Filename: d.16.b.H.pylori2.bpseq
Organism: Helicobacter pylori
Accession Number: M88157
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 U 0
2 U 0
3 U 0
4 A 0
5 U 0
6 G 0
7 G 0
8 A 0
9 G 25
10 A 24
11 G 23
12 U 22
13 U 21
14 U 0
15 G 0
16 A 0
17 U 880
18 C 879
19 C 878
20 U 0
21 G 13
22 G 12
23 C 11
24 U 10
25 C 9
26 A 0
27 G 516
28 A 515
29 G 514
30 U 513
31 G 0
32 A 512
33 A 511
34 C 510
35 G 509
36 C 508
37 U 507
38 G 0
39 G 388
40 C 387
41 G 386
42 G 385
43 C 384
44 G 383
45 U 381
46 G 380
47 C 346
48 C 0
49 U 0
50 A 0
51 A 0
52 U 344
53 A 343
54 C 342
55 A 0
56 U 341
57 G 340
58 C 339
59 A 0
60 A 0
61 G 105
62 U 104
63 C 103
64 G 0
65 A 0
66 A 102
67 C 101
68 G 100
69 A 98
70 U 97
71 G 0
72 A 0
73 A 0
74 G 94
75 C 93
76 U 91
77 U 90
78 C 89
79 U 88
80 A 87
81 G 86
82 C 0
83 U 0
84 U 0
85 G 0
86 C 81
87 U 80
88 A 79
89 G 78
90 A 77
91 G 76
92 U 0
93 G 75
94 C 74
95 U 0
96 G 0
97 A 70
98 U 69
99 U 0
100 A 68
101 G 67
102 U 66
103 G 63
104 G 62
105 C 61
106 G 0
107 C 0
108 A 0
109 C 0
110 G 0
111 G 0
112 G 299
113 U 298
114 G 297
115 A 0
116 G 0
117 U 0
118 A 0
119 A 0
120 C 0
121 G 224
122 C 223
123 A 222
124 U 221
125 A 220
126 G 219
127 G 218
128 U 217
129 C 0
130 A 0
131 U 216
132 G 215
133 U 0
134 G 0
135 C 0
136 C 212
137 U 211
138 C 210
139 U 209
140 U 208
141 A 207
142 G 206
143 U 0
144 U 178
145 U 177
146 G 176
147 G 175
148 G 0
149 A 0
150 U 0
151 A 0
152 G 169
153 C 168
154 C 167
155 A 166
156 U 165
157 U 164
158 G 163
159 G 0
160 A 0
161 A 0
162 A 0
163 C 158
164 G 157
165 A 156
166 U 155
167 G 154
168 A 153
169 U 152
170 U 0
171 A 0
172 A 0
173 U 0
174 A 0
175 C 147
176 C 146
177 A 145
178 G 144
179 A 0
180 U 0
181 A 0
182 C 193
183 U 192
184 C 191
185 C 190
186 U 0
187 A 0
188 C 0
189 G 0
190 G 185
191 G 184
192 G 183
193 G 182
194 A 0
195 A 0
196 A 0
197 G 204
198 A 203
199 U 0
200 U 0
201 U 0
202 A 0
203 U 198
204 C 197
205 G 0
206 C 142
207 U 141
208 A 140
209 A 139
210 G 138
211 A 137
212 G 136
213 A 0
214 U 0
215 C 132
216 A 131
217 G 128
218 C 127
219 C 126
220 U 125
221 A 124
222 U 123
223 G 122
224 U 121
225 C 271
226 C 270
227 U 269
228 A 0
229 U 0
230 C 268
231 A 0
232 G 262
233 C 261
234 U 260
235 U 0
236 G 0
237 U 259
238 U 258
239 G 257
240 G 256
241 U 255
242 A 254
243 A 253
244 G 252
245 G 0
246 U 0
247 A 0
248 A 0
249 U 0
250 G 0
251 G 0
252 C 244
253 U 243
254 U 242
255 A 241
256 C 240
257 C 239
258 A 238
259 A 237
260 G 234
261 G 233
262 C 232
263 U 0
264 A 0
