Filename: d.16.b.M.hyopneumoniae.bpseq
Organism: Mycoplasma hyopneumoniae
Accession Number: Y00149
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 C 0
2 G 0
3 C 0
4 A 0
5 A 0
6 U 0
7 C 0
8 A 0
9 U 0
10 G 0
11 A 0
12 G 28
13 A 27
14 G 26
15 U 25
16 U 24
17 U 0
18 G 0
19 A 0
20 U 918
21 C 917
22 C 916
23 U 0
24 G 16
25 G 15
26 C 14
27 U 13
28 C 12
29 A 0
30 G 563
31 G 562
32 A 561
33 U 560
34 A 0
35 A 559
36 A 558
37 C 557
38 G 556
39 C 555
40 U 554
41 A 0
42 G 410
43 C 409
44 U 408
45 G 407
46 U 406
47 G 405
48 U 403
49 G 402
50 C 368
51 U 0
52 U 0
53 A 0
54 A 0
55 U 366
56 A 365
57 C 364
58 A 0
59 U 363
60 G 362
61 C 361
62 A 0
63 U 0
64 G 103
65 U 102
66 U 101
67 G 0
68 A 0
69 A 100
70 C 99
71 G 98
72 G 97
73 A 96
74 A 95
75 U 94
76 A 93
77 U 92
78 U 91
79 U 90
80 U 89
81 A 88
82 G 87
83 U 0
84 U 0
85 C 0
86 G 0
87 C 82
88 U 81
89 A 80
90 A 79
91 A 78
92 A 77
93 U 76
94 A 75
95 U 74
96 U 73
97 U 72
98 A 71
99 G 70
100 U 69
101 A 66
102 G 65
103 C 64
104 A 0
105 A 0
106 A 0
107 U 0
108 G 0
109 G 0
110 G 321
111 U 320
112 G 319
113 A 0
114 G 0
115 U 0
116 A 0
117 A 0
118 C 0
119 A 246
120 C 245
121 G 244
122 U 243
123 A 242
124 C 241
125 C 240
126 U 239
127 A 0
128 A 0
129 C 238
130 C 237
131 U 0
132 A 0
133 C 0
134 C 234
135 U 233
136 U 232
137 U 231
138 U 230
139 G 229
140 G 228
141 A 0
142 C 176
143 U 175
144 G 174
145 G 173
146 G 0
147 A 0
148 U 0
149 A 0
150 A 167
151 C 166
152 C 165
153 A 164
154 U 163
155 U 162
156 G 161
157 G 0
158 A 0
159 A 0
160 A 0
161 C 156
162 A 155
163 G 154
164 U 153
165 G 152
166 G 151
167 C 150
168 U 0
169 A 0
170 A 0
171 U 0
172 A 0
173 C 145
174 C 144
175 A 143
176 G 142
177 A 0
178 U 0
179 A 0
180 U 0
181 G 206
182 A 205
183 U 204
184 A 203
185 A 202
186 A 201
187 A 200
188 A 199
189 U 198
190 U 197
191 U 196
192 G 0
193 C 0
194 A 0
195 U 0
196 G 191
197 A 190
198 A 189
199 U 188
200 U 187
201 U 186
202 U 185
203 U 184
204 A 183
205 U 182
206 U 181
207 C 0
208 A 0
209 A 0
210 A 0
211 G 226
212 G 225
213 A 224
214 G 223
215 C 222
216 C 0
217 U 0
218 U 0
219 C 0
220 A 0
221 A 0
222 G 215
223 C 214
224 U 213
225 U 212
226 C 211
227 A 0
228 C 140
229 C 139
230 A 138
231 A 137
232 G 136
233 A 135
234 A 134
235 A 0
236 U 0
237 G 130
238 G 129
239 G 126
240 G 125
241 G 124
242 U 123
243 G 122
244 C 121
245 G 120
246 C 119
247 A 293
248 A 292
249 C 291
250 A 0
251 U 0
252 U 290
253 A 0
254 G 284
255 U 283
256 U 282
257 A 0
258 G 0
259 U 281
260 U 280
261 G 279
262 G 278
263 U 277
264 A 276
265 G 275
266 G 274
267 G 0
268 U 0
