Filename: d.16.b.H.foetida.bpseq Organism: Holophaga foetida Accession Number: X77215 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 915 18 C 914 19 C 913 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 552 28 A 551 29 A 550 30 U 549 31 G 0 32 A 548 33 A 547 34 C 546 35 N 545 36 C 544 37 U 543 38 G 0 39 G 399 40 C 398 41 G 397 42 G 396 43 C 395 44 G 394 45 U 392 46 G 391 47 C 357 48 C 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 355 53 A 354 54 C 353 55 A 0 56 U 352 57 G 351 58 C 350 59 A 0 60 A 0 61 G 87 62 U 86 63 C 85 64 G 0 65 G 0 66 A 84 67 U 83 68 G 82 69 U 81 70 G 80 71 C 0 72 C 79 73 C 78 74 G 0 75 C 0 76 A 0 77 A 0 78 G 73 79 G 72 80 U 70 81 G 69 82 C 68 83 A 67 84 U 66 85 G 63 86 G 62 87 C 61 88 A 0 89 G 0 90 A 0 91 C 0 92 G 0 93 G 0 94 G 310 95 U 309 96 G 308 97 A 0 98 G 0 99 U 0 100 A 0 101 A 0 102 C 0 103 G 235 104 C 234 105 G 233 106 U 232 107 A 231 108 G 230 109 G 229 110 A 228 111 G 0 112 A 0 113 C 227 114 C 226 115 U 0 116 A 0 117 C 0 118 C 223 119 U 222 120 U 221 121 U 220 122 U 219 123 U 218 124 G 217 125 U 0 126 G 160 127 G 159 128 G 158 129 G 157 130 A 0 131 A 0 132 U 0 133 A 0 134 A 151 135 C 150 136 G 149 137 U 148 138 U 147 139 C 146 140 C 145 141 G 0 142 A 0 143 A 0 144 A 0 145 G 140 146 G 139 147 G 138 148 A 137 149 C 136 150 G 135 151 A 134 152 U 0 153 A 0 154 A 0 155 U 0 156 A 0 157 C 129 158 C 128 159 G 127 160 C 126 161 A 0 162 U 0 163 G 0 164 A 0 165 G 0 166 A 189 167 C 188 168 C 187 169 A 186 170 C 185 171 A 184 172 G 183 173 G 182 174 A 0 175 U 0 176 U 0 177 G 0 178 G 0 179 A 0 180 U 0 181 G 0 182 C 173 183 C 172 184 U 171 185 G 170 186 U 169 187 G 168 188 G 167 189 U 166 190 G 0 191 A 0 192 A 0 193 A 0 194 G 215 195 C 214 196 C 213 197 G 212 198 G 211 199 G 210 200 G 0 201 A 0 202 C 209 203 C 208 204 G 0 205 U 0 206 A 0 207 A 0 208 G 203 209 G 202 210 C 199 211 C 198 212 U 197 213 G 196 214 G 195 215 C 194 216 G 0 217 C 124 218 A 123 219 A 122 220 G 121 221 A 120 222 A 119 223 G 118 224 A 0 225 G 0 226 G 114 227 G 113 228 U 110 229 C 109 230 C 108 231 U 107 232 G 106 233 C 105 234 G 104 235 U 103 236 C 282 237 U 281 238 G 280 239 A 0 240 U 0 241 U 279 242 A 0 243 G 273 244 C 272 245 U 271 246 A 0 247 G 0 248 U 270 249 U 269 250 G 268 251 G 267 252 C 266 253 G 265 254 G 264 255 G 263 256 G 0 257 U 0 258 A 0 259 A 0 260 C 0 261 G 0 262 G 0 263 C 255 264 C 254 265 C 253 266 A 252 267 C 251 268 C 250 269 A 249 270 A 248 271 G 245 272 G 244 273 C 243 274 G 0 275 A 0 276 C 0 277 G 0 278 A 0 279 U 241 280 