265 U 0
266 G 0
267 A 0
268 C 230
269 G 227
270 G 226
271 G 225
272 U 0
273 A 0
274 U 296
275 C 295
276 C 294
277 G 293
278 G 289
279 C 288
280 C 287
281 U 286
282 G 0
283 A 0
284 G 0
285 A 0
286 G 281
287 G 280
288 G 279
289 U 278
290 G 0
291 A 0
292 A 0
293 C 277
294 G 276
295 G 275
296 A 274
297 C 114
298 A 113
299 C 112
300 A 0
301 C 322
302 U 321
303 G 320
304 G 319
305 A 318
306 A 317
307 C 0
308 U 0
309 G 0
310 A 0
311 G 0
312 A 0
313 C 0
314 A 0
315 C 0
316 G 0
317 G 306
318 U 305
319 C 304
320 C 303
321 A 302
322 G 301
323 A 0
324 C 335
325 U 334
326 C 333
327 C 332
328 U 0
329 A 0
330 C 0
331 G 0
332 G 327
333 G 326
334 A 325
335 G 324
336 G 0
337 C 0
338 A 0
339 G 58
340 C 57
341 A 56
342 G 54
343 U 53
344 A 52
345 G 0
346 G 47
347 G 0
348 A 0
349 A 0
350 U 0
351 A 0
352 U 378
353 U 0
354 G 377
355 C 376
356 U 375
357 C 0
358 A 0
359 A 0
360 U 373
361 G 372
362 G 371
363 G 370
364 G 369
365 G 0
366 A 0
367 A 0
368 A 0
369 C 364
370 C 363
371 C 362
372 U 361
373 G 360
374 A 0
375 A 356
376 G 355
377 C 354
378 A 352
379 G 0
380 C 46
381 A 45
382 A 0
383 C 44
384 G 43
385 C 42
386 C 41
387 G 40
388 C 39
389 G 0
390 U 0
391 G 421
392 G 420
393 A 419
394 G 418
395 G 0
396 A 0
397 U 0
398 G 0
399 A 0
400 A 0
401 G 412
402 G 411
403 U 410
404 U 409
405 U 0
406 U 0
407 A 0
408 G 0
409 G 404
410 A 403
411 U 402
412 U 401
413 G 0
414 U 0
415 A 0
416 A 0
417 A 0
418 C 394
419 U 393
420 C 392
421 C 391
422 U 0
423 U 456
424 U 0
425 U 457
426 G 453
427 U 452
428 U 451
429 A 450
430 G 449
431 A 448
432 G 0
433 A 0
434 A 0
435 G 443
436 A 0
437 U 0
438 A 0
439 A 0
440 U 0
441 G 0
442 A 0
443 C 435
444 G 0
445 G 0
446 U 0
447 A 0
448 U 431
449 C 430
450 U 429
451 A 428
452 A 427
453 C 426
454 G 0
455 A 0
456 A 423
457 U 425
458 A 0
459 A 0
460 G 505
461 C 504
462 A 503
463 C 502
464 C 501
465 G 486
466 G 485
467 C 484
468 U 0
469 A 0
470 A 0
471 C 500
472 U 499
473 C 498
474 C 497
475 G 496
476 U 0
477 G 0
478 C 0
479 C 0
480 A 0
481 G 488
482 C 487
483 A 0
484 G 467
485 C 466
486 C 465
487 G 482
488 C 481
489 G 0
490 G 0
491 U 0
492 A 0
493 A 0
494 U 0
495 A 0
496 C 475
497 G 474
498 G 473
499 A 472
500 G 471
501 G 464
502 G 463
503 U 462
504 G 461
505 C 460
506 A 0
507 A 37
508 G 36
509 C 35
510 G 34
511 U 33
512 U 32
513 A 30
514 C 29
515 U 28
516 C 27
517 G 0
518 G 0
519 A 0
520 A 0
521 U 0
522 C 0
523 A 0
524 C 0
525 U 0
526 G 0
527 G 845
528 G 844
529 C 843
530 G 828
531 U 827
532 A 0
533 A 0
534 A 0
