U 389 377 G 388 378 G 387 379 G 386 380 C 385 381 G 0 382 A 0 383 A 0 384 A 0 385 G 380 386 C 379 387 C 378 388 U 377 389 G 376 390 A 0 391 C 372 392 G 371 393 G 370 394 A 368 395 G 0 396 C 46 397 A 45 398 A 0 399 U 44 400 G 43 401 C 42 402 C 41 403 G 40 404 C 39 405 G 0 406 U 0 407 G 437 408 G 436 409 G 435 410 G 434 411 G 0 412 A 0 413 U 0 414 G 0 415 A 0 416 A 0 417 G 428 418 G 427 419 U 426 420 C 425 421 U 0 422 U 0 423 C 0 424 G 0 425 G 420 426 A 419 427 U 418 428 U 417 429 G 0 430 U 0 431 A 0 432 A 0 433 A 0 434 C 410 435 C 409 436 C 408 437 U 407 438 U 0 439 G 474 440 U 0 441 C 475 442 U 471 443 U 470 444 C 469 445 G 468 446 G 467 447 G 466 448 G 0 449 A 0 450 A 0 451 G 461 452 A 0 453 A 0 454 G 458 455 U 0 456 U 0 457 U 0 458 U 454 459 G 0 460 A 0 461 C 451 462 G 0 463 G 0 464 U 0 465 A 0 466 C 447 467 C 446 468 C 445 469 G 444 470 A 443 471 G 442 472 G 0 473 A 0 474 G 439 475 G 441 476 A 0 477 A 0 478 G 523 479 C 522 480 C 521 481 C 520 482 C 519 483 G 504 484 G 503 485 C 502 486 U 0 487 A 0 488 A 0 489 C 518 490 U 517 491 A 516 492 C 515 493 G 514 494 U 0 495 G 0 496 C 0 497 C 0 498 A 0 499 G 506 500 C 505 501 A 0 502 G 485 503 C 484 504 C 483 505 G 500 506 C 499 507 G 0 508 G 0 509 U 0 510 A 0 511 A 0 512 U 0 513 A 0 514 C 493 515 G 492 516 U 491 517 A 490 518 G 489 519 G 482 520 G 481 521 G 480 522 G 479 523 C 478 524 A 0 525 A 37 526 G 36 527 C 35 528 G 34 529 U 33 530 U 32 531 G 30 532 U 29 533 C 28 534 C 27 535 G 0 536 G 0 537 A 0 538 A 0 539 U 0 540 G 0 541 A 0 542 C 0 543 U 0 544 G 0 545 G 862 546 G 861 547 C 860 548 G 845 549 U 844 550 A 0 551 A 0 552 A 0 553 G 859 554 C 0 555 G 742 556 C 741 557 G 740 558 U 739 559 G 0 560 C 736 561 A 0 562 G 735 563 G 734 564 C 733 565 G 0 566 G 629 567 A 628 568 C 627 569 A 626 570 U 625 571 G 624 572 U 623 573 A 0 574 A 622 575 G 621 576 U 618 577 C 617 578 U 616 579 G 615 580 A 614 581 G 613 582 G 612 583 U 611 584 G 610 585 A 0 586 A 0 587 A 0 588 G 0 589 C 607 590 U 606 591 U 605 592 G 604 593 G 603 594 A 602 595 G 601 596 C 0 597 U 0 598 C 0 599 A 0 600 A 0 601 C 595 602 U 594 603 C 593 604 C 592 605 G 591 606 A 590 607 A 589 608 A 0 609 C 0 610 G 584 611 G 583 612 C 582 613 C 581 614 U 580 615 U 579 616 G 578 617 G 577 618 A 576 619 A 0 620 A 0 621 C 575 622 U 574 623 G 572 624 G 571 625 