C 238 281 A 237 282 G 236 283 U 0 284 A 0 285 G 307 286 C 306 287 C 305 288 G 304 289 G 300 290 C 299 291 C 298 292 U 297 293 G 0 294 A 0 295 G 0 296 A 0 297 G 292 298 G 291 299 G 290 300 U 289 301 G 0 302 A 0 303 U 0 304 C 288 305 G 287 306 G 286 307 C 285 308 C 96 309 A 95 310 C 94 311 A 0 312 C 333 313 U 332 314 G 331 315 G 330 316 A 329 317 A 328 318 C 327 319 U 0 320 G 0 321 A 0 322 G 0 323 A 0 324 C 0 325 A 0 326 C 0 327 G 318 328 G 317 329 U 316 330 C 315 331 C 314 332 A 313 333 G 312 334 A 0 335 C 346 336 U 345 337 C 344 338 C 343 339 U 0 340 A 0 341 C 0 342 G 0 343 G 338 344 G 337 345 A 336 346 G 335 347 G 0 348 C 0 349 A 0 350 G 58 351 C 57 352 A 56 353 G 54 354 U 53 355 G 52 356 G 0 357 G 47 358 G 0 359 A 0 360 A 0 361 U 0 362 U 0 363 U 389 364 U 0 365 G 388 366 C 387 367 G 386 368 C 0 369 A 0 370 A 0 371 U 384 372 G 383 373 G 382 374 G 381 375 C 380 376 G 0 377 A 0 378 A 0 379 A 0 380 G 375 381 C 374 382 C 373 383 U 372 384 G 371 385 A 0 386 C 367 387 G 366 388 C 365 389 A 363 390 G 0 391 C 46 392 A 45 393 A 0 394 C 44 395 G 43 396 C 42 397 C 41 398 G 40 399 C 39 400 G 0 401 U 0 402 G 432 403 G 431 404 G 430 405 U 429 406 G 0 407 A 0 408 U 0 409 G 0 410 A 0 411 A 0 412 G 423 413 G 422 414 U 421 415 C 420 416 U 0 417 U 0 418 C 0 419 G 0 420 G 415 421 A 414 422 U 413 423 U 412 424 G 0 425 U 0 426 A 0 427 A 0 428 A 0 429 A 405 430 C 404 431 C 403 432 C 402 433 U 0 434 G 492 435 U 0 436 C 493 437 G 489 438 U 488 439 C 487 440 A 486 441 G 485 442 G 484 443 G 0 444 A 0 445 C 0 446 G 479 447 A 0 448 A 0 449 G 475 450 G 474 451 C 473 452 A 472 453 U 471 454 G 470 455 G 469 456 G 468 457 A 467 458 U 0 459 U 0 460 G 0 461 A 0 462 A 0 463 U 0 464 A 0 465 U 0 466 U 0 467 U 457 468 C 456 469 C 455 470 U 454 471 A 453 472 U 452 473 G 451 474 C 450 475 U 449 476 U 0 477 G 0 478 A 0 479 C 446 480 G 0 481 G 0 482 U 0 483 A 0 484 C 442 485 C 441 486 U 440 487 G 439 488 G 438 489 A 437 490 G 0 491 A 0 492 G 434 493 G 436 494 A 0 495 A 0 496 G 541 497 C 540 498 C 539 499 C 538 500 C 537 501 G 522 502 G 521 503 C 520 504 U 0 505 A 0 506 A 0 507 C 536 508 U 535 509 C 534 510 U 533 511 G 532 512 U 0 513 G 0 514 C 0 515 C 0 516 A 0 517 G 524 518 C 523 519 A 0 520 G 503 521 C 502 522 C 501 523 G 518 524 C 517 525 G 0 526 G 0 527 U 0 528 A 0 529 A 0 530 U 0 531 A 0 532 C 511 533 A 510 534 G 509 535 A 508 536 G 507 537 G 500 538 G 499 539 G 498 540 G 497 541 C 496 542 A 0 543 A 37 544 G 36 545 C 35 546 G 34 547 U 33 548 U 32 549 A 30 550 U 29 551 U 28 552 C 27 553 