535 G 842
536 A 0
537 G 725
538 C 724
539 G 723
540 C 722
541 G 0
542 U 718
543 A 0
544 G 717
545 G 716
546 C 715
547 G 0
548 G 611
549 G 610
550 A 609
551 U 608
552 A 607
553 G 606
554 U 605
555 C 0
556 A 604
557 G 603
558 U 600
559 C 599
560 A 598
561 G 597
562 G 596
563 U 595
564 G 594
565 U 593
566 G 592
567 A 0
568 A 0
569 A 0
570 U 0
571 C 589
572 C 588
573 U 587
574 A 586
575 U 585
576 G 584
577 G 583
578 C 0
579 U 0
580 U 0
581 A 0
582 A 0
583 C 577
584 C 576
585 A 575
586 U 574
587 A 573
588 G 572
589 A 571
590 A 0
591 C 0
592 U 566
593 G 565
594 C 564
595 A 563
596 U 562
597 U 561
598 U 560
599 G 559
600 A 558
601 A 0
602 A 0
603 C 557
604 U 556
605 A 554
606 C 553
607 U 552
608 A 551
609 U 550
610 U 549
611 C 548
612 U 0
613 A 0
614 G 0
615 A 711
616 G 710
617 U 709
618 G 707
619 U 706
620 G 705
621 G 704
622 G 703
623 A 702
624 G 0
625 A 0
626 G 700
627 G 699
628 U 698
629 A 697
630 G 696
631 G 695
632 U 694
633 G 677
634 G 676
635 A 0
636 A 0
637 U 673
638 U 672
639 C 671
640 U 670
641 U 669
642 G 668
643 G 667
644 U 666
645 G 0
646 U 0
647 A 0
648 G 659
649 G 658
650 G 657
651 G 0
652 U 0
653 A 0
654 A 0
655 A 0
656 A 0
657 U 650
658 C 649
659 C 648
660 G 0
661 U 0
662 A 0
663 G 0
664 A 0
665 G 0
666 A 644
667 U 643
668 C 642
669 A 641
670 A 640
671 G 639
672 A 638
673 G 637
674 G 0
675 A 0
676 A 634
677 U 633
678 A 0
679 C 0
680 U 0
681 C 0
682 A 693
683 U 0
684 U 0
685 G 692
686 C 691
687 G 0
688 A 0
689 A 0
690 G 0
691 G 686
692 C 685
693 G 682
694 A 632
695 C 631
696 C 630
697 U 629
698 G 628
699 C 627
700 U 626
701 G 0
702 G 623
703 A 622
704 A 621
705 C 620
706 A 619
707 U 618
708 U 0
709 A 617
710 C 616
711 U 615
712 G 0
713 A 0
714 C 0
715 G 546
716 C 545
717 U 544
718 G 542
719 A 0
720 U 0
721 U 0
722 G 540
723 C 539
724 G 538
725 C 537
726 U 0
727 A 0
728 A 0
729 A 0
730 G 771
731 C 770
732 G 769
733 U 768
734 G 767
735 G 766
736 G 0
737 G 0
738 A 0
739 G 765
740 C 764
741 A 0
742 A 0
743 A 0
744 C 760
745 A 759
746 G 758
747 G 757
748 A 0
749 U 0
750 U 0
751 A 0
752 G 0
753 A 0
754 U 0
755 A 0
756 C 0
757 C 747
758 C 746
759 U 745
760 G 744
761 G 0
762 U 0
763 A 0
764 G 740
765 U 739
766 C 735
767 C 734
768 A 733
769 C 732
770 G 731
771 C 730
772 C 0
773 C 0
774 U 0
775 A 0
776 A 0
777 A 0
778 C 0
779 G 0
780 A 0
781 U 0
782 G 841
783 G 840
784 A 839
785 U 838
786 G 837
787 C 836
788 U 0
789 A 0
790 G 819
791 U 818
792 U 817
793 G 816
794 U 815
795 U 814
796 G 813
797 G 812
