Filename: d.16.b.M.capricolum.bpseq Organism: Mycoplasma capricolum Accession Number: X00921 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 A 0 3 A 0 4 A 0 5 A 0 6 U 0 7 G 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 904 18 C 903 19 C 902 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 550 28 G 549 29 A 548 30 U 547 31 A 0 32 A 546 33 A 545 34 C 544 35 G 543 36 C 542 37 U 541 38 G 0 39 G 397 40 C 396 41 G 395 42 G 394 43 C 393 44 U 392 45 G 390 46 G 389 47 C 355 48 C 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 U 353 53 A 352 54 C 351 55 A 0 56 U 350 57 G 349 58 C 348 59 A 0 60 A 0 61 G 90 62 U 89 63 C 88 64 G 0 65 A 0 66 A 87 67 C 86 68 G 85 69 G 84 70 G 83 71 G 82 72 G 81 73 U 80 74 G 79 75 C 0 76 U 0 77 U 0 78 G 0 79 C 74 80 A 73 81 C 72 82 C 71 83 U 70 84 C 69 85 A 68 86 G 67 87 U 66 88 G 63 89 G 62 90 C 61 91 G 0 92 A 0 93 A 0 94 C 0 95 G 0 96 G 0 97 G 308 98 U 307 99 G 306 100 A 0 101 G 0 102 U 0 103 A 0 104 A 0 105 C 0 106 A 233 107 C 232 108 G 231 109 U 230 110 A 229 111 U 228 112 C 227 113 U 226 114 A 0 115 A 0 116 C 225 117 C 224 118 U 0 119 A 0 120 C 0 121 C 221 122 U 220 123 U 219 124 A 218 125 U 217 126 A 216 127 G 215 128 C 0 129 G 163 130 G 162 131 G 161 132 G 160 133 G 0 134 A 0 135 U 0 136 A 0 137 A 154 138 C 153 139 U 152 140 U 151 141 U 150 142 U 149 143 G 148 144 G 0 145 A 0 146 A 0 147 A 0 148 C 143 149 G 142 150 A 141 151 A 140 152 A 139 153 G 138 154 A 137 155 U 0 156 A 0 157 A 0 158 U 0 159 A 0 160 C 132 161 C 131 162 G 130 163 C 129 164 A 0 165 U 0 166 G 0 167 U 0 168 A 0 169 G 195 170 A 194 171 U 193 172 C 192 173 U 191 174 U 190 175 A 0 176 U 189 177 U 188 178 A 187 179 U 186 180 C 185 181 G 0 182 C 0 183 A 0 184 U 0 185 G 180 186 A 179 187 G 178 188 A 177 189 A 176 190 A 174 191 A 173 192 G 172 193 A 171 194 U 170 195 C 169 196 A 0 197 A 0 198 A 0 199 A 0 200 G 213 201 A 212 202 A 211 203 C 210 204 C 209 205 G 0 206 U 0 207 U 0 208 U 0 209 G 204 210 G 203 211 U 202 212 U 201 213 C 200 214 A 0 215 C 127 216 U 126 217 A 125 218 U 124 219 G 123 220 A 122 221 G 121 222 A 0 223 U 0 224 G 117 225 G 116 226 G 113 227 G 112 228 A 111 229 U 110 230 G 109 231 C 108 232 G 107 233 G 106 234 C 280 235 G 279 236 U 278 237 A 0 238 U 0 239 U 277 240 A 0 241 G 271 242 C 270 243 U 269 244 A 0 245 G 0 246 U 268 247 A 267 248 G 266 249 G 265 250 U 264 251 G 263 252 A 262 253 G 261 254 A 0 255 U 0 256 A 0 257 A 0 258 U 0 259 A 0 260 G 0 261 C 253 262 C 252 263 C 251 264 A 250 265 C 249 266 C 248 267 