Filename: d.16.b.L.illini.bpseq Organism: Leptonema illini Accession Number: M88719 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 U 0 2 A 21 3 A 20 4 U 19 5 C 18 6 U 17 7 A 16 8 U 15 9 C 14 10 G 0 11 C 0 12 A 0 13 A 0 14 G 9 15 A 8 16 U 7 17 A 6 18 G 5 19 A 4 20 U 3 21 U 2 22 C 0 23 A 0 24 U 0 25 A 0 26 A 0 27 C 0 28 G 0 29 G 0 30 A 0 31 G 47 32 A 46 33 G 45 34 U 44 35 U 43 36 U 0 37 G 0 38 A 0 39 U 908 40 C 907 41 C 906 42 U 0 43 G 35 44 G 34 45 C 33 46 U 32 47 C 31 48 A 0 49 G 545 50 A 544 51 A 543 52 C 542 53 U 0 54 A 541 55 A 540 56 C 539 57 G 538 58 C 537 59 U 536 60 G 0 61 G 416 62 C 415 63 G 414 64 G 413 65 C 412 66 G 411 67 C 409 68 G 408 69 U 374 70 C 0 71 U 0 72 U 0 73 A 0 74 A 372 75 A 371 76 C 370 77 A 0 78 U 369 79 G 368 80 C 367 81 A 0 82 A 0 83 G 114 84 U 113 85 C 112 86 G 0 87 A 0 88 G 111 89 C 110 90 G 109 91 G 107 92 C 106 93 A 0 94 G 0 95 C 105 96 A 104 97 C 103 98 U 0 99 U 0 100 C 0 101 G 0 102 G 0 103 G 97 104 U 96 105 G 95 106 G 92 107 C 91 108 G 0 109 A 90 110 G 89 111 C 88 112 G 85 113 G 84 114 C 83 115 G 0 116 A 0 117 A 0 118 C 0 119 G 0 120 G 0 121 G 327 122 U 326 123 G 325 124 A 0 125 G 0 126 U 0 127 A 0 128 A 0 129 C 0 130 A 252 131 C 251 132 G 250 133 U 249 134 A 248 135 G 247 136 G 246 137 U 245 138 A 0 139 A 0 140 U 244 141 U 243 142 U 0 143 G 0 144 C 0 145 C 240 146 C 239 147 A 238 148 C 237 149 G 236 150 G 235 151 A 234 152 U 0 153 G 187 154 G 186 155 G 185 156 G 184 157 G 0 158 A 0 159 U 0 160 A 0 161 A 178 162 C 177 163 C 176 164 U 175 165 U 174 166 U 173 167 C 172 168 G 0 169 A 0 170 A 0 171 A 0 172 G 167 173 G 166 174 A 165 175 A 164 176 G 163 177 G 162 178 C 161 179 U 0 180 A 0 181 A 0 182 U 0 183 A 0 184 C 156 185 C 155 186 G 154 187 C 153 188 A 0 189 U 0 190 A 0 191 A 0 192 C 0 193 A 218 194 C 217 195 C 216 196 A 215 197 U 214 198 G 213 199 G 212 200 U 211 201 U 210 202 A 209 203 C 208 204 C 0 205 A 0 206 C 0 207 G 0 208 G 203 209 U 202 210 A 201 211 A 200 212 U 199 213 U 198 214 A 197 215 U 196 216 G 195 217 G 194 218 U 193 219 C 0 220 A 0 221 A 0 222 A 0 223 G 232 224 C 231 225 A 230 226 G 0 227 C 0 228 A 0 229 A 0 230 U 225 231 G 224 232 C 223 233 G 0 234 U 151 235 C 150 236 U 149 237 G 148 238 U 147 239 G 146 240 G 145 241 A 0 242 G 0 243 A 141 244 A 140 245 G 137 246 C 136 247 C 135 248 U 134 249 G 133 250 C 132 251 G 131 252 U 130 253 C 299 254 C 298 255 G 297 256 A 0 257 U 0 258 U 296 259 A 0 260 G 290 261 G 289 262 U 288 263 A 0 264 G 0 265 U 287 266 U 286 267 G 285 268 G 284 269 U 283 