Filename: d.16.b.L.pneumophila.1.bpseq Organism: Legionella pneumophila Accession Number: M59157 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 A 0 2 A 0 3 C 0 4 U 0 5 G 0 6 A 0 7 A 0 8 G 24 9 A 23 10 G 22 11 U 21 12 U 20 13 U 0 14 G 0 15 A 0 16 U 918 17 C 917 18 C 916 19 U 0 20 G 12 21 G 11 22 C 10 23 U 9 24 C 8 25 A 0 26 G 555 27 A 554 28 U 553 29 U 552 30 G 0 31 A 551 32 A 550 33 C 549 34 G 548 35 C 547 36 U 546 37 G 0 38 G 402 39 C 401 40 G 400 41 G 399 42 C 398 43 A 397 44 U 395 45 G 394 46 C 360 47 U 0 48 U 0 49 A 0 50 A 0 51 C 358 52 A 357 53 C 356 54 A 0 55 U 355 56 G 354 57 C 353 58 A 0 59 A 0 60 G 105 61 U 104 62 C 103 63 G 0 64 A 0 65 A 102 66 C 101 67 G 100 68 G 98 69 C 97 70 A 0 71 G 0 72 C 96 73 A 95 74 U 94 75 U 92 76 G 91 77 U 90 78 C 89 79 U 88 80 A 87 81 G 86 82 C 0 83 U 0 84 U 0 85 G 0 86 C 81 87 U 80 88 A 79 89 G 78 90 A 77 91 C 76 92 A 75 93 G 0 94 A 74 95 U 73 96 G 72 97 G 69 98 C 68 99 G 0 100 A 67 101 G 66 102 U 65 103 G 62 104 G 61 105 C 60 106 G 0 107 A 0 108 A 0 109 C 0 110 G 0 111 G 0 112 G 313 113 U 312 114 G 311 115 A 0 116 G 0 117 U 0 118 A 0 119 A 0 120 C 0 121 G 238 122 C 237 123 G 236 124 U 235 125 A 234 126 G 233 127 G 232 128 A 231 129 A 0 130 U 230 131 A 229 132 U 0 133 G 0 134 C 0 135 C 226 136 U 225 137 U 224 138 G 223 139 A 222 140 A 221 141 G 220 142 A 0 143 G 177 144 G 176 145 G 175 146 G 174 147 G 0 148 A 0 149 C 0 150 A 0 151 A 168 152 C 167 153 U 166 154 U 165 155 G 164 156 G 163 157 G 162 158 G 0 159 A 0 160 A 0 161 A 0 162 C 157 163 U 156 164 C 155 165 A 154 166 A 153 167 G 152 168 C 151 169 U 0 170 A 0 171 A 0 172 U 0 173 A 0 174 C 146 175 C 145 176 G 144 177 C 143 178 A 0 179 U 0 180 A 0 181 A 0 182 U 0 183 G 192 184 U 191 185 C 190 186 U 0 187 G 0 188 A 0 189 G 0 190 G 185 191 A 184 192 C 183 193 G 0 194 A 0 195 A 0 196 A 0 197 G 218 198 C 217 199 U 216 200 G 215 201 G 214 202 G 213 203 G 0 204 A 0 205 C 212 206 C 211 207 U 0 208 U 0 209 C 0 210 G 0 211 G 206 212 G 205 213 C 202 214 C 201 215 U 200 216 G 199 217 G 198 218 C 197 219 G 0 220 C 141 221 U 140 222 U 139 223 U 138 224 A 137 225 A 136 226 G 135 227 A 0 228 U 0 229 U 131 230 A 130 231 G 128 232 C 127 233 C 126 234 U 125 235 G 124 236 C 123 237 G 122 238 U 121 239 C 285 240 C 284 241 G 283 242 A 0 243 U 0 244 U 282 245 A 0 246 G 276 247 C 275 248 U 274 249 A 0 250 G 0 251 U 273 252 U 272 253 G 271 254 G 270 255 U 269 256 G 268 257 G 267 258 G 266 259 G 0 260 U 0 261 A 0 262 A 0 263 G 0 264 G 0 265 G 0 266 C 258 267 C 257 268 U 256 269 A 255 270 C 254 