U 247 268 A 246 269 G 243 270 G 242 271 C 241 272 G 0 273 A 0 274 U 0 275 G 0 276 A 0 277 U 239 278 A 236 279 C 235 280 G 234 281 U 0 282 A 0 283 G 305 284 C 304 285 C 303 286 G 302 287 A 298 288 A 297 289 C 296 290 U 295 291 G 0 292 A 0 293 G 0 294 A 0 295 G 290 296 G 289 297 U 288 298 U 287 299 G 0 300 A 0 301 U 0 302 C 286 303 G 285 304 G 284 305 C 283 306 C 99 307 A 98 308 C 97 309 A 0 310 U 331 311 U 330 312 G 329 313 G 328 314 G 327 315 A 326 316 C 0 317 U 0 318 G 0 319 A 0 320 A 0 321 A 0 322 U 0 323 A 0 324 C 0 325 G 0 326 G 315 327 C 314 328 C 313 329 C 312 330 A 311 331 G 310 332 A 0 333 C 344 334 U 343 335 C 342 336 C 341 337 U 0 338 A 0 339 C 0 340 G 0 341 G 336 342 G 335 343 A 334 344 G 333 345 G 0 346 C 0 347 A 0 348 G 58 349 C 57 350 A 56 351 G 54 352 U 53 353 A 52 354 G 0 355 G 47 356 G 0 357 A 0 358 A 0 359 U 0 360 U 0 361 U 387 362 U 0 363 U 386 364 C 385 365 A 384 366 C 0 367 A 0 368 A 0 369 U 382 370 G 381 371 G 380 372 A 379 373 C 378 374 G 0 375 A 0 376 A 0 377 A 0 378 G 373 379 U 372 380 C 371 381 U 370 382 G 369 383 A 0 384 U 365 385 G 364 386 A 363 387 A 361 388 G 0 389 C 46 390 A 45 391 A 0 392 U 44 393 G 43 394 C 42 395 C 41 396 G 40 397 C 39 398 G 0 399 U 0 400 G 430 401 A 429 402 G 428 403 U 427 404 G 0 405 A 0 406 U 0 407 G 0 408 A 0 409 C 0 410 G 421 411 G 420 412 C 419 413 C 418 414 U 0 415 U 0 416 C 0 417 G 0 418 G 413 419 G 412 420 U 411 421 U 410 422 G 0 423 U 0 424 A 0 425 A 0 426 A 0 427 G 403 428 C 402 429 U 401 430 C 400 431 U 0 432 G 490 433 U 0 434 U 491 435 G 487 436 U 486 437 A 485 438 A 484 439 G 483 440 G 482 441 G 0 442 A 0 443 A 0 444 G 477 445 A 0 446 A 0 447 A 0 448 A 0 449 A 0 450 A 471 451 U 470 452 A 469 453 G 468 454 A 467 455 G 466 456 U 465 457 A 464 458 G 463 459 G 0 460 A 0 461 A 0 462 A 0 463 U 458 464 G 457 465 A 456 466 C 455 467 U 454 468 U 453 469 U 452 470 A 451 471 U 450 472 C 0 473 U 0 474 U 0 475 G 0 476 A 0 477 C 444 478 A 0 479 G 0 480 U 0 481 A 0 482 C 440 483 C 439 484 U 438 485 U 437 486 A 436 487 C 435 488 C 0 489 A 0 490 G 432 491 A 434 492 A 0 493 A 0 494 G 539 495 C 538 496 C 537 497 A 536 498 C 535 499 G 520 500 G 519 501 C 518 502 U 0 503 A 0 504 A 0 505 C 534 506 U 533 507 A 532 508 U 531 509 G 530 510 U 0 511 G 0 512 C 0 513 C 0 514 A 0 515 G 522 516 C 521 517 A 0 518 G 501 519 C 500 520 C 499 521 G 516 522 C 515 523 G 0 524 G 0 525 U 0 526 A 0 527 A 0 528 U 0 529 A 0 530 C 509 531 A 508 532 U 507 533 A 506 534 G 505 535 G 498 536 U 497 537 G 496 538 G 495 