Filename: d.16.b.K.pneumoniae.bpseq Organism: Klebsiella pneumoniae Accession Number: X80684 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 A 0 3 A 0 4 N 0 5 U 0 6 G 0 7 A 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 918 18 C 917 19 A 916 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 555 28 A 554 29 U 553 30 U 552 31 G 0 32 A 551 33 A 550 34 C 549 35 G 548 36 C 547 37 U 546 38 G 0 39 G 402 40 C 401 41 G 400 42 G 399 43 C 398 44 A 397 45 G 395 46 G 394 47 C 360 48 C 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 358 53 A 357 54 C 356 55 A 0 56 U 355 57 G 354 58 C 353 59 A 0 60 A 0 61 G 105 62 U 104 63 C 103 64 G 0 65 A 0 66 G 102 67 C 101 68 G 100 69 G 98 70 U 97 71 A 0 72 G 0 73 C 96 74 A 95 75 C 94 76 N 0 77 N 92 78 G 91 79 A 90 80 G 89 81 A 88 82 G 87 83 C 0 84 U 0 85 U 0 86 G 0 87 C 82 88 N 81 89 C 80 90 U 79 91 C 78 92 G 77 93 G 0 94 G 75 95 U 74 96 G 73 97 A 70 98 C 69 99 G 0 100 A 68 101 G 67 102 C 66 103 G 63 104 G 62 105 C 61 106 G 0 107 G 0 108 A 0 109 C 0 110 G 0 111 G 0 112 G 313 113 U 312 114 G 311 115 A 0 116 G 0 117 U 0 118 A 0 119 A 0 120 U 0 121 G 238 122 U 237 123 C 236 124 U 235 125 G 234 126 G 233 127 G 232 128 A 231 129 A 0 130 A 230 131 C 229 132 U 0 133 G 0 134 C 0 135 C 226 136 U 225 137 G 224 138 A 223 139 U 222 140 G 221 141 G 220 142 A 0 143 G 177 144 G 176 145 G 175 146 G 174 147 G 0 148 A 0 149 U 0 150 A 0 151 A 168 152 C 167 153 U 166 154 A 165 155 C 164 156 U 163 157 G 162 158 G 0 159 A 0 160 A 0 161 A 0 162 C 157 163 G 156 164 G 155 165 U 154 166 A 153 167 G 152 168 C 151 169 U 0 170 A 0 171 A 0 172 U 0 173 A 0 174 C 146 175 C 145 176 G 144 177 C 143 178 A 0 179 U 0 180 A 0 181 A 0 182 C 0 183 G 192 184 U 191 185 C 190 186 G 0 187 C 0 188 A 0 189 A 0 190 G 185 191 A 184 192 C 183 193 C 0 194 A 0 195 A 0 196 A 0 197 G 218 198 U 217 199 G 216 200 G 215 201 G 214 202 G 213 203 G 0 204 A 0 205 C 212 206 C 211 207 U 0 208 U 0 209 C 0 210 G 0 211 G 206 212 G 205 213 C 202 214 C 201 215 U 200 216 C 199 217 A 198 218 U 197 219 G 0 220 C 141 221 C 140 222 A 139 223 U 138 224 C 137 225 A 136 226 G 135 227 A 0 228 U 0 229 G 131 230 U 130 231 G 128 232 C 127 233 C 126 234 C 125 235 A 124 236 G 123 237 A 122 238 U 121 239 G 285 240 G 284 241 G 283 242 A 0 243 U 0 244 U 282 245 A 0 246 G 276 247 C 275 248 U 274 249 A 0 250 G 0 251 U 273 252 A 272 253 G 271 254 G 270 255 U 269 256 G 268 257 G 267 258 G 266 259 G 0 260 U 0 261 A 0 262 A 0 263 C 0 264 G 0 265 G 0 266 C 258 267 U 257 268 C 256 269 A 255 270 C 254 271 C 253 