A 570 626 U 569 627 G 568 628 U 567 629 C 566 630 U 0 631 U 0 632 G 0 633 A 729 634 G 728 635 A 727 636 G 725 637 A 724 638 U 723 639 G 722 640 G 721 641 A 720 642 G 0 643 A 0 644 G 718 645 G 717 646 A 716 647 U 715 648 A 714 649 G 713 650 C 712 651 G 695 652 G 694 653 A 0 654 A 0 655 U 691 656 U 690 657 C 689 658 C 688 659 C 687 660 G 686 661 G 685 662 U 684 663 G 0 664 U 0 665 A 0 666 G 677 667 C 676 668 G 675 669 G 0 670 U 0 671 G 0 672 A 0 673 A 0 674 A 0 675 U 668 676 G 667 677 C 666 678 G 0 679 U 0 680 A 0 681 G 0 682 A 0 683 U 0 684 A 662 685 U 661 686 C 660 687 G 659 688 G 658 689 G 657 690 A 656 691 G 655 692 G 0 693 A 0 694 A 652 695 C 651 696 A 0 697 C 0 698 C 0 699 C 0 700 G 711 701 U 0 702 G 0 703 G 710 704 C 709 705 G 0 706 A 0 707 A 0 708 G 0 709 G 704 710 C 703 711 G 700 712 G 650 713 C 649 714 U 648 715 A 647 716 U 646 717 C 645 718 U 644 719 G 0 720 G 641 721 A 640 722 C 639 723 A 638 724 U 637 725 U 636 726 A 0 727 U 635 728 C 634 729 U 633 730 G 0 731 A 0 732 C 0 733 G 564 734 C 563 735 U 562 736 G 560 737 A 0 738 G 0 739 G 558 740 C 557 741 G 556 742 C 555 743 G 0 744 A 0 745 A 0 746 A 0 747 G 788 748 C 787 749 G 786 750 U 785 751 G 784 752 G 783 753 G 0 754 G 0 755 A 0 756 G 782 757 C 781 758 A 0 759 A 0 760 A 0 761 C 777 762 A 776 763 G 775 764 G 774 765 A 0 766 U 0 767 U 0 768 A 0 769 G 0 770 A 0 771 U 0 772 A 0 773 C 0 774 C 764 775 C 763 776 U 762 777 G 761 778 G 0 779 U 0 780 A 0 781 G 757 782 U 756 783 C 752 784 C 751 785 A 750 786 C 749 787 G 748 788 C 747 789 C 0 790 G 0 791 U 0 792 A 0 793 A 0 794 A 0 795 C 0 796 G 0 797 A 0 798 U 0 799 G 858 800 A 857 801 G 856 802 U 855 803 G 854 804 C 853 805 U 0 806 A 0 807 G 836 808 G 835 809 U 834 810 G 833 811 U 832 812 U 831 813 G 830 814 G 829 815 G 828 816 G 827 817 G 826 818 U 0 819 A 0 820 U 0 821 C 0 822 G 0 823 A 0 824 C 0 825 C 0 826 C 817 827 C 816 828 C 815 829 C 814 830 C 813 831 G 812 832 G 811 833 U 810 834 G 809 835 C 808 836 C 807 837 G 0 838 C 0 839 A 0 840 G 847 841 U 846 842 U 0 843 C 0 844 A 549 845 C 548 846 G 841 847 C 840 848 A 0 849 A 0 850 U 0 851 A 0 852 A 0 853 G 804 854 C 803 855 A 802 856 C 801 857 U 800 858 C 799 859 C 553 860 G 547 861 C 546 862 C 545 863 U 0 864 G 891 865 G 890 866 G 889 867 G 0 868 A 0 869 G 0 870 U 0 871 A 0 872 C 0 873 G 884 