269 A 0
270 A 0
271 A 0
272 A 0
273 G 0
274 C 266
275 C 265
276 U 264
277 A 263
278 C 262
279 C 261
280 A 260
281 A 259
282 G 256
283 A 255
284 C 254
285 G 0
286 A 0
287 U 0
288 G 0
289 A 0
290 U 252
291 G 249
292 U 248
293 U 247
294 U 0
295 A 0
296 G 318
297 C 317
298 G 316
299 G 315
300 G 311
301 G 310
302 C 309
303 C 308
304 A 0
305 A 0
306 G 0
307 A 0
308 G 303
309 G 302
310 U 301
311 U 300
312 G 0
313 U 0
314 A 0
315 C 299
316 C 298
317 G 297
318 C 296
319 C 112
320 A 111
321 C 110
322 A 0
323 C 344
324 U 343
325 G 342
326 G 341
327 G 340
328 A 339
329 U 0
330 U 0
331 G 0
332 A 0
333 G 0
334 A 0
335 U 0
336 A 0
337 C 0
338 G 0
339 G 328
340 C 327
341 C 326
342 C 325
343 A 324
344 G 323
345 A 0
346 C 357
347 U 356
348 C 355
349 C 354
350 U 0
351 A 0
352 C 0
353 G 0
354 G 349
355 G 348
356 A 347
357 G 346
358 G 0
359 C 0
360 A 0
361 G 61
362 C 60
363 A 59
364 G 57
365 U 56
366 A 55
367 A 0
368 G 50
369 G 0
370 A 0
371 A 0
372 U 0
373 A 0
374 U 400
375 U 0
376 C 399
377 C 398
378 A 397
379 C 0
380 A 0
381 A 0
382 U 395
383 A 394
384 A 393
385 G 392
386 C 391
387 G 0
388 A 0
389 A 0
390 A 0
391 G 386
392 C 385
393 U 384
394 U 383
395 G 382
396 A 0
397 U 378
398 G 377
399 G 376
400 A 374
401 G 0
402 C 49
403 G 48
404 A 0
405 C 47
406 A 46
407 C 45
408 A 44
409 G 43
410 C 42
411 G 0
412 U 0
413 G 443
414 C 442
415 A 441
416 G 440
417 G 0
418 A 0
419 U 0
420 G 0
421 A 0
422 A 0
423 G 434
424 U 433
425 C 432
426 U 431
427 U 0
428 U 0
429 C 0
430 G 0
431 G 426
432 G 425
433 A 424
434 U 423
435 G 0
436 U 0
437 A 0
438 A 0
439 A 0
440 C 416
441 U 415
442 G 414
443 C 413
444 U 0
445 G 503
446 U 0
447 U 504
448 G 500
449 U 499
450 A 498
451 A 497
452 G 496
453 G 495
454 G 0
455 A 0
456 A 0
457 G 490
458 A 0
459 A 0
460 A 0
461 A 0
462 A 0
463 A 484
464 C 483
465 U 482
466 A 481
467 G 480
468 A 479
469 U 478
470 A 477
471 G 476
472 G 0
473 A 0
474 A 0
475 A 0
476 U 471
477 G 470
478 C 469
479 U 468
480 C 467
481 U 466
482 A 465
483 G 464
484 U 463
485 C 0
486 U 0
487 U 0
488 G 0
489 A 0
490 C 457
491 G 0
492 G 0
493 U 0
494 A 0
495 C 453
496 C 452
497 U 451
498 U 450
499 A 449
500 U 448
501 U 0
502 A 0
503 G 445
504 A 447
505 A 0
506 A 0
507 G 552
508 C 551
509 G 550
510 A 549
511 C 548
512 G 533
513 G 532
514 C 531
515 A 0
516 A 0
517 A 0
518 C 547
519 U 546
520 A 545
521 U 544
522 G 543
523 U 0
524 G 0
525 C 0
526 C 0
527 A 0
528 G 535
529 C 534
530 A 0
531 G 514
532 C 513
533 C 512
534 G 529
535 C 528
536 G 0
537 G 0
538 U 0
539 A 0
540 A 0
541 U 0
542 A 0
543 C 522