270 G 282 271 A 281 272 G 280 273 G 0 274 U 0 275 A 0 276 A 0 277 C 0 278 G 0 279 G 0 280 C 272 281 U 271 282 C 270 283 A 269 284 C 268 285 C 267 286 A 266 287 A 265 288 G 262 289 C 261 290 C 260 291 A 0 292 G 0 293 C 0 294 G 0 295 A 0 296 U 258 297 C 255 298 G 254 299 G 253 300 U 0 301 A 0 302 G 324 303 C 323 304 C 322 305 G 321 306 G 317 307 C 316 308 C 315 309 U 314 310 G 0 311 A 0 312 G 0 313 A 0 314 G 309 315 G 308 316 G 307 317 U 306 318 G 0 319 A 0 320 A 0 321 C 305 322 G 304 323 G 303 324 C 302 325 C 123 326 A 122 327 C 121 328 A 0 329 C 350 330 U 349 331 G 348 332 G 347 333 A 346 334 A 345 335 C 0 336 U 0 337 G 0 338 G 0 339 G 0 340 A 0 341 C 0 342 A 0 343 C 0 344 G 0 345 G 334 346 U 333 347 C 332 348 C 331 349 A 330 350 G 329 351 A 0 352 C 363 353 U 362 354 C 361 355 C 360 356 U 0 357 A 0 358 C 0 359 G 0 360 G 355 361 G 354 362 A 353 363 G 352 364 G 0 365 C 0 366 A 0 367 G 80 368 C 79 369 A 78 370 G 76 371 U 75 372 U 74 373 A 0 374 A 69 375 G 0 376 A 0 377 A 0 378 U 0 379 C 0 380 U 406 381 U 0 382 G 405 383 C 404 384 G 403 385 C 0 386 A 0 387 A 0 388 U 401 389 G 400 390 G 399 391 A 398 392 G 397 393 G 0 394 C 0 395 A 0 396 A 0 397 C 392 398 U 391 399 C 390 400 U 389 401 G 388 402 A 0 403 C 384 404 G 383 405 C 382 406 A 380 407 G 0 408 C 68 409 G 67 410 A 0 411 C 66 412 G 65 413 C 64 414 C 63 415 G 62 416 C 61 417 G 0 418 U 0 419 G 449 420 U 448 421 G 447 422 C 446 423 G 0 424 A 0 425 U 0 426 G 0 427 A 0 428 A 0 429 G 440 430 G 439 431 C 438 432 C 437 433 C 0 434 U 0 435 C 0 436 G 0 437 G 432 438 G 431 439 U 430 440 U 429 441 G 0 442 U 0 443 A 0 444 A 0 445 A 0 446 G 422 447 C 421 448 A 420 449 C 419 450 A 0 451 A 487 452 C 0 453 A 0 454 A 484 455 A 483 456 C 482 457 A 481 458 G 480 459 G 479 460 G 0 461 A 0 462 A 0 463 G 474 464 A 0 465 A 0 466 G 471 467 A 0 468 A 0 469 A 0 470 G 0 471 U 466 472 G 0 473 A 0 474 C 463 475 G 0 476 G 0 477 U 0 478 A 0 479 C 459 480 C 458 481 U 457 482 G 456 483 U 455 484 C 454 485 U 0 486 G 0 487 A 451 488 A 0 489 G 534 490 C 533 491 A 532 492 C 531 493 C 530 494 G 515 495 G 514 496 C 513 497 U 0 498 A 0 499 A 0 500 C 529 501 U 528 502 A 527 503 C 526 504 G 525 505 U 0 506 G 0 507 C 0 508 C 0 509 A 0 510 G 517 511 C 516 512 A 0 513 G 496 514 C 495 515 C 494 516 G 511 517 C 510 518 G 0 519 G 0 520 U 0 521 A 0 522 A 0 523 U 0 524 A 0 525 C 504 526 G 503 527 U 502 528 A 501 529 U 500 530 G 493 531 G 492 532 U 491 533 G 490 534 C 489 535 A 0 536 A 59 537 G 58 538 C 57 539 G 56 540 U 55 541 U 54 542 G 52 