798 A 811
799 G 810
800 G 809
801 G 808
802 C 0
803 U 0
804 U 0
805 A 0
806 G 0
807 U 0
808 C 801
809 U 800
810 C 799
811 U 798
812 C 797
813 C 796
814 A 795
815 G 794
816 U 793
817 A 792
818 A 791
819 U 790
820 G 0
821 C 0
822 A 0
823 G 830
824 C 829
825 U 0
826 A 0
827 A 531
828 C 530
829 G 824
830 C 823
831 A 0
832 U 0
833 U 0
834 A 0
835 A 0
836 G 787
837 C 786
838 A 785
839 U 784
840 C 783
841 C 782
842 C 535
843 G 529
844 C 528
845 C 527
846 U 0
847 G 874
848 G 873
849 G 872
850 G 0
851 A 0
852 G 0
853 U 0
854 A 0
855 C 0
856 G 867
857 G 866
858 U 865
859 C 864
860 G 0
861 C 0
862 A 0
863 A 0
864 G 859
865 A 858
866 U 857
867 U 856
868 A 0
869 A 0
870 A 0
871 A 0
872 C 849
873 U 848
874 C 847
875 A 0
876 A 0
877 A 0
878 G 19
879 G 18
880 A 17
881 A 0
882 U 0
883 A 1363
884 G 1362
885 A 1360
886 C 1359
887 G 1358
888 G 0
889 G 1357
890 G 1356
891 A 1355
892 C 1354
893 C 1353
894 C 1352
895 G 1351
896 C 0
897 A 1347
898 C 1346
899 A 0
900 A 0
901 G 1310
902 C 1309
903 G 1308
904 G 1307
905 U 1306
906 G 1204
907 G 1203
908 A 1202
909 G 1201
910 C 1200
911 A 1199
912 N 1198
913 G 1197
914 U 1196
915 G 1195
916 G 1193
917 U 1192
918 U 0
919 U 0
920 A 0
921 A 0
922 U 937
923 U 936
924 C 935
925 G 934
926 A 0
927 N 0
928 N 0
929 N 0
930 N 0
931 A 0
932 C 0
933 A 0
934 C 925
935 G 924
936 A 923
937 A 922
938 G 0
939 A 0
940 A 0
941 C 0
942 C 0
943 U 0
944 U 0
945 A 0
946 C 1188
947 C 1187
948 U 1186
949 A 1185
950 G 1184
951 G 1183
952 C 1182
953 U 0
954 U 0
955 G 0
956 A 0
957 C 0
958 A 1012
959 U 1011
960 U 1010
961 G 1008
962 A 1007
963 G 1006
964 A 1005
965 G 1004
966 A 0
967 A 0
968 U 985
969 C 984
970 C 983
971 G 982
972 C 981
973 U 980
974 A 979
975 G 0
976 A 0
977 A 0
978 A 0
979 U 974
980 A 973
981 G 972
982 U 971
983 G 970
984 G 969
985 A 968
986 G 0
987 U 0
988 G 1003
989 U 1002
990 C 1001
991 U 1000
992 A 999
993 G 998
994 C 0
995 U 0
996 U 0
997 G 0
998 C 993
999 U 992
1000 A 991
1001 G 990
1002 A 989
1003 C 988
1004 C 965
1005 U 964
1006 U 963
1007 G 962
1008 A 961
1009 A 0
1010 A 960
1011 A 959
1012 C 958
1013 A 0
1014 G 1177
1015 G 1176
1016 U 0
1017 G 1175
1018 C 1174
1019 U 1173
1020 G 1172
1021 C 0
1022 A 0
1023 C 1171
1024 G 1170
1025 G 1166
1026 C 1165
1027 U 1164
1028 G 1162
1029 U 1161
1030 C 1160
1031 G 1159
1032 U 0
1033 C 0
1034 A 0
1035 G 1074
1036 C 1073
1037 U 1072
1038 C 1071
1039 G 1070
1040 U 1069
1041 G 1050
1042 U 1049
1043 C 1048
1044 G 0
1045 U 0
1046 G 0
1047 A 0