G 0 554 G 0 555 A 0 556 A 0 557 U 0 558 U 0 559 A 0 560 U 0 561 U 0 562 G 0 563 G 880 564 G 879 565 C 878 566 G 863 567 U 862 568 A 0 569 A 0 570 A 0 571 G 877 572 G 0 573 G 760 574 C 759 575 G 758 576 C 757 577 G 0 578 U 754 579 A 0 580 G 753 581 G 752 582 C 751 583 G 0 584 G 647 585 U 646 586 U 645 587 C 644 588 U 643 589 U 642 590 U 641 591 A 0 592 A 640 593 G 639 594 U 636 595 G 635 596 A 634 597 G 633 598 A 632 599 U 631 600 G 630 601 U 629 602 G 628 603 C 0 604 A 0 605 A 0 606 U 0 607 C 625 608 C 624 609 C 623 610 C 622 611 G 621 612 G 620 613 G 619 614 C 0 615 U 0 616 C 0 617 A 0 618 A 0 619 C 613 620 C 612 621 U 611 622 G 610 623 G 609 624 G 608 625 A 607 626 A 0 627 C 0 628 U 602 629 G 601 630 C 600 631 A 599 632 U 598 633 C 597 634 U 596 635 C 595 636 A 594 637 U 0 638 A 0 639 C 593 640 U 592 641 G 590 642 G 589 643 A 588 644 G 587 645 A 586 646 G 585 647 C 584 648 U 0 649 A 0 650 G 0 651 A 747 652 G 746 653 U 745 654 G 743 655 C 742 656 U 741 657 G 740 658 G 739 659 A 738 660 G 0 661 A 0 662 G 736 663 G 735 664 G 734 665 U 733 666 G 732 667 G 731 668 U 730 669 A 713 670 G 712 671 A 0 672 A 0 673 U 709 674 U 708 675 C 707 676 C 706 677 A 705 678 C 704 679 G 703 680 U 702 681 G 0 682 U 0 683 A 0 684 G 695 685 C 694 686 G 693 687 G 0 688 U 0 689 G 0 690 A 0 691 A 0 692 A 0 693 U 686 694 G 685 695 C 684 696 G 0 697 U 0 698 A 0 699 G 0 700 A 0 701 G 0 702 A 680 703 U 679 704 G 678 705 U 677 706 G 676 707 G 675 708 A 674 709 G 673 710 G 0 711 A 0 712 A 670 713 U 669 714 A 0 715 C 0 716 C 0 717 A 0 718 G 729 719 U 0 720 G 0 721 G 728 722 C 727 723 G 0 724 A 0 725 A 0 726 G 0 727 G 722 728 C 721 729 G 718 730 G 668 731 C 667 732 C 666 733 A 665 734 C 664 735 C 663 736 U 662 737 G 0 738 G 659 739 A 658 740 C 657 741 A 656 742 G 655 743 U 654 744 A 0 745 A 653 746 C 652 747 U 651 748 G 0 749 A 0 750 C 0 751 G 582 752 C 581 753 U 580 754 G 578 755 A 0 756 G 0 757 G 576 758 C 575 759 G 574 760 C 573 761 G 0 762 A 0 763 A 0 764 A 0 765 G 806 766 U 805 767 G 804 768 U 803 769 G 802 770 G 801 771 G 0 772 U 0 773 A 0 774 G 800 775 C 799 776 A 0 777 A 0 778 A 0 779 C 795 780 A 794 781 G 793 782 G 792 783 A 0 784 U 0 785 U 0 786 A 0 787 G 0 788 A 0 789 U 0 790 A 0 791 C 0 792 C 782 793 C 781 794 U 780 795 G 779 796 G 0 797 U 0 798 A 0 799 G 775 800 U 774 801 C 770 802 C 769 803 A 768 804 C 767 805 G 766 806 C 765 807 U 0 808 G 0 809 U 0 810 A 0 811 A 0 812 A 0 813 C 0 814 G 0 815 A 0 816 U 0 817 G 876 818 A 875 819 A 874 820 C 873 821 A 872 822 C 871 823 U 0 