543 U 51 544 U 50 545 C 49 546 G 0 547 G 0 548 A 0 549 A 0 550 U 0 551 C 0 552 A 0 553 C 0 554 U 0 555 G 0 556 G 873 557 G 872 558 C 871 559 G 856 560 U 855 561 A 0 562 A 0 563 A 0 564 G 870 565 G 0 566 G 753 567 U 752 568 G 751 569 C 750 570 G 0 571 C 747 572 A 0 573 G 746 574 G 745 575 C 744 576 G 0 577 G 640 578 A 639 579 C 638 580 U 637 581 G 636 582 U 635 583 U 634 584 A 0 585 A 633 586 G 632 587 U 629 588 C 628 589 G 627 590 G 626 591 G 625 592 A 624 593 G 623 594 U 622 595 G 621 596 A 0 597 A 0 598 A 0 599 A 0 600 C 618 601 U 617 602 G 616 603 A 615 604 G 614 605 G 613 606 G 612 607 C 0 608 U 0 609 C 0 610 A 0 611 A 0 612 C 606 613 C 605 614 C 604 615 U 603 616 C 602 617 A 601 618 G 600 619 C 0 620 C 0 621 U 595 622 G 594 623 C 593 624 U 592 625 U 591 626 U 590 627 C 589 628 G 588 629 A 587 630 A 0 631 A 0 632 C 586 633 U 585 634 G 583 635 G 582 636 C 581 637 A 580 638 G 579 639 U 578 640 C 577 641 U 0 642 G 0 643 G 0 644 A 740 645 G 739 646 U 738 647 C 737 648 C 735 649 C 734 650 G 733 651 G 732 652 A 731 653 G 0 654 A 0 655 G 729 656 G 728 657 C 727 658 A 726 659 G 725 660 G 724 661 C 723 662 G 706 663 G 705 664 A 0 665 A 0 666 U 702 667 U 701 668 C 700 669 C 699 670 C 698 671 G 697 672 G 696 673 U 695 674 G 0 675 U 0 676 A 0 677 G 688 678 C 687 679 G 686 680 G 0 681 U 0 682 G 0 683 A 0 684 A 0 685 A 0 686 U 679 687 G 678 688 C 677 689 A 0 690 C 0 691 A 0 692 G 0 693 A 0 694 U 0 695 A 673 696 U 672 697 C 671 698 G 670 699 G 669 700 G 668 701 A 667 702 G 666 703 G 0 704 A 0 705 A 663 706 C 662 707 A 0 708 C 0 709 C 0 710 A 0 711 A 722 712 U 0 713 G 0 714 G 721 715 C 720 716 G 0 717 A 0 718 A 0 719 G 0 720 G 715 721 C 714 722 A 711 723 G 661 724 C 660 725 C 659 726 U 658 727 G 657 728 C 656 729 U 655 730 G 0 731 G 652 732 A 651 733 C 650 734 G 649 735 G 648 736 A 0 737 G 647 738 A 646 739 C 645 740 U 644 741 G 0 742 A 0 743 C 0 744 G 575 745 C 574 746 U 573 747 C 571 748 A 0 749 U 0 750 G 569 751 C 568 752 A 567 753 C 566 754 G 0 755 A 0 756 A 0 757 A 0 758 G 799 759 C 798 760 G 797 761 U 796 762 G 795 763 G 794 764 G 0 765 G 0 766 A 0 767 U 793 768 C 792 769 A 0 770 A 0 771 A 0 772 C 788 773 A 787 774 G 786 775 G 785 776 A 0 777 U 0 778 U 0 779 A 0 780 G 0 781 A 0 782 U 0 783 A 0 784 C 0 785 C 775 786 C 774 787 U 773 788 G 772 789 G 0 790 U 0 791 A 0 792 G 768 793 U 767 794 C 763 795 C 762 796 A 761 797 C 760 798 G 759 799 C 758 800 C 0 801 C 0 802 U 0 803 A 0 804 A 0 805 A 0 806 C 0 807 G 0 808 U 0 809 U 0 810 G 869 811 U 868 812 A 