544 A 521
545 U 520
546 A 519
547 G 518
548 G 511
549 U 510
550 C 509
551 G 508
552 C 507
553 A 0
554 A 40
555 G 39
556 C 38
557 G 37
558 U 36
559 U 35
560 A 33
561 U 32
562 C 31
563 C 30
564 G 0
565 G 0
566 A 0
567 A 0
568 U 0
569 U 0
570 A 0
571 U 0
572 U 0
573 G 0
574 G 883
575 G 882
576 C 881
577 G 866
578 U 865
579 A 0
580 A 0
581 A 0
582 G 880
583 C 0
584 G 771
585 U 770
586 C 769
587 C 768
588 G 0
589 U 765
590 A 0
591 G 764
592 G 763
593 U 762
594 U 0
595 U 657
596 U 656
597 U 655
598 U 654
599 G 653
600 U 652
601 U 651
602 A 0
603 A 650
604 G 649
605 U 646
606 U 645
607 U 644
608 A 643
609 A 642
610 A 641
611 G 640
612 U 639
613 U 638
614 A 0
615 A 0
616 A 0
617 U 0
618 G 0
619 C 635
620 U 634
621 A 633
622 A 632
623 A 631
624 G 630
625 C 0
626 U 0
627 C 0
628 A 0
629 A 0
630 C 624
631 U 623
632 U 622
633 U 621
634 A 620
635 G 619
636 U 0
637 C 0
638 C 613
639 G 612
640 C 611
641 U 610
642 U 609
643 U 608
644 A 607
645 G 606
646 A 605
647 U 0
648 A 0
649 C 604
650 U 603
651 G 601
652 G 600
653 C 599
654 A 598
655 A 597
656 A 596
657 A 595
658 U 0
659 A 0
660 G 0
661 A 758
662 A 757
663 U 756
664 U 754
665 A 753
666 U 752
667 G 751
668 A 750
669 A 749
670 G 0
671 A 0
672 G 747
673 G 746
674 U 745
675 U 744
676 A 743
677 G 742
678 C 741
679 G 723
680 G 722
681 A 0
682 A 0
683 U 719
684 U 718
685 C 717
686 C 716
687 U 715
688 A 714
689 G 713
690 U 712
691 G 0
692 G 0
693 A 0
694 G 705
695 U 704
696 G 703
697 G 0
698 U 0
699 G 0
700 G 0
701 A 0
702 A 0
703 U 696
704 A 695
705 C 694
706 G 0
707 U 0
708 A 0
709 G 0
710 A 0
711 U 0
712 A 690
713 U 689
714 U 688
715 A 687
716 G 686
717 G 685
718 A 684
719 A 683
720 G 0
721 A 0
722 A 680
723 C 679
724 A 0
725 C 0
726 C 0
727 A 0
728 A 740
729 U 0
730 A 0
731 G 0
732 G 739
733 C 738
734 G 0
735 A 0
736 A 0
737 G 0
738 G 733
739 C 732
740 A 728
741 G 678
742 C 677
743 U 676
744 A 675
745 A 674
746 C 673
747 U 672
748 G 0
749 G 669
750 U 668
751 C 667
752 A 666
753 U 665
754 A 664
755 U 0
756 A 663
757 U 662
758 U 661
759 G 0
760 A 0
761 C 0
762 A 593
763 C 592
764 U 591
765 A 589
766 A 0
767 G 0
768 G 587
769 G 586
770 A 585
771 C 584
772 G 0
773 A 0
774 A 0
775 A 0
776 G 817
777 C 816
778 G 815
779 U 814
780 G 813
781 G 812
782 G 0
783 G 0
784 A 0
785 G 811
786 C 810
787 A 0
788 A 0
789 A 0
790 C 806
791 A 805
792 G 804
793 G 803
794 A 0
795 U 0
796 U 0
797 A 0
798 G 0
799 A 0
800 U 0
801 A 0
802 C 0
803 C 793
804 C 792
805 U 791
806 G 790
807 G 0
808 U 0
809 A 0
810 G 786
811 U 785
812 C 781
813 C 780