824 U 0 825 G 854 826 G 853 827 U 852 828 G 851 829 U 850 830 G 849 831 G 848 832 U 847 833 G 846 834 G 845 835 G 844 836 A 843 837 G 842 838 U 0 839 U 0 840 G 0 841 A 0 842 C 837 843 C 836 844 C 835 845 C 834 846 U 833 847 G 832 848 C 831 849 C 830 850 G 829 851 U 828 852 G 827 853 C 826 854 C 825 855 G 0 856 G 0 857 A 0 858 G 865 859 C 864 860 U 0 861 A 0 862 A 567 863 C 566 864 G 859 865 C 858 866 G 0 867 U 0 868 U 0 869 A 0 870 A 0 871 G 822 872 U 821 873 G 820 874 U 819 875 U 818 876 C 817 877 C 571 878 G 565 879 C 564 880 C 563 881 U 0 882 G 909 883 G 908 884 G 907 885 G 0 886 A 0 887 G 0 888 U 0 889 A 0 890 C 0 891 G 902 892 G 901 893 U 900 894 C 899 895 G 0 896 C 0 897 A 0 898 A 0 899 G 894 900 G 893 901 C 892 902 U 891 903 G 0 904 A 0 905 A 0 906 A 0 907 C 884 908 U 883 909 C 882 910 A 0 911 A 0 912 A 0 913 G 19 914 G 18 915 A 17 916 A 0 917 U 0 918 U 1392 919 G 1391 920 A 1389 921 C 1388 922 G 1387 923 G 0 924 G 1386 925 G 1385 926 G 1384 927 C 1383 928 C 1382 929 C 1381 930 G 1380 931 C 0 932 A 1376 933 C 1375 934 A 0 935 A 0 936 G 1340 937 C 1339 938 G 1338 939 G 1337 940 U 1336 941 G 1233 942 G 1232 943 A 1231 944 G 1230 945 C 1229 946 A 1228 947 U 1227 948 G 1226 949 U 1225 950 G 1224 951 G 1222 952 U 1221 953 U 0 954 U 0 955 A 0 956 A 0 957 U 972 958 U 971 959 C 970 960 G 969 961 A 0 962 C 0 963 G 0 964 C 0 965 A 0 966 A 0 967 C 0 968 G 0 969 C 960 970 G 959 971 A 958 972 A 957 973 G 0 974 A 0 975 A 0 976 C 0 977 C 0 978 U 0 979 U 0 980 A 0 981 C 1217 982 C 1216 983 U 1215 984 G 1214 985 G 1213 986 G 1212 987 C 1211 988 U 0 989 U 0 990 G 0 991 A 0 992 A 0 993 C 1041 994 U 1040 995 G 1039 996 U 1038 997 A 1037 998 A 1036 999 U 1035 1000 G 1034 1001 G 0 1002 A 0 1003 C 0 1004 C 1021 1005 G 1020 1006 G 1019 1007 U 1018 1008 G 1017 1009 C 1016 1010 A 1015 1011 G 0 1012 A 0 1013 G 0 1014 A 0 1015 U 1010 1016 G 1009 1017 U 1008 1018 G 1007 1019 C 1006 1020 C 1005 1021 U 1004 1022 U 0 1023 U 1032 1024 U 1031 1025 C 1030 1026 G 0 1027 C 0 1028 A 0 1029 A 0 1030 G 1025 1031 A 1024 1032 A 1023 1033 C 0 1034 U 1000 1035 G 999 1036 U 998 1037 U 997 1038 A 996 1039 C 995 1040 A 994 1041 G 993 1042 A 0 1043 G 1206 1044 G 1205 1045 U 0 1046 G 1204 1047 C 1203 1048 U 1202 1049 G 1201 1050 C 0 1051 A 0 1052 U 1200 1053 G 1199 1054 G 1195 1055 C 1194 1056 U 1193 1057 G 1191 1058 U 1190 1059 C 1189 1060 G 1188 1061 U 0 1062 C 0 1063 A 0 1064 G 1103 1065 C 1102 1066 U 1101 1067 C 1100 1068 G 1099 1069 U 1098 1070 G 1079 1071 U 1078 1072 C 1077 1073 G 0 1074 