867 813 G 866 814 A 865 815 C 864 816 C 0 817 A 0 818 G 847 819 A 846 820 C 845 821 G 844 822 U 843 823 U 842 824 G 841 825 G 840 826 A 839 827 G 838 828 G 837 829 C 0 830 A 0 831 U 0 832 C 0 833 A 0 834 A 0 835 C 0 836 C 0 837 C 828 838 C 827 839 U 826 840 U 825 841 C 824 842 A 823 843 G 822 844 U 821 845 G 820 846 U 819 847 C 818 848 A 0 849 A 0 850 A 0 851 C 858 852 C 857 853 A 0 854 A 0 855 A 560 856 C 559 857 G 852 858 G 851 859 A 0 860 U 0 861 U 0 862 A 0 863 A 0 864 G 815 865 U 814 866 C 813 867 U 812 868 A 811 869 C 810 870 C 564 871 G 558 872 C 557 873 C 556 874 U 0 875 G 902 876 G 901 877 G 900 878 G 0 879 A 0 880 C 0 881 U 0 882 A 0 883 U 0 884 G 895 885 C 894 886 U 893 887 C 892 888 G 0 889 C 0 890 A 0 891 A 0 892 G 887 893 A 886 894 G 885 895 U 884 896 G 0 897 A 0 898 A 0 899 A 0 900 C 877 901 U 876 902 C 875 903 A 0 904 A 0 905 A 0 906 G 41 907 G 40 908 A 39 909 A 0 910 U 0 911 U 1382 912 G 1381 913 A 1379 914 C 1378 915 G 1377 916 G 0 917 G 1376 918 G 1375 919 G 1374 920 N 1373 921 C 1372 922 C 1371 923 G 1370 924 C 0 925 A 1366 926 C 1365 927 A 0 928 A 0 929 G 1330 930 C 1329 931 G 1328 932 G 1327 933 U 1326 934 G 1223 935 G 1222 936 A 1221 937 G 1220 938 C 1219 939 A 1218 940 U 1217 941 G 1216 942 U 1215 943 G 1214 944 G 1212 945 U 1211 946 U 0 947 U 0 948 A 0 949 A 0 950 U 965 951 U 964 952 C 963 953 G 962 954 A 0 955 U 0 956 G 0 957 A 0 958 U 0 959 A 0 960 C 0 961 G 0 962 C 953 963 G 952 964 A 951 965 A 950 966 A 0 967 A 0 968 A 0 969 C 0 970 C 0 971 U 0 972 U 0 973 A 0 974 C 1207 975 C 1206 976 C 1205 977 G 1204 978 G 1203 979 G 1202 980 C 1201 981 U 0 982 U 0 983 G 0 984 A 0 985 C 0 986 A 1032 987 U 1031 988 G 1030 989 C 1029 990 A 1028 991 U 1027 992 C 1026 993 A 1025 994 G 1024 995 A 0 996 C 0 997 A 1014 998 G 1013 999 G 1012 1000 C 1011 1001 G 1010 1002 U 1009 1003 A 1008 1004 G 0 1005 A 0 1006 G 0 1007 A 0 1008 U 1003 1009 A 1002 1010 C 1001 1011 G 1000 1012 C 999 1013 C 998 1014 C 997 1015 U 0 1016 C 1023 1017 C 1022 1018 G 0 1019 C 0 1020 G 0 1021 A 0 1022 G 1017 1023 G 1016 1024 C 994 1025 U 993 1026 G 992 1027 G 991 1028 U 990 1029 G 989 1030 C 988 1031 A 987 1032 C 986 1033 A 0 1034 G 1196 1035 G 1195 1036 U 0 1037 G 1194 1038 C 1193 1039 U 1192 1040 G 1191 1041 C 0 1042 A 0 1043 U 1190 1044 G 1189 1045 G 1185 1046 U 1184 1047 U 1183 1048 G 1181 1049 U 1180 1050 C 1179 1051 G 1178 1052 U 0 1053 C 0 1054 A 0 1055 G 1094 1056 C 1093 1057 U 1092 1058 C 1091 1059 G 1090 1060 U 1089 1061 G 1070 1062 U 1069 1063 C 1068 