271 C 253 272 A 252 273 A 251 274 G 248 275 G 247 276 C 246 277 G 0 278 A 0 279 C 0 280 G 0 281 A 0 282 U 244 283 C 241 284 G 240 285 G 239 286 N 0 287 A 0 288 G 310 289 C 309 290 U 308 291 N 307 292 G 303 293 U 302 294 C 301 295 U 300 296 G 0 297 A 0 298 G 0 299 A 0 300 G 295 301 G 294 302 A 293 303 U 292 304 G 0 305 A 0 306 C 0 307 C 291 308 A 290 309 G 289 310 C 288 311 C 114 312 A 113 313 C 112 314 A 0 315 C 336 316 U 335 317 G 334 318 G 333 319 A 332 320 A 331 321 C 0 322 U 0 323 G 0 324 A 0 325 G 0 326 A 0 327 C 0 328 A 0 329 C 0 330 G 0 331 G 320 332 U 319 333 C 318 334 C 317 335 A 316 336 G 315 337 A 0 338 C 349 339 U 348 340 C 347 341 C 346 342 U 0 343 A 0 344 C 0 345 G 0 346 G 341 347 G 340 348 A 339 349 G 338 350 G 0 351 C 0 352 A 0 353 G 57 354 C 56 355 A 55 356 G 53 357 U 52 358 G 51 359 G 0 360 G 46 361 G 0 362 A 0 363 A 0 364 U 0 365 A 0 366 U 392 367 U 0 368 G 391 369 G 390 370 A 389 371 C 0 372 A 0 373 A 0 374 U 387 375 G 386 376 G 385 377 G 384 378 G 383 379 G 0 380 C 0 381 A 0 382 A 0 383 C 378 384 C 377 385 C 376 386 U 375 387 G 374 388 A 0 389 U 370 390 C 369 391 C 368 392 A 366 393 G 0 394 C 45 395 A 44 396 A 0 397 U 43 398 G 42 399 C 41 400 C 40 401 G 39 402 C 38 403 G 0 404 U 0 405 G 435 406 U 434 407 G 433 408 U 432 409 G 0 410 A 0 411 A 0 412 G 0 413 A 0 414 A 0 415 G 426 416 G 425 417 C 424 418 C 423 419 U 0 420 N 0 421 A 0 422 G 0 423 G 418 424 G 417 425 U 416 426 U 415 427 G 0 428 U 0 429 A 0 430 A 0 431 A 0 432 G 408 433 C 407 434 A 406 435 C 405 436 U 0 437 U 495 438 U 0 439 C 0 440 A 492 441 G 491 442 U 490 443 G 489 444 G 488 445 G 487 446 G 0 447 A 0 448 G 0 449 G 482 450 A 0 451 G 0 452 G 0 453 G 0 454 U 476 455 U 475 456 G 474 457 A 473 458 U 472 459 A 471 460 G 470 461 G 469 462 U 0 463 U 0 464 A 0 465 A 0 466 G 0 467 A 0 468 G 0 469 C 461 470 U 460 471 G 459 472 A 458 473 U 457 474 U 456 475 A 455 476 A 454 477 C 0 478 U 0 479 G 0 480 G 0 481 A 0 482 C 449 483 G 0 484 U 0 485 U 0 486 A 0 487 C 445 488 C 444 489 C 443 490 A 442 491 C 441 492 A 440 493 G 0 494 A 0 495 A 437 496 G 0 497 A 0 498 A 0 499 G 544 500 C 543 501 A 542 502 C 541 503 C 540 504 G 0 505 G 0 506 C 0 507 U 0 508 A 0 509 A 0 510 C 539 511 U 538 512 C 537 513 C 536 514 G 535 515 U 0 516 G 0 517 C 0 518 C 0 519 A 0 520 G 527 521 C 526 522 A 0 523 G 0 524 C 0 525 C 0 526 N 521 527 C 520 528 G 0 529 G 0 530 U 0 531 A 0 532 A 0 533 U 0 534 A 0 535 C 514 536 G 513 537 G 512 538 A 511 539 G 510 540 N 503 541 G 502 542 U 501 543 G 500 544 C 499 545 N 0 546 A 36 547 G 35 