539 C 494 540 A 0 541 A 37 542 G 36 543 C 35 544 G 34 545 U 33 546 U 32 547 A 30 548 U 29 549 C 28 550 C 27 551 G 0 552 G 0 553 A 0 554 U 0 555 U 0 556 U 0 557 A 0 558 U 0 559 U 0 560 G 0 561 G 869 562 G 868 563 C 867 564 G 852 565 U 851 566 A 0 567 U 0 568 A 0 569 G 866 570 G 0 571 G 757 572 U 756 573 G 755 574 C 754 575 G 0 576 U 751 577 A 0 578 G 750 579 G 749 580 C 748 581 G 0 582 G 644 583 U 643 584 U 642 585 U 641 586 U 640 587 G 639 588 C 638 589 A 0 590 A 637 591 G 636 592 U 633 593 U 632 594 U 631 595 G 630 596 A 629 597 G 628 598 G 627 599 U 626 600 U 625 601 A 0 602 A 0 603 A 0 604 G 0 605 U 0 606 C 622 607 C 621 608 G 620 609 G 619 610 A 618 611 G 617 612 C 0 613 U 0 614 C 0 615 A 0 616 A 0 617 C 611 618 U 610 619 C 609 620 C 608 621 G 607 622 G 606 623 U 0 624 U 0 625 C 600 626 G 599 627 C 598 628 C 597 629 U 596 630 U 595 631 G 594 632 A 593 633 A 592 634 G 0 635 A 0 636 C 591 637 U 590 638 G 588 639 U 587 640 U 586 641 U 585 642 U 584 643 A 583 644 C 582 645 U 0 646 A 0 647 G 0 648 A 744 649 A 743 650 U 742 651 G 740 652 C 739 653 A 738 654 A 737 655 G 736 656 A 735 657 G 0 658 A 0 659 G 733 660 G 732 661 U 731 662 A 730 663 A 729 664 G 728 665 C 727 666 G 710 667 G 709 668 A 0 669 A 0 670 U 706 671 U 705 672 C 704 673 C 703 674 A 702 675 U 701 676 G 700 677 U 699 678 G 0 679 U 0 680 A 0 681 G 692 682 C 691 683 G 690 684 G 0 685 U 0 686 G 0 687 A 0 688 A 0 689 A 0 690 U 683 691 G 682 692 C 681 693 G 0 694 U 0 695 A 0 696 G 0 697 A 0 698 U 0 699 A 677 700 U 676 701 A 675 702 U 674 703 G 673 704 G 672 705 A 671 706 A 670 707 G 0 708 A 0 709 A 667 710 C 666 711 A 0 712 C 0 713 C 0 714 U 0 715 G 726 716 U 0 717 G 0 718 G 725 719 C 724 720 G 0 721 A 0 722 A 0 723 A 0 724 G 719 725 C 718 726 G 715 727 G 665 728 C 664 729 U 663 730 U 662 731 A 661 732 C 660 733 U 659 734 G 0 735 G 656 736 C 655 737 U 654 738 U 653 739 G 652 740 U 651 741 U 0 742 A 650 743 U 649 744 U 648 745 G 0 746 A 0 747 C 0 748 G 580 749 C 579 750 U 578 751 G 576 752 A 0 753 G 0 754 G 574 755 C 573 756 A 572 757 C 571 758 G 0 759 A 0 760 A 0 761 A 0 762 G 803 763 C 802 764 G 801 765 U 800 766 G 799 767 G 798 768 G 0 769 G 0 770 A 0 771 G 797 772 C 796 773 A 0 774 A 0 775 A 0 776 U 792 777 A 791 778 G 790 779 G 789 780 A 0 781 U 0 782 U 0 783 A 0 784 G 0 785 A 0 786 U 0 787 A 0 788 C 0 789 C 779 790 C 778 791 U 777 792 A 776 793 G 0 794 U 0 795 A 0 796 G 772 797 U 771 798 C 767 799 C 766 800 A 765 801 C 764 802 G 763 803 C 762 804 C 0 805 G 0 806 U 0 807 A 0 