814 A 779
815 C 778
816 G 777
817 C 776
818 C 0
819 G 0
820 U 0
821 A 0
822 A 0
823 A 0
824 C 0
825 G 0
826 A 0
827 U 0
828 G 879
829 A 878
830 U 877
831 C 876
832 A 875
833 U 874
834 U 0
835 A 0
836 G 857
837 U 856
838 U 855
839 G 854
840 G 853
841 U 852
842 G 851
843 G 850
844 C 849
845 A 0
846 A 0
847 A 0
848 A 0
849 G 844
850 U 843
851 C 842
852 A 841
853 C 840
854 U 839
855 A 838
856 A 837
857 C 836
858 A 0
859 C 0
860 A 0
861 G 868
862 C 867
863 U 0
864 A 0
865 A 578
866 C 577
867 G 862
868 C 861
869 G 0
870 U 0
871 U 0
872 A 0
873 A 0
874 A 833
875 U 832
876 G 831
877 A 830
878 U 829
879 C 828
880 C 582
881 G 576
882 C 575
883 C 574
884 U 0
885 G 912
886 A 911
887 G 910
888 U 0
889 A 0
890 G 0
891 U 0
892 A 0
893 U 0
894 G 905
895 C 904
896 U 903
897 C 902
898 G 0
899 C 0
900 A 0
901 A 0
902 G 897
903 A 896
904 G 895
905 U 894
906 G 0
907 A 0
908 A 0
909 A 0
910 C 887
911 U 886
912 U 885
913 A 0
914 A 0
915 A 0
916 G 22
917 G 21
918 A 20
919 A 0
920 U 0
921 U 1390
922 G 1389
923 A 1387
924 C 1386
925 G 1385
926 G 0
927 G 1384
928 A 1383
929 A 1382
930 C 1381
931 C 1380
932 C 1379
933 G 1378
934 C 0
935 A 1374
936 C 1373
937 A 0
938 A 0
939 G 1337
940 C 1336
941 G 1335
942 G 1334
943 U 1333
944 G 1230
945 G 1229
946 A 1228
947 G 1227
948 C 1226
949 A 1225
950 U 1224
951 G 1223
952 U 1222
953 G 1221
954 G 1219
955 U 1218
956 U 0
957 U 0
958 A 0
959 A 0
960 U 975
961 U 974
962 U 973
963 G 972
964 A 0
965 A 0
966 G 0
967 A 0
968 U 0
969 A 0
970 C 0
971 G 0
972 C 963
973 G 962
974 U 961
975 A 960
976 G 0
977 A 0
978 A 0
979 C 0
980 C 0
981 U 0
982 U 0
983 A 0
984 C 1214
985 C 1213
986 C 1212
987 A 1211
988 C 1210
989 U 1209
990 C 1208
991 U 0
992 U 0
993 G 0
994 A 0
995 C 0
996 A 1040
997 U 1039
998 U 1036
999 C 1035
1000 U 1034
1001 C 1033
1002 G 1032
1003 C 0
1004 A 0
1005 A 0
1006 A 1023
1007 A 1022
1008 C 1021
1009 U 1020
1010 A 1019
1011 U 1018
1012 A 1017
1013 G 0
1014 A 0
1015 G 0
1016 A 0
1017 U 1012
1018 A 1011
1019 U 1010
1020 A 1009
1021 G 1008
1022 C 1007
1023 C 1006
1024 G 0
1025 A 0
1026 G 0
1027 G 0
1028 C 0
1029 U 0
1030 A 0
1031 A 0
1032 C 1002
1033 G 1001
1034 A 1000
1035 G 999
1036 A 998
1037 U 0
1038 C 0
1039 A 997
1040 C 996
1041 A 0
1042 G 1203
1043 A 1202
1044 U 0
1045 G 1201
1046 G 1200
1047 U 1199
1048 G 1198
1049 C 0
1050 A 0
1051 U 1197
1052 G 1196
1053 G 1192
1054 U 1191
1055 U 1190
1056 G 1188
1057 U 1187
1058 C 1186
1059 G 1185
1060 U 0
1061 C 0
1062 A 0
1063 G 1102
1064 C 1101
1065 U 1100
1066 C 1099
1067 G 1098
1068 U 1097