272 U 252 273 A 251 274 G 248 275 G 247 276 C 246 277 G 0 278 A 0 279 C 0 280 G 0 281 A 0 282 U 244 283 C 241 284 C 240 285 C 239 286 U 0 287 A 0 288 G 310 289 C 309 290 U 308 291 G 307 292 G 303 293 U 302 294 C 301 295 U 300 296 G 0 297 A 0 298 G 0 299 A 0 300 G 295 301 G 294 302 A 293 303 U 292 304 G 0 305 A 0 306 C 0 307 C 291 308 A 290 309 G 289 310 C 288 311 C 114 312 A 113 313 C 112 314 A 0 315 C 336 316 U 335 317 G 334 318 G 333 319 A 332 320 A 331 321 C 0 322 U 0 323 G 0 324 A 0 325 G 0 326 A 0 327 C 0 328 A 0 329 C 0 330 G 0 331 G 320 332 U 319 333 C 318 334 C 317 335 A 316 336 G 315 337 A 0 338 C 349 339 U 348 340 C 347 341 C 346 342 U 0 343 A 0 344 C 0 345 G 0 346 G 341 347 G 340 348 A 339 349 G 338 350 G 0 351 C 0 352 A 0 353 G 58 354 C 57 355 N 56 356 G 54 357 U 53 358 G 52 359 G 0 360 G 47 361 G 0 362 A 0 363 A 0 364 U 0 365 A 0 366 U 392 367 U 0 368 G 391 369 C 390 370 A 389 371 C 0 372 A 0 373 A 0 374 U 387 375 G 386 376 G 385 377 G 384 378 C 383 379 G 0 380 C 0 381 A 0 382 A 0 383 G 378 384 C 377 385 C 376 386 U 375 387 G 374 388 A 0 389 U 370 390 G 369 391 C 368 392 A 366 393 G 0 394 C 46 395 C 45 396 A 0 397 U 44 398 G 43 399 C 42 400 C 41 401 G 40 402 C 39 403 G 0 404 U 0 405 G 435 406 U 434 407 G 433 408 U 432 409 G 0 410 A 0 411 A 0 412 G 0 413 A 0 414 A 0 415 G 426 416 G 425 417 C 424 418 N 423 419 U 0 420 U 0 421 C 0 422 G 0 423 G 418 424 G 417 425 U 416 426 U 415 427 G 0 428 U 0 429 A 0 430 A 0 431 A 0 432 G 408 433 C 407 434 A 406 435 C 405 436 U 0 437 U 495 438 U 0 439 C 496 440 A 492 441 G 491 442 C 490 443 G 489 444 G 488 445 G 487 446 G 0 447 A 0 448 G 0 449 G 482 450 A 0 451 A 0 452 G 0 453 G 0 454 C 476 455 G 475 456 U 474 457 U 473 458 A 472 459 A 471 460 G 470 461 G 469 462 U 0 463 U 0 464 A 0 465 A 0 466 U 0 467 A 0 468 A 0 469 C 461 470 C 460 471 U 459 472 U 458 473 G 457 474 G 456 475 C 455 476 G 454 477 A 0 478 U 0 479 U 0 480 G 0 481 A 0 482 C 449 483 G 0 484 U 0 485 U 0 486 A 0 487 C 445 488 C 444 489 C 443 490 G 442 491 C 441 492 A 440 493 G 0 494 A 0 495 A 437 496 G 439 497 A 0 498 A 0 499 G 544 500 C 543 501 A 542 502 C 541 503 C 540 504 G 525 505 G 524 506 C 523 507 U 0 508 A 0 509 A 0 510 C 539 511 U 538 512 C 537 513 C 536 514 G 535 515 U 0 516 G 0 517 C 0 518 C 0 519 A 0 520 G 527 521 C 526 522 A 0 523 G 506 524 C 505 525 C 504 526 G 521 527 C 520 528 G 0 529 G 0 530 U 0 531 A 0 532 A 0 533 U 0 534 A 0 535 C 514 536 G 513 537 G 512 538 A 511 539 G 510 540 G 503 541 G 502 542 U 501 543 G 500 544 C 499 545 A 0 546 A 37 547 