874 G 883 875 C 882 876 C 881 877 G 0 878 C 0 879 A 0 880 A 0 881 G 876 882 G 875 883 U 874 884 U 873 885 G 0 886 A 0 887 A 0 888 A 0 889 C 866 890 U 865 891 C 864 892 A 0 893 A 0 894 A 0 895 G 19 896 G 18 897 A 17 898 A 0 899 U 0 900 U 1377 901 G 1376 902 A 1374 903 C 1373 904 G 1372 905 G 0 906 G 1371 907 G 1370 908 G 1369 909 C 1368 910 C 1367 911 C 1366 912 G 1365 913 C 0 914 A 1361 915 C 1360 916 A 0 917 A 0 918 G 1325 919 C 1324 920 G 1323 921 U 1322 922 U 1321 923 G 1218 924 G 1217 925 A 1216 926 G 1215 927 C 1214 928 A 1213 929 U 1212 930 G 1211 931 U 1210 932 G 1209 933 G 1207 934 U 1206 935 U 0 936 U 0 937 A 0 938 A 0 939 U 954 940 U 953 941 C 952 942 G 951 943 A 0 944 C 0 945 G 0 946 C 0 947 A 0 948 A 0 949 C 0 950 G 0 951 C 942 952 G 941 953 A 940 954 A 939 955 G 0 956 A 0 957 A 0 958 C 0 959 C 0 960 U 0 961 U 0 962 A 0 963 C 1202 964 C 1201 965 A 1200 966 A 1199 967 G 1198 968 G 1197 969 C 1196 970 U 0 971 U 0 972 G 0 973 A 0 974 C 0 975 A 1026 976 U 1025 977 C 1024 978 C 1022 979 U 1021 980 C 1020 981 U 1019 982 G 1018 983 A 0 984 A 0 985 U 1002 986 C 1001 987 C 1000 988 G 999 989 A 998 990 U 997 991 A 996 992 G 0 993 A 0 994 G 0 995 A 0 996 U 991 997 A 990 998 G 989 999 C 988 1000 G 987 1001 G 986 1002 A 985 1003 G 0 1004 U 0 1005 G 0 1006 C 1015 1007 C 1014 1008 C 1013 1009 U 0 1010 U 0 1011 C 0 1012 G 0 1013 G 1008 1014 G 1007 1015 G 1006 1016 A 0 1017 G 0 1018 C 982 1019 A 981 1020 G 980 1021 A 979 1022 G 978 1023 A 0 1024 G 977 1025 A 976 1026 C 975 1027 A 0 1028 G 1191 1029 G 1190 1030 U 0 1031 G 1189 1032 G 1188 1033 U 1187 1034 G 1186 1035 C 0 1036 A 0 1037 U 1185 1038 G 1184 1039 G 1180 1040 U 1179 1041 U 1178 1042 G 1176 1043 U 1175 1044 C 1174 1045 G 1173 1046 U 0 1047 C 0 1048 A 0 1049 G 1088 1050 C 1087 1051 U 1086 1052 C 1085 1053 G 1084 1054 U 1083 1055 G 1064 1056 U 1063 1057 C 1062 1058 G 0 1059 U 0 1060 G 0 1061 A 0 1062 G 1057 1063 A 1056 1064 U 1055 1065 G 0 1066 U 0 1067 U 1080 1068 G 1079 1069 G 1078 1070 G 1077 1071 U 0 1072 U 0 1073 A 0 1074 A 0 1075 G 0 1076 U 0 1077 C 1070 1078 C 1069 1079 C 1068 1080 G 1067 1081 C 0 1082 A 0 1083 A 1054 1084 C 1053 1085 G 1052 1086 A 1051 1087 G 1050 1088 C 1049 1089 G 0 1090 C 0 1091 A 0 1092 A 0 1093 C 0 1094 C 1168 1095 C 1167 1096 U 1166 1097 U 1165 1098 A 0 1099 U 1136 