808 A 0 809 A 0 810 C 0 811 G 0 812 A 0 813 U 0 814 G 865 815 A 864 816 G 863 817 U 862 818 A 861 819 C 860 820 U 0 821 A 0 822 A 843 823 G 842 824 U 841 825 G 840 826 U 839 827 U 838 828 G 837 829 G 836 830 G 835 831 G 0 832 U 0 833 A 0 834 A 0 835 C 830 836 U 829 837 C 828 838 A 827 839 G 826 840 C 825 841 G 824 842 C 823 843 U 822 844 G 0 845 C 0 846 A 0 847 G 854 848 C 853 849 U 0 850 A 0 851 A 565 852 C 564 853 G 848 854 C 847 855 A 0 856 U 0 857 U 0 858 A 0 859 A 0 860 G 819 861 U 818 862 A 817 863 C 816 864 U 815 865 C 814 866 C 569 867 G 563 868 C 562 869 C 561 870 U 0 871 G 898 872 A 897 873 G 896 874 U 0 875 A 0 876 G 0 877 U 0 878 A 0 879 U 0 880 G 891 881 C 890 882 U 889 883 C 888 884 G 0 885 C 0 886 A 0 887 A 0 888 G 883 889 A 882 890 G 881 891 U 880 892 G 0 893 A 0 894 A 0 895 A 0 896 C 873 897 U 872 898 C 871 899 A 0 900 A 0 901 A 0 902 G 19 903 G 18 904 A 17 905 A 0 906 U 0 907 U 1377 908 G 1376 909 A 1374 910 C 1373 911 G 1372 912 G 0 913 G 1371 914 G 1370 915 A 1369 916 C 1368 917 C 1367 918 C 1366 919 G 1365 920 C 0 921 A 1361 922 C 1360 923 A 0 924 A 0 925 G 1324 926 U 1323 927 G 1322 928 G 1321 929 U 1320 930 G 1217 931 G 1216 932 A 1215 933 G 1214 934 C 1213 935 A 1212 936 U 1211 937 G 1210 938 U 1209 939 G 1208 940 G 1206 941 U 1205 942 U 0 943 U 0 944 A 0 945 A 0 946 U 961 947 U 960 948 C 959 949 G 958 950 A 0 951 A 0 952 G 0 953 C 0 954 A 0 955 A 0 956 C 0 957 A 0 958 C 949 959 G 948 960 A 947 961 A 946 962 G 0 963 A 0 964 A 0 965 C 0 966 C 0 967 U 0 968 U 0 969 A 0 970 C 1201 971 C 1200 972 A 1199 973 G 1198 974 G 1197 975 G 1196 976 C 1195 977 N 0 978 U 0 979 G 0 980 A 0 981 C 0 982 A 1027 983 U 1026 984 C 1025 985 C 1023 986 A 1022 987 G 1021 988 U 1020 989 G 1019 990 U 0 991 A 0 992 A 0 993 A 1010 994 G 1009 995 C 1008 996 U 1007 997 A 1006 998 U 1005 999 A 1004 1000 G 0 1001 A 0 1002 G 0 1003 A 0 1004 U 999 1005 A 998 1006 U 997 1007 A 996 1008 G 995 1009 U 994 1010 A 993 1011 G 0 1012 A 0 1013 G 0 1014 G 0 1015 U 0 1016 U 0 1017 A 0 1018 A 0 1019 C 989 1020 A 988 1021 U 987 1022 U 986 1023 G 985 1024 A 0 1025 G 984 1026 A 983 1027 C 982 1028 A 0 1029 G 1190 1030 G 1189 1031 U 0 1032 G 1188 1033 G 1187 1034 U 1186 1035 G 1185 1036 C 0 1037 A 0 1038 U 1184 1039 G 1183 1040 G 1179 1041 U 1178 1042 U 1177 1043 G 1175 1044 U 1174 1045 C 1173 1046 G 1172 1047 U 0 1048 C 0 1049 A 0 1050 G 1089 1051 U 1088 1052 U 1087 1053 C 1086 1054 G 1085 1055 U 1084 1056 G 1065 1057 C 1064 1058 C 1063 1059 G 0 1060 U 0 1061 G 