G 36 548 C 35 549 G 34 550 U 33 551 U 32 552 A 30 553 A 29 554 U 28 555 C 27 556 G 0 557 G 0 558 A 0 559 A 0 560 U 0 561 U 0 562 A 0 563 C 0 564 U 0 565 G 0 566 G 883 567 G 882 568 C 881 569 G 866 570 U 865 571 A 0 572 A 0 573 A 0 574 G 880 575 C 0 576 G 763 577 C 762 578 A 761 579 C 760 580 G 0 581 C 757 582 A 0 583 G 756 584 G 755 585 C 754 586 G 0 587 G 650 588 U 649 589 C 648 590 U 647 591 G 646 592 U 645 593 C 644 594 A 0 595 A 643 596 G 642 597 U 639 598 C 638 599 G 637 600 G 636 601 A 635 602 U 634 603 G 633 604 U 632 605 G 631 606 A 0 607 A 0 608 A 0 609 U 0 610 C 628 611 C 627 612 C 626 613 C 625 614 G 624 615 G 623 616 G 622 617 C 0 618 U 0 619 C 0 620 A 0 621 A 0 622 C 616 623 C 615 624 U 614 625 G 613 626 G 612 627 G 611 628 A 610 629 A 0 630 C 0 631 U 605 632 G 604 633 C 603 634 A 602 635 U 601 636 U 600 637 C 599 638 G 598 639 A 597 640 A 0 641 A 0 642 C 596 643 U 595 644 G 593 645 G 592 646 C 591 647 A 590 648 G 589 649 G 588 650 C 587 651 U 0 652 A 0 653 G 0 654 A 750 655 G 749 656 U 748 657 C 747 658 U 745 659 U 744 660 G 743 661 U 742 662 A 741 663 G 0 664 C 0 665 G 739 666 G 738 667 G 737 668 G 736 669 G 735 670 G 734 671 U 733 672 G 716 673 G 715 674 A 0 675 A 0 676 U 712 677 U 711 678 C 710 679 C 709 680 A 708 681 G 707 682 G 706 683 U 705 684 G 0 685 U 0 686 C 0 687 G 698 688 C 697 689 G 696 690 G 0 691 U 0 692 G 0 693 A 0 694 A 0 695 A 0 696 U 689 697 G 688 698 C 687 699 G 0 700 U 0 701 C 0 702 G 0 703 A 0 704 G 0 705 A 683 706 U 682 707 C 681 708 U 680 709 G 679 710 G 678 711 A 677 712 G 676 713 G 0 714 A 0 715 A 673 716 U 672 717 C 0 718 C 0 719 C 0 720 G 0 721 G 732 722 U 0 723 G 0 724 G 731 725 C 730 726 G 0 727 A 0 728 A 0 729 G 0 730 G 725 731 C 724 732 G 721 733 G 671 734 C 670 735 C 669 736 C 668 737 C 667 738 C 666 739 U 665 740 G 0 741 G 662 742 A 661 743 C 660 744 C 659 745 A 658 746 A 0 747 G 657 748 A 656 749 C 655 750 U 654 751 G 0 752 A 0 753 C 0 754 G 585 755 C 584 756 U 583 757 C 581 758 C 0 759 G 0 760 G 579 761 U 578 762 G 577 763 C 576 764 G 0 765 A 0 766 A 0 767 A 0 768 G 809 769 C 808 770 G 807 771 U 806 772 G 805 773 G 804 774 G 0 775 G 0 776 A 0 777 G 803 778 C 802 779 C 0 780 A 0 781 A 0 782 C 798 783 A 797 784 G 796 785 G 795 786 A 0 787 U 0 788 U 0 789 C 0 790 G 0 791 A 0 792 U 0 793 C 0 794 C 0 795 C 785 796 C 784 797 U 783 798 G 782 799 G 0 800 U 0 801 C 0 802 G 778 803 U 777 804 C 773 805 C 772 806 A 771 807 C 770 808 G 769 809 C 768 810 A 0 811 G 0 812 C 0 813 C 0 814 A 0 815 A 0 816 C 0 817 G 0 818 A 0 819 U 0 