548 C 34 549 G 33 550 U 32 551 U 31 552 A 29 553 A 28 554 U 27 555 C 26 556 G 0 557 G 0 558 A 0 559 A 0 560 U 0 561 U 0 562 A 0 563 C 0 564 U 0 565 G 0 566 G 883 567 G 882 568 C 881 569 G 0 570 U 0 571 A 0 572 A 0 573 A 0 574 G 0 575 G 0 576 G 763 577 U 762 578 G 761 579 C 760 580 G 0 581 U 757 582 A 0 583 G 756 584 G 755 585 U 754 586 G 0 587 G 650 588 U 649 589 U 648 590 G 647 591 A 646 592 U 645 593 U 644 594 A 0 595 A 643 596 G 642 597 U 639 598 U 638 599 A 637 600 U 636 601 C 635 602 U 634 603 G 633 604 U 632 605 G 631 606 A 0 607 A 0 608 A 0 609 U 0 610 U 628 611 C 627 612 C 626 613 U 625 614 G 624 615 G 623 616 G 622 617 C 0 618 U 0 619 U 0 620 A 0 621 A 0 622 C 616 623 C 615 624 U 614 625 G 613 626 G 612 627 G 611 628 A 610 629 C 0 630 G 0 631 G 605 632 U 604 633 C 603 634 A 602 635 G 601 636 A 600 637 U 599 638 A 598 639 A 597 640 U 0 641 A 0 642 C 596 643 U 595 644 G 593 645 G 592 646 U 591 647 U 590 648 G 589 649 A 588 650 C 587 651 U 0 652 C 0 653 G 0 654 A 750 655 G 749 656 U 748 657 A 747 658 U 746 659 G 744 660 G 743 661 G 742 662 A 741 663 G 0 664 A 0 665 G 739 666 G 738 667 G 737 668 U 736 669 A 735 670 G 734 671 U 733 672 G 716 673 G 715 674 A 0 675 A 0 676 U 712 677 U 711 678 U 710 679 C 709 680 C 708 681 G 707 682 G 706 683 U 705 684 G 0 685 U 0 686 A 0 687 G 698 688 C 697 689 G 696 690 G 0 691 U 0 692 G 0 693 A 0 694 A 0 695 A 0 696 U 689 697 G 688 698 C 687 699 G 0 700 U 0 701 A 0 702 G 0 703 A 0 704 G 0 705 A 683 706 U 682 707 C 681 708 G 680 709 G 679 710 A 678 711 A 677 712 G 676 713 G 0 714 A 0 715 A 673 716 C 672 717 A 0 718 C 0 719 C 0 720 A 0 721 G 732 722 U 0 723 G 0 724 G 731 725 C 730 726 G 0 727 A 0 728 A 0 729 G 0 730 G 725 731 C 724 732 G 721 733 G 671 734 C 670 735 U 669 736 A 668 737 C 667 738 C 666 739 U 665 740 G 0 741 G 662 742 C 661 743 C 660 744 U 659 745 A 0 746 A 658 747 U 657 748 A 656 749 C 655 750 U 654 751 G 0 752 A 0 753 C 0 754 A 585 755 C 584 756 U 583 757 G 581 758 A 0 759 G 0 760 G 579 761 C 578 762 A 577 763 C 576 764 G 0 765 A 0 766 A 0 767 A 0 768 G 809 769 C 808 770 G 807 771 U 806 772 G 805 773 G 804 774 G 0 775 G 0 776 A 0 777 G 803 778 C 802 779 A 0 780 A 0 781 A 0 782 C 798 783 A 797 784 G 796 785 G 795 786 A 0 787 U 0 788 U 0 789 A 0 790 G 0 791 A 0 792 U 0 793 A 0 794 C 0 795 C 785 796 C 784 797 U 783 798 G 782 799 G 0 800 U 0 801 A 0 802 G 778 803 U 777 804 C 773 805 C 772 806 A 771 807 C 770 808 G 769 809 C 768 810 U 0 811 G 0 812 U 0 813 A 0 814 A 0 815 A 0 816 C 0 817 G 0 818 A 0 819 U 0 820 G 879 821 