0 1062 A 0 1063 G 1058 1064 G 1057 1065 U 1056 1066 G 0 1067 U 0 1068 U 1081 1069 G 1080 1070 G 1079 1071 G 1078 1072 U 0 1073 U 0 1074 A 0 1075 A 0 1076 G 0 1077 U 0 1078 C 1071 1079 C 1070 1080 C 1069 1081 G 1068 1082 C 0 1083 A 0 1084 A 1055 1085 C 1054 1086 G 1053 1087 A 1052 1088 A 1051 1089 C 1050 1090 G 0 1091 C 0 1092 A 0 1093 A 0 1094 C 0 1095 C 1167 1096 C 1166 1097 U 1165 1098 U 1164 1099 G 0 1100 U 1136 1101 C 1135 1102 G 1134 1103 U 1133 1104 U 1132 1105 A 1131 1106 G 1130 1107 U 0 1108 U 0 1109 A 0 1110 C 1125 1111 U 1124 1112 A 0 1113 A 0 1114 C 1123 1115 A 1122 1116 U 0 1117 U 0 1118 A 0 1119 A 0 1120 G 0 1121 U 0 1122 U 1115 1123 G 1114 1124 A 1111 1125 G 1110 1126 A 0 1127 A 0 1128 C 0 1129 U 0 1130 C 1106 1131 U 1105 1132 A 1104 1133 A 1103 1134 C 1102 1135 G 1101 1136 A 1100 1137 G 0 1138 A 0 1139 C 1158 1140 U 1157 1141 G 1156 1142 C 1155 1143 U 1154 1144 A 1153 1145 G 1152 1146 U 1151 1147 G 0 1148 U 0 1149 A 0 1150 A 0 1151 G 1146 1152 C 1145 1153 U 1144 1154 A 1143 1155 G 1142 1156 A 1141 1157 G 1140 1158 G 1139 1159 A 0 1160 A 0 1161 G 0 1162 G 0 1163 U 0 1164 G 1098 1165 G 1097 1166 G 1096 1167 G 1095 1168 A 0 1169 U 0 1170 G 0 1171 A 0 1172 C 1046 1173 G 1045 1174 U 1044 1175 C 1043 1176 A 0 1177 A 1042 1178 A 1041 1179 U 1040 1180 C 0 1181 A 0 1182 U 0 1183 C 1039 1184 A 1038 1185 U 1035 1186 G 1034 1187 C 1033 1188 C 1032 1189 C 1030 1190 C 1029 1191 U 0 1192 U 0 1193 A 0 1194 U 0 1195 G 976 1196 U 975 1197 C 974 1198 C 973 1199 U 972 1200 G 971 1201 G 970 1202 G 0 1203 C 0 1204 U 0 1205 A 941 1206 C 940 1207 A 0 1208 C 939 1209 A 938 1210 C 937 1211 G 936 1212 U 935 1213 G 934 1214 C 933 1215 U 932 1216 A 931 1217 C 930 1218 A 0 1219 A 0 1220 U 0 1221 G 1276 1222 G 1275 1223 C 1274 1224 U 1273 1225 G 1272 1226 G 1271 1227 U 1270 1228 A 0 1229 C 0 1230 A 0 1231 A 0 1232 A 0 1233 G 1264 1234 A 1263 1235 G 1262 1236 U 0 1237 U 0 1238 G 1257 1239 C 1256 1240 A 0 1241 A 0 1242 U 0 1243 C 1252 1244 C 1251 1245 U 1250 1246 G 0 1247 U 0 1248 G 0 1249 A 0 1250 A 1245 1251 G 1244 1252 G 1243 1253 G 0 1254 G 0 1255 A 0 1256 G 1239 1257 C 1238 1258 U 0 1259 A 0 1260 A 0 1261 U 0 1262 C 1235 1263 U 1234 1264 C 1233 1265 A 0 1266 A 0 1267 A 0 1268 A 0 1269 A 0 1270 A 1227 1271 C 1226 1272 C 1225 1273 A 1224 1274 G 1223 1275 U 1222 1276 C 1221 1277 U 0 1278 C 0 1279 A 0 1280 G 0 1281 U 0 1282 U 0 1283 C 1314 1284 G 0 1285 G 0 1286 A 0 1287 U 1310 1288 U 1309 1289 G 1308 1290 A 1307 1291 A 1306 1292 G 1305 1293 U 1304 1294 