820 G 879 821 U 878 822 C 877 823 G 876 824 A 875 825 U 874 826 C 0 827 C 0 828 G 856 829 G 855 830 A 854 831 G 853 832 G 852 833 U 851 834 U 850 835 G 849 836 U 848 837 G 847 838 C 846 839 C 845 840 C 0 841 U 0 842 U 0 843 G 0 844 A 0 845 G 839 846 G 838 847 C 837 848 G 836 849 U 835 850 G 834 851 G 833 852 C 832 853 U 831 854 U 830 855 C 829 856 C 828 857 G 0 858 G 0 859 A 0 860 G 868 861 C 867 862 G 0 863 U 0 864 A 0 865 A 570 866 C 569 867 G 861 868 C 860 869 G 0 870 U 0 871 U 0 872 A 0 873 A 0 874 A 825 875 U 824 876 C 823 877 G 822 878 A 821 879 C 820 880 C 574 881 G 568 882 C 567 883 C 566 884 U 0 885 G 912 886 G 911 887 G 910 888 G 0 889 A 0 890 G 0 891 U 0 892 A 0 893 C 0 894 G 905 895 G 904 896 C 903 897 C 902 898 G 0 899 C 0 900 A 0 901 A 0 902 G 897 903 G 896 904 U 895 905 U 894 906 A 0 907 A 0 908 A 0 909 A 0 910 C 887 911 U 886 912 C 885 913 A 0 914 A 0 915 A 0 916 U 19 917 G 18 918 A 17 919 A 0 920 U 0 921 U 1395 922 G 1394 923 A 1392 924 C 1391 925 G 1390 926 G 0 927 G 1389 928 G 1388 929 G 1387 930 C 1386 931 C 1384 932 G 1383 933 C 0 934 A 1379 935 C 1378 936 A 0 937 A 0 938 G 1343 939 C 1342 940 G 1341 941 G 1340 942 U 1339 943 G 1236 944 G 1235 945 A 1234 946 G 1233 947 C 1232 948 A 1231 949 U 1230 950 G 1229 951 U 1228 952 G 1227 953 G 1225 954 U 1224 955 U 0 956 U 0 957 A 0 958 A 0 959 U 974 960 U 973 961 C 972 962 G 971 963 A 0 964 U 0 965 G 0 966 C 0 967 A 0 968 A 0 969 C 0 970 G 0 971 C 962 972 G 961 973 A 960 974 A 959 975 G 0 976 A 0 977 A 0 978 C 0 979 C 0 980 U 0 981 U 0 982 A 0 983 C 1220 984 C 1219 985 U 1218 986 G 1217 987 G 1216 988 U 1215 989 C 1214 990 U 0 991 U 0 992 G 0 993 A 0 994 C 0 995 A 1044 996 U 1043 997 C 1042 998 C 1040 999 A 1039 1000 C 1038 1001 A 1037 1002 G 1036 1003 A 0 1004 A 0 1005 C 1022 1006 U 1021 1007 U 1020 1008 U 1019 1009 C 1018 1010 C 1017 1011 A 1016 1012 G 0 1013 A 0 1014 G 0 1015 A 0 1016 U 1011 1017 G 1010 1018 G 1009 1019 A 1008 1020 U 1007 1021 U 1006 1022 G 1005 1023 G 0 1024 U 1035 1025 G 1034 1026 C 1033 1027 C 1032 1028 U 0 1029 U 0 1030 C 0 1031 G 0 1032 G 1027 1033 G 1026 1034 A 1025 1035 A 1024 1036 C 1002 1037 U 1001 1038 G 1000 1039 U 999 1040 G 998 1041 A 0 1042 G 997 1043 A 996 1044 C 995 1045 A 0 1046 G 1209 1047 G 1208 1048 U 0 1049 G 1207 1050 C 1206 1051 U 1205 1052 G 1204 1053 C 0 1054 A 0 1055 U 1203 1056 G 1202 1057 G 1198 1058 C 1197 1059 U 1196 1060 G 1194 1061 U 1193 1062 C 1192 1063 G 1191 1064 U 0 1065 C 0 1066 A 0 1067 G 1106 1068 C 1105 1069 U 1104 1070 C 1103 1071 G 1102 1072 U 