1069 G 1078
1070 U 1077
1071 C 1076
1072 G 0
1073 U 0
1074 G 0
1075 A 0
1076 G 1071
1077 A 1070
1078 U 1069
1079 G 0
1080 U 0
1081 U 1094
1082 A 1093
1083 G 1092
1084 G 1091
1085 U 0
1086 U 0
1087 A 0
1088 A 0
1089 G 0
1090 U 0
1091 C 1084
1092 C 1083
1093 U 1082
1094 G 1081
1095 C 0
1096 A 0
1097 A 1068
1098 C 1067
1099 G 1066
1100 A 1065
1101 G 1064
1102 C 1063
1103 G 0
1104 C 0
1105 A 0
1106 A 0
1107 C 0
1108 C 1180
1109 C 1179
1110 U 1178
1111 U 1177
1112 U 0
1113 U 1149
1114 C 1148
1115 U 1147
1116 U 1146
1117 U 1145
1118 A 1144
1119 G 1143
1120 U 0
1121 U 0
1122 G 0
1123 C 1138
1124 U 1137
1125 A 0
1126 A 0
1127 C 1136
1128 A 1135
1129 U 0
1130 U 0
1131 U 0
1132 A 0
1133 G 0
1134 U 0
1135 U 1128
1136 G 1127
1137 A 1124
1138 G 1123
1139 A 0
1140 A 0
1141 C 0
1142 C 0
1143 C 1119
1144 U 1118
1145 A 1117
1146 A 1116
1147 A 1115
1148 G 1114
1149 A 1113
1150 U 0
1151 A 0
1152 C 1171
1153 U 1170
1154 G 1169
1155 C 1168
1156 C 1167
1157 G 1166
1158 G 1165
1159 C 1164
1160 G 0
1161 C 0
1162 A 0
1163 A 0
1164 G 1159
1165 C 1158
1166 C 1157
1167 G 1156
1168 G 1155
1169 A 1154
1170 G 1153
1171 G 1152
1172 A 0
1173 A 0
1174 G 0
1175 G 0
1176 U 0
1177 G 1111
1178 G 1110
1179 G 1109
1180 G 1108
1181 A 0
1182 C 0
1183 G 0
1184 A 0
1185 C 1059
1186 G 1058
1187 U 1057
1188 C 1056
1189 A 0
1190 A 1055
1191 A 1054
1192 U 1053
1193 C 0
1194 A 0
1195 U 0
1196 C 1052
1197 A 1051
1198 U 1048
1199 G 1047
1200 C 1046
1201 C 1045
1202 U 1043
1203 C 1042
1204 U 0
1205 U 0
1206 A 0
1207 C 0
1208 G 990
1209 A 989
1210 G 988
1211 U 987
1212 G 986
1213 G 985
1214 G 984
1215 G 0
1216 C 0
1217 A 0
1218 A 955
1219 C 954
1220 A 0
1221 C 953
1222 A 952
1223 C 951
1224 G 950
1225 U 949
1226 G 948
1227 C 947
1228 U 946
1229 A 945
1230 C 944
1231 A 0
1232 A 0
1233 U 0
1234 G 1289
1235 G 1288
1236 C 1287
1237 U 1286
1238 A 1285
1239 C 1284
1240 U 1283
1241 A 0
1242 C 0
1243 A 0
1244 A 0
1245 A 0
1246 G 1277
1247 A 1276
1248 G 1275
1249 C 0
1250 A 0
1251 G 1270
1252 C 1269
1253 A 0
1254 A 0
1255 A 0
1256 A 1265
1257 C 1264
1258 A 1263
1259 G 0
1260 U 0
1261 G 0
1262 A 0
1263 U 1258
1264 G 1257
1265 U 1256
1266 C 0
1267 A 0
1268 A 0
1269 G 1252
1270 C 1251
1271 U 0
1272 A 0
1273 A 0
1274 U 0
1275 C 1248
1276 U 1247
1277 C 1246
1278 A 0
1279 A 0
1280 A 0
1281 A 0
1282 A 0
1283 A 1240
1284 G 1239
1285 U 1238
1286 A 1237
1287 G 1236
1288 U 1235
1289 C 1234
1290 U 0
1291 C 0
1292 A 0
1293 G 0
1294 U 0
1295 U 0
1296 C 1327
1297 G 0
1298 G 0
1299 A 0
1300 U 1323
1301 U 1322
1302 G 1321
1303 A 1320