U 0 1075 G 0 1076 A 0 1077 G 1072 1078 A 1071 1079 U 1070 1080 G 0 1081 U 0 1082 U 1095 1083 G 1094 1084 G 1093 1085 G 1092 1086 U 0 1087 U 0 1088 A 0 1089 A 0 1090 G 0 1091 U 0 1092 C 1085 1093 C 1084 1094 C 1083 1095 G 1082 1096 C 0 1097 A 0 1098 A 1069 1099 C 1068 1100 G 1067 1101 A 1066 1102 G 1065 1103 C 1064 1104 G 0 1105 C 0 1106 A 0 1107 A 0 1108 C 0 1109 C 1183 1110 C 1182 1111 U 1181 1112 U 1180 1113 A 0 1114 C 1152 1115 C 1151 1116 C 1150 1117 U 1149 1118 U 1148 1119 A 1147 1120 G 1146 1121 U 0 1122 U 0 1123 G 0 1124 C 1141 1125 C 1140 1126 A 0 1127 G 0 1128 C 1139 1129 G 1138 1130 C 1137 1131 G 0 1132 U 0 1133 A 0 1134 A 0 1135 A 0 1136 G 0 1137 G 1130 1138 C 1129 1139 G 1128 1140 G 1125 1141 G 1124 1142 A 0 1143 A 0 1144 C 0 1145 U 0 1146 C 1120 1147 U 1119 1148 A 1118 1149 A 1117 1150 G 1116 1151 G 1115 1152 G 1114 1153 G 0 1154 A 0 1155 C 1174 1156 U 1173 1157 G 1172 1158 C 1171 1159 C 1170 1160 G 1169 1161 G 1168 1162 G 1167 1163 U 0 1164 U 0 1165 A 0 1166 A 0 1167 C 1162 1168 C 1161 1169 G 1160 1170 G 1159 1171 G 1158 1172 A 1157 1173 G 1156 1174 G 1155 1175 A 0 1176 A 0 1177 G 0 1178 G 0 1179 U 0 1180 G 1112 1181 G 1111 1182 G 1110 1183 G 1109 1184 A 0 1185 U 0 1186 G 0 1187 A 0 1188 U 1060 1189 G 1059 1190 U 1058 1191 C 1057 1192 A 0 1193 A 1056 1194 G 1055 1195 U 1054 1196 C 0 1197 C 0 1198 U 0 1199 C 1053 1200 A 1052 1201 U 1049 1202 G 1048 1203 G 1047 1204 C 1046 1205 C 1044 1206 C 1043 1207 U 0 1208 U 0 1209 A 0 1210 U 0 1211 G 987 1212 U 986 1213 C 985 1214 C 984 1215 A 983 1216 G 982 1217 G 981 1218 G 0 1219 C 0 1220 U 0 1221 A 952 1222 C 951 1223 A 0 1224 C 950 1225 A 949 1226 C 948 1227 G 947 1228 U 946 1229 G 945 1230 C 944 1231 U 943 1232 A 942 1233 C 941 1234 A 0 1235 A 0 1236 U 0 1237 G 1292 1238 G 1291 1239 G 1290 1240 C 1289 1241 G 1288 1242 A 1287 1243 U 1286 1244 A 0 1245 C 0 1246 A 0 1247 A 0 1248 A 0 1249 C 1280 1250 C 1279 1251 G 1278 1252 U 0 1253 G 0 1254 C 1273 1255 C 1272 1256 G 0 1257 A 0 1258 G 0 1259 G 1268 1260 C 1267 1261 C 1266 1262 G 0 1263 C 0 1264 G 0 1265 A 0 1266 G 1261 1267 G 1260 1268 U 1259 1269 G 0 1270 G 0 1271 A 0 1272 G 1255 1273 C 1254 1274 U 0 1275 A 0 1276 A 0 1277 U 0 1278 C 1251 1279 G 1250 1280 G 1249 1281 A 0 1282 G 0 1283 A 0 1284 A 0 1285 A 0 1286 G 1243 1287 U 1242 1288 C 1241 1289 G 1240 1290 C 1239 1291 C 1238 1292 C 1237 1293 U 0 1294 C 0 1295 A 0 1296 G 0 1297 U 0 1298 U 0 1299 C 1330 1300 G 0 1301 G 0 1302 A 0 1303 U 1326 1304 U 1325 1305 G 1324 1306 U 1323 1307 A 1322 1308 G 1321 