1101 1073 G 1082 1074 U 1081 1075 U 1080 1076 G 0 1077 U 0 1078 G 0 1079 A 0 1080 A 1075 1081 A 1074 1082 U 1073 1083 G 0 1084 U 0 1085 U 1098 1086 G 1097 1087 G 1096 1088 G 1095 1089 U 0 1090 U 0 1091 A 0 1092 A 0 1093 G 0 1094 U 0 1095 C 1088 1096 C 1087 1097 C 1086 1098 G 1085 1099 C 0 1100 A 0 1101 A 1072 1102 C 1071 1103 G 1070 1104 A 1069 1105 G 1068 1106 C 1067 1107 G 0 1108 C 0 1109 A 0 1110 A 0 1111 C 0 1112 C 1186 1113 C 1185 1114 U 1184 1115 U 1183 1116 A 0 1117 U 1154 1118 C 1153 1119 C 1152 1120 U 1151 1121 U 1150 1122 U 1149 1123 G 1148 1124 U 0 1125 U 0 1126 G 0 1127 C 1143 1128 C 1142 1129 A 0 1130 G 0 1131 C 1141 1132 G 1140 1133 G 1139 1134 U 0 1135 U 0 1136 C 0 1137 G 0 1138 G 0 1139 C 1133 1140 C 1132 1141 G 1131 1142 G 1128 1143 G 1127 1144 A 0 1145 A 0 1146 C 0 1147 U 0 1148 C 1123 1149 A 1122 1150 A 1121 1151 A 1120 1152 G 1119 1153 G 1118 1154 A 1117 1155 G 0 1156 A 0 1157 C 1177 1158 U 1176 1159 G 1175 1160 C 1174 1161 C 1173 1162 A 1172 1163 G 1171 1164 U 1170 1165 G 0 1166 A 0 1167 U 0 1168 A 0 1169 A 0 1170 A 1164 1171 C 1163 1172 U 1162 1173 G 1161 1174 G 1160 1175 A 1159 1176 G 1158 1177 G 1157 1178 A 0 1179 A 0 1180 G 0 1181 G 0 1182 U 0 1183 G 1115 1184 G 1114 1185 G 1113 1186 G 1112 1187 A 0 1188 U 0 1189 G 0 1190 A 0 1191 C 1063 1192 G 1062 1193 U 1061 1194 C 1060 1195 A 0 1196 A 1059 1197 G 1058 1198 U 1057 1199 C 0 1200 A 0 1201 U 0 1202 C 1056 1203 A 1055 1204 U 1052 1205 G 1051 1206 G 1050 1207 C 1049 1208 C 1047 1209 C 1046 1210 U 0 1211 U 0 1212 A 0 1213 C 0 1214 G 989 1215 A 988 1216 C 987 1217 C 986 1218 A 985 1219 G 984 1220 G 983 1221 G 0 1222 C 0 1223 U 0 1224 A 954 1225 C 953 1226 A 0 1227 C 952 1228 A 951 1229 C 950 1230 G 949 1231 U 948 1232 G 947 1233 C 946 1234 U 945 1235 A 944 1236 C 943 1237 A 0 1238 A 0 1239 U 0 1240 G 1295 1241 G 1294 1242 C 1293 1243 A 1292 1244 U 1291 1245 A 1290 1246 U 1289 1247 A 0 1248 C 0 1249 A 0 1250 A 0 1251 A 0 1252 G 1283 1253 A 1282 1254 G 1281 1255 A 0 1256 A 0 1257 G 1276 1258 C 1275 1259 G 0 1260 A 0 1261 C 0 1262 C 1271 1263 U 1270 1264 C 1269 1265 G 0 1266 C 0 1267 G 0 1268 A 0 1269 G 1264 1270 A 1263 1271 G 1262 1272 C 0 1273 A 0 1274 A 0 1275 G 1258 1276 C 1257 1277 G 0 1278 G 0 1279 A 0 1280 C 0 1281 C 1254 1282 U 1253 1283 C 1252 1284 A 0 1285 U 0 1286 A 0 1287 A 0 1288 A 0 1289 G 1246 1290 U 1245 1291 A 1244 1292 U 1243 1293 G 1242 1294 U 1241 1295 C 1240 1296 G 0 1297 U 0 1298 A 0 1299 G 0 1300 U 0 1301 C 0 1302 C 1333 1303 G 0 1304 G 0 1305 A 0 1306 U 1329 1307 U 1328 1308 