1100 C 1135 1101 C 1134 1102 C 1133 1103 U 1132 1104 A 1131 1105 G 1130 1106 U 0 1107 U 0 1108 G 0 1109 C 1125 1110 C 1124 1111 A 0 1112 G 0 1113 C 1123 1114 G 1122 1115 A 1121 1116 G 0 1117 A 0 1118 G 0 1119 A 0 1120 G 0 1121 U 1115 1122 C 1114 1123 G 1113 1124 G 1110 1125 G 1109 1126 G 0 1127 A 0 1128 C 0 1129 U 0 1130 C 1105 1131 U 1104 1132 A 1103 1133 G 1102 1134 G 1101 1135 G 1100 1136 A 1099 1137 G 0 1138 A 0 1139 C 1159 1140 U 1158 1141 G 1157 1142 C 1156 1143 C 1155 1144 C 1154 1145 G 1153 1146 G 1152 1147 G 0 1148 A 0 1149 C 0 1150 G 0 1151 A 0 1152 C 1146 1153 C 1145 1154 G 1144 1155 G 1143 1156 G 1142 1157 A 1141 1158 G 1140 1159 G 1139 1160 A 0 1161 A 0 1162 G 0 1163 G 0 1164 C 0 1165 G 1097 1166 G 1096 1167 G 1095 1168 G 1094 1169 A 0 1170 U 0 1171 G 0 1172 A 0 1173 C 1045 1174 G 1044 1175 U 1043 1176 C 1042 1177 A 0 1178 A 1041 1179 A 1040 1180 U 1039 1181 C 0 1182 A 0 1183 U 0 1184 C 1038 1185 A 1037 1186 U 1034 1187 G 1033 1188 C 1032 1189 C 1031 1190 C 1029 1191 C 1028 1192 U 0 1193 U 0 1194 A 0 1195 U 0 1196 G 969 1197 U 968 1198 C 967 1199 U 966 1200 U 965 1201 G 964 1202 G 963 1203 G 0 1204 C 0 1205 U 0 1206 A 934 1207 C 933 1208 A 0 1209 C 932 1210 A 931 1211 C 930 1212 G 929 1213 U 928 1214 G 927 1215 C 926 1216 U 925 1217 A 924 1218 C 923 1219 A 0 1220 A 0 1221 U 0 1222 G 1277 1223 G 1276 1224 G 1275 1225 C 1274 1226 G 1273 1227 G 1272 1228 U 1271 1229 A 0 1230 C 0 1231 A 0 1232 A 0 1233 A 0 1234 C 1265 1235 C 1264 1236 G 1263 1237 A 0 1238 A 0 1239 G 1258 1240 C 1257 1241 G 0 1242 A 0 1243 A 0 1244 G 1253 1245 C 1252 1246 C 1251 1247 G 0 1248 A 0 1249 G 0 1250 A 0 1251 G 1246 1252 G 1245 1253 U 1244 1254 G 0 1255 G 0 1256 A 0 1257 G 1240 1258 C 1239 1259 G 0 1260 A 0 1261 A 0 1262 C 0 1263 C 1236 1264 G 1235 1265 G 1234 1266 A 0 1267 G 0 1268 A 0 1269 A 0 1270 A 0 1271 G 1228 1272 C 1227 1273 C 1226 1274 G 1225 1275 U 1224 1276 U 1223 1277 C 1222 1278 C 0 1279 C 0 1280 A 0 1281 G 0 1282 U 0 1283 U 0 1284 C 1315 1285 G 0 1286 G 0 1287 A 0 1288 U 1311 1289 U 1310 1290 G 1309 1291 C 1308 1292 U 1307 1293 C 1306 1294 U 1305 1295 C 1304 1296 U 0 1297 G 0 1298 C 0 1299 A 0 1300 A 0 1301 C 0 1302 U 0 1303 C 0 1304 G 1295 1305 A 1294 1306 G 1293 1307 A 1292 1308 G 1291 1309 C 1290 1310 A 1289 1311 U 1288 1312 G 0 1313 A 0 1314 A 