U 878 822 C 877 823 A 876 824 A 875 825 C 874 826 U 0 827 A 0 828 G 857 829 C 856 830 U 855 831 G 854 832 U 853 833 U 852 834 G 851 835 G 850 836 U 849 837 U 848 838 A 847 839 U 846 840 A 0 841 U 0 842 G 0 843 A 0 844 A 0 845 A 0 846 A 839 847 U 838 848 A 837 849 A 836 850 U 835 851 U 834 852 A 833 853 G 832 854 U 831 855 G 830 856 G 829 857 C 828 858 G 0 859 C 0 860 A 0 861 G 868 862 C 867 863 A 0 864 A 0 865 A 0 866 C 0 867 G 862 868 C 861 869 G 0 870 A 0 871 U 0 872 A 0 873 A 0 874 G 825 875 U 824 876 U 823 877 G 822 878 A 821 879 C 820 880 C 0 881 G 568 882 C 567 883 C 566 884 U 0 885 G 912 886 G 911 887 G 910 888 G 0 889 A 0 890 G 0 891 U 0 892 A 0 893 C 0 894 G 905 895 G 904 896 U 903 897 C 902 898 G 0 899 C 0 900 A 0 901 A 0 902 G 897 903 A 896 904 U 895 905 U 894 906 A 0 907 A 0 908 A 0 909 A 0 910 C 887 911 U 886 912 C 885 913 A 0 914 A 0 915 A 0 916 G 18 917 G 17 918 A 16 919 A 0 920 U 0 921 U 1397 922 G 1396 923 A 1394 924 C 1393 925 G 1392 926 G 0 927 G 1391 928 G 1390 929 G 1389 930 C 1388 931 N 1387 932 C 1386 933 G 1385 934 C 0 935 A 1381 936 C 1380 937 A 0 938 A 0 939 G 1345 940 C 1344 941 G 1343 942 G 1342 943 U 1341 944 G 1238 945 G 1237 946 A 1236 947 G 1235 948 C 1234 949 A 1233 950 U 1232 951 G 1231 952 U 1230 953 G 1229 954 G 1227 955 U 1226 956 U 0 957 U 0 958 A 0 959 A 0 960 U 975 961 U 974 962 C 973 963 G 972 964 A 0 965 U 0 966 G 0 967 C 0 968 A 0 969 A 0 970 C 0 971 G 0 972 C 963 973 G 962 974 A 961 975 A 960 976 G 0 977 A 0 978 A 0 979 C 0 980 C 0 981 U 0 982 U 0 983 A 0 984 C 1222 985 C 1221 986 U 1220 987 A 1219 988 C 1218 989 C 1217 990 C 1216 991 U 0 992 U 0 993 G 0 994 A 0 995 C 0 996 A 1045 997 U 1044 998 A 1043 999 C 1041 1000 A 1040 1001 G 1039 1002 U 1038 1003 G 1037 1004 A 0 1005 A 0 1006 U 1023 1007 U 1022 1008 U 1021 1009 U 1020 1010 G 1019 1011 C 1018 1012 A 1017 1013 G 0 1014 A 0 1015 G 0 1016 A 0 1017 U 1012 1018 G 1011 1019 C 1010 1020 A 1009 1021 U 1008 1022 U 1007 1023 A 1006 1024 G 0 1025 U 1036 1026 G 1035 1027 C 1034 1028 C 1033 1029 U 0 1030 U 0 1031 C 0 1032 G 0 1033 G 1028 1034 G 1027 1035 A 1026 1036 A 1025 1037 C 1003 1038 A 1002 1039 C 1001 1040 U 1000 1041 G 999 1042 A 0 1043 U 998 1044 A 997 1045 C 996 1046 A 0 1047 G 1211 1048 G 1210 1049 U 0 1050 G 1209 1051 C 1208 1052 U 1207 1053 G 1206 1054 C 0 1055 A 0 1056 U 1205 1057 G 1204 1058 G 1200 1059 C 1199 1060 U 1198 1061 G 1196 1062 U 1195 1063 C 1194 1064 G 1193 1065 U 0 1066 C 0 1067 A 0 1068 G 1107 1069 C 1106 1070 U 1105 1071 C 1104 1072 G 1103 1073 U 1102 