C 1303 1295 U 0 1296 G 0 1297 C 0 1298 A 0 1299 A 0 1300 C 0 1301 U 0 1302 C 0 1303 G 1294 1304 A 1293 1305 C 1292 1306 U 1291 1307 U 1290 1308 C 1289 1309 A 1288 1310 U 1287 1311 G 0 1312 A 0 1313 A 0 1314 G 1283 1315 C 0 1316 C 0 1317 G 0 1318 G 0 1319 A 0 1320 A 929 1321 U 928 1322 C 927 1323 A 926 1324 C 925 1325 U 0 1326 A 0 1327 G 0 1328 U 0 1329 A 0 1330 A 1353 1331 U 1352 1332 C 1351 1333 G 1350 1334 C 1349 1335 G 1348 1336 A 1347 1337 A 1346 1338 U 0 1339 C 0 1340 A 0 1341 G 0 1342 C 0 1343 U 0 1344 A 0 1345 U 0 1346 G 1337 1347 U 1336 1348 C 1335 1349 G 1334 1350 C 1333 1351 G 1332 1352 G 1331 1353 U 1330 1354 G 0 1355 A 0 1356 A 0 1357 U 0 1358 A 0 1359 C 0 1360 G 922 1361 U 921 1362 U 0 1363 C 0 1364 U 0 1365 C 919 1366 G 918 1367 G 917 1368 G 916 1369 U 915 1370 C 914 1371 U 913 1372 U 911 1373 G 910 1374 U 909 1375 A 0 1376 C 908 1377 A 907 1378 C 0 1379 A 0 1380 C 1485 1381 C 0 1382 G 1482 1383 C 1481 1384 C 0 1385 C 1478 1386 G 1477 1387 U 0 1388 C 0 1389 A 0 1390 C 1472 1391 A 1471 1392 C 1470 1393 C 1469 1394 A 1468 1395 U 1467 1396 G 1466 1397 A 1465 1398 G 0 1399 A 0 1400 G 1462 1401 U 1461 1402 U 1460 1403 G 1459 1404 G 1458 1405 U 1457 1406 A 1456 1407 A 1455 1408 U 1454 1409 A 1453 1410 C 1452 1411 C 1451 1412 A 0 1413 G 0 1414 A 0 1415 A 0 1416 G 1447 1417 U 1446 1418 A 1445 1419 G 1444 1420 G 1443 1421 U 1442 1422 A 0 1423 G 1441 1424 C 1440 1425 U 1439 1426 U 1438 1427 A 0 1428 A 0 1429 C 1436 1430 C 1435 1431 A 0 1432 U 0 1433 U 0 1434 U 0 1435 G 1430 1436 G 1429 1437 A 0 1438 G 1426 1439 A 1425 1440 G 1424 1441 C 1423 1442 G 1421 1443 C 1420 1444 U 1419 1445 U 1418 1446 C 1417 1447 C 1416 1448 C 0 1449 A 0 1450 A 0 1451 G 1411 1452 G 1410 1453 U 1409 1454 A 1408 1455 G 1407 1456 G 1406 1457 A 1405 1458 C 1404 1459 U 1403 1460 A 1402 1461 G 1401 1462 C 1400 1463 G 0 1464 A 0 1465 U 1397 1466 U 1396 1467 G 1395 1468 G 1394 1469 G 1393 1470 G 1392 1471 U 1391 1472 G 1390 1473 A 0 1474 A 0 1475 G 0 1476 U 0 1477 C 1386 1478 G 1385 1479 U 0 1480 A 0 1481 A 1383 1482 C 1382 1483 A 0 1484 A 0 1485 G 1380 1486 G 0 1487 U 1510 1488 A 1509 1489 U 1508 1490 C 1507 1491 C 1506 1492 G 1505 1493 U 1504 1494 A 1503 1495 C 1502 1496 G 1501 1497 G 0 1498 G 0 1499 A 0 1500 A 0 1501 C 1496 1502 G 1495 1503 U 1494 1504 G 1493 1505 C 1492 1506 G 1491 1507 G 1490 1508 A 1489 1509 U 1488 1510 G 1487 1511 G 0 1512 A 0 1513 U 0 1514 C 0 1515 A 0 1516 C 0 1517 C 0 1518 U 0 1519 C 0 1520 C 0 1521 U 0 1522 U 0 1523 U 0 1524 C 0 1525 U 0