1309 U 1320 1310 C 1319 1311 U 0 1312 G 0 1313 C 0 1314 A 0 1315 A 0 1316 C 0 1317 U 0 1318 C 0 1319 G 1310 1320 A 1309 1321 C 1308 1322 U 1307 1323 A 1306 1324 C 1305 1325 A 1304 1326 U 1303 1327 G 0 1328 A 0 1329 A 0 1330 G 1299 1331 G 0 1332 U 0 1333 G 0 1334 G 0 1335 A 0 1336 A 940 1337 U 939 1338 C 938 1339 G 937 1340 C 936 1341 U 0 1342 A 0 1343 G 0 1344 U 0 1345 A 0 1346 A 1368 1347 U 1367 1348 C 1366 1349 G 1365 1350 U 1364 1351 G 1363 1352 U 1362 1353 A 1361 1354 U 0 1355 C 0 1356 A 0 1357 G 0 1358 A 0 1359 A 0 1360 U 0 1361 G 1353 1362 A 1352 1363 U 1351 1364 A 1350 1365 C 1349 1366 G 1348 1367 G 1347 1368 U 1346 1369 G 0 1370 A 0 1371 A 0 1372 U 0 1373 A 0 1374 C 0 1375 G 933 1376 U 932 1377 U 0 1378 C 0 1379 C 0 1380 C 930 1381 G 929 1382 G 928 1383 G 927 1384 C 926 1385 C 925 1386 U 924 1387 U 922 1388 G 921 1389 U 920 1390 A 0 1391 C 919 1392 A 918 1393 C 0 1394 A 0 1395 C 1502 1396 C 0 1397 G 1499 1398 C 1498 1399 C 0 1400 C 1495 1401 G 1494 1402 U 0 1403 C 0 1404 A 0 1405 C 1489 1406 A 1488 1407 U 1487 1408 C 1486 1409 A 1485 1410 C 1484 1411 G 1483 1412 A 1482 1413 A 0 1414 A 0 1415 G 1479 1416 C 1478 1417 C 1477 1418 G 1476 1419 G 1475 1420 G 1474 1421 A 1473 1422 G 1472 1423 C 1471 1424 A 1470 1425 C 1469 1426 U 1468 1427 U 0 1428 G 0 1429 A 0 1430 A 0 1431 G 1464 1432 A 1463 1433 G 1462 1434 G 1461 1435 C 1460 1436 U 1459 1437 G 0 1438 U 1458 1439 G 1457 1440 G 1456 1441 U 1455 1442 A 0 1443 A 0 1444 C 1453 1445 C 1452 1446 C 1451 1447 G 0 1448 C 0 1449 A 0 1450 A 0 1451 G 1446 1452 G 1445 1453 G 1444 1454 G 0 1455 G 1441 1456 C 1440 1457 U 1439 1458 A 1438 1459 G 1436 1460 G 1435 1461 U 1434 1462 U 1433 1463 U 1432 1464 C 1431 1465 A 0 1466 A 0 1467 U 0 1468 G 1426 1469 G 1425 1470 U 1424 1471 G 1423 1472 A 1422 1473 A 1421 1474 C 1420 1475 U 1419 1476 U 1418 1477 G 1417 1478 G 1416 1479 U 1415 1480 G 0 1481 A 0 1482 U 1412 1483 U 1411 1484 G 1410 1485 G 1409 1486 G 1408 1487 G 1407 1488 U 1406 1489 G 1405 1490 A 0 1491 A 0 1492 G 0 1493 U 0 1494 C 1401 1495 G 1400 1496 U 0 1497 A 0 1498 A 1398 1499 C 1397 1500 A 0 1501 A 0 1502 G 1395 1503 G 0 1504 U 1527 1505 A 1526 1506 U 1525 1507 C 1524 1508 C 1523 1509 G 1522 1510 N 1521 1511 N 1520 1512 N 1519 1513 N 1518 1514 N 0 1515 N 0 1516 N 0 1517 N 0 1518 N 1513 1519 N 1512 1520 N 1511 1521 N 1510 1522 N 1509 1523 N 1508 1524 N 1507 1525 N 1506 1526 N 1505 1527 N 1504 1528 N 0 1529 N 0 1530 N 0 1531 N 0 1532 N 0 1533 N 0 1534 N 0 1535 N 0 1536 N 0 1537 N 0 1538 N 0 1539 N 0 1540 N 0