1064 G 0 1065 U 0 1066 G 0 1067 A 0 1068 G 1063 1069 A 1062 1070 U 1061 1071 G 0 1072 U 0 1073 U 1086 1074 G 1085 1075 G 1084 1076 G 1083 1077 U 0 1078 U 0 1079 A 0 1080 A 0 1081 G 0 1082 U 0 1083 C 1076 1084 C 1075 1085 C 1074 1086 G 1073 1087 C 0 1088 A 0 1089 A 1060 1090 C 1059 1091 G 1058 1092 A 1057 1093 G 1056 1094 C 1055 1095 G 0 1096 C 0 1097 A 0 1098 A 0 1099 C 0 1100 C 1173 1101 C 1172 1102 C 1171 1103 U 1170 1104 A 0 1105 C 1141 1106 C 1140 1107 G 1139 1108 U 1138 1109 G 1137 1110 U 1136 1111 G 1135 1112 U 0 1113 U 0 1114 A 0 1115 C 1130 1116 C 1129 1117 A 0 1118 U 0 1119 C 1128 1120 A 1127 1121 U 0 1122 U 0 1123 A 0 1124 A 0 1125 G 0 1126 U 0 1127 U 1120 1128 G 1119 1129 G 1116 1130 G 1115 1131 G 0 1132 A 0 1133 C 0 1134 U 0 1135 U 1111 1136 G 1110 1137 C 1109 1138 A 1108 1139 C 1107 1140 G 1106 1141 G 1105 1142 A 0 1143 A 0 1144 C 1164 1145 U 1163 1146 G 1162 1147 C 1161 1148 C 1160 1149 G 1159 1150 G 1158 1151 U 1157 1152 G 0 1153 A 0 1154 U 0 1155 A 0 1156 A 0 1157 A 1151 1158 C 1150 1159 C 1149 1160 G 1148 1161 G 1147 1162 A 1146 1163 G 1145 1164 G 1144 1165 A 0 1166 A 0 1167 G 0 1168 G 0 1169 U 0 1170 G 1103 1171 G 1102 1172 G 1101 1173 G 1100 1174 A 0 1175 U 0 1176 G 0 1177 A 0 1178 C 1051 1179 G 1050 1180 U 1049 1181 C 1048 1182 A 0 1183 A 1047 1184 A 1046 1185 U 1045 1186 C 0 1187 C 0 1188 U 0 1189 C 1044 1190 A 1043 1191 U 1040 1192 G 1039 1193 G 1038 1194 C 1037 1195 C 1035 1196 U 1034 1197 U 0 1198 U 0 1199 A 0 1200 U 0 1201 G 980 1202 U 979 1203 C 978 1204 C 977 1205 G 976 1206 G 975 1207 G 974 1208 G 0 1209 C 0 1210 U 0 1211 A 945 1212 C 944 1213 A 0 1214 C 943 1215 A 942 1216 C 941 1217 G 940 1218 U 939 1219 G 938 1220 C 937 1221 U 936 1222 A 935 1223 C 934 1224 A 0 1225 A 0 1226 U 0 1227 G 1282 1228 G 1281 1229 U 1280 1230 C 1279 1231 G 1278 1232 G 1277 1233 U 1276 1234 A 0 1235 C 0 1236 A 0 1237 G 0 1238 A 0 1239 A 1270 1240 G 1269 1241 G 1268 1242 A 0 1243 A 0 1244 G 1263 1245 C 1262 1246 G 0 1247 A 0 1248 A 0 1249 G 1258 1250 U 1257 1251 C 1256 1252 G 0 1253 U 0 1254 G 0 1255 A 0 1256 G 1251 1257 A 1250 1258 U 1249 1259 G 0 1260 G 0 1261 A 0 1262 G 1245 1263 C 1244 1264 A 0 1265 G 0 1266 A 0 1267 U 0 1268 C 1241 1269 C 1240 1270 G 1239 1271 A 0 1272 G 0 1273 A 0 1274 A 0 1275 A 0 1276 G 1233 1277 C 1232 1278 C 1231 1279 G 1230 1280 A 1229 1281 U 1228 1282 C 1227 1283 U 0 1284 C 0 1285 A 0 1286 G 0 1287 U 0 1288 U 0 1289 C 1320 1290 G 0 1291 G 0 1292 A 0 1293 U 1316 1294 U 1315 1295 G 1314 1296 G 1313 1297 G 