1048 G 1043
1049 A 1042
1050 U 1041
1051 G 0
1052 U 0
1053 U 1066
1054 G 1065
1055 G 1064
1056 G 1063
1057 U 0
1058 U 0
1059 A 0
1060 A 0
1061 G 0
1062 U 0
1063 C 1056
1064 C 1055
1065 C 1054
1066 G 1053
1067 C 0
1068 A 0
1069 A 1040
1070 C 1039
1071 G 1038
1072 A 1037
1073 G 1036
1074 C 1035
1075 G 0
1076 C 0
1077 A 0
1078 A 0
1079 C 0
1080 C 1154
1081 C 1153
1082 C 1152
1083 N 1151
1084 U 0
1085 U 1123
1086 U 1122
1087 C 1121
1088 U 1120
1089 U 1119
1090 A 1118
1091 G 1117
1092 U 0
1093 U 0
1094 G 0
1095 C 1112
1096 U 1111
1097 A 0
1098 A 0
1099 C 1110
1100 A 1109
1101 G 1108
1102 G 0
1103 U 0
1104 U 0
1105 A 0
1106 U 0
1107 G 0
1108 C 1101
1109 U 1100
1110 G 1099
1111 A 1096
1112 G 1095
1113 A 0
1114 A 0
1115 C 0
1116 U 0
1117 C 1091
1118 U 1090
1119 A 1089
1120 A 1088
1121 G 1087
1122 G 1086
1123 A 1085
1124 U 0
1125 A 0
1126 C 1145
1127 U 1144
1128 G 1143
1129 C 1142
1130 C 1141
1131 U 1140
1132 C 1139
1133 C 1138
1134 G 0
1135 U 0
1136 A 0
1137 A 0
1138 G 1133
1139 G 1132
1140 A 1131
1141 G 1130
1142 G 1129
1143 A 1128
1144 G 1127
1145 G 1126
1146 A 0
1147 A 0
1148 G 0
1149 G 0
1150 U 0
1151 G 1083
1152 G 1082
1153 G 1081
1154 G 1080
1155 A 0
1156 C 0
1157 G 0
1158 A 0
1159 C 1031
1160 G 1030
1161 U 1029
1162 C 1028
1163 A 0
1164 A 1027
1165 G 1026
1166 U 1025
1167 C 0
1168 A 0
1169 U 0
1170 C 1024
1171 A 1023
1172 U 1020
1173 G 1019
1174 G 1018
1175 C 1017
1176 C 1015
1177 C 1014
1178 U 0
1179 U 0
1180 A 0
1181 C 0
1182 G 952
1183 C 951
1184 C 950
1185 U 949
1186 A 948
1187 G 947
1188 G 946
1189 G 0
1190 C 0
1191 U 0
1192 A 917
1193 C 916
1194 A 0
1195 C 915
1196 A 914
1197 C 913
1198 G 912
1199 U 911
1200 G 910
1201 C 909
1202 U 908
1203 A 907
1204 C 906
1205 A 0
1206 A 0
1207 U 0
1208 G 1262
1209 G 1261
1210 G 1260
1211 G 1259
1212 U 1258
1213 G 1257
1214 C 1256
1215 A 0
1216 C 0
1217 A 0
1218 A 0
1219 A 0
1220 G 1251
1221 A 1250
1222 G 1249
1223 A 0
1224 A 0
1225 G 1244
1226 C 1243
1227 A 0
1228 A 0
1229 U 0
1230 A 1239
1231 C 1238
1232 U 1237
1233 G 0
1234 U 0
1235 G 0
1236 A 0
1237 A 1232
1238 G 1231
1239 U 1230
1240 G 0
1241 G 0
1242 A 0
1243 G 1226
1244 C 1225
1245 C 0
1246 A 0
1247 A 0
1248 U 0
1249 C 1222
1250 U 1221
1251 U 1220
1252 C 0
1253 A 0
1254 A 0
1255 A 0
1256 A 1214
1257 C 1213
1258 A 1212
1259 C 1211
1260 C 1210
1261 U 1209
1262 C 1208
1263 U 0
1264 C 0
1265 A 0
1266 G 0
1267 U 0
1268 U 0
1269 C 1300
1270 G 0
1271 G 0
1272 A 0
1273 U 1296
1274 U 1295
1275 G 1294
1276 U 1293