0 1315 G 1284 1316 G 0 1317 C 0 1318 G 0 1319 G 0 1320 A 0 1321 A 922 1322 U 921 1323 C 920 1324 G 919 1325 C 918 1326 U 0 1327 A 0 1328 G 0 1329 U 0 1330 A 0 1331 A 1353 1332 U 1352 1333 C 1351 1334 G 1350 1335 C 1349 1336 G 1348 1337 G 1347 1338 G 1346 1339 U 0 1340 C 0 1341 A 0 1342 G 0 1343 C 0 1344 A 0 1345 U 0 1346 A 1338 1347 C 1337 1348 C 1336 1349 G 1335 1350 C 1334 1351 G 1333 1352 G 1332 1353 U 1331 1354 G 0 1355 A 0 1356 A 0 1357 U 0 1358 A 0 1359 C 0 1360 G 915 1361 U 914 1362 U 0 1363 C 0 1364 C 0 1365 C 912 1366 G 911 1367 G 910 1368 G 909 1369 C 908 1370 C 907 1371 U 906 1372 U 904 1373 G 903 1374 U 902 1375 A 0 1376 C 901 1377 A 900 1378 C 0 1379 A 0 1380 C 1486 1381 C 0 1382 G 1483 1383 C 1482 1384 C 0 1385 C 1479 1386 G 1478 1387 U 0 1388 C 0 1389 A 0 1390 C 1473 1391 A 1472 1392 C 1471 1393 C 1470 1394 A 1469 1395 C 1468 1396 G 1467 1397 A 1466 1398 A 0 1399 A 0 1400 G 1463 1401 U 1462 1402 C 1461 1403 G 1460 1404 G 1459 1405 C 1458 1406 A 1457 1407 A 1456 1408 C 1455 1409 A 1454 1410 C 1453 1411 C 1452 1412 C 0 1413 G 0 1414 A 0 1415 A 0 1416 G 1448 1417 U 1447 1418 C 1446 1419 G 1445 1420 G 1444 1421 U 1443 1422 G 0 1423 A 1442 1424 G 1441 1425 G 1440 1426 U 1439 1427 A 0 1428 A 0 1429 C 1437 1430 C 1436 1431 U 1435 1432 U 0 1433 U 0 1434 C 0 1435 A 1431 1436 G 1430 1437 G 1429 1438 A 0 1439 G 1426 1440 C 1425 1441 C 1424 1442 A 1423 1443 G 1421 1444 C 1420 1445 C 1419 1446 G 1418 1447 C 1417 1448 C 1416 1449 G 0 1450 A 0 1451 A 0 1452 G 1411 1453 G 1410 1454 U 1409 1455 G 1408 1456 G 1407 1457 G 1406 1458 G 1405 1459 U 1404 1460 C 1403 1461 G 1402 1462 A 1401 1463 U 1400 1464 G 0 1465 A 0 1466 U 1397 1467 U 1396 1468 G 1395 1469 G 1394 1470 G 1393 1471 G 1392 1472 U 1391 1473 G 1390 1474 A 0 1475 A 0 1476 G 0 1477 U 0 1478 C 1386 1479 G 1385 1480 U 0 1481 A 0 1482 A 1383 1483 C 1382 1484 A 0 1485 A 0 1486 G 1380 1487 G 0 1488 U 1511 1489 A 1510 1490 G 1509 1491 C 1508 1492 C 1507 1493 G 1506 1494 U 1505 1495 A 1504 1496 U 1503 1497 C 1502 1498 G 0 1499 G 0 1500 A 0 1501 A 0 1502 G 1497 1503 G 1496 1504 U 1495 1505 G 1494 1506 C 1493 1507 G 1492 1508 G 1491 1509 C 1490 1510 U 1489 1511 G 1488 1512 G 0 1513 A 0 1514 U 0 1515 C 0 1516 A 0 1517 C 0 1518 C 0 1519 U 0 1520 C 0 1521 C 0 1522 U 0 1523 U 0 1524 U 0 1525 C 0 1526 U 0