1304 A 1319
1305 G 1318
1306 U 1317
1307 C 1316
1308 U 0
1309 G 0
1310 C 0
1311 A 0
1312 A 0
1313 C 0
1314 U 0
1315 C 0
1316 G 1307
1317 A 1306
1318 C 1305
1319 U 1304
1320 U 1303
1321 C 1302
1322 A 1301
1323 U 1300
1324 G 0
1325 A 0
1326 A 0
1327 G 1296
1328 U 0
1329 C 0
1330 G 0
1331 G 0
1332 A 0
1333 A 943
1334 U 942
1335 C 941
1336 G 940
1337 C 939
1338 U 0
1339 A 0
1340 G 0
1341 U 0
1342 A 0
1343 A 1366
1344 U 1365
1345 C 1364
1346 G 1363
1347 C 1362
1348 A 1361
1349 G 1360
1350 G 1359
1351 U 0
1352 C 0
1353 A 0
1354 G 0
1355 C 0
1356 U 0
1357 A 0
1358 U 0
1359 A 1350
1360 C 1349
1361 U 1348
1362 G 1347
1363 C 1346
1364 G 1345
1365 G 1344
1366 U 1343
1367 G 0
1368 A 0
1369 A 0
1370 U 0
1371 A 0
1372 C 0
1373 G 936
1374 U 935
1375 U 0
1376 C 0
1377 U 0
1378 C 933
1379 G 932
1380 G 931
1381 G 930
1382 U 929
1383 U 928
1384 U 927
1385 U 925
1386 G 924
1387 U 923
1388 A 0
1389 C 922
1390 A 921
1391 C 0
1392 A 0
1393 C 1496
1394 C 0
1395 G 1493
1396 C 1492
1397 C 0
1398 C 1489
1399 G 1488
1400 U 0
1401 C 0
1402 A 0
1403 C 1483
1404 A 1482
1405 C 1481
1406 C 1480
1407 A 1479
1408 U 1478
1409 G 1477
1410 G 1476
1411 G 0
1412 A 0
1413 G 1473
1414 U 1472
1415 U 1471
1416 G 1470
1417 G 1469
1418 U 1468
1419 A 1467
1420 A 1466
1421 U 1465
1422 G 1464
1423 C 1463
1424 C 1462
1425 C 0
1426 A 0
1427 A 0
1428 A 0
1429 G 1458
1430 U 1457
1431 C 1456
1432 G 1455
1433 G 1454
1434 U 1453
1435 G 0
1436 A 1452
1437 G 1451
1438 U 1450
1439 U 1449
1440 A 0
1441 A 0
1442 C 1447
1443 U 0
1444 U 0
1445 C 0
1446 G 0
1447 G 1442
1448 A 0
1449 G 1439
1450 A 1438
1451 C 1437
1452 C 1436
1453 A 1434
1454 U 1433
1455 U 1432
1456 G 1431
1457 C 1430
1458 C 1429
1459 U 0
1460 A 0
1461 A 0
1462 G 1424
1463 G 1423
1464 C 1422
1465 A 1421
1466 G 1420
1467 G 1419
1468 A 1418
1469 C 1417
1470 C 1416
1471 G 1415
1472 A 1414
1473 U 1413
1474 G 0
1475 A 0
1476 C 1410
1477 U 1409
1478 G 1408
1479 G 1407
1480 G 1406
1481 G 1405
1482 U 1404
1483 G 1403
1484 A 0
1485 A 0
1486 G 0
1487 U 0
1488 C 1399
1489 G 1398
1490 U 0
1491 A 0
1492 A 1396
1493 C 1395
1494 A 0
1495 A 0
1496 G 1393
1497 G 0
1498 U 1521
1499 A 1520
1500 U 1519
1501 C 1518
1502 C 1517
1503 C 1516
1504 U 1515
1505 A 1514
1506 C 1513
1507 G 1512
1508 A 0
1509 G 0
1510 A 0
1511 A 0
1512 C 1507
1513 G 1506
1514 U 1505
1515 G 1504
1516 G 1503
1517 G 1502
1518 G 1501
1519 A 1500
1520 U 1499
1521 G 1498
1522 G 0
1523 A 0
1524 A 0
1525 C 0
1526 A 0
1527 C 0
1528 C 0
1529 U 0
1530 C 0
1531 C 0
1532 U 0
1533 U 0
1534 U 0
1535 C 0
1536 U 0
1537 A 0