1277 A 1292
1278 G 1291
1279 G 1290
1280 C 1289
1281 U 0
1282 G 0
1283 C 0
1284 A 0
1285 A 0
1286 C 0
1287 U 0
1288 C 0
1289 G 1280
1290 C 1279
1291 C 1278
1292 U 1277
1293 G 1276
1294 C 1275
1295 A 1274
1296 U 1273
1297 G 0
1298 A 0
1299 A 0
1300 G 1269
1301 C 0
1302 U 0
1303 G 0
1304 G 0
1305 A 0
1306 A 905
1307 U 904
1308 C 903
1309 G 902
1310 C 901
1311 U 0
1312 A 0
1313 G 0
1314 U 0
1315 A 0
1316 A 1339
1317 U 1338
1318 C 1337
1319 G 1336
1320 C 1335
1321 A 1334
1322 A 1333
1323 A 1332
1324 U 0
1325 C 0
1326 A 0
1327 G 0
1328 C 0
1329 C 0
1330 A 0
1331 U 0
1332 G 1323
1333 U 1322
1334 U 1321
1335 G 1320
1336 C 1319
1337 G 1318
1338 G 1317
1339 U 1316
1340 G 0
1341 A 0
1342 A 0
1343 U 0
1344 A 0
1345 C 0
1346 G 898
1347 U 897
1348 U 0
1349 C 0
1350 C 0
1351 C 895
1352 G 894
1353 G 893
1354 G 892
1355 U 891
1356 C 890
1357 U 889
1358 U 887
1359 G 886
1360 U 885
1361 A 0
1362 C 884
1363 U 883
1364 C 0
1365 A 0
1366 C 1465
1367 C 0
1368 G 1462
1369 C 1461
1370 C 0
1371 C 1458
1372 G 1457
1373 U 0
1374 C 1455
1375 A 0
1376 C 1452
1377 A 1451
1378 C 1450
1379 C 1449
1380 A 1448
1381 U 1447
1382 G 1446
1383 G 1445
1384 G 0
1385 A 0
1386 G 1442
1387 U 1441
1388 U 1440
1389 G 1439
1390 U 1438
1391 G 1437
1392 U 1436
1393 U 1435
1394 U 1434
1395 G 1433
1396 C 1432
1397 C 1431
1398 U 0
1399 U 0
1400 A 0
1401 A 0
1402 G 1427
1403 U 1426
1404 C 1425
1405 A 1424
1406 G 1423
1407 G 1422
1408 A 1421
1409 U 0
1410 G 1420
1411 C 1419
1412 U 1418
1413 A 1417
1414 A 0
1415 A 0
1416 U 0
1417 U 1413
1418 G 1412
1419 G 1411
1420 C 1410
1421 U 1408
1422 A 1407
1423 C 1406
1424 U 1405
1425 G 1404
1426 C 1403
1427 C 1402
1428 C 0
1429 A 0
1430 C 0
1431 G 1397
1432 G 1396
1433 C 1395
1434 A 1394
1435 C 1393
1436 A 1392
1437 C 1391
1438 A 1390
1439 C 1389
1440 A 1388
1441 G 1387
1442 C 1386
1443 G 0
1444 A 0
1445 C 1383
1446 U 1382
1447 G 1381
1448 G 1380
1449 G 1379
1450 G 1378
1451 N 1377
1452 N 1376
1453 N 0
1454 N 0
1455 N 1374
1456 N 0
1457 N 1372
1458 N 1371
1459 N 0
1460 N 0
1461 N 1369
1462 N 1368
1463 N 0
1464 N 0
1465 N 1366
1466 N 0
1467 N 1490
1468 N 1489
1469 N 1488
1470 N 1487
1471 N 1486
1472 N 1485
1473 N 1484
1474 N 1483
1475 N 1482
1476 N 1481
1477 N 0
1478 N 0
1479 N 0
1480 N 0
1481 N 1476
1482 N 1475
1483 N 1474
1484 N 1473
1485 N 1472
1486 N 1471
1487 N 1470
1488 N 1469
1489 N 1468
1490 N 1467
1491 N 0
1492 N 0
1493 N 0
1494 N 0
1495 N 0
1496 N 0
1497 N 0
1498 N 0
1499 N 0
1500 N 0
1501 N 0
1502 N 0
1503 N 0