1312 1298 G 1311 1299 U 1310 1300 C 1309 1301 U 0 1302 G 0 1303 C 0 1304 A 0 1305 A 0 1306 C 0 1307 U 0 1308 C 0 1309 G 1300 1310 A 1299 1311 C 1298 1312 U 1297 1313 C 1296 1314 C 1295 1315 A 1294 1316 U 1293 1317 G 0 1318 A 0 1319 A 0 1320 G 1289 1321 U 0 1322 C 0 1323 G 0 1324 G 0 1325 A 0 1326 A 933 1327 U 932 1328 C 931 1329 G 930 1330 C 929 1331 U 0 1332 A 0 1333 G 0 1334 U 0 1335 A 0 1336 A 1358 1337 U 1357 1338 C 1356 1339 G 1355 1340 C 1354 1341 G 1353 1342 G 1352 1343 A 1351 1344 U 0 1345 C 0 1346 A 0 1347 G 0 1348 C 0 1349 A 0 1350 U 0 1351 G 1343 1352 C 1342 1353 C 1341 1354 G 1340 1355 C 1339 1356 G 1338 1357 G 1337 1358 U 1336 1359 G 0 1360 A 0 1361 A 0 1362 U 0 1363 A 0 1364 C 0 1365 G 926 1366 U 925 1367 U 0 1368 C 0 1369 C 0 1370 C 923 1371 G 922 1372 G 921 1373 G 920 1374 C 919 1375 C 918 1376 U 917 1377 U 915 1378 G 914 1379 U 913 1380 A 0 1381 C 912 1382 A 911 1383 C 0 1384 A 0 1385 C 1490 1386 C 0 1387 G 1487 1388 C 1486 1389 C 0 1390 C 1483 1391 G 1482 1392 U 0 1393 C 0 1394 A 0 1395 C 1477 1396 A 1476 1397 C 1475 1398 C 1474 1399 A 1473 1400 C 1472 1401 C 1471 1402 C 1470 1403 G 0 1404 A 0 1405 G 1467 1406 U 1466 1407 U 1465 1408 G 1464 1409 G 1463 1410 U 1462 1411 A 1461 1412 G 1460 1413 U 1459 1414 G 1458 1415 C 1457 1416 C 1456 1417 C 0 1418 G 0 1419 A 0 1420 A 0 1421 G 1452 1422 U 1451 1423 G 1450 1424 G 1449 1425 U 1448 1426 C 1447 1427 C 0 1428 G 1446 1429 G 1445 1430 C 1444 1431 U 1443 1432 A 0 1433 A 0 1434 C 1441 1435 C 1440 1436 G 0 1437 C 0 1438 A 0 1439 A 0 1440 G 1435 1441 G 1434 1442 A 0 1443 G 1431 1444 G 1430 1445 C 1429 1446 A 1428 1447 G 1426 1448 A 1425 1449 U 1424 1450 U 1423 1451 A 1422 1452 U 1421 1453 C 0 1454 A 0 1455 A 0 1456 G 1416 1457 G 1415 1458 C 1414 1459 A 1413 1460 A 1412 1461 G 1411 1462 A 1410 1463 U 1409 1464 C 1408 1465 G 1407 1466 G 1406 1467 U 1405 1468 G 0 1469 A 0 1470 G 1402 1471 G 1401 1472 G 1400 1473 G 1399 1474 G 1398 1475 G 1397 1476 U 1396 1477 G 1395 1478 A 0 1479 A 0 1480 G 0 1481 U 0 1482 C 1391 1483 G 1390 1484 U 0 1485 A 0 1486 A 1388 1487 C 1387 1488 A 0 1489 A 0 1490 G 1385 1491 G 0 1492 U 1515 1493 A 1514 1494 G 1513 1495 C 1512 1496 C 1511 1497 G 1510 1498 U 1509 1499 A 1508 1500 C 1507 1501 G 1506 1502 G 0 1503 G 0 1504 A 0 1505 A 0 1506 C 1501 1507 G 1500 1508 U 1499 1509 G 1498 1510 C 1497 1511 G 1496 1512 G 1495 1513 C 1494 1514 U 1493 1515 G 1492 1516 G 0 1517 A 0 1518 U 0 1519 C 0 1520 A 0 1521 C 0 1522 C 0 1523 U 0 1524 C 0 1525 C 0 1526 U 0 1527 U 0 1528 N 0