G 1327 1309 G 1326 1310 A 1325 1311 G 1324 1312 U 1323 1313 C 1322 1314 U 0 1315 G 0 1316 C 0 1317 A 0 1318 A 0 1319 C 0 1320 U 0 1321 C 0 1322 G 1313 1323 A 1312 1324 C 1311 1325 U 1310 1326 C 1309 1327 C 1308 1328 A 1307 1329 U 1306 1330 G 0 1331 A 0 1332 A 0 1333 G 1302 1334 U 0 1335 C 0 1336 G 0 1337 G 0 1338 A 0 1339 A 942 1340 U 941 1341 C 940 1342 G 939 1343 C 938 1344 U 0 1345 A 0 1346 G 0 1347 U 0 1348 A 0 1349 A 1371 1350 U 1370 1351 C 1369 1352 G 1368 1353 U 1367 1354 A 1366 1355 G 1365 1356 A 1364 1357 U 0 1358 C 0 1359 A 0 1360 G 0 1361 A 0 1362 A 0 1363 U 0 1364 G 1356 1365 C 1355 1366 U 1354 1367 A 1353 1368 C 1352 1369 G 1351 1370 G 1350 1371 U 1349 1372 G 0 1373 A 0 1374 A 0 1375 U 0 1376 A 0 1377 C 0 1378 G 935 1379 U 934 1380 U 0 1381 C 0 1382 C 0 1383 A 932 1384 G 931 1385 G 0 1386 G 930 1387 C 929 1388 C 928 1389 U 927 1390 U 925 1391 G 924 1392 U 923 1393 A 0 1394 C 922 1395 A 921 1396 C 0 1397 A 0 1398 C 1503 1399 C 0 1400 G 1500 1401 C 1499 1402 N 0 1403 C 1496 1404 G 1495 1405 U 0 1406 C 1493 1407 A 0 1408 C 1490 1409 A 1489 1410 C 1488 1411 C 1487 1412 A 1486 1413 U 1485 1414 G 1484 1415 G 1483 1416 G 0 1417 A 0 1418 G 1480 1419 U 1479 1420 G 1478 1421 G 1477 1422 G 1476 1423 U 1475 1424 U 1474 1425 N 1473 1426 C 1472 1427 A 1471 1428 N 1470 1429 A 1469 1430 A 0 1431 G 0 1432 N 0 1433 A 0 1434 G 1465 1435 U 1464 1436 N 1463 1437 G 1462 1438 G 1461 1439 U 1460 1440 N 0 1441 G 1459 1442 C 1458 1443 C 0 1444 N 1457 1445 N 0 1446 A 0 1447 U 1455 1448 C 1454 1449 A 0 1450 C 0 1451 C 0 1452 U 0 1453 C 0 1454 N 1448 1455 G 1447 1456 G 0 1457 U 1444 1458 G 1442 1459 C 1441 1460 N 1439 1461 N 1438 1462 N 1437 1463 N 1436 1464 N 1435 1465 N 1434 1466 N 0 1467 N 0 1468 N 0 1469 N 1429 1470 N 1428 1471 N 1427 1472 N 1426 1473 N 1425 1474 N 1424 1475 N 1423 1476 N 1422 1477 N 1421 1478 N 1420 1479 N 1419 1480 N 1418 1481 N 0 1482 N 0 1483 N 1415 1484 N 1414 1485 N 1413 1486 N 1412 1487 N 1411 1488 N 1410 1489 N 1409 1490 N 1408 1491 N 0 1492 N 0 1493 N 1406 1494 N 0 1495 N 1404 1496 N 1403 1497 N 0 1498 N 0 1499 N 1401 1500 N 1400 1501 N 0 1502 N 0 1503 N 1398 1504 N 0 1505 N 1528 1506 N 1527 1507 N 1526 1508 N 1525 1509 N 1524 1510 N 1523 1511 N 1522 1512 N 1521 1513 N 1520 1514 N 1519 1515 N 0 1516 N 0 1517 N 0 1518 N 0 1519 N 1514 1520 N 1513 1521 N 1512 1522 N 1511 1523 N 1510 1524 N 1509 1525 N 1508 1526 N 1507 1527 N 1506 1528 N 1505 1529 N 0 1530 N 0 1531 N 0 1532 N 0 1533 N 0 1534 N 0 1535 N 0 1536 N 0 1537 N 0 1538 N 0 1539 N 0 1540 N 0 1541 N 0