1074 G 1083 1075 U 1082 1076 C 1081 1077 G 0 1078 U 0 1079 G 0 1080 A 0 1081 G 1076 1082 A 1075 1083 U 1074 1084 G 0 1085 U 0 1086 U 1099 1087 G 1098 1088 G 1097 1089 G 1096 1090 U 0 1091 U 0 1092 A 0 1093 A 0 1094 G 0 1095 U 0 1096 C 1089 1097 C 1088 1098 C 1087 1099 G 1086 1100 U 0 1101 A 0 1102 A 1073 1103 C 1072 1104 G 1071 1105 A 1070 1106 G 1069 1107 C 1068 1108 G 0 1109 C 0 1110 A 0 1111 A 0 1112 C 0 1113 C 1188 1114 C 1187 1115 U 1186 1116 U 1185 1117 A 0 1118 U 1156 1119 C 1155 1120 C 1154 1121 U 1153 1122 U 1152 1123 A 1151 1124 G 1150 1125 U 0 1126 U 0 1127 G 0 1128 C 1145 1129 C 1144 1130 A 0 1131 G 0 1132 C 1143 1133 A 1142 1134 U 1141 1135 G 0 1136 U 0 1137 G 0 1138 A 0 1139 U 0 1140 G 0 1141 G 1134 1142 U 1133 1143 G 1132 1144 G 1129 1145 G 1128 1146 G 0 1147 A 0 1148 C 0 1149 U 0 1150 C 1124 1151 U 1123 1152 A 1122 1153 A 1121 1154 G 1120 1155 G 1119 1156 A 1118 1157 G 0 1158 A 0 1159 C 1179 1160 U 1178 1161 G 1177 1162 C 1176 1163 C 1175 1164 G 1174 1165 G 1173 1166 U 1172 1167 G 0 1168 A 0 1169 C 0 1170 A 0 1171 A 0 1172 A 1166 1173 C 1165 1174 C 1164 1175 G 1163 1176 G 1162 1177 A 1161 1178 G 1160 1179 G 1159 1180 A 0 1181 A 0 1182 G 0 1183 G 0 1184 C 0 1185 G 1116 1186 G 1115 1187 G 1114 1188 G 1113 1189 A 0 1190 U 0 1191 G 0 1192 A 0 1193 C 1064 1194 G 1063 1195 U 1062 1196 C 1061 1197 A 0 1198 A 1060 1199 G 1059 1200 U 1058 1201 C 0 1202 A 0 1203 U 0 1204 C 1057 1205 A 1056 1206 U 1053 1207 G 1052 1208 G 1051 1209 C 1050 1210 C 1048 1211 C 1047 1212 U 0 1213 U 0 1214 A 0 1215 C 0 1216 G 990 1217 G 989 1218 G 988 1219 U 987 1220 A 986 1221 G 985 1222 G 984 1223 G 0 1224 C 0 1225 U 0 1226 A 955 1227 C 954 1228 A 0 1229 C 953 1230 A 952 1231 C 951 1232 G 950 1233 U 949 1234 G 948 1235 C 947 1236 U 946 1237 A 945 1238 C 944 1239 A 0 1240 A 0 1241 U 0 1242 G 1297 1243 G 1296 1244 C 1295 1245 C 1294 1246 G 1293 1247 A 1292 1248 U 1291 1249 A 0 1250 C 0 1251 A 0 1252 G 0 1253 A 0 1254 G 1285 1255 G 1284 1256 G 1283 1257 C 0 1258 G 0 1259 G 1278 1260 C 1277 1261 G 0 1262 A 0 1263 A 0 1264 G 1273 1265 G 1272 1266 G 1271 1267 G 0 1268 C 0 1269 G 0 1270 A 0 1271 C 1266 1272 C 1265 1273 U 1264 1274 G 0 1275 G 0 1276 A 0 1277 G 1260 1278 C 1259 1279 A 0 1280 A 0 1281 A 0 1282 U 0 1283 C 1256 1284 C 1255 1285 U 1254 1286 U 0 1287 A 0 1288 A 0 1289 A 0 1290 A 0 1291 G 1248 1292 U 1247 1293 C 1246 1294 G 1245 1295 G 1244 1296 U 1243 1297 C 1242 1298 G 0 1299 U 0 1300 A 0 1301 G 0 1302 U 0 1303 C 0 1304 C 1335 1305 G 0 1306 G 0 1307 A 0 1308 U 1331 1309 U 1330 1310 G 1329 1311 G 1328 1312 A 1327 1313 G 1326 1314 U 1325 1315 C 1324 1316 U 0 1317 G 0 1318 C 0 1319 A 0 1320 A 0 1321 C 0 1322 U 0 1323 C 0 1324 G 1315 1325 A 1314 1326 C 1313 1327 U 1312 1328 C 1311 1329 C 1310 1330 A 1309 1331 U 1308 1332 G 0 1333 A 0 1334 A 0 1335 G 1304 1336 U 0 1337 C 0 1338 G 0 1339 G 0 1340 A 0 1341 A 943 1342 U 942 1343 C 941 1344 G 940 1345 C 939 1346 U 0 1347 A 0 1348 G 0 1349 U 0 1350 A 0 1351 A 1373 1352 U 1372 1353 C 1371 1354 G 1370 1355 C 1369 1356 G 1368 1357 A 1367 1358 A 1366 1359 U 0 1360 C 0 1361 A 0 1362 G 0 1363 C 0 1364 A 0 1365 U 0 1366 G 1358 1367 U 1357 1368 C 1356 1369 G 1355 1370 C 1354 1371 G 1353 1372 G 1352 1373 U 1351 1374 G 0 1375 A 0 1376 A 0 1377 U 0 1378 A 0 1379 C 0 1380 G 936 1381 U 935 1382 U 0 1383 C 0 1384 C 0 1385 C 933 1386 G 932 1387 G 931 1388 G 930 1389 C 929 1390 C 928 1391 U 927 1392 U 925 1393 G 924 1394 U 923 1395 A 0 1396 C 922 1397 A 921 1398 C 0 1399 A 0 1400 C 0 1401 C 0 1402 G 1502 1403 C 1501 1404 C 0 1405 C 0 1406 G 1497 1407 U 0 1408 C 1495 1409 A 0 1410 C 1492 1411 A 1491 1412 C 1490 1413 C 1489 1414 A 1488 1415 U 1487 1416 G 1486 1417 G 1485 1418 G 0 1419 A 0 1420 G 1482 1421 U 1481 1422 G 1480 1423 G 1479 1424 G 1478 1425 U 1477 1426 U 1476 1427 G 1475 1428 C 1474 1429 A 1473 1430 C 1472 1431 C 1471 1432 A 0 1433 G 0 1434 A 0 1435 A 0 1436 G 1467 1437 U 1466 1438 A 1465 1439 G 1464 1440 A 1463 1441 U 1462 1442 A 0 1443 G 1461 1444 U 1460 1445 C 1459 1446 U 1458 1447 A 0 1448 A 0 1449 C 1456 1450 C 1455 1451 U 0 1452 U 0 1453 C 0 1454 G 0 1455 G 1450 1456 G 1449 1457 G 0 1458 G 1446 1459 G 1445 1460 A 1444 1461 C 1443 1462 G 1441 1463 U 1440 1464 U 1439 1465 U 1438 1466 A 1437 1467 C 1436 1468 C 0 1469 A 0 1470 C 0 1471 G 1431 1472 G 1430 1473 U 1429 1474 G 1428 1475 U 1427 1476 G 1426 1477 G 1425 1478 U 1424 1479 U 1423 1480 C 1422 1481 A 1421 1482 U 1420 1483 G 0 1484 N 0 1485 C 1417 1486 N 1416 1487 N 1415 1488 G 1414 1489 G 1413 1490 G 1412 1491 N 1411 1492 N 1410 1493 N 0 1494 N 0 1495 N 1408 1496 N 0 1497 N 1406 1498 G 0 1499 U 0 1500 A 0 1501 A 1403 1502 C 1402 1503 A 0 1504 A 0 1505 G 0 1506 N 0 1507 N 1530 1508 N 1529 1509 N 1528 1510 N 1527 1511 N 1526 1512 N 1525 1513 N 1524 1514 N 1523 1515 N 1522 1516 N 1521 1517 N 0 1518 N 0 1519 N 0 1520 N 0 1521 N 1516 1522 N 1515 1523 N 1514 1524 N 1513 1525 N 1512 1526 N 1511 1527 N 1510 1528 N 1509 1529 N 1508 1530 N 1507 1531 G 0 1532 A 0 1533 U 0 1534 C 0 1535 A 0 1536 C 0 1537 C 0 1538 U 0 1539